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;KIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRKTI EQLMTLDLPTGVEIEIKT ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAG REQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; ;KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAG REQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;PTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVL IRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEA ; ;PTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVL IRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEA ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; ;ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRL MDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no 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'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 19 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 20 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 1 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 2 2 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 3 3 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 4 4 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 5 5 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 6 6 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 7 7 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 8 8 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 9 9 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 10 10 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 11 11 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 12 12 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 13 13 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 14 14 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 15 15 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 16 16 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 17 17 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 18 18 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 19 19 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? 20 20 PDB 1PNX 1PNX ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1PNX A 1 ? 1537 ? 1PNX 5 ? 1544 ? 5 1544 2 2 1PNX B 1 ? 234 ? 1PNX 7 ? 240 ? 7 240 3 3 1PNX C 1 ? 206 ? 1PNX 2 ? 207 ? 2 207 4 4 1PNX D 1 ? 208 ? 1PNX 2 ? 209 ? 2 209 5 5 1PNX E 1 ? 150 ? 1PNX 5 ? 154 ? 5 154 6 6 1PNX F 1 ? 101 ? 1PNX 1 ? 101 ? 1 101 7 7 1PNX G 1 ? 155 ? 1PNX 2 ? 156 ? 2 156 8 8 1PNX H 1 ? 138 ? 1PNX 1 ? 138 ? 1 138 9 9 1PNX I 1 ? 127 ? 1PNX 2 ? 128 ? 2 128 10 10 1PNX J 1 ? 98 ? 1PNX 3 ? 100 ? 3 100 11 11 1PNX K 1 ? 119 ? 1PNX 11 ? 129 ? 11 129 12 12 1PNX L 1 ? 124 ? 1PNX 5 ? 128 ? 5 128 13 13 1PNX M 1 ? 125 ? 1PNX 2 ? 126 ? 2 126 14 14 1PNX N 1 ? 60 ? 1PNX 2 ? 61 ? 2 61 15 15 1PNX O 1 ? 88 ? 1PNX 2 ? 89 ? 2 89 16 16 1PNX P 1 ? 83 ? 1PNX 1 ? 83 ? 1 83 17 17 1PNX Q 1 ? 104 ? 1PNX 2 ? 105 ? 2 105 18 18 1PNX R 1 ? 73 ? 1PNX 16 ? 88 ? 16 88 19 19 1PNX S 1 ? 80 ? 1PNX 2 ? 81 ? 2 81 20 20 1PNX T 1 ? 99 ? 1PNX 8 ? 106 ? 8 106 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1PNX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 10 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION' _exptl_crystal_grow.temp 277 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'MPD, ethanol, magnesium chloride, ammonium chloride, spermine, spermidine, MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # loop_ _exptl_crystal_grow_comp.crystal_id _exptl_crystal_grow_comp.id _exptl_crystal_grow_comp.sol_id _exptl_crystal_grow_comp.name _exptl_crystal_grow_comp.volume _exptl_crystal_grow_comp.conc _exptl_crystal_grow_comp.details 1 1 1 MPD ? ? ? 1 2 1 ethanol ? ? ? 1 3 1 'magnesium chloride' ? ? ? 1 4 1 'ammonium chloride' ? ? ? 1 5 1 spermine ? ? ? 1 6 1 spermidine ? ? ? 1 7 1 MES ? ? ? 1 8 1 H2O ? ? ? 1 9 2 MPD ? ? ? 1 10 2 'magnesium chloride' ? ? ? 1 11 2 'ammonium chloride' ? ? ? 1 12 2 H2O ? ? ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 110 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 4' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2000-12-08 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Si 111' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 1.0 1.0 2 1.1 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ALS BEAMLINE 5.0.2' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ALS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 5.0.2 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list '1.0, 1.1' # _reflns.entry_id 1PNX _reflns.observed_criterion_sigma_F 0 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3 _reflns.d_resolution_high 9.5 _reflns.d_resolution_low 300 _reflns.number_all 29028 _reflns.number_obs 26821 _reflns.percent_possible_obs 92.1 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.142 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 44.8 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 25.1 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _reflns_shell.d_res_high 9.5 _reflns_shell.d_res_low 9.68 _reflns_shell.percent_possible_all 71.8 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.549 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.5 _reflns_shell.pdbx_redundancy 9.7 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.pdbx_diffrn_id ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 1PNX _refine.ls_d_res_high 9.5 _refine.ls_d_res_low 70 _refine.pdbx_ls_sigma_F 0 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_number_reflns_all 29028 _refine.ls_number_reflns_obs 26821 _refine.ls_number_reflns_R_free 1215 _refine.ls_percent_reflns_obs 92.1 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.389 _refine.ls_R_factor_R_free 0.407 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 1J5E,1LNR _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values NA _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ANISOTROPIC _refine.B_iso_mean 696.1 _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.details ;87 RIGID-BODIES REFINEMENT, GROUPED B-FACTOR REFINEMENT. There are many long O3'-P distances. Coordinates used for solving and refining this structure mainly comes from PDB entry, 1J5E, where the sequence represents that of T. thermophilus. ; _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 19012 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 32939 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 51951 _refine_hist.d_res_high 9.5 _refine_hist.d_res_low 70 # _struct.entry_id 1PNX _struct.title ;Crystal Structure of the Wild Type Ribosome from E. Coli, 30S Subunit of 70S Ribosome. THIS FILE, 1PNX, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50S SUBUNIT IS IN THE PDB FILE 1PNY. ; _struct.pdbx_descriptor '30S RIBOSOMAL SUBUNIT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1PNX _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text '30S RIBOSOMAL SUBUNIT, PROTEIN-PROTEIN COMPLEX, PROTEIN-RNA COMPLEX, RNA-RNA COMPLEX, RIBOSOME' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LEU B 5 ? VAL B 9 ? LEU B 11 VAL B 15 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 ASN B 19 ? ARG B 24 ? ASN B 25 ARG B 30 5 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 ASP B 37 ? MET B 57 ? ASP B 43 MET B 63 1 ? 21 HELX_P HELX_P4 4 LYS B 68 ? ARG B 81 ? LYS B 74 ARG B 87 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 5 ASN B 98 ? PHE B 116 ? ASN B 104 PHE B 122 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 6 ALA B 117 ? SER B 118 ? ALA B 123 SER B 124 5 ? 2 HELX_P HELX_P7 7 PRO B 119 ? GLU B 123 ? PRO B 125 GLU B 129 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 8 LYS B 127 ? LEU B 143 ? LYS B 133 LEU B 149 1 ? 17 HELX_P HELX_P9 9 GLU B 164 ? LEU B 174 ? GLU B 170 LEU B 180 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 10 ASP B 187 ? VAL B 191 ? ASP B 193 VAL B 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 11 ALA B 201 ? ALA B 219 ? ALA B 207 ALA B 225 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 12 SER B 229 ? GLN B 234 ? SER B 235 GLN B 240 5 ? 6 HELX_P HELX_P13 13 HIS C 5 ? LEU C 11 ? HIS C 6 LEU C 12 1 ? 7 HELX_P HELX_P14 14 GLN C 27 ? LEU C 46 ? GLN C 28 LEU C 47 1 ? 20 HELX_P HELX_P15 15 LYS C 71 ? GLY C 77 ? LYS C 72 GLY C 78 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 16 GLU C 81 ? LYS C 92 ? GLU C 82 LYS C 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 17 ASN C 107 ? LEU C 110 ? ASN C 108 LEU C 111 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 18 SER C 111 ? ARG C 126 ? SER C 112 ARG C 127 1 ? 16 HELX_P HELX_P19 19 ALA C 128 ? GLU C 142 ? ALA C 129 GLU C 143 1 ? 15 HELX_P HELX_P20 20 ARG C 155 ? ALA C 159 ? ARG C 156 ALA C 160 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 21 VAL D 7 ? GLU D 14 ? VAL D 8 GLU D 15 1 ? 8 HELX_P HELX_P22 22 SER D 51 ? TYR D 67 ? SER D 52 TYR D 68 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 23 SER D 70 ? LYS D 84 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P24 24 VAL D 87 ? SER D 98 ? VAL D 88 SER D 99 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 ARG D 99 ? LEU D 107 ? ARG D 100 LEU D 108 1 ? 9 HELX_P HELX_P26 26 SER D 112 ? HIS D 122 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 27 ALA D 148 ? ASN D 153 ? ALA D 149 ASN D 154 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 28 LEU D 154 ? MET D 164 ? LEU D 155 MET D 165 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 29 ASP D 189 ? LEU D 193 ? ASP D 190 LEU D 194 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 ASN D 198 ? TYR D 206 ? ASN D 199 TYR D 207 1 ? 9 HELX_P HELX_P31 31 GLU E 46 ? ARG E 60 ? GLU E 50 ARG E 64 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 32 GLY E 99 ? ALA E 109 ? GLY E 103 ALA E 113 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 33 ASN E 123 ? LEU E 138 ? ASN E 127 LEU E 142 1 ? 16 HELX_P HELX_P34 34 THR E 140 ? ARG E 148 ? THR E 144 ARG E 152 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 35 ASP F 15 ? TYR F 33 ? ASP F 15 TYR F 33 1 ? 19 HELX_P HELX_P36 36 PRO F 68 ? ARG F 82 ? PRO F 68 ARG F 82 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 37 ASP G 19 ? MET G 30 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 38 LYS G 34 ? LYS G 52 ? LYS G 35 LYS G 53 1 ? 19 HELX_P HELX_P39 39 GLU G 56 ? LYS G 69 ? GLU G 57 LYS G 70 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 40 SER G 91 ? ASN G 108 ? SER G 92 ASN G 109 1 ? 18 HELX_P HELX_P41 41 ARG G 114 ? GLY G 129 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 42 GLY G 131 ? ALA G 144 ? GLY G 132 ALA G 145 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 43 ALA G 149 ? ARG G 154 ? ALA G 150 ARG G 155 5 ? 6 HELX_P HELX_P44 44 ASP H 4 ? VAL H 19 ? ASP H 4 VAL H 19 1 ? 16 HELX_P HELX_P45 45 SER H 29 ? GLU H 42 ? SER H 29 GLU H 42 1 ? 14 HELX_P HELX_P46 46 ARG H 102 ? LEU H 107 ? ARG H 102 LEU H 107 5 ? 6 HELX_P HELX_P47 47 ASP H 121 ? LEU H 127 ? 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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details eicosameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 20 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 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Other # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal DENZO 'data collection' . ? 1 SCALEPACK 'data reduction' . ? 2 CNS 'model building' . ? 3 CNS refinement . ? 4 DENZO 'data reduction' . ? 5 SCALEPACK 'data scaling' . ? 6 CNS phasing . ? 7 # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 400 ;COMPOUND PDB ENTRIES 1PNX AND 1PNY REPRESENT ONE CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNX, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50S SUBUNIT IS IN THE PDB FILE 1PNY. ; 999 ;SEQUENCE The 30S subunit is derived mainly from 1J5E, the T. thermophilus 30S subunit, with modifications to the rRNA to make it match E. coli insertions and deletions. The sequence of this subunit represent that of pdb entry, 1J5E. As a result, no dbref was provided. ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 "O2'" A C 335 ? ? "O2'" A A 1433 ? ? 0.30 2 1 "O3'" A A 1044 ? ? "C4'" A C 1045 ? ? 0.47 3 1 N3 A A 189 ? ? CA T ALA 106 ? ? 0.51 4 1 C4 A C 188 ? ? NH1 T ARG 89 ? ? 0.54 5 1 "O4'" A G 1458 ? ? "O2'" A C 1459 ? ? 0.58 6 1 OP2 A A 1457 ? ? N4 A C 1459 ? ? 0.68 7 1 "C1'" A C 217 ? ? 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O J THR 92 ? ? 1.52 98 1 N3 A A 189 ? ? N T ALA 106 ? ? 1.53 99 1 "O3'" A A 1014 ? ? CE1 S HIS 14 ? ? 1.53 100 1 N3 A G 142 ? ? N3 A A 196 ? ? 1.53 101 1 "O2'" A G 1224 ? ? OP1 A A 1225 ? ? 1.53 102 1 "O4'" A C 335 ? ? "C4'" A A 1434 ? ? 1.54 103 1 C5 A C 188 ? ? CZ T ARG 89 ? ? 1.54 104 1 "C4'" A A 1457 ? ? C6 A C 1459 ? ? 1.54 105 1 "O2'" A C 401 ? ? C2 A A 621 ? ? 1.54 106 1 "C2'" A G 191 ? ? "O4'" A U 192 ? ? 1.54 107 1 N3 A U 820 ? ? N7 A A 873 ? ? 1.54 108 1 C4 A U 421 ? ? CZ C ARG 127 ? ? 1.55 109 1 OP1 A C 1459 ? ? OG T SER 31 ? ? 1.55 110 1 "O5'" A G 1458 ? ? "C2'" A C 1459 ? ? 1.55 111 1 "O2'" A C 217 ? ? "C2'" A C 469 ? ? 1.56 112 1 "O2'" A C 335 ? ? "C2'" A A 1433 ? ? 1.56 113 1 "O2'" A A 262 ? ? ND2 T ASN 75 ? ? 1.56 114 1 "O2'" A A 815 ? ? "O4'" A C 1527 ? ? 1.56 115 1 "C5'" A A 1457 ? ? C5 A C 1459 ? ? 1.57 116 1 "O2'" A G 115 ? ? OP2 A A 116 ? ? 1.57 117 1 "O2'" A G 319 ? ? N1 A A 1434 ? ? 1.58 118 1 N3 A G 113 ? ? "O2'" A A 353 ? ? 1.58 119 1 N3 A G 142 ? ? C2 A A 196 ? ? 1.58 120 1 N1 A A 1256 ? ? C4 A C 1277 ? ? 1.59 121 1 C6 A A 185 ? ? N4 A C 186 ? ? 1.59 122 1 "C3'" A C 436 ? ? "O5'" A U 437 ? ? 1.59 123 1 OP2 A U 1330 ? ? CA M GLY 26 ? ? 1.59 124 1 "O3'" A C 1342 ? ? OH I TYR 125 ? ? 1.60 125 1 "O3'" A C 1328 ? ? CB M ALA 28 ? ? 1.61 126 1 "C5'" A C 218 ? ? "C5'" A U 470 ? ? 1.61 127 1 "O3'" A C 436 ? ? "C5'" A U 437 ? ? 1.61 128 1 N3 A G 319 ? ? N3 A A 1434 ? ? 1.62 129 1 N6 A A 1256 ? ? O2 A U 1278 ? ? 1.62 130 1 O2 A C 19 ? ? N2 A G 916 ? ? 1.62 131 1 O6 A G 191 ? ? N3 A U 192 ? ? 1.63 132 1 C2 A A 1256 ? ? N3 A C 1277 ? ? 1.63 133 1 "O2'" A A 189 ? ? OXT T ALA 106 ? ? 1.63 134 1 N1 A A 994 ? ? CA N ALA 5 ? ? 1.63 135 1 "C4'" A A 1014 ? ? CD2 S HIS 14 ? ? 1.63 136 1 C6 A A 994 ? ? CA N ALA 5 ? ? 1.63 137 1 C2 A A 994 ? ? O N LYS 4 ? ? 1.64 138 1 OP1 A C 1297 ? ? NH2 M ARG 44 ? ? 1.64 139 1 C2 A A 994 ? ? C N LYS 4 ? ? 1.64 140 1 N9 A A 189 ? ? N T ALA 106 ? ? 1.64 141 1 "C3'" A A 1457 ? ? "O4'" A C 1459 ? ? 1.64 142 1 N3 A A 1014 ? ? "O2'" A U 1219 ? ? 1.65 143 1 C4 A A 130 ? ? "O4'" A U 264 ? ? 1.66 144 1 "O3'" A A 1044 ? ? "O4'" A C 1045 ? ? 1.66 145 1 OP1 A C 489 ? ? NH2 D ARG 132 ? ? 1.66 146 1 N4 A C 188 ? ? NH1 T ARG 89 ? ? 1.67 147 1 "C1'" A C 217 ? ? "C2'" A C 469 ? ? 1.67 148 1 OP1 A A 1500 ? ? OP1 A G 1508 ? ? 1.67 149 1 N7 A A 189 ? ? CA T SER 105 ? ? 1.67 150 1 P A U 1330 ? ? O M ILE 25 ? ? 1.68 151 1 "C3'" A A 185 ? ? OP2 A C 186 ? ? 1.68 152 1 P A A 1016 ? ? NZ N LYS 15 ? ? 1.68 153 1 N6 A A 190 ? ? N T LEU 104 ? ? 1.68 154 1 C8 A A 189 ? ? OG T SER 105 ? ? 1.69 155 1 C2 A A 185 ? ? N4 A C 186 ? ? 1.69 156 1 N1 A G 760 ? ? O Q LYS 104 ? ? 1.69 157 1 OP1 A A 1503 ? ? "O2'" A A 1531 ? ? 1.69 158 1 OP2 A A 1329 ? ? CB M ALA 28 ? ? 1.69 159 1 "C3'" A A 59 ? ? OP1 A A 60 ? ? 1.70 160 1 "C3'" A A 1457 ? ? "C1'" A C 1459 ? ? 1.70 161 1 "C3'" A U 249 ? ? OP2 A A 250 ? ? 1.70 162 1 "C2'" A C 335 ? ? "O2'" A A 1433 ? ? 1.71 163 1 C2 A A 1256 ? ? C4 A C 1277 ? ? 1.71 164 1 N3 A U 421 ? ? CZ C ARG 127 ? ? 1.71 165 1 "C2'" A U 476 ? ? "C5'" A G 477 ? ? 1.71 166 1 "C1'" A A 189 ? ? C T ALA 106 ? ? 1.72 167 1 "O4'" A G 187 ? ? CE T MET 85 ? ? 1.72 168 1 N1 A A 1256 ? ? N3 A C 1277 ? ? 1.72 169 1 C2 A A 130 ? ? N1 A U 264 ? ? 1.72 170 1 N1 A A 185 ? ? C4 A C 186 ? ? 1.72 171 1 "C2'" A G 1190 ? ? OP2 A A 1191 ? ? 1.72 172 1 "C1'" A C 335 ? ? "O4'" A A 1434 ? ? 1.72 173 1 "C3'" A A 59 ? ? "O5'" A A 60 ? ? 1.73 174 1 "O2'" A C 400 ? ? "O2'" A A 622 ? ? 1.73 175 1 "O3'" A A 1014 ? ? NE2 S HIS 14 ? ? 1.73 176 1 "O2'" A C 103 ? ? N1 A A 171 ? ? 1.73 177 1 "O4'" A C 217 ? ? "O2'" A C 469 ? ? 1.74 178 1 "O2'" A G 318 ? ? "C2'" A A 1468 ? ? 1.74 179 1 OP1 A C 1459 ? ? O T ALA 28 ? ? 1.74 180 1 "O2'" A G 1190 ? ? OP2 A A 1191 ? ? 1.74 181 1 O2 A U 20 ? ? N6 A A 915 ? ? 1.75 182 1 "C2'" A A 1457 ? ? N1 A C 1459 ? ? 1.75 183 1 "O4'" A C 335 ? ? "C5'" A A 1434 ? ? 1.76 184 1 "C2'" A C 217 ? ? "C2'" A C 469 ? ? 1.76 185 1 "O3'" A C 216 ? ? N3 A A 468 ? ? 1.76 186 1 OP1 A A 1329 ? ? N M ALA 28 ? ? 1.76 187 1 "O2'" A C 217 ? ? "O2'" A C 469 ? ? 1.76 188 1 C2 A A 994 ? ? N N ALA 5 ? ? 1.76 189 1 N1 A A 130 ? ? C2 A U 264 ? ? 1.76 190 1 OP1 A G 1190 ? ? CA C LYS 4 ? ? 1.77 191 1 "C1'" A A 141 ? ? O2 A U 182 ? ? 1.77 192 1 OP1 A A 452 ? ? NZ P LYS 43 ? ? 1.77 193 1 OP1 A G 1231 ? ? NZ I LYS 127 ? ? 1.78 194 1 C2 A A 1014 ? ? "O2'" A U 1219 ? ? 1.78 195 1 "O2'" A A 59 ? ? OP1 A A 60 ? ? 1.78 196 1 OP1 A G 1458 ? ? "C5'" A C 1459 ? ? 1.78 197 1 N1 A G 191 ? ? O2 A U 192 ? ? 1.78 198 1 "C5'" A A 1014 ? ? CB S HIS 14 ? ? 1.78 199 1 C4 A C 188 ? ? NH2 T ARG 89 ? ? 1.78 200 1 "O4'" A G 1458 ? ? "C2'" A C 1459 ? ? 1.78 201 1 "O5'" A A 189 ? ? OG T SER 105 ? ? 1.79 202 1 CB D THR 89 ? ? O E GLY 97 ? ? 1.79 203 1 "O2'" A C 1277 ? ? N9 A A 1279 ? ? 1.79 204 1 OP1 A A 1329 ? ? C M ALA 28 ? ? 1.79 205 1 P A A 1329 ? ? CB M ALA 28 ? ? 1.79 206 1 "C4'" A C 216 ? ? N3 A A 468 ? ? 1.79 207 1 C2 A A 185 ? ? C5 A C 186 ? ? 1.79 208 1 "O3'" A A 1457 ? ? "O4'" A C 1459 ? ? 1.80 209 1 C8 A A 189 ? ? CA T SER 105 ? ? 1.81 210 1 "O4'" A C 217 ? ? "C2'" A C 469 ? ? 1.81 211 1 "O5'" A G 293 ? ? N6 A A 609 ? ? 1.81 212 1 "O2'" A C 545 ? ? OP1 A C 549 ? ? 1.81 213 1 C8 A A 189 ? ? CB T SER 105 ? ? 1.82 214 1 N9 A A 130 ? ? "O4'" A U 264 ? ? 1.82 215 1 NH2 E ARG 152 ? ? O H LEU 107 ? ? 1.82 216 1 N1 A A 130 ? ? O2 A U 264 ? ? 1.82 217 1 P A A 1015 ? ? CE1 S HIS 14 ? ? 1.83 218 1 N6 A A 190 ? ? O T LEU 104 ? ? 1.83 219 1 "O3'" A C 390 ? ? NH2 P ARG 28 ? ? 1.83 220 1 N2 A G 922 ? ? C5 A A 1396 ? ? 1.84 221 1 C2 A A 189 ? ? CA T ALA 106 ? ? 1.84 222 1 C2 A A 51 ? ? "O2'" A C 314 ? ? 1.84 223 1 "O3'" A G 928 ? ? N4 A C 1533 ? ? 1.85 224 1 O6 A G 760 ? ? CB Q ALA 105 ? ? 1.85 225 1 "C1'" A G 142 ? ? N1 A A 196 ? ? 1.85 226 1 OP1 A U 835 ? ? NH2 R ARG 64 ? ? 1.85 227 1 "O3'" A A 1329 ? ? C M ILE 25 ? ? 1.85 228 1 "O4'" A A 1261 ? ? "C4'" A G 1283 ? ? 1.86 229 1 C6 A A 189 ? ? NH2 T ARG 89 ? ? 1.86 230 1 OP2 A U 261 ? ? NH2 T ARG 79 ? ? 1.86 231 1 OP1 A C 1367 ? ? N I GLY 115 ? ? 1.86 232 1 "O4'" A A 935 ? ? O2 A C 1384 ? ? 1.87 233 1 N6 A A 189 ? ? NH2 T ARG 89 ? ? 1.87 234 1 OP2 A A 1457 ? ? C4 A C 1459 ? ? 1.87 235 1 "C5'" A A 1457 ? ? C6 A C 1459 ? ? 1.87 236 1 N3 A A 130 ? ? "O4'" A U 264 ? ? 1.87 237 1 "C5'" A A 1014 ? ? CD2 S HIS 14 ? ? 1.87 238 1 "C4'" A A 994 ? ? CE N LYS 11 ? ? 1.88 239 1 "O4'" A C 355 ? ? "O2'" A G 388 ? ? 1.88 240 1 "O2'" A C 1277 ? ? C8 A A 1279 ? ? 1.88 241 1 O6 A G 31 ? ? "O4'" A C 48 ? ? 1.88 242 1 "O3'" A C 131 ? ? "O2'" A A 262 ? ? 1.88 243 1 "O2'" A C 186 ? ? SD T MET 85 ? ? 1.89 244 1 "C3'" A C 217 ? ? "O2'" A C 469 ? ? 1.89 245 1 "O2'" A A 737 ? ? CG F ASN 73 ? ? 1.89 246 1 O2 A U 820 ? ? C8 A A 873 ? ? 1.89 247 1 "C2'" A G 318 ? ? "O2'" A A 1468 ? ? 1.89 248 1 N2 A G 1497 ? ? N3 A A 1519 ? ? 1.89 249 1 N7 A A 397 ? ? "O2'" A A 547 ? ? 1.89 250 1 "O2'" A G 581 ? ? O Q ALA 105 ? ? 1.89 251 1 N2 A G 112 ? ? "C5'" A G 354 ? ? 1.90 252 1 OP2 A A 559 ? ? NH2 E ARG 126 ? ? 1.90 253 1 "C3'" A C 216 ? ? N3 A A 468 ? ? 1.90 254 1 "O4'" A A 130 ? ? "C4'" A U 264 ? ? 1.90 255 1 N6 A A 190 ? ? N T SER 105 ? ? 1.90 256 1 "O3'" A G 570 ? ? "O2'" A A 819 ? ? 1.91 257 1 OP2 A G 976 ? ? "O2'" A U 1358 ? ? 1.91 258 1 O4 A U 261 ? ? CD T ARG 79 ? ? 1.91 259 1 OP1 A C 132 ? ? OD1 T ASN 75 ? ? 1.91 260 1 OP1 A A 1015 ? ? CE1 S HIS 14 ? ? 1.91 261 1 N1 A A 116 ? ? "O2'" A A 313 ? ? 1.92 262 1 OP1 A G 1371 ? ? O I LYS 11 ? ? 1.92 263 1 "O3'" A U 323 ? ? CB T ARG 22 ? ? 1.92 264 1 "O2'" A A 196 ? ? O2 A C 221 ? ? 1.92 265 1 "O2'" A A 1067 ? ? "O3'" A A 1093 ? ? 1.92 266 1 N1 A C 217 ? ? "O2'" A C 469 ? ? 1.92 267 1 C2 A A 130 ? ? C2 A U 264 ? ? 1.92 268 1 "O2'" A C 217 ? ? "O3'" A C 469 ? ? 1.93 269 1 C2 A A 189 ? ? CB T ALA 106 ? ? 1.93 270 1 "O2'" A C 216 ? ? "O4'" A C 469 ? ? 1.93 271 1 N1 A A 994 ? ? C N LYS 4 ? ? 1.93 272 1 C5 A A 189 ? ? N T ALA 106 ? ? 1.93 273 1 N4 A C 280 ? ? CZ Q ARG 91 ? ? 1.93 274 1 C2 A G 922 ? ? C6 A A 1396 ? ? 1.93 275 1 C6 A A 994 ? ? CB N ALA 5 ? ? 1.93 276 1 OP2 A A 1329 ? ? N M ALA 28 ? ? 1.93 277 1 C4 A C 280 ? ? NH1 Q ARG 91 ? ? 1.93 278 1 OP1 A A 130 ? ? NE Q ARG 63 ? ? 1.93 279 1 C2 A A 994 ? ? CA N ALA 5 ? ? 1.94 280 1 N3 A C 19 ? ? N1 A G 916 ? ? 1.94 281 1 N7 A A 189 ? ? N T SER 105 ? ? 1.94 282 1 "O4'" A A 923 ? ? C2 A A 1398 ? ? 1.94 283 1 OP1 A A 1329 ? ? CA M ALA 28 ? ? 1.94 284 1 "C1'" A A 141 ? ? C2 A U 182 ? ? 1.94 285 1 "O4'" A A 141 ? ? C2 A U 182 ? ? 1.95 286 1 OP1 A C 237 ? ? CD Q LYS 40 ? ? 1.95 287 1 OP2 A G 44 ? ? CB P LYS 12 ? ? 1.95 288 1 "O2'" A C 217 ? ? "C3'" A C 469 ? ? 1.96 289 1 N1 A G 922 ? ? N6 A A 1396 ? ? 1.96 290 1 "O3'" A A 1457 ? ? C6 A C 1459 ? ? 1.96 291 1 OP1 A U 626 ? ? NZ P LYS 35 ? ? 1.96 292 1 OD2 K ASP 110 ? ? NZ R LYS 88 ? ? 1.96 293 1 "C4'" A A 1014 ? ? NE2 S HIS 14 ? ? 1.97 294 1 P A A 1457 ? ? C4 A C 1459 ? ? 1.97 295 1 N3 A A 1256 ? ? N1 A G 1258 ? ? 1.97 296 1 "O3'" A A 1457 ? ? 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"O3'" A C 366 ? ? 126.76 113.70 13.06 1.60 N 62 1 "C2'" A C 372 ? ? "C3'" A C 372 ? ? "O3'" A C 372 ? ? 123.86 113.70 10.16 1.60 N 63 1 "C3'" A U 375 ? ? "O3'" A U 375 ? ? P A G 376 ? ? 142.86 119.70 23.16 1.20 Y 64 1 "O3'" A U 375 ? ? P A G 376 ? ? "O5'" A G 376 ? ? 90.21 104.00 -13.79 1.90 Y 65 1 "O3'" A U 375 ? ? P A G 376 ? ? OP1 A G 376 ? ? 132.41 110.50 21.91 1.10 Y 66 1 "O3'" A U 387 ? ? P A G 388 ? ? "O5'" A G 388 ? ? 90.40 104.00 -13.60 1.90 Y 67 1 "O3'" A U 387 ? ? P A G 388 ? ? OP1 A G 388 ? ? 134.18 110.50 23.68 1.10 Y 68 1 "C3'" A G 394 ? ? "O3'" A G 394 ? ? P A C 395 ? ? 132.31 119.70 12.61 1.20 Y 69 1 "O3'" A G 394 ? ? P A C 395 ? ? OP1 A C 395 ? ? 123.24 110.50 12.74 1.10 Y 70 1 "C3'" A G 396 ? ? "O3'" A G 396 ? ? P A A 397 ? ? 133.94 119.70 14.24 1.20 Y 71 1 "O3'" A G 396 ? ? P A A 397 ? ? OP1 A A 397 ? ? 119.86 110.50 9.36 1.10 Y 72 1 "C3'" A A 397 ? ? "O3'" A A 397 ? ? P A C 398 ? ? 127.76 119.70 8.06 1.20 Y 73 1 "O3'" A A 397 ? ? P A C 398 ? ? OP1 A C 398 ? ? 118.94 110.50 8.44 1.10 Y 74 1 "C3'" A C 403 ? ? "O3'" A C 403 ? ? P A U 404 ? ? 84.98 119.70 -34.72 1.20 Y 75 1 "O3'" A C 403 ? ? P A U 404 ? ? OP2 A U 404 ? ? 132.79 110.50 22.29 1.10 Y 76 1 "O3'" A C 403 ? ? P A U 404 ? ? OP1 A U 404 ? ? 73.95 105.20 -31.25 2.20 Y 77 1 "C3'" A C 436 ? ? "O3'" A C 436 ? ? P A U 437 ? ? 78.51 119.70 -41.19 1.20 Y 78 1 "O3'" A C 436 ? ? P A U 437 ? ? "O5'" A U 437 ? ? 52.62 104.00 -51.38 1.90 Y 79 1 "O3'" A C 436 ? ? P A U 437 ? ? OP2 A U 437 ? ? 157.62 110.50 47.12 1.10 Y 80 1 "O3'" A C 436 ? ? P A U 437 ? ? OP1 A U 437 ? ? 80.68 105.20 -24.52 2.20 Y 81 1 "C3'" A C 461 ? ? "O3'" A C 461 ? ? P A A 462 ? ? 141.86 119.70 22.16 1.20 Y 82 1 "O3'" A C 461 ? ? P A A 462 ? ? OP2 A A 462 ? ? 83.58 105.20 -21.62 2.20 Y 83 1 "O3'" A C 461 ? ? P A A 462 ? ? OP1 A A 462 ? ? 121.84 110.50 11.34 1.10 Y 84 1 "O3'" A A 499 ? ? P A G 500 ? ? "O5'" A G 500 ? ? 86.32 104.00 -17.68 1.90 Y 85 1 "O3'" A A 499 ? ? P A G 500 ? ? OP2 A G 500 ? ? 123.90 110.50 13.40 1.10 Y 86 1 "C2'" A A 509 ? ? "C3'" A A 509 ? ? "O3'" A A 509 ? ? 123.75 113.70 10.05 1.60 N 87 1 "C3'" A G 546 ? ? "O3'" A G 546 ? ? P A A 547 ? ? 130.78 119.70 11.08 1.20 Y 88 1 "O3'" A G 546 ? ? P A A 547 ? ? "O5'" A A 547 ? ? 118.21 104.00 14.21 1.90 Y 89 1 "O3'" A G 546 ? ? P A A 547 ? ? OP2 A A 547 ? ? 91.80 105.20 -13.40 2.20 Y 90 1 "C3'" A A 547 ? ? "O3'" A A 547 ? ? P A G 548 ? ? 86.94 119.70 -32.76 1.20 Y 91 1 "O3'" A A 547 ? ? P A G 548 ? ? "O5'" A G 548 ? ? 134.72 104.00 30.72 1.90 Y 92 1 "O3'" A A 547 ? ? P A G 548 ? ? OP2 A G 548 ? ? 72.59 105.20 -32.61 2.20 Y 93 1 "C3'" A C 556 ? ? "O3'" A C 556 ? ? P A G 557 ? ? 136.96 119.70 17.26 1.20 Y 94 1 "O3'" A C 556 ? ? P A G 557 ? ? OP2 A G 557 ? ? 76.53 105.20 -28.67 2.20 Y 95 1 "O3'" A C 556 ? ? P A G 557 ? ? OP1 A G 557 ? ? 125.76 110.50 15.26 1.10 Y 96 1 "C2'" A A 559 ? ? "C3'" A A 559 ? ? "O3'" A A 559 ? ? 129.68 113.70 15.98 1.60 N 97 1 "C3'" A U 561 ? ? "O3'" A U 561 ? ? P A C 562 ? ? 130.40 119.70 10.70 1.20 Y 98 1 "O3'" A U 561 ? ? P A C 562 ? ? "O5'" A C 562 ? ? 120.62 104.00 16.62 1.90 Y 99 1 "O3'" A U 561 ? ? P A C 562 ? ? OP1 A C 562 ? ? 89.90 105.20 -15.30 2.20 Y 100 1 "C2'" A G 575 ? ? "C3'" A G 575 ? ? "O3'" A G 575 ? ? 126.39 113.70 12.69 1.60 N 101 1 "C3'" A G 576 ? ? "O3'" A G 576 ? ? P A G 577 ? ? 101.48 119.70 -18.22 1.20 Y 102 1 "O3'" A G 576 ? ? P A G 577 ? ? OP1 A G 577 ? ? 86.18 105.20 -19.02 2.20 Y 103 1 "C3'" A C 651 ? ? "O3'" A C 651 ? ? P A U 652 ? ? 72.64 119.70 -47.06 1.20 Y 104 1 "O3'" A C 651 ? ? P A U 652 ? ? "O5'" A U 652 ? ? 146.47 104.00 42.47 1.90 Y 105 1 "O3'" A C 651 ? ? P A U 652 ? ? OP1 A U 652 ? ? 59.31 105.20 -45.89 2.20 Y 106 1 "C3'" A A 684 ? ? "O3'" A A 684 ? ? P A G 685 ? ? 137.19 119.70 17.49 1.20 Y 107 1 "O3'" A A 684 ? ? P A G 685 ? ? OP2 A G 685 ? ? 91.56 105.20 -13.64 2.20 Y 108 1 "O3'" A A 684 ? ? P A G 685 ? ? OP1 A G 685 ? ? 127.37 110.50 16.87 1.10 Y 109 1 "C2'" A A 687 ? ? "C3'" A A 687 ? ? "O3'" A A 687 ? ? 126.46 113.70 12.76 1.60 N 110 1 "O3'" A U 705 ? ? P A A 706 ? ? "O5'" A A 706 ? ? 88.56 104.00 -15.44 1.90 Y 111 1 "O3'" A U 705 ? ? P A A 706 ? ? OP2 A A 706 ? ? 121.02 110.50 10.52 1.10 Y 112 1 "C3'" A C 754 ? ? "O3'" A C 754 ? ? P A G 755 ? ? 99.42 119.70 -20.28 1.20 Y 113 1 "O3'" A C 754 ? ? P A G 755 ? ? "O5'" A G 755 ? ? 132.32 104.00 28.32 1.90 Y 114 1 "C2'" A A 792 ? ? "C3'" A A 792 ? ? "O3'" A A 792 ? ? 125.37 113.70 11.67 1.60 N 115 1 "C3'" A G 869 ? ? "O3'" A G 869 ? ? P A U 870 ? ? 130.51 119.70 10.81 1.20 Y 116 1 "O3'" A U 884 ? ? P A G 885 ? ? "O5'" A G 885 ? ? 90.65 104.00 -13.35 1.90 Y 117 1 "O3'" A C 893 ? ? P A G 894 ? ? "O5'" A G 894 ? ? 77.30 104.00 -26.70 1.90 Y 118 1 "O3'" A C 893 ? ? P A G 894 ? ? OP2 A G 894 ? ? 118.09 110.50 7.59 1.10 Y 119 1 "C3'" A U 905 ? ? "O3'" A U 905 ? ? P A G 906 ? ? 142.46 119.70 22.76 1.20 Y 120 1 "O3'" A U 905 ? ? P A G 906 ? ? "O5'" A G 906 ? ? 84.56 104.00 -19.44 1.90 Y 121 1 "O3'" A U 905 ? ? P A G 906 ? ? OP1 A G 906 ? ? 128.41 110.50 17.91 1.10 Y 122 1 "C3'" A G 933 ? ? "O3'" A G 933 ? ? P A C 934 ? ? 77.10 119.70 -42.60 1.20 Y 123 1 "O3'" A G 933 ? ? P A C 934 ? ? "O5'" A C 934 ? ? 126.45 104.00 22.45 1.90 Y 124 1 "O3'" A G 933 ? ? P A C 934 ? ? OP2 A C 934 ? ? 122.17 110.50 11.67 1.10 Y 125 1 "O3'" A G 933 ? ? P A C 934 ? ? OP1 A C 934 ? ? 61.39 105.20 -43.81 2.20 Y 126 1 "C3'" A G 944 ? ? "O3'" A G 944 ? ? P A G 945 ? ? 130.73 119.70 11.03 1.20 Y 127 1 "O3'" A G 944 ? ? P A G 945 ? ? "O5'" A G 945 ? ? 91.97 104.00 -12.03 1.90 Y 128 1 "O3'" A G 944 ? ? P A G 945 ? ? OP1 A G 945 ? ? 125.07 110.50 14.57 1.10 Y 129 1 "C3'" A U 960 ? ? "O3'" A U 960 ? ? P A U 961 ? ? 131.78 119.70 12.08 1.20 Y 130 1 "O3'" A U 960 ? ? P A U 961 ? ? OP2 A U 961 ? ? 89.39 105.20 -15.81 2.20 Y 131 1 "O3'" A U 960 ? ? P A U 961 ? ? OP1 A U 961 ? ? 135.70 110.50 25.20 1.10 Y 132 1 "C3'" A A 983 ? ? "O3'" A A 983 ? ? P A C 984 ? ? 136.27 119.70 16.57 1.20 Y 133 1 "O3'" A A 983 ? ? P A C 984 ? ? OP2 A C 984 ? ? 82.13 105.20 -23.07 2.20 Y 134 1 "O3'" A A 983 ? ? P A C 984 ? ? OP1 A C 984 ? ? 128.14 110.50 17.64 1.10 Y 135 1 "C3'" A G 1033 ? ? "O3'" A G 1033 ? ? P A G 1034 ? ? 139.97 119.70 20.27 1.20 Y 136 1 "O3'" A G 1033 ? ? P A G 1034 ? ? "O5'" A G 1034 ? ? 116.30 104.00 12.30 1.90 Y 137 1 "O3'" A G 1033 ? ? P A G 1034 ? ? OP2 A G 1034 ? ? 81.72 105.20 -23.48 2.20 Y 138 1 "O3'" A G 1033 ? ? P A G 1034 ? ? OP1 A G 1034 ? ? 120.61 110.50 10.11 1.10 Y 139 1 "C2'" A A 1067 ? ? "C3'" A A 1067 ? ? "O3'" A A 1067 ? ? 124.23 113.70 10.53 1.60 N 140 1 "C3'" A A 1110 ? ? "O3'" A A 1110 ? ? P A A 1111 ? ? 110.16 119.70 -9.54 1.20 Y 141 1 "O3'" A A 1110 ? ? P A A 1111 ? ? "O5'" A A 1111 ? ? 75.37 104.00 -28.63 1.90 Y 142 1 "O3'" A A 1110 ? ? P A A 1111 ? ? OP2 A A 1111 ? ? 132.78 110.50 22.28 1.10 Y 143 1 "O3'" A G 1182 ? ? P A A 1183 ? ? "O5'" A A 1183 ? ? 73.11 104.00 -30.89 1.90 Y 144 1 "O3'" A G 1182 ? ? P A A 1183 ? ? OP2 A A 1183 ? ? 143.95 110.50 33.45 1.10 Y 145 1 "C3'" A A 1183 ? ? "O3'" A A 1183 ? ? P A G 1184 ? ? 87.25 119.70 -32.45 1.20 Y 146 1 "O3'" A A 1183 ? ? P A G 1184 ? ? OP2 A G 1184 ? ? 72.71 105.20 -32.49 2.20 Y 147 1 "O3'" A A 1183 ? ? P A G 1184 ? ? OP1 A G 1184 ? ? 147.76 110.50 37.26 1.10 Y 148 1 "C3'" A G 1190 ? ? "O3'" A G 1190 ? ? P A A 1191 ? ? 94.42 119.70 -25.28 1.20 Y 149 1 "O3'" A G 1190 ? ? P A A 1191 ? ? "O5'" A A 1191 ? ? 133.69 104.00 29.69 1.90 Y 150 1 "O3'" A G 1190 ? ? P A A 1191 ? ? OP1 A A 1191 ? ? 75.85 105.20 -29.35 2.20 Y 151 1 "C3'" A G 1224 ? ? "O3'" A G 1224 ? ? P A A 1225 ? ? 106.43 119.70 -13.27 1.20 Y 152 1 "O3'" A G 1224 ? ? P A A 1225 ? ? "O5'" A A 1225 ? ? 137.03 104.00 33.03 1.90 Y 153 1 "O3'" A G 1224 ? ? P A A 1225 ? ? OP2 A A 1225 ? ? 76.31 105.20 -28.89 2.20 Y 154 1 N9 A A 1299 ? ? "C1'" A A 1299 ? ? "C2'" A A 1299 ? ? 125.10 114.00 11.10 1.30 N 155 1 "C3'" A C 1335 ? ? "O3'" A C 1335 ? ? 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