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N1 A DT 1 B ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 93 4 N3 A DT 1 B ? C2 A DT 1 B ? O2 A DT 1 B ? 118.65 122.30 -3.65 0.60 N 94 4 N1 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? N3 A DU 2 B ? 119.47 114.90 4.57 0.60 N 95 4 N3 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? O2 A DU 2 B ? 117.16 122.20 -5.04 0.70 N 96 4 C2 A DU 2 B ? N1 A DU 2 B ? "C1'" A DU 2 B ? 126.97 117.70 9.27 1.20 N 97 4 C5 A DG 3 B ? C6 A DG 3 B ? N1 A DG 3 B ? 114.56 111.50 3.06 0.50 N 98 4 "O4'" A DG 4 B ? "C1'" A DG 4 B ? N9 A DG 4 B ? 111.90 108.30 3.60 0.30 N 99 4 C5 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N1 A DA 5 B ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 100 4 N1 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N6 A DA 5 B ? 114.96 118.60 -3.64 0.60 N 101 4 N3 A DT 6 B ? C2 A DT 6 B ? O2 A DT 6 B ? 118.52 122.30 -3.78 0.60 N 102 4 N3 A DC 8 B ? C2 A DC 8 B ? O2 A DC 8 B ? 117.63 121.90 -4.27 0.70 N 103 4 C6 A DT 9 B ? C5 A DT 9 B ? C7 A DT 9 B ? 118.09 122.90 -4.81 0.60 N 104 5 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 105 5 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? 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C6 A DU 2 B ? N1 A DU 2 B ? 119.11 122.70 -3.59 0.50 N 119 5 N3 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? O2 A DU 2 B ? 117.02 122.20 -5.18 0.70 N 120 5 C2 A DU 2 B ? N1 A DU 2 B ? "C1'" A DU 2 B ? 126.30 117.70 8.60 1.20 N 121 5 C5 A DG 3 B ? C6 A DG 3 B ? N1 A DG 3 B ? 114.59 111.50 3.09 0.50 N 122 5 "O4'" A DG 4 B ? "C1'" A DG 4 B ? N9 A DG 4 B ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 123 5 C5 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N1 A DA 5 B ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 124 5 N1 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N6 A DA 5 B ? 114.88 118.60 -3.72 0.60 N 125 5 N3 A DT 6 B ? C2 A DT 6 B ? O2 A DT 6 B ? 118.45 122.30 -3.85 0.60 N 126 5 N3 A DC 8 B ? C2 A DC 8 B ? O2 A DC 8 B ? 117.66 121.90 -4.24 0.70 N 127 5 C6 A DT 9 B ? C5 A DT 9 B ? C7 A DT 9 B ? 118.11 122.90 -4.79 0.60 N 128 6 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 129 6 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 130 6 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 131 6 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 132 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 133 6 C5 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? N1 A DG 2 ? ? 114.51 111.50 3.01 0.50 N 134 6 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 135 6 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 136 6 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 137 6 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 114.73 118.60 -3.87 0.60 N 138 6 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? "C2'" A DT 5 ? ? 100.34 105.90 -5.56 0.80 N 139 6 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 140 6 "O4'" A DC 7 ? ? "C1'" A DC 7 ? ? N1 A DC 7 ? ? 111.96 108.30 3.66 0.30 N 141 6 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 117.06 122.90 -5.84 0.60 N 142 6 "O4'" A DT 1 B ? "C1'" A DT 1 B ? N1 A DT 1 B ? 111.47 108.30 3.17 0.30 N 143 6 N1 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? N3 A DU 2 B ? 119.30 114.90 4.40 0.60 N 144 6 C5 A DU 2 B ? C6 A DU 2 B ? N1 A DU 2 B ? 119.11 122.70 -3.59 0.50 N 145 6 N3 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? O2 A DU 2 B ? 117.01 122.20 -5.19 0.70 N 146 6 C2 A DU 2 B ? N1 A DU 2 B ? "C1'" A DU 2 B ? 126.26 117.70 8.56 1.20 N 147 6 C5 A DG 3 B ? C6 A DG 3 B ? N1 A DG 3 B ? 114.52 111.50 3.02 0.50 N 148 6 "O4'" A DG 4 B ? "C1'" A DG 4 B ? N9 A DG 4 B ? 112.00 108.30 3.70 0.30 N 149 6 C5 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N1 A DA 5 B ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 150 6 N3 A DT 6 B ? C2 A DT 6 B ? O2 A DT 6 B ? 118.48 122.30 -3.82 0.60 N 151 6 N3 A DC 8 B ? C2 A DC 8 B ? O2 A DC 8 B ? 117.67 121.90 -4.23 0.70 N 152 6 C6 A DT 9 B ? C5 A DT 9 B ? C7 A DT 9 B ? 118.14 122.90 -4.76 0.60 N 153 7 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 154 7 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 155 7 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 156 7 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N6 A DA 1 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 157 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 158 7 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.99 117.00 -3.01 0.50 N 159 7 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.52 117.70 3.82 0.50 N 160 7 "C1'" A DT 5 ? ? "O4'" A DT 5 ? ? "C4'" A DT 5 ? ? 104.01 110.10 -6.09 1.00 N 161 7 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? "C2'" A DT 5 ? ? 100.23 105.90 -5.67 0.80 N 162 7 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.21 122.90 -3.69 0.60 N 163 7 "O4'" A DC 7 ? ? "C1'" A DC 7 ? ? N1 A DC 7 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 164 7 C6 A DT 9 ? ? C5 A DT 9 ? ? C7 A DT 9 ? ? 116.92 122.90 -5.98 0.60 N 165 7 "O4'" A DT 1 B ? "C1'" A DT 1 B ? N1 A DT 1 B ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 166 7 N3 A DT 1 B ? C2 A DT 1 B ? O2 A DT 1 B ? 118.54 122.30 -3.76 0.60 N 167 7 N1 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? N3 A DU 2 B ? 119.48 114.90 4.58 0.60 N 168 7 N3 A DU 2 B ? C2 A DU 2 B ? O2 A DU 2 B ? 117.16 122.20 -5.04 0.70 N 169 7 C2 A DU 2 B ? N1 A DU 2 B ? "C1'" A DU 2 B ? 126.97 117.70 9.27 1.20 N 170 7 C5 A DG 3 B ? C6 A DG 3 B ? N1 A DG 3 B ? 114.56 111.50 3.06 0.50 N 171 7 "O4'" A DG 4 B ? "C1'" A DG 4 B ? N9 A DG 4 B ? 111.92 108.30 3.62 0.30 N 172 7 C5 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N1 A DA 5 B ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 173 7 N1 A DA 5 B ? C6 A DA 5 B ? N6 A DA 5 B ? 114.82 118.60 -3.78 0.60 N 174 7 N3 A DT 6 B ? C2 A DT 6 B ? O2 A DT 6 B ? 118.33 122.30 -3.97 0.60 N 175 7 C6 A DT 6 B ? C5 A DT 6 B ? C7 A DT 6 B ? 118.95 122.90 -3.95 0.60 N 176 7 "O4'" A DC 7 B ? "C1'" A DC 7 B ? N1 A DC 7 B ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 177 7 N3 A DC 8 B ? C2 A DC 8 B ? O2 A DC 8 B ? 117.56 121.90 -4.34 0.70 N 178 7 C6 A DT 9 B ? C5 A DT 9 B ? C7 A DT 9 B ? 118.15 122.90 -4.75 0.60 N 179 8 "O4'" A DA 1 ? ? "C1'" A DA 1 ? ? N9 A DA 1 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 180 8 C4 A DA 1 ? ? C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 181 8 C5 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? N1 A DA 1 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 182 8 N1 A DA 1 ? ? C6 A DA 1 ? ? 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A 9 B 20 1 1 A DG 6 1_555 A DC 21 1_555 -0.595 -0.268 -0.432 -10.085 -2.524 -1.658 2 A_DG2:DC8B_A A 2 ? A 8 B 19 1 1 A DG 7 1_555 A DC 20 1_555 -0.455 -0.203 -0.209 -6.437 6.336 -0.888 3 A_DG3:DC7B_A A 3 ? A 7 B 19 1 1 A DA 8 1_555 A DT 19 1_555 0.006 -0.123 -0.252 1.464 2.588 -0.731 4 A_DA4:DT6B_A A 4 ? A 6 B 20 1 1 A DT 9 1_555 A DA 18 1_555 0.047 -0.144 -0.584 9.023 2.743 0.467 5 A_DT5:DA5B_A A 5 ? A 5 B 20 1 1 A DC 10 1_555 A DG 17 1_555 0.665 -0.245 -0.012 -4.653 2.984 0.513 6 A_DC6:DG4B_A A 6 ? A 4 B 19 1 1 A DC 11 1_555 A DG 16 1_555 0.224 -0.126 0.087 -16.018 -4.711 -2.386 7 A_DC7:DG3B_A A 7 ? A 3 B 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DA 5 1_555 A DT 22 1_555 A DG 6 1_555 A DC 21 1_555 -0.728 -1.837 3.168 -1.759 15.964 27.633 -5.763 1.058 1.892 30.389 3.349 31.883 1 AA_DA1DG2:DC8BDT9B_AA A 1 ? A 9 B A 2 ? A 8 B 1 A DG 6 1_555 A DC 21 1_555 A DG 7 1_555 A DC 20 1_555 0.503 -1.565 3.098 1.218 2.295 36.117 -2.821 -0.649 3.011 3.696 -1.962 36.207 2 AA_DG2DG3:DC7BDC8B_AA A 2 ? A 8 B A 3 ? A 7 B 1 A DG 7 1_555 A DC 20 1_555 A DA 8 1_555 A DT 19 1_555 0.127 -1.800 3.074 2.964 1.591 33.540 -3.345 0.228 2.988 2.748 -5.120 33.704 3 AA_DG3DA4:DT6BDC7B_AA A 3 ? A 7 B A 4 ? A 6 B 1 A DA 8 1_555 A DT 19 1_555 A DT 9 1_555 A DA 18 1_555 0.804 -1.442 3.143 2.077 -0.151 26.066 -3.148 -1.228 3.204 -0.333 -4.596 26.147 4 AA_DA4DT5:DA5BDT6B_AA A 4 ? A 6 B A 5 ? A 5 B 1 A DT 9 1_555 A DA 18 1_555 A DC 10 1_555 A DG 17 1_555 -0.234 -1.398 3.558 -5.637 4.204 41.330 -2.426 -0.304 3.408 5.904 7.917 41.898 5 AA_DT5DC6:DG4BDA5B_AA A 5 ? A 5 B A 6 ? A 4 B 1 A DC 10 1_555 A DG 17 1_555 A DC 11 1_555 A DG 16 1_555 -0.323 -2.139 3.437 2.833 -0.772 31.873 -3.733 1.125 3.446 -1.401 -5.145 32.005 6 AA_DC6DC7:DG3BDG4B_AA A 6 ? A 4 B A 7 ? A 3 B #