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UNP P11413 ARG 458 variant 459 4 5 1QKI LEU E 458 ? UNP P11413 ARG 458 variant 459 5 6 1QKI LEU F 458 ? UNP P11413 ARG 458 variant 459 6 7 1QKI LEU G 458 ? UNP P11413 ARG 458 variant 459 7 8 1QKI LEU H 458 ? UNP P11413 ARG 458 variant 459 8 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GOA non-polymer . 'GLYCOLIC ACID' 'HYDROXYACETIC ACID; HYDROXYETHANOIC ACID' 'C2 H4 O3' 76.051 GOL non-polymer . GLYCEROL 'GLYCERIN; PROPANE-1,2,3-TRIOL' 'C3 H8 O3' 92.094 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAP non-polymer . 'NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE' ;2'-MONOPHOSPHOADENOSINE 5'-DIPHOSPHORIBOSE ; 'C21 H28 N7 O17 P3' 743.405 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1QKI _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 3 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.04 _exptl_crystal.density_percent_sol 59.5 _exptl_crystal.description '3 DATA SETS WERE MERGED, SEE REFERENCE 1.' # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 5.80 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION. 1+1 MICROLITER DROPS IN THE WELL 0.1M SODIUM CITRATE, 0.05M GLYCOLIC ACID, PH 5.8. PROTEIN CONCENTRATION 10MG/ML ; # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100.0 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector 'IMAGE PLATE' _diffrn_detector.type MARRESEARCH _diffrn_detector.pdbx_collection_date 1997-02-15 _diffrn_detector.details MIRRORS # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'GRAPHITE(002)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 0.870 1.0 2 1.488 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SRS BEAMLINE PX9.6' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SRS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline PX9.6 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list '0.870, 1.488' # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 1QKI _reflns.observed_criterion_sigma_I 4.000 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 25.000 _reflns.d_resolution_high 3.000 _reflns.number_obs 98864 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 85.3 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.11100 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 5.2000 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 2.200 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 3.00 _reflns_shell.d_res_low 3.20 _reflns_shell.percent_possible_all 74.7 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value 0.56500 _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.400 _reflns_shell.pdbx_redundancy 1.80 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 1QKI _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 98864 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF 1000000 _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF 0.001 _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 25 _refine.ls_d_res_high 3.0 _refine.ls_percent_reflns_obs 85.3 _refine.ls_R_factor_obs 0.247 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.247 _refine.ls_R_factor_R_free 0.294 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0 _refine.ls_number_reflns_R_free 4918 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method 'FREE R-VALUE' _refine.details ;LITTLE OF THE N-TERMINAL TAIL IS SEEN IN THE ELECTRON DENSITY MAP; SEGMENTS BUILT HERE VARY IN LENGTH AND CONFORMATION IN EACH SUBUNIT AND DO NOT OBEY THE NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY. FOR DETAILS OF THE RESIDUES RESTRAINED IN NCS GROUPS 1 AND 2, SEE JRNL REFERENCE. PARAMETER FILES FOR GLYCOLATE AND GLYCEROL ARE COMBINED INTO ONE FILE. TOPOLOGY FILES FOR GLYCOLATE AND GLYCEROL ARE COMBINED INTO ONE FILE. ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRY 1DPG' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details 'RANDOM IN THIN SHELLS' _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_analyze.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_analyze.entry_id 1QKI _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_obs ? _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_obs 0.57 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_obs 25 _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_free ? _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_free ? _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_free ? _refine_analyze.number_disordered_residues ? _refine_analyze.occupancy_sum_hydrogen ? _refine_analyze.occupancy_sum_non_hydrogen ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 31154 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 454 _refine_hist.number_atoms_solvent 55 _refine_hist.number_atoms_total 31663 _refine_hist.d_res_high 3.0 _refine_hist.d_res_low 25 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function x_bond_d 0.008 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg 1.54 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d 22.14 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d 1.17 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_mcbond_it 3.45 1.5 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_mcangle_it 5.24 2.0 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_scbond_it 3.45 1.5 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_scangle_it 5.24 2.0 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_restr_ncs.dom_id 1 _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details ? _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position 0.84 _refine_ls_restr_ncs.weight_position 50.0 _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso 3.21 _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso 1.0 _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal 1 _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type . _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id . _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 1 _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number ? _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id ? _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms ? _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 3.0 _refine_ls_shell.d_res_low 3.05 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 3769 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.405 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 72 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.449 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free 5.0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 192 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # loop_ _pdbx_xplor_file.pdbx_refine_id _pdbx_xplor_file.serial_no _pdbx_xplor_file.param_file _pdbx_xplor_file.topol_file 'X-RAY DIFFRACTION' 1 PARHCSDX.PRO TOPHCSDX.PRO 'X-RAY DIFFRACTION' 2 PARAM19.SOL TOPH19.SOL 'X-RAY DIFFRACTION' 3 GLYCOLATE_GLYCEROL.PAR GLYCOLATE_GLYCEROL.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 4 NADP.PAR NADP.TOP # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 0.145490 -0.927760 0.343650 -0.920080 -0.254570 -0.297750 0.363720 -0.272860 -0.890650 49.75400 128.18000 173.24400 2 given ? -0.914110 -0.030400 -0.404320 -0.072200 -0.969040 0.236100 -0.398990 0.245020 0.883620 53.47000 129.84800 -4.69800 3 given ? -0.221550 0.971910 0.079460 0.971970 0.213530 0.098350 0.078620 0.099030 -0.991970 -68.50400 42.80700 154.88400 4 given ? 0.979150 0.201460 0.026100 0.200450 -0.979010 0.036950 0.032990 -0.030950 -0.998980 -23.58900 190.87500 222.52000 5 given ? -0.121970 0.894050 -0.431040 -0.948320 0.023200 0.316470 0.292940 0.447360 0.845020 -40.40800 34.64600 -91.47600 6 given ? -0.899710 -0.108210 0.422860 -0.248320 0.923630 -0.291980 -0.358960 -0.367700 -0.857870 -31.18300 4.26700 247.82900 7 given ? 0.050340 -0.998560 -0.018830 0.995690 0.051650 -0.077070 0.077930 -0.014870 0.996850 135.14800 76.05600 -54.83100 8 given ? 0.143730 -0.920890 0.362370 -0.920330 -0.258980 -0.293110 0.363770 -0.291370 -0.884750 47.86600 127.98900 173.92000 9 given ? -0.905880 -0.036190 -0.421990 -0.063490 -0.973480 0.219770 -0.418750 0.225880 0.879560 55.32600 131.71500 -3.29900 10 given ? -0.232010 0.970820 0.060690 0.970420 0.226720 0.082980 0.066800 0.078150 -0.994700 -66.93400 42.48400 157.81000 11 given ? 0.972880 0.230640 -0.017780 0.231320 -0.970330 0.070350 -0.001030 -0.072550 -0.997360 -21.21900 184.47100 229.01100 12 given ? -0.093130 0.895400 -0.435420 -0.952760 0.046830 0.300090 0.289090 0.442800 0.848740 -40.21300 33.19300 -91.00000 13 given ? -0.888710 -0.133930 0.438480 -0.279360 0.916520 -0.286260 -0.363540 -0.376900 -0.851930 -30.05300 3.50600 248.24300 14 given ? 0.021030 -0.999690 0.013300 0.996090 0.019800 -0.086160 0.085870 0.015060 0.996190 130.99700 80.35700 -57.42400 # _struct_ncs_dom.id 1 _struct_ncs_dom.details ? _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 1QKI _struct.title 'X-RAY STRUCTURE OF HUMAN GLUCOSE 6-PHOSPHATE DEHYDROGENASE (VARIANT CANTON R459L) COMPLEXED WITH STRUCTURAL NADP+' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1QKI _struct_keywords.pdbx_keywords OXIDOREDUCTASE _struct_keywords.text 'OXIDOREDUCTASE, OXIDOREDUTASE, (CHOH(D)-NADP), GLUCOSE METABOLISM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 3 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 2 ? P N N 3 ? Q N N 4 ? R N N 2 ? S N N 3 ? T N N 2 ? U N N 3 ? V N N 4 ? W N N 2 ? X N N 3 ? Y N N 2 ? Z N N 3 ? AA N N 4 ? BA N N 2 ? CA N N 3 ? DA N N 5 ? EA N N 5 ? FA N N 5 ? GA N N 5 ? HA N N 5 ? IA N N 5 ? JA N N 5 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;THERE ARE TWO TETRAMERS ABCD AND EFGH IN THE ASYMMETRICUNIT; THESE ARE RELATED BY NON-CRYSTALLOGRAPHY SYMMETRY.DUE TO THE DIFFERENCE OF HINGE ANGLE IN EVERY SUBUNIT, TWOMATRICES ARE PROVIDED TO GENERATE A WHOLE SUBUNIT - ONEFOR THE COENZYME DOMAIN (RESIDUES 31- 200) AND ANOTHER FORTHE LARGE DOMAIN (RESIDUE 201 -511). PRO 172 IS ONLY INTHE CIS CONFORMATION IN SUBUNIT E. ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 A ASP A 41 ? ARG A 56 ? ASP A 42 ARG A 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 B LYS A 94 ? PHE A 101 ? LYS A 95 PHE A 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 C ALA A 114 ? ALA A 126 ? ALA A 115 ALA A 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 D PRO A 143 ? SER A 156 ? PRO A 144 SER A 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P5 E LEU A 176 ? LEU A 189 ? LEU A 177 LEU A 190 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 F1 HIS A 200 ? GLY A 203 ? HIS A 201 GLY A 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P7 F2 GLU A 205 ? PHE A 215 ? GLU A 206 PHE A 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 H GLY A 246 ? PHE A 249 ? GLY A 247 PHE A 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P9 I1 ILE A 254 ? ASP A 257 ? ILE A 255 ASP A 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P10 I2 HIS A 262 ? ALA A 271 ? HIS A 263 ALA A 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 J SER A 280 ? LEU A 291 ? SER A 281 LEU A 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 K GLY A 315 ? THR A 318 ? GLY A 316 THR A 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P13 L TYR A 423 ? ARG A 426 ? TYR A 424 ARG A 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P14 M ALA A 435 ? CYS A 445 ? ALA A 436 CYS A 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 N SER A 454 ? GLU A 474 ? SER A 455 GLU A 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P16 O THR A 489 ? ARG A 497 ? THR A 490 ARG A 498 1 ? 9 HELX_P HELX_P17 A ASP B 41 ? ARG B 56 ? ASP B 42 ARG B 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 B LYS B 94 ? PHE B 101 ? LYS B 95 PHE B 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 C ALA B 114 ? ALA B 126 ? ALA B 115 ALA B 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 D PRO B 143 ? SER B 156 ? PRO B 144 SER B 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P21 E SER B 178 ? ILE B 186 ? SER B 179 ILE B 187 1 ? 9 HELX_P HELX_P22 F1 HIS B 200 ? GLY B 203 ? HIS B 201 GLY B 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P23 F2 GLU B 205 ? PHE B 215 ? GLU B 206 PHE B 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 H GLY B 246 ? PHE B 249 ? GLY B 247 PHE B 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P25 I1 ILE B 254 ? ASP B 257 ? ILE B 255 ASP B 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P26 I2 HIS B 262 ? ALA B 271 ? HIS B 263 ALA B 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 J SER B 280 ? LEU B 291 ? SER B 281 LEU B 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 K GLY B 315 ? THR B 318 ? GLY B 316 THR B 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P29 L TYR B 423 ? ARG B 426 ? TYR B 424 ARG B 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P30 M ALA B 435 ? CYS B 445 ? ALA B 436 CYS B 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 N SER B 454 ? GLU B 474 ? SER B 455 GLU B 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P32 O THR B 489 ? ARG B 497 ? THR B 490 ARG B 498 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 A ASP C 41 ? ARG C 56 ? ASP C 42 ARG C 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P34 B LYS C 94 ? PHE C 101 ? LYS C 95 PHE C 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P35 C ALA C 114 ? ALA C 126 ? ALA C 115 ALA C 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 D PRO C 143 ? SER C 156 ? PRO C 144 SER C 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P37 E LEU C 176 ? SER C 187 ? LEU C 177 SER C 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P38 F1 HIS C 200 ? GLY C 203 ? HIS C 201 GLY C 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P39 F2 GLU C 205 ? PHE C 215 ? GLU C 206 PHE C 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 H GLY C 246 ? PHE C 249 ? GLY C 247 PHE C 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P41 I1 ILE C 254 ? ASP C 257 ? ILE C 255 ASP C 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P42 I2 HIS C 262 ? ALA C 271 ? HIS C 263 ALA C 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P43 J SER C 280 ? LEU C 291 ? SER C 281 LEU C 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P44 K GLY C 315 ? THR C 318 ? GLY C 316 THR C 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P45 L TYR C 423 ? ARG C 426 ? TYR C 424 ARG C 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P46 M ALA C 435 ? CYS C 445 ? ALA C 436 CYS C 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P47 N SER C 454 ? GLU C 474 ? SER C 455 GLU C 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P48 O THR C 489 ? VAL C 498 ? THR C 490 VAL C 499 1 ? 10 HELX_P HELX_P49 A ASP D 41 ? ARG D 56 ? ASP D 42 ARG D 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P50 B LYS D 94 ? PHE D 101 ? LYS D 95 PHE D 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P51 C ALA D 114 ? ALA D 126 ? ALA D 115 ALA D 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P52 D PRO D 143 ? SER D 156 ? PRO D 144 SER D 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P53 E LEU D 176 ? LEU D 189 ? LEU D 177 LEU D 190 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 F1 HIS D 200 ? GLY D 203 ? HIS D 201 GLY D 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P55 F2 GLU D 205 ? PHE D 215 ? GLU D 206 PHE D 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P56 H GLY D 246 ? GLU D 251 ? GLY D 247 GLU D 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P57 I1 ILE D 254 ? ASP D 257 ? ILE D 255 ASP D 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P58 I2 HIS D 262 ? ALA D 271 ? HIS D 263 ALA D 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P59 J SER D 280 ? LEU D 291 ? SER D 281 LEU D 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P60 K GLY D 315 ? THR D 318 ? GLY D 316 THR D 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P61 L TYR D 423 ? ARG D 426 ? TYR D 424 ARG D 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P62 M ALA D 435 ? CYS D 445 ? ALA D 436 CYS D 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P63 N SER D 454 ? GLU D 474 ? SER D 455 GLU D 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P64 O THR D 489 ? VAL D 498 ? THR D 490 VAL D 499 1 ? 10 HELX_P HELX_P65 A ASP E 41 ? ARG E 56 ? ASP E 42 ARG E 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P66 B LYS E 94 ? ARG E 103 ? LYS E 95 ARG E 104 1 ? 10 HELX_P HELX_P67 C ALA E 114 ? ALA E 126 ? ALA E 115 ALA E 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P68 D PRO E 143 ? SER E 156 ? PRO E 144 SER E 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P69 E ASP E 180 ? LEU E 189 ? ASP E 181 LEU E 190 1 ? 10 HELX_P HELX_P70 F1 HIS E 200 ? GLY E 203 ? HIS E 201 GLY E 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P71 F2 GLU E 205 ? PHE E 215 ? GLU E 206 PHE E 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P72 H GLY E 246 ? PHE E 249 ? GLY E 247 PHE E 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P73 I1 ILE E 254 ? ASP E 257 ? ILE E 255 ASP E 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P74 I2 HIS E 262 ? ALA E 271 ? HIS E 263 ALA E 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P75 J SER E 280 ? LEU E 291 ? SER E 281 LEU E 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P76 K GLY E 315 ? THR E 318 ? GLY E 316 THR E 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P77 L TYR E 423 ? ARG E 426 ? TYR E 424 ARG E 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P78 M ALA E 435 ? CYS E 445 ? ALA E 436 CYS E 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P79 N SER E 454 ? GLU E 474 ? SER E 455 GLU E 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P80 O THR E 489 ? VAL E 498 ? THR E 490 VAL E 499 1 ? 10 HELX_P HELX_P81 A ASP F 41 ? ARG F 56 ? ASP F 42 ARG F 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P82 B2 LYS F 94 ? PHE F 101 ? LYS F 95 PHE F 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P83 C ALA F 114 ? ALA F 126 ? ALA F 115 ALA F 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P84 D PRO F 143 ? SER F 156 ? PRO F 144 SER F 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P85 E LEU F 176 ? ILE F 186 ? LEU F 177 ILE F 187 1 ? 11 HELX_P HELX_P86 F1 HIS F 200 ? GLY F 203 ? HIS F 201 GLY F 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P87 F2 GLU F 205 ? PHE F 215 ? GLU F 206 PHE F 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P88 H GLY F 246 ? PHE F 249 ? GLY F 247 PHE F 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P89 I1 ILE F 254 ? ASP F 257 ? ILE F 255 ASP F 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P90 I2 HIS F 262 ? ALA F 271 ? HIS F 263 ALA F 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P91 J SER F 280 ? LEU F 291 ? SER F 281 LEU F 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P92 K GLY F 315 ? THR F 318 ? GLY F 316 THR F 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P93 L TYR F 423 ? ARG F 426 ? TYR F 424 ARG F 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P94 M ALA F 435 ? PHE F 444 ? ALA F 436 PHE F 445 1 ? 10 HELX_P HELX_P95 N SER F 454 ? GLU F 474 ? SER F 455 GLU F 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P96 O THR F 489 ? VAL F 498 ? THR F 490 VAL F 499 1 ? 10 HELX_P HELX_P97 A ASP G 41 ? ARG G 56 ? ASP G 42 ARG G 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P98 B LYS G 94 ? PHE G 101 ? LYS G 95 PHE G 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P99 C ALA G 114 ? ALA G 126 ? ALA G 115 ALA G 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P100 D PRO G 143 ? SER G 156 ? PRO G 144 SER G 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P101 E LEU G 176 ? LEU G 189 ? LEU G 177 LEU G 190 1 ? 14 HELX_P HELX_P102 F1 HIS G 200 ? GLY G 203 ? HIS G 201 GLY G 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P103 F2 GLU G 205 ? PHE G 215 ? GLU G 206 PHE G 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P104 H GLY G 246 ? PHE G 249 ? GLY G 247 PHE G 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P105 I1 ILE G 254 ? ASP G 257 ? ILE G 255 ASP G 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P106 I2 HIS G 262 ? ALA G 271 ? HIS G 263 ALA G 272 1 ? 10 HELX_P HELX_P107 J SER G 280 ? LEU G 291 ? SER G 281 LEU G 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P108 K GLY G 315 ? THR G 318 ? GLY G 316 THR G 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P109 L TYR G 423 ? ARG G 426 ? TYR G 424 ARG G 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P110 M ALA G 435 ? CYS G 445 ? ALA G 436 CYS G 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P111 N SER G 454 ? GLU G 474 ? SER G 455 GLU G 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P112 O THR G 489 ? VAL G 498 ? THR G 490 VAL G 499 1 ? 10 HELX_P HELX_P113 A ASP H 41 ? ARG H 56 ? ASP H 42 ARG H 57 1 ? 16 HELX_P HELX_P114 B LYS H 94 ? PHE H 101 ? LYS H 95 PHE H 102 1 ? 8 HELX_P HELX_P115 C ALA H 114 ? ALA H 126 ? ALA H 115 ALA H 127 1 ? 13 HELX_P HELX_P116 D PRO H 143 ? SER H 156 ? PRO H 144 SER H 157 1 ? 14 HELX_P HELX_P117 E LEU H 176 ? SER H 187 ? LEU H 177 SER H 188 1 ? 12 HELX_P HELX_P118 F1 HIS H 200 ? GLY H 203 ? HIS H 201 GLY H 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P119 F2 GLU H 205 ? PHE H 215 ? GLU H 206 PHE H 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P120 H GLY H 246 ? PHE H 249 ? GLY H 247 PHE H 250 1 ? 4 HELX_P HELX_P121 I1 ILE H 254 ? ASP H 257 ? ILE H 255 ASP H 258 1 ? 4 HELX_P HELX_P122 I2 LEU H 263 ? ALA H 271 ? LEU H 264 ALA H 272 1 ? 9 HELX_P HELX_P123 J SER H 280 ? LEU H 291 ? SER H 281 LEU H 292 1 ? 12 HELX_P HELX_P124 K GLY H 315 ? THR H 318 ? GLY H 316 THR H 319 5 ? 4 HELX_P HELX_P125 L TYR H 423 ? ARG H 426 ? TYR H 424 ARG H 427 1 ? 4 HELX_P HELX_P126 M ALA H 435 ? CYS H 445 ? ALA H 436 CYS H 446 1 ? 11 HELX_P HELX_P127 N SER H 454 ? GLU H 474 ? SER H 455 GLU H 475 1 ? 21 HELX_P HELX_P128 O THR H 489 ? VAL H 498 ? THR H 490 VAL H 499 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? C CYS 12 SG ? ? ? 1_555 C CYS 445 SG ? ? C CYS 13 C CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf2 disulf ? ? D CYS 12 SG ? ? ? 1_555 D CYS 445 SG ? ? D CYS 13 D CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? E CYS 12 SG ? ? ? 1_555 E CYS 445 SG ? ? E CYS 13 E CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf4 disulf ? ? F CYS 12 SG ? ? ? 1_555 F CYS 445 SG ? ? F CYS 13 F CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf5 disulf ? ? H CYS 12 SG ? ? ? 1_555 H CYS 445 SG ? ? H CYS 13 H CYS 446 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 394 A . ? GLN 395 A PRO 395 A ? PRO 396 A 1 -0.28 2 GLN 394 B . ? GLN 395 B PRO 395 B ? PRO 396 B 1 -0.26 3 GLN 394 C . ? GLN 395 C PRO 395 C ? PRO 396 C 1 -0.30 4 GLN 394 D . ? GLN 395 D PRO 395 D ? PRO 396 D 1 -0.11 5 LYS 170 E . ? LYS 171 E PRO 171 E ? PRO 172 E 1 0.17 6 GLN 394 E . ? GLN 395 E PRO 395 E ? PRO 396 E 1 -0.14 7 GLN 394 F . ? GLN 395 F PRO 395 F ? PRO 396 F 1 -0.18 8 GLN 394 G . ? GLN 395 G PRO 395 G ? PRO 396 G 1 -0.25 9 GLN 394 H . ? GLN 395 H PRO 395 H ? PRO 396 H 1 -0.11 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details COA ? 6 ? DIA ? 9 ? COB ? 6 ? DIB ? 9 ? COC ? 6 ? DIC ? 9 ? COD ? 6 ? DID ? 9 ? COE ? 6 ? DIE ? 9 ? COF ? 6 ? DIF ? 9 ? COG ? 6 ? DIG ? 9 ? COH ? 6 ? DIH ? 9 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense COA 1 2 ? parallel COA 2 3 ? parallel COA 3 4 ? parallel COA 4 5 ? parallel COA 5 6 ? parallel DIA 1 2 ? anti-parallel DIA 2 3 ? anti-parallel DIA 3 4 ? anti-parallel DIA 4 5 ? anti-parallel DIA 5 6 ? parallel DIA 6 7 ? anti-parallel DIA 7 8 ? anti-parallel DIA 8 9 ? parallel COB 1 2 ? parallel COB 2 3 ? parallel COB 3 4 ? parallel COB 4 5 ? parallel COB 5 6 ? parallel DIB 1 2 ? anti-parallel DIB 2 3 ? anti-parallel DIB 3 4 ? anti-parallel DIB 4 5 ? anti-parallel DIB 5 6 ? parallel DIB 6 7 ? anti-parallel DIB 7 8 ? anti-parallel DIB 8 9 ? parallel COC 1 2 ? parallel COC 2 3 ? parallel COC 3 4 ? parallel COC 4 5 ? parallel COC 5 6 ? parallel DIC 1 2 ? anti-parallel DIC 2 3 ? anti-parallel DIC 3 4 ? anti-parallel DIC 4 5 ? anti-parallel DIC 5 6 ? parallel DIC 6 7 ? anti-parallel DIC 7 8 ? anti-parallel DIC 8 9 ? parallel COD 1 2 ? parallel COD 2 3 ? parallel COD 3 4 ? parallel COD 4 5 ? parallel COD 5 6 ? parallel DID 1 2 ? anti-parallel DID 2 3 ? anti-parallel DID 3 4 ? anti-parallel DID 4 5 ? anti-parallel DID 5 6 ? parallel DID 6 7 ? anti-parallel DID 7 8 ? anti-parallel DID 8 9 ? parallel COE 1 2 ? parallel COE 2 3 ? parallel COE 3 4 ? parallel COE 4 5 ? parallel COE 5 6 ? parallel DIE 1 2 ? anti-parallel DIE 2 3 ? anti-parallel DIE 3 4 ? anti-parallel DIE 4 5 ? anti-parallel DIE 5 6 ? parallel DIE 6 7 ? anti-parallel DIE 7 8 ? anti-parallel DIE 8 9 ? parallel COF 1 2 ? parallel COF 2 3 ? parallel COF 3 4 ? parallel COF 4 5 ? parallel COF 5 6 ? parallel DIF 1 2 ? anti-parallel DIF 2 3 ? anti-parallel DIF 3 4 ? anti-parallel DIF 4 5 ? anti-parallel DIF 5 6 ? parallel DIF 6 7 ? anti-parallel DIF 7 8 ? anti-parallel DIF 8 9 ? parallel COG 1 2 ? parallel COG 2 3 ? parallel COG 3 4 ? parallel COG 4 5 ? parallel COG 5 6 ? parallel DIG 1 2 ? anti-parallel DIG 2 3 ? anti-parallel DIG 3 4 ? anti-parallel DIG 4 5 ? anti-parallel DIG 5 6 ? parallel DIG 6 7 ? anti-parallel DIG 7 8 ? anti-parallel DIG 8 9 ? parallel COH 1 2 ? parallel COH 2 3 ? parallel COH 3 4 ? parallel COH 4 5 ? parallel COH 5 6 ? parallel DIH 1 2 ? anti-parallel DIH 2 3 ? anti-parallel DIH 3 4 ? anti-parallel DIH 4 5 ? anti-parallel DIH 5 6 ? parallel DIH 6 7 ? anti-parallel DIH 7 8 ? anti-parallel DIH 8 9 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id COA 1 ASN A 104 ? 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ILE B 196 ARG B 198 DIB 1 PRO B 414 ? THR B 422 ? PRO B 415 THR B 423 DIB 2 ALA B 398 ? LYS B 406 ? ALA B 399 LYS B 407 DIB 3 GLU B 388 ? GLN B 394 ? GLU B 389 GLN B 395 DIB 4 LYS B 365 ? PHE B 372 ? LYS B 366 PHE B 373 DIB 5 ILE B 229 ? LYS B 237 ? ILE B 230 LYS B 238 DIB 6 PRO B 352 ? GLY B 358 ? PRO B 353 GLY B 359 DIB 7 PHE B 336 ? TYR B 342 ? PHE B 337 TYR B 343 DIB 8 VAL B 302 ? VAL B 308 ? VAL B 303 VAL B 309 DIB 9 ILE B 479 ? ILE B 482 ? ILE B 480 ILE B 483 COC 1 ASN C 104 ? ALA C 108 ? ASN C 105 ALA C 109 COC 2 ASN C 63 ? ALA C 70 ? ASN C 64 ALA C 71 COC 3 THR C 30 ? MET C 36 ? THR C 31 MET C 37 COC 4 ASN C 134 ? LEU C 139 ? ASN C 135 LEU C 140 COC 5 ASN C 164 ? VAL C 168 ? ASN C 165 VAL C 169 COC 6 ILE C 195 ? ARG C 197 ? ILE C 196 ARG C 198 DIC 1 PRO C 414 ? THR C 422 ? PRO C 415 THR C 423 DIC 2 ALA C 398 ? LYS C 406 ? ALA C 399 LYS C 407 DIC 3 GLU C 388 ? GLN C 394 ? GLU C 389 GLN C 395 DIC 4 LYS C 365 ? PHE C 372 ? LYS C 366 PHE C 373 DIC 5 ILE C 229 ? LYS C 237 ? ILE C 230 LYS C 238 DIC 6 PRO C 352 ? GLY C 358 ? PRO C 353 GLY C 359 DIC 7 PHE C 336 ? TYR C 342 ? PHE C 337 TYR C 343 DIC 8 VAL C 302 ? VAL C 308 ? VAL C 303 VAL C 309 DIC 9 ILE C 479 ? ILE C 482 ? ILE C 480 ILE C 483 COD 1 ASN D 104 ? ALA D 108 ? ASN D 105 ALA D 109 COD 2 THR D 64 ? ALA D 70 ? THR D 65 ALA D 71 COD 3 HIS D 31 ? MET D 36 ? HIS D 32 MET D 37 COD 4 ASN D 134 ? LEU D 139 ? ASN D 135 LEU D 140 COD 5 ASN D 164 ? VAL D 168 ? ASN D 165 VAL D 169 COD 6 ILE D 195 ? ARG D 197 ? ILE D 196 ARG D 198 DID 1 PRO D 414 ? THR D 422 ? PRO D 415 THR D 423 DID 2 ALA D 398 ? LYS D 406 ? ALA D 399 LYS D 407 DID 3 GLU D 388 ? GLN D 394 ? GLU D 389 GLN D 395 DID 4 LYS D 365 ? PHE D 372 ? LYS D 366 PHE D 373 DID 5 ILE D 229 ? LYS D 237 ? ILE D 230 LYS D 238 DID 6 PRO D 352 ? GLY D 358 ? PRO D 353 GLY D 359 DID 7 PHE D 336 ? TYR D 342 ? PHE D 337 TYR D 343 DID 8 VAL D 302 ? VAL D 308 ? VAL D 303 VAL D 309 DID 9 ILE D 479 ? ILE D 482 ? ILE D 480 ILE D 483 COE 1 ASN E 104 ? ALA E 108 ? ASN E 105 ALA E 109 COE 2 ASN E 63 ? ALA E 70 ? ASN E 64 ALA E 71 COE 3 THR E 30 ? MET E 36 ? THR E 31 MET E 37 COE 4 ASN E 134 ? LEU E 139 ? ASN E 135 LEU E 140 COE 5 ASN E 164 ? VAL E 168 ? ASN E 165 VAL E 169 COE 6 ILE E 195 ? ARG E 197 ? ILE E 196 ARG E 198 DIE 1 PRO E 414 ? THR E 422 ? PRO E 415 THR E 423 DIE 2 ALA E 398 ? LYS E 406 ? ALA E 399 LYS E 407 DIE 3 GLU E 388 ? GLN E 394 ? GLU E 389 GLN E 395 DIE 4 LYS E 365 ? PHE E 372 ? LYS E 366 PHE E 373 DIE 5 ILE E 229 ? LYS E 237 ? ILE E 230 LYS E 238 DIE 6 PRO E 352 ? GLY E 358 ? PRO E 353 GLY E 359 DIE 7 PHE E 336 ? TYR E 342 ? PHE E 337 TYR E 343 DIE 8 VAL E 302 ? VAL E 308 ? VAL E 303 VAL E 309 DIE 9 ILE E 479 ? ILE E 482 ? ILE E 480 ILE E 483 COF 1 ASN F 104 ? ALA F 108 ? ASN F 105 ALA F 109 COF 2 ASN F 63 ? ALA F 70 ? ASN F 64 ALA F 71 COF 3 THR F 30 ? MET F 36 ? THR F 31 MET F 37 COF 4 ASN F 134 ? LEU F 139 ? ASN F 135 LEU F 140 COF 5 ASN F 164 ? VAL F 168 ? ASN F 165 VAL F 169 COF 6 ILE F 195 ? ARG F 197 ? ILE F 196 ARG F 198 DIF 1 PRO F 414 ? THR F 422 ? PRO F 415 THR F 423 DIF 2 ALA F 398 ? LYS F 406 ? ALA F 399 LYS F 407 DIF 3 GLU F 388 ? GLN F 394 ? GLU F 389 GLN F 395 DIF 4 LYS F 365 ? PHE F 372 ? LYS F 366 PHE F 373 DIF 5 ILE F 229 ? LYS F 237 ? ILE F 230 LYS F 238 DIF 6 PRO F 352 ? GLY F 358 ? PRO F 353 GLY F 359 DIF 7 PHE F 336 ? TYR F 342 ? PHE F 337 TYR F 343 DIF 8 VAL F 302 ? VAL F 308 ? VAL F 303 VAL F 309 DIF 9 ILE F 479 ? ILE F 482 ? ILE F 480 ILE F 483 COG 1 ASN G 104 ? ALA G 108 ? ASN G 105 ALA G 109 COG 2 ASN G 63 ? ALA G 70 ? ASN G 64 ALA G 71 COG 3 THR G 30 ? MET G 36 ? THR G 31 MET G 37 COG 4 ASN G 134 ? LEU G 139 ? ASN G 135 LEU G 140 COG 5 ASN G 164 ? VAL G 168 ? ASN G 165 VAL G 169 COG 6 ILE G 195 ? ARG G 197 ? ILE G 196 ARG G 198 DIG 1 PRO G 414 ? THR G 422 ? PRO G 415 THR G 423 DIG 2 ALA G 398 ? LYS G 406 ? ALA G 399 LYS G 407 DIG 3 GLU G 388 ? GLN G 394 ? GLU G 389 GLN G 395 DIG 4 LYS G 365 ? PHE G 372 ? LYS G 366 PHE G 373 DIG 5 ILE G 229 ? LYS G 237 ? ILE G 230 LYS G 238 DIG 6 PRO G 352 ? GLY G 358 ? PRO G 353 GLY G 359 DIG 7 PHE G 336 ? TYR G 342 ? PHE G 337 TYR G 343 DIG 8 VAL G 302 ? VAL G 308 ? VAL G 303 VAL G 309 DIG 9 ILE G 479 ? ILE G 482 ? ILE G 480 ILE G 483 COH 1 ASN H 104 ? ALA H 108 ? ASN H 105 ALA H 109 COH 2 THR H 64 ? ALA H 70 ? THR H 65 ALA H 71 COH 3 HIS H 31 ? MET H 36 ? HIS H 32 MET H 37 COH 4 ASN H 134 ? LEU H 139 ? ASN H 135 LEU H 140 COH 5 ASN H 164 ? VAL H 168 ? ASN H 165 VAL H 169 COH 6 ILE H 195 ? ARG H 197 ? ILE H 196 ARG H 198 DIH 1 PRO H 414 ? THR H 422 ? PRO H 415 THR H 423 DIH 2 ALA H 398 ? LYS H 406 ? ALA H 399 LYS H 407 DIH 3 GLU H 388 ? GLN H 394 ? GLU H 389 GLN H 395 DIH 4 LYS H 365 ? PHE H 372 ? LYS H 366 PHE H 373 DIH 5 ILE H 229 ? LYS H 237 ? ILE H 230 LYS H 238 DIH 6 PRO H 352 ? GLY H 358 ? PRO H 353 GLY H 359 DIH 7 PHE H 336 ? TYR H 342 ? PHE H 337 TYR H 343 DIH 8 VAL H 302 ? VAL H 308 ? VAL H 303 VAL H 309 DIH 9 ILE H 479 ? ILE H 482 ? ILE H 480 ILE H 483 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id COA 1 2 N SER A 105 ? 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GA 5 HOH 3 2003 2003 HOH HOH D . GA 5 HOH 4 2004 2004 HOH HOH D . GA 5 HOH 5 2005 2005 HOH HOH D . GA 5 HOH 6 2006 2006 HOH HOH D . GA 5 HOH 7 2007 2007 HOH HOH D . GA 5 HOH 8 2008 2008 HOH HOH D . HA 5 HOH 1 2001 2001 HOH HOH E . HA 5 HOH 2 2002 2002 HOH HOH E . HA 5 HOH 3 2003 2003 HOH HOH E . HA 5 HOH 4 2004 2004 HOH HOH E . HA 5 HOH 5 2005 2005 HOH HOH E . HA 5 HOH 6 2006 2006 HOH HOH E . HA 5 HOH 7 2007 2007 HOH HOH E . HA 5 HOH 8 2008 2008 HOH HOH E . HA 5 HOH 9 2009 2009 HOH HOH E . HA 5 HOH 10 2010 2010 HOH HOH E . HA 5 HOH 11 2011 2011 HOH HOH E . IA 5 HOH 1 2001 2001 HOH HOH F . IA 5 HOH 2 2002 2002 HOH HOH F . IA 5 HOH 3 2003 2003 HOH HOH F . JA 5 HOH 1 2001 2001 HOH HOH H . JA 5 HOH 2 2002 2002 HOH HOH H . JA 5 HOH 3 2003 2003 HOH HOH H . JA 5 HOH 4 2004 2004 HOH HOH H . JA 5 HOH 5 2005 2005 HOH HOH H . JA 5 HOH 6 2006 2006 HOH HOH H . JA 5 HOH 7 2007 2007 HOH HOH H . JA 5 HOH 8 2008 2008 HOH HOH H . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 software_defined_assembly PQS tetrameric 4 2 software_defined_assembly PQS tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,DA,EA,FA,GA 2 1 E,F,G,H,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,HA,IA,JA # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 15740 ? 1 MORE -84.4 ? 1 'SSA (A^2)' 96080 ? 2 'ABSA (A^2)' 15380 ? 2 MORE -105.1 ? 2 'SSA (A^2)' 95420 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2000-03-16 2 'Structure model' 1 1 2011-05-08 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2019-05-08 5 'Structure model' 1 4 2019-05-22 6 'Structure model' 2 0 2023-11-15 7 'Structure model' 2 1 2023-12-13 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Experimental preparation' 5 4 'Structure model' Other 6 5 'Structure model' 'Data collection' 7 5 'Structure model' 'Refinement description' 8 6 'Structure model' 'Atomic model' 9 6 'Structure model' 'Data collection' 10 6 'Structure model' 'Database references' 11 6 'Structure model' 'Derived calculations' 12 6 'Structure model' Other 13 7 'Structure model' 'Refinement description' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' database_PDB_rev 2 4 'Structure model' database_PDB_rev_record 3 4 'Structure model' exptl_crystal_grow 4 4 'Structure model' pdbx_database_proc 5 4 'Structure model' pdbx_database_status 6 5 'Structure model' refine 7 6 'Structure model' atom_site 8 6 'Structure model' chem_comp_atom 9 6 'Structure model' chem_comp_bond 10 6 'Structure model' database_2 11 6 'Structure model' pdbx_database_status 12 6 'Structure model' struct_site 13 7 'Structure model' pdbx_initial_refinement_model # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_exptl_crystal_grow.method' 2 4 'Structure model' '_pdbx_database_status.date_author_approval' 3 4 'Structure model' '_pdbx_database_status.recvd_author_approval' 4 5 'Structure model' '_refine.pdbx_ls_cross_valid_method' 5 6 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 6 6 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 7 6 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 8 6 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 9 6 'Structure model' '_pdbx_database_status.status_code_sf' 10 6 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 11 6 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 12 6 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal X-PLOR refinement 3.851 ? 1 DENZO 'data reduction' . ? 2 SCALA 'data scaling' . ? 3 X-PLOR phasing 3.851 ? 4 # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 650 ; HELIX DETERMINATION METHOD: PROCHECK, WITH IDENTIFICATION CORRESPONDING TO THE 2.0A LEUCONOSTOC MESENTERODES STRUCTURE, 1DPG. THE BEND AT LYS 47 IN HELIX A OF ALL SUBUNITS IS A CONSEQUENCE OF THE CONSERVED PRO 50. ; 700 ; SHEET DETERMINATION METHOD: PROCHECK WITH EXTENSION TAKEN WHERE HYDROGEN BONDING INDICATES THAT THIS IS APPROPRIATE ; # _pdbx_entry_details.entry_id 1QKI _pdbx_entry_details.compound_details ;AS ALL THE EIGHT SUBUNITS ARE VERY SIMILAR, ONLY THE SALT BRIDGES WITHIN SUBUNIT A AND WITHIN SUBUNIT E ARE GIVEN. FOR DETAILS OF RESIDUES FORMING INTERSUBUNIT BRIDGES, SEE JRNL REFERENCE. ; _pdbx_entry_details.source_details ;THE G6PD PROTEIN USED IN THIS WORK IS THE NATURAL VARIANT ARG459 -> LEU (CANTON, CLASS II, FREQUENT IN CHINA). ; _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 C B PRO 143 ? ? 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? -171.31 -176.17 23 1 ARG A 330 ? ? -38.74 -30.51 24 1 GLN A 383 ? ? 37.38 23.46 25 1 GLN A 395 ? ? -174.88 145.99 26 1 GLU A 398 ? ? -37.99 122.08 27 1 SER A 418 ? ? -162.35 -166.69 28 1 LYS A 476 ? ? 34.86 66.93 29 1 VAL B 12 ? ? -80.47 -70.07 30 1 SER B 29 ? ? 24.34 80.71 31 1 LYS B 47 ? ? -131.81 -57.12 32 1 ARG B 74 ? ? -63.40 89.60 33 1 ILE B 80 ? ? -67.76 -84.96 34 1 LYS B 82 ? ? -104.20 45.96 35 1 GLN B 83 ? ? -149.46 -14.20 36 1 PHE B 87 ? ? 178.47 -1.05 37 1 LYS B 89 ? ? 73.97 56.54 38 1 TYR B 112 ? ? -78.37 40.09 39 1 ASP B 113 ? ? -156.49 -38.42 40 1 HIS B 129 ? ? -54.92 105.59 41 1 ALA B 141 ? ? -92.59 53.89 42 1 GLU B 156 ? ? -75.65 -70.84 43 1 ARG B 175 ? ? -146.29 -53.84 44 1 ASP B 194 ? ? -74.21 21.31 45 1 ASP B 200 ? ? -166.29 73.07 46 1 HIS B 201 ? ? -38.64 -23.84 47 1 PRO B 223 ? ? -57.17 -3.85 48 1 TRP B 225 ? ? -66.50 67.10 49 1 GLU B 244 ? ? -50.04 78.42 50 1 ARG B 246 ? ? -80.75 40.51 51 1 ASN B 262 ? ? -106.63 -82.99 52 1 ARG B 330 ? ? -38.94 -24.61 53 1 GLU B 347 ? 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