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ARG n 1 658 PHE n 1 659 ASP n 1 660 ILE n 1 661 LEU n 1 662 PRO n 1 663 SER n 1 664 ARG n 1 665 SER n 1 666 GLY n 1 667 THR n 1 668 LYS n 1 669 GLN n 1 670 LEU n 1 671 LEU n 1 672 ALA n 1 673 ASP n 1 674 PHE n 1 675 SER n 1 676 CYS n 1 677 ASN n 1 678 LYS n 1 679 PHE n 1 680 PRO n 1 681 ALA n 1 682 ILE n 1 683 LYS n 1 684 ALA n 1 685 MET n 1 686 LEU n 1 687 SER n 1 688 ILE n 1 689 ASP n 1 690 VAL n 1 691 ALA n 1 692 GLU n # _entity_src_gen.entity_id 1 _entity_src_gen.pdbx_src_id 1 _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag sample _entity_src_gen.pdbx_seq_type ? _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num ? _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num ? _entity_src_gen.gene_src_common_name human _entity_src_gen.gene_src_genus Homo _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene TGM3 _entity_src_gen.gene_src_species ? _entity_src_gen.gene_src_strain ? _entity_src_gen.gene_src_tissue Foreskin _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction ? _entity_src_gen.gene_src_details ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name 'Homo sapiens' _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id 9606 _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location ? _entity_src_gen.host_org_common_name 'fall armyworm' _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name 'Spodoptera frugiperda' _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id 7108 _entity_src_gen.host_org_genus Spodoptera _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ ? _entity_src_gen.host_org_species ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line sf9 _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type baculovirus _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector ? _entity_src_gen.host_org_details ? _entity_src_gen.expression_system_id ? _entity_src_gen.plasmid_name 'pET 11a vector (Novagen), PVL1392 (Invitrogen), Bac-N-Blue (Invitrogen)' _entity_src_gen.plasmid_details ? _entity_src_gen.pdbx_description 'See Reference 5 Below' # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code TGM3_HUMAN _struct_ref.pdbx_db_accession Q08188 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;AALGVQSINWQTAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQVLMIMNKGLGSNERLEFIVSTGPYPSESAMTKAVFPLSNGSS GGWSAVLQASNGNTLTISISSPASAPIGRYTMALQIFSQGGISSVKLGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAEREEYVQEDAG IIFVGSTNRIGMIGWNFGQFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRNDPKYVGRVLSAMINSNDDNGVLAGNWSGTY TGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQCWVFAGTLNTALRSLGIPSRVITNFNSAHDTDRNLSVDVYYDPMGNPLD KGSDSVWNFHVWNEGWFVRSDLGPSYGGWQVLDATPQERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFAEVNADRITWL YDNTTGKQWKNSVNSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKALGKLKPNTPFAATSSMGLETEEQEP SIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKTVTVNMTAWTIIYNGTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYE RYLKSDNMIRITAVCKVPDESEVVVERDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVRDCVLMVEGSGLLLGN LKIDVPTLGPKERSRVRFDILPSRSGTKQLLADFSCNKFPAIKAMLSIDVAE ; _struct_ref.pdbx_align_begin 2 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1SGX A 1 ? 692 ? Q08188 2 ? 693 ? 1 692 2 1 1SGX B 1 ? 692 ? Q08188 2 ? 693 ? 1 692 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 1SGX LEU A 264 ? UNP Q08188 PHE 265 ENGINEERED 264 1 2 1SGX LEU B 264 ? UNP Q08188 PHE 265 ENGINEERED 264 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 5GP non-polymer . "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CA non-polymer . 'CALCIUM ION' ? 'Ca 2' 40.078 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1SGX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol 57.14 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.87 _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 288 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.0 _exptl_crystal_grow.pdbx_details '4-10% (w/v) Peg 6000, 100 mM Na-Hepes pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # loop_ _diffrn.id _diffrn.ambient_temp _diffrn.ambient_temp_details _diffrn.crystal_id 1 100 ? 1 2 ? ? 1 # loop_ _diffrn_detector.diffrn_id _diffrn_detector.detector _diffrn_detector.type _diffrn_detector.pdbx_collection_date _diffrn_detector.details 1 'IMAGE PLATE' 'RIGAKU RAXIS IV' 2003-04-26 ? 2 CCD 'ADSC QUANTUM 4' 2003-04-26 ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'SI 111 channel' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 1.5418 1.0 2 0.97946 1.0 # loop_ _diffrn_source.diffrn_id _diffrn_source.source _diffrn_source.type _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline _diffrn_source.pdbx_wavelength _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1 'ROTATING ANODE' 'RIGAKU RU200' ? ? ? 1.5418 2 SYNCHROTRON 'NSLS BEAMLINE X9B' NSLS X9B ? 0.97946 # _reflns.entry_id 1SGX _reflns.observed_criterion_sigma_F 2.0 _reflns.observed_criterion_sigma_I 2.0 _reflns.d_resolution_high 2.0 _reflns.d_resolution_low 20.0 _reflns.number_all 104830 _reflns.number_obs 97639 _reflns.percent_possible_obs 90.3 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # _reflns_shell.d_res_high 2.00 _reflns_shell.d_res_low 2.07 _reflns_shell.percent_possible_all 81.7 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs ? _reflns_shell.pdbx_redundancy ? _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 # _refine.entry_id 1SGX _refine.ls_d_res_high 2.0 _refine.ls_d_res_low 20.0 _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.0 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_number_reflns_all 104830 _refine.ls_number_reflns_obs 104830 _refine.ls_number_reflns_R_free 9826 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_all 0.206 _refine.ls_R_factor_obs 0.241 _refine.ls_R_factor_R_work 0.206 _refine.ls_R_factor_R_free 0.241 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 'PDB 1RLL and 1RLN' _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.pdbx_R_Free_selection_details Random _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'Engh & Huber' _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model Isotropic _refine.B_iso_mean 23.2 _refine.aniso_B[1][1] -6.92 _refine.aniso_B[1][2] -2.32 _refine.aniso_B[1][3] 0.39 _refine.aniso_B[2][2] 9.36 _refine.aniso_B[2][3] 0.58 _refine.aniso_B[3][3] -2.44 _refine.details ;Chain A (1-692) disorder from 462-478 and chain B (1-692) disorder from 460-472, NCS rtwo fold averaging was employed during refinement ; _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_analyze.entry_id 1SGX _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_obs 0.24 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_obs 0.24 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_obs 5.00 _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_free 0.29 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_free 0.26 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_free ? _refine_analyze.number_disordered_residues ? _refine_analyze.occupancy_sum_non_hydrogen ? _refine_analyze.occupancy_sum_hydrogen ? _refine_analyze.pdbx_Luzzati_d_res_high_obs ? _refine_analyze.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 10567 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 54 _refine_hist.number_atoms_solvent 861 _refine_hist.number_atoms_total 11482 _refine_hist.d_res_high 2.0 _refine_hist.d_res_low 20.0 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function c_bond_d 0.006 ? 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'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d 1.3 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d 25.4 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d 0.75 ? ? ? 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ARG 268 B TYR 269 B ? TYR 269 B 1 -0.68 5 GLY 367 B . ? GLY 367 B PRO 368 B ? PRO 368 B 1 1.60 6 ASN 382 B . ? ASN 382 B PHE 383 B ? PHE 383 B 1 -0.08 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 9 ? B ? 2 ? C ? 2 ? D ? 6 ? E ? 3 ? F ? 3 ? G ? 4 ? H ? 3 ? I ? 4 ? J ? 9 ? K ? 2 ? L ? 2 ? M ? 6 ? N ? 3 ? O ? 2 ? P ? 3 ? Q ? 4 ? R ? 3 ? 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