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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1SL6 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2004-03-05 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf REL _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Guo, Y.' 1 'Feinberg, H.' 2 'Conroy, E.' 3 'Mitchell, D.A.' 4 'Alvarez, R.' 5 'Blixt, O.' 6 'Taylor, M.E.' 7 'Weis, W.I.' 8 'Drickamer, K.' 9 # _citation.id primary _citation.title ;Structural basis for distinct ligand-binding and targeting properties of the receptors DC-SIGN and DC-SIGNR ; _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_volume 11 _citation.page_first 591 _citation.page_last 598 _citation.year 2004 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 1545-9993 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 15195147 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/nsmb784 # 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WATER.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' # _database_PDB_matrix.entry_id 1SL6 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 1SL6 _struct.title ;Crystal Structure of a fragment of DC-SIGNR (containg the carbohydrate recognition domain and two repeats of the neck) complexed with Lewis-x. ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1SL6 _struct_keywords.pdbx_keywords 'SUGAR BINDING PROTEIN' _struct_keywords.text 'DC-SIGNR, C-TYPE LECTIN, SUGAR BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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GLN F 249 CYS F 265 1 ? 17 HELX_P HELX_P30 30 ASN F 73 ? GLU F 83 ? ASN F 288 GLU F 298 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 31 THR F 93 ? ASN F 108 ? THR F 308 ASN F 323 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 32 SER F 133 ? TRP F 140 ? 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D CYS 50 SG ? ? ? 1_555 D CYS 180 SG ? ? D CYS 265 D CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf11 disulf ? ? D CYS 53 SG ? ? ? 1_555 D CYS 64 SG ? ? D CYS 268 D CYS 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 81 SG ? ? ? 1_555 D CYS 174 SG ? ? D CYS 296 D CYS 389 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 50 SG ? ? ? 1_555 E CYS 180 SG ? ? E CYS 265 E CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf14 disulf ? ? E CYS 53 SG ? ? ? 1_555 E CYS 64 SG ? ? E CYS 268 E CYS 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf15 disulf ? ? E CYS 81 SG ? ? ? 1_555 E CYS 174 SG ? ? E CYS 296 E CYS 389 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? disulf16 disulf ? ? F CYS 50 SG ? ? ? 1_555 F CYS 180 SG ? ? F CYS 265 F CYS 395 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf17 disulf ? ? F CYS 53 SG ? ? ? 1_555 F CYS 64 SG ? ? F CYS 268 F CYS 279 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf18 disulf ? ? F CYS 81 SG ? ? ? 1_555 F CYS 174 SG ? ? F CYS 296 F CYS 389 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.050 ? ? covale1 covale both ? G NDG . O3 ? ? ? 1_555 G FUC . C1 ? ? G NDG 1 G FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? ? covale2 covale both ? G NDG . O4 ? ? ? 1_555 G GAL . C1 ? ? G NDG 1 G GAL 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale3 covale both ? H NDG . O3 ? ? ? 1_555 H FUC . C1 ? ? H NDG 1 H FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? ? covale4 covale both ? H NDG . O4 ? ? ? 1_555 H GAL . C1 ? ? H NDG 1 H GAL 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.390 ? ? covale5 covale both ? I NDG . O3 ? ? ? 1_555 I FUC . C1 ? ? I NDG 1 I FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? ? covale6 covale both ? I NDG . O4 ? ? ? 1_555 I GAL . C1 ? ? I NDG 1 I GAL 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale7 covale both ? J NDG . O3 ? ? ? 1_555 J FUC . C1 ? ? J NDG 1 J FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? ? covale8 covale both ? J NDG . O4 ? ? ? 1_555 J GAL . C1 ? ? J NDG 1 J GAL 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale9 covale both ? K NDG . O3 ? ? ? 1_555 K FUC . C1 ? ? K NDG 1 K FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? ? covale10 covale both ? K NDG . O4 ? ? ? 1_555 K GAL . C1 ? ? K NDG 1 K GAL 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.387 ? ? covale11 covale both ? L NDG . O3 ? ? ? 1_555 L FUC . C1 ? ? L NDG 1 L FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? ? covale12 covale both ? L NDG . O4 ? ? ? 1_555 L GAL . C1 ? ? L NDG 1 L GAL 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.386 ? ? metalc1 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 117 OD1 ? ? A CA 1 A ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? ? metalc2 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 117 OD2 ? ? A CA 1 A ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? ? metalc3 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 121 OE2 ? ? A CA 1 A GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? ? metalc4 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 121 OE1 ? ? A CA 1 A GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? ? metalc5 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A ASN 147 OD1 ? ? A CA 1 A ASN 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? ? metalc6 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 151 O ? ? A CA 1 A GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? ? metalc7 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 152 OD1 ? ? A CA 1 A ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? ? metalc8 metalc ? ? M CA . CA ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? A CA 1 A HOH 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? ? metalc9 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 144 OE1 ? ? A CA 2 A GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.899 ? ? metalc10 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 A ASN 146 OD1 ? ? A CA 2 A ASN 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? ? metalc11 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 151 OE1 ? ? A CA 2 A GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? ? metalc12 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 A ASN 162 OD1 ? ? A CA 2 A ASN 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? ? metalc13 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 163 O ? ? A CA 2 A ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? ? metalc14 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 163 OD1 ? ? A CA 2 A ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? ? metalc15 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 G FUC . O3 ? ? A CA 2 G FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? ? metalc16 metalc ? ? N CA . CA ? ? ? 1_555 G FUC . O4 ? ? A CA 2 G FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.390 ? ? metalc17 metalc ? ? O CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 121 OE1 ? ? A CA 3 A GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? ? metalc18 metalc ? ? O CA . CA ? ? ? 1_555 A ASN 150 OD1 ? ? A CA 3 A ASN 365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? ? metalc19 metalc ? ? O CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 152 OD1 ? ? A CA 3 A ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? ? metalc20 metalc ? ? O CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 152 OD2 ? ? A CA 3 A ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? ? metalc21 metalc ? ? O CA . CA ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? A CA 3 A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? ? metalc22 metalc ? ? O CA . CA ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? A CA 3 A HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? ? metalc23 metalc ? ? P CA . CA ? ? ? 1_555 A GLU 38 OE1 ? ? A CA 4 A GLU 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? ? metalc24 metalc ? ? P CA . CA ? ? ? 1_555 A ASP 41 OD2 ? ? A CA 4 A ASP 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? ? metalc25 metalc ? ? P CA . CA ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? A CA 4 E HOH 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? ? metalc26 metalc ? ? P CA . CA ? ? ? 1_555 F GLU 15 OE1 ? ? A CA 4 F GLU 230 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? ? metalc27 metalc ? ? P CA . CA ? ? ? 1_555 F GLU 15 OE2 ? ? A CA 4 F GLU 230 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.767 ? ? metalc28 metalc ? ? P CA . CA ? ? ? 1_555 F GLN 18 OE1 ? ? A CA 4 F GLN 233 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? ? metalc29 metalc ? ? A GLU 15 OE1 ? ? ? 1_555 FA CA . CA ? ? A GLU 230 E CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? ? metalc30 metalc ? ? A GLN 18 OE1 ? ? ? 1_555 FA CA . CA ? ? A GLN 233 E CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? ? metalc31 metalc ? ? A ASP 169 OD2 ? ? ? 2_654 W CA . CA ? ? A ASP 384 C CA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? ? metalc32 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 117 OD1 ? ? B CA 1 B ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? ? metalc33 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 117 OD2 ? ? B CA 1 B ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? ? metalc34 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 121 OE1 ? ? B CA 1 B GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? ? metalc35 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 121 OE2 ? ? B CA 1 B GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? ? metalc36 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B ASN 147 OD1 ? ? B CA 1 B ASN 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? ? metalc37 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 151 O ? ? B CA 1 B GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? ? metalc38 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 152 OD1 ? ? B CA 1 B ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? ? metalc39 metalc ? ? Q CA . CA ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? B CA 1 B HOH 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? ? metalc40 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 144 OE1 ? ? B CA 2 B GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? ? metalc41 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 B ASN 146 OD1 ? ? B CA 2 B ASN 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? ? metalc42 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 151 OE1 ? ? B CA 2 B GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? ? metalc43 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 B ASN 162 OD1 ? ? B CA 2 B ASN 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? ? metalc44 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 163 OD1 ? ? B CA 2 B ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? ? metalc45 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 163 O ? ? B CA 2 B ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.450 ? ? metalc46 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 H FUC . O3 ? ? B CA 2 H FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? ? metalc47 metalc ? ? R CA . CA ? ? ? 1_555 H FUC . O4 ? ? B CA 2 H FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? ? metalc48 metalc ? ? S CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 121 OE1 ? ? B CA 3 B GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? ? metalc49 metalc ? ? S CA . CA ? ? ? 1_555 B ASN 150 OD1 ? ? B CA 3 B ASN 365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc50 metalc ? ? S CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 152 OD1 ? ? B CA 3 B ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? ? metalc51 metalc ? ? S CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 152 OD2 ? ? B CA 3 B ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? ? metalc52 metalc ? ? S CA . CA ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? B CA 3 B HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? ? metalc53 metalc ? ? S CA . CA ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? B CA 3 B HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.280 ? ? metalc54 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 38 OE1 ? ? B CA 4 B GLU 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.230 ? ? metalc55 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 B GLU 38 OE2 ? ? B CA 4 B GLU 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.060 ? ? metalc56 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 B ASP 41 OD2 ? ? B CA 4 B ASP 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? ? metalc57 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 15 OE2 ? ? B CA 4 E GLU 230 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.269 ? ? metalc58 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 15 OE1 ? ? B CA 4 E GLU 230 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? ? metalc59 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 E GLN 18 OE1 ? ? B CA 4 E GLN 233 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? ? metalc60 metalc ? ? T CA . CA ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? B CA 4 F HOH 424 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc61 metalc ? ? B GLU 15 OE1 ? ? ? 1_555 JA CA . CA ? ? B GLU 230 F CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? ? metalc62 metalc ? ? B GLU 15 OE2 ? ? ? 1_555 JA CA . CA ? ? B GLU 230 F CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.120 ? ? metalc63 metalc ? ? B GLN 18 OE1 ? ? ? 1_555 JA CA . CA ? ? B GLN 233 F CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? ? metalc64 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C CA 1 C HOH 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? ? metalc65 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 117 OD2 ? ? C CA 1 C ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? ? metalc66 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 117 OD1 ? ? C CA 1 C ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? ? metalc67 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 121 OE1 ? ? C CA 1 C GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.580 ? ? metalc68 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 121 OE2 ? ? C CA 1 C GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? ? metalc69 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C ASN 147 OD1 ? ? C CA 1 C ASN 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? ? metalc70 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 151 O ? ? C CA 1 C GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? ? metalc71 metalc ? ? U CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 152 OD1 ? ? C CA 1 C ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? ? metalc72 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 144 OE1 ? ? C CA 2 C GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? ? metalc73 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 C ASN 146 OD1 ? ? C CA 2 C ASN 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? ? metalc74 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 151 OE1 ? ? C CA 2 C GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? ? metalc75 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 C ASN 162 OD1 ? ? C CA 2 C ASN 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? ? metalc76 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 163 O ? ? C CA 2 C ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? ? metalc77 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 163 OD1 ? ? C CA 2 C ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? ? metalc78 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 I FUC . O3 ? ? C CA 2 I FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? ? metalc79 metalc ? ? V CA . CA ? ? ? 1_555 I FUC . O4 ? ? C CA 2 I FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? ? metalc80 metalc ? ? W CA . CA ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C CA 3 C HOH 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? ? metalc81 metalc ? ? W CA . CA ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C CA 3 C HOH 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? ? metalc82 metalc ? ? W CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 121 OE1 ? ? C CA 3 C GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? ? metalc83 metalc ? ? W CA . CA ? ? ? 1_555 C ASN 150 OD1 ? ? C CA 3 C ASN 365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? ? metalc84 metalc ? ? W CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 152 OD2 ? ? C CA 3 C ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.670 ? ? metalc85 metalc ? ? W CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 152 OD1 ? ? C CA 3 C ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? ? metalc86 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C CA 4 C HOH 137 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? ? metalc87 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 C GLU 38 OE1 ? ? C CA 4 C GLU 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? ? metalc88 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 C ASP 41 OD2 ? ? C CA 4 C ASP 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.825 ? ? metalc89 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 15 OE2 ? ? C CA 4 D GLU 230 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? ? metalc90 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 15 OE1 ? ? C CA 4 D GLU 230 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? ? metalc91 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 D GLN 18 OE1 ? ? C CA 4 D GLN 233 5_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? ? metalc92 metalc ? ? X CA . CA ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? C CA 4 D HOH 425 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? ? metalc93 metalc ? ? C GLU 15 OE1 ? ? ? 5_555 BA CA . CA ? ? C GLU 230 D CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.841 ? ? metalc94 metalc ? ? C GLN 18 OE1 ? ? ? 5_555 BA CA . CA ? ? C GLN 233 D CA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? ? metalc95 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 117 OD1 ? ? D CA 1 D ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? ? metalc96 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 117 OD2 ? ? D CA 1 D ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? ? metalc97 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 121 OE1 ? ? D CA 1 D GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? ? metalc98 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 121 OE2 ? ? D CA 1 D GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? ? metalc99 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D ASN 147 OD1 ? ? D CA 1 D ASN 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? ? metalc100 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 151 O ? ? D CA 1 D GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? ? metalc101 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 152 OD1 ? ? D CA 1 D ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? ? metalc102 metalc ? ? Y CA . CA ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? D CA 1 D HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? ? metalc103 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 144 OE1 ? ? D CA 2 D GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? ? metalc104 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 D ASN 146 OD1 ? ? D CA 2 D ASN 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? ? metalc105 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 151 OE1 ? ? D CA 2 D GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? ? metalc106 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 D ASN 162 OD1 ? ? D CA 2 D ASN 377 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? ? metalc107 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 163 O ? ? D CA 2 D ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? ? metalc108 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 163 OD1 ? ? D CA 2 D ASP 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? ? metalc109 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 J FUC . O3 ? ? D CA 2 J FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? ? metalc110 metalc ? ? Z CA . CA ? ? ? 1_555 J FUC . O4 ? ? D CA 2 J FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? ? metalc111 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 121 OE1 ? ? D CA 3 D GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? ? metalc112 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 D ASN 150 OD1 ? ? D CA 3 D ASN 365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? ? metalc113 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 152 OD1 ? ? D CA 3 D ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? ? metalc114 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 152 OD2 ? ? D CA 3 D ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? ? metalc115 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? D CA 3 D HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? ? metalc116 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 F ASP 169 OD2 ? ? D CA 3 F ASP 384 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? ? metalc117 metalc ? ? AA CA . CA ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? D CA 3 F HOH 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? ? metalc118 metalc ? ? BA CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 38 OE1 ? ? D CA 4 D GLU 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? ? metalc119 metalc ? ? BA CA . CA ? ? ? 1_555 D GLU 38 OE2 ? ? D CA 4 D GLU 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? ? metalc120 metalc ? ? BA CA . CA ? ? ? 1_555 D ASP 41 OD2 ? ? D CA 4 D ASP 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.001 ? ? metalc121 metalc ? ? D ASP 169 OD2 ? ? ? 1_555 EA CA . CA ? ? D ASP 384 E CA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? ? metalc122 metalc ? ? NA HOH . O ? ? ? 1_555 EA CA . CA ? ? D HOH 400 E CA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? ? metalc123 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E ASP 117 OD1 ? ? E CA 1 E ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? ? metalc124 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E ASP 117 OD2 ? ? E CA 1 E ASP 332 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? ? metalc125 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 121 OE1 ? ? E CA 1 E GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? ? metalc126 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 121 OE2 ? ? E CA 1 E GLU 336 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? ? metalc127 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E ASN 147 OD1 ? ? E CA 1 E ASN 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? ? metalc128 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 151 O ? ? E CA 1 E GLU 366 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? ? metalc129 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 E ASP 152 OD1 ? ? E CA 1 E ASP 367 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? ? metalc130 metalc ? ? CA CA . CA ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? E CA 1 E HOH 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.330 ? ? metalc131 metalc ? ? DA CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 144 OE1 ? ? E CA 2 E GLU 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? ? metalc132 metalc ? ? DA CA . CA ? ? ? 1_555 E ASN 146 OD1 ? ? E CA 2 E ASN 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? ? metalc133 metalc ? ? DA CA . CA ? ? ? 1_555 E GLU 151 OE1 ? ? 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MET C 67 ? ASN C 278 MET C 282 E 3 TYR C 171 ? PRO C 177 ? TYR C 386 PRO C 392 E 4 SER C 111 ? SER C 116 ? SER C 326 SER C 331 E 5 GLN C 125 ? TRP C 126 ? GLN C 340 TRP C 341 F 1 GLN C 87 ? LEU C 88 ? GLN C 302 LEU C 303 F 2 TYR C 171 ? PRO C 177 ? TYR C 386 PRO C 392 F 3 SER C 111 ? SER C 116 ? SER C 326 SER C 331 F 4 CYS C 153 ? SER C 157 ? CYS C 368 SER C 372 F 5 GLY C 160 ? ASN C 164 ? GLY C 375 ASN C 379 G 1 THR D 58 ? PHE D 60 ? THR D 273 PHE D 275 G 2 ASN D 63 ? MET D 67 ? ASN D 278 MET D 282 G 3 TYR D 171 ? PRO D 177 ? TYR D 386 PRO D 392 G 4 SER D 111 ? SER D 116 ? SER D 326 SER D 331 G 5 GLN D 125 ? TRP D 126 ? GLN D 340 TRP D 341 H 1 GLN D 87 ? LEU D 88 ? GLN D 302 LEU D 303 H 2 TYR D 171 ? PRO D 177 ? TYR D 386 PRO D 392 H 3 SER D 111 ? SER D 116 ? SER D 326 SER D 331 H 4 CYS D 153 ? SER D 157 ? CYS D 368 SER D 372 H 5 GLY D 160 ? ASN D 164 ? GLY D 375 ASN D 379 I 1 THR E 58 ? PHE E 60 ? THR E 273 PHE E 275 I 2 ASN E 63 ? MET E 67 ? ASN E 278 MET E 282 I 3 TYR E 171 ? PRO E 177 ? TYR E 386 PRO E 392 I 4 SER E 111 ? SER E 116 ? SER E 326 SER E 331 I 5 GLN E 125 ? TRP E 126 ? GLN E 340 TRP E 341 J 1 GLN E 87 ? LEU E 88 ? GLN E 302 LEU E 303 J 2 TYR E 171 ? PRO E 177 ? TYR E 386 PRO E 392 J 3 SER E 111 ? SER E 116 ? SER E 326 SER E 331 J 4 CYS E 153 ? SER E 157 ? CYS E 368 SER E 372 J 5 GLY E 160 ? ASN E 164 ? GLY E 375 ASN E 379 K 1 THR F 58 ? PHE F 60 ? THR F 273 PHE F 275 K 2 ASN F 63 ? MET F 67 ? ASN F 278 MET F 282 K 3 TYR F 171 ? PRO F 177 ? TYR F 386 PRO F 392 K 4 SER F 111 ? SER F 116 ? SER F 326 SER F 331 K 5 GLN F 125 ? TRP F 126 ? GLN F 340 TRP F 341 L 1 GLN F 87 ? LEU F 88 ? GLN F 302 LEU F 303 L 2 TYR F 171 ? PRO F 177 ? TYR F 386 PRO F 392 L 3 SER F 111 ? SER F 116 ? SER F 326 SER F 331 L 4 CYS F 153 ? SER F 157 ? CYS F 368 SER F 372 L 5 GLY F 160 ? ASN F 164 ? GLY F 375 ASN F 379 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N THR A 58 ? 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O TYR E 386 N TRP E 112 ? N TRP E 327 I 4 5 N SER E 116 ? N SER E 331 O GLN E 125 ? O GLN E 340 J 1 2 N GLN E 87 ? N GLN E 302 O LYS E 175 ? O LYS E 390 J 2 3 O TYR E 171 ? O TYR E 386 N TRP E 112 ? N TRP E 327 J 3 4 N SER E 111 ? N SER E 326 O PHE E 156 ? O PHE E 371 J 4 5 N SER E 157 ? N SER E 372 O GLY E 160 ? O GLY E 375 K 1 2 N THR F 58 ? N THR F 273 O TYR F 65 ? O TYR F 280 K 2 3 N CYS F 64 ? N CYS F 279 O LYS F 176 ? O LYS F 391 K 3 4 O TYR F 171 ? O TYR F 386 N TRP F 112 ? N TRP F 327 K 4 5 N SER F 116 ? N SER F 331 O GLN F 125 ? O GLN F 340 L 1 2 N GLN F 87 ? N GLN F 302 O LYS F 175 ? O LYS F 390 L 2 3 O TYR F 171 ? O TYR F 386 N TRP F 112 ? N TRP F 327 L 3 4 N SER F 111 ? N SER F 326 O PHE F 156 ? O PHE F 371 L 4 5 N CYS F 153 ? N CYS F 368 O ASN F 164 ? O ASN F 379 # _pdbx_entry_details.entry_id 1SL6 _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 GLN A 233 ? ? -76.18 22.80 2 1 ASP A 271 ? ? 78.24 -2.96 3 1 VAL A 304 ? ? -36.59 115.79 4 1 VAL A 342 ? ? -59.97 -5.10 5 1 SER A 363 ? ? -57.63 106.38 6 1 ASN A 365 ? ? 62.67 83.15 7 1 GLN B 233 ? ? -69.69 16.14 8 1 ASP B 271 ? ? 84.36 6.72 9 1 ALA B 301 ? ? -127.64 -165.88 10 1 VAL B 304 ? ? -36.93 116.47 11 1 SER B 363 ? ? -55.89 103.25 12 1 ASN B 365 ? ? 71.25 86.59 13 1 GLN C 233 ? ? -65.87 22.74 14 1 ARG C 266 ? ? -146.06 46.52 15 1 ASP C 271 ? ? 77.17 -7.58 16 1 ALA C 301 ? ? -123.43 -155.99 17 1 VAL C 304 ? ? -30.95 118.62 18 1 ASN C 365 ? ? 62.80 99.97 19 1 LYS D 223 ? ? -111.66 -126.22 20 1 LYS D 235 ? ? -52.93 -70.93 21 1 ALA D 236 ? ? -65.98 34.68 22 1 ARG D 266 ? ? -143.90 37.67 23 1 ASP D 271 ? ? 80.37 -5.29 24 1 PHE D 275 ? ? -160.57 116.21 25 1 ALA D 301 ? ? -121.12 -165.30 26 1 VAL D 304 ? ? -38.67 119.45 27 1 ASN D 365 ? ? 71.32 75.76 28 1 LYS E 223 ? ? -106.89 -141.00 29 1 TYR E 251 ? ? -47.68 -19.25 30 1 GLN E 252 ? ? -67.86 -73.80 31 1 ARG E 266 ? ? -146.66 33.49 32 1 ASP E 271 ? ? 84.33 6.28 33 1 VAL E 304 ? ? -34.41 121.87 34 1 ASN E 365 ? ? 66.04 81.98 35 1 LYS F 223 ? ? -116.76 -126.46 36 1 ASP F 271 ? ? 86.27 -6.48 37 1 GLN F 276 ? ? 39.22 53.81 38 1 ALA F 301 ? ? -128.70 -168.37 39 1 ASN F 365 ? ? 75.26 78.72 # _pdbx_molecule_features.prd_id PRD_900120 _pdbx_molecule_features.name 'Lewis X antigen, alpha anomer' _pdbx_molecule_features.type Oligosaccharide _pdbx_molecule_features.class Antigen _pdbx_molecule_features.details 'oligosaccharide with branches' # loop_ _pdbx_molecule.instance_id _pdbx_molecule.prd_id _pdbx_molecule.asym_id 1 PRD_900120 G 2 PRD_900120 H 3 PRD_900120 I 4 PRD_900120 J 5 PRD_900120 K 6 PRD_900120 L # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLY 216 ? 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