data_1SP6 # _entry.id 1SP6 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.391 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 1SP6 pdb_00001sp6 10.2210/pdb1sp6/pdb RCSB RCSB021892 ? ? WWPDB D_1000021892 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2004-06-01 2 'Structure model' 1 1 2008-04-29 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2024-05-01 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Non-polymer description' 3 3 'Structure model' 'Version format compliance' 4 4 'Structure model' 'Data collection' 5 4 'Structure model' 'Database references' 6 4 'Structure model' 'Derived calculations' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' chem_comp_atom 2 4 'Structure model' chem_comp_bond 3 4 'Structure model' database_2 4 4 'Structure model' pdbx_nmr_software 5 4 'Structure model' struct_conn # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' 4 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1SP6 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2004-03-16 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Gomez-Pinto, I.' 1 'Cubero, E.' 2 'Kalko, S.G.' 3 'Monaco, V.' 4 'van der Marel, G.' 5 'van Boom, J.H.' 6 'Orozco, M.' 7 'Gonzalez, C.' 8 # _citation.id primary _citation.title 'Effect of bulky lesions on DNA: Solution structure of a DNA duplex containing a cholesterol adduct.' _citation.journal_abbrev J.Biol.Chem. _citation.journal_volume 279 _citation.page_first 24552 _citation.page_last 24560 _citation.year 2004 _citation.journal_id_ASTM JBCHA3 _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0021-9258 _citation.journal_id_CSD 0071 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 15047709 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1074/jbc.M311751200 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Gomez-Pinto, I.' 1 ? primary 'Cubero, E.' 2 ? primary 'Kalko, S.G.' 3 ? primary 'Monaco, V.' 4 ? primary 'Van Der Marel, G.' 5 ? primary 'Van Boom, J.H.' 6 ? primary 'Orozco, M.' 7 ? primary 'Gonzalez, C.' 8 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-D(*CP*CP*AP*CP*(HOL)P*GP*GP*AP*AP*C)-3'" 3375.639 1 ? ? ? ? 2 polymer syn "5'-D(GP*TP*TP*CP*CP*GP*GP*TP*GP*G)-3'" 3092.013 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no yes '(DC)(DC)(DA)(DC)(HOL)(DG)(DG)(DA)(DA)(DC)' CCACNGGAAC A ? 2 polydeoxyribonucleotide no no '(DG)(DT)(DT)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DG)' GTTCCGGTGG B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DC n 1 3 DA n 1 4 DC n 1 5 HOL n 1 6 DG n 1 7 DG n 1 8 DA n 1 9 DA n 1 10 DC n 2 1 DG n 2 2 DT n 2 3 DT n 2 4 DC n 2 5 DC n 2 6 DG n 2 7 DG n 2 8 DT n 2 9 DG n 2 10 DG n # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 HOL 'DNA linking' . 'ALPHA-CHOLEST-5-EN-3-YL 3-[(2-DEOXY-5-O-PHOSPHONO-ALPHA-D-GLYCERO-PENTOFURANOSYL)OXY]PROPYLCARBAMATE' ? 'C36 H62 N O9 P' 683.853 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC C A . n A 1 2 DC 2 2 2 DC C A . n A 1 3 DA 3 3 3 DA A A . n A 1 4 DC 4 4 4 DC C A . n A 1 5 HOL 5 5 5 HOL CHY A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG G A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG G A . n A 1 8 DA 8 8 8 DA A A . n A 1 9 DA 9 9 9 DA A A . n A 1 10 DC 10 10 10 DC C A . n B 2 1 DG 1 11 11 DG G B . n B 2 2 DT 2 12 12 DT T B . n B 2 3 DT 3 13 13 DT T B . n B 2 4 DC 4 14 14 DC C B . n B 2 5 DC 5 15 15 DC C B . n B 2 6 DG 6 16 16 DG G B . n B 2 7 DG 7 17 17 DG G B . n B 2 8 DT 8 18 18 DT T B . n B 2 9 DG 9 19 19 DG G B . n B 2 10 DG 10 20 20 DG G B . n # _exptl.entry_id 1SP6 _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.density_Matthews ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _database_PDB_matrix.entry_id 1SP6 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 1SP6 _struct.title 'A DNA duplex containing a cholesterol adduct (alpha-anomer)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1SP6 _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'double helix, modified DNA, cholesterol adduct, DNA lesion, DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 1 PDB 1SP6 1SP6 ? ? ? 2 2 PDB 1SP6 1SP6 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1SP6 A 1 ? 10 ? 1SP6 1 ? 10 ? 1 10 2 2 1SP6 B 1 ? 10 ? 1SP6 11 ? 20 ? 11 20 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A DC 4 "O3'" ? ? ? 1_555 A HOL 5 P ? ? A DC 4 A HOL 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.610 ? ? covale2 covale both ? A HOL 5 "O3'" ? ? ? 1_555 A DG 6 P ? ? A HOL 5 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.610 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 10 N1 ? ? A DC 1 B DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 10 O6 ? ? A DC 1 B DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 10 N2 ? ? A DC 1 B DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DC 2 N3 ? ? ? 1_555 B DG 9 N1 ? ? A DC 2 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DC 2 N4 ? ? ? 1_555 B DG 9 O6 ? ? A DC 2 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 2 O2 ? ? ? 1_555 B DG 9 N2 ? ? A DC 2 B DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DA 3 N1 ? ? ? 1_555 B DT 8 N3 ? ? A DA 3 B DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DA 3 N6 ? ? ? 1_555 B DT 8 O4 ? ? A DA 3 B DT 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DC 4 N3 ? ? ? 1_555 B DG 7 N1 ? ? A DC 4 B DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DC 4 N4 ? ? ? 1_555 B DG 7 O6 ? ? A DC 4 B DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DC 4 O2 ? ? ? 1_555 B DG 7 N2 ? ? A DC 4 B DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 B DC 5 N3 ? ? A DG 6 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 B DC 5 O2 ? ? A DG 6 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B DC 5 N4 ? ? A DG 6 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 B DC 4 N3 ? ? A DG 7 B DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 B DC 4 O2 ? ? A DG 7 B DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 B DC 4 N4 ? ? A DG 7 B DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 B DC 5 O2 ? ? A DG 7 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DA 8 N1 ? ? ? 1_555 B DT 3 N3 ? ? A DA 8 B DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DA 8 N6 ? ? ? 1_555 B DT 3 O4 ? ? A DA 8 B DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DA 9 N1 ? ? ? 1_555 B DT 2 N3 ? ? A DA 9 B DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DA 9 N6 ? ? ? 1_555 B DT 2 O4 ? ? A DA 9 B DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DA 9 N1 ? ? ? 1_555 B DT 3 N3 ? ? A DA 9 B DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DC 10 N3 ? ? ? 1_555 B DG 1 N1 ? ? A DC 10 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DC 10 N4 ? ? ? 1_555 B DG 1 O6 ? ? A DC 10 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DC 10 O2 ? ? ? 1_555 B DG 1 N2 ? ? A DC 10 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 3 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.383 1.446 -0.063 0.010 N 2 3 "O3'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 1.379 1.419 -0.040 0.006 N 3 3 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 4 3 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 5 3 "O4'" B DT 18 ? ? "C4'" B DT 18 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 6 3 "O3'" B DG 19 ? ? "C3'" B DG 19 ? ? 1.381 1.419 -0.038 0.006 N 7 3 "O3'" B DG 19 ? ? P B DG 20 ? ? 1.478 1.607 -0.129 0.012 Y 8 3 P B DG 20 ? ? OP1 B DG 20 ? ? 1.356 1.485 -0.129 0.017 N 9 3 P B DG 20 ? ? OP2 B DG 20 ? ? 1.374 1.485 -0.111 0.017 N 10 3 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.370 1.419 -0.049 0.006 N 11 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.374 1.446 -0.072 0.010 N 12 4 "O3'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 1.372 1.419 -0.047 0.006 N 13 4 "O4'" A DC 2 ? ? "C4'" A DC 2 ? ? 1.377 1.446 -0.069 0.010 N 14 4 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? 1.378 1.446 -0.068 0.010 N 15 4 "O3'" A DC 4 ? ? "C3'" A DC 4 ? ? 1.376 1.419 -0.043 0.006 N 16 4 "O3'" A DC 4 ? ? P A HOL 5 ? ? 1.523 1.607 -0.084 0.012 Y 17 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C4'" A DG 7 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 18 4 "O3'" A DG 7 ? ? "C3'" A DG 7 ? ? 1.368 1.419 -0.051 0.006 N 19 4 "O3'" A DG 7 ? ? P A DA 8 ? ? 1.409 1.607 -0.198 0.012 Y 20 4 P A DA 8 ? ? OP1 A DA 8 ? ? 1.309 1.485 -0.176 0.017 N 21 4 P A DA 8 ? ? OP2 A DA 8 ? ? 1.348 1.485 -0.137 0.017 N 22 4 "O4'" B DG 17 ? ? "C4'" B DG 17 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 23 4 "O4'" B DT 18 ? ? "C4'" B DT 18 ? ? 1.380 1.446 -0.066 0.010 N 24 4 "O4'" B DG 20 ? ? "C4'" B DG 20 ? ? 1.383 1.446 -0.063 0.010 N 25 4 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.373 1.419 -0.046 0.006 N 26 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.381 1.446 -0.065 0.010 N 27 5 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 28 5 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.383 1.446 -0.063 0.010 N 29 5 "O4'" B DT 13 ? ? "C4'" B DT 13 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 30 5 "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 31 6 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.380 1.446 -0.066 0.010 N 32 6 "O3'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 1.377 1.419 -0.042 0.006 N 33 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 34 6 "O3'" A DG 6 ? ? "C3'" A DG 6 ? ? 1.379 1.419 -0.040 0.006 N 35 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C4'" A DG 7 ? ? 1.376 1.446 -0.070 0.010 N 36 6 "O3'" A DG 7 ? ? "C3'" A DG 7 ? ? 1.382 1.419 -0.037 0.006 N 37 6 "O5'" A DA 8 ? ? "C5'" A DA 8 ? ? 0.887 1.418 -0.531 0.025 N 38 6 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? 1.365 1.446 -0.081 0.010 N 39 6 "O3'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? 1.381 1.419 -0.038 0.006 N 40 6 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 41 6 "O3'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 1.376 1.419 -0.043 0.006 N 42 6 "O3'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 1.377 1.419 -0.042 0.006 N 43 6 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.382 1.446 -0.064 0.010 N 44 6 "O3'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 1.380 1.419 -0.039 0.006 N 45 6 "O3'" B DT 12 ? ? "C3'" B DT 12 ? ? 1.381 1.419 -0.038 0.006 N 46 6 "O4'" B DT 13 ? ? "C4'" B DT 13 ? ? 1.379 1.446 -0.067 0.010 N 47 6 "O3'" B DT 13 ? ? "C3'" B DT 13 ? ? 1.380 1.419 -0.039 0.006 N 48 6 "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? 1.376 1.446 -0.070 0.010 N 49 6 "O3'" B DC 14 ? ? "C3'" B DC 14 ? ? 1.374 1.419 -0.045 0.006 N 50 6 "O4'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 51 6 "O3'" B DC 15 ? ? "C3'" B DC 15 ? ? 1.382 1.419 -0.037 0.006 N 52 6 "O4'" B DG 19 ? ? "C4'" B DG 19 ? ? 1.386 1.446 -0.060 0.010 N 53 6 "O3'" B DG 19 ? ? P B DG 20 ? ? 1.521 1.607 -0.086 0.012 Y 54 6 "O4'" B DG 20 ? ? "C4'" B DG 20 ? ? 1.381 1.446 -0.065 0.010 N 55 6 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.379 1.419 -0.040 0.006 N 56 7 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.383 1.446 -0.063 0.010 N 57 7 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 58 7 "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? 1.386 1.446 -0.060 0.010 N 59 7 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.370 1.419 -0.049 0.006 N 60 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 61 8 "O3'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 1.382 1.419 -0.037 0.006 N 62 8 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.386 1.446 -0.060 0.010 N 63 8 "O4'" B DG 20 ? ? "C4'" B DG 20 ? ? 1.370 1.446 -0.076 0.010 N 64 8 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.371 1.419 -0.048 0.006 N 65 9 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.374 1.446 -0.072 0.010 N 66 9 "O3'" A DC 2 ? ? "C3'" A DC 2 ? ? 1.382 1.419 -0.037 0.006 N 67 9 "O3'" A DC 4 ? ? P A HOL 5 ? ? 1.521 1.607 -0.086 0.012 Y 68 9 "O4'" A DC 10 ? ? "C4'" A DC 10 ? ? 1.382 1.446 -0.064 0.010 N 69 9 "O3'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 1.381 1.419 -0.038 0.006 N 70 9 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.375 1.446 -0.071 0.010 N 71 9 "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 72 9 "O3'" B DG 19 ? ? P B DG 20 ? ? 1.404 1.607 -0.203 0.012 Y 73 9 P B DG 20 ? ? OP1 B DG 20 ? ? 1.300 1.485 -0.185 0.017 N 74 9 P B DG 20 ? ? "O5'" B DG 20 ? ? 1.530 1.593 -0.063 0.010 N 75 9 "O4'" B DG 20 ? ? "C4'" B DG 20 ? ? 1.376 1.446 -0.070 0.010 N 76 9 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.375 1.419 -0.044 0.006 N 77 10 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 1.362 1.446 -0.084 0.010 N 78 10 "O3'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 1.366 1.419 -0.053 0.006 N 79 10 "O4'" A DC 2 ? ? "C4'" A DC 2 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 80 10 "O3'" A DC 2 ? ? "C3'" A DC 2 ? ? 1.378 1.419 -0.041 0.006 N 81 10 "O3'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 1.381 1.419 -0.038 0.006 N 82 10 "O4'" A DC 4 ? ? "C4'" A DC 4 ? ? 1.372 1.446 -0.074 0.010 N 83 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C4'" A DG 7 ? ? 1.384 1.446 -0.062 0.010 N 84 10 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? 1.372 1.446 -0.074 0.010 N 85 10 "O3'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? 1.377 1.419 -0.042 0.006 N 86 10 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? 1.373 1.446 -0.073 0.010 N 87 10 "O3'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 1.375 1.419 -0.044 0.006 N 88 10 "O4'" A DC 10 ? ? "C4'" A DC 10 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 89 10 "O3'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 1.370 1.419 -0.049 0.006 N 90 10 N1 A DC 10 ? ? C6 A DC 10 ? ? 1.330 1.367 -0.037 0.006 N 91 10 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 92 10 "O3'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 1.370 1.419 -0.049 0.006 N 93 10 "O4'" B DT 12 ? ? "C4'" B DT 12 ? ? 1.378 1.446 -0.068 0.010 N 94 10 "O3'" B DT 12 ? ? "C3'" B DT 12 ? ? 1.376 1.419 -0.043 0.006 N 95 10 "O4'" B DT 13 ? ? "C4'" B DT 13 ? ? 1.369 1.446 -0.077 0.010 N 96 10 "O3'" B DT 13 ? ? "C3'" B DT 13 ? ? 1.374 1.419 -0.045 0.006 N 97 10 "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? 1.371 1.446 -0.075 0.010 N 98 10 "O3'" B DC 14 ? ? "C3'" B DC 14 ? ? 1.376 1.419 -0.043 0.006 N 99 10 "O4'" B DG 17 ? ? "C4'" B DG 17 ? ? 1.383 1.446 -0.063 0.010 N 100 10 "O4'" B DT 18 ? ? "C4'" B DT 18 ? ? 1.381 1.446 -0.065 0.010 N 101 10 "O3'" B DT 18 ? ? "C3'" B DT 18 ? ? 1.375 1.419 -0.044 0.006 N 102 10 "O4'" B DG 19 ? ? "C4'" B DG 19 ? ? 1.385 1.446 -0.061 0.010 N 103 10 "O3'" B DG 19 ? ? "C3'" B DG 19 ? ? 1.380 1.419 -0.039 0.006 N 104 10 "O4'" B DG 20 ? ? "C4'" B DG 20 ? ? 1.375 1.446 -0.071 0.010 N 105 10 "O3'" B DG 20 ? ? "C3'" B DG 20 ? ? 1.358 1.419 -0.061 0.006 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 117.53 108.30 9.23 0.30 N 2 1 C6 A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? 123.52 120.30 3.22 0.40 N 3 1 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 125.38 118.90 6.48 0.60 N 4 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 5 1 C5 A DC 1 ? ? C4 A DC 1 ? ? N4 A DC 1 ? ? 115.93 120.20 -4.27 0.70 N 6 1 "O4'" A DC 2 ? ? "C4'" A DC 2 ? ? "C3'" A DC 2 ? ? 110.18 106.00 4.18 0.60 N 7 1 "C3'" A DC 2 ? ? "O3'" A DC 2 ? ? P A DA 3 ? ? 128.33 119.70 8.63 1.20 Y 8 1 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 111.93 106.00 5.93 0.60 N 9 1 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? "C2'" A DA 3 ? ? 109.99 106.80 3.19 0.50 N 10 1 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.62 108.30 4.32 0.30 N 11 1 N1 A DA 3 ? ? C2 A DA 3 ? ? N3 A DA 3 ? ? 121.53 129.30 -7.77 0.50 N 12 1 C2 A DA 3 ? ? N3 A DA 3 ? ? C4 A DA 3 ? ? 116.65 110.60 6.05 0.50 N 13 1 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 14 1 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? N7 A DA 3 ? ? 115.42 110.70 4.72 0.50 N 15 1 C5 A DA 3 ? ? N7 A DA 3 ? ? C8 A DA 3 ? ? 98.42 103.90 -5.48 0.50 N 16 1 N7 A DA 3 ? ? C8 A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 117.69 113.80 3.89 0.50 N 17 1 N9 A DA 3 ? ? C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? 103.31 105.80 -2.49 0.40 N 18 1 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 109.73 118.60 -8.87 0.60 N 19 1 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 128.87 123.70 5.17 0.80 N 20 1 "O4'" A DC 4 ? ? "C4'" A DC 4 ? ? "C3'" A DC 4 ? ? 100.83 104.50 -3.67 0.40 N 21 1 "C3'" A DC 4 ? ? "C2'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? 93.63 102.40 -8.77 0.80 N 22 1 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 115.21 108.30 6.91 0.30 N 23 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "C3'" A DG 6 ? ? 110.33 106.00 4.33 0.60 N 24 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.77 108.30 4.47 0.30 N 25 1 C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? N7 A DG 6 ? ? 108.24 110.80 -2.56 0.40 N 26 1 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.03 113.10 -3.07 0.50 N 27 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C4'" A DG 7 ? ? "C3'" A DG 7 ? ? 109.67 106.00 3.67 0.60 N 28 1 C6 A DG 7 ? ? N1 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? 120.34 125.10 -4.76 0.60 N 29 1 C5 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? N1 A DG 7 ? ? 115.21 111.50 3.71 0.50 N 30 1 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 113.82 119.90 -6.08 0.60 N 31 1 "C5'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? "O4'" A DA 8 ? ? 116.69 109.80 6.89 1.10 N 32 1 N1 A DA 8 ? ? C2 A DA 8 ? ? N3 A DA 8 ? ? 123.90 129.30 -5.40 0.50 N 33 1 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 109.13 118.60 -9.47 0.60 N 34 1 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 130.59 123.70 6.89 0.80 N 35 1 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 100.09 108.00 -7.91 0.70 N 36 1 N1 A DA 9 ? ? C2 A DA 9 ? ? N3 A DA 9 ? ? 125.80 129.30 -3.50 0.50 N 37 1 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.37 117.00 -4.63 0.50 N 38 1 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 122.26 117.70 4.56 0.50 N 39 1 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? N7 A DA 9 ? ? 107.06 110.70 -3.64 0.50 N 40 1 C5 A DA 9 ? ? N7 A DA 9 ? ? C8 A DA 9 ? ? 107.90 103.90 4.00 0.50 N 41 1 N7 A DA 9 ? ? C8 A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 110.28 113.80 -3.52 0.50 N 42 1 C6 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? N7 A DA 9 ? ? 140.54 132.30 8.24 0.70 N 43 1 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 112.42 118.60 -6.18 0.60 N 44 1 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 45 1 C2 A DC 10 ? ? N3 A DC 10 ? ? C4 A DC 10 ? ? 115.91 119.90 -3.99 0.50 N 46 1 C5 A DC 10 ? ? C6 A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 117.81 121.00 -3.19 0.50 N 47 1 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.16 121.90 -5.74 0.70 N 48 1 C6 A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? 113.43 120.80 -7.37 1.20 N 49 1 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 109.92 106.00 3.92 0.60 N 50 1 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 113.79 108.30 5.49 0.30 N 51 1 C4 B DG 11 ? ? C5 B DG 11 ? ? N7 B DG 11 ? ? 107.49 110.80 -3.31 0.40 N 52 1 C8 B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? C4 B DG 11 ? ? 103.46 106.40 -2.94 0.40 N 53 1 N9 B DG 11 ? ? C4 B DG 11 ? ? C5 B DG 11 ? ? 109.37 105.40 3.97 0.40 N 54 1 N3 B DG 11 ? ? C2 B DG 11 ? ? N2 B DG 11 ? ? 115.16 119.90 -4.74 0.70 N 55 1 "O4'" B DT 12 ? ? "C4'" B DT 12 ? ? "C3'" B DT 12 ? ? 110.32 106.00 4.32 0.60 N 56 1 C6 B DT 12 ? ? C5 B DT 12 ? ? C7 B DT 12 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 57 1 C6 B DT 13 ? ? N1 B DT 13 ? ? C2 B DT 13 ? ? 116.08 121.30 -5.22 0.50 N 58 1 N1 B DT 13 ? ? C2 B DT 13 ? ? N3 B DT 13 ? ? 118.62 114.60 4.02 0.60 N 59 1 C5 B DT 13 ? ? C6 B DT 13 ? ? N1 B DT 13 ? ? 127.41 123.70 3.71 0.60 N 60 1 "C3'" B DT 13 ? ? "O3'" B DT 13 ? ? P B DC 14 ? ? 127.94 119.70 8.24 1.20 Y 61 1 "O4'" B DC 14 ? ? "C1'" B DC 14 ? ? N1 B DC 14 ? ? 103.24 108.00 -4.76 0.70 N 62 1 C6 B DC 14 ? ? N1 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? 117.04 120.30 -3.26 0.40 N 63 1 N1 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? N3 B DC 14 ? ? 124.94 119.20 5.74 0.70 N 64 1 C2 B DC 14 ? ? N3 B DC 14 ? ? C4 B DC 14 ? ? 115.10 119.90 -4.80 0.50 N 65 1 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 113.11 121.90 -8.79 0.70 N 66 1 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 102.97 108.00 -5.03 0.70 N 67 1 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 68 1 C5 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? N4 B DC 15 ? ? 115.67 120.20 -4.53 0.70 N 69 1 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 113.39 108.30 5.09 0.30 N 70 1 N3 B DG 16 ? ? C2 B DG 16 ? ? N2 B DG 16 ? ? 113.92 119.90 -5.98 0.70 N 71 1 N1 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? O6 B DG 16 ? ? 115.89 119.90 -4.01 0.60 N 72 1 "O4'" B DG 17 ? ? "C4'" B DG 17 ? ? "C3'" B DG 17 ? ? 110.09 106.00 4.09 0.60 N 73 1 "O4'" B DG 17 ? ? "C1'" B DG 17 ? ? N9 B DG 17 ? ? 101.13 108.00 -6.87 0.70 N 74 1 N3 B DG 17 ? ? C4 B DG 17 ? ? C5 B DG 17 ? ? 132.38 128.60 3.78 0.50 N 75 1 C4 B DG 17 ? ? C5 B DG 17 ? ? C6 B DG 17 ? ? 114.87 118.80 -3.93 0.60 N 76 1 C5 B DG 17 ? ? C6 B DG 17 ? ? N1 B DG 17 ? ? 114.87 111.50 3.37 0.50 N 77 1 C8 B DG 17 ? ? N9 B DG 17 ? ? C4 B DG 17 ? ? 109.42 106.40 3.02 0.40 N 78 1 N9 B DG 17 ? ? C4 B DG 17 ? ? C5 B DG 17 ? ? 102.73 105.40 -2.67 0.40 N 79 1 "C1'" B DT 18 ? ? "O4'" B DT 18 ? ? "C4'" B DT 18 ? ? 117.02 110.30 6.72 0.70 N 80 1 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 81 1 C2 B DT 18 ? ? N3 B DT 18 ? ? C4 B DT 18 ? ? 122.01 127.20 -5.19 0.60 N 82 1 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? "C2'" B DG 19 ? ? 100.89 105.90 -5.01 0.80 N 83 1 C4 B DG 19 ? ? C5 B DG 19 ? ? N7 B DG 19 ? ? 113.98 110.80 3.18 0.40 N 84 1 C5 B DG 19 ? ? N7 B DG 19 ? ? C8 B DG 19 ? ? 99.94 104.30 -4.36 0.50 N 85 2 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 112.88 106.00 6.88 0.60 N 86 2 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 116.03 108.30 7.73 0.30 N 87 2 N3 A DC 1 ? ? C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 116.98 121.90 -4.92 0.40 N 88 2 C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? 124.85 117.40 7.45 0.50 N 89 2 C5 A DC 1 ? ? C6 A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 114.61 121.00 -6.39 0.50 N 90 2 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.95 121.90 -4.95 0.70 N 91 2 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 99.87 108.00 -8.13 0.70 N 92 2 C2 A DC 2 ? ? N3 A DC 2 ? ? C4 A DC 2 ? ? 115.75 119.90 -4.15 0.50 N 93 2 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 115.43 121.90 -6.47 0.70 N 94 2 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 110.17 106.00 4.17 0.60 N 95 2 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 96 2 N1 A DA 3 ? ? C2 A DA 3 ? ? N3 A DA 3 ? ? 123.23 129.30 -6.07 0.50 N 97 2 C2 A DA 3 ? ? N3 A DA 3 ? ? C4 A DA 3 ? ? 114.51 110.60 3.91 0.50 N 98 2 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.29 117.00 -3.71 0.50 N 99 2 N9 A DA 3 ? ? C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? 103.05 105.80 -2.75 0.40 N 100 2 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.24 118.60 -6.36 0.60 N 101 2 C6 A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? 116.83 120.30 -3.47 0.40 N 102 2 "C5'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "O4'" A DG 6 ? ? 123.86 109.80 14.06 1.10 N 103 2 "C4'" A DG 6 ? ? "C3'" A DG 6 ? ? "C2'" A DG 6 ? ? 97.37 102.20 -4.83 0.70 N 104 2 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? "C2'" A DG 6 ? ? 100.03 105.90 -5.87 0.80 N 105 2 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 113.30 108.30 5.00 0.30 N 106 2 C6 A DG 6 ? ? N1 A DG 6 ? ? C2 A DG 6 ? ? 120.61 125.10 -4.49 0.60 N 107 2 C5 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? N1 A DG 6 ? ? 114.93 111.50 3.43 0.50 N 108 2 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 107.84 113.10 -5.26 0.50 N 109 2 C8 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 109.64 106.40 3.24 0.40 N 110 2 N9 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? C5 A DG 6 ? ? 102.81 105.40 -2.59 0.40 N 111 2 N3 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 129.81 126.00 3.81 0.60 N 112 2 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 116.21 119.90 -3.69 0.60 N 113 2 "O4'" A DG 7 ? ? "C4'" A DG 7 ? ? "C3'" A DG 7 ? ? 111.23 106.00 5.23 0.60 N 114 2 "C4'" A DG 7 ? ? "C3'" A DG 7 ? ? "C2'" A DG 7 ? ? 97.83 102.20 -4.37 0.70 N 115 2 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.66 108.30 3.36 0.30 N 116 2 C6 A DG 7 ? ? N1 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? 120.39 125.10 -4.71 0.60 N 117 2 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.25 119.90 -3.65 0.60 N 118 2 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? 109.61 106.00 3.61 0.60 N 119 2 "C4'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? "C2'" A DA 8 ? ? 94.46 102.20 -7.74 0.70 N 120 2 "O4'" A DA 8 ? ? "C1'" A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? 112.58 108.30 4.28 0.30 N 121 2 C2 A DA 8 ? ? N3 A DA 8 ? ? C4 A DA 8 ? ? 107.34 110.60 -3.26 0.50 N 122 2 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 123 2 N7 A DA 8 ? ? C8 A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 124 2 C8 A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? C4 A DA 8 ? ? 102.66 105.80 -3.14 0.40 N 125 2 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.60 118.60 -5.00 0.60 N 126 2 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 114.20 106.00 8.20 0.60 N 127 2 "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? "C2'" A DA 9 ? ? 96.55 102.20 -5.65 0.70 N 128 2 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.77 118.60 -4.83 0.60 N 129 2 "O4'" A DC 10 ? ? "C4'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 111.35 106.00 5.35 0.60 N 130 2 N3 A DC 10 ? ? C4 A DC 10 ? ? N4 A DC 10 ? ? 112.19 118.00 -5.81 0.70 N 131 2 C5 A DC 10 ? ? C4 A DC 10 ? ? N4 A DC 10 ? ? 126.01 120.20 5.81 0.70 N 132 2 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 110.61 106.00 4.61 0.60 N 133 2 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 134 2 C6 B DG 11 ? ? N1 B DG 11 ? ? C2 B DG 11 ? ? 120.71 125.10 -4.39 0.60 N 135 2 N3 B DG 11 ? ? C4 B DG 11 ? ? C5 B DG 11 ? ? 125.36 128.60 -3.24 0.50 N 136 2 C4 B DG 11 ? ? C5 B DG 11 ? ? N7 B DG 11 ? ? 108.04 110.80 -2.76 0.40 N 137 2 N1 B DG 11 ? ? C6 B DG 11 ? ? O6 B DG 11 ? ? 114.09 119.90 -5.81 0.60 N 138 2 N3 B DT 12 ? ? C2 B DT 12 ? ? O2 B DT 12 ? ? 118.47 122.30 -3.83 0.60 N 139 2 N3 B DT 12 ? ? C4 B DT 12 ? ? O4 B DT 12 ? ? 115.02 119.90 -4.88 0.60 N 140 2 C5 B DT 12 ? ? C4 B DT 12 ? ? O4 B DT 12 ? ? 129.27 124.90 4.37 0.70 N 141 2 C4 B DT 12 ? ? C5 B DT 12 ? ? C7 B DT 12 ? ? 124.41 119.00 5.41 0.60 N 142 2 C6 B DT 12 ? ? C5 B DT 12 ? ? C7 B DT 12 ? ? 117.33 122.90 -5.57 0.60 N 143 2 "O4'" B DT 13 ? ? "C4'" B DT 13 ? ? "C3'" B DT 13 ? ? 110.01 106.00 4.01 0.60 N 144 2 "O4'" B DT 13 ? ? "C1'" B DT 13 ? ? N1 B DT 13 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 145 2 C4 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C6 B DT 13 ? ? 123.11 118.00 5.11 0.60 N 146 2 N1 B DT 13 ? ? C2 B DT 13 ? ? O2 B DT 13 ? ? 128.20 123.10 5.10 0.80 N 147 2 N3 B DT 13 ? ? C2 B DT 13 ? ? O2 B DT 13 ? ? 114.45 122.30 -7.85 0.60 N 148 2 N3 B DT 13 ? ? C4 B DT 13 ? ? O4 B DT 13 ? ? 123.54 119.90 3.64 0.60 N 149 2 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 114.46 122.90 -8.44 0.60 N 150 2 "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? "C3'" B DC 14 ? ? 112.59 106.00 6.59 0.60 N 151 2 "C1'" B DC 14 ? ? "O4'" B DC 14 ? ? "C4'" B DC 14 ? ? 101.42 110.10 -8.68 1.00 N 152 2 "C3'" B DC 14 ? ? "C2'" B DC 14 ? ? "C1'" B DC 14 ? ? 97.15 102.40 -5.25 0.80 N 153 2 C4 B DC 14 ? ? C5 B DC 14 ? ? C6 B DC 14 ? ? 121.25 117.40 3.85 0.50 N 154 2 C5 B DC 14 ? ? C6 B DC 14 ? ? N1 B DC 14 ? ? 117.26 121.00 -3.74 0.50 N 155 2 N1 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 123.80 118.90 4.90 0.60 N 156 2 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 115.06 121.90 -6.84 0.70 N 157 2 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 103.04 108.00 -4.96 0.70 N 158 2 C6 B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? 117.86 120.30 -2.44 0.40 N 159 2 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 114.78 108.30 6.48 0.30 N 160 2 C6 B DG 16 ? ? N1 B DG 16 ? ? C2 B DG 16 ? ? 121.09 125.10 -4.01 0.60 N 161 2 N1 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? O6 B DG 16 ? ? 113.55 119.90 -6.35 0.60 N 162 2 C5 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? O6 B DG 16 ? ? 133.33 128.60 4.73 0.60 N 163 2 "C3'" B DG 17 ? ? "C2'" B DG 17 ? ? "C1'" B DG 17 ? ? 97.05 102.40 -5.35 0.80 N 164 2 "O4'" B DG 17 ? ? "C1'" B DG 17 ? ? "C2'" B DG 17 ? ? 110.32 106.80 3.52 0.50 N 165 2 "O4'" B DT 18 ? ? "C4'" B DT 18 ? ? "C3'" B DT 18 ? ? 110.35 106.00 4.35 0.60 N 166 2 N1 B DT 18 ? ? C2 B DT 18 ? ? N3 B DT 18 ? ? 120.28 114.60 5.68 0.60 N 167 2 C2 B DT 18 ? ? N3 B DT 18 ? ? C4 B DT 18 ? ? 121.50 127.20 -5.70 0.60 N 168 2 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C6 B DT 18 ? ? 123.99 118.00 5.99 0.60 N 169 2 C5 B DT 18 ? ? C6 B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 119.12 123.70 -4.58 0.60 N 170 2 N3 B DT 18 ? ? C2 B DT 18 ? ? O2 B DT 18 ? ? 116.64 122.30 -5.66 0.60 N 171 2 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 116.65 122.90 -6.25 0.60 N 172 2 "C5'" B DG 19 ? ? "C4'" B DG 19 ? ? "O4'" B DG 19 ? ? 117.23 109.80 7.43 1.10 N 173 2 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? "C2'" B DG 19 ? ? 100.01 105.90 -5.89 0.80 N 174 2 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 111.39 108.30 3.09 0.30 N 175 2 C6 B DG 19 ? ? N1 B DG 19 ? ? C2 B DG 19 ? ? 120.30 125.10 -4.80 0.60 N 176 2 N1 B DG 19 ? ? C2 B DG 19 ? ? N3 B DG 19 ? ? 130.55 123.90 6.65 0.60 N 177 2 C2 B DG 19 ? ? N3 B DG 19 ? ? C4 B DG 19 ? ? 106.60 111.90 -5.30 0.50 N 178 2 C4 B DG 19 ? ? C5 B DG 19 ? ? C6 B DG 19 ? ? 124.39 118.80 5.59 0.60 N 179 2 C4 B DG 19 ? ? C5 B DG 19 ? ? N7 B DG 19 ? ? 106.96 110.80 -3.84 0.40 N 180 2 C5 B DG 19 ? ? N7 B DG 19 ? ? C8 B DG 19 ? ? 108.47 104.30 4.17 0.50 N 181 2 N7 B DG 19 ? ? C8 B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 109.84 113.10 -3.26 0.50 N 182 2 C6 B DG 20 ? ? N1 B DG 20 ? ? C2 B DG 20 ? ? 119.77 125.10 -5.33 0.60 N 183 2 N1 B DG 20 ? ? C2 B DG 20 ? ? N3 B DG 20 ? ? 128.64 123.90 4.74 0.60 N 184 2 N3 B DG 20 ? ? C4 B DG 20 ? ? C5 B DG 20 ? ? 125.58 128.60 -3.02 0.50 N 185 2 C4 B DG 20 ? ? C5 B DG 20 ? ? N7 B DG 20 ? ? 107.87 110.80 -2.93 0.40 N 186 3 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.66 118.90 3.76 0.60 N 187 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.15 121.90 -5.75 0.70 N 188 3 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 189 3 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.44 108.30 3.14 0.30 N 190 3 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.23 117.00 -3.77 0.50 N 191 3 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 192 3 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.66 118.60 -4.94 0.60 N 193 3 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 113.03 108.30 4.73 0.30 N 194 3 "C5'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "O4'" A DG 6 ? ? 119.69 109.80 9.89 1.10 N 195 3 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.81 108.30 3.51 0.30 N 196 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 197 3 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 112.58 117.00 -4.42 0.50 N 198 3 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.61 117.70 3.91 0.50 N 199 3 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 200 3 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 111.37 106.00 5.37 0.60 N 201 3 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.28 117.00 -4.72 0.50 N 202 3 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 120.78 117.70 3.08 0.50 N 203 3 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 114.13 118.60 -4.47 0.60 N 204 3 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 205 3 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.21 121.90 -4.69 0.70 N 206 3 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 109.86 106.00 3.86 0.60 N 207 3 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 208 3 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 209 3 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 117.61 121.90 -4.29 0.70 N 210 3 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.52 121.90 -4.38 0.70 N 211 3 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.49 108.30 4.19 0.30 N 212 3 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 213 3 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 123.37 119.00 4.37 0.60 N 214 3 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 116.67 122.90 -6.23 0.60 N 215 3 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.98 108.30 2.68 0.30 N 216 3 "C3'" B DG 19 ? ? "O3'" B DG 19 ? ? P B DG 20 ? ? 132.90 119.70 13.20 1.20 Y 217 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 109.96 106.00 3.96 0.60 N 218 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 219 4 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.52 118.90 3.62 0.60 N 220 4 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 221 4 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 222 4 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 109.80 106.00 3.80 0.60 N 223 4 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.68 108.30 3.38 0.30 N 224 4 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 112.93 117.00 -4.07 0.50 N 225 4 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 226 4 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.81 118.60 -4.79 0.60 N 227 4 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 228 4 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.46 121.90 -4.44 0.70 N 229 4 "C5'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "O4'" A DG 6 ? ? 120.69 109.80 10.89 1.10 N 230 4 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N 231 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 232 4 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.24 119.90 -3.66 0.60 N 233 4 "C3'" A DG 7 ? ? "O3'" A DG 7 ? ? P A DA 8 ? ? 137.61 119.70 17.91 1.20 Y 234 4 "O4'" A DA 8 ? ? "C1'" A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 235 4 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.33 117.00 -3.67 0.50 N 236 4 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 237 4 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 238 4 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 111.03 106.00 5.03 0.60 N 239 4 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.18 117.00 -4.82 0.50 N 240 4 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.03 117.70 3.33 0.50 N 241 4 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 242 4 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.69 121.90 -4.21 0.70 N 243 4 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 110.98 106.00 4.98 0.60 N 244 4 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 245 4 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 246 4 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.46 121.90 -4.44 0.70 N 247 4 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 248 4 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 249 4 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 124.20 119.00 5.20 0.60 N 250 4 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 115.69 122.90 -7.21 0.60 N 251 4 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 252 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 253 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 254 5 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.07 121.90 -4.83 0.70 N 255 5 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 109.68 106.00 3.68 0.60 N 256 5 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 257 5 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.29 117.00 -3.71 0.50 N 258 5 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.88 117.70 4.18 0.50 N 259 5 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.50 118.60 -6.10 0.60 N 260 5 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 261 5 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.49 121.90 -4.41 0.70 N 262 5 "C5'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "O4'" A DG 6 ? ? 119.62 109.80 9.82 1.10 N 263 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 264 5 C5 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? N1 A DG 6 ? ? 114.58 111.50 3.08 0.50 N 265 5 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 116.00 119.90 -3.90 0.60 N 266 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 267 5 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.00 119.90 -3.90 0.60 N 268 5 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.18 117.00 -3.82 0.50 N 269 5 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 270 5 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.63 118.60 -4.97 0.60 N 271 5 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 111.07 106.00 5.07 0.60 N 272 5 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.11 117.00 -4.89 0.50 N 273 5 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.72 117.70 4.02 0.50 N 274 5 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 275 5 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.97 121.90 -4.93 0.70 N 276 5 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 110.86 106.00 4.86 0.60 N 277 5 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 278 5 "O4'" B DT 12 ? ? "C1'" B DT 12 ? ? N1 B DT 12 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 279 5 C6 B DT 12 ? ? C5 B DT 12 ? ? C7 B DT 12 ? ? 119.14 122.90 -3.76 0.60 N 280 5 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 118.69 122.90 -4.21 0.60 N 281 5 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.70 121.90 -4.20 0.70 N 282 5 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 113.10 108.30 4.80 0.30 N 283 5 N1 B DG 17 ? ? C6 B DG 17 ? ? O6 B DG 17 ? ? 115.94 119.90 -3.96 0.60 N 284 5 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 285 5 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 124.17 119.00 5.17 0.60 N 286 5 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 115.72 122.90 -7.18 0.60 N 287 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.84 121.90 -5.06 0.70 N 288 6 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.13 121.90 -4.77 0.70 N 289 6 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 110.23 106.00 4.23 0.60 N 290 6 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.20 108.30 3.90 0.30 N 291 6 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.41 117.00 -3.59 0.50 N 292 6 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.58 117.70 3.88 0.50 N 293 6 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.91 118.60 -5.69 0.60 N 294 6 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 295 6 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.41 121.90 -4.49 0.70 N 296 6 "C5'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "O4'" A DG 6 ? ? 117.50 109.80 7.70 1.10 N 297 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 298 6 "C3'" A DG 6 ? ? "O3'" A DG 6 ? ? P A DG 7 ? ? 127.90 119.70 8.20 1.20 Y 299 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 300 6 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.11 119.90 -3.79 0.60 N 301 6 "O5'" A DA 8 ? ? "C5'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? 160.90 111.00 49.90 2.50 N 302 6 P A DA 8 ? ? "O5'" A DA 8 ? ? "C5'" A DA 8 ? ? 156.38 120.90 35.48 1.60 N 303 6 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? 109.71 106.00 3.71 0.60 N 304 6 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.00 117.00 -4.00 0.50 N 305 6 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 306 6 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 307 6 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 111.38 106.00 5.38 0.60 N 308 6 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.44 117.00 -4.56 0.50 N 309 6 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.01 117.70 3.31 0.50 N 310 6 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 114.34 118.60 -4.26 0.60 N 311 6 "O4'" A DC 10 ? ? "C4'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 109.90 106.00 3.90 0.60 N 312 6 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 313 6 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.54 121.90 -4.36 0.70 N 314 6 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 110.95 106.00 4.95 0.60 N 315 6 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 316 6 C6 B DT 12 ? ? C5 B DT 12 ? ? C7 B DT 12 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 317 6 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 118.84 122.90 -4.06 0.60 N 318 6 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 117.65 121.90 -4.25 0.70 N 319 6 "O4'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? "C3'" B DC 15 ? ? 109.65 106.00 3.65 0.60 N 320 6 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.44 121.90 -4.46 0.70 N 321 6 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.98 108.30 4.68 0.30 N 322 6 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 323 6 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 124.12 119.00 5.12 0.60 N 324 6 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 116.09 122.90 -6.81 0.60 N 325 6 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 326 6 "C3'" B DG 19 ? ? "O3'" B DG 19 ? ? P B DG 20 ? ? 127.33 119.70 7.63 1.20 Y 327 7 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.99 108.30 3.69 0.30 N 328 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.44 121.90 -5.46 0.70 N 329 7 "O4'" A DC 2 ? ? "C4'" A DC 2 ? ? "C3'" A DC 2 ? ? 109.91 106.00 3.91 0.60 N 330 7 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 331 7 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.39 108.30 3.09 0.30 N 332 7 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.09 117.00 -3.91 0.50 N 333 7 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 334 7 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.55 118.60 -5.05 0.60 N 335 7 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.30 121.90 -4.60 0.70 N 336 7 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 111.85 108.30 3.55 0.30 N 337 7 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 115.91 119.90 -3.99 0.60 N 338 7 "O4'" A DA 8 ? ? "C1'" A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 339 7 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 112.82 117.00 -4.18 0.50 N 340 7 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.59 117.70 3.89 0.50 N 341 7 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.52 118.60 -5.08 0.60 N 342 7 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 110.93 106.00 4.93 0.60 N 343 7 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.56 117.00 -4.44 0.50 N 344 7 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.08 117.70 3.38 0.50 N 345 7 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.44 118.60 -5.16 0.60 N 346 7 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 347 7 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.48 121.90 -4.42 0.70 N 348 7 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 110.33 106.00 4.33 0.60 N 349 7 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 112.04 108.30 3.74 0.30 N 350 7 N3 B DT 13 ? ? C2 B DT 13 ? ? O2 B DT 13 ? ? 118.65 122.30 -3.65 0.60 N 351 7 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 118.96 122.90 -3.94 0.60 N 352 7 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 117.70 121.90 -4.20 0.70 N 353 7 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 354 7 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 355 7 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 123.50 119.00 4.50 0.60 N 356 7 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 116.44 122.90 -6.46 0.60 N 357 7 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 358 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 359 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.44 121.90 -5.46 0.70 N 360 8 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 361 8 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N 362 8 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 112.81 117.00 -4.19 0.50 N 363 8 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.64 117.70 3.94 0.50 N 364 8 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 112.81 118.60 -5.79 0.60 N 365 8 "O4'" A DC 4 ? ? "C1'" A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? 112.88 108.30 4.58 0.30 N 366 8 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.60 121.90 -4.30 0.70 N 367 8 "C3'" A HOL 5 ? ? "O3'" A HOL 5 ? ? P A DG 6 ? ? 128.66 119.70 8.96 1.20 Y 368 8 "C5'" A DG 6 ? ? "C4'" A DG 6 ? ? "O4'" A DG 6 ? ? 119.55 109.80 9.75 1.10 N 369 8 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.64 108.30 2.34 0.30 N 370 8 "O4'" A DA 8 ? ? "C1'" A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 371 8 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 372 8 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 373 8 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.11 118.60 -5.49 0.60 N 374 8 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 111.78 106.00 5.78 0.60 N 375 8 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.13 117.00 -4.87 0.50 N 376 8 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 377 8 C6 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? N7 A DA 9 ? ? 136.78 132.30 4.48 0.70 N 378 8 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.19 118.60 -5.41 0.60 N 379 8 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.58 121.90 -4.32 0.70 N 380 8 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 109.91 106.00 3.91 0.60 N 381 8 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 382 8 "C3'" B DT 12 ? ? "O3'" B DT 12 ? ? P B DT 13 ? ? 127.73 119.70 8.03 1.20 Y 383 8 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 117.42 122.90 -5.48 0.60 N 384 8 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.35 121.90 -4.55 0.70 N 385 8 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.58 108.30 4.28 0.30 N 386 8 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 387 8 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 123.67 119.00 4.67 0.60 N 388 8 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 115.88 122.90 -7.02 0.60 N 389 8 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 390 8 C5 B DG 19 ? ? C6 B DG 19 ? ? N1 B DG 19 ? ? 114.85 111.50 3.35 0.50 N 391 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 392 9 "C3'" A DC 1 ? ? "O3'" A DC 1 ? ? P A DC 2 ? ? 127.57 119.70 7.87 1.20 Y 393 9 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.03 121.90 -4.87 0.70 N 394 9 "O4'" A DA 3 ? ? "C4'" A DA 3 ? ? "C3'" A DA 3 ? ? 109.91 106.00 3.91 0.60 N 395 9 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 396 9 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 397 9 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 398 9 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.46 118.60 -5.14 0.60 N 399 9 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.50 121.90 -4.40 0.70 N 400 9 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 401 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 402 9 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.21 119.90 -3.69 0.60 N 403 9 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? 109.71 106.00 3.71 0.60 N 404 9 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 112.65 117.00 -4.35 0.50 N 405 9 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 406 9 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 112.70 118.60 -5.90 0.60 N 407 9 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 110.67 106.00 4.67 0.60 N 408 9 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.00 117.00 -5.00 0.50 N 409 9 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 410 9 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.69 118.60 -4.91 0.60 N 411 9 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.69 121.90 -4.21 0.70 N 412 9 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 110.28 106.00 4.28 0.60 N 413 9 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.32 108.30 3.02 0.30 N 414 9 C6 B DT 12 ? ? C5 B DT 12 ? ? C7 B DT 12 ? ? 119.19 122.90 -3.71 0.60 N 415 9 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 118.89 122.90 -4.01 0.60 N 416 9 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 117.42 121.90 -4.48 0.70 N 417 9 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 418 9 C5 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? N1 B DG 16 ? ? 114.73 111.50 3.23 0.50 N 419 9 N1 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? O6 B DG 16 ? ? 116.08 119.90 -3.82 0.60 N 420 9 "O4'" B DT 18 ? ? "C1'" B DT 18 ? ? N1 B DT 18 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 421 9 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 123.30 119.00 4.30 0.60 N 422 9 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 115.98 122.90 -6.92 0.60 N 423 9 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 424 9 "C3'" B DG 19 ? ? "O3'" B DG 19 ? ? P B DG 20 ? ? 134.31 119.70 14.61 1.20 Y 425 10 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 112.09 108.30 3.79 0.30 N 426 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.36 121.90 -4.54 0.70 N 427 10 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.76 121.90 -5.14 0.70 N 428 10 "O4'" A DA 3 ? ? "C1'" A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 429 10 C4 A DA 3 ? ? C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? 113.22 117.00 -3.78 0.50 N 430 10 C5 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N1 A DA 3 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 431 10 N1 A DA 3 ? ? C6 A DA 3 ? ? N6 A DA 3 ? ? 113.39 118.60 -5.21 0.60 N 432 10 "O4'" A DC 4 ? ? "C4'" A DC 4 ? ? "C3'" A DC 4 ? ? 110.05 106.00 4.05 0.60 N 433 10 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 434 10 "C3'" A DC 4 ? ? "O3'" A DC 4 ? ? P A HOL 5 ? ? 127.74 119.70 8.04 1.20 Y 435 10 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.28 119.90 -3.62 0.60 N 436 10 "O4'" A DA 8 ? ? "C4'" A DA 8 ? ? "C3'" A DA 8 ? ? 109.73 106.00 3.73 0.60 N 437 10 C4 A DA 8 ? ? C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? 112.85 117.00 -4.15 0.50 N 438 10 C5 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N1 A DA 8 ? ? 121.54 117.70 3.84 0.50 N 439 10 N1 A DA 8 ? ? C6 A DA 8 ? ? N6 A DA 8 ? ? 113.81 118.60 -4.79 0.60 N 440 10 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 111.68 106.00 5.68 0.60 N 441 10 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.54 117.00 -4.46 0.50 N 442 10 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 443 10 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.89 118.60 -4.71 0.60 N 444 10 "O4'" A DC 10 ? ? "C4'" A DC 10 ? ? "C3'" A DC 10 ? ? 109.69 106.00 3.69 0.60 N 445 10 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.72 121.90 -5.18 0.70 N 446 10 "O4'" B DG 11 ? ? "C4'" B DG 11 ? ? "C3'" B DG 11 ? ? 111.51 106.00 5.51 0.60 N 447 10 "O4'" B DG 11 ? ? "C1'" B DG 11 ? ? N9 B DG 11 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 448 10 C6 B DT 13 ? ? C5 B DT 13 ? ? C7 B DT 13 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 449 10 "O4'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? "C3'" B DC 15 ? ? 109.90 106.00 3.90 0.60 N 450 10 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.14 121.90 -4.76 0.70 N 451 10 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? N9 B DG 16 ? ? 111.77 108.30 3.47 0.30 N 452 10 C5 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? N1 B DG 16 ? ? 114.72 111.50 3.22 0.50 N 453 10 N1 B DG 17 ? ? C6 B DG 17 ? ? O6 B DG 17 ? ? 115.57 119.90 -4.33 0.60 N 454 10 C4 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 123.38 119.00 4.38 0.60 N 455 10 C6 B DT 18 ? ? C5 B DT 18 ? ? C7 B DT 18 ? ? 116.32 122.90 -6.58 0.60 N 456 10 "O4'" B DG 19 ? ? "C1'" B DG 19 ? ? N9 B DG 19 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_chiral.id _pdbx_validate_chiral.PDB_model_num _pdbx_validate_chiral.auth_atom_id _pdbx_validate_chiral.label_alt_id _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id _pdbx_validate_chiral.auth_comp_id _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id _pdbx_validate_chiral.PDB_ins_code _pdbx_validate_chiral.details _pdbx_validate_chiral.omega 1 8 "C4'" ? A HOL 5 ? 'WRONG HAND' . 2 10 "C4'" ? A HOL 5 ? 'WRONG HAND' . # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DC A 2 ? ? 0.101 'SIDE CHAIN' 2 1 DA A 3 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 3 1 DC A 4 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 4 1 DG A 6 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 5 1 DG A 7 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 6 1 DA A 8 ? ? 0.145 'SIDE CHAIN' 7 1 DG B 11 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 8 1 DT B 12 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 9 1 DT B 13 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 10 1 DC B 14 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 11 1 DG B 19 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 12 2 DC A 1 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 13 2 DA A 3 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 14 2 DC A 4 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 15 2 DG A 6 ? ? 0.166 'SIDE CHAIN' 16 2 DG A 7 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 17 2 DA A 9 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 18 2 DG B 11 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 19 2 DT B 12 ? ? 0.110 'SIDE CHAIN' 20 2 DT B 13 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 21 2 DC B 14 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 22 2 DG B 16 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 23 2 DG B 17 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 24 2 DT B 18 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 25 2 DG B 19 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 26 2 DG B 20 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 27 3 DC A 1 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 28 3 DG A 6 ? ? 0.152 'SIDE CHAIN' 29 3 DC A 10 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 30 4 DG A 6 ? ? 0.152 'SIDE CHAIN' 31 4 DC A 10 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 32 4 DC B 15 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 33 5 DG A 6 ? ? 0.163 'SIDE CHAIN' 34 5 DC B 14 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 35 6 DC A 1 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 36 6 DG A 6 ? ? 0.190 'SIDE CHAIN' 37 6 DC A 10 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 38 6 DC B 14 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 39 7 DC A 2 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 40 7 DG A 6 ? ? 0.185 'SIDE CHAIN' 41 7 DA A 8 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 42 7 DC B 15 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 43 8 DA A 3 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 44 8 DG A 6 ? ? 0.192 'SIDE CHAIN' 45 8 DC A 10 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 46 8 DT B 12 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 47 8 DC B 14 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 48 9 DG A 6 ? ? 0.201 'SIDE CHAIN' 49 9 DC A 10 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 50 9 DC B 14 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 51 10 DC A 2 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 52 10 DC A 4 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 53 10 DG A 6 ? ? 0.330 'SIDE CHAIN' 54 10 DC A 10 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 55 10 DC B 14 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 56 10 DC B 15 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1SP6 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'all calculated structures submitted' _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 1SP6 _pdbx_nmr_representative.conformer_id 5 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.contents '2mM duplex' _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '100 mM NaCl, 10 mM phosphate, pH 7' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 278 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength '100 mM NaCl' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D NOESY' 2 1 1 DQF-COSY # _pdbx_nmr_refine.entry_id 1SP6 _pdbx_nmr_refine.method ;molecular dynamics matrix relaxation ; _pdbx_nmr_refine.details ;The structures are based on a total of 311 NOE-derived distance constraints obtained from a complete relaxation matrix refinement. The structures were calculated by using restrained molecular dynamics with explicit solvent, and applying the particle Mesh Ewald method ; _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # loop_ _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.ordinal DYANA 5.0 'structure solution' 'Gunter, P.' 1 MARDIGRAS 5.2 'iterative matrix relaxation' 'James, T.L.' 2 XwinNMR 1.3 collection Bruker 3 Amber 5.0 refinement 'Kollman, P.A.' 4 XEASY 1.0 'data analysis' Bartels 5 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 HOL P P N N 144 HOL OP1 O N N 145 HOL OP2 O N N 146 HOL "O5'" O N N 147 HOL "C5'" C N N 148 HOL "C4'" C N R 149 HOL "C3'" C N S 150 HOL "C2'" C N N 151 HOL "C1'" C N S 152 HOL "O4'" O N N 153 HOL O1 O N N 154 HOL C2 C N N 155 HOL C3 C N N 156 HOL C4 C N N 157 HOL N5 N N N 158 HOL C6 C N N 159 HOL O8 O N N 160 HOL C9 C N S 161 HOL C14 C N N 162 HOL C13 C N N 163 HOL C12 C N R 164 HOL C11 C N N 165 HOL C10 C N N 166 HOL C16 C N N 167 HOL C17 C N N 168 HOL C18 C N S 169 HOL C19 C N S 170 HOL C20 C N N 171 HOL C21 C N N 172 HOL C22 C N R 173 HOL C23 C N S 174 HOL C25 C N N 175 HOL C26 C N N 176 HOL C27 C N R 177 HOL C28 C N R 178 HOL C29 C N N 179 HOL C30 C N N 180 HOL C31 C N N 181 HOL C32 C N N 182 HOL C33 C N N 183 HOL C34 C N N 184 HOL C35 C N N 185 HOL C24 C N N 186 HOL C15 C N N 187 HOL O7 O N N 188 HOL "O3'" O N N 189 HOL OP3 O N N 190 HOL HOP2 H N N 191 HOL "H5'" H N N 192 HOL "H5''" H N N 193 HOL "H4'" H N N 194 HOL "H3'" H N N 195 HOL "H2'" H N N 196 HOL "H2''" H N N 197 HOL "H1'" H N N 198 HOL H21 H N N 199 HOL H22 H N N 200 HOL H31 H N N 201 HOL H32 H N N 202 HOL H41 H N N 203 HOL H42 H N N 204 HOL H5 H N N 205 HOL H9 H N N 206 HOL H141 H N N 207 HOL H142 H N N 208 HOL H131 H N N 209 HOL H132 H N N 210 HOL H101 H N N 211 HOL H102 H N N 212 HOL H16 H N N 213 HOL H171 H N N 214 HOL H172 H N N 215 HOL H18 H N N 216 HOL H19 H N N 217 HOL H201 H N N 218 HOL H202 H N N 219 HOL H211 H N N 220 HOL H212 H N N 221 HOL H23 H N N 222 HOL H251 H N N 223 HOL H252 H N N 224 HOL H261 H N N 225 HOL H262 H N N 226 HOL H27 H N N 227 HOL H28 H N N 228 HOL H291 H N N 229 HOL H292 H N N 230 HOL H293 H N N 231 HOL H301 H N N 232 HOL H302 H N N 233 HOL H311 H N N 234 HOL H312 H N N 235 HOL H321 H N N 236 HOL H322 H N N 237 HOL H33 H N N 238 HOL H341 H N N 239 HOL H342 H N N 240 HOL H343 H N N 241 HOL H351 H N N 242 HOL H352 H N N 243 HOL H353 H N N 244 HOL H241 H N N 245 HOL H242 H N N 246 HOL H243 H N N 247 HOL H151 H N N 248 HOL H152 H N N 249 HOL H153 H N N 250 HOL "HO3'" H N N 251 HOL HOP3 H N N 252 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 HOL P OP1 doub N N 150 HOL P OP2 sing N N 151 HOL P "O5'" sing N N 152 HOL P OP3 sing N N 153 HOL OP2 HOP2 sing N N 154 HOL "O5'" "C5'" sing N N 155 HOL "C5'" "C4'" sing N N 156 HOL "C5'" "H5'" sing N N 157 HOL "C5'" "H5''" sing N N 158 HOL "C4'" "C3'" sing N N 159 HOL "C4'" "O4'" sing N N 160 HOL "C4'" "H4'" sing N N 161 HOL "C3'" "C2'" sing N N 162 HOL "C3'" "O3'" sing N N 163 HOL "C3'" "H3'" sing N N 164 HOL "C2'" "C1'" sing N N 165 HOL "C2'" "H2'" sing N N 166 HOL "C2'" "H2''" sing N N 167 HOL "C1'" "O4'" sing N N 168 HOL "C1'" O1 sing N N 169 HOL "C1'" "H1'" sing N N 170 HOL O1 C2 sing N N 171 HOL C2 C3 sing N N 172 HOL C2 H21 sing N N 173 HOL C2 H22 sing N N 174 HOL C3 C4 sing N N 175 HOL C3 H31 sing N N 176 HOL C3 H32 sing N N 177 HOL C4 N5 sing N N 178 HOL C4 H41 sing N N 179 HOL C4 H42 sing N N 180 HOL N5 C6 sing N N 181 HOL N5 H5 sing N N 182 HOL C6 O8 sing N N 183 HOL C6 O7 doub N N 184 HOL O8 C9 sing N N 185 HOL C9 C14 sing N N 186 HOL C9 C10 sing N N 187 HOL C9 H9 sing N N 188 HOL C14 C13 sing N N 189 HOL C14 H141 sing N N 190 HOL C14 H142 sing N N 191 HOL C13 C12 sing N N 192 HOL C13 H131 sing N N 193 HOL C13 H132 sing N N 194 HOL C12 C11 sing N N 195 HOL C12 C19 sing N N 196 HOL C12 C15 sing N N 197 HOL C11 C10 sing N N 198 HOL C11 C16 doub N N 199 HOL C10 H101 sing N N 200 HOL C10 H102 sing N N 201 HOL C16 C17 sing N N 202 HOL C16 H16 sing N N 203 HOL C17 C18 sing N N 204 HOL C17 H171 sing N N 205 HOL C17 H172 sing N N 206 HOL C18 C19 sing N N 207 HOL C18 C23 sing N N 208 HOL C18 H18 sing N N 209 HOL C19 C20 sing N N 210 HOL C19 H19 sing N N 211 HOL C20 C21 sing N N 212 HOL C20 H201 sing N N 213 HOL C20 H202 sing N N 214 HOL C21 C22 sing N N 215 HOL C21 H211 sing N N 216 HOL C21 H212 sing N N 217 HOL C22 C23 sing N N 218 HOL C22 C27 sing N N 219 HOL C22 C24 sing N N 220 HOL C23 C25 sing N N 221 HOL C23 H23 sing N N 222 HOL C25 C26 sing N N 223 HOL C25 H251 sing N N 224 HOL C25 H252 sing N N 225 HOL C26 C27 sing N N 226 HOL C26 H261 sing N N 227 HOL C26 H262 sing N N 228 HOL C27 C28 sing N N 229 HOL C27 H27 sing N N 230 HOL C28 C29 sing N N 231 HOL C28 C30 sing N N 232 HOL C28 H28 sing N N 233 HOL C29 H291 sing N N 234 HOL C29 H292 sing N N 235 HOL C29 H293 sing N N 236 HOL C30 C31 sing N N 237 HOL C30 H301 sing N N 238 HOL C30 H302 sing N N 239 HOL C31 C32 sing N N 240 HOL C31 H311 sing N N 241 HOL C31 H312 sing N N 242 HOL C32 C33 sing N N 243 HOL C32 H321 sing N N 244 HOL C32 H322 sing N N 245 HOL C33 C34 sing N N 246 HOL C33 C35 sing N N 247 HOL C33 H33 sing N N 248 HOL C34 H341 sing N N 249 HOL C34 H342 sing N N 250 HOL C34 H343 sing N N 251 HOL C35 H351 sing N N 252 HOL C35 H352 sing N N 253 HOL C35 H353 sing N N 254 HOL C24 H241 sing N N 255 HOL C24 H242 sing N N 256 HOL C24 H243 sing N N 257 HOL C15 H151 sing N N 258 HOL C15 H152 sing N N 259 HOL C15 H153 sing N N 260 HOL "O3'" "HO3'" sing N N 261 HOL OP3 HOP3 sing N N 262 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1SP6 'double helix' 1SP6 'b-form double helix' 1SP6 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 10 1_555 -0.173 -0.144 0.630 -7.920 -10.493 -4.981 1 A_DC1:DG20_B A 1 ? B 20 ? 19 1 1 A DC 2 1_555 B DG 9 1_555 -0.254 -0.068 -0.200 3.137 7.083 0.062 2 A_DC2:DG19_B A 2 ? B 19 ? 19 1 1 A DA 3 1_555 B DT 8 1_555 0.239 -0.074 0.035 12.084 -2.156 1.759 3 A_DA3:DT18_B A 3 ? B 18 ? 20 1 1 A DC 4 1_555 B DG 7 1_555 0.420 -0.152 -0.185 22.655 -19.813 -1.028 4 A_DC4:DG17_B A 4 ? B 17 ? 19 1 1 A DG 6 1_555 B DC 5 1_555 -0.613 -0.099 -0.725 -40.205 -3.405 -4.595 5 A_DG6:DC15_B A 6 ? B 15 ? 19 1 1 A DG 7 1_555 B DC 4 1_555 -0.126 -0.037 -1.246 -17.087 -9.812 2.151 6 A_DG7:DC14_B A 7 ? B 14 ? 19 1 1 A DA 8 1_555 B DT 3 1_555 0.889 -0.075 -1.033 -17.037 -9.484 1.554 7 A_DA8:DT13_B A 8 ? B 13 ? 20 1 1 A DA 9 1_555 B DT 2 1_555 -0.053 -0.109 -0.384 -2.503 -13.782 -0.641 8 A_DA9:DT12_B A 9 ? B 12 ? 20 1 1 A DC 10 1_555 B DG 1 1_555 -0.062 0.011 0.211 -3.812 7.848 -1.253 9 A_DC10:DG11_B A 10 ? B 11 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DC 1 1_555 B DG 10 1_555 A DC 2 1_555 B DG 9 1_555 0.167 0.009 3.226 5.071 0.974 43.073 -0.082 0.261 3.224 1.321 -6.877 43.367 1 AA_DC1DC2:DG19DG20_BB A 1 ? B 20 ? A 2 ? B 19 ? 1 A DC 2 1_555 B DG 9 1_555 A DA 3 1_555 B DT 8 1_555 -0.342 -0.230 3.042 -3.884 3.872 30.781 -1.111 -0.051 3.011 7.223 7.245 31.254 2 AA_DC2DA3:DT18DG19_BB A 2 ? B 19 ? A 3 ? B 18 ? 1 A DA 3 1_555 B DT 8 1_555 A DC 4 1_555 B DG 7 1_555 -0.180 -0.323 3.075 0.649 7.422 34.766 -1.538 0.384 2.942 12.248 -1.072 35.531 3 AA_DA3DC4:DG17DT18_BB A 3 ? B 18 ? A 4 ? B 17 ? 1 A DG 6 1_555 B DC 5 1_555 A DG 7 1_555 B DC 4 1_555 0.508 -0.536 3.396 14.566 2.320 32.815 -1.225 1.406 3.280 3.872 -24.311 35.894 4 AA_DG6DG7:DC14DC15_BB A 6 ? B 15 ? A 7 ? B 14 ? 1 A DG 7 1_555 B DC 4 1_555 A DA 8 1_555 B DT 3 1_555 -0.365 0.519 3.229 -1.254 6.343 44.309 0.103 0.365 3.278 8.357 1.652 44.755 5 AA_DG7DA8:DT13DC14_BB A 7 ? B 14 ? A 8 ? B 13 ? 1 A DA 8 1_555 B DT 3 1_555 A DA 9 1_555 B DT 2 1_555 -0.012 -0.191 2.806 -1.978 6.903 33.459 -1.254 -0.246 2.710 11.821 3.387 34.199 6 AA_DA8DA9:DT12DT13_BB A 8 ? B 13 ? A 9 ? B 12 ? 1 A DA 9 1_555 B DT 2 1_555 A DC 10 1_555 B DG 1 1_555 0.394 -0.659 3.613 -7.122 -0.925 32.871 -0.974 -1.955 3.470 -1.610 12.401 33.625 7 AA_DA9DC10:DG11DT12_BB A 9 ? B 12 ? A 10 ? B 11 ? # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.model DMX _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 600 # _atom_sites.entry_id 1SP6 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_