data_1T2G # _entry.id 1T2G # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 1T2G RCSB RCSB022227 WWPDB D_1000022227 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 2A4J _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 1T2G _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2005-07-12 _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ? # _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.entry_id 1T2G _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2004-04-21 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr OBS _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Miron, S.' 1 'Yang, A.' 2 'Blouquit, Y.' 3 'Duchambon, P.' 4 'Craescu, C.T.' 5 # _citation.id primary _citation.title ;Solution structure of the C-terminal domain (T94-Y172) of the human centrin 2 in complex with a 17 residues peptide (P1) from Xeroderma pigmentosum group C protein ; _citation.journal_abbrev 'to be published' _citation.journal_volume ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.year ? _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country ? _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Miron, S.' 1 primary 'Yang, A.' 2 primary 'Blouquit, Y.' 3 primary 'Duchambon, P.' 4 primary 'Craescu, C.T.' 5 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Centrin 2' 9234.317 1 ? ? 'c-terminal domain (residues 94-172)' ? 2 polymer syn '17-mer peptide P1-XPC from Xeroderma pigmentosum, complementation group C' 2113.639 1 ? ? 'residues 847-863' ? # _entity_name_com.entity_id 1 _entity_name_com.name 'Caltractin isoform 1' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no TQKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGKISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEQEFLRIMKKTSLY TQKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGKISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEQEFLRIMKKTSLY A ? 2 'polypeptide(L)' no no NWKLLAKGLLIRERLKR NWKLLAKGLLIRERLKR B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 THR n 1 2 GLN n 1 3 LYS n 1 4 MET n 1 5 SER n 1 6 GLU n 1 7 LYS n 1 8 ASP n 1 9 THR n 1 10 LYS n 1 11 GLU n 1 12 GLU n 1 13 ILE n 1 14 LEU n 1 15 LYS n 1 16 ALA n 1 17 PHE n 1 18 LYS n 1 19 LEU n 1 20 PHE n 1 21 ASP n 1 22 ASP n 1 23 ASP n 1 24 GLU n 1 25 THR n 1 26 GLY n 1 27 LYS n 1 28 ILE n 1 29 SER n 1 30 PHE n 1 31 LYS n 1 32 ASN n 1 33 LEU n 1 34 LYS n 1 35 ARG n 1 36 VAL n 1 37 ALA n 1 38 LYS n 1 39 GLU n 1 40 LEU n 1 41 GLY n 1 42 GLU n 1 43 ASN n 1 44 LEU n 1 45 THR n 1 46 ASP n 1 47 GLU n 1 48 GLU n 1 49 LEU n 1 50 GLN n 1 51 GLU n 1 52 MET n 1 53 ILE n 1 54 ASP n 1 55 GLU n 1 56 ALA n 1 57 ASP n 1 58 ARG n 1 59 ASP n 1 60 GLY n 1 61 ASP n 1 62 GLY n 1 63 GLU n 1 64 VAL n 1 65 SER n 1 66 GLU n 1 67 GLN n 1 68 GLU n 1 69 PHE n 1 70 LEU n 1 71 ARG n 1 72 ILE n 1 73 MET n 1 74 LYS n 1 75 LYS n 1 76 THR n 1 77 SER n 1 78 LEU n 1 79 TYR n 2 1 ASN n 2 2 TRP n 2 3 LYS n 2 4 LEU n 2 5 LEU n 2 6 ALA n 2 7 LYS n 2 8 GLY n 2 9 LEU n 2 10 LEU n 2 11 ILE n 2 12 ARG n 2 13 GLU n 2 14 ARG n 2 15 LEU n 2 16 LYS n 2 17 ARG n # _entity_src_gen.entity_id 1 _entity_src_gen.pdbx_src_id 1 _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag sample _entity_src_gen.pdbx_seq_type ? _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num ? _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num ? _entity_src_gen.gene_src_common_name human _entity_src_gen.gene_src_genus ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene cen2 _entity_src_gen.gene_src_species ? _entity_src_gen.gene_src_strain ? _entity_src_gen.gene_src_tissue ? _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction ? _entity_src_gen.gene_src_details ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name 'Homo sapiens' _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell ? _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location ? _entity_src_gen.host_org_common_name bacteria _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name 'Escherichia coli' _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id ? _entity_src_gen.host_org_genus ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ ? _entity_src_gen.host_org_species ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain 'BL21(DE3)' _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location ? _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type PLASMID _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector ? _entity_src_gen.host_org_details ? _entity_src_gen.expression_system_id ? _entity_src_gen.plasmid_name 'PET24A(+)' _entity_src_gen.plasmid_details ? _entity_src_gen.pdbx_description ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 2 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific ? _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id ? _pdbx_entity_src_syn.details 'this sequens occurs in Homo sapiens' # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 1 SWS CET2_HUMAN P41208 94 TQKMSEKDTKEEILKAFKLFDDDETGKISFKNLKRVAKELGENLTDEELQEMIDEADRDGDGEVSEQEFLRIMKKTSLY ? 2 2 SWS Q96AX0 Q96AX0 847 NWKLLAKGLLIRERLKR ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1T2G A 1 ? 79 ? P41208 94 ? 172 ? 94 172 2 2 1T2G B 1 ? 17 ? Q96AX0 847 ? 863 ? 1 17 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D NOESY' 2 1 1 '2D TOCSY' 3 1 1 DQF-COSY 4 2 2 3D_15N-separated_NOESY 5 2 2 2D_15N_HSQC 6 3 3 '3D HCCH-TOCSY' 7 2 2 3D_15N-separated_TOCSY 8 3 3 'HNCA and HNCOCA' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 308 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 6.5 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength '100 mM NaCl' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units ? # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system 1 ;1.2 mM UNLABELED SC-HSCEN2 (T94-Y172); deuterated TRIS/HCl 20 mM buffer; 100 mM NaCl;5mM CaCl2;pH 6.5; 1.4 mM UNLABELED P1-XPC ; ;93% 1H2O/ 7% 2H2O; or 100% 2H2O ; 2 ;1.2 mM SC-HSCEN2 (T94-Y172) U-15N; deuterated TRIS/HCl 20 mM buffer; 100 mM NaCl;5mM CaCl2; pH 6.5; 1.4 mM UNLABELED P1-XPC ; '93% 1H2O/ 7% 2H2O;' 3 ;1.2 mM SC-HSCEN2 (T94-Y172) U-15N,13C; deuterated TRIS/HCl 20 mM buffer; 100 mM NaCl;5mM CaCl2; pH 6.5; 1.4 mM UNLABELED P1-XPC ; '93% 1H2O/ 7% 2H2O;' # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Varian _pdbx_nmr_spectrometer.model UNITY _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 500 # _pdbx_nmr_refine.entry_id 1T2G _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ;the structures are based on 1298 NOE distance restraints, 121 dihedral angle restraints, and 84 hydrogen bond restraints. ; _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1T2G _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 200 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 20 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 1T2G _pdbx_nmr_representative.conformer_id 7 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'fewest violations,lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.ordinal FELIX 2000.1 'data analysis' ACCELRYS 1 DISCOVER 'InsightII 2000 (NMR_Refine)' refinement ACCELRYS 2 # _exptl.entry_id 1T2G _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _struct.entry_id 1T2G _struct.title ;Solution structure of the C-terminal domain (T94-Y172) of the human centrin 2 in complex with a 17 residues peptide (P1) from xeroderma pigmentosum group C protein ; _struct.pdbx_descriptor 'Centrin 2/17 residue peptide from Xeroderma pigmentosum, complementation group C' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1T2G _struct_keywords.pdbx_keywords 'STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.text 'EF-hand, STRUCTURAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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NH1 A ARG 164 ? ? 124.13 120.30 3.83 0.50 N 98 11 NE B ARG 12 ? ? CZ B ARG 12 ? ? NH1 B ARG 12 ? ? 123.92 120.30 3.62 0.50 N 99 11 NE B ARG 14 ? ? CZ B ARG 14 ? ? NH1 B ARG 14 ? ? 124.00 120.30 3.70 0.50 N 100 11 NE B ARG 17 ? ? CZ B ARG 17 ? ? NH1 B ARG 17 ? ? 124.03 120.30 3.73 0.50 N 101 12 CA A PHE 113 ? ? CB A PHE 113 ? ? CG A PHE 113 ? ? 129.96 113.90 16.06 2.40 N 102 12 CB A PHE 113 ? ? CG A PHE 113 ? ? CD2 A PHE 113 ? ? 114.77 120.80 -6.03 0.70 N 103 12 NE A ARG 128 ? ? CZ A ARG 128 ? ? NH1 A ARG 128 ? ? 123.95 120.30 3.65 0.50 N 104 12 NE A ARG 151 ? ? CZ A ARG 151 ? ? NH1 A ARG 151 ? ? 123.96 120.30 3.66 0.50 N 105 12 CB A PHE 162 ? ? CG A PHE 162 ? ? CD2 A PHE 162 ? ? 125.11 120.80 4.31 0.70 N 106 12 NE A ARG 164 ? ? CZ A ARG 164 ? ? NH1 A ARG 164 ? ? 124.15 120.30 3.85 0.50 N 107 12 NE B ARG 12 ? ? CZ B ARG 12 ? ? NH1 B ARG 12 ? ? 124.06 120.30 3.76 0.50 N 108 12 NE B ARG 14 ? ? CZ B ARG 14 ? ? NH1 B ARG 14 ? ? 124.02 120.30 3.72 0.50 N 109 12 NE B ARG 17 ? ? 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