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PDB 8RUC unspecified 'ACTIVATED SPINACH RUBISCO COMPLEXED WITH 2- CARBOXYARABINITOL BISPHOSPHATE' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1UPM _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2003-10-08 _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Karkehabadi, S.' 1 'Taylor, T.C.' 2 'Andersson, I.' 3 # _citation.id primary _citation.title 'Calcium Supports Loop Closure But not Catalysis in Rubisco' _citation.journal_abbrev J.Mol.Biol. _citation.journal_volume 334 _citation.page_first 65 _citation.page_last ? _citation.year 2003 _citation.journal_id_ASTM JMOBAK _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0022-2836 _citation.journal_id_CSD 0070 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 14596800 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/J.JMB.2003.09.025 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Karkehabadi, S.' 1 primary 'Taylor, T.C.' 2 primary 'Andersson, I.' 3 # _cell.entry_id 1UPM _cell.length_a 219.600 _cell.length_b 220.942 _cell.length_c 116.984 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1UPM _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 2' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 18 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'RIBULOSE BISPHOSPHATE CARBOXYLASE LARGE CHAIN' 52849.742 8 4.1.1.39 ? ? ? 2 polymer nat 'RIBULOSE BISPHOSPHATE CARBOXYLASE SMALL CHAIN' 14638.671 8 4.1.1.39 ? ? 'THE COMPLETE STRUCTURE HAS BEEN SUBMITTED AS WELL AS THE MATRIX TRANSFORMATION FOR EACH CHAIN.' 3 non-polymer syn 'CALCIUM ION' 40.078 8 ? ? ? ? 4 non-polymer syn 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE 356.115 8 ? ? ? ? 5 water nat water 18.015 2788 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'RIBULOSE BISPHOSPHATE CARBOXYLASE/OXYGENASE, RUBISCO LARGE SUBUNIT' 2 'RIBULOSE BISPHOSPHATE CARBOXYLASE/OXYGENASE, RUBISCO SMALL SUBUNIT' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no yes ;MSPQTETKASVEFKAGVKDYKLTYYTPEYETLDTDILAAFRVSPQPGVPPEEAGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTNLDRY KGRCYHIEPVAGEENQYICYVAYPLDLFEEGSVTNMFTSIVGNVFGFKALRALRLEDLRIPVAYVKTFQGPPHGIQVERD KLNKYGRPLLGCTIKPKLGLSAKNYGRAVYECLRGGLDFT(KCX)DDENVNSQPFMRWRDRFLFCAEALYKAQAETGEIK 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SPINACH 'SPINACIA OLERACEA' 3562 ? ? ? LEAF ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? SPINACH 'SPINACIA OLERACEA' 3562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? LEAF ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP RBL_SPIOL 1 ? ? P00875 ? 2 UNP RBS2_SPIOL 2 ? ? Q43832 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1UPM L 1 ? 475 ? 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V CA 476 V GLU 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc45 metalc ? ? EA CA . CA ? ? ? 1_555 FA CAP . O2 ? ? V CA 476 V CAP 477 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc46 metalc ? ? EA CA . CA ? ? ? 1_555 FA CAP . O3 ? ? V CA 476 V CAP 477 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? metalc47 metalc ? ? EA CA . CA ? ? ? 1_555 FA CAP . O6 ? ? V CA 476 V CAP 477 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc48 metalc ? ? EA CA . CA ? ? ? 1_555 O KCX 201 OQ2 ? ? V CA 476 V KCX 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id LYS _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 175 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id L _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id LYS _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 175 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id R _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 176 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 L _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 176 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 R _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 22.30 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details BA ? 5 ? 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