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_refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_analyze.entry_id 1VLN _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_obs 0.35 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_obs ? _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_obs ? _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_free ? _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_free ? _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_free ? 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'X-RAY DIFFRACTION' ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1VLN _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 1VLN _struct.title 'A TRICLINIC CRYSTAL FORM OF THE LECTIN CONCANAVALIN A' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1VLN _struct_keywords.pdbx_keywords LECTIN _struct_keywords.text 'LEGUME, LECTIN, CALCIUM, MANGANESE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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UNP P08902 GLU 62 conflict 151 3 2 1VLN GLU B 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 4 3 1VLN ASP C 151 ? UNP P08902 GLU 62 conflict 151 5 3 1VLN GLU C 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 6 4 1VLN ASP D 151 ? UNP P08902 GLU 62 conflict 151 7 4 1VLN GLU D 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 8 5 1VLN ASP E 151 ? UNP P08902 GLU 62 conflict 151 9 5 1VLN GLU E 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 10 6 1VLN ASP F 151 ? UNP P08902 GLU 62 conflict 151 11 6 1VLN GLU F 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 12 7 1VLN ASP G 151 ? UNP P08902 GLU 62 conflict 151 13 7 1VLN GLU G 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 14 8 1VLN ASP H 151 ? UNP P08902 GLU 62 conflict 151 15 8 1VLN GLU H 155 ? UNP P08902 ARG 66 conflict 155 16 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA tetrameric 4 2 author_and_software_defined_assembly PISA tetrameric 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 9470 ? 1 MORE -112 ? 1 'SSA (A^2)' 33560 ? 2 'ABSA (A^2)' 9270 ? 2 MORE -119 ? 2 'SSA (A^2)' 33710 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Y,Z,AA,BA 2 1 E,F,G,H,Q,R,S,T,U,V,W,X,CA,DA,EA,FA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_biol.id 1 2 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN A 14 ? GLY A 18 ? ASN A 14 GLY A 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 ASP A 80 ? VAL A 84 ? ASP A 80 VAL A 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 THR A 226 ? LEU A 230 ? THR A 226 LEU A 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P4 4 ASN B 14 ? GLY B 18 ? ASN B 14 GLY B 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 5 ASP B 80 ? LEU B 85 ? ASP B 80 LEU B 85 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 6 THR B 226 ? LEU B 230 ? THR B 226 LEU B 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 7 ASN C 14 ? GLY C 18 ? ASN C 14 GLY C 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P8 8 ASP C 80 ? VAL C 84 ? ASP C 80 VAL C 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 9 THR C 226 ? LEU C 230 ? THR C 226 LEU C 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 10 ASN D 14 ? GLY D 18 ? ASN D 14 GLY D 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 11 ASP D 80 ? VAL D 84 ? ASP D 80 VAL D 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 12 THR D 226 ? LEU D 230 ? THR D 226 LEU D 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 13 ASN E 14 ? GLY E 18 ? ASN E 14 GLY E 18 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 ASP E 80 ? VAL E 84 ? ASP E 80 VAL E 84 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 15 THR E 150 ? GLY E 152 ? THR E 150 GLY E 152 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 16 THR E 226 ? LEU E 230 ? 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THR H 226 LEU H 230 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A GLU 8 OE2 ? ? ? 1_555 I MN . MN ? ? A GLU 8 A MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? ? metalc2 metalc ? ? A ASP 10 OD2 ? ? ? 1_555 I MN . MN ? ? A ASP 10 A MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? ? metalc3 metalc ? ? A ASP 10 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 10 A CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? ? metalc4 metalc ? ? A ASP 10 OD2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 10 A CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? ? metalc5 metalc ? ? A TYR 12 O ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A TYR 12 A CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? ? metalc6 metalc ? ? A ASN 14 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASN 14 A CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? ? metalc7 metalc ? ? A ASP 19 OD1 ? ? ? 1_555 I MN . MN ? ? A ASP 19 A MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? ? metalc8 metalc ? ? A ASP 19 OD2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 19 A CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? ? metalc9 metalc ? ? A HIS 24 NE2 ? ? ? 1_555 I MN . MN ? ? A HIS 24 A MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? ? metalc10 metalc ? ? I MN . MN ? ? ? 1_555 Y HOH . O ? ? A MN 238 A HOH 240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? ? metalc11 metalc ? ? I MN . MN ? ? ? 1_555 Y HOH . O ? ? A MN 238 A HOH 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? ? metalc12 metalc ? ? J CA . CA ? ? ? 1_555 Y HOH . O ? ? A CA 239 A HOH 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? ? metalc13 metalc ? ? J CA . CA ? ? ? 1_555 Y HOH . O ? ? A CA 239 A HOH 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? metalc14 metalc ? ? B GLU 8 OE2 ? ? ? 1_555 K MN . MN ? ? B GLU 8 B MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? ? metalc15 metalc ? ? B ASP 10 OD2 ? ? ? 1_555 K MN . MN ? ? B ASP 10 B MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? metalc16 metalc ? ? B ASP 10 OD1 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? B ASP 10 B CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? ? metalc17 metalc ? ? B ASP 10 OD2 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? B ASP 10 B CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? ? metalc18 metalc ? ? B TYR 12 O ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? B TYR 12 B CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? ? metalc19 metalc ? ? B ASN 14 OD1 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? B ASN 14 B CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? ? metalc20 metalc ? ? B ASP 19 OD1 ? ? ? 1_555 K MN . MN ? ? B ASP 19 B MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? ? metalc21 metalc ? ? B ASP 19 OD2 ? ? ? 1_555 L CA . CA ? ? B ASP 19 B CA 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? ? metalc22 metalc ? ? B HIS 24 NE2 ? ? ? 1_555 K MN . MN ? ? B HIS 24 B MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? ? metalc23 metalc ? ? K MN . MN ? ? ? 1_555 Z HOH . O ? ? B MN 238 B HOH 240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? ? metalc24 metalc ? ? K MN . MN ? ? ? 1_555 Z HOH . O ? ? B MN 238 B HOH 241 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? ? metalc25 metalc ? ? L CA . CA ? ? ? 1_555 Z HOH . O ? ? B CA 239 B HOH 242 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.856 ? ? metalc26 metalc ? ? L CA . CA ? ? ? 1_555 Z HOH . O ? ? B CA 239 B HOH 243 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.380 ? ? metalc27 metalc ? ? C GLU 8 OE2 ? ? ? 1_555 M MN . MN ? ? C GLU 8 C MN 238 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? ? metalc28 metalc ? ? C ASP 10 OD2 ? ? ? 1_555 M MN . MN ? ? 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ALA 207 B ASP 208 B ? ASP 208 B 1 4.20 3 ALA 207 C . ? ALA 207 C ASP 208 C ? ASP 208 C 1 16.18 4 ALA 207 D . ? ALA 207 D ASP 208 D ? ASP 208 D 1 10.32 5 ALA 207 E . ? ALA 207 E ASP 208 E ? ASP 208 E 1 -1.61 6 ALA 207 F . ? ALA 207 F ASP 208 F ? ASP 208 F 1 9.84 7 ALA 207 G . ? ALA 207 G ASP 208 G ? ASP 208 G 1 6.01 8 ALA 207 H . ? ALA 207 H ASP 208 H ? ASP 208 H 1 15.30 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details S1A ? 7 ? S2A ? 6 ? S1B ? 7 ? S2B ? 6 ? S1C ? 7 ? S2C ? 6 ? S1D ? 7 ? S2D ? 6 ? S1E ? 7 ? S2E ? 6 ? S1F ? 7 ? S2F ? 6 ? S1G ? 7 ? S2G ? 6 ? S1H ? 7 ? 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