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'X-RAY DIFFRACTION' . 10.8699 94.2416 6414 0.2644 94.00 0.3035 . . 711 . . . . # _struct.entry_id 1VW6 _struct.title 'Computationally Designed Two-Component Self-Assembling Tetrahedral Cage T33-28' _struct.pdbx_descriptor 'integron gene cassette protein, Macrophage migration inhibitory factor-like protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1VW6 _struct_keywords.text ;two-component, self-assembling, tetrahedron, designed protein cage, computational design, computational biology, protein engineering, multimerization, nanomaterial, nanostructure, integrons, macrophage migration-inhibitory factors, PROTEIN BINDING ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'PROTEIN BINDING' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? O N N 1 ? P N N 1 ? Q N N 1 ? R N N 1 ? S N N 1 ? T N N 1 ? U N N 1 ? V N N 1 ? W N N 1 ? X N N 1 ? Y N N 2 ? Z N N 2 ? AA N N 2 ? BA N N 2 ? CA N N 2 ? DA N N 2 ? EA N N 2 ? FA N N 2 ? GA N N 2 ? HA N N 2 ? IA N N 2 ? JA N N 2 ? KA N N 2 ? LA N N 2 ? MA N N 2 ? NA N N 2 ? OA N N 2 ? PA N N 2 ? QA N N 2 ? RA N N 2 ? SA N N 2 ? TA N N 2 ? UA N N 2 ? VA N N 2 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The biological assembly is a protein cage with tetrahedral point group symmetry that comprises twenty-four subunits, where twelve each are a total of four homotrimers. ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP A 13 ? VAL A 31 ? ASP x 13 VAL x 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P2 2 SER A 72 ? CYS A 89 ? SER x 72 CYS x 89 1 ? 18 HELX_P HELX_P3 3 VAL A 92 ? ASP A 94 ? VAL x 92 ASP x 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 4 ASP B 13 ? VAL B 31 ? ASP z 13 VAL z 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P5 5 SER B 72 ? GLY B 90 ? SER z 72 GLY z 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 6 VAL B 92 ? ASP B 94 ? VAL z 92 ASP z 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 7 ASP C 13 ? VAL C 31 ? ASP 1 13 VAL 1 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P8 8 SER C 72 ? GLY C 90 ? SER 1 72 GLY 1 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P9 9 VAL C 92 ? ASP C 94 ? VAL 1 92 ASP 1 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P10 10 ASP D 13 ? VAL D 31 ? ASP 3 13 VAL 3 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P11 11 SER D 72 ? GLY D 90 ? SER 3 72 GLY 3 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 12 VAL D 92 ? ASP D 94 ? VAL 3 92 ASP 3 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 13 ASP E 13 ? VAL E 31 ? ASP 5 13 VAL 5 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P14 14 SER E 72 ? GLY E 90 ? SER 5 72 GLY 5 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P15 15 VAL E 92 ? ASP E 94 ? VAL 5 92 ASP 5 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 16 ASP F 13 ? VAL F 31 ? ASP 7 13 VAL 7 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P17 17 SER F 72 ? GLY F 90 ? SER 7 72 GLY 7 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P18 18 VAL F 92 ? ASP F 94 ? 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VAL H 92 ASP H 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P34 34 ASP L 13 ? VAL L 31 ? ASP J 13 VAL J 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P35 35 SER L 72 ? GLY L 90 ? SER J 72 GLY J 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P36 36 VAL L 92 ? ASP L 94 ? VAL J 92 ASP J 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 37 ASP M 13 ? VAL M 31 ? ASP L 13 VAL L 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 38 SER M 72 ? GLY M 90 ? SER L 72 GLY L 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P39 39 VAL M 92 ? ASP M 94 ? VAL L 92 ASP L 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P40 40 ASP N 13 ? VAL N 31 ? ASP N 13 VAL N 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P41 41 SER N 72 ? GLY N 90 ? SER N 72 GLY N 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P42 42 VAL N 92 ? ASP N 94 ? VAL N 92 ASP N 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P43 43 ASP O 13 ? VAL O 31 ? ASP P 13 VAL P 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P44 44 SER O 72 ? GLY O 90 ? SER P 72 GLY P 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P45 45 VAL O 92 ? ASP O 94 ? VAL P 92 ASP P 94 5 ? 3 HELX_P HELX_P46 46 ASP P 13 ? VAL P 31 ? ASP R 13 VAL R 31 1 ? 19 HELX_P HELX_P47 47 SER P 72 ? GLY P 90 ? SER R 72 GLY R 90 1 ? 19 HELX_P HELX_P48 48 VAL P 92 ? ASP P 94 ? 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1 MORE -487 ? 1 'SSA (A^2)' 116490 ? 2 'ABSA (A^2)' 56230 ? 2 MORE -490 ? 2 'SSA (A^2)' 116470 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2014-05-28 2 'Structure model' 1 1 2014-06-11 3 'Structure model' 1 2 2014-12-10 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 3 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Database references' 2 3 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_refine_tls.pdbx_refine_id _pdbx_refine_tls.id _pdbx_refine_tls.details _pdbx_refine_tls.method _pdbx_refine_tls.origin_x _pdbx_refine_tls.origin_y _pdbx_refine_tls.origin_z _pdbx_refine_tls.T[1][1] _pdbx_refine_tls.T[2][2] _pdbx_refine_tls.T[3][3] _pdbx_refine_tls.T[1][2] _pdbx_refine_tls.T[1][3] _pdbx_refine_tls.T[2][3] _pdbx_refine_tls.L[1][1] _pdbx_refine_tls.L[2][2] _pdbx_refine_tls.L[3][3] _pdbx_refine_tls.L[1][2] _pdbx_refine_tls.L[1][3] _pdbx_refine_tls.L[2][3] _pdbx_refine_tls.S[1][1] _pdbx_refine_tls.S[1][2] _pdbx_refine_tls.S[1][3] _pdbx_refine_tls.S[2][1] _pdbx_refine_tls.S[2][2] _pdbx_refine_tls.S[2][3] _pdbx_refine_tls.S[3][1] _pdbx_refine_tls.S[3][2] _pdbx_refine_tls.S[3][3] 'X-RAY DIFFRACTION' 1 ? 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