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'complete structure' # _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.entry_id 1WE3 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2004-05-23 _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_sf OBS _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Shimamura, T.' 1 'Koike-Takeshita, A.' 2 'Yokoyama, K.' 3 'Masui, R.' 4 'Murai, N.' 5 'Yoshida, M.' 6 'Taguchi, H.' 7 'Iwata, S.' 8 # _citation.id primary _citation.title 'Crystal structure of the native chaperonin complex from Thermus thermophilus revealed unexpected asymmetry at the cis-cavity' _citation.journal_abbrev STRUCTURE _citation.journal_volume 12 _citation.page_first 1471 _citation.page_last 1480 _citation.year 2004 _citation.journal_id_ASTM STRUE6 _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0969-2126 _citation.journal_id_CSD 2005 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 15296740 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.str.2004.05.020 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Shimamura, T.' 1 primary 'Koike-Takeshita, A.' 2 primary 'Yokoyama, K.' 3 primary 'Masui, R.' 4 primary 'Murai, N.' 5 primary 'Yoshida, M.' 6 primary 'Taguchi, H.' 7 primary 'Iwata, S.' 8 # _cell.entry_id 1WE3 _cell.length_a 140.378 _cell.length_b 156.424 _cell.length_c 273.153 _cell.angle_alpha 82.88 _cell.angle_beta 85.35 _cell.angle_gamma 68.52 _cell.Z_PDB 14 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1WE3 _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description 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;AAEVKTVIKPLGDRVVVKRIEEEPKTKGGIVLPDTAKEKPQKGKVIAVGTGRVLENGQRVPLEVKEGDIVVFAKYGGTEI EIDGEEYVILSERDLLAVLQ ; ;AAEVKTVIKPLGDRVVVKRIEEEPKTKGGIVLPDTAKEKPQKGKVIAVGTGRVLENGQRVPLEVKEGDIVVFAKYGGTEI EIDGEEYVILSERDLLAVLQ ; O,P,Q,R,S,T,U ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 LYS n 1 4 ILE n 1 5 LEU n 1 6 VAL n 1 7 PHE n 1 8 ASP n 1 9 GLU n 1 10 ALA n 1 11 ALA n 1 12 ARG n 1 13 ARG n 1 14 ALA n 1 15 LEU n 1 16 GLU n 1 17 ARG n 1 18 GLY n 1 19 VAL n 1 20 ASN n 1 21 ALA n 1 22 VAL n 1 23 ALA n 1 24 ASN n 1 25 ALA n 1 26 VAL n 1 27 LYS n 1 28 VAL n 1 29 THR n 1 30 LEU n 1 31 GLY n 1 32 PRO n 1 33 ARG n 1 34 GLY n 1 35 ARG n 1 36 ASN n 1 37 VAL n 1 38 VAL n 1 39 LEU n 1 40 GLU n 1 41 LYS n 1 42 LYS n 1 43 PHE n 1 44 GLY n 1 45 SER n 1 46 PRO n 1 47 THR n 1 48 ILE n 1 49 THR n 1 50 LYS n 1 51 ASP n 1 52 GLY n 1 53 VAL n 1 54 THR n 1 55 VAL n 1 56 ALA n 1 57 LYS n 1 58 GLU n 1 59 VAL n 1 60 GLU n 1 61 LEU n 1 62 GLU 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'Thermus thermophilus' 274 Thermus ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 274 Thermus ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code 1 UNP CH60_THET2 P61490 1 1 ? ? 2 UNP CH10_THET2 P61492 2 1 ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1WE3 A 1 ? 543 ? 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C MG 3550 C ADP 3551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc11 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 D ASP 86 OD1 ? ? D MG 4550 D ASP 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc12 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 CA ADP . O2A ? ? D MG 4550 D ADP 4551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc13 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 CA ADP . O1B ? ? D MG 4550 D ADP 4551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc14 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ADP . O2A ? ? E MG 5550 E ADP 5551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc15 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 E ASP 86 OD1 ? ? E MG 5550 E ASP 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc16 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 EA ADP . O1B ? ? E MG 5550 E ADP 5551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc17 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 GA ADP . O2A ? ? F MG 6550 F ADP 6551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc18 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 F ASP 86 OD1 ? ? F MG 6550 F ASP 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc19 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 GA ADP . O1B ? ? F MG 6550 F ADP 6551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc20 metalc ? ? HA MG . MG ? ? ? 1_555 G ASP 86 OD1 ? ? G MG 7550 G ASP 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.230 ? metalc21 metalc ? ? HA MG . MG ? ? ? 1_555 IA ADP . O1B ? ? G MG 7550 G ADP 7551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? metalc22 metalc ? ? HA MG . MG ? ? ? 1_555 IA ADP . O2A ? ? G MG 7550 G ADP 7551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 4 ? C ? 3 ? D ? 6 ? E ? 2 ? F ? 2 ? G ? 4 ? H ? 3 ? I ? 6 ? J ? 2 ? K ? 2 ? L ? 4 ? M ? 3 ? N ? 6 ? O ? 2 ? P ? 2 ? Q ? 4 ? R ? 3 ? S ? 4 ? T ? 6 ? U ? 2 ? V ? 2 ? W ? 4 ? X ? 3 ? Y ? 3 ? Z ? 4 ? AA ? 2 ? AB ? 2 ? AC ? 2 ? AD ? 4 ? AE ? 3 ? AF ? 6 ? AG ? 2 ? AH ? 2 ? AI ? 3 ? AJ ? 3 ? AK ? 4 ? AL ? 4 ? AM ? 2 ? AN ? 2 ? AO ? 4 ? AP ? 4 ? AQ ? 3 ? AR ? 6 ? AS ? 2 ? AT ? 2 ? AU ? 4 ? AV ? 3 ? AW ? 6 ? AX ? 2 ? AY ? 2 ? AZ ? 4 ? BA ? 3 ? BB ? 6 ? BC ? 2 ? BD ? 2 ? BE ? 4 ? BF ? 3 ? BG ? 6 ? BH ? 2 ? BI ? 2 ? BJ ? 4 ? BK ? 3 ? BL ? 6 ? BM ? 2 ? BN ? 2 ? BO ? 4 ? BP ? 3 ? BQ ? 6 ? BR ? 2 ? BS ? 2 ? BT ? 3 ? BU ? 6 ? BV ? 2 ? BW ? 2 ? BX ? 7 ? BY ? 7 ? BZ ? 2 ? CA ? 7 ? CB ? 2 ? CC ? 7 ? CD ? 2 ? CE ? 5 ? CF ? 2 ? CG ? 2 ? CH ? 7 ? CI ? 2 ? CJ ? 7 ? CK ? 2 ? CL ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? parallel A 3 4 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? parallel C 2 3 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? parallel D 5 6 ? parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? parallel G 3 4 ? anti-parallel H 1 2 ? parallel H 2 3 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel I 3 4 ? anti-parallel I 4 5 ? parallel I 5 6 ? parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? parallel L 3 4 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel N 4 5 ? parallel N 5 6 ? parallel O 1 2 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? parallel R 2 3 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel S 3 4 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel T 2 3 ? anti-parallel T 3 4 ? anti-parallel T 4 5 ? parallel T 5 6 ? parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel W 2 3 ? parallel W 3 4 ? anti-parallel X 1 2 ? parallel X 2 3 ? anti-parallel Y 1 2 ? anti-parallel Y 2 3 ? anti-parallel Z 1 2 ? parallel Z 2 3 ? parallel Z 3 4 ? anti-parallel AA 1 2 ? parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AD 1 2 ? anti-parallel AD 2 3 ? parallel AD 3 4 ? anti-parallel AE 1 2 ? parallel AE 2 3 ? anti-parallel AF 1 2 ? anti-parallel AF 2 3 ? anti-parallel AF 3 4 ? anti-parallel AF 4 5 ? parallel AF 5 6 ? parallel AG 1 2 ? anti-parallel AH 1 2 ? anti-parallel AI 1 2 ? parallel AI 2 3 ? anti-parallel AJ 1 2 ? anti-parallel AJ 2 3 ? anti-parallel AK 1 2 ? parallel AK 2 3 ? parallel AK 3 4 ? parallel AL 1 2 ? parallel AL 2 3 ? parallel AL 3 4 ? anti-parallel AM 1 2 ? anti-parallel AN 1 2 ? anti-parallel AO 1 2 ? anti-parallel AO 2 3 ? parallel AO 3 4 ? anti-parallel AP 1 2 ? anti-parallel AP 2 3 ? parallel AP 3 4 ? anti-parallel AQ 1 2 ? parallel AQ 2 3 ? anti-parallel AR 1 2 ? anti-parallel AR 2 3 ? anti-parallel AR 3 4 ? anti-parallel AR 4 5 ? parallel AR 5 6 ? parallel AS 1 2 ? anti-parallel AT 1 2 ? anti-parallel AU 1 2 ? anti-parallel AU 2 3 ? parallel AU 3 4 ? anti-parallel AV 1 2 ? parallel AV 2 3 ? anti-parallel AW 1 2 ? anti-parallel AW 2 3 ? anti-parallel AW 3 4 ? anti-parallel AW 4 5 ? parallel AW 5 6 ? parallel AX 1 2 ? anti-parallel AY 1 2 ? anti-parallel AZ 1 2 ? anti-parallel AZ 2 3 ? parallel AZ 3 4 ? anti-parallel BA 1 2 ? parallel BA 2 3 ? anti-parallel BB 1 2 ? anti-parallel BB 2 3 ? anti-parallel BB 3 4 ? anti-parallel BB 4 5 ? parallel BB 5 6 ? parallel BC 1 2 ? anti-parallel BD 1 2 ? anti-parallel BE 1 2 ? anti-parallel BE 2 3 ? parallel BE 3 4 ? anti-parallel BF 1 2 ? parallel BF 2 3 ? anti-parallel BG 1 2 ? anti-parallel BG 2 3 ? anti-parallel BG 3 4 ? anti-parallel BG 4 5 ? parallel BG 5 6 ? parallel BH 1 2 ? anti-parallel BI 1 2 ? anti-parallel BJ 1 2 ? anti-parallel BJ 2 3 ? parallel BJ 3 4 ? anti-parallel BK 1 2 ? parallel BK 2 3 ? anti-parallel BL 1 2 ? anti-parallel BL 2 3 ? anti-parallel BL 3 4 ? anti-parallel BL 4 5 ? parallel BL 5 6 ? parallel BM 1 2 ? anti-parallel BN 1 2 ? anti-parallel BO 1 2 ? anti-parallel BO 2 3 ? parallel BO 3 4 ? anti-parallel BP 1 2 ? parallel BP 2 3 ? anti-parallel BQ 1 2 ? anti-parallel BQ 2 3 ? anti-parallel BQ 3 4 ? anti-parallel BQ 4 5 ? parallel BQ 5 6 ? parallel BR 1 2 ? anti-parallel BS 1 2 ? anti-parallel BT 1 2 ? parallel BT 2 3 ? anti-parallel BU 1 2 ? anti-parallel BU 2 3 ? anti-parallel BU 3 4 ? anti-parallel BU 4 5 ? parallel BU 5 6 ? parallel BV 1 2 ? anti-parallel BW 1 2 ? anti-parallel BX 1 2 ? anti-parallel BX 2 3 ? anti-parallel BX 3 4 ? anti-parallel BX 4 5 ? anti-parallel BX 5 6 ? anti-parallel BX 6 7 ? anti-parallel BY 1 2 ? anti-parallel BY 2 3 ? anti-parallel BY 3 4 ? anti-parallel BY 4 5 ? anti-parallel BY 5 6 ? anti-parallel BY 6 7 ? anti-parallel BZ 1 2 ? anti-parallel CA 1 2 ? anti-parallel CA 2 3 ? anti-parallel CA 3 4 ? anti-parallel CA 4 5 ? anti-parallel CA 5 6 ? anti-parallel CA 6 7 ? anti-parallel CB 1 2 ? anti-parallel CC 1 2 ? anti-parallel CC 2 3 ? anti-parallel CC 3 4 ? anti-parallel CC 4 5 ? anti-parallel CC 5 6 ? anti-parallel CC 6 7 ? anti-parallel CD 1 2 ? anti-parallel CE 1 2 ? anti-parallel CE 2 3 ? anti-parallel CE 3 4 ? anti-parallel CE 4 5 ? anti-parallel CF 1 2 ? anti-parallel CG 1 2 ? anti-parallel CH 1 2 ? anti-parallel CH 2 3 ? anti-parallel CH 3 4 ? anti-parallel CH 4 5 ? anti-parallel CH 5 6 ? anti-parallel CH 6 7 ? anti-parallel CI 1 2 ? anti-parallel CJ 1 2 ? anti-parallel CJ 2 3 ? anti-parallel CJ 3 4 ? anti-parallel CJ 4 5 ? anti-parallel CJ 5 6 ? anti-parallel CJ 6 7 ? anti-parallel CK 1 2 ? anti-parallel CL 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 LYS A 3 ? PHE A 7 ? LYS A 4 PHE A 8 A 2 THR A 518 ? GLU A 524 ? THR A 519 GLU A 525 A 3 ASN B 36 ? LEU B 39 ? ASN B 37 LEU B 40 A 4 THR B 47 ? THR B 49 ? THR B 48 THR B 50 B 1 THR A 47 ? THR A 49 ? THR A 48 THR A 50 B 2 ASN A 36 ? LEU A 39 ? ASN A 37 LEU A 40 B 3 THR G 518 ? GLU G 524 ? THR G 519 GLU G 525 B 4 LYS G 3 ? PHE G 7 ? LYS G 4 PHE G 8 C 1 ILE A 172 ? GLU A 177 ? ILE A 173 GLU A 178 C 2 VAL A 374 ? VAL A 379 ? VAL A 375 VAL A 380 C 3 GLU A 184 ? VAL A 188 ? GLU A 185 VAL A 189 D 1 TYR A 191 ? PHE A 193 ? TYR A 192 PHE A 194 D 2 THR A 328 ? GLY A 333 ? THR A 329 GLY A 334 D 3 GLY A 316 ? ILE A 323 ? GLY A 317 ILE A 324 D 4 LEU A 213 ? VAL A 221 ? LEU A 214 VAL A 222 D 5 LEU A 245 ? ALA A 249 ? LEU A 246 ALA A 250 D 6 VAL A 271 ? LYS A 275 ? VAL A 272 LYS A 276 E 1 ILE A 409 ? PRO A 411 ? ILE A 410 PRO A 412 E 2 VAL A 495 ? PRO A 497 ? VAL A 496 PRO A 498 F 1 TYR A 477 ? PHE A 479 ? TYR A 478 PHE A 480 F 2 PHE A 486 ? ASP A 488 ? PHE A 487 ASP A 489 G 1 LYS B 3 ? PHE B 7 ? LYS B 4 PHE B 8 G 2 THR B 518 ? GLU B 524 ? THR B 519 GLU B 525 G 3 ASN C 36 ? LEU C 39 ? ASN C 37 LEU C 40 G 4 THR C 47 ? THR C 49 ? THR C 48 THR C 50 H 1 ILE B 172 ? GLU B 177 ? ILE B 173 GLU B 178 H 2 VAL B 374 ? VAL B 379 ? VAL B 375 VAL B 380 H 3 GLU B 184 ? VAL B 188 ? GLU B 185 VAL B 189 I 1 TYR B 191 ? PHE B 193 ? TYR B 192 PHE B 194 I 2 GLU B 327 ? GLY B 333 ? GLU B 328 GLY B 334 I 3 GLY B 316 ? THR B 324 ? GLY B 317 THR B 325 I 4 VAL B 212 ? VAL B 221 ? VAL B 213 VAL B 222 I 5 LEU B 245 ? ALA B 249 ? LEU B 246 ALA B 250 I 6 VAL B 271 ? LYS B 275 ? VAL B 272 LYS B 276 J 1 ILE B 409 ? PRO B 411 ? ILE B 410 PRO B 412 J 2 VAL B 495 ? PRO B 497 ? VAL B 496 PRO B 498 K 1 TYR B 477 ? PHE B 479 ? TYR B 478 PHE B 480 K 2 PHE B 486 ? ASP B 488 ? PHE B 487 ASP B 489 L 1 LYS C 3 ? PHE C 7 ? LYS C 4 PHE C 8 L 2 THR C 518 ? GLU C 524 ? THR C 519 GLU C 525 L 3 ASN D 36 ? LEU D 39 ? ASN D 37 LEU D 40 L 4 THR D 47 ? THR D 49 ? THR D 48 THR D 50 M 1 ILE C 172 ? GLU C 177 ? 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