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IT HAS A BAD PHI/PSI ANGLE, AND SHOULD BE IGNORED. ; _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 13488 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 50 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 13538 _refine_hist.d_res_high 2.8 _refine_hist.d_res_low 6.0 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function x_bond_d 0.018 ? ? ? 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GLU A 572 LYS A 574 5 ? 3 HELX_P HELX_P31 31 GLN A 615 ? ASN A 635 F GLN A 576 ASN A 592 1 ? 21 HELX_P HELX_P32 32 ILE A 639 J LYS A 645 ? ILE A 592 LYS A 597 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 33 TYR A 662 ? VAL A 678 ? TYR A 614 VAL A 630 1 ? 17 HELX_P HELX_P34 34 GLU A 682 ? ILE A 684 ? GLU A 634 ILE A 636 5 ? 3 HELX_P HELX_P35 35 VAL A 698 ? ALA A 707 ? VAL A 650 ALA A 659 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 36 THR A 724 ? ASN A 732 ? THR A 676 ASN A 684 1 ? 9 HELX_P HELX_P37 37 GLY A 742 ? ILE A 751 ? GLY A 694 ILE A 703 5 ? 10 HELX_P HELX_P38 38 GLU A 753 ? ASN A 755 ? GLU A 705 ASN A 707 5 ? 3 HELX_P HELX_P39 39 GLU A 764 ? TYR A 775 ? GLU A 716 TYR A 730 1 ? 12 HELX_P HELX_P40 40 SER A 782 C ILE A 791 ? SER A 736 ILE A 745 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 41 PRO A 798 ? ASN A 800 ? PRO A 752 ASN A 754 5 ? 3 HELX_P HELX_P42 42 LYS A 805 ? TYR A 813 C LYS A 759 TYR A 766 1 ? 9 HELX_P HELX_P43 43 VAL A 820 ? ASN A 840 ? VAL A 773 ASN A 793 1 ? 21 HELX_P HELX_P44 44 ARG A 842 ? PHE A 859 ? ARG A 795 PHE A 811 1 ? 18 HELX_P HELX_P45 45 SER A 861 ? THR A 871 ? SER A 813 THR A 823 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 45 PRO B 12 N MET B 21 ? PRO B 6 MET B 4 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 47 LEU B 24 ? HIS B 33 ? LEU B 7 HIS B 16 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 48 ALA B 41 ? GLU B 53 ? ALA B 24 GLU B 36 1 ? 13 HELX_P HELX_P49 49 LEU B 60 ? ASN B 62 ? LEU B 43 ASN B 45 5 ? 3 HELX_P HELX_P50 50 ASP B 65 ? ARG B 94 ? ASP B 48 ARG B 77 1 ? 30 HELX_P HELX_P51 51 ALA B 111 ? ILE B 117 ? ALA B 94 ILE B 100 1 ? 7 HELX_P HELX_P52 52 ARG B 135 G LEU B 145 ? ARG B 113 LEU B 115 1 ? 11 HELX_P HELX_P53 53 LEU B 149 ? GLN B 155 ? LEU B 119 GLN B 125 1 ? 7 HELX_P HELX_P54 54 GLY B 165 ? THR B 179 ? GLY B 135 THR B 149 1 ? 15 HELX_P HELX_P55 55 LEU B 290 ? ASN B 294 ? LEU B 254 ASN B 258 1 ? 5 HELX_P HELX_P56 56 TYR B 298 ? ALA B 313 ? TYR B 262 ALA B 277 1 ? 16 HELX_P HELX_P57 57 ALA B 322 ? SER B 350 ? ALA B 286 SER B 314 1 ? 29 HELX_P HELX_P58 58 TRP B 354 ? GLN B 360 ? 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SER B 813 THR B 823 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale ? ? E PLP . C4A ? ? ? 1_555 A LYS 728 NZ ? ? A PLP 860 A LYS 680 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale2 covale ? ? H PLP . C4A ? ? ? 1_555 B LYS 728 NZ ? ? B PLP 860 B LYS 680 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 9 ? B ? 2 ? C ? 2 ? D ? 2 ? E ? 3 ? F ? 3 ? G ? 9 ? H ? 2 ? I ? 2 ? J ? 2 ? K ? 3 ? L ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? parallel A 4 5 ? parallel A 5 6 ? parallel A 6 7 ? parallel A 7 8 ? parallel A 8 9 ? parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? parallel E 2 3 ? parallel F 1 2 ? parallel F 2 3 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? parallel G 4 5 ? parallel G 5 6 ? parallel G 6 7 ? parallel G 7 8 ? parallel G 8 9 ? parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel K 1 2 ? parallel K 2 3 ? parallel L 1 2 ? parallel L 2 3 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLU A 220 ? PHE A 232 ? GLU A 190 PHE A 202 A 2 GLU A 255 ? PRO A 267 ? GLU A 219 PRO A 231 A 3 VAL A 274 ? PRO A 284 ? VAL A 238 PRO A 248 A 4 ALA A 184 ? LEU A 189 ? ALA A 154 LEU A 159 A 5 ARG A 98 ? LEU A 102 ? ARG A 81 LEU A 85 A 6 VAL A 361 ? ASN A 366 ? VAL A 333 ASN A 338 A 7 PHE A 400 ? ASN A 404 ? PHE A 372 ASN A 376 A 8 VAL A 481 ? GLY A 483 ? VAL A 452 GLY A 454 A 9 PHE A 509 ? ASN A 511 ? PHE A 479 ASN A 481 B 1 ALA A 197 ? ILE A 201 ? ALA A 167 ILE A 171 B 2 TYR A 204 ? THR A 208 ? TYR A 174 THR A 178 C 1 TYR A 235 ? ASP A 237 ? TYR A 205 ASP A 207 C 2 GLN A 250 H ILE A 252 ? GLN A 214 ILE A 216 D 1 LYS A 414 ? PRO A 416 ? LYS A 386 PRO A 388 D 2 GLN A 467 ? ARG A 469 ? GLN A 439 ARG A 440 E 1 LEU A 601 ? VAL A 606 ? LEU A 562 VAL A 567 E 2 LYS A 649 ? GLY A 654 ? LYS A 601 GLY A 606 E 3 LEU A 688 ? VAL A 693 ? LEU A 640 VAL A 645 F 1 LEU A 710 ? HIS A 713 ? LEU A 662 HIS A 665 F 2 LEU A 735 ? THR A 739 ? LEU A 687 THR A 691 F 3 PHE A 757 ? PHE A 759 ? PHE A 709 PHE A 711 G 1 GLU B 220 ? PHE B 232 ? GLU B 190 PHE B 202 G 2 GLU B 255 ? PRO B 267 ? GLU B 219 PRO B 231 G 3 VAL B 274 ? PRO B 284 ? VAL B 238 PRO B 248 G 4 ALA B 184 ? LEU B 189 ? ALA B 154 LEU B 159 G 5 ARG B 98 ? LEU B 102 ? ARG B 81 LEU B 85 G 6 VAL B 361 ? ASN B 366 ? VAL B 333 ASN B 338 G 7 PHE B 400 ? ASN B 404 ? PHE B 372 ASN B 376 G 8 VAL B 481 ? GLY B 483 ? VAL B 452 GLY B 454 G 9 PHE B 509 ? ASN B 511 ? PHE B 479 ASN B 481 H 1 ALA B 197 ? ILE B 201 ? ALA B 167 ILE B 171 H 2 TYR B 204 ? THR B 208 ? TYR B 174 THR B 178 I 1 TYR B 235 ? ASP B 237 ? TYR B 205 ASP B 207 I 2 GLN B 250 H ILE B 252 ? GLN B 214 ILE B 216 J 1 LYS B 414 ? PRO B 416 ? LYS B 386 PRO B 388 J 2 GLN B 467 ? ARG B 469 ? GLN B 439 ARG B 440 K 1 LEU B 601 ? VAL B 606 ? LEU B 562 VAL B 567 K 2 LYS B 649 ? GLY B 654 ? LYS B 601 GLY B 606 K 3 LEU B 688 ? VAL B 693 ? LEU B 640 VAL B 645 L 1 LEU B 710 ? HIS B 713 ? LEU B 662 HIS B 665 L 2 LEU B 735 ? THR B 739 ? LEU B 687 THR B 691 L 3 PHE B 757 ? PHE B 759 ? PHE B 709 PHE B 711 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 O ILE A 221 ? O ILE A 191 N ASP A 263 ? N ASP A 227 A 2 3 O LEU A 258 ? O LEU A 222 N ARG A 283 ? N ARG A 247 A 3 4 O ASN A 276 ? O ASN A 240 N GLY A 186 ? N GLY A 156 A 4 5 O TRP A 185 ? O TRP A 155 N VAL A 99 ? N VAL A 82 A 5 6 O ARG A 98 ? O ARG A 81 N ALA A 362 ? N ALA A 334 A 6 7 O ILE A 363 ? O ILE A 335 N ALA A 401 ? N ALA A 373 A 7 8 O TYR A 402 ? O TYR A 374 N ASN A 482 ? N ASN A 453 A 8 9 O VAL A 481 ? O VAL A 452 N VAL A 510 ? N VAL A 480 B 1 2 O ALA A 197 ? O ALA A 167 N THR A 208 ? N THR A 178 C 1 2 O TYR A 235 ? O TYR A 205 N ILE A 252 ? N ILE A 216 D 1 2 O TRP A 415 ? O TRP A 387 N ILE A 468 C N ILE A 439 E 1 2 O LEU A 601 ? O LEU A 562 N VAL A 650 ? N VAL A 602 E 2 3 O LYS A 649 ? O LYS A 601 N LYS A 689 ? N LYS A 641 F 1 2 O SER A 711 ? O SER A 663 N LEU A 735 ? N LEU A 687 F 2 3 O GLY A 738 ? O GLY A 690 N PHE A 757 ? N PHE A 709 G 1 2 O ILE B 221 ? O ILE B 191 N ASP B 263 ? N ASP B 227 G 2 3 O LEU B 258 ? O LEU B 222 N ARG B 283 ? N ARG B 247 G 3 4 O ASN B 276 ? O ASN B 240 N GLY B 186 ? N GLY B 156 G 4 5 O TRP B 185 ? O TRP B 155 N VAL B 99 ? N VAL B 82 G 5 6 O ARG B 98 ? O ARG B 81 N ALA B 362 ? N ALA B 334 G 6 7 O ILE B 363 ? O ILE B 335 N ALA B 401 ? N ALA B 373 G 7 8 O TYR B 402 ? O TYR B 374 N ASN B 482 ? N ASN B 453 G 8 9 O VAL B 481 ? O VAL B 452 N VAL B 510 ? N VAL B 480 H 1 2 O ALA B 197 ? O ALA B 167 N THR B 208 ? N THR B 178 I 1 2 O TYR B 235 ? O TYR B 205 N ILE B 252 ? N ILE B 216 J 1 2 O TRP B 415 ? O TRP B 387 N ILE B 468 C N ILE B 439 K 1 2 O LEU B 601 ? O LEU B 562 N VAL B 650 ? N VAL B 602 K 2 3 O LYS B 649 ? O LYS B 601 N LYS B 689 ? N LYS B 641 L 1 2 O SER B 711 ? O SER B 663 N LEU B 735 ? N LEU B 687 L 2 3 O GLY B 738 ? O GLY B 690 N PHE B 757 ? N PHE B 709 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 A 859' AC2 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 A 1900' AC3 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 B 859' AC4 Software ? ? ? ? 6 'BINDING SITE FOR RESIDUE PO4 B 1900' AC5 Software ? ? ? ? 7 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP A 860' AC6 Software ? ? ? ? 8 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP B 860' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 4 THR A 8 N THR A 10 . ? 1_555 ? 2 AC1 4 ARG A 345 ? 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THE LONGER N-TERMINAL TAIL RESIDUES OF THE YEAST ENZYME ARE NUMBERED 1N TO 39N TOWARDS THE N-TERMINUS. INSERTION RESIDUES RELATIVE TO THE MAMMALIAN ENZYME ARE NUMBERED AS THE PRECEDING RESIDUE NUMBER FOLLOWED BY AN ALPHABETIC CHARACTER, STARTING WITH C. DISCONTINUITY IN THE NUMBERING (BETWEEN 315 AND 324, 722 AND 726) INDICATES THAT THERE ARE GAPS IN THOSE REGIONS RELATIVE TO THE MAMMALIAN ENZYME. OTHER DISCONTINUITY IN NUMBERING OF RESIDUES INDICATES THAT THOSE MISSING RESIDUES ARE DISORDERED IN THE STRUCTURE. ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 CZ A ARG 60 ? ? O B THR 38 ? ? 0.25 2 1 CG A ASP 61 ? ? CG2 B THR 37 ? ? 0.50 3 1 O A LEU 115 ? ? CE2 B TRP 13 ? ? 0.50 4 1 O A THR 38 ? ? NH1 B ARG 60 ? ? 0.53 5 1 OH A TYR 181 ? ? CB B GLU 251 ? ? 0.53 6 1 OE2 A GLU 251 ? ? 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