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C4 A G 9 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1ZIH 'double helix' 1ZIH 'a-form double helix' 1ZIH tetraloop 1ZIH 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A U 12 1_555 -2.704 -0.737 0.211 10.913 -6.709 -1.802 1 A_G1:U12_A A 1 ? A 12 ? 28 ? 1 A G 2 1_555 A C 11 1_555 -0.178 -0.336 0.371 -1.228 -9.471 -2.760 2 A_G2:C11_A A 2 ? A 11 ? 19 1 1 A G 3 1_555 A C 10 1_555 -0.235 -0.361 0.264 -4.736 -19.638 -5.639 3 A_G3:C10_A A 3 ? A 10 ? 19 1 1 A C 4 1_555 A G 9 1_555 0.493 -0.386 -0.270 8.189 -14.428 -0.747 4 A_C4:G9_A A 4 ? A 9 ? 19 1 1 A G 5 1_555 A A 8 1_555 6.882 -6.052 0.088 23.117 -10.052 -29.999 5 A_G5:A8_A A 5 ? A 8 ? ? ? # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 1 1_555 A U 12 1_555 A G 2 1_555 A C 11 1_555 -0.315 -1.768 3.396 -1.704 0.550 40.334 -2.626 0.257 3.383 0.797 2.470 40.372 1 AA_G1G2:C11U12_AA A 1 ? A 12 ? A 2 ? A 11 ? 1 A G 2 1_555 A C 11 1_555 A G 3 1_555 A C 10 1_555 -1.006 -1.527 3.185 2.611 0.597 33.594 -2.727 2.142 3.074 1.031 -4.509 33.697 2 AA_G2G3:C10C11_AA A 2 ? A 11 ? A 3 ? A 10 ? 1 A G 3 1_555 A C 10 1_555 A C 4 1_555 A G 9 1_555 0.254 -0.858 2.958 2.300 -2.105 39.836 -1.034 -0.130 3.008 -3.084 -3.369 39.953 3 AA_G3C4:G9C10_AA A 3 ? A 10 ? A 4 ? A 9 ? 1 A C 4 1_555 A G 9 1_555 A G 5 1_555 A A 8 1_555 -2.284 -0.602 3.006 -8.512 1.795 62.991 -0.648 1.812 3.242 1.709 8.105 63.527 4 AA_C4G5:A8G9_AA A 4 ? A 9 ? A 5 ? A 8 ? #