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WWPDB D_1000009518 ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1CS2 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 1999-08-16 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Leporc, S.' 1 'Mauffret, O.' 2 'Tevanian, G.' 3 'Lescot, E.' 4 'Monnot, M.' 5 'Fermandjian, S.' 6 # _citation.id primary _citation.title ;An NMR and molecular modelling analysis of d(CTACTGCTTTAG). d(CTAAAGCAGTAG) reveals that the particular behaviour of TpA steps is related to edge-to-edge contacts of their base-pairs in the major groove ; _citation.journal_abbrev 'Nucleic Acids Res.' _citation.journal_volume 27 _citation.page_first 4759 _citation.page_last 4767 _citation.year 1999 _citation.journal_id_ASTM NARHAD _citation.country UK _citation.journal_id_ISSN 0305-1048 _citation.journal_id_CSD 0389 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 10572176 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1093/nar/27.24.4759 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Leporc, S.' 1 ? primary 'Mauffret, O.' 2 ? primary 'Tevanian, G.' 3 ? primary 'Lescot, E.' 4 ? primary 'Monnot, M.' 5 ? primary 'Fermandjian, S.' 6 ? # _cell.entry_id 1CS2 _cell.length_a 1.000 _cell.length_b 1.000 _cell.length_c 1.000 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1CS2 _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-d(*CP*TP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*TP*AP*G)-3'" 3628.377 1 ? ? ? ? 2 polymer syn "5'-d(*CP*TP*AP*AP*AP*GP*CP*AP*GP*TP*AP*G)-3'" 3695.443 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no '(DC)(DT)(DA)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DT)(DT)(DA)(DG)' CTACTGCTTTAG A ? 2 polydeoxyribonucleotide no no '(DC)(DT)(DA)(DA)(DA)(DG)(DC)(DA)(DG)(DT)(DA)(DG)' CTAAAGCAGTAG B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DT n 1 3 DA n 1 4 DC n 1 5 DT n 1 6 DG n 1 7 DC n 1 8 DT n 1 9 DT n 1 10 DT n 1 11 DA n 1 12 DG n 2 1 DC n 2 2 DT n 2 3 DA n 2 4 DA n 2 5 DA n 2 6 DG n 2 7 DC n 2 8 DA n 2 9 DG n 2 10 DT n 2 11 DA n 2 12 DG n # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 1 PDB 1CS2 1CS2 ? ? ? 2 2 PDB 1CS2 1CS2 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1CS2 A 1 ? 12 ? 1CS2 1 ? 12 ? 1 12 2 2 1CS2 B 1 ? 12 ? 1CS2 13 ? 24 ? 13 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.solution_id 1 1 '2D NOESY' 1 2 1 P-COSY 1 3 1 '2D_31P/1H HETEROTOCSY' 1 4 2 '2D NOESY' 2 # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 308 AMBIENT 6.9 0.1 ? K 2 283 AMBIENT 6.9 0.1 ? 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N1 B DC 13 ? ? 111.32 108.30 3.02 0.30 N 38 2 "O4'" B DT 14 ? ? "C1'" B DT 14 ? ? N1 B DT 14 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 39 2 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 40 2 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 111.66 108.30 3.36 0.30 N 41 2 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 42 2 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 43 2 "O4'" B DC 19 ? ? "C1'" B DC 19 ? ? N1 B DC 19 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 44 2 "O4'" B DA 20 ? ? "C1'" B DA 20 ? ? N9 B DA 20 ? ? 111.44 108.30 3.14 0.30 N 45 2 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 46 2 "O4'" B DT 22 ? ? "C1'" B DT 22 ? ? N1 B DT 22 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 47 2 "O4'" B DA 23 ? ? "C1'" B DA 23 ? ? N9 B DA 23 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 48 2 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 49 3 "O5'" A DC 1 ? ? "C5'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 143.06 111.00 32.06 2.50 N 50 3 "O3'" A DC 1 ? ? P A DT 2 ? ? OP2 A DT 2 ? ? 129.84 110.50 19.34 1.10 Y 51 3 "O3'" A DC 1 ? ? P A DT 2 ? ? OP1 A DT 2 ? ? 128.67 110.50 18.17 1.10 Y 52 3 OP1 A DT 2 ? ? P A DT 2 ? ? OP2 A DT 2 ? ? 1.17 119.60 -118.43 1.50 N 53 3 "O5'" A DT 2 ? ? P A DT 2 ? ? OP1 A DT 2 ? ? 130.05 110.70 19.35 1.20 N 54 3 "O5'" A DT 2 ? ? P A DT 2 ? ? OP2 A DT 2 ? ? 128.89 110.70 18.19 1.20 N 55 3 "O3'" A DT 2 ? ? P A DA 3 ? ? OP2 A DA 3 ? ? 128.78 110.50 18.28 1.10 Y 56 3 "O3'" A DT 2 ? ? P A DA 3 ? ? OP1 A DA 3 ? ? 129.39 110.50 18.89 1.10 Y 57 3 OP1 A DA 3 ? ? P A DA 3 ? ? OP2 A DA 3 ? ? 1.55 119.60 -118.05 1.50 N 58 3 "O5'" A DA 3 ? ? P A DA 3 ? ? OP1 A DA 3 ? ? 128.41 110.70 17.71 1.20 N 59 3 "O5'" A DA 3 ? ? P A DA 3 ? ? OP2 A DA 3 ? ? 129.02 110.70 18.32 1.20 N 60 3 N7 A DA 3 ? ? C8 A DA 3 ? ? N9 A DA 3 ? ? 117.79 113.80 3.99 0.50 N 61 3 "O3'" A DA 3 ? ? P A DC 4 ? ? OP2 A DC 4 ? ? 125.38 110.50 14.88 1.10 Y 62 3 "O3'" A DA 3 ? ? P A DC 4 ? ? OP1 A DC 4 ? ? 133.43 110.50 22.93 1.10 Y 63 3 OP1 A DC 4 ? ? P A DC 4 ? ? OP2 A DC 4 ? ? 8.06 119.60 -111.54 1.50 N 64 3 "O5'" A DC 4 ? ? P A DC 4 ? ? OP1 A DC 4 ? ? 124.67 110.70 13.97 1.20 N 65 3 "O5'" A DC 4 ? ? P A DC 4 ? ? OP2 A DC 4 ? ? 132.72 110.70 22.02 1.20 N 66 3 "O3'" A DC 4 ? ? P A DT 5 ? ? OP2 A DT 5 ? ? 127.55 110.50 17.05 1.10 Y 67 3 "O3'" A DC 4 ? ? P A DT 5 ? ? OP1 A DT 5 ? ? 130.06 110.50 19.56 1.10 Y 68 3 OP1 A DT 5 ? ? P A DT 5 ? ? OP2 A DT 5 ? ? 2.53 119.60 -117.07 1.50 N 69 3 "O5'" A DT 5 ? ? P A DT 5 ? ? OP1 A DT 5 ? ? 128.04 110.70 17.34 1.20 N 70 3 "O5'" A DT 5 ? ? P A DT 5 ? ? OP2 A DT 5 ? ? 130.55 110.70 19.85 1.20 N 71 3 "O3'" A DT 5 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 130.73 110.50 20.23 1.10 Y 72 3 "O3'" A DT 5 ? ? P A DG 6 ? ? OP1 A DG 6 ? ? 127.48 110.50 16.98 1.10 Y 73 3 OP1 A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 3.26 119.60 -116.34 1.50 N 74 3 "O5'" A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP1 A DG 6 ? ? 130.45 110.70 19.75 1.20 N 75 3 "O5'" A DG 6 ? ? P A DG 6 ? ? OP2 A DG 6 ? ? 127.19 110.70 16.49 1.20 N 76 3 N7 A DG 6 ? ? C8 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 117.57 113.10 4.47 0.50 N 77 3 C8 A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? C4 A DG 6 ? ? 103.44 106.40 -2.96 0.40 N 78 3 "O3'" A DG 6 ? ? P A DC 7 ? ? OP2 A DC 7 ? ? 126.95 110.50 16.45 1.10 Y 79 3 "O3'" A DG 6 ? ? P A DC 7 ? ? OP1 A DC 7 ? ? 131.70 110.50 21.20 1.10 Y 80 3 OP1 A DC 7 ? ? P A DC 7 ? ? OP2 A DC 7 ? ? 4.76 119.60 -114.84 1.50 N 81 3 "O5'" A DC 7 ? ? P A DC 7 ? ? OP1 A DC 7 ? ? 126.35 110.70 15.65 1.20 N 82 3 "O5'" A DC 7 ? ? P A DC 7 ? ? OP2 A DC 7 ? ? 131.10 110.70 20.40 1.20 N 83 3 "O3'" A DC 7 ? ? P A DT 8 ? ? OP2 A DT 8 ? ? 128.65 110.50 18.15 1.10 Y 84 3 "O3'" A DC 7 ? ? P A DT 8 ? ? OP1 A DT 8 ? ? 129.72 110.50 19.22 1.10 Y 85 3 OP1 A DT 8 ? ? P A DT 8 ? ? OP2 A DT 8 ? ? 1.08 119.60 -118.52 1.50 N 86 3 "O5'" A DT 8 ? ? P A DT 8 ? ? OP1 A DT 8 ? ? 128.65 110.70 17.95 1.20 N 87 3 "O5'" A DT 8 ? ? P A DT 8 ? ? OP2 A DT 8 ? ? 129.72 110.70 19.02 1.20 N 88 3 "O3'" A DT 8 ? ? P A DT 9 ? ? OP2 A DT 9 ? ? 129.43 110.50 18.93 1.10 Y 89 3 "O3'" A DT 8 ? ? P A DT 9 ? ? OP1 A DT 9 ? ? 129.36 110.50 18.86 1.10 Y 90 3 OP1 A DT 9 ? ? P A DT 9 ? ? OP2 A DT 9 ? ? 0.09 119.60 -119.51 1.50 N 91 3 "O5'" A DT 9 ? ? P A DT 9 ? ? OP1 A DT 9 ? ? 129.17 110.70 18.47 1.20 N 92 3 "O5'" A DT 9 ? ? P A DT 9 ? ? OP2 A DT 9 ? ? 129.09 110.70 18.39 1.20 N 93 3 "O3'" A DT 9 ? ? P A DT 10 ? ? OP2 A DT 10 ? ? 131.90 110.50 21.40 1.10 Y 94 3 "O3'" A DT 9 ? ? P A DT 10 ? ? OP1 A DT 10 ? ? 126.73 110.50 16.23 1.10 Y 95 3 OP1 A DT 10 ? ? P A DT 10 ? ? OP2 A DT 10 ? ? 5.17 119.60 -114.43 1.50 N 96 3 "O5'" A DT 10 ? ? P A DT 10 ? ? OP1 A DT 10 ? ? 131.91 110.70 21.21 1.20 N 97 3 "O5'" A DT 10 ? ? P A DT 10 ? ? OP2 A DT 10 ? ? 126.74 110.70 16.04 1.20 N 98 3 "O3'" A DT 10 ? ? P A DA 11 ? ? OP2 A DA 11 ? ? 131.85 110.50 21.35 1.10 Y 99 3 "O3'" A DT 10 ? ? P A DA 11 ? ? OP1 A DA 11 ? ? 127.12 110.50 16.62 1.10 Y 100 3 OP1 A DA 11 ? ? P A DA 11 ? ? OP2 A DA 11 ? ? 4.72 119.60 -114.88 1.50 N 101 3 "O5'" A DA 11 ? ? P A DA 11 ? ? OP1 A DA 11 ? ? 131.31 110.70 20.61 1.20 N 102 3 "O5'" A DA 11 ? ? P A DA 11 ? ? OP2 A DA 11 ? ? 126.59 110.70 15.89 1.20 N 103 3 N7 A DA 11 ? ? C8 A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 104 3 "O3'" A DA 11 ? ? P A DG 12 ? ? OP2 A DG 12 ? ? 132.75 110.50 22.25 1.10 Y 105 3 "O3'" A DA 11 ? ? P A DG 12 ? ? OP1 A DG 12 ? ? 125.53 110.50 15.03 1.10 Y 106 3 OP1 A DG 12 ? ? P A DG 12 ? ? OP2 A DG 12 ? ? 7.22 119.60 -112.38 1.50 N 107 3 "O5'" A DG 12 ? ? P A DG 12 ? ? OP1 A DG 12 ? ? 133.03 110.70 22.33 1.20 N 108 3 "O5'" A DG 12 ? ? P A DG 12 ? ? OP2 A DG 12 ? ? 125.82 110.70 15.12 1.20 N 109 3 N7 A DG 12 ? ? C8 A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 110 3 "O5'" B DC 13 ? ? "C5'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? 146.37 111.00 35.37 2.50 N 111 3 "O3'" B DC 13 ? ? P B DT 14 ? ? OP2 B DT 14 ? ? 133.82 110.50 23.32 1.10 Y 112 3 "O3'" B DC 13 ? ? P B DT 14 ? ? OP1 B DT 14 ? ? 124.07 110.50 13.57 1.10 Y 113 3 OP1 B DT 14 ? ? P B DT 14 ? ? OP2 B DT 14 ? ? 9.76 119.60 -109.84 1.50 N 114 3 "O5'" B DT 14 ? ? P B DT 14 ? ? OP1 B DT 14 ? ? 134.56 110.70 23.86 1.20 N 115 3 "O5'" B DT 14 ? ? P B DT 14 ? ? OP2 B DT 14 ? ? 124.80 110.70 14.10 1.20 N 116 3 "O3'" B DT 14 ? ? P B DA 15 ? ? OP2 B DA 15 ? ? 125.96 110.50 15.46 1.10 Y 117 3 "O3'" B DT 14 ? ? P B DA 15 ? ? OP1 B DA 15 ? ? 131.88 110.50 21.38 1.10 Y 118 3 OP1 B DA 15 ? ? P B DA 15 ? ? OP2 B DA 15 ? ? 5.92 119.60 -113.68 1.50 N 119 3 "O5'" B DA 15 ? ? P B DA 15 ? ? OP1 B DA 15 ? ? 126.39 110.70 15.69 1.20 N 120 3 "O5'" B DA 15 ? ? P B DA 15 ? ? OP2 B DA 15 ? ? 132.31 110.70 21.61 1.20 N 121 3 N7 B DA 15 ? ? C8 B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 122 3 "O3'" B DA 15 ? ? P B DA 16 ? ? OP2 B DA 16 ? ? 133.35 110.50 22.85 1.10 Y 123 3 "O3'" B DA 15 ? ? P B DA 16 ? ? OP1 B DA 16 ? ? 126.73 110.50 16.23 1.10 Y 124 3 OP1 B DA 16 ? ? P B DA 16 ? ? OP2 B DA 16 ? ? 6.66 119.60 -112.94 1.50 N 125 3 "O5'" B DA 16 ? ? P B DA 16 ? ? OP1 B DA 16 ? ? 131.44 110.70 20.74 1.20 N 126 3 "O5'" B DA 16 ? ? P B DA 16 ? ? OP2 B DA 16 ? ? 124.82 110.70 14.12 1.20 N 127 3 N7 B DA 16 ? ? C8 B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 128 3 "O3'" B DA 16 ? ? P B DA 17 ? ? OP2 B DA 17 ? ? 131.35 110.50 20.85 1.10 Y 129 3 "O3'" B DA 16 ? ? P B DA 17 ? ? OP1 B DA 17 ? ? 126.86 110.50 16.36 1.10 Y 130 3 OP1 B DA 17 ? ? P B DA 17 ? ? OP2 B DA 17 ? ? 4.49 119.60 -115.11 1.50 N 131 3 "O5'" B DA 17 ? ? P B DA 17 ? ? OP1 B DA 17 ? ? 131.47 110.70 20.77 1.20 N 132 3 "O5'" B DA 17 ? ? P B DA 17 ? ? OP2 B DA 17 ? ? 126.98 110.70 16.28 1.20 N 133 3 N7 B DA 17 ? ? C8 B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 117.68 113.80 3.88 0.50 N 134 3 "O3'" B DA 17 ? ? P B DG 18 ? ? OP2 B DG 18 ? ? 129.37 110.50 18.87 1.10 Y 135 3 "O3'" B DA 17 ? ? P B DG 18 ? ? OP1 B DG 18 ? ? 129.64 110.50 19.14 1.10 Y 136 3 OP1 B DG 18 ? ? P B DG 18 ? ? OP2 B DG 18 ? ? 0.35 119.60 -119.25 1.50 N 137 3 "O5'" B DG 18 ? ? P B DG 18 ? ? OP1 B DG 18 ? ? 128.81 110.70 18.11 1.20 N 138 3 "O5'" B DG 18 ? ? P B DG 18 ? ? OP2 B DG 18 ? ? 129.08 110.70 18.38 1.20 N 139 3 N7 B DG 18 ? ? C8 B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 140 3 "O3'" B DG 18 ? ? P B DC 19 ? ? OP2 B DC 19 ? ? 129.72 110.50 19.22 1.10 Y 141 3 "O3'" B DG 18 ? ? P B DC 19 ? ? OP1 B DC 19 ? ? 128.55 110.50 18.05 1.10 Y 142 3 OP1 B DC 19 ? ? P B DC 19 ? ? OP2 B DC 19 ? ? 1.18 119.60 -118.42 1.50 N 143 3 "O5'" B DC 19 ? ? P B DC 19 ? ? OP1 B DC 19 ? ? 129.71 110.70 19.01 1.20 N 144 3 "O5'" B DC 19 ? ? P B DC 19 ? ? OP2 B DC 19 ? ? 128.54 110.70 17.84 1.20 N 145 3 "O3'" B DC 19 ? ? P B DA 20 ? ? OP2 B DA 20 ? ? 129.39 110.50 18.89 1.10 Y 146 3 "O3'" B DC 19 ? ? P B DA 20 ? ? OP1 B DA 20 ? ? 129.38 110.50 18.88 1.10 Y 147 3 OP1 B DA 20 ? ? P B DA 20 ? ? OP2 B DA 20 ? ? 0.03 119.60 -119.57 1.50 N 148 3 "O5'" B DA 20 ? ? P B DA 20 ? ? 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OP1 B DG 24 ? ? 132.69 110.70 21.99 1.20 N 173 3 "O5'" B DG 24 ? ? P B DG 24 ? ? OP2 B DG 24 ? ? 125.33 110.70 14.63 1.20 N 174 3 N7 B DG 24 ? ? C8 B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1CS2 'double helix' 1CS2 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 0.351 -0.205 0.099 -10.127 3.719 -1.362 1 A_DC1:DG24_B A 1 ? 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B 13 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 A DT 2 1_555 B DA 11 1_555 -0.124 -1.338 3.454 1.569 -2.447 34.969 -1.828 0.457 3.528 -4.063 -2.605 35.086 1 AA_DC1DT2:DA23DG24_BB A 1 ? 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B 18 ? 1 A DC 7 1_555 B DG 6 1_555 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 -0.050 -1.339 3.354 2.785 1.762 28.380 -3.119 0.743 3.247 3.578 -5.656 28.567 7 AA_DC7DT8:DA17DG18_BB A 7 ? B 18 ? A 8 ? B 17 ? 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 A DT 9 1_555 B DA 4 1_555 0.582 -0.703 3.274 0.783 0.653 39.497 -1.117 -0.769 3.273 0.967 -1.159 39.510 8 AA_DT8DT9:DA16DA17_BB A 8 ? B 17 ? A 9 ? B 16 ? 1 A DT 9 1_555 B DA 4 1_555 A DT 10 1_555 B DA 3 1_555 -0.097 -1.211 3.268 -0.674 4.233 30.292 -3.112 0.055 3.075 8.049 1.281 30.586 9 AA_DT9DT10:DA15DA16_BB A 9 ? B 16 ? A 10 ? B 15 ? 1 A DT 10 1_555 B DA 3 1_555 A DA 11 1_555 B DT 2 1_555 -0.125 -1.159 3.052 -0.015 10.213 33.655 -3.271 0.205 2.601 17.154 0.025 35.128 10 AA_DT10DA11:DT14DA15_BB A 10 ? B 15 ? A 11 ? B 14 ? 1 A DA 11 1_555 B DT 2 1_555 A DG 12 1_555 B DC 1 1_555 0.292 -1.453 3.361 -3.242 1.336 29.533 -3.115 -1.256 3.243 2.609 6.331 29.736 11 AA_DA11DG12:DC13DT14_BB A 11 ? B 14 ? A 12 ? B 13 ? #