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'SINGLE WAVELENGTH' x-ray # loop_ _diffrn_radiation_wavelength.id _diffrn_radiation_wavelength.wavelength _diffrn_radiation_wavelength.wt 1 0.935 1.0 2 0.9159 1.0 3 0.9771 1.0 # loop_ _diffrn_source.diffrn_id _diffrn_source.source _diffrn_source.type _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline _diffrn_source.pdbx_wavelength _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1 SYNCHROTRON 'CHESS BEAMLINE A1' CHESS A1 0.935 ? 2 SYNCHROTRON 'CHESS BEAMLINE F1' CHESS F1 0.9159 ? 3 SYNCHROTRON 'NSLS BEAMLINE X9B' NSLS X9B 0.9771 ? # _reflns.entry_id 1CVJ _reflns.observed_criterion_sigma_I 0 _reflns.observed_criterion_sigma_F 0 _reflns.d_resolution_low 20.0 _reflns.d_resolution_high 2.6 _reflns.number_obs 61125 _reflns.number_all 61125 _reflns.percent_possible_obs 99.4 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.0530000 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 19 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 60 _reflns.pdbx_redundancy 3.2 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1,2,3 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _reflns_shell.d_res_high 2.6 _reflns_shell.d_res_low 2.69 _reflns_shell.percent_possible_all 99.7 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.2940000 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs ? _reflns_shell.pdbx_redundancy 3.0 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_diffrn_id ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 1CVJ _refine.ls_number_reflns_obs 57149 _refine.ls_number_reflns_all 61739 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 2 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 20 _refine.ls_d_res_high 2.6 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs 0.2300000 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.2300000 _refine.ls_R_factor_R_free 0.3040000 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 10 _refine.ls_number_reflns_R_free 5791 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'ENGH & HUBER' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 9683 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 1274 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 152 _refine_hist.number_atoms_solvent 53 _refine_hist.number_atoms_total 11162 _refine_hist.d_res_high 2.6 _refine_hist.d_res_low 20 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function c_bond_d 0.008 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d 1.57 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1CVJ _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 1CVJ _struct.title 'X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE POLY(A)-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH POLYADENYLATE RNA' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1CVJ _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION/RNA' _struct_keywords.text 'RRM, PROTEIN-RNA COMPLEX, GENE REGULATION-RNA COMPLEX' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 2 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 3 ? V N N 3 ? W N N 3 ? X N N 3 ? Y N N 4 ? Z N N 4 ? AA N N 4 ? BA N N 4 ? CA N N 4 ? DA N N 4 ? EA N N 4 ? FA N N 4 ? GA N N 4 ? HA N N 4 ? IA N N 4 ? JA N N 4 ? KA N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP PABP1_HUMAN P11940 2 1 ? ? 2 PDB 1CVJ 1CVJ 1 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1CVJ A 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 2 1 1CVJ B 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 3 1 1CVJ C 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 4 1 1CVJ D 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 5 1 1CVJ E 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 6 1 1CVJ F 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 7 1 1CVJ G 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 8 1 1CVJ H 1 ? 190 ? P11940 1 ? 190 ? 1 190 9 2 1CVJ M 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 10 2 1CVJ N 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 11 2 1CVJ O 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 12 2 1CVJ P 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 13 2 1CVJ Q 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 14 2 1CVJ R 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 15 2 1CVJ S 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 16 2 1CVJ T 1 ? 11 ? 1CVJ 1 ? 11 ? 1 11 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_defined_assembly ? dimeric 2 2 author_defined_assembly ? dimeric 2 3 author_defined_assembly ? dimeric 2 4 author_defined_assembly ? dimeric 2 5 author_defined_assembly ? dimeric 2 6 author_defined_assembly ? dimeric 2 7 author_defined_assembly ? dimeric 2 8 author_defined_assembly ? dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,I,U,DA 2 1 B,J,Q,Y,EA 3 1 C,K,R,Z,FA 4 1 D,L,V,AA,GA 5 1 E,M,S,BA,HA 6 1 F,N,W,IA 7 1 G,O,T,JA 8 1 H,P,X,CA,KA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.pdbx_parent_biol_id _struct_biol.details 1 ? ? 2 ? ? 3 ? ? 4 ? ? 5 ? ? 6 ? ? 7 ? ? 8 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 THR I 23 ? SER I 32 ? THR A 23 SER A 32 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 2 PRO I 33 ? GLY I 35 ? PRO A 33 GLY A 35 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 3 GLN I 61 ? ASP I 70 ? GLN A 61 ASP A 70 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 4 PRO I 91 ? SER I 96 ? PRO A 91 SER A 96 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 ASP I 111 ? ALA I 121 ? ASP A 111 ALA A 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 6 THR I 147 ? ILE I 155 ? THR A 147 ILE A 155 1 ? 9 HELX_P HELX_P7 7 THR J 23 ? SER J 32 ? THR B 23 SER B 32 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 8 PRO J 33 ? GLY J 35 ? PRO B 33 GLY B 35 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 9 GLN J 61 ? ASN J 73 ? GLN B 61 ASN B 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 10 PRO J 91 ? SER J 96 ? PRO B 91 SER B 96 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 ASP J 111 ? ALA J 121 ? ASP B 111 ALA B 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 12 THR J 147 ? ILE J 155 ? THR B 147 ILE B 155 1 ? 9 HELX_P HELX_P13 13 THR K 23 ? SER K 32 ? THR C 23 SER C 32 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 14 PRO K 33 ? GLY K 35 ? PRO C 33 GLY C 35 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 15 GLN K 61 ? ASN K 73 ? GLN C 61 ASN C 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 16 PRO K 91 ? SER K 96 ? PRO C 91 SER C 96 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 ASP K 111 ? ALA K 121 ? ASP C 111 ALA C 121 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 18 THR K 147 ? MET K 158 ? THR C 147 MET C 158 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 19 THR L 23 ? SER L 32 ? THR D 23 SER D 32 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 20 PRO L 33 ? GLY L 35 ? PRO D 33 GLY D 35 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 21 GLN L 61 ? ASN L 73 ? GLN D 61 ASN D 73 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 22 PRO L 91 ? SER L 96 ? PRO D 91 SER D 96 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 23 ASP L 111 ? SER L 120 ? ASP D 111 SER D 120 1 ? 10 HELX_P HELX_P24 24 THR L 147 ? MET L 158 ? THR D 147 MET D 158 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 THR M 23 ? SER M 32 ? THR E 23 SER E 32 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 26 PRO M 33 ? GLY M 35 ? PRO E 33 GLY E 35 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 27 GLN M 61 ? ASP M 70 ? GLN E 61 ASP E 70 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 28 PRO M 91 ? SER M 96 ? PRO E 91 SER E 96 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 ASP M 111 ? SER M 120 ? ASP E 111 SER E 120 1 ? 10 HELX_P HELX_P30 30 THR M 147 ? MET M 158 ? THR E 147 MET E 158 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 THR N 23 ? 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