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Nature 394 502 506 1998 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? 9697776 10.1038/28893 1 ;Identification of the Primary Metal Ion-Activation Sites of the Diphtheria Tox Repressor by X-Ray Crystallography and Site-Directed Mutational Analysis ; Nat.Struct.Biol. 3 382 ? 1996 NSBIEW US 1072-8368 2024 ? ? ? 2 'Structures of the Apo-and the Metal Ion-Activated Forms of the Diphtheria Tox Repressor from Corynebacterium Diphtheriae' Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92 9843 ? 1995 PNASA6 US 0027-8424 0040 ? ? ? 3 'Cysteine-102 is Positioned in the Metal Binding Activation Site of the Corynebacterium Diphtheriae Regulatory Element Dtxr' Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90 8524 ? 1993 PNASA6 US 0027-8424 0040 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'White, A.' 1 ? primary 'Ding, X.' 2 ? primary 'vanderSpek, J.C.' 3 ? primary 'Murphy, J.R.' 4 ? primary 'Ringe, D.' 5 ? 1 'Ding, X.' 6 ? 1 'Zeng, H.' 7 ? 1 'Schiering, N.' 8 ? 1 'Ringe, D.' 9 ? 1 'Murphy, J.R.' 10 ? 2 'Schiering, N.' 11 ? 2 'Tao, X.' 12 ? 2 'Zeng, H.' 13 ? 2 'Murphy, J.R.' 14 ? 2 'Petsko, G.A.' 15 ? 2 'Ringe, D.' 16 ? 3 'Tao, X.' 17 ? 3 'Murphy, J.R.' 18 ? # _cell.entry_id 1DDN _cell.length_a 117.050 _cell.length_b 117.050 _cell.length_c 145.340 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1DDN _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting tetragonal _symmetry.Int_Tables_number 76 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn '33 BASE DNA CONTAINING TOXIN OPERATOR' 10131.578 1 ? ? ? ? 2 polymer syn '33 BASE DNA CONTAINING TOXIN OPERATOR' 10158.620 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'DIPHTHERIA TOX REPRESSOR' 25361.740 4 ? 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GLY D 38 ARG D 50 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 22 PRO F 66 ? ASP F 88 ? PRO D 66 ASP D 88 1 ? 23 HELX_P HELX_P23 23 VAL F 97 ? VAL F 107 ? VAL D 97 VAL D 107 1 ? 11 HELX_P HELX_P24 24 ASP F 110 ? LYS F 118 ? ASP D 110 LYS D 118 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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F LEU 226 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1DDN 'double helix' 1DDN 'b-form double helix' 1DDN 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DT 2 1_555 B DA 33 1_555 -2.743 -0.678 -0.502 18.061 0.233 -5.789 1 E_DT302:DA433_F E 302 ? 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