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Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92 1222 1226 1995 PNASA6 US 0027-8424 0040 ? 7532306 10.1073/pnas.92.4.1222 1 'Recombinant HIV-1 Reverse Transcriptase: Purification, Primary Structure, and Polymerase(Slash)Ribonuclease H Activities' Arch.Biochem.Biophys. 273 347 ? 1989 ABBIA4 US 0003-9861 0158 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Rodgers, D.W.' 1 ? primary 'Gamblin, S.J.' 2 ? primary 'Harris, B.A.' 3 ? primary 'Ray, S.' 4 ? primary 'Culp, J.S.' 5 ? primary 'Hellmig, B.' 6 ? primary 'Woolf, D.J.' 7 ? primary 'Debouck, C.' 8 ? primary 'Harrison, S.C.' 9 ? 1 'Misrahi, V.' 10 ? 1 'Lazarus, G.M.' 11 ? 1 'Miles, L.M.' 12 ? 1 'Meyers, C.A.' 13 ? 1 'Debouck, C.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'HIV-1 REVERSE 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B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 1 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP POL_HV1B1 1 P03366 168 ? ? 2 UNP POL_HV1B1 2 P03366 168 ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1HMV A 1 ? 560 ? P03366 168 ? 727 ? 1 560 2 2 1HMV B 1 ? 440 ? P03366 168 ? 607 ? 1 440 3 1 1HMV C 1 ? 560 ? P03366 168 ? 727 ? 1 560 4 2 1HMV D 1 ? 440 ? P03366 168 ? 607 ? 1 440 5 1 1HMV E 1 ? 560 ? P03366 168 ? 727 ? 1 560 6 2 1HMV F 1 ? 440 ? P03366 168 ? 607 ? 1 440 7 1 1HMV G 1 ? 560 ? P03366 168 ? 727 ? 1 560 8 2 1HMV H 1 ? 440 ? P03366 168 ? 607 ? 1 440 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 3 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 4 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 5160 ? 1 MORE -32 ? 1 'SSA (A^2)' 44370 ? 2 'ABSA (A^2)' 5160 ? 2 MORE -32 ? 2 'SSA (A^2)' 44350 ? 3 'ABSA (A^2)' 5160 ? 3 MORE -32 ? 3 'SSA (A^2)' 44390 ? 4 'ABSA (A^2)' 5160 ? 4 MORE -32 ? 4 'SSA (A^2)' 44370 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,I 2 1 C,D,J 3 1 E,F,K 4 1 G,H,L # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.details _struct_biol.pdbx_parent_biol_id 1 ;THE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE CONSISTS OF TWO SUBUNITS, P66 (DESIGNATED CHAIN A) AND P51 (DESIGNATED CHAIN B). IN THIS CRYSTAL FORM THERE ARE FOUR REVERSE TRANSCRIPTASE MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT. COORDINATES FOR ONE MOLECULE ARE CONTAINED IN THIS ENTRY, AND THE NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS GIVEN BELOW ARE BASED ON THE BEST SUPERPOSITION OF THIS MOLECULE ON EACH OF THE REMAINING THREE. MTRIX THE TRANSFORMATIONS PRESENTED ON MTRIX RECORDS BELOW DESCRIBE NON-CRYSTALLOGRAPHIC RELATIONSHIPS AMONG THE VARIOUS DOMAINS IN THIS ENTRY. APPLYING THE APPROPRIATE MTRIX TRANSFORMATION TO THE RESIDUES LISTED FIRST WILL YIELD COORDINATES FOR THE OTHER THREE MOLECULES PRESENT IN THE ASYMMETRIC UNIT. APPLIED TO WILL GENERATE MTRIX RESIDUES RESIDUES M1 A 1 .. A 554 C 1 .. C 554 M1 B 5 .. B 427 D 5 .. D 427 M2 A 1 .. A 554 E 1 .. E 554 M2 B 5 .. B 427 F 5 .. F 427 M3 A 1 .. A 554 G 1 .. G 554 M3 B 5 .. B 427 H 5 .. H 427 ; ? 2 ? ? 3 ? ? 4 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 A THR A 27 ? GLU A 44 ? THR A 27 GLU A 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P2 B PHE A 77 ? THR A 84 ? PHE A 77 THR A 84 1 ? 8 HELX_P HELX_P3 C GLY A 155 ? ASN A 175 ? GLY A 155 ASN A 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P4 D GLU A 194 ? ARG A 211 ? GLU A 194 ARG A 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P5 E THR A 253 ? SER A 268 ? THR A 253 SER A 268 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 F VAL A 276 ? LYS A 281 ? VAL A 276 LYS A 281 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 G THR A 296 ? LYS A 311 ? THR A 296 LYS A 311 1 ? 16 HELX_P HELX_P8 H ASN A 363 ? TRP A 383 ? ASN A 363 TRP A 383 1 ? 21 HELX_P HELX_P9 I GLN A 394 ? GLU A 404 ? GLN A 394 GLU A 404 1 ? 11 HELX_P HELX_P10 J THR A 473 ? ASP A 488 ? THR A 473 ASP A 488 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 K SER A 499 ? ALA A 508 ? SER A 499 ALA A 508 1 ? 10 HELX_P HELX_P12 L SER A 515 ? LYS A 528 ? SER A 515 LYS A 528 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 M GLY A 544 ? VAL A 552 ? GLY A 544 VAL A 552 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 A THR B 27 ? GLU B 44 ? THR B 27 GLU B 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P15 B PHE B 77 ? ARG B 83 ? PHE B 77 ARG B 83 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 C GLY B 155 ? ASN B 175 ? GLY B 155 ASN B 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P17 D GLU B 194 ? ARG B 211 ? GLU B 194 ARG B 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 E THR B 253 ? GLN B 269 ? THR B 253 GLN B 269 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 F ARG B 277 ? ARG B 284 ? ARG B 277 ARG B 284 1 ? 8 HELX_P HELX_P20 G THR B 296 ? LEU B 310 ? THR B 296 LEU B 310 1 ? 15 HELX_P HELX_P21 H ASN B 363 ? ILE B 382 ? ASN B 363 ILE B 382 1 ? 20 HELX_P HELX_P22 I GLN B 394 ? TRP B 406 ? GLN B 394 TRP B 406 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 A THR C 27 ? GLU C 44 ? THR C 27 GLU C 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P24 B PHE C 77 ? THR C 84 ? PHE C 77 THR C 84 1 ? 8 HELX_P HELX_P25 C GLY C 155 ? ASN C 175 ? GLY C 155 ASN C 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P26 D GLU C 194 ? ARG C 211 ? GLU C 194 ARG C 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P27 E THR C 253 ? SER C 268 ? THR C 253 SER C 268 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 F VAL C 276 ? LYS C 281 ? VAL C 276 LYS C 281 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 G THR C 296 ? LYS C 311 ? THR C 296 LYS C 311 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 H ASN C 363 ? TRP C 383 ? ASN C 363 TRP C 383 1 ? 21 HELX_P HELX_P31 I GLN C 394 ? GLU C 404 ? GLN C 394 GLU C 404 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 J THR C 473 ? ASP C 488 ? THR C 473 ASP C 488 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 K SER C 499 ? ALA C 508 ? SER C 499 ALA C 508 1 ? 10 HELX_P HELX_P34 L SER C 515 ? LYS C 528 ? SER C 515 LYS C 528 1 ? 14 HELX_P HELX_P35 M GLY C 544 ? VAL C 552 ? GLY C 544 VAL C 552 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 A THR D 27 ? GLU D 44 ? THR D 27 GLU D 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P37 B PHE D 77 ? ARG D 83 ? PHE D 77 ARG D 83 1 ? 7 HELX_P HELX_P38 C GLY D 155 ? ASN D 175 ? GLY D 155 ASN D 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P39 D GLU D 194 ? ARG D 211 ? GLU D 194 ARG D 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P40 E THR D 253 ? GLN D 269 ? THR D 253 GLN D 269 1 ? 17 HELX_P HELX_P41 F ARG D 277 ? ARG D 284 ? ARG D 277 ARG D 284 1 ? 8 HELX_P HELX_P42 G THR D 296 ? LEU D 310 ? THR D 296 LEU D 310 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 H ASN D 363 ? ILE D 382 ? ASN D 363 ILE D 382 1 ? 20 HELX_P HELX_P44 I GLN D 394 ? TRP D 406 ? GLN D 394 TRP D 406 1 ? 13 HELX_P HELX_P45 A THR E 27 ? GLU E 44 ? THR E 27 GLU E 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P46 B PHE E 77 ? THR E 84 ? PHE E 77 THR E 84 1 ? 8 HELX_P HELX_P47 C GLY E 155 ? ASN E 175 ? GLY E 155 ASN E 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P48 D GLU E 194 ? ARG E 211 ? GLU E 194 ARG E 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P49 E THR E 253 ? SER E 268 ? THR E 253 SER E 268 1 ? 16 HELX_P HELX_P50 F VAL E 276 ? LYS E 281 ? VAL E 276 LYS E 281 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 G THR E 296 ? LYS E 311 ? THR E 296 LYS E 311 1 ? 16 HELX_P HELX_P52 H ASN E 363 ? TRP E 383 ? ASN E 363 TRP E 383 1 ? 21 HELX_P HELX_P53 I GLN E 394 ? GLU E 404 ? GLN E 394 GLU E 404 1 ? 11 HELX_P HELX_P54 J THR E 473 ? ASP E 488 ? THR E 473 ASP E 488 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 K SER E 499 ? ALA E 508 ? SER E 499 ALA E 508 1 ? 10 HELX_P HELX_P56 L SER E 515 ? LYS E 528 ? SER E 515 LYS E 528 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 M GLY E 544 ? VAL E 552 ? GLY E 544 VAL E 552 1 ? 9 HELX_P HELX_P58 A THR F 27 ? GLU F 44 ? THR F 27 GLU F 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P59 B PHE F 77 ? ARG F 83 ? PHE F 77 ARG F 83 1 ? 7 HELX_P HELX_P60 C GLY F 155 ? ASN F 175 ? GLY F 155 ASN F 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P61 D GLU F 194 ? ARG F 211 ? GLU F 194 ARG F 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P62 E THR F 253 ? GLN F 269 ? THR F 253 GLN F 269 1 ? 17 HELX_P HELX_P63 F ARG F 277 ? ARG F 284 ? ARG F 277 ARG F 284 1 ? 8 HELX_P HELX_P64 G THR F 296 ? LEU F 310 ? THR F 296 LEU F 310 1 ? 15 HELX_P HELX_P65 H ASN F 363 ? ILE F 382 ? ASN F 363 ILE F 382 1 ? 20 HELX_P HELX_P66 I GLN F 394 ? TRP F 406 ? GLN F 394 TRP F 406 1 ? 13 HELX_P HELX_P67 A THR G 27 ? GLU G 44 ? THR G 27 GLU G 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P68 B PHE G 77 ? THR G 84 ? PHE G 77 THR G 84 1 ? 8 HELX_P HELX_P69 C GLY G 155 ? ASN G 175 ? GLY G 155 ASN G 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P70 D GLU G 194 ? ARG G 211 ? GLU G 194 ARG G 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P71 E THR G 253 ? SER G 268 ? THR G 253 SER G 268 1 ? 16 HELX_P HELX_P72 F VAL G 276 ? LYS G 281 ? VAL G 276 LYS G 281 1 ? 6 HELX_P HELX_P73 G THR G 296 ? LYS G 311 ? THR G 296 LYS G 311 1 ? 16 HELX_P HELX_P74 H ASN G 363 ? TRP G 383 ? ASN G 363 TRP G 383 1 ? 21 HELX_P HELX_P75 I GLN G 394 ? GLU G 404 ? GLN G 394 GLU G 404 1 ? 11 HELX_P HELX_P76 J THR G 473 ? ASP G 488 ? THR G 473 ASP G 488 1 ? 16 HELX_P HELX_P77 K SER G 499 ? ALA G 508 ? SER G 499 ALA G 508 1 ? 10 HELX_P HELX_P78 L SER G 515 ? LYS G 528 ? SER G 515 LYS G 528 1 ? 14 HELX_P HELX_P79 M GLY G 544 ? VAL G 552 ? GLY G 544 VAL G 552 1 ? 9 HELX_P HELX_P80 A THR H 27 ? GLU H 44 ? THR H 27 GLU H 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P81 B PHE H 77 ? ARG H 83 ? PHE H 77 ARG H 83 1 ? 7 HELX_P HELX_P82 C GLY H 155 ? ASN H 175 ? GLY H 155 ASN H 175 1 ? 21 HELX_P HELX_P83 D GLU H 194 ? ARG H 211 ? GLU H 194 ARG H 211 1 ? 18 HELX_P HELX_P84 E THR H 253 ? GLN H 269 ? THR H 253 GLN H 269 1 ? 17 HELX_P HELX_P85 F ARG H 277 ? ARG H 284 ? ARG H 277 ARG H 284 1 ? 8 HELX_P HELX_P86 G THR H 296 ? LEU H 310 ? THR H 296 LEU H 310 1 ? 15 HELX_P HELX_P87 H ASN H 363 ? ILE H 382 ? ASN H 363 ILE H 382 1 ? 20 HELX_P HELX_P88 I GLN H 394 ? TRP H 406 ? GLN H 394 TRP H 406 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A ASP 443 OD1 ? ? ? 1_555 I MG . MG ? ? A ASP 443 B MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.117 ? ? metalc2 metalc ? ? A GLU 478 OE2 ? ? ? 1_555 I MG . MG ? ? A GLU 478 B MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.750 ? ? metalc3 metalc ? ? A ASP 498 OD1 ? ? ? 1_555 I MG . MG ? ? A ASP 498 B MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.059 ? ? metalc4 metalc ? ? A ASP 498 OD2 ? ? ? 1_555 I MG . MG ? ? A ASP 498 B MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.753 ? ? metalc5 metalc ? ? C ASP 443 OD1 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? C ASP 443 D MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.117 ? ? metalc6 metalc ? ? C GLU 478 OE2 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? C GLU 478 D MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.751 ? ? metalc7 metalc ? ? C ASP 498 OD1 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? C ASP 498 D MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.059 ? ? metalc8 metalc ? ? C ASP 498 OD2 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? C ASP 498 D MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.753 ? ? metalc9 metalc ? ? E ASP 443 OD1 ? ? ? 1_555 K MG . MG ? ? E ASP 443 F MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.116 ? ? metalc10 metalc ? ? E GLU 478 OE2 ? ? ? 1_555 K MG . MG ? ? E GLU 478 F MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.751 ? ? metalc11 metalc ? ? E ASP 498 OD1 ? ? ? 1_555 K MG . MG ? ? E ASP 498 F MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.059 ? ? metalc12 metalc ? ? E ASP 498 OD2 ? ? ? 1_555 K MG . MG ? ? E ASP 498 F MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.753 ? ? metalc13 metalc ? ? G ASP 443 OD1 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? G ASP 443 H MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.117 ? ? metalc14 metalc ? ? G GLU 478 OE2 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? G GLU 478 H MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.750 ? ? metalc15 metalc ? ? G ASP 498 OD2 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? G ASP 498 H MG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.753 ? ? metalc16 metalc ? ? G ASP 498 OD1 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? 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