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'EMBO J.' 20 1829 1839 2001 EMJODG UK 0261-4189 0897 ? 11296217 10.1093/emboj/20.8.1829 1 'Structure of Functionally Activated Small Ribosomal Subunit at 3.3 A Resolution' 'Cell(Cambridge,Mass.)' 102 615 623 2000 CELLB5 US 0092-8674 0998 ? ? '10.1016/S0092-8674(00)00084-2' # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Pioletti, M.' 1 ? primary 'Schlunzen, F.' 2 ? primary 'Harms, J.' 3 ? primary 'Zarivach, R.' 4 ? primary 'Gluhmann, M.' 5 ? primary 'Avila, H.' 6 ? primary 'Bashan, A.' 7 ? primary 'Bartels, H.' 8 ? primary 'Auerbach, T.' 9 ? primary 'Jacobi, C.' 10 ? primary 'Hartsch, T.' 11 ? primary 'Yonath, A.' 12 ? primary 'Franceschi, F.' 13 ? 1 'Schluenzen, F.' 14 ? 1 'Tocilj, A.' 15 ? 1 'Zarivach, R.' 16 ? 1 'Harms, J.' 17 ? 1 'Gluehmann, M.' 18 ? 1 'Janell, D.' 19 ? 1 'Bashan, A.' 20 ? 1 'Bartels, H.' 21 ? 1 'Agmon, I.' 22 ? 1 'Franceschi, F.' 23 ? 1 'Yonath, A.' 24 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '16S RRNA' 491510.938 1 ? ? ? ? 2 polymer nat '30S 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RMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPDA IFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQE AEATETPEGESEVEA ; ;PVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDIV RMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPDA IFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQE AEATETPEGESEVEA ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;GNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRGG ERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGAE QARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; ;GNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRGG ERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGAE QARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no 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;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;ARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVG GANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; ;ARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVG GANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTEVPASRFKEEILKILAREGFIKGYERVEVDGKPYLRIHLKYGPRRQGPDPRPEQVI KHIRRISRPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTPKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTEVPASRFKEEILKILAREGFIKGYERVEVDGKPYLRIHLKYGPRRQGPDPRPEQVI KHIRRISRPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTPKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLG IARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; 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LDLVEKYLVRRQNYASLSKRGGKA ; ;PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEERYKVGDVVEIIEARPISKRKRFRVLRLVEEGR LDLVEKYLVRRQNYASLSKRGGKA ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ;STKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPF TEKLVRK ; ;STKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPF TEKLVRK ; R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;PRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR GHGKEAKATKKK ; ;PRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYR GHGKEAKATKKK ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;AQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRK SRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; ;AQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRK SRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK U ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 22 'MAGNESIUM ION' MG 23 'OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE' WO2 24 'EDEINE B' EDE 25 'ZINC ION' ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 U n 1 5 G n 1 6 G n 1 7 A n 1 8 G n 1 9 A n 1 10 G n 1 11 U n 1 12 U n 1 13 U n 1 14 G n 1 15 A n 1 16 U n 1 17 C n 1 18 C n 1 19 U n 1 20 G n 1 21 G n 1 22 C n 1 23 U n 1 24 C n 1 25 A n 1 26 G n 1 27 G n 1 28 G n 1 29 U n 1 30 G n 1 31 A n 1 32 A n 1 33 C n 1 34 G n 1 35 C n 1 36 U n 1 37 G n 1 38 G n 1 39 C n 1 40 G n 1 41 G n 1 42 C n 1 43 G n 1 44 U n 1 45 G n 1 46 C n 1 47 C n 1 48 U n 1 49 A n 1 50 A n 1 51 G n 1 52 A n 1 53 C n 1 54 A n 1 55 U n 1 56 G n 1 57 C n 1 58 A n 1 59 A n 1 60 G n 1 61 U n 1 62 C n 1 63 G n 1 64 U n 1 65 G n 1 66 C n 1 67 G n 1 68 G n 1 69 G n 1 70 C n 1 71 C n 1 72 G n 1 73 C n 1 74 G n 1 75 G n 1 76 G n 1 77 G n 1 78 U n 1 79 U n 1 80 U n 1 81 U n 1 82 A n 1 83 C n 1 84 U n 1 85 C n 1 86 C n 1 87 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'Thermus thermophilus' 274 Thermus ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 EDE non-polymer . 'EDEINE B' ? 'C34 H59 N11 O10' 781.900 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 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A G 139 A C 171 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog226 hydrog ? ? A G 138 O6 ? ? ? 1_555 A C 170 N4 ? ? A G 139 A C 171 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog227 hydrog ? ? A G 138 N1 ? ? ? 1_555 A C 171 N3 ? ? A G 139 A C 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog228 hydrog ? ? A G 138 N2 ? ? ? 1_555 A C 171 O2 ? ? A G 139 A C 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog229 hydrog ? ? A G 138 O6 ? ? ? 1_555 A C 171 N4 ? ? A G 139 A C 172 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog230 hydrog ? ? A G 139 N1 ? ? ? 1_555 A C 169 N3 ? ? A G 140 A C 170 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog231 hydrog ? ? A G 139 N2 ? ? ? 1_555 A C 169 O2 ? ? A G 140 A C 170 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog232 hydrog ? ? A G 139 O6 ? ? ? 1_555 A C 169 N4 ? ? A G 140 A C 170 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog233 hydrog ? ? A G 140 N1 ? ? ? 1_555 A C 168 N3 ? ? A G 141 A C 169 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? A G 140 N2 ? ? ? 1_555 A C 168 O2 ? ? A G 141 A C 169 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? A G 140 O6 ? ? ? 1_555 A C 168 N4 ? ? A G 141 A C 169 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? A G 141 N1 ? ? ? 1_555 A C 167 N3 ? ? A G 142 A C 168 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? A A 142 N1 ? ? ? 1_555 A A 165 N6 ? ? A A 143 A A 166 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog238 hydrog ? ? A C 143 N3 ? ? ? 1_555 A A 164 N6 ? ? A C 144 A A 165 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog239 hydrog ? ? A C 143 N4 ? ? ? 1_555 A A 164 N7 ? ? A C 144 A A 165 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? ? hydrog240 hydrog ? ? A A 144 N6 ? ? ? 1_555 A U 163 O2 ? ? A A 145 A U 164 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog241 hydrog ? ? A A 144 N7 ? ? ? 1_555 A U 163 N3 ? ? A A 145 A U 164 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog242 hydrog ? ? A A 145 N6 ? ? ? 1_555 A C 162 O2 ? ? A A 146 A C 163 1_555 ? ? ? ? ? ? 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