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_citation.id primary _citation.title 'Orientation of bound ligands in mannose-binding proteins. Implications for multivalent ligand recognition.' _citation.journal_abbrev J.Biol.Chem. _citation.journal_volume 277 _citation.page_first 16088 _citation.page_last 16095 _citation.year 2002 _citation.journal_id_ASTM JBCHA3 _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0021-9258 _citation.journal_id_CSD 0071 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 11850428 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1074/jbc.M200493200 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Ng, K.K.' 1 ? primary 'Kolatkar, A.R.' 2 ? primary 'Park-Snyder, S.' 3 ? primary 'Feinberg, H.' 4 ? primary 'Clark, D.A.' 5 ? primary 'Drickamer, K.' 6 ? primary 'Weis, W.I.' 7 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'MANNOSE-BINDING PROTEIN A' 16478.674 6 ? ? 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# loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 2 2 MAN C1 O1 1 MAN O3 HO3 sing ? 2 2 3 MAN C1 O1 2 MAN O2 HO2 sing ? 3 2 4 MAN C1 O1 1 MAN O6 HO6 sing ? 4 2 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 5 2 6 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 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P19999 90 ? 238 ? 73 221 3 1 1KX1 C 1 ? 149 ? P19999 90 ? 238 ? 73 221 4 1 1KX1 D 1 ? 149 ? P19999 90 ? 238 ? 73 221 5 1 1KX1 E 1 ? 149 ? P19999 90 ? 238 ? 73 221 6 1 1KX1 F 1 ? 149 ? P19999 90 ? 238 ? 73 221 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 6500 ? 1 MORE -143 ? 1 'SSA (A^2)' 21970 ? 2 'ABSA (A^2)' 6680 ? 2 MORE -141 ? 2 'SSA (A^2)' 21680 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,G,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,CA,DA,EA 2 1 D,E,F,H,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,FA,GA,HA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.pdbx_parent_biol_id _struct_biol.details 1 ? ? 2 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ALA A 1 ? 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LEU E 59 ? PRO E 120 LEU E 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 17 ASN E 68 ? LYS E 80 ? ASN E 140 LYS E 152 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 18 ASP E 128 ? GLY E 130 ? ASP E 200 GLY E 202 5 ? 3 HELX_P HELX_P19 19 ILE F 2 ? MET F 31 ? ILE F 74 MET F 103 1 ? 30 HELX_P HELX_P20 20 PRO F 48 ? LEU F 59 ? PRO F 120 LEU F 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 21 ASN F 68 ? LYS F 80 ? ASN F 140 LYS F 152 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 56 SG ? ? ? 1_555 A CYS 145 SG ? ? A CYS 128 A CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 123 SG ? ? ? 1_555 A CYS 137 SG ? ? A CYS 195 A CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 56 SG ? ? ? 1_555 B CYS 145 SG ? ? B CYS 128 B CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 123 SG ? ? ? 1_555 B CYS 137 SG ? ? B CYS 195 B CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 56 SG ? ? ? 1_555 C CYS 145 SG ? ? C CYS 128 C CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 123 SG ? ? ? 1_555 C CYS 137 SG ? ? C CYS 195 C CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 56 SG ? ? ? 1_555 D CYS 145 SG ? ? D CYS 128 D CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 123 SG ? ? ? 1_555 D CYS 137 SG ? ? D CYS 195 D CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf9 disulf ? ? E CYS 56 SG ? ? ? 1_555 E CYS 145 SG ? ? E CYS 128 E CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf10 disulf ? ? E CYS 123 SG ? ? ? 1_555 E CYS 137 SG ? ? E CYS 195 E CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf11 disulf ? ? F CYS 56 SG ? ? ? 1_555 F CYS 145 SG ? ? F CYS 128 F CYS 217 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf12 disulf ? ? F CYS 123 SG ? ? ? 1_555 F CYS 137 SG ? ? F CYS 195 F CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? covale1 covale both ? G MAN . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G MAN 1 G MAN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? ? covale2 covale both ? G MAN . O6 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G MAN 1 G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? ? covale3 covale both ? G MAN . O2 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G MAN 2 G MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? ? covale4 covale both ? G MAN . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G MAN 4 G MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? covale5 covale both ? G MAN . O6 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G MAN 4 G MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.400 ? ? covale6 covale both ? H MAN . O3 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? H MAN 1 H MAN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? ? covale7 covale both ? H MAN . O6 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? H MAN 1 H MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? ? covale8 covale both ? H MAN . O2 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? H MAN 2 H MAN 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? ? covale9 covale both ? H MAN . O3 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? H MAN 4 H MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale10 covale both ? H MAN . O6 ? ? ? 1_555 H MAN . C1 ? ? H MAN 4 H MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? ? metalc1 metalc ? ? CA HOH . O ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A HOH 8 A CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? ? metalc2 metalc ? ? A ASP 89 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A ASP 161 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? ? metalc3 metalc ? ? A ASP 89 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A ASP 161 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? ? metalc4 metalc ? ? A GLU 93 OE2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A GLU 165 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? ? metalc5 metalc ? ? A GLU 93 OE1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A GLU 165 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.057 ? ? metalc6 metalc ? ? A GLU 93 OE2 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A GLU 165 A CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? ? metalc7 metalc ? ? A GLU 113 OE1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 185 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.116 ? ? metalc8 metalc ? ? A GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 185 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? ? metalc9 metalc ? ? A ASN 115 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASN 187 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? ? metalc10 metalc ? ? A ASN 115 ND2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASN 187 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.315 ? ? metalc11 metalc ? ? A ASP 116 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A ASP 188 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.430 ? ? metalc12 metalc ? ? A GLU 121 O ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A GLU 193 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? ? metalc13 metalc ? ? A GLU 121 OE2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A GLU 193 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? ? metalc14 metalc ? ? A ASP 122 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? A ASP 194 A CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? ? metalc15 metalc ? ? A ASP 122 OD1 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 194 A CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? ? metalc16 metalc ? ? A ASP 122 OD2 ? ? ? 1_555 K CA . CA ? ? A ASP 194 A CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? ? metalc17 metalc ? ? A ASN 133 OD1 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASN 205 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? ? metalc18 metalc ? ? A ASP 134 OD2 ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 206 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? ? metalc19 metalc ? ? A ASP 134 O ? ? ? 1_555 J CA . CA ? ? A ASP 206 A CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? ? metalc20 metalc ? ? J CA . CA ? ? ? 1_555 H MAN . O4 ? ? A CA 223 H MAN 6 1_554 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? ? metalc21 metalc ? ? J CA . CA ? ? ? 1_555 H MAN . O3 ? ? A CA 223 H MAN 6 1_554 ? ? ? ? ? ? ? 3.328 ? ? metalc22 metalc ? ? L MAN . O4 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B MAN 20 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.296 ? ? metalc23 metalc ? ? L MAN . O3 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B MAN 20 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.130 ? ? metalc24 metalc ? ? B ASP 89 OD1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B ASP 161 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.889 ? ? metalc25 metalc ? ? B ASP 89 OD2 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B ASP 161 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.923 ? ? metalc26 metalc ? ? B GLU 93 OE1 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B GLU 165 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? ? metalc27 metalc ? ? B GLU 93 OE2 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B GLU 165 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? ? metalc28 metalc ? ? B GLU 93 OE1 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? B GLU 165 B CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? ? metalc29 metalc ? ? B GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B GLU 185 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.972 ? ? metalc30 metalc ? ? B ASN 115 OD1 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B ASN 187 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? ? metalc31 metalc ? ? B ASP 116 OD2 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B ASP 188 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.970 ? ? metalc32 metalc ? ? B GLU 121 O ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B GLU 193 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? ? metalc33 metalc ? ? B GLU 121 OE2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B GLU 193 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.932 ? ? metalc34 metalc ? ? B ASP 122 OD2 ? ? ? 1_555 M CA . CA ? ? B ASP 194 B CA 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? ? metalc35 metalc ? ? B ASP 122 OD1 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? B ASP 194 B CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? ? metalc36 metalc ? ? B ASP 122 OD2 ? ? ? 1_555 O CA . CA ? ? B ASP 194 B CA 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.810 ? ? metalc37 metalc ? ? B ASN 133 ND2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B ASN 205 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? ? metalc38 metalc ? ? B ASN 133 OD1 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B ASN 205 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? ? metalc39 metalc ? ? B ASP 134 O ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B ASP 206 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? ? metalc40 metalc ? ? B ASP 134 OD2 ? ? ? 1_555 N CA . CA ? ? B ASP 206 B CA 223 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? ? metalc41 metalc ? ? C ASP 89 OD1 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? C ASP 161 C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.079 ? ? metalc42 metalc ? ? C ASP 89 OD2 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? C ASP 161 C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? ? metalc43 metalc ? ? C GLU 93 OE1 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? C GLU 165 C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? ? metalc44 metalc ? ? C GLU 93 OE2 ? ? ? 1_555 R CA . CA ? ? C GLU 165 C CA 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.922 ? ? metalc45 metalc ? ? C GLU 113 OE1 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? C GLU 185 C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.848 ? ? metalc46 metalc ? ? C GLU 113 OE2 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? C GLU 185 C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? ? metalc47 metalc ? ? C ASN 115 OD1 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? C ASN 187 C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? ? metalc48 metalc ? ? C ASP 116 OD2 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? C ASP 188 C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? ? metalc49 metalc ? ? C GLU 121 O ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? C GLU 193 C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? ? metalc50 metalc ? ? C GLU 121 OE2 ? ? ? 1_555 Q CA . CA ? ? C GLU 193 C CA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? ? metalc51 metalc ? ? C ASP 122 OD2 ? ? ? 1_555 P CA . CA ? ? 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