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N-Glycosylation covale6 covale one ? R NAG . C1 ? ? ? 1_555 E ASN 61 ND2 ? ? E NAG 579 E ASN 5079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? U NAG . C1 ? ? ? 1_555 F ASN 61 ND2 ? ? F NAG 679 F ASN 6079 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale8 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NDG . C1 ? ? G NAG 1 G NDG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 11 ? C ? 2 ? D ? 2 ? E ? 3 ? F ? 11 ? G ? 2 ? H ? 2 ? I ? 3 ? J ? 11 ? K ? 2 ? L ? 2 ? M ? 3 ? N ? 11 ? O ? 2 ? P ? 2 ? Q ? 3 ? R ? 11 ? S ? 2 ? T ? 3 ? U ? 11 ? V ? 2 ? 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? 2 4 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Non-polymer description' 3 3 'Structure model' 'Version format compliance' 4 4 'Structure model' Advisory 5 4 'Structure model' 'Atomic model' 6 4 'Structure model' 'Data collection' 7 4 'Structure model' 'Database references' 8 4 'Structure model' 'Derived calculations' 9 4 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' atom_site 2 4 'Structure model' chem_comp 3 4 'Structure model' entity 4 4 'Structure model' pdbx_branch_scheme 5 4 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 6 4 'Structure model' pdbx_entity_branch 7 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_descriptor 8 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_link 9 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_list 10 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 11 4 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 12 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly_gen 13 4 'Structure model' pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms 14 4 'Structure model' struct_asym 15 4 'Structure model' struct_conn 16 4 'Structure model' struct_ref_seq_dif 17 4 'Structure model' struct_site 18 4 'Structure model' struct_site_gen # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_atom_site.B_iso_or_equiv' 2 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 3 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 4 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 5 4 'Structure model' '_atom_site.auth_asym_id' 6 4 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 7 4 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 8 4 'Structure model' '_atom_site.auth_seq_id' 9 4 'Structure model' '_atom_site.label_alt_id' 10 4 'Structure model' '_atom_site.label_asym_id' 11 4 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 12 4 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 13 4 'Structure model' '_atom_site.label_entity_id' 14 4 'Structure model' '_atom_site.occupancy' 15 4 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 16 4 'Structure model' '_chem_comp.name' 17 4 'Structure model' '_chem_comp.type' 18 4 'Structure model' '_entity.formula_weight' 19 4 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 20 4 'Structure model' '_entity.pdbx_number_of_molecules' 21 4 'Structure model' '_entity.src_method' 22 4 'Structure model' '_entity.type' 23 4 'Structure model' '_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list' 24 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_dist_value' 25 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 26 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_role' 27 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id' 28 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 29 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 30 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 31 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 32 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 33 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 34 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id' 35 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 36 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 37 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 38 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 39 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 40 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_seq_id' 41 4 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal MOSFLM 'data reduction' . ? 1 SCALEPACK 'data scaling' . ? 2 AMoRE phasing . ? 3 CNS refinement 1.0 ? 4 # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 300 ;BIOMOLECULE: 1 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 6 CHAIN(S). SEE REMARK 350 FOR INFORMATION ON GENERATING THE BIOLOGICAL MOLECULE(S). The authors have confirmed that human carboxylesterase 1 will form a trimer or hexamer in solution by Atomic Force Microscopy (AFM). They found the ratio of monomer:trimer:hexmer is ~ 10:44:46. 1MX5 is a trimer and 1MX9 is a hexamer. This entry contains a hexamer. The authors found that the trimer:hexmer ratio is dependent on the type and amount of ligands. ; 999 ;SEQUENCE THE AUTHOR'S SEQUENCE HAS NO GLN 362 (CALLED hCEv in: Kroetz DL, McBride OW, Gonzalez FJ.Glycosylation-dependent activity of baculovirus-expressed human liver carboxylesterases: cDNA cloning and characterization of two highly similar enzyme forms. Biochemistry 1993 Nov 2;32(43):11606-17) ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O B SER 2082 ? ? O1A B SIA 282 ? ? 2.09 2 1 O B LEU 2051 ? ? O1A B SIA 282 ? ? 2.13 3 1 O E ASN 5079 ? ? O10 E SIA 582 ? ? 2.16 4 1 O B GLY 2052 ? ? O2 B SIA 282 ? ? 2.17 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 PHE A 1076 ? ? 56.16 -161.89 2 1 ALA A 1080 ? ? -104.49 64.82 3 1 SER A 1113 ? ? -175.74 146.81 4 1 PHE A 1177 ? ? -140.58 13.42 5 1 SER A 1185 ? ? -163.61 80.66 6 1 SER A 1221 ? ? 62.82 -123.51 7 1 SER A 1253 ? ? -29.86 -50.57 8 1 ARG A 1339 ? ? -62.03 64.62 9 1 ASN A 1340 ? ? -107.74 77.45 10 1 THR A 1343 ? ? -86.39 49.16 11 1 TRP A 1357 ? ? -158.00 -56.41 12 1 PHE A 1426 ? ? -125.23 -63.21 13 1 ASP A 1439 ? ? -59.60 -8.85 14 1 ASN A 1521 ? ? -104.78 -156.50 15 1 PHE B 2076 ? ? 56.08 -147.38 16 1 ALA B 2080 ? ? -109.50 68.88 17 1 SER B 2185 ? ? -170.84 77.89 18 1 SER B 2221 ? ? 61.99 -126.85 19 1 SER B 2253 ? ? -38.46 -38.94 20 1 ARG B 2339 ? ? -152.45 51.22 21 1 ASN B 2340 ? ? -140.62 56.85 22 1 TRP B 2357 ? ? -165.32 -58.04 23 1 PHE B 2426 ? ? -124.32 -55.83 24 1 ASN B 2521 ? ? -106.49 -153.18 25 1 PHE C 3076 ? ? -112.11 -131.25 26 1 ALA C 3080 ? ? -114.41 63.74 27 1 SER C 3113 ? ? -170.97 149.67 28 1 LYS C 3129 ? ? -117.09 -156.63 29 1 SER C 3185 ? ? -178.31 79.06 30 1 SER C 3221 ? ? 69.39 -128.84 31 1 TRP C 3357 ? ? -166.48 -57.96 32 1 PHE C 3426 ? ? -124.27 -53.14 33 1 PRO C 3479 ? ? -56.81 -8.56 34 1 ASN C 3521 ? ? -104.51 -153.39 35 1 PRO D 4023 ? ? -48.09 150.77 36 1 PHE D 4076 ? ? 60.54 -154.95 37 1 ALA D 4080 ? ? -107.62 61.38 38 1 ASP D 4090 ? ? -53.27 106.62 39 1 SER D 4113 ? ? -178.48 146.74 40 1 LYS D 4129 ? ? -128.67 -167.46 41 1 PHE D 4177 ? ? -141.58 14.96 42 1 SER D 4185 ? ? -163.59 80.10 43 1 SER D 4221 ? ? 64.75 -120.97 44 1 SER D 4253 ? ? -39.58 -20.46 45 1 ARG D 4339 ? ? -107.27 44.30 46 1 TRP D 4357 ? ? -147.60 -67.10 47 1 LEU D 4368 ? ? -142.87 15.58 48 1 SER D 4369 ? ? -51.92 -5.92 49 1 TYR D 4451 ? ? -172.32 146.56 50 1 ASN D 4521 ? ? -102.84 -144.63 51 1 PHE E 5076 ? ? 65.18 -154.45 52 1 SER E 5185 ? ? -171.00 76.24 53 1 SER E 5221 ? ? 60.93 -120.22 54 1 TRP E 5357 ? ? -158.07 -55.99 55 1 SER E 5369 ? ? -114.21 55.40 56 1 GLU E 5370 ? ? -148.23 -34.77 57 1 LEU E 5373 ? ? -171.57 113.42 58 1 PHE E 5426 ? ? -121.97 -54.72 59 1 ASN E 5521 ? ? -102.48 -153.53 60 1 LYS E 5538 ? ? 62.17 62.83 61 1 PHE F 6076 ? ? -110.35 -128.09 62 1 ALA F 6080 ? ? -110.24 61.28 63 1 LYS F 6129 ? ? -106.16 -161.61 64 1 SER F 6185 ? ? -171.04 78.32 65 1 SER F 6221 ? ? 65.10 -126.61 66 1 GLU F 6338 ? ? -69.23 83.48 67 1 ARG F 6339 ? ? -68.63 61.39 68 1 ASN F 6340 ? ? -169.64 -10.20 69 1 TRP F 6357 ? ? -159.15 -59.73 70 1 PHE F 6426 ? ? -123.95 -51.48 71 1 ALA F 6485 ? ? -178.44 135.90 72 1 ASN F 6521 ? ? -103.49 -150.76 # _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag N _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id F _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id NAG _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id 680 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code ? _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id O1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id ? _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id V _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id NAG _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id 1 _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id O1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A HIS 1019 ? A HIS 1 2 1 Y 1 A PRO 1020 ? A PRO 2 3 1 Y 1 A LYS 1554 ? A LYS 535 4 1 Y 1 A ALA 1555 ? A ALA 536 5 1 Y 1 A VAL 1556 ? A VAL 537 6 1 Y 1 A GLU 1557 ? A GLU 538 7 1 Y 1 A LYS 1558 ? A LYS 539 8 1 Y 1 A PRO 1559 ? A PRO 540 9 1 Y 1 A PRO 1560 ? A PRO 541 10 1 Y 1 A GLN 1561 ? A GLN 542 11 1 Y 1 A THR 1562 ? A THR 543 12 1 Y 1 A GLU 1563 ? A GLU 544 13 1 Y 1 A HIS 1564 ? A HIS 545 14 1 Y 1 A ILE 1565 ? A ILE 546 15 1 Y 1 A GLU 1566 ? A GLU 547 16 1 Y 1 A LEU 1567 ? A LEU 548 17 1 Y 1 B HIS 2019 ? B HIS 1 18 1 Y 1 B PRO 2020 ? B PRO 2 19 1 Y 1 B SER 2021 ? B SER 3 20 1 Y 1 B LYS 2554 ? B LYS 535 21 1 Y 1 B ALA 2555 ? B ALA 536 22 1 Y 1 B VAL 2556 ? B VAL 537 23 1 Y 1 B GLU 2557 ? B GLU 538 24 1 Y 1 B LYS 2558 ? B LYS 539 25 1 Y 1 B PRO 2559 ? B PRO 540 26 1 Y 1 B PRO 2560 ? B PRO 541 27 1 Y 1 B GLN 2561 ? B GLN 542 28 1 Y 1 B THR 2562 ? B THR 543 29 1 Y 1 B GLU 2563 ? B GLU 544 30 1 Y 1 B HIS 2564 ? B HIS 545 31 1 Y 1 B ILE 2565 ? B ILE 546 32 1 Y 1 B GLU 2566 ? 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D GLU 544 64 1 Y 1 D HIS 4564 ? D HIS 545 65 1 Y 1 D ILE 4565 ? D ILE 546 66 1 Y 1 D GLU 4566 ? D GLU 547 67 1 Y 1 D LEU 4567 ? D LEU 548 68 1 Y 1 E HIS 5019 ? E HIS 1 69 1 Y 1 E PRO 5020 ? E PRO 2 70 1 Y 1 E SER 5021 ? E SER 3 71 1 Y 1 E LYS 5554 ? E LYS 535 72 1 Y 1 E ALA 5555 ? E ALA 536 73 1 Y 1 E VAL 5556 ? E VAL 537 74 1 Y 1 E GLU 5557 ? E GLU 538 75 1 Y 1 E LYS 5558 ? E LYS 539 76 1 Y 1 E PRO 5559 ? E PRO 540 77 1 Y 1 E PRO 5560 ? E PRO 541 78 1 Y 1 E GLN 5561 ? E GLN 542 79 1 Y 1 E THR 5562 ? E THR 543 80 1 Y 1 E GLU 5563 ? E GLU 544 81 1 Y 1 E HIS 5564 ? E HIS 545 82 1 Y 1 E ILE 5565 ? E ILE 546 83 1 Y 1 E GLU 5566 ? E GLU 547 84 1 Y 1 E LEU 5567 ? E LEU 548 85 1 Y 1 F HIS 6019 ? F HIS 1 86 1 Y 1 F PRO 6020 ? F PRO 2 87 1 Y 1 F SER 6021 ? F SER 3 88 1 Y 1 F LYS 6554 ? F LYS 535 89 1 Y 1 F ALA 6555 ? F ALA 536 90 1 Y 1 F VAL 6556 ? F VAL 537 91 1 Y 1 F GLU 6557 ? F GLU 538 92 1 Y 1 F LYS 6558 ? F LYS 539 93 1 Y 1 F PRO 6559 ? F PRO 540 94 1 Y 1 F PRO 6560 ? 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F LEU 548 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero G 2 NAG 1 G NAG 1 C NAG 379 n G 2 NDG 2 G NDG 2 C NAG 380 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc NDG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAca NDG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-a-D-glucopyranosamine NDG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-GlcpNAc NDG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc SIA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DNeup5Aca SIA 'COMMON NAME' GMML 1.0 'N-acetyl-a-D-neuraminic acid' SIA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Neup5Ac SIA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Neu5Ac # _pdbx_entity_branch.entity_id 2 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 2 DGlcpNAca1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 2 'WURCS=2.0/2,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a2122h-1a_1-5_2*NCC/3=O]/1-2/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 2 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][a-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NDG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 2 NAG 1 n 2 NDG 2 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 4 'N-acetyl-alpha-neuraminic acid' SIA 5 TACRINE THA 6 water HOH #