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C4 A U 6 ? ? 122.65 127.00 -4.35 0.60 N 56 1 C5 A U 6 ? ? C4 A U 6 ? ? O4 A U 6 ? ? 119.87 125.90 -6.03 0.60 N 57 1 OP1 A G 7 ? ? P A G 7 ? ? OP2 A G 7 ? ? 107.77 119.60 -11.83 1.50 N 58 1 C2 A G 7 ? ? N3 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 120.83 111.90 8.93 0.50 N 59 1 N3 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? C5 A G 7 ? ? 119.19 128.60 -9.41 0.50 N 60 1 C5 A G 7 ? ? C6 A G 7 ? ? N1 A G 7 ? ? 115.19 111.50 3.69 0.50 N 61 1 C4 A G 7 ? ? C5 A G 7 ? ? N7 A G 7 ? ? 101.43 110.80 -9.37 0.40 N 62 1 C5 A G 7 ? ? N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? 108.97 104.30 4.67 0.50 N 63 1 N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? C5 A G 7 ? ? 111.55 105.40 6.15 0.40 N 64 1 C6 A G 7 ? ? C5 A G 7 ? ? N7 A G 7 ? ? 138.11 130.40 7.71 0.60 N 65 1 N1 A G 7 ? ? C6 A G 7 ? ? O6 A G 7 ? ? 124.63 119.90 4.73 0.60 N 66 1 C5 A G 7 ? ? C6 A G 7 ? ? O6 A G 7 ? ? 120.18 128.60 -8.42 0.60 N 67 1 "C3'" A G 7 ? ? "O3'" A G 7 ? ? P A A 8 ? ? 133.40 119.70 13.70 1.20 Y 68 1 OP1 A A 8 ? ? P A A 8 ? ? OP2 A A 8 ? ? 108.95 119.60 -10.65 1.50 N 69 1 N1 A A 8 ? ? C2 A A 8 ? ? N3 A A 8 ? ? 122.29 129.30 -7.01 0.50 N 70 1 C2 A A 8 ? ? N3 A A 8 ? ? C4 A A 8 ? ? 118.21 110.60 7.61 0.50 N 71 1 N3 A A 8 ? ? C4 A A 8 ? ? C5 A A 8 ? ? 119.05 126.80 -7.75 0.70 N 72 1 C4 A A 8 ? ? C5 A A 8 ? ? C6 A A 8 ? ? 122.77 117.00 5.77 0.50 N 73 1 C4 A A 8 ? ? C5 A A 8 ? ? N7 A A 8 ? ? 105.81 110.70 -4.89 0.50 N 74 1 C5 A A 8 ? ? N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? 109.65 103.90 5.75 0.50 N 75 1 N3 A A 8 ? ? C4 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 134.92 127.40 7.52 0.80 N 76 1 N1 A A 8 ? ? C6 A A 8 ? ? N6 A A 8 ? ? 124.07 118.60 5.47 0.60 N 77 1 OP1 A C 9 ? ? P A C 9 ? ? OP2 A C 9 ? ? 109.88 119.60 -9.72 1.50 N 78 1 "O4'" A C 9 ? ? "C1'" A C 9 ? ? N1 A C 9 ? ? 113.78 108.50 5.28 0.70 N 79 1 N3 A C 9 ? ? C4 A C 9 ? ? C5 A C 9 ? ? 116.40 121.90 -5.50 0.40 N 80 1 C4 A C 9 ? ? C5 A C 9 ? ? C6 A C 9 ? ? 121.27 117.40 3.87 0.50 N 81 1 N1 A C 9 ? ? C2 A C 9 ? ? O2 A C 9 ? ? 123.18 118.90 4.28 0.60 N 82 1 N3 A C 9 ? ? C2 A C 9 ? ? O2 A C 9 ? ? 116.15 121.90 -5.75 0.70 N 83 1 N3 A C 9 ? ? C4 A C 9 ? ? N4 A C 9 ? ? 122.33 118.00 4.33 0.70 N 84 1 OP1 A G 10 ? ? P A G 10 ? ? OP2 A G 10 ? ? 109.99 119.60 -9.61 1.50 N 85 1 "C5'" A G 10 ? ? "C4'" A G 10 ? ? "O4'" A G 10 ? ? 117.72 109.80 7.92 0.90 N 86 1 "C2'" A G 10 ? ? "C3'" A G 10 ? ? "O3'" A G 10 ? ? 123.30 113.70 9.60 1.60 N 87 1 C2 A G 10 ? ? N3 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 120.54 111.90 8.64 0.50 N 88 1 N3 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? C5 A G 10 ? ? 118.47 128.60 -10.13 0.50 N 89 1 C4 A G 10 ? ? C5 A G 10 ? ? N7 A G 10 ? ? 101.39 110.80 -9.41 0.40 N 90 1 C5 A G 10 ? ? N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? 108.69 104.30 4.39 0.50 N 91 1 N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? C5 A G 10 ? ? 111.91 105.40 6.51 0.40 N 92 1 N3 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 129.62 126.00 3.62 0.60 N 93 1 C6 A G 10 ? ? C5 A G 10 ? ? N7 A G 10 ? ? 136.93 130.40 6.53 0.60 N 94 1 N1 A G 10 ? ? C6 A G 10 ? ? O6 A G 10 ? ? 125.13 119.90 5.23 0.60 N 95 1 C5 A G 10 ? ? C6 A G 10 ? ? O6 A G 10 ? ? 120.59 128.60 -8.01 0.60 N 96 1 "C3'" A G 10 ? ? "O3'" A G 10 ? ? P A A 11 ? ? 142.96 119.70 23.26 1.20 Y 97 1 OP1 A A 11 ? ? P A A 11 ? ? OP2 A A 11 ? ? 107.87 119.60 -11.73 1.50 N 98 1 N1 A A 11 ? ? C2 A A 11 ? ? N3 A A 11 ? ? 122.58 129.30 -6.72 0.50 N 99 1 C2 A A 11 ? ? N3 A A 11 ? ? C4 A A 11 ? ? 116.83 110.60 6.23 0.50 N 100 1 N3 A A 11 ? ? C4 A A 11 ? ? C5 A A 11 ? ? 118.07 126.80 -8.73 0.70 N 101 1 C4 A A 11 ? ? C5 A A 11 ? ? C6 A A 11 ? ? 124.05 117.00 7.05 0.50 N 102 1 C5 A A 11 ? ? C6 A A 11 ? ? N1 A A 11 ? ? 113.73 117.70 -3.97 0.50 N 103 1 C4 A A 11 ? ? C5 A A 11 ? ? N7 A A 11 ? ? 105.58 110.70 -5.12 0.50 N 104 1 C5 A A 11 ? ? N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? 109.42 103.90 5.52 0.50 N 105 1 N3 A A 11 ? ? C4 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 135.46 127.40 8.06 0.80 N 106 1 N1 A A 11 ? ? C6 A A 11 ? ? N6 A A 11 ? ? 125.64 118.60 7.04 0.60 N 107 1 OP1 A U 12 ? ? P A U 12 ? ? OP2 A U 12 ? ? 107.11 119.60 -12.49 1.50 N 108 1 "C3'" A U 12 ? ? "C2'" A U 12 ? ? "C1'" A U 12 ? ? 106.34 101.50 4.84 0.80 N 109 1 "O4'" A U 12 ? ? "C1'" A U 12 ? ? N1 A U 12 ? ? 118.63 108.50 10.13 0.70 N 110 1 N1 A U 12 ? ? C2 A U 12 ? ? N3 A U 12 ? ? 120.07 114.90 5.17 0.60 N 111 1 C2 A U 12 ? ? N3 A U 12 ? ? C4 A U 12 ? ? 122.10 127.00 -4.90 0.60 N 112 1 C5 A U 12 ? ? C4 A U 12 ? ? O4 A U 12 ? ? 120.58 125.90 -5.32 0.60 N 113 1 OP1 A C 13 ? ? P A C 13 ? ? OP2 A C 13 ? ? 108.12 119.60 -11.48 1.50 N 114 1 P A C 13 ? ? "O5'" A C 13 ? ? "C5'" A C 13 ? ? 133.67 120.90 12.77 1.60 N 115 1 "O4'" A C 13 ? ? "C1'" A C 13 ? ? N1 A C 13 ? ? 121.16 108.50 12.66 0.70 N 116 1 C6 A C 13 ? ? N1 A C 13 ? ? C2 A C 13 ? ? 117.12 120.30 -3.18 0.40 N 117 1 N3 A C 13 ? ? C4 A C 13 ? ? C5 A C 13 ? ? 116.21 121.90 -5.69 0.40 N 118 1 C4 A C 13 ? ? C5 A C 13 ? ? C6 A C 13 ? ? 120.58 117.40 3.18 0.50 N 119 1 N3 A C 13 ? ? C2 A C 13 ? ? O2 A C 13 ? ? 117.22 121.90 -4.68 0.70 N 120 1 N3 A C 13 ? ? C4 A C 13 ? ? N4 A C 13 ? ? 122.83 118.00 4.83 0.70 N 121 1 "C3'" A C 13 ? ? "O3'" A C 13 ? ? P A A 14 ? ? 129.80 119.70 10.10 1.20 Y 122 1 OP1 A A 14 ? ? P A A 14 ? ? OP2 A A 14 ? ? 105.44 119.60 -14.16 1.50 N 123 1 N9 A A 14 ? ? "C1'" A A 14 ? ? "C2'" A A 14 ? ? 103.19 112.00 -8.81 1.10 N 124 1 "O4'" A A 14 ? ? "C1'" A A 14 ? ? N9 A A 14 ? ? 115.34 108.50 6.84 0.70 N 125 1 N1 A A 14 ? ? C2 A A 14 ? ? N3 A A 14 ? ? 122.60 129.30 -6.70 0.50 N 126 1 C2 A A 14 ? ? N3 A A 14 ? ? C4 A A 14 ? ? 117.96 110.60 7.36 0.50 N 127 1 N3 A A 14 ? ? C4 A A 14 ? ? C5 A A 14 ? ? 119.67 126.80 -7.13 0.70 N 128 1 C4 A A 14 ? ? C5 A A 14 ? ? C6 A A 14 ? ? 122.52 117.00 5.52 0.50 N 129 1 C4 A A 14 ? ? C5 A A 14 ? ? N7 A A 14 ? ? 106.15 110.70 -4.55 0.50 N 130 1 C5 A A 14 ? ? N7 A A 14 ? ? C8 A A 14 ? ? 109.55 103.90 5.65 0.50 N 131 1 N7 A A 14 ? ? C8 A A 14 ? ? N9 A A 14 ? ? 110.66 113.80 -3.14 0.50 N 132 1 N3 A A 14 ? ? C4 A A 14 ? ? N9 A A 14 ? ? 134.78 127.40 7.38 0.80 N 133 1 N1 A A 14 ? ? C6 A A 14 ? ? N6 A A 14 ? ? 125.37 118.60 6.77 0.60 N 134 1 C5 A A 14 ? ? C6 A A 14 ? ? N6 A A 14 ? ? 118.88 123.70 -4.82 0.80 N 135 1 "O4'" A C 15 ? ? "C4'" A C 15 ? ? "C3'" A C 15 ? ? 97.71 104.00 -6.29 1.00 N 136 1 "C5'" A C 15 ? ? "C4'" A C 15 ? ? "O4'" A C 15 ? ? 116.73 109.80 6.93 0.90 N 137 1 N1 A C 15 ? ? "C1'" A C 15 ? ? "C2'" A C 15 ? ? 105.35 112.00 -6.65 1.10 N 138 1 "O4'" A C 15 ? ? "C1'" A C 15 ? ? N1 A C 15 ? ? 116.98 108.50 8.48 0.70 N 139 1 N3 A C 15 ? ? C4 A C 15 ? ? C5 A C 15 ? ? 115.97 121.90 -5.93 0.40 N 140 1 C4 A C 15 ? ? C5 A C 15 ? ? C6 A C 15 ? ? 121.57 117.40 4.17 0.50 N 141 1 N3 A C 15 ? ? C2 A C 15 ? ? O2 A C 15 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 142 1 OP1 A G 16 ? ? P A G 16 ? ? OP2 A G 16 ? ? 109.63 119.60 -9.97 1.50 N 143 1 C2 A G 16 ? ? N3 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? 120.86 111.90 8.96 0.50 N 144 1 N3 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? C5 A G 16 ? ? 118.72 128.60 -9.88 0.50 N 145 1 C5 A G 16 ? ? C6 A G 16 ? ? N1 A G 16 ? ? 115.90 111.50 4.40 0.50 N 146 1 C4 A G 16 ? ? C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? 101.69 110.80 -9.11 0.40 N 147 1 C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? C8 A G 16 ? ? 109.02 104.30 4.72 0.50 N 148 1 N9 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? C5 A G 16 ? ? 111.24 105.40 5.84 0.40 N 149 1 N3 A G 16 ? ? C4 A G 16 ? ? N9 A G 16 ? ? 130.05 126.00 4.05 0.60 N 150 1 C6 A G 16 ? ? C5 A G 16 ? ? N7 A G 16 ? ? 137.66 130.40 7.26 0.60 N 151 1 N1 A G 16 ? ? C6 A G 16 ? ? O6 A G 16 ? ? 125.05 119.90 5.15 0.60 N 152 1 C5 A G 16 ? ? C6 A G 16 ? ? O6 A G 16 ? ? 119.04 128.60 -9.56 0.60 N 153 1 OP1 A C 17 ? ? P A C 17 ? ? OP2 A C 17 ? ? 109.90 119.60 -9.70 1.50 N 154 1 N3 A C 17 ? ? C4 A C 17 ? ? C5 A C 17 ? ? 116.41 121.90 -5.49 0.40 N 155 1 C4 A C 17 ? ? C5 A C 17 ? ? C6 A C 17 ? ? 120.79 117.40 3.39 0.50 N 156 1 N1 A C 17 ? ? C2 A C 17 ? ? O2 A C 17 ? ? 122.89 118.90 3.99 0.60 N 157 1 N3 A C 17 ? ? C2 A C 17 ? ? O2 A C 17 ? ? 116.45 121.90 -5.45 0.70 N 158 1 N3 A C 17 ? ? C4 A C 17 ? ? N4 A C 17 ? ? 122.79 118.00 4.79 0.70 N 159 1 OP1 A A 18 ? ? P A A 18 ? ? OP2 A A 18 ? ? 109.58 119.60 -10.02 1.50 N 160 1 "O4'" A A 18 ? ? "C1'" A A 18 ? ? N9 A A 18 ? ? 113.46 108.50 4.96 0.70 N 161 1 C6 A A 18 ? ? N1 A A 18 ? ? 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O4 A U 24 ? ? 119.50 125.90 -6.40 0.60 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 A A 4 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 2 1 A A 8 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 3 1 A A 11 ? ? 0.139 'SIDE CHAIN' 4 1 C A 13 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1RHT 'double helix' 1RHT 'bulge loop' 1RHT 'mismatched base pair' 1RHT 'triple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 2 1_555 A U 22 1_555 -2.180 -1.724 1.768 -19.272 -3.912 -3.965 1 A_G2:U22_A A 2 ? 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A 15 ? ? 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 2 1_555 A U 22 1_555 A G 3 1_555 A C 21 1_555 0.598 -0.155 3.490 2.915 13.304 33.547 -2.259 -0.525 3.240 21.959 -4.810 36.132 1 AA_G2G3:C21U22_AA A 2 ? A 22 ? A 3 ? A 21 ? 1 A G 3 1_555 A C 21 1_555 A A 4 1_555 A U 20 1_555 0.267 -3.047 3.773 5.945 -0.671 -2.944 29.141 28.325 1.122 7.161 63.418 -6.667 2 AA_G3A4:U20C21_AA A 3 ? A 21 ? A 4 ? A 20 ? 1 A A 4 1_555 A U 20 1_555 A C 5 1_555 A G 19 1_555 -1.023 -0.322 2.878 -2.255 3.335 47.842 -0.628 1.100 2.893 4.104 2.774 48.001 3 AA_A4C5:G19U20_AA A 4 ? A 20 ? A 5 ? A 19 ? 1 A C 5 1_555 A G 19 1_555 A U 6 1_555 A A 18 1_555 -0.342 -1.219 3.118 -3.948 29.996 10.148 -6.125 0.108 -0.098 71.270 9.380 31.873 4 AA_C5U6:A18G19_AA A 5 ? A 19 ? A 6 ? A 18 ? 1 A U 6 1_555 A A 18 1_555 A G 7 1_555 A C 17 1_555 1.648 -2.534 2.723 6.813 17.052 8.666 -11.056 -3.135 -0.405 60.310 -24.098 20.289 5 AA_U6G7:C17A18_AA A 6 ? A 18 ? A 7 ? A 17 ? 1 A G 7 1_555 A C 17 1_555 A C 9 1_555 A G 16 1_555 -1.997 -0.355 4.347 11.890 13.178 59.338 -1.128 2.653 3.778 12.999 -11.728 61.704 6 AA_G7C9:G16C17_AA A 7 ? A 17 ? A 9 ? A 16 ? 1 A C 9 1_555 A G 16 1_555 A G 10 1_555 A C 15 1_555 -0.370 -1.905 2.736 0.790 26.284 4.043 -6.491 0.874 -1.473 81.376 -2.445 26.600 7 AA_C9G10:C15G16_AA A 9 ? A 16 ? A 10 ? A 15 ? #