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'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MSE 'L-peptide linking' n SELENOMETHIONINE ? 'C5 H11 N O2 Se' 196.106 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1XF1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.67 _exptl_crystal.density_percent_sol 54.00 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION' _exptl_crystal_grow.temp 291 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 4.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, , temperature 291K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol MAD _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.000 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'NSLS BEAMLINE X25' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site NSLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X25 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.000 # _reflns.entry_id 1XF1 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.d_resolution_high 1.9 _reflns.d_resolution_low 50 _reflns.number_all ? _reflns.number_obs 171036 _reflns.percent_possible_obs 99.8 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy ? _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 1XF1 _refine.ls_d_res_high 1.9 _refine.ls_d_res_low 50 _refine.pdbx_ls_sigma_F 3 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_number_reflns_all 171293 _refine.ls_number_reflns_obs 171036 _refine.ls_number_reflns_R_free 8618 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.229 _refine.ls_R_factor_R_free 0.269 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 0.05 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct MAD _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'Engh & Huber' _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.details ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 14364 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 88 _refine_hist.number_atoms_solvent 1057 _refine_hist.number_atoms_total 15509 _refine_hist.d_res_high 1.9 _refine_hist.d_res_low 50 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function o_bond_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_angle_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_dihedral_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_improper_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_mcbond_it 1.49 ? 1.5 ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_mcangle_it 2.398 ? 2.0 ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_scbond_it 2.317 ? 2.0 ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? o_scangle_it 3.324 ? 2.5 ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _struct.entry_id 1XF1 _struct.title 'Structure of C5a peptidase- a key virulence factor from Streptococcus' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1XF1 _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE _struct_keywords.text 'C5a peptidase, hydrolase' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 4 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 5 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 VAL A 6 ? GLY A 14 ? VAL A 111 GLY A 119 1 ? 9 HELX_P HELX_P2 2 GLN A 46 ? GLU A 57 ? GLN A 151 GLU A 162 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 3 THR A 90 ? ILE A 95 ? THR A 195 ILE A 200 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 4 GLY A 129 ? LEU A 147 ? GLY A 234 LEU A 252 1 ? 19 HELX_P HELX_P5 5 PRO A 167 ? LYS A 180 ? PRO A 272 LYS A 285 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 6 ASP A 292 ? ALA A 303 ? ASP A 397 ALA A 408 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 7 SER A 334 ? ASN A 344 ? SER A 439 ASN A 449 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 8 MSE A 408 ? GLN A 427 ? MSE A 513 GLN A 532 1 ? 20 HELX_P HELX_P9 9 MSE A 431 ? ALA A 448 ? MSE A 536 ALA A 553 1 ? 18 HELX_P HELX_P10 10 GLU A 454 ? LYS A 457 ? GLU A 559 LYS A 562 5 ? 4 HELX_P HELX_P11 11 SER A 461 ? GLY A 466 ? SER A 566 GLY A 571 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 12 ASP A 471 ? ALA A 478 ? ASP A 576 ALA A 583 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 13 PHE A 567 ? MSE A 575 ? PHE A 672 MSE A 680 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 14 ASP A 607 ? LEU A 611 ? ASP A 712 LEU A 716 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 15 PRO A 617 ? SER A 621 ? PRO A 722 SER A 726 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 16 PRO A 662 ? GLY A 672 ? PRO A 767 GLY A 777 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 17 GLU A 779 ? ARG A 782 ? GLU A 884 ARG A 887 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 18 LYS A 899 ? ASP A 902 ? LYS A 1004 ASP A 1007 5 ? 4 HELX_P HELX_P19 19 VAL A 919 ? GLU A 924 ? VAL A 1024 GLU A 1029 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 20 VAL B 6 ? GLY B 14 ? VAL B 111 GLY B 119 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 21 SER B 47 ? HIS B 58 ? SER B 152 HIS B 163 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 22 GLN B 86 ? ILE B 95 ? GLN B 191 ILE B 200 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 23 GLY B 129 ? LEU B 147 ? GLY B 234 LEU B 252 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 24 PRO B 167 ? LYS B 180 ? PRO B 272 LYS B 285 1 ? 14 HELX_P HELX_P25 25 GLU B 273 ? LYS B 277 ? GLU B 378 LYS B 382 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 ASP B 292 ? ALA B 303 ? ASP B 397 ALA B 408 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 27 SER B 334 ? LYS B 342 ? SER B 439 LYS B 447 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 28 MSE B 408 ? TYR B 428 ? MSE B 513 TYR B 533 1 ? 21 HELX_P HELX_P29 29 THR B 432 ? ALA B 448 ? THR B 537 ALA B 553 1 ? 17 HELX_P HELX_P30 30 SER B 461 ? GLY B 466 ? SER B 566 GLY B 571 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 31 ASP B 471 ? ALA B 478 ? ASP B 576 ALA B 583 1 ? 8 HELX_P HELX_P32 32 PHE B 567 ? MSE B 575 ? PHE B 672 MSE B 680 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 33 PRO B 617 ? SER B 621 ? 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VAL B 1024 GLU B 1029 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A ALA 113 C ? ? ? 1_555 A MSE 114 N ? ? A ALA 218 A MSE 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale2 covale both ? A MSE 114 C ? ? ? 1_555 A PRO 115 N ? ? A MSE 219 A PRO 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale3 covale both ? A LEU 121 C ? ? ? 1_555 A MSE 122 N ? ? A LEU 226 A MSE 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale4 covale both ? A MSE 122 C ? ? ? 1_555 A ARG 123 N ? ? A MSE 227 A ARG 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale5 covale both ? A ASN 153 C ? ? ? 1_555 A MSE 154 N ? ? A ASN 258 A MSE 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale6 covale both ? A MSE 154 C ? ? ? 1_555 A SER 155 N ? ? A MSE 259 A SER 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale7 covale both ? A GLU 247 C ? ? ? 1_555 A MSE 248 N ? ? A GLU 352 A MSE 353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale8 covale both ? A MSE 248 C ? ? ? 1_555 A PRO 249 N ? ? A MSE 353 A PRO 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? ? covale9 covale both ? A GLN 327 C ? ? ? 1_555 A MSE 328 N ? ? A GLN 432 A MSE 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale10 covale both ? A MSE 328 C ? ? ? 1_555 A PRO 329 N ? ? A MSE 433 A PRO 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale11 covale both ? A SER 407 C ? ? ? 1_555 A MSE 408 N ? ? A SER 512 A MSE 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale12 covale both ? A MSE 408 C ? ? ? 1_555 A SER 409 N ? ? A MSE 513 A SER 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale13 covale both ? A ILE 416 C ? ? ? 1_555 A MSE 417 N ? ? A ILE 521 A MSE 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale14 covale both ? A MSE 417 C ? ? ? 1_555 A GLY 418 N ? ? A MSE 522 A GLY 523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale15 covale both ? A ASP 430 C ? ? ? 1_555 A MSE 431 N ? ? A ASP 535 A MSE 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale16 covale both ? A MSE 431 C ? ? ? 1_555 A THR 432 N ? ? A MSE 536 A THR 537 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale17 covale both ? A LEU 444 C ? ? ? 1_555 A MSE 445 N ? ? A LEU 549 A MSE 550 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale18 covale both ? A MSE 445 C ? ? ? 1_555 A SER 446 N ? ? A MSE 550 A SER 551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale19 covale both ? A THR 479 C ? ? ? 1_555 A MSE 480 N ? ? A THR 584 A MSE 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale20 covale both ? A MSE 480 C ? ? ? 1_555 A TYR 481 N ? ? A MSE 585 A TYR 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale21 covale both ? A GLN 574 C ? ? ? 1_555 A MSE 575 N ? ? A GLN 679 A MSE 680 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale22 covale both ? A MSE 575 C ? ? ? 1_555 A LYS 576 N ? ? A MSE 680 A LYS 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale23 covale both ? A LEU 596 C ? ? ? 1_555 A MSE 597 N ? ? A LEU 701 A MSE 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale24 covale both ? A MSE 597 C ? ? ? 1_555 A SER 598 N ? ? A MSE 702 A SER 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale25 covale both ? A TYR 863 C ? ? ? 1_555 A MSE 864 N ? ? A TYR 968 A MSE 969 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale26 covale both ? A MSE 864 C ? ? ? 1_555 A ASP 865 N ? ? A MSE 969 A ASP 970 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale27 covale both ? A THR 890 C ? ? ? 1_555 A MSE 891 N ? ? A THR 995 A MSE 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale28 covale both ? A MSE 891 C ? ? ? 1_555 A GLU 892 N ? ? A MSE 996 A GLU 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale29 covale both ? A LYS 899 C ? ? ? 1_555 A MSE 900 N ? ? A LYS 1004 A MSE 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale30 covale both ? A MSE 900 C ? ? ? 1_555 A SER 901 N ? ? A MSE 1005 A SER 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale31 covale both ? A ASP 909 C ? ? ? 1_555 A MSE 910 N ? ? A ASP 1014 A MSE 1015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale32 covale both ? A MSE 910 C ? ? ? 1_555 A ALA 911 N ? ? A MSE 1015 A ALA 1016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale33 covale both ? B ALA 113 C ? ? ? 1_555 B MSE 114 N ? ? B ALA 218 B MSE 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale34 covale both ? B MSE 114 C ? ? ? 1_555 B PRO 115 N ? ? B MSE 219 B PRO 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? ? covale35 covale both ? B LEU 121 C ? ? ? 1_555 B MSE 122 N ? ? B LEU 226 B MSE 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale36 covale both ? B MSE 122 C ? ? ? 1_555 B ARG 123 N ? ? B MSE 227 B ARG 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale37 covale both ? B ASN 153 C ? ? ? 1_555 B MSE 154 N ? ? B ASN 258 B MSE 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale38 covale both ? B MSE 154 C ? ? ? 1_555 B SER 155 N ? ? B MSE 259 B SER 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale39 covale both ? B GLU 247 C ? ? ? 1_555 B MSE 248 N ? ? B GLU 352 B MSE 353 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale40 covale both ? B MSE 248 C ? ? ? 1_555 B PRO 249 N ? ? B MSE 353 B PRO 354 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.344 ? ? covale41 covale both ? B GLN 327 C ? ? ? 1_555 B MSE 328 N ? ? B GLN 432 B MSE 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale42 covale both ? B MSE 328 C ? ? ? 1_555 B PRO 329 N ? ? B MSE 433 B PRO 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? ? covale43 covale both ? B SER 407 C ? ? ? 1_555 B MSE 408 N ? ? B SER 512 B MSE 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale44 covale both ? B MSE 408 C ? ? ? 1_555 B SER 409 N ? ? B MSE 513 B SER 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale45 covale both ? B ILE 416 C ? ? ? 1_555 B MSE 417 N ? ? B ILE 521 B MSE 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale46 covale both ? B MSE 417 C ? ? ? 1_555 B GLY 418 N ? ? B MSE 522 B GLY 523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale47 covale both ? B ASP 430 C ? ? ? 1_555 B MSE 431 N ? ? B ASP 535 B MSE 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale48 covale both ? B MSE 431 C ? ? ? 1_555 B THR 432 N ? ? B MSE 536 B THR 537 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale49 covale both ? B LEU 444 C ? ? ? 1_555 B MSE 445 N ? ? B LEU 549 B MSE 550 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale50 covale both ? B MSE 445 C ? ? ? 1_555 B SER 446 N ? ? B MSE 550 B SER 551 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale51 covale both ? B THR 479 C ? ? ? 1_555 B MSE 480 N ? ? B THR 584 B MSE 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale52 covale both ? B MSE 480 C ? ? ? 1_555 B TYR 481 N ? ? B MSE 585 B TYR 586 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale53 covale both ? B GLN 574 C ? ? ? 1_555 B MSE 575 N ? ? B GLN 679 B MSE 680 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale54 covale both ? B MSE 575 C ? ? ? 1_555 B LYS 576 N ? ? B MSE 680 B LYS 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale55 covale both ? B LEU 596 C ? ? ? 1_555 B MSE 597 N ? ? B LEU 701 B MSE 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale56 covale both ? B MSE 597 C ? ? ? 1_555 B SER 598 N ? ? B MSE 702 B SER 703 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale57 covale both ? B TYR 863 C ? ? ? 1_555 B MSE 864 N ? ? B TYR 968 B MSE 969 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale58 covale both ? B MSE 864 C ? ? ? 1_555 B ASP 865 N ? ? B MSE 969 B ASP 970 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale59 covale both ? B THR 890 C ? ? ? 1_555 B MSE 891 N ? ? B THR 995 B MSE 996 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale60 covale both ? B MSE 891 C ? ? ? 1_555 B GLU 892 N ? ? B MSE 996 B GLU 997 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale61 covale both ? B LYS 899 C ? ? ? 1_555 B MSE 900 N ? ? B LYS 1004 B MSE 1005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale62 covale both ? B MSE 900 C ? ? ? 1_555 B SER 901 N ? ? B MSE 1005 B SER 1006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale63 covale both ? B ASP 909 C ? ? ? 1_555 B MSE 910 N ? ? B ASP 1014 B MSE 1015 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale64 covale both ? B MSE 910 C ? ? ? 1_555 B ALA 911 N ? ? B MSE 1015 B ALA 1016 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? metalc1 metalc ? ? A SER 717 OG ? ? ? 1_555 D CA . CA ? ? A SER 822 A CA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? ? metalc2 metalc ? ? A SER 717 O ? ? ? 1_555 D CA . CA ? ? A SER 822 A CA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? ? metalc3 metalc ? ? A ASN 719 OD1 ? ? ? 1_555 D CA . CA ? ? A ASN 824 A CA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? ? metalc4 metalc ? ? A ASP 721 OD2 ? ? ? 1_555 D CA . CA ? ? A ASP 826 A CA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? ? metalc5 metalc ? ? A ASN 723 O ? ? ? 1_555 D CA . CA ? ? A ASN 828 A CA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? ? metalc6 metalc ? ? A ASP 725 OD1 ? ? ? 1_555 D CA . CA ? ? A ASP 830 A CA 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? ? metalc7 metalc ? ? D CA . CA ? ? ? 1_555 M HOH . O ? ? A CA 1109 A HOH 1264 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? ? metalc8 metalc ? ? B SER 717 OG ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? B SER 822 B CA 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? ? metalc9 metalc ? ? B SER 717 O ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? B SER 822 B CA 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? ? metalc10 metalc ? ? B ASN 719 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? B ASN 824 B CA 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.650 ? ? metalc11 metalc ? ? B ASP 721 OD2 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? B ASP 826 B CA 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? ? metalc12 metalc ? ? B ASN 723 O ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? B ASN 828 B CA 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? ? metalc13 metalc ? ? B ASP 725 OD1 ? ? ? 1_555 I CA . CA ? ? B ASP 830 B CA 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? ? metalc14 metalc ? ? I CA . CA ? ? ? 1_555 N HOH . O ? ? B CA 1110 B HOH 1390 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id LYS _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 847 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id A _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id LYS _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 952 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id A _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 848 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 953 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 A _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -0.32 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 7 ? B ? 9 ? 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MET SELENOMETHIONINE 7 A MSE 417 A MSE 522 ? MET SELENOMETHIONINE 8 A MSE 431 A MSE 536 ? MET SELENOMETHIONINE 9 A MSE 445 A MSE 550 ? MET SELENOMETHIONINE 10 A MSE 480 A MSE 585 ? MET SELENOMETHIONINE 11 A MSE 575 A MSE 680 ? MET SELENOMETHIONINE 12 A MSE 597 A MSE 702 ? MET SELENOMETHIONINE 13 A MSE 864 A MSE 969 ? MET SELENOMETHIONINE 14 A MSE 891 A MSE 996 ? MET SELENOMETHIONINE 15 A MSE 900 A MSE 1005 ? MET SELENOMETHIONINE 16 A MSE 910 A MSE 1015 ? MET SELENOMETHIONINE 17 B MSE 114 B MSE 219 ? MET SELENOMETHIONINE 18 B MSE 122 B MSE 227 ? MET SELENOMETHIONINE 19 B MSE 154 B MSE 259 ? MET SELENOMETHIONINE 20 B MSE 248 B MSE 353 ? MET SELENOMETHIONINE 21 B MSE 328 B MSE 433 ? MET SELENOMETHIONINE 22 B MSE 408 B MSE 513 ? MET SELENOMETHIONINE 23 B MSE 417 B MSE 522 ? MET SELENOMETHIONINE 24 B MSE 431 B MSE 536 ? MET SELENOMETHIONINE 25 B MSE 445 B MSE 550 ? MET SELENOMETHIONINE 26 B MSE 480 B MSE 585 ? MET SELENOMETHIONINE 27 B MSE 575 B MSE 680 ? MET SELENOMETHIONINE 28 B MSE 597 B MSE 702 ? MET SELENOMETHIONINE 29 B MSE 864 B MSE 969 ? MET SELENOMETHIONINE 30 B MSE 891 B MSE 996 ? MET SELENOMETHIONINE 31 B MSE 900 B MSE 1005 ? MET SELENOMETHIONINE 32 B MSE 910 B MSE 1015 ? MET SELENOMETHIONINE # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 9330 ? 1 MORE -27 ? 1 'SSA (A^2)' 76420 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? 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CIT 1102, 1104, 1106, ACT 1108, and CA 1110 are associated with protein chain B. ; 999 ;SEQUENCE The author states that the residues at 648, 697, and 794 are indeed THR, THR, and PHE, respectively. There is an error in the database sequence.' ; # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 GLU A 116 ? ? -77.24 26.93 2 1 LYS A 117 ? ? -145.37 -10.55 3 1 ALA A 118 ? ? -142.18 -7.77 4 1 PHE A 133 ? ? -142.16 -3.05 5 1 ASN A 136 ? ? -58.17 99.09 6 1 GLU A 138 ? ? 39.78 117.84 7 1 TRP A 140 ? ? -54.87 -173.35 8 1 ARG A 141 ? ? 83.41 -76.24 9 1 THR A 143 ? ? -159.40 -16.72 10 1 LYS A 145 ? ? 163.73 72.76 11 1 THR A 146 ? ? -57.94 13.44 12 1 SER A 152 ? ? 63.34 158.19 13 1 ASN A 172 ? ? 48.04 162.78 14 1 VAL A 175 ? ? 75.96 59.93 15 1 LYS A 183 ? ? -73.71 -98.75 16 1 ASP A 184 ? ? -17.18 137.74 17 1 LYS A 186 ? ? 71.05 87.34 18 1 VAL A 189 ? ? -99.40 -101.15 19 1 ASP A 190 ? ? -106.15 -92.18 20 1 GLN A 191 ? ? -144.95 33.13 21 1 GLU A 192 ? 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