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_refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 ? 10656 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.491 ? 14426 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.937 ? 4004 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.041 ? 1505 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 1869 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 23NX _struct.title 'Structure of mouse DNMT3A-TCL1A complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 23NX _struct_keywords.text 'DNA methyltransferase, complex, TRANSFERASE' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TCL1A_MOUSE P56280 ? 1 ;MATQRAHRAETPAHPNRLWIWEKHVYLDEFRRSWLPVVIKSNEKFQVILRQEDVTLGEAMSPSQLVPYELPLMWQLYPKD RYRSCDSMYWQILYHIKFRDVEDMLLELIDSESNDE ; 1 2 UNP DNM3A_MOUSE O88508 ? 2 ;PMAQDSGPSDLLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAAGQKGGAPAEGEGTETPPEASRAVENGCCVTKEGRGASAGEGKEQKQTN IESMKMEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAVMNAVEENQASGESQ KVEEASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGGDAGDKNATKAADDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTG RSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPACHDSDESDSGK AVEVQNKQMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTTEKPKVKEIIDERTRE RLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFIGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRC FCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVL SLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVN PARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGN LPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDV SNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV ; 74 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 23NX A 1 ? 116 ? P56280 1 ? 116 ? 1 116 2 1 23NX C 1 ? 116 ? P56280 1 ? 116 ? 1 116 3 1 23NX D 1 ? 116 ? P56280 1 ? 116 ? 1 116 4 1 23NX E 1 ? 116 ? P56280 1 ? 116 ? 1 116 5 2 23NX B 1 ? 835 ? O88508 74 ? 908 ? 74 908 6 2 23NX F 1 ? 835 ? O88508 74 ? 908 ? 74 908 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER A 61 ? VAL A 66 ? SER A 61 VAL A 66 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 SER B 61 ? LEU B 65 ? SER C 61 LEU C 65 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 SER C 61 ? VAL C 66 ? SER D 61 VAL D 66 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 PRO D 62 ? VAL D 66 ? PRO E 62 VAL E 66 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 ARG E 397 ? GLN E 408 ? ARG B 470 GLN B 481 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN E 412 ? ILE E 416 ? ASN B 485 ILE B 489 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 CYS E 437 ? ALA E 448 ? CYS B 510 ALA B 521 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 AA8 VAL E 483 ? LEU E 489 ? VAL B 556 LEU B 562 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY E 493 ? GLU E 501 ? GLY B 566 GLU B 574 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 ASP E 523 ? PHE E 532 ? ASP B 596 PHE B 605 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 ALA E 567 ? GLY E 577 ? ALA B 640 GLY B 650 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 AB3 CYS E 589 ? HIS E 600 ? CYS B 662 HIS B 673 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP E 609 ? VAL E 613 ? ASP B 682 VAL B 686 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 THR E 614 ? GLY E 622 ? THR B 687 GLY B 695 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 THR E 650 ? ARG E 665 ? THR B 723 ARG B 738 1 ? 16 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY E 685 ? GLU E 697 ? GLY B 758 GLU B 770 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS E 706 ? VAL E 708 ? LYS B 779 VAL B 781 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU E 737 ? LEU E 742 ? GLU B 810 LEU B 815 5 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 TRP E 783 ? GLY E 792 ? TRP B 856 GLY B 865 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 SER E 804 ? SER E 815 ? SER B 877 SER B 888 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 AC3 SER E 817 ? ALA E 826 ? SER B 890 ALA B 899 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO E 827 ? TYR E 831 ? PRO B 900 TYR B 904 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 ARG F 397 ? GLN F 408 ? ARG F 470 GLN F 481 1 ? 12 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN F 412 ? ILE F 416 ? ASN F 485 ILE F 489 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 CYS F 437 ? ALA F 448 ? CYS F 510 ALA F 521 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 AC8 VAL F 483 ? LEU F 489 ? VAL F 556 LEU F 562 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY F 493 ? GLU F 501 ? GLY F 566 GLU F 574 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP F 523 ? PHE F 532 ? ASP F 596 PHE F 605 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA F 567 ? GLY F 577 ? ALA F 640 GLY F 650 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 CYS F 589 ? HIS F 600 ? CYS F 662 HIS F 673 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP F 609 ? VAL F 613 ? ASP F 682 VAL F 686 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 THR F 614 ? GLY F 622 ? THR F 687 GLY F 695 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 AD6 GLY F 649 ? ARG F 665 ? GLY F 722 ARG F 738 1 ? 17 HELX_P HELX_P34 AD7 GLY F 685 ? GLU F 697 ? GLY F 758 GLU F 770 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 AD8 LYS F 706 ? VAL F 708 ? LYS F 779 VAL F 781 5 ? 3 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU F 737 ? LEU F 742 ? GLU F 810 LEU F 815 5 ? 6 HELX_P HELX_P37 AE1 TRP F 783 ? GLY F 792 ? TRP F 856 GLY F 865 1 ? 10 HELX_P HELX_P38 AE2 SER F 804 ? SER F 815 ? SER F 877 SER F 888 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 AE3 SER F 817 ? ALA F 826 ? SER F 890 ALA F 899 1 ? 10 HELX_P HELX_P40 AE4 PRO F 827 ? TYR F 831 ? PRO F 900 TYR F 904 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 VAL 66 A . ? VAL 66 A PRO 67 A ? PRO 67 A 1 -0.72 2 VAL 66 B . ? VAL 66 C PRO 67 B ? PRO 67 C 1 -2.10 3 VAL 66 C . ? VAL 66 D PRO 67 C ? PRO 67 D 1 -1.07 4 VAL 66 D . ? VAL 66 E PRO 67 D ? PRO 67 E 1 -5.45 5 ASP 502 E . ? ASP 575 B PRO 503 E ? PRO 576 B 1 -6.76 6 GLY 622 E . ? GLY 695 B PRO 623 E ? PRO 696 B 1 -1.01 7 ASP 502 F . ? ASP 575 F PRO 503 F ? PRO 576 F 1 -4.76 8 GLY 622 F . ? GLY 695 F PRO 623 F ? PRO 696 F 1 1.41 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 8 ? AA2 ? 8 ? AA3 ? 8 ? AA4 ? 8 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 7 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 7 ? AB5 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 18 ? 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