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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.817 ? 9304 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.434 ? 910 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.060 ? 1120 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 1120 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 23XK _struct.title 'Cryo-EM structure of human sodium/proton antiporter NHE1 in complex with Cariporide in an outward-open conformation' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 23XK _struct_keywords.text 'sodium/proton antiporter, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 2 ? D N N 2 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code SL9A1_HUMAN _struct_ref.pdbx_db_accession P19634 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MVLRSGICGLSPHRIFPSLLVVVALVGLLPVLRSHGLQLSPTASTIRSSEPPRERSIGDVTTAPPEVTPESRPVNHSVTD HGMKPRKAFPVLGIDYTHVRTPFEISLWILLACLMKIGFHVIPTISSIVPESCLLIVVGLLVGGLIKGVGETPPFLQSDV FFLFLLPPIILDAGYFLPLRQFTENLGTILIFAVVGTLWNAFFLGGLMYAVCLVGGEQINNIGLLDNLLFGSIISAVDPV AVLAVFEEIHINELLHILVFGESLLNDAVTVVLYHLFEEFANYEHVGIVDIFLGFLSFFVVALGGVLVGVVYGVIAAFTS RFTSHIRVIEPLFVFLYSYMAYLSAELFHLSGIMALIASGVVMRPYVEANISHKSHTTIKYFLKMWSSVSETLIFIFLGV STVAGSHHWNWTFVISTLLFCLIARVLGVLGLTWFINKFRIVKLTPKDQFIIAYGGLRGAIAFSLGYLLDKKHFPMCDLF LTAIITVIFFTVFVQGMTIRPLVDLLAVKKKQETKRSINEEIHTQFLDHLLTGIEDICGHYGHHHWKDKLNRFNKKYVKK CLIAGERSKEPQLIAFYHKMEMKQAIELVESGGMGKIPSAVSTVSMQNIHPKSLPSERILPALSKDKEEEIRKILRNNLQ KTRQRLRSYNRHTLVADPYEEAWNQMLLRRQKARQLEQKINNYLTVPAHKLDSPTMSRARIGSDPLAYEPKEDLPVITID PASPQSPESVDLVNEELKGKVLGLSRDPAKVAEEDEDDDGGIMMRSKETSSPGTDDVFTPAPSDSPSSQRIQRCLSDPGP HPEPGEGEPFFPKGQ ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 23XK A 1 ? 815 ? 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P19634 1 ? 815 ? 1 815 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 95 ? 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GLY A 459 LEU A 468 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 MET A 476 ? LEU A 506 ? MET A 476 LEU A 506 1 ? 31 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP B 95 ? HIS B 98 ? ASP B 95 HIS B 98 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 AB9 VAL B 99 ? ILE B 122 ? VAL B 99 ILE B 122 1 ? 24 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO B 130 ? GLY B 150 ? PRO B 130 GLY B 150 1 ? 21 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN B 157 ? PHE B 176 ? GLN B 157 PHE B 176 1 ? 20 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN B 185 ? VAL B 214 ? ASN B 185 VAL B 214 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY B 223 ? SER B 235 ? GLY B 223 SER B 235 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP B 238 ? GLU B 247 ? ASP B 238 GLU B 247 1 ? 10 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN B 252 ? TYR B 283 ? ASN B 252 TYR B 283 1 ? 32 HELX_P HELX_P25 AC7 ILE B 288 ? PHE B 322 ? ILE B 288 PHE B 322 1 ? 35 HELX_P HELX_P26 AC8 ILE B 329 ? PHE B 348 ? ILE B 329 PHE B 348 1 ? 20 HELX_P HELX_P27 AC9 SER B 351 ? ILE B 371 ? SER B 351 ILE B 371 1 ? 21 HELX_P HELX_P28 AD1 SER B 372 ? VAL B 403 ? SER B 372 VAL B 403 1 ? 32 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN B 410 ? LYS B 438 ? ASN B 410 LYS B 438 1 ? 29 HELX_P HELX_P30 AD3 THR B 445 ? GLY B 455 ? THR B 445 GLY B 455 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY B 459 ? LEU B 468 ? GLY B 459 LEU B 468 1 ? 10 HELX_P HELX_P32 AD5 MET B 476 ? LEU B 506 ? MET B 476 LEU B 506 1 ? 31 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _pdbx_entry_details.entry_id 23XK _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest Y _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CD A ARG 180 ? ? NE A ARG 180 ? ? CZ A ARG 180 ? ? 139.99 123.60 16.39 1.40 N 2 1 NE A ARG 180 ? ? CZ A ARG 180 ? ? NH2 A ARG 180 ? ? 111.79 120.30 -8.51 0.50 N 3 1 CD B ARG 180 ? ? NE B ARG 180 ? ? CZ B ARG 180 ? ? 139.96 123.60 16.36 1.40 N 4 1 NE B ARG 180 ? ? CZ B ARG 180 ? ? 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A GLY 36 37 1 Y 1 A LEU 37 ? A LEU 37 38 1 Y 1 A GLN 38 ? A GLN 38 39 1 Y 1 A LEU 39 ? A LEU 39 40 1 Y 1 A SER 40 ? A SER 40 41 1 Y 1 A PRO 41 ? A PRO 41 42 1 Y 1 A THR 42 ? A THR 42 43 1 Y 1 A ALA 43 ? A ALA 43 44 1 Y 1 A SER 44 ? A SER 44 45 1 Y 1 A THR 45 ? A THR 45 46 1 Y 1 A ILE 46 ? A ILE 46 47 1 Y 1 A ARG 47 ? A ARG 47 48 1 Y 1 A SER 48 ? A SER 48 49 1 Y 1 A SER 49 ? A SER 49 50 1 Y 1 A GLU 50 ? A GLU 50 51 1 Y 1 A PRO 51 ? A PRO 51 52 1 Y 1 A PRO 52 ? A PRO 52 53 1 Y 1 A ARG 53 ? A ARG 53 54 1 Y 1 A GLU 54 ? A GLU 54 55 1 Y 1 A ARG 55 ? A ARG 55 56 1 Y 1 A SER 56 ? A SER 56 57 1 Y 1 A ILE 57 ? A ILE 57 58 1 Y 1 A GLY 58 ? A GLY 58 59 1 Y 1 A ASP 59 ? A ASP 59 60 1 Y 1 A VAL 60 ? A VAL 60 61 1 Y 1 A THR 61 ? A THR 61 62 1 Y 1 A THR 62 ? A THR 62 63 1 Y 1 A ALA 63 ? A ALA 63 64 1 Y 1 A PRO 64 ? A PRO 64 65 1 Y 1 A PRO 65 ? A PRO 65 66 1 Y 1 A GLU 66 ? A GLU 66 67 1 Y 1 A VAL 67 ? A VAL 67 68 1 Y 1 A THR 68 ? A THR 68 69 1 Y 1 A PRO 69 ? A PRO 69 70 1 Y 1 A GLU 70 ? A GLU 70 71 1 Y 1 A SER 71 ? A SER 71 72 1 Y 1 A ARG 72 ? A ARG 72 73 1 Y 1 A PRO 73 ? A PRO 73 74 1 Y 1 A VAL 74 ? A VAL 74 75 1 Y 1 A ASN 75 ? A ASN 75 76 1 Y 1 A HIS 76 ? A HIS 76 77 1 Y 1 A SER 77 ? A SER 77 78 1 Y 1 A VAL 78 ? A VAL 78 79 1 Y 1 A THR 79 ? A THR 79 80 1 Y 1 A ASP 80 ? A ASP 80 81 1 Y 1 A HIS 81 ? A HIS 81 82 1 Y 1 A GLY 82 ? A GLY 82 83 1 Y 1 A MET 83 ? A MET 83 84 1 Y 1 A LYS 84 ? A LYS 84 85 1 Y 1 A PRO 85 ? A PRO 85 86 1 Y 1 A ARG 86 ? A ARG 86 87 1 Y 1 A LYS 87 ? A LYS 87 88 1 Y 1 A VAL 508 ? A VAL 508 89 1 Y 1 A LYS 509 ? A LYS 509 90 1 Y 1 A LYS 510 ? A LYS 510 91 1 Y 1 A LYS 511 ? A LYS 511 92 1 Y 1 A GLN 512 ? A GLN 512 93 1 Y 1 A GLU 513 ? A GLU 513 94 1 Y 1 A THR 514 ? A THR 514 95 1 Y 1 A LYS 515 ? A LYS 515 96 1 Y 1 A ARG 516 ? A ARG 516 97 1 Y 1 A SER 517 ? A SER 517 98 1 Y 1 A ILE 518 ? A ILE 518 99 1 Y 1 A ASN 519 ? A ASN 519 100 1 Y 1 A GLU 520 ? A GLU 520 101 1 Y 1 A GLU 521 ? A GLU 521 102 1 Y 1 A ILE 522 ? A ILE 522 103 1 Y 1 A HIS 523 ? 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