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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.581 ? 37749 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.396 ? 3897 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.044 ? 4077 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 4974 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 25VJ _struct.title 'tail fiber of F2-pyocin' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 25VJ _struct_keywords.text 'pyocin, phage, cap, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 2 ? L N N 2 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A5E5R453_PSEAI A0A5E5R453 ? 1 ;MNKTITGHKGGSKKPRQPVEMPDSVRSIARAKILLALGEGEFDGGVDGRSIYLDDTPLLAADGSVNFPGVTWEFRPGSVD QEHIAGVPAVENELAVGVELKSDAPWVRAVSNTQLSAVRLRLSWPAIQRQQENGDVVGYRIDYAIDIAVDGGAWQEALKA SLDDKSTSRYERSHRVDLPEARSGWQVRVRRLTPNQNNNRVADTMRVEAITEVIDAKLRYPNTALLFVEFDASQFQSIPQ ISVEARGRRVRVPSNYDPQTRSYSGTWDGSFKSAWTSNPAWHWYDIVLHKRFGLGRRIDASMVDKWSLYRIAQYCDQSVP DGKGGQEPRFSCNLYLQSRAEAWTVLRDLAAIFRGMSYWSGAEMVAVSDMPEDEAYTFSPSNTVRGDDGSHFNYSSSRQR DRHTLALVNYDNPGNGYQSQPVAVNNDRAQRRYGISQLEITAIGCTSEGEAQRRGQWALLTEELEQDAVTFRTGMDGRGL APGKIIAVADPVKSGKQIGGRLSAVDGRALTLDRDVEARPGDRLLVNLPNGKAEARSVQSVVGRVLSVTASYSETPRPQG QWALQSNSLTTQRFRIMSITRPEDNLFEITALQHNASKFDAIDNGARIELPPVTSIPPGVQAPPQNVRIKAFTKVDQGLA VTSLSASWDAAPNAVAYEAEWRKDSGNWVRVPRTSALGFDVPGIYAGRYLVRVRALNVMEVGSVYASSEETALEGKTTPP PALAYLRCVAGPWRIGLEWGFPASGAADTAYTEIQQSATPGGSEETARALGLFAYPGNTHLVSPIPAGERLAFRGRLIDR SGNVGAWSNWVTGTSSSDASEYNQLITQEYVESALGQQFFSDIERMQVDIGGLQKQVGDLADVLLYDPAKVYAKNDMVRQ GQRLYQALKAVPAKTAPPNAAYWSDIGQSLETANGLAQQVASHTAEISELDGSLTAQASRLGVLQAATRDDADDGNGAMA DALRGWKTVARAAQEETVRATENEAQATRTTLLEARTADAEGRIATVERVATSDRQATAQRLDQLSASIGGTAASLQSEQ TARANADSALAQRIDTVQASTDTNSAAIQTTSQAVTSLDGNVKAMYSVKLQAHANGQKYAAGWQLGFDSGTSVSTMAFQA DRFIWFDSSSGTAVAPVSIVNGQMFIKNALIQDGAIDNAKIGNVIQSNAMSNNGMPIWRLDKAGTYTVRDSAGQVRVEMG LLQS ; 1 2 UNP A0A2V3GUQ2_PSEAI A0A2V3GUQ2 ? 2 ;MAWHSKGSVSVTLNSEAVLGNATDFIANVRTGDAFRGPDGRWYEITNVTSATVISIKPNYQGATASGQVYAVVPIHGYSK NLADQFRDINNQWGATLAGIKPWAVSSTGQQAQADMGISAVGRALNNASTPANALSYLGGVAPNQMGWAGNAMNTADLDS LTVSGLYAHGTAVPSPVNNAQGYVLHMQHGNPDFAVQQWYQLNSATGQYMRIKAGGNWSRWVLQYSQFNLVGLASFDASN NPSGAIIQRGGTVGFNEYVRYADGTQICWGNTTTNVGATMAYQPAGTLSFYITPVAYSWGFPVSFSRPPSVMVNPMRAAG NNASRPWGSTMSVTETLFSWYGYDTASVASGMAASYVAMGRWN ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 25VJ D 1 ? 1204 ? A0A5E5R453 1 ? 1204 ? 1 1204 2 2 25VJ A 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 3 2 25VJ B 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 4 2 25VJ C 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 5 1 25VJ E 1 ? 1204 ? A0A5E5R453 1 ? 1204 ? 1 1204 6 2 25VJ F 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 7 2 25VJ G 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 8 2 25VJ H 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 9 1 25VJ I 1 ? 1204 ? A0A5E5R453 1 ? 1204 ? 1 1204 10 2 25VJ J 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 11 2 25VJ K 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 12 2 25VJ L 1 ? 363 ? A0A2V3GUQ2 1 ? 363 ? 1 363 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 25VJ LEU D 945 ? UNP A0A5E5R453 GLN 945 conflict 945 1 5 25VJ LEU E 945 ? UNP A0A5E5R453 GLN 945 conflict 945 2 9 25VJ LEU I 945 ? UNP A0A5E5R453 GLN 945 conflict 945 3 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 919 ? ASP A 953 ? GLN D 919 ASP D 953 1 ? 35 HELX_P HELX_P2 AA2 GLY A 955 ? SER A 1028 ? GLY D 955 SER D 1028 1 ? 74 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP B 24 ? VAL B 29 ? ASP A 24 VAL A 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY B 77 ? TRP B 93 ? GLY A 77 TRP A 93 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 AA5 TRP B 93 ? GLY B 99 ? TRP A 93 GLY A 99 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 LYS B 101 ? VAL B 105 ? LYS A 101 VAL A 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 THR B 108 ? GLY B 117 ? THR A 108 GLY A 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P8 AA8 SER B 119 ? ALA B 128 ? SER A 119 ALA A 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P9 AA9 THR B 130 ? GLY B 139 ? THR A 130 GLY A 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU C 82 ? GLY C 99 ? LEU B 82 GLY B 99 1 ? 18 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE C 100 ? VAL C 105 ? ILE B 100 VAL B 105 5 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 THR C 108 ? GLY C 117 ? THR B 108 GLY B 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P13 AB4 SER C 119 ? ALA C 128 ? SER B 119 ALA B 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 AB5 THR C 130 ? GLY C 139 ? THR B 130 GLY B 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P15 AB6 SER C 226 ? LEU C 230 ? SER B 226 LEU B 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP D 24 ? VAL D 29 ? ASP C 24 VAL C 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY D 77 ? GLY D 99 ? GLY C 77 GLY C 99 1 ? 23 HELX_P HELX_P18 AB9 LYS D 101 ? VAL D 105 ? LYS C 101 VAL C 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 THR D 108 ? MET D 116 ? THR C 108 MET C 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 SER D 119 ? ASN D 127 ? SER C 119 ASN C 127 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 THR D 130 ? GLY D 139 ? THR C 130 GLY C 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL E 920 ? ASP E 953 ? VAL E 920 ASP E 953 1 ? 34 HELX_P HELX_P23 AC5 GLY E 955 ? ALA E 1027 ? GLY E 955 ALA E 1027 1 ? 73 HELX_P HELX_P24 AC6 ASP F 24 ? VAL F 29 ? ASP F 24 VAL F 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 GLY F 77 ? TRP F 93 ? GLY F 77 TRP F 93 1 ? 17 HELX_P HELX_P26 AC8 TRP F 93 ? GLY F 99 ? TRP F 93 GLY F 99 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS F 101 ? VAL F 105 ? LYS F 101 VAL F 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 THR F 108 ? GLY F 117 ? THR F 108 GLY F 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 SER F 119 ? ALA F 128 ? SER F 119 ALA F 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P30 AD3 THR F 130 ? GLY F 139 ? THR F 130 GLY F 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P31 AD4 LEU G 82 ? GLY G 99 ? LEU G 82 GLY G 99 1 ? 18 HELX_P HELX_P32 AD5 ILE G 100 ? VAL G 105 ? ILE G 100 VAL G 105 5 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 THR G 108 ? GLY G 117 ? THR G 108 GLY G 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P34 AD7 SER G 119 ? ALA G 128 ? SER G 119 ALA G 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P35 AD8 THR G 130 ? GLY G 139 ? THR G 130 GLY G 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 AD9 SER G 226 ? LEU G 230 ? SER G 226 LEU G 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP H 24 ? VAL H 29 ? ASP H 24 VAL H 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P38 AE2 GLY H 77 ? GLY H 99 ? GLY H 77 GLY H 99 1 ? 23 HELX_P HELX_P39 AE3 LYS H 101 ? VAL H 105 ? LYS H 101 VAL H 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 THR H 108 ? MET H 116 ? THR H 108 MET H 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P41 AE5 SER H 119 ? ASN H 127 ? SER H 119 ASN H 127 1 ? 9 HELX_P HELX_P42 AE6 THR H 130 ? GLY H 139 ? THR H 130 GLY H 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P43 AE7 VAL I 920 ? ASP I 953 ? VAL I 920 ASP I 953 1 ? 34 HELX_P HELX_P44 AE8 GLY I 955 ? ALA I 1027 ? GLY I 955 ALA I 1027 1 ? 73 HELX_P HELX_P45 AE9 ASP J 24 ? VAL J 29 ? ASP J 24 VAL J 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 AF1 GLY J 77 ? TRP J 93 ? GLY J 77 TRP J 93 1 ? 17 HELX_P HELX_P47 AF2 TRP J 93 ? GLY J 99 ? TRP J 93 GLY J 99 1 ? 7 HELX_P HELX_P48 AF3 LYS J 101 ? VAL J 105 ? LYS J 101 VAL J 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 THR J 108 ? GLY J 117 ? THR J 108 GLY J 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P50 AF5 SER J 119 ? ALA J 128 ? SER J 119 ALA J 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P51 AF6 THR J 130 ? GLY J 139 ? THR J 130 GLY J 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P52 AF7 LEU K 82 ? GLY K 99 ? LEU K 82 GLY K 99 1 ? 18 HELX_P HELX_P53 AF8 ILE K 100 ? VAL K 105 ? ILE K 100 VAL K 105 5 ? 6 HELX_P HELX_P54 AF9 THR K 108 ? GLY K 117 ? THR K 108 GLY K 117 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 AG1 SER K 119 ? ALA K 128 ? SER K 119 ALA K 128 1 ? 10 HELX_P HELX_P56 AG2 THR K 130 ? GLY K 139 ? THR K 130 GLY K 139 1 ? 10 HELX_P HELX_P57 AG3 SER K 226 ? LEU K 230 ? SER K 226 LEU K 230 5 ? 5 HELX_P HELX_P58 AG4 ASP L 24 ? VAL L 29 ? ASP L 24 VAL L 29 1 ? 6 HELX_P HELX_P59 AG5 GLY L 77 ? GLY L 99 ? GLY L 77 GLY L 99 1 ? 23 HELX_P HELX_P60 AG6 LYS L 101 ? VAL L 105 ? LYS L 101 VAL L 105 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 THR L 108 ? MET L 116 ? THR L 108 MET L 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P62 AG8 SER L 119 ? ASN L 127 ? SER L 119 ASN L 127 1 ? 9 HELX_P HELX_P63 AG9 THR L 130 ? GLY L 139 ? THR L 130 GLY L 139 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 954 A . ? ASP 954 D GLY 955 A ? GLY 955 D 1 10.29 2 LYS 57 B . ? LYS 57 A PRO 58 B ? PRO 58 A 1 3.26 3 LYS 57 C . ? LYS 57 B PRO 58 C ? PRO 58 B 1 -1.31 4 LYS 57 D . ? LYS 57 C PRO 58 D ? PRO 58 C 1 -1.46 5 LYS 57 F . ? LYS 57 F PRO 58 F ? PRO 58 F 1 3.28 6 LYS 57 G . ? LYS 57 G PRO 58 G ? PRO 58 G 1 -0.62 7 LYS 57 H . ? LYS 57 H PRO 58 H ? PRO 58 H 1 -1.21 8 ASP 954 I . ? ASP 954 I GLY 955 I ? GLY 955 I 1 10.78 9 LYS 57 J . ? LYS 57 J PRO 58 J ? PRO 58 J 1 3.39 10 LYS 57 K . ? LYS 57 K PRO 58 K ? PRO 58 K 1 -1.84 11 LYS 57 L . ? LYS 57 L PRO 58 L ? PRO 58 L 1 -1.53 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 7 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 6 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 7 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 3 ? AB3 ? 7 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 5 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 7 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 7 ? AC6 ? 6 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 7 ? AD2 ? 6 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 7 ? AD7 ? 6 ? AD8 ? 6 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 7 ? AE4 ? 6 ? AE5 ? 5 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 7 ? AE9 ? 6 ? AF1 ? 6 ? AF2 ? 5 ? AF3 ? 3 ? AF4 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? anti-parallel AA7 6 7 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? 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