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EMDB EMD-56669 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-09-16 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-09-16 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 28OE _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2026-02-10 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'Human PRC1.4 in complex with native UBCH5C bound to a H3Kc27me3 mononucleosome' EMD-56669 'associated EM volume' EMDB 'Human PRC1.4 bound to a H3Kc27me3 mononucleosome' EMD-56717 'other EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email muellerj@biochem.mpg.de _pdbx_contact_author.name_first Juerg _pdbx_contact_author.name_last Mueller _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0003-2391-4641 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Ciapponi, M.' 1 0009-0003-9124-6945 'Mueller, J.' 2 0000-0003-2391-4641 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Cryo-EM structure, enzymatic activity and genome targeting of canonical PRC1' _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-026-01885-6 _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Ciapponi, M.' 1 ? primary 'Cafiso, M.' 2 ? primary 'Schkoelziger, S.' 3 ? primary 'Benda, C.' 4 ? primary 'Bonnet, J.' 5 ? primary 'Mueller, J.' 6 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Isoform 2 of Polyhomeotic-like protein 2' 36200.988 1 ? 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_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;GPDSMTSGNGNSASSIAGTAPQNGENKPPQAIVKPQILTHVIEGFVIQEGAEPFPVGRSSLLVGNLKKKYAQGFLPEKLP QQDHTTTTDSEMEEPYLQESKEEGAPLKLKCELCGRVDFAYKFKRSKRFCSMACAKRYNVGCTKRVGLFHSDRSKLQKAG AATHNRRRASKASLPPLTKDTKKQPTGTVPLSVTAALQLTHSQEDSSRCSDNSSYEEPLSPISASSSTSRRRQGQRDLEL PDMHMRDLVGMGHHFLPSEPTKWNVEDVYEFIRSLPGCQEIAEEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKEGPAEKIYAR ISMLKDS ; ;GPDSMTSGNGNSASSIAGTAPQNGENKPPQAIVKPQILTHVIEGFVIQEGAEPFPVGRSSLLVGNLKKKYAQGFLPEKLP QQDHTTTTDSEMEEPYLQESKEEGAPLKLKCELCGRVDFAYKFKRSKRFCSMACAKRYNVGCTKRVGLFHSDRSKLQKAG AATHNRRRASKASLPPLTKDTKKQPTGTVPLSVTAALQLTHSQEDSSRCSDNSSYEEPLSPISASSSTSRRRQGQRDLEL PDMHMRDLVGMGHHFLPSEPTKWNVEDVYEFIRSLPGCQEIAEEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKEGPAEKIYAR ISMLKDS ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;GPDSMELSAIGEQVFAVESIRKKRVRKGKVEYLVKWKGWPPKYSTWEPEEHILDPRLVMAYEEKEERDRASGYRKRGPKP KRLLLQEPPAPDVLQAAGEWEPAAQPPEEEADADLAEGPPPWTPALPSSEVTVTDITANSITVTFREAQAAEGFFRDRSG KF ; ;GPDSMELSAIGEQVFAVESIRKKRVRKGKVEYLVKWKGWPPKYSTWEPEEHILDPRLVMAYEEKEERDRASGYRKRGPKP KRLLLQEPPAPDVLQAAGEWEPAAQPPEEEADADLAEGPPPWTPALPSSEVTVTDITANSITVTFREAQAAEGFFRDRSG KF ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;GPDSMSQAVQTNGTQPLSKTWELSLYELQRTPQEAITDGLEIVVSPRSLHSELMCPICLDMLKNTMTTKECLHRFCADCI ITALRSGNKECPTCRKKLVSKRSLRPDPNFDALISKIYPSRDEYEAHQERVLARINKHNNQQALSHSIEEGLKIQAMNRL QRGKKQQIENGSGAEDNGDSSHCSNASTHSNQEAGPSNKRTKTSDDSGLELDNNNAAMAIDPVMDGASEIELVFRPHPTL MEKDDSAQTRYIKTSGNATVDHLSKYLAVRLALEELRSKGESNQMNLDTASEKQYTIYIATASGQFTVLNGSFSLELVSE KYWKVNKPMELYYAPTKEHK ; ;GPDSMSQAVQTNGTQPLSKTWELSLYELQRTPQEAITDGLEIVVSPRSLHSELMCPICLDMLKNTMTTKECLHRFCADCI ITALRSGNKECPTCRKKLVSKRSLRPDPNFDALISKIYPSRDEYEAHQERVLARINKHNNQQALSHSIEEGLKIQAMNRL QRGKKQQIENGSGAEDNGDSSHCSNASTHSNQEAGPSNKRTKTSDDSGLELDNNNAAMAIDPVMDGASEIELVFRPHPTL MEKDDSAQTRYIKTSGNATVDHLSKYLAVRLALEELRSKGESNQMNLDTASEKQYTIYIATASGQFTVLNGSFSLELVSE KYWKVNKPMELYYAPTKEHK ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVY KLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKEEVND KRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQR DGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSPSGNHQSSFANRPRKSSVNGS SATSSGGSGSLEVLFQ ; ;MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVY KLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKEEVND KRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQR DGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSPSGNHQSSFANRPRKSSVNGS SATSSGGSGSLEVLFQ ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINS NGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM ; ;MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINS NGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLAAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; F,J ? 7 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; G,K ? 8 'polypeptide(L)' no no ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; H,L ? 9 'polypeptide(L)' no no ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; I,M ? 10 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DT)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT) (DG)(DG)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DC) (DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA) (DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG) (DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC) (DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DG) (DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA) (DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DC) (DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC) (DA)(DG)(DC)(DG)(DA)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA) (DG)(DA)(DG)(DT)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC) (DA)(DA)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG) ; ;ATATCTCGGGCTTATGTGATGGACCCTATACGCGGCGGACCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAG ACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCA GGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGTATTTATTGAACAGCGACTCGGGATATCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGC AAGCTTGG ; N ? 11 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DC)(DA)(DA)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG) (DG)(DT)(DC)(DG)(DA)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC) (DG)(DA)(DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DT)(DA) (DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DA) (DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DG) (DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT) (DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT) (DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT) (DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG)(DG)(DA) (DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DT)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA) (DT)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DC)(DC)(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DC) (DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT) ; ;CCAAGCTTGCATGCCTGCAGGTCGACTCTAGAGATATCCCGAGTCGCTGTTCAATAAATACACAGGATGTATATATCTGA CACGTGCCTGGAGATTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCT AGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGTCCGCCGCGTATAGGGTCCATCACATAAGCC CGAGATAT ; O ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 12 _pdbx_entity_nonpoly.name 'ZINC ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLY n 1 2 PRO n 1 3 ASP n 1 4 SER n 1 5 MET n 1 6 THR n 1 7 SER n 1 8 GLY n 1 9 ASN n 1 10 GLY n 1 11 ASN n 1 12 SER n 1 13 ALA n 1 14 SER n 1 15 SER n 1 16 ILE n 1 17 ALA n 1 18 GLY n 1 19 THR n 1 20 ALA n 1 21 PRO n 1 22 GLN n 1 23 ASN n 1 24 GLY n 1 25 GLU n 1 26 ASN n 1 27 LYS n 1 28 PRO n 1 29 PRO n 1 30 GLN n 1 31 ALA n 1 32 ILE n 1 33 VAL n 1 34 LYS n 1 35 PRO n 1 36 GLN n 1 37 ILE n 1 38 LEU n 1 39 THR n 1 40 HIS n 1 41 VAL n 1 42 ILE n 1 43 GLU n 1 44 GLY n 1 45 PHE n 1 46 VAL n 1 47 ILE n 1 48 GLN n 1 49 GLU n 1 50 GLY n 1 51 ALA n 1 52 GLU n 1 53 PRO n 1 54 PHE n 1 55 PRO n 1 56 VAL n 1 57 GLY n 1 58 ARG n 1 59 SER n 1 60 SER n 1 61 LEU n 1 62 LEU n 1 63 VAL n 1 64 GLY n 1 65 ASN n 1 66 LEU n 1 67 LYS n 1 68 LYS n 1 69 LYS n 1 70 TYR n 1 71 ALA n 1 72 GLN n 1 73 GLY n 1 74 PHE n 1 75 LEU n 1 76 PRO n 1 77 GLU n 1 78 LYS n 1 79 LEU n 1 80 PRO n 1 81 GLN n 1 82 GLN n 1 83 ASP n 1 84 HIS n 1 85 THR n 1 86 THR n 1 87 THR n 1 88 THR n 1 89 ASP n 1 90 SER n 1 91 GLU n 1 92 MET n 1 93 GLU n 1 94 GLU n 1 95 PRO n 1 96 TYR n 1 97 LEU n 1 98 GLN n 1 99 GLU n 1 100 SER n 1 101 LYS n 1 102 GLU n 1 103 GLU n 1 104 GLY n 1 105 ALA n 1 106 PRO n 1 107 LEU n 1 108 LYS n 1 109 LEU n 1 110 LYS n 1 111 CYS n 1 112 GLU n 1 113 LEU n 1 114 CYS n 1 115 GLY n 1 116 ARG n 1 117 VAL n 1 118 ASP n 1 119 PHE n 1 120 ALA n 1 121 TYR n 1 122 LYS n 1 123 PHE n 1 124 LYS n 1 125 ARG n 1 126 SER n 1 127 LYS n 1 128 ARG n 1 129 PHE n 1 130 CYS n 1 131 SER n 1 132 MET n 1 133 ALA n 1 134 CYS n 1 135 ALA n 1 136 LYS n 1 137 ARG n 1 138 TYR n 1 139 ASN n 1 140 VAL n 1 141 GLY n 1 142 CYS n 1 143 THR n 1 144 LYS n 1 145 ARG n 1 146 VAL n 1 147 GLY n 1 148 LEU n 1 149 PHE n 1 150 HIS n 1 151 SER n 1 152 ASP n 1 153 ARG n 1 154 SER n 1 155 LYS n 1 156 LEU n 1 157 GLN n 1 158 LYS n 1 159 ALA n 1 160 GLY n 1 161 ALA n 1 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S N N 12 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PHC2_HUMAN Q8IXK0 Q8IXK0-2 1 ;MTSGNGNSASSIAGTAPQNGENKPPQAIVKPQILTHVIEGFVIQEGAEPFPVGRSSLLVGNLKKKYAQGFLPEKLPQQDH TTTTDSEMEEPYLQESKEEGAPLKLKCELCGRVDFAYKFKRSKRFCSMACAKRYNVGCTKRVGLFHSDRSKLQKAGAATH NRRRASKASLPPLTKDTKKQPTGTVPLSVTAALQLTHSQEDSSRCSDNSSYEEPLSPISASSSTSRRRQGQRDLELPDMH MRDLVGMGHHFLPSEPTKWNVEDVYEFIRSLPGCQEIAEEFRAQEIDGQALLLLKEDHLMSAMNIKLGPALKIYARISML KDS ; 1 2 UNP B0QYP2_HUMAN B0QYP2 ? 2 ;MELSAIGEQVFAVESIRKKRVRKGKVEYLVKWKGWPPKYSTWEPEEHILDPRLVMAYEEKEERDRASGYRKRGPKPKRLL LQEPPAPDVLQAAGEWEPAAQPPEEEADADLAEGPPPWTPALPSSEVTVTDITANSITVTFREAQAAEGFFRDRSGKF ; 1 3 UNP RING2_HUMAN Q99496 ? 3 ;MSQAVQTNGTQPLSKTWELSLYELQRTPQEAITDGLEIVVSPRSLHSELMCPICLDMLKNTMTTKECLHRFCADCIITAL RSGNKECPTCRKKLVSKRSLRPDPNFDALISKIYPSRDEYEAHQERVLARINKHNNQQALSHSIEEGLKIQAMNRLQRGK KQQIENGSGAEDNGDSSHCSNASTHSNQEAGPSNKRTKTSDDSGLELDNNNAAMAIDPVMDGASEIELVFRPHPTLMEKD DSAQTRYIKTSGNATVDHLSKYLAVRLALEELRSKGESNQMNLDTASEKQYTIYIATASGQFTVLNGSFSLELVSEKYWK VNKPMELYYAPTKEHK ; 1 4 UNP BMI1_HUMAN P35226 ? 4 ;MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVY KLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKEEVND KRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQR DGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSPSGNHQSSFANRPRKSSVNGS SATSSG ; 1 5 UNP UB2D3_MACFA Q4R5N4 ? 5 ;MALKRINKELSDLARDPPAQCSAGPVGDDMFHWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINS NGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM ; 1 6 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 6 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 7 UNP H4_XENBO P62798 ? 7 ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 2 8 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 8 ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 2 9 UNP A0A1B8Y854_XENTR A0A1B8Y854 ? 9 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 10 PDB 28OE 28OE ? 10 ? 1 11 PDB 28OE 28OE ? 11 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 28OE A 5 ? 327 ? Q8IXK0 1 ? 323 ? 1 323 2 2 28OE B 5 ? 162 ? B0QYP2 1 ? 158 ? 1 158 3 3 28OE C 5 ? 340 ? Q99496 1 ? 336 ? 1 336 4 4 28OE D 1 ? 326 ? P35226 1 ? 326 ? 1 326 5 5 28OE E 1 ? 147 ? Q4R5N4 1 ? 147 ? 1 147 6 6 28OE F 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 7 7 28OE G 1 ? 102 ? P62798 2 ? 103 ? 1 102 8 8 28OE H 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 9 9 28OE I 1 ? 122 ? A0A1B8Y854 5 ? 126 ? 1 122 10 6 28OE J 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 11 7 28OE K 1 ? 102 ? P62798 2 ? 103 ? 1 102 12 8 28OE L 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 13 9 28OE M 1 ? 122 ? A0A1B8Y854 5 ? 126 ? 1 122 14 10 28OE N 1 ? 248 ? 28OE -113 ? 134 ? -113 134 15 11 28OE O 1 ? 248 ? 28OE -134 ? 113 ? -134 113 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 28OE GLY A 1 ? UNP Q8IXK0 ? ? 'expression tag' -3 1 1 28OE PRO A 2 ? UNP Q8IXK0 ? ? 'expression tag' -2 2 1 28OE ASP A 3 ? UNP Q8IXK0 ? ? 'expression tag' -1 3 1 28OE SER A 4 ? UNP Q8IXK0 ? ? 'expression tag' 0 4 1 28OE GLU A 311 ? UNP Q8IXK0 LEU 307 'engineered mutation' 307 5 1 28OE GLU A 315 ? UNP Q8IXK0 LEU 311 'engineered mutation' 311 6 2 28OE GLY B 1 ? UNP B0QYP2 ? ? 'expression tag' -3 7 2 28OE PRO B 2 ? UNP B0QYP2 ? ? 'expression tag' -2 8 2 28OE ASP B 3 ? UNP B0QYP2 ? ? 'expression tag' -1 9 2 28OE SER B 4 ? UNP B0QYP2 ? ? 'expression tag' 0 10 3 28OE GLY C 1 ? UNP Q99496 ? ? 'expression tag' -3 11 3 28OE PRO C 2 ? UNP Q99496 ? ? 'expression tag' -2 12 3 28OE ASP C 3 ? UNP Q99496 ? ? 'expression tag' -1 13 3 28OE SER C 4 ? UNP Q99496 ? ? 'expression tag' 0 14 4 28OE GLY D 327 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 327 15 4 28OE SER D 328 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 328 16 4 28OE GLY D 329 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 329 17 4 28OE SER D 330 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 330 18 4 28OE LEU D 331 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 331 19 4 28OE GLU D 332 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 332 20 4 28OE VAL D 333 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 333 21 4 28OE LEU D 334 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 334 22 4 28OE PHE D 335 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 335 23 4 28OE GLN D 336 ? UNP P35226 ? ? 'expression tag' 336 24 6 28OE ALA F 110 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 'engineered mutation' 110 25 10 28OE ALA J 110 ? UNP A0A310TTQ1 CYS 111 'engineered mutation' 110 26 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'not applicable' # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER C 24 ? GLN C 29 ? SER C 20 GLN C 25 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 SER C 45 ? HIS C 50 ? SER C 41 HIS C 46 5 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 ALA C 77 ? SER C 86 ? ALA C 73 SER C 82 1 ? 10 HELX_P HELX_P4 AA4 SER C 100 ? ARG C 102 ? SER C 96 ARG C 98 5 ? 3 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP C 107 ? TYR C 118 ? ASP C 103 TYR C 114 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ARG C 121 ? ASN C 140 ? ARG C 117 ASN C 136 1 ? 20 HELX_P HELX_P7 AA7 HIS C 237 ? GLU C 242 ? HIS C 233 GLU C 238 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 THR C 259 ? GLY C 280 ? THR C 255 GLY C 276 1 ? 22 HELX_P HELX_P9 AA9 SER C 291 ? TYR C 295 ? SER C 287 TYR C 291 5 ? 5 HELX_P HELX_P10 AB1 SER C 314 ? TYR C 322 ? SER C 310 TYR C 318 1 ? 9 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE D 9 ? ASN D 13 ? ILE D 9 ASN D 13 1 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 PRO D 14 ? LEU D 16 ? PRO D 14 LEU D 16 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 LYS D 40 ? LEU D 47 ? LYS D 40 LEU D 47 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 GLU D 48 ? SER D 50 ? GLU D 48 SER D 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 AB6 ARG D 64 ? LEU D 67 ? ARG D 64 LEU D 67 5 ? 4 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS D 73 ? VAL D 83 ? LYS D 73 VAL D 83 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY D 85 ? MET D 91 ? GLY D 85 MET D 91 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 LYS D 92 ? HIS D 101 ? LYS D 92 HIS D 101 1 ? 10 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP D 139 ? ASP D 144 ? ASP D 139 ASP D 144 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 THR D 171 ? MET D 183 ? THR D 171 MET D 183 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 THR D 205 ? THR D 214 ? THR D 205 THR D 214 1 ? 10 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU E 3 ? ASP E 16 ? LEU E 3 ASP E 16 1 ? 14 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP E 59 ? LYS E 63 ? ASP E 59 LYS E 63 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 THR E 98 ? ASP E 112 ? THR E 98 ASP E 112 1 ? 15 HELX_P HELX_P25 AC7 VAL E 120 ? ASP E 130 ? VAL E 120 ASP E 130 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 ARG E 131 ? LYS E 144 ? ARG E 131 LYS E 144 1 ? 14 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY F 44 ? GLN F 55 ? GLY F 44 GLN F 55 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG F 63 ? GLN F 76 ? ARG F 63 GLN F 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 GLN F 85 ? ALA F 114 ? GLN F 85 ALA F 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P30 AD3 MET F 120 ? ARG F 131 ? MET F 120 ARG F 131 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP G 24 ? ILE G 29 ? ASP G 24 ILE G 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 THR G 30 ? GLY G 42 ? THR G 30 GLY G 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 AD6 LEU G 49 ? ALA G 76 ? LEU G 49 ALA G 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P34 AD7 THR G 82 ? GLN G 93 ? THR G 82 GLN G 93 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 AD8 THR H 16 ? GLY H 22 ? THR H 16 GLY H 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P36 AD9 VAL H 27 ? GLY H 37 ? VAL H 27 GLY H 37 1 ? 11 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY H 46 ? ASN H 73 ? GLY H 46 ASN H 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P38 AE2 ILE H 79 ? ASN H 89 ? ILE H 79 ASN H 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P39 AE3 ASP H 90 ? LEU H 97 ? ASP H 90 LEU H 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P40 AE4 GLN H 112 ? LEU H 116 ? GLN H 112 LEU H 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 TYR I 34 ? HIS I 46 ? TYR I 34 HIS I 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 AE6 SER I 52 ? ASN I 81 ? SER I 52 ASN I 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P43 AE7 THR I 87 ? LEU I 99 ? THR I 87 LEU I 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 AE8 GLY I 101 ? 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ASP L 90 LEU L 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P59 AG5 GLN L 112 ? LEU L 116 ? GLN L 112 LEU L 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 AG6 TYR M 34 ? LEU M 42 ? TYR M 34 LEU M 42 1 ? 9 HELX_P HELX_P61 AG7 SER M 52 ? ASN M 81 ? SER M 52 ASN M 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P62 AG8 THR M 87 ? LEU M 99 ? THR M 87 LEU M 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P63 AG9 GLY M 101 ? LYS M 122 ? GLY M 101 LYS M 122 1 ? 22 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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