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'Molecular basis of polyadenylated RNA fate determination in the nucleus' _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-026-10650-0 _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hohmann, U.' 1 0000-0003-2124-1439 primary 'Graf, M.' 2 0009-0001-0756-5173 primary 'Plaschka, C.' 3 0000-0002-6020-9514 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man ;Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Leukocyte receptor cluster member 8,Leukocyte receptor cluster member 8,Leukocyte receptor cluster member 8,Leukocyte receptor cluster member 8 ; 76829.578 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'PCI 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THR H 344 ARG H 349 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 AG4 ASP D 367 ? ARG D 377 ? ASP H 367 ARG H 377 1 ? 11 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP D 393 ? GLU D 408 ? ASP H 393 GLU H 408 1 ? 16 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 637 A . ? ARG 749 A PRO 638 A ? 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O SER H 412 # _pdbx_entry_details.entry_id 28XB _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 CYS A 723 ? ? 47.31 -144.53 2 1 ASN B 183 ? ? 70.32 32.11 3 1 LYS B 184 ? ? -100.51 44.68 4 1 HIS B 275 ? ? 59.85 15.73 5 1 LEU B 276 ? ? -87.49 38.03 6 1 ASP B 354 ? ? 56.20 17.51 7 1 LYS B 374 ? ? -98.80 55.24 8 1 GLU C 25 ? ? -150.39 -63.75 9 1 TRP C 27 ? ? -58.18 103.04 10 1 ASP C 44 ? ? -78.07 43.89 11 1 ASP C 46 ? ? -81.22 34.21 12 1 ASN H 164 ? ? -145.12 56.09 13 1 ASP H 245 ? ? 36.36 49.24 14 1 THR H 344 ? ? -76.04 -162.80 15 1 ARG H 355 ? ? -78.22 25.45 16 1 PHE H 381 ? ? -85.60 -71.61 # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 28XB _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 28XB _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution 6.2 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.num_particles 7866 _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.9 # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details _em_entity_assembly.entity_id_list 1 0 RECOMBINANT COMPLEX 'Human UAP56-RNA - LENG8-PCID2-SEM1 complex' ? ? ? 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