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EMDB EMD-57241 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-09-30 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-09-30 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 29KN _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2026-03-18 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'Consensus map of human DNAAF19-RUVBL1/2-DPCD' EMD-57215 'consensus EM volume' EMDB 'Focused map of human DNAAF19-RUVBL1/2 without the external DII domains' EMD-57217 'focused EM volume' EMDB 'Focused map of the external DII domain of RUVBL2 in complex with DPCD (subunit A)' EMD-57219 'focused EM volume' EMDB 'Focused map of the external DII domain of RUVBL2 in complex with DPCD (subunit B)' EMD-57221 'focused EM volume' EMDB 'Focused map of the external DII domain of RUVBL2 in complex with DPCD (subunit C)' EMD-57234 'focused EM volume' EMDB 'Focused map of the external DII domain of RUVBL2 in complex with DPCD (subunit D)' EMD-57238 'focused EM volume' EMDB 'Focused map of the external DII domain of RUVBL2 in complex with DPCD (subunit E)' EMD-57239 'focused EM volume' EMDB 'Composite cryo-EM map of the human DNAAF19-RUVBL1/2-DPCD complex' EMD-57241 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 2 _pdbx_contact_author.email t.ochi@leeds.ac.uk _pdbx_contact_author.name_first Takashi _pdbx_contact_author.name_last Ochi _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0001-8546-6341 # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Wood, E.' 1 0009-0001-2516-615X 'Ochi, T.' 2 0000-0001-8546-6341 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'DNAAF19-RUVBL1/2 complex recruits multiple adaptors to promote dynein arm assembly' _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.2612755123 _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'de Almeida Gomes, M.' 1 ? primary 'Wood, E.' 2 0009-0001-2516-615X primary 'Burgoyne, T.' 3 ? primary 'Batrinu, D.' 4 ? primary 'Klose, F.' 5 ? primary 'Boldt, K.' 6 ? primary 'Beyer, T.' 7 ? primary 'Khan, G.N.' 8 ? primary 'Mitchison, H.' 9 ? primary 'Ochi, T.' 10 0000-0001-8546-6341 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'RuvB-like 1' 50296.914 1 3.6.4.12 ? ? ? 2 polymer man 'RuvB-like 2' 51222.465 5 3.6.4.12 ? ? ? 3 polymer man 'Dynein axonemal assembly factor 19' 27400.104 1 ? ? ? 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;GGSMERNDIINFKALEKELQAALTADEKYKRENAAKLRAVEQRVASYEEFRGIVLASHLKPLERKDKMGGKRTVPWNCHT IQGRTFQDVATEISPEKAPLQPETSADFYRDWRRHLPSGPERYQALLQLGGPRLGCLFQTDVGFGLLGELLVALADHVGP ADRAAVLGILCSLASTGRFTLNLSLLSRAERESCKGLFQKLQAMGNPRSVKEGLSWEEQGLEEQSGGLQEEERLLQELLE LYQVD ; ;GGSMERNDIINFKALEKELQAALTADEKYKRENAAKLRAVEQRVASYEEFRGIVLASHLKPLERKDKMGGKRTVPWNCHT IQGRTFQDVATEISPEKAPLQPETSADFYRDWRRHLPSGPERYQALLQLGGPRLGCLFQTDVGFGLLGELLVALADHVGP ADRAAVLGILCSLASTGRFTLNLSLLSRAERESCKGLFQKLQAMGNPRSVKEGLSWEEQGLEEQSGGLQEEERLLQELLE LYQVD ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;GSMAVTGWLESLRTAQKTALLQDGRRKVHYLFPDGKEMAEEYDEKTSELLVRKWRVKSALGAMGQWQLEVGDPAPLGAGN LGPELIKESNANPIFMRKDTKMSFQWRIRNLPYPKDVYSVSVDQKERCIIVRTTNKKYYKKFSIPDLDRHQLPLDDALLS FAHANCTLIISYQKPKEVVVAESELQKELKKVKTAHSNDGDCKTQ ; ;GSMAVTGWLESLRTAQKTALLQDGRRKVHYLFPDGKEMAEEYDEKTSELLVRKWRVKSALGAMGQWQLEVGDPAPLGAGN LGPELIKESNANPIFMRKDTKMSFQWRIRNLPYPKDVYSVSVDQKERCIIVRTTNKKYYKKFSIPDLDRHQLPLDDALLS FAHANCTLIISYQKPKEVVVAESELQKELKKVKTAHSNDGDCKTQ ; H,I,J,K,L ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _pdbx_entity_nonpoly.comp_id ADP # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LYS n 1 3 ILE n 1 4 GLU n 1 5 GLU n 1 6 VAL n 1 7 LYS n 1 8 SER n 1 9 THR n 1 10 THR n 1 11 LYS n 1 12 THR n 1 13 GLN n 1 14 ARG n 1 15 ILE n 1 16 ALA n 1 17 SER n 1 18 HIS n 1 19 SER n 1 20 HIS n 1 21 VAL n 1 22 LYS n 1 23 GLY n 1 24 LEU n 1 25 GLY n 1 26 LEU n 1 27 ASP n 1 28 GLU n 1 29 SER n 1 30 GLY n 1 31 LEU n 1 32 ALA n 1 33 LYS n 1 34 GLN n 1 35 ALA n 1 36 ALA n 1 37 SER n 1 38 GLY n 1 39 LEU n 1 40 VAL n 1 41 GLY n 1 42 GLN n 1 43 GLU n 1 44 ASN n 1 45 ALA n 1 46 ARG n 1 47 GLU n 1 48 ALA n 1 49 CYS n 1 50 GLY n 1 51 VAL n 1 52 ILE n 1 53 VAL n 1 54 GLU n 1 55 LEU n 1 56 ILE n 1 57 LYS n 1 58 SER n 1 59 LYS n 1 60 LYS n 1 61 MET n 1 62 ALA n 1 63 GLY n 1 64 ARG n 1 65 ALA n 1 66 VAL n 1 67 LEU n 1 68 LEU n 1 69 ALA n 1 70 GLY n 1 71 PRO n 1 72 PRO n 1 73 GLY n 1 74 THR n 1 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