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FTEKLVRK ; ;MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLP FTEKLVRK ; R ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTY RGHGKEAKATKKK ; ;MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTY RGHGKEAKATKKK ; S ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARR KSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; ;MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARR KSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; T ? 24 'polypeptide(L)' no no MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK U ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MDLERLAQRLEGLRGYLDIPQKETRLKELERRLEDPSLWNDPEAARKVSQEAARLRRTVDTFRSLESDLQGLLELMEELP AEEREALKPELEEAAKKLDELYHQTLLNFPHAEKNAILTIQPGAGGTEACDWAEMLLRMYTRFAERQGFQVEVVDLTPGP EAGIDYAQILVKGENAYGLLSPEAGVHRLVRPSPFDASGRRHTSFAGVEVIPEVDEEVEVVLKPEELRIDVMRASGPGGQ 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45 G n 1 46 U n 1 47 G n 1 48 C n 1 49 C n 1 50 U n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 A n 1 55 C n 1 56 A n 1 57 U n 1 58 G n 1 59 C n 1 60 A n 1 61 A n 1 62 G n 1 63 U n 1 64 C n 1 65 G n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 G n 1 71 G n 1 72 C n 1 73 C n 1 74 G n 1 75 C n 1 76 G n 1 77 G n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 U n 1 81 U n 1 82 U n 1 83 U n 1 84 A n 1 85 C n 1 86 U n 1 87 C n 1 88 C n 1 89 G n 1 90 U n 1 91 G n 1 92 G n 1 93 U n 1 94 C n 1 95 A n 1 96 G n 1 97 C n 1 98 G n 1 99 G n 1 100 C n 1 101 G n 1 102 G n 1 103 A n 1 104 C n 1 105 G n 1 106 G n 1 107 G n 1 108 U n 1 109 G n 1 110 A n 1 111 G n 1 112 U n 1 113 A n 1 114 A n 1 115 C n 1 116 G n 1 117 C n 1 118 G n 1 119 U n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 G n 1 123 U n 1 124 G n 1 125 A n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 U n 1 129 A n 1 130 C n 1 131 C n 1 132 C n 1 133 G n 1 134 G n 1 135 A n 1 136 A n 1 137 G n 1 138 A n 1 139 G n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 G n 1 143 G n 1 144 A n 1 145 C n 1 146 A n 1 147 A n 1 148 C n 1 149 C n 1 150 C n 1 151 G n 1 152 G n 1 153 G n 1 154 G n 1 155 A n 1 156 A n 1 157 A n 1 158 C n 1 159 U n 1 160 C n 1 161 G n 1 162 G n 1 163 G n 1 164 C n 1 165 U n 1 166 A n 1 167 A n 1 168 U n 1 169 C n 1 170 C n 1 171 C n 1 172 C n 1 173 C n 1 174 A n 1 175 U n 1 176 G n 1 177 U n 1 178 G n 1 179 G n 1 180 A n 1 181 C n 1 182 C n 1 183 C n 1 184 G n 1 185 C n 1 186 C n 1 187 C n 1 188 C n 1 189 U n 1 190 U n 1 191 G n 1 192 G n 1 193 G n 1 194 G n 1 195 U n 1 196 G n 1 197 U n 1 198 G n 1 199 U n 1 200 C n 1 201 C n 1 202 A n 1 203 A n 1 204 A n 1 205 G n 1 206 G n 1 207 G n 1 208 C n 1 209 U n 1 210 U n 1 211 U n 1 212 G n 1 213 C n 1 214 C n 1 215 C n 1 216 G n 1 217 C n 1 218 U n 1 219 U n 1 220 C n 1 221 C n 1 222 G n 1 223 G n 1 224 A n 1 225 U n 1 226 G n 1 227 G n 1 228 G n 1 229 C n 1 230 C n 1 231 C n 1 232 G n 1 233 C n 1 234 G n 1 235 U n 1 236 C n 1 237 C n 1 238 C n 1 239 A n 1 240 U n 1 241 C n 1 242 A n 1 243 G n 1 244 C n 1 245 U n 1 246 A n 1 247 G n 1 248 U n 1 249 U n 1 250 G 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PLASMID ? ? ? pET42bTEV ? ? # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 19 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 20 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 21 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 22 1 sample ? ? ? 'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 23 1 sample ? ? ? 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'Thermus thermophilus' 300852 Thermus 'Thermus thermophilus' HB8 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 4 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific ? _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id ? _pdbx_entity_src_syn.details 'CHEMICALLY SYNTHESIZED AND GEL-PURIFIED SOURCE 24 (DHARMACON)' # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 GB M26923 155076 1 ;UUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGU UUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUC GGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAU CAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUG AGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCU UGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUA AUAGCGCCGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGG CGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACG GUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCA CCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAAC GAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGG CUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUA CCAGGCCUUGACAUGCAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGC CGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGG CCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUG GGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAG UUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACG UUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCG CCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU ; 646 ? 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'C5 H11 N O2' 117.146 YYG 'RNA linking' n '4-(3-[5-O-PHOSPHONORIBOFURANOSYL]-4,6-DIMETHYL-8-OXO-4,8-DIHYDRO-3H-1,3,4,5,7A-PENTAAZA-S-INDACEN-YLAMINO-BUTYRIC ACID METHYL ESTER' ;MODIFIED GUANOSINE-5'-PHOSPHATE ; 'C21 H29 N6 O12 P' 588.462 # _exptl.entry_id 2B9M _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 5 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 4.8 _exptl_crystal.density_percent_sol 74 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION' _exptl_crystal_grow.temp 277 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.7 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'PEG20k, MES buffer, magnesium acetate, potassium chloride, ammonium chloride, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # loop_ _exptl_crystal_grow_comp.crystal_id _exptl_crystal_grow_comp.id _exptl_crystal_grow_comp.sol_id _exptl_crystal_grow_comp.name _exptl_crystal_grow_comp.volume _exptl_crystal_grow_comp.conc _exptl_crystal_grow_comp.details 1 1 1 PEG20K ? ? ? 1 2 1 MES ? ? ? 1 3 1 'magnesium acetate' ? ? ? 1 4 1 'potassium chloride' ? ? ? 1 5 1 'ammonium chloride' ? ? ? 1 6 1 H2O ? ? ? 1 7 2 PEG20K ? ? ? 1 8 2 'magnesium acetate' ? ? ? 1 9 2 'potassium chloride' ? ? ? 1 10 2 'ammonium chloride' ? ? ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 4' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2005-04-30 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Khozu monochromator with a McLennon controller containing a LN2 cooled Si111 crystal' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.976269 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ESRF BEAMLINE ID14-4' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ESRF _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline ID14-4 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.976269 # _reflns.entry_id 2B9M _reflns.observed_criterion_sigma_F 0 _reflns.observed_criterion_sigma_I 5 _reflns.d_resolution_high 6.76 _reflns.d_resolution_low 100 _reflns.number_all ? _reflns.number_obs 123564 _reflns.percent_possible_obs 99.1 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.193 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 8.2 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 5.7 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # _reflns_shell.d_res_high 6.76 _reflns_shell.d_res_low 7.11 _reflns_shell.percent_possible_all 99.6 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value 0.75 _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.34 _reflns_shell.pdbx_redundancy 5.7 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all 12215 _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 # _refine.entry_id 2B9M _refine.ls_d_res_high 6.76 _refine.ls_d_res_low 43.35 _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.0 _refine.pdbx_ls_sigma_I 31449976.91 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs 84085 _refine.ls_number_reflns_R_free 4219 _refine.ls_percent_reflns_obs 96.2 _refine.ls_R_factor_all 0.344 _refine.ls_R_factor_obs 0.344 _refine.ls_R_factor_R_work 0.341 _refine.ls_R_factor_R_free 0.356 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRY 1J5E, 1NKW' _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.pdbx_R_Free_selection_details random _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'Engh & Huber' _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model anisotropic _refine.B_iso_mean 279 _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.details ;THIS IS A LOW RESOLUTION STRUCTURE OBTAINED BY USING A MOLECULAR REPLACEMENT MODEL. THE STRUCTURE IS DEPOSITED AS AN ALL-ATOM MODEL ONLY SO THAT OUR REFINEMENT PROCEDURE AND MAPS CAN BE REPLICATED. THE CONFORMATION OF INDIVIDUAL ATOMS OR SIDE CHAINS, THE REGISTRY OF THE RESIDUES ALONG THE CHAIN, OR EVEN THE DETAILED PATH OF MAIN CHAINS CANNOT BE ASCERTAINED AT THIS RESOLUTION. Chain X contains only P atoms and chain Y contains only CA atoms. There are lots of O3*-P distances that are not within bond distance in both chain A and chain W. ; _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_analyze.entry_id 2B9M _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_obs 1.39 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_obs 0.92 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_obs 15.00 _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_free 1.50 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_free 1.29 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_free ? _refine_analyze.number_disordered_residues ? _refine_analyze.occupancy_sum_non_hydrogen ? _refine_analyze.occupancy_sum_hydrogen ? _refine_analyze.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 19596 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 35947 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 55543 _refine_hist.d_res_high 6.76 _refine_hist.d_res_low 43.35 # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used ? _refine_ls_shell.d_res_high 6.76 _refine_ls_shell.d_res_low 6.81 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.367 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 87.9 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.399 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error 0.015 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 629 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 2B9M _struct.title ;30S ribosomal subunit, tRNAs, mRNA and release factor RF2 from a crystal structure of the whole ribosomal complex. This file contains the 30S ribosomal subunit, tRNAs, mRNA and release factor RF2 from a crystal structure of the whole ribosomal complex". The entire crystal structure contains one 70S ribosome, tRNAs, mRNA and release factor RF2 and is described in remark 400. ; _struct.pdbx_descriptor '30S ribosomal subunit' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2B9M _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text 'ribosome, translation, release factor' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP E 43 ? MET E 63 ? ASP B 43 MET B 63 1 ? 21 HELX_P HELX_P2 2 ALA E 77 ? ALA E 85 ? ALA B 77 ALA B 85 1 ? 9 HELX_P HELX_P3 3 ASN E 104 ? VAL E 112 ? ASN B 104 VAL B 112 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 4 HIS E 113 ? LEU E 121 ? HIS B 113 LEU B 121 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 5 PRO E 131 ? TYR E 148 ? PRO B 131 TYR B 148 1 ? 18 HELX_P HELX_P6 6 TYR E 148 ? ARG E 153 ? TYR B 148 ARG B 153 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 7 GLU E 170 ? PHE E 181 ? GLU B 170 PHE B 181 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 8 ALA E 207 ? GLY E 227 ? ALA B 207 GLY B 227 1 ? 21 HELX_P HELX_P9 9 GLN F 28 ? LEU F 47 ? GLN C 28 LEU C 47 1 ? 20 HELX_P HELX_P10 10 PRO F 73 ? GLY F 78 ? PRO C 73 GLY C 78 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 GLU F 82 ? THR F 95 ? GLU C 82 THR C 95 1 ? 14 HELX_P HELX_P12 12 SER F 112 ? ARG F 126 ? SER C 112 ARG C 126 1 ? 15 HELX_P HELX_P13 13 ALA F 129 ? SER F 144 ? ALA C 129 SER C 144 1 ? 16 HELX_P HELX_P14 14 ARG G 10 ? GLU G 15 ? ARG D 10 GLU D 15 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 15 SER G 52 ? GLY G 69 ? SER D 52 GLY D 69 1 ? 18 HELX_P HELX_P16 16 SER G 71 ? LYS G 85 ? SER D 71 LYS D 85 1 ? 15 HELX_P HELX_P17 17 GLY G 90 ? SER G 99 ? GLY D 90 SER D 99 1 ? 10 HELX_P HELX_P18 18 ARG G 100 ? LEU G 108 ? ARG D 100 LEU D 108 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 19 SER G 113 ? HIS G 123 ? SER D 113 HIS D 123 1 ? 11 HELX_P HELX_P20 20 LYS G 151 ? ASN G 154 ? LYS D 151 ASN D 154 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 21 LEU G 155 ? MET G 165 ? LEU D 155 MET D 165 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 GLU G 200 ? GLU G 205 ? GLU D 200 GLU D 205 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 23 GLU H 50 ? ALA H 62 ? GLU E 50 ALA E 62 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 24 ALA H 104 ? ILE H 109 ? ALA E 104 ILE E 109 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 25 ILE H 109 ? GLY H 114 ? ILE E 109 GLY E 114 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 26 ASN H 127 ? THR H 135 ? ASN E 127 THR E 135 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 27 THR H 135 ? GLN H 141 ? THR E 135 GLN E 141 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 28 THR H 144 ? THR H 144 ? THR E 144 THR E 144 1 ? 1 HELX_P HELX_P29 29 LYS H 145 ? LYS H 153 ? LYS E 145 LYS E 153 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 30 ASP I 15 ? GLY I 34 ? ASP F 15 GLY F 34 1 ? 20 HELX_P HELX_P31 31 PRO I 68 ? ASP I 70 ? PRO F 68 ASP F 70 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 ARG I 71 ? ILE I 81 ? ARG F 71 ILE F 81 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 33 ASP J 20 ? MET J 31 ? ASP G 20 MET G 31 1 ? 12 HELX_P HELX_P34 34 LYS J 35 ? THR J 54 ? LYS G 35 THR G 54 1 ? 20 HELX_P HELX_P35 35 GLU J 57 ? ASN J 68 ? GLU G 57 ASN G 68 1 ? 12 HELX_P HELX_P36 36 SER J 92 ? GLN J 110 ? SER G 92 GLN G 110 1 ? 19 HELX_P HELX_P37 37 ARG J 115 ? GLY J 130 ? ARG G 115 GLY G 130 1 ? 16 HELX_P HELX_P38 38 GLY J 132 ? ASN J 148 ? GLY G 132 ASN G 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P39 39 ARG J 149 ? ARG J 155 ? ARG G 149 ARG G 155 5 ? 7 HELX_P HELX_P40 40 ASP K 4 ? TYR K 20 ? ASP H 4 TYR H 20 1 ? 17 HELX_P HELX_P41 41 SER K 29 ? ARG K 41 ? SER H 29 ARG H 41 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 42 ARG K 102 ? LEU K 107 ? ARG H 102 LEU H 107 5 ? 6 HELX_P HELX_P43 43 ASP K 121 ? LYS K 126 ? ASP H 121 LYS H 126 1 ? 6 HELX_P HELX_P44 44 ASP L 32 ? PHE L 37 ? ASP I 32 PHE I 37 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 45 LEU L 40 ? ARG L 51 ? LEU I 40 ARG I 51 5 ? 12 HELX_P HELX_P46 46 GLY L 69 ? ASN L 89 ? GLY I 69 ASN I 89 1 ? 21 HELX_P HELX_P47 47 TYR L 92 ? LYS L 97 ? TYR I 92 LYS I 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 48 ASP M 12 ? ALA M 27 ? ASP J 12 ALA J 27 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 49 ARG M 28 ? 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ARG M 88 ARG M 94 1 ? 7 HELX_P HELX_P65 65 PHE Q 16 ? ALA Q 20 ? PHE N 16 ALA N 20 5 ? 5 HELX_P HELX_P66 66 CYS Q 40 ? LYS Q 50 ? CYS N 40 LYS N 50 1 ? 11 HELX_P HELX_P67 67 THR R 4 ? ALA R 16 ? THR O 4 ALA O 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P68 68 SER R 24 ? ARG R 38 ? SER O 24 ARG O 38 1 ? 15 HELX_P HELX_P69 69 LEU R 39 ? VAL R 45 ? LEU O 39 VAL O 45 1 ? 7 HELX_P HELX_P70 70 ASP R 49 ? ASP R 74 ? ASP O 49 ASP O 74 1 ? 26 HELX_P HELX_P71 71 ASP R 74 ? GLY R 86 ? ASP O 74 GLY O 86 1 ? 13 HELX_P HELX_P72 72 ASP S 52 ? VAL S 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P73 73 THR S 67 ? GLN S 76 ? THR P 67 GLN P 76 1 ? 10 HELX_P HELX_P74 74 LEU T 84 ? ARG T 92 ? LEU Q 84 ARG Q 92 1 ? 9 HELX_P HELX_P75 75 GLN T 93 ? TYR T 95 ? GLN Q 93 TYR Q 95 5 ? 3 HELX_P HELX_P76 76 PRO U 52 ? GLY U 57 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P77 77 LYS U 61 ? LEU U 66 ? LYS R 61 LEU R 66 1 ? 6 HELX_P HELX_P78 78 LEU U 66 ? GLY U 77 ? LEU R 66 GLY R 77 1 ? 12 HELX_P HELX_P79 79 ASP V 12 ? GLU V 21 ? 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THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAIN ONE 70S RIBOSOME, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF2 AND ARE DEPOSITED UNDER 2B9M (30S SUBUNIT AND LIGANDS) AND 2B9N (50S SUBUNIT). ; 999 ;SEQUENCE THE FIRST 17 INSERTIONS IN CHAIN Y ARE DUE TO AN INTERNAL FRAMESHIFT SITE WITHIN THE RF2 (CHAIN Y) CODING SEQUENCE. THE +1 FRAMESHIFT TAKES PLACE AT POSITION 18. ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O23 W YYG 37 ? ? CB G ALA 83 ? ? 0.59 2 1 "O2'" A A 1229 ? ? OP1 V G 30 ? ? 0.92 3 1 O6 W G 24 ? ? N2 W G 45 ? ? 0.93 4 1 "O2'" A A 986 ? ? O S LYS 55 ? ? 1.09 5 1 CD M LYS 122 ? ? CA Y ALA 162 ? ? 1.10 6 1 "O5'" V A 31 ? ? CE I LYS 127 ? ? 1.11 7 1 C2 V A 35 ? ? N3 X C 118 ? ? 1.22 8 1 "C2'" W C 25 ? ? 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P A U 561 ? ? 129.61 119.70 9.91 1.20 Y 86 1 "C1'" A A 563 ? ? "O4'" A A 563 ? ? "C4'" A A 563 ? ? 102.90 109.70 -6.80 0.70 N 87 1 "C3'" A G 566 ? ? "O3'" A G 566 ? ? P A G 567 ? ? 110.67 119.70 -9.03 1.20 Y 88 1 "O3'" A G 566 ? ? P A G 567 ? ? "O5'" A G 567 ? ? 125.69 104.00 21.69 1.90 Y 89 1 "C3'" A C 569 ? ? "O3'" A C 569 ? ? P A G 570 ? ? 109.65 119.70 -10.05 1.20 Y 90 1 "O3'" A C 569 ? ? P A G 570 ? ? "O5'" A G 570 ? ? 90.94 104.00 -13.06 1.90 Y 91 1 "O3'" A C 569 ? ? P A G 570 ? ? OP2 A G 570 ? ? 120.98 110.50 10.48 1.10 Y 92 1 "C3'" A A 573 ? ? "O3'" A A 573 ? ? P A A 574 ? ? 127.11 119.70 7.41 1.20 Y 93 1 "C3'" A G 575 ? ? "O3'" A G 575 ? ? P A G 576 ? ? 132.64 119.70 12.94 1.20 Y 94 1 "O4'" A C 578 ? ? "C1'" A C 578 ? ? N1 A C 578 ? ? 113.54 108.50 5.04 0.70 N 95 1 "O4'" A C 586 ? ? "C1'" A C 586 ? ? N1 A C 586 ? ? 112.75 108.50 4.25 0.70 N 96 1 "O4'" A U 591 ? ? "C1'" A U 591 ? ? N1 A U 591 ? ? 113.67 108.50 5.17 0.70 N 97 1 "C3'" A U 603 ? ? "C2'" A U 603 ? ? "C1'" A U 603 ? ? 96.63 101.30 -4.67 0.70 N 98 1 "C3'" A G 616 ? ? "C2'" A G 616 ? ? "C1'" A G 616 ? ? 97.02 101.30 -4.28 0.70 N 99 1 "O4'" A C 634 ? ? "C1'" A C 634 ? ? N1 A C 634 ? ? 113.17 108.50 4.67 0.70 N 100 1 "O4'" A U 652 ? ? "C1'" A U 652 ? ? N1 A U 652 ? ? 113.22 108.50 4.72 0.70 N 101 1 "C3'" A C 656 ? ? "C2'" A C 656 ? ? "C1'" A C 656 ? ? 97.09 101.30 -4.21 0.70 N 102 1 "C3'" A A 687 ? ? "O3'" A A 687 ? ? P A G 688 ? ? 130.94 119.70 11.24 1.20 Y 103 1 "O3'" A A 687 ? ? P A G 688 ? ? OP2 A G 688 ? ? 123.61 110.50 13.11 1.10 Y 104 1 "C1'" A C 701 ? ? "O4'" A C 701 ? ? "C4'" A C 701 ? ? 104.46 109.70 -5.24 0.70 N 105 1 "C3'" A C 701 ? ? "O3'" A C 701 ? ? P A A 702 ? ? 128.86 119.70 9.16 1.20 Y 106 1 "O3'" A C 717 ? ? P A G 718 ? ? OP2 A G 718 ? ? 86.56 105.20 -18.64 2.20 Y 107 1 "O3'" A C 717 ? ? P A G 718 ? ? OP1 A G 718 ? ? 122.89 110.50 12.39 1.10 Y 108 1 C2 A U 723 ? ? N1 A U 723 ? ? "C1'" A U 723 ? ? 125.18 117.70 7.48 1.20 N 109 1 "O4'" A G 727 ? ? "C4'" A G 727 ? ? "C3'" A G 727 ? ? 97.98 104.00 -6.02 1.00 N 110 1 "C3'" A G 727 ? ? "C2'" A G 727 ? ? "C1'" A G 727 ? ? 95.41 101.30 -5.89 0.70 N 111 1 "O4'" A A 728 ? ? "C1'" A A 728 ? ? N9 A A 728 ? ? 112.96 108.50 4.46 0.70 N 112 1 "O4'" A C 732 ? ? "C1'" A C 732 ? ? N1 A C 732 ? ? 112.75 108.50 4.25 0.70 N 113 1 "C3'" A C 738 ? ? "C2'" A C 738 ? ? "C1'" A C 738 ? ? 96.95 101.30 -4.35 0.70 N 114 1 "O4'" A U 740 ? ? "C1'" A U 740 ? ? N1 A U 740 ? ? 112.87 108.50 4.37 0.70 N 115 1 "C3'" A C 748 ? ? "O3'" A C 748 ? ? P A C 749 ? ? 126.91 119.70 7.21 1.20 Y 116 1 "C3'" A C 754 ? ? "O3'" A C 754 ? ? P A G 755 ? ? 130.83 119.70 11.13 1.20 Y 117 1 "O3'" A G 765 ? ? P A A 766 ? ? "O5'" A A 766 ? ? 87.72 104.00 -16.28 1.90 Y 118 1 "O3'" A G 765 ? ? P A A 766 ? ? OP1 A A 766 ? ? 123.90 110.50 13.40 1.10 Y 119 1 "O4'" A C 770 ? ? "C1'" A C 770 ? ? N1 A C 770 ? ? 113.65 108.50 5.15 0.70 N 120 1 "C3'" A G 776 ? ? "O3'" A G 776 ? ? P A A 777 ? ? 127.76 119.70 8.06 1.20 Y 121 1 "C1'" A U 793 ? ? "O4'" A U 793 ? ? "C4'" A U 793 ? ? 102.00 109.70 -7.70 0.70 N 122 1 "O4'" A U 801 ? ? "C1'" A U 801 ? ? N1 A U 801 ? ? 112.75 108.50 4.25 0.70 N 123 1 "C3'" A U 804 ? ? "O3'" A U 804 ? ? P A C 805 ? ? 106.51 119.70 -13.19 1.20 Y 124 1 "O4'" A C 806 ? ? "C1'" A C 806 ? ? N1 A C 806 ? ? 113.08 108.50 4.58 0.70 N 125 1 "C3'" A C 812 ? ? "O3'" A C 812 ? ? P A U 813 ? ? 130.83 119.70 11.13 1.20 Y 126 1 "C3'" A U 813 ? ? "O3'" A U 813 ? ? P A A 814 ? ? 131.73 119.70 12.03 1.20 Y 127 1 "C3'" A C 817 ? ? "O3'" A C 817 ? ? P A G 818 ? ? 130.58 119.70 10.88 1.20 Y 128 1 "C1'" A G 818 ? ? "O4'" A G 818 ? ? "C4'" A G 818 ? ? 104.38 109.70 -5.32 0.70 N 129 1 "O4'" A G 818 ? ? "C1'" A G 818 ? ? N9 A G 818 ? ? 116.38 108.50 7.88 0.70 N 130 1 "O4'" A A 819 ? ? "C1'" A A 819 ? ? N9 A A 819 ? ? 102.24 108.20 -5.96 0.80 N 131 1 "O4'" A C 849 ? ? "C1'" A C 849 ? ? N1 A C 849 ? ? 113.06 108.50 4.56 0.70 N 132 1 "C4'" A G 851 ? ? "C3'" A G 851 ? ? "C2'" A G 851 ? ? 95.47 102.60 -7.13 1.00 N 133 1 "C1'" A A 859 ? ? "O4'" A A 859 ? ? "C4'" A A 859 ? ? 104.99 109.70 -4.71 0.70 N 134 1 "O4'" A A 859 ? ? "C1'" A A 859 ? ? N9 A A 859 ? ? 113.32 108.50 4.82 0.70 N 135 1 "C1'" A U 863 ? ? "O4'" A U 863 ? ? "C4'" A U 863 ? ? 103.89 109.70 -5.81 0.70 N 136 1 "C3'" A G 869 ? ? "O3'" A G 869 ? ? P A U 870 ? ? 128.72 119.70 9.02 1.20 Y 137 1 "O3'" A G 869 ? ? P A U 870 ? ? OP1 A U 870 ? ? 90.30 105.20 -14.90 2.20 Y 138 1 "C3'" A U 871 ? ? "O3'" A U 871 ? ? P A A 872 ? ? 127.04 119.70 7.34 1.20 Y 139 1 "C3'" A A 873 ? ? "O3'" A A 873 ? ? P A G 874 ? ? 127.42 119.70 7.72 1.20 Y 140 1 "C4'" A C 877 ? ? "C3'" A C 877 ? ? "C2'" A C 877 ? ? 95.76 102.60 -6.84 1.00 N 141 1 "C3'" A C 877 ? ? "C2'" A C 877 ? ? "C1'" A C 877 ? ? 94.88 101.30 -6.42 0.70 N 142 1 "O4'" A C 882 ? ? "C1'" A C 882 ? ? N1 A C 882 ? ? 112.86 108.50 4.36 0.70 N 143 1 "O4'" A U 884 ? ? "C1'" A U 884 ? ? N1 A U 884 ? ? 113.38 108.50 4.88 0.70 N 144 1 "C3'" A U 884 ? ? "O3'" A U 884 ? ? P A G 885 ? ? 109.34 119.70 -10.36 1.20 Y 145 1 "O3'" A U 884 ? ? P A G 885 ? ? "O5'" A G 885 ? ? 87.26 104.00 -16.74 1.90 Y 146 1 "O3'" A U 884 ? ? P A G 885 ? ? OP1 A G 885 ? ? 127.00 110.50 16.50 1.10 Y 147 1 "C3'" A A 889 ? ? "O3'" A A 889 ? ? P A G 890 ? ? 129.62 119.70 9.92 1.20 Y 148 1 "C1'" A G 890 ? ? "O4'" A G 890 ? ? "C4'" A G 890 ? ? 104.79 109.70 -4.91 0.70 N 149 1 "O4'" A U 891 ? ? "C1'" A U 891 ? ? N1 A U 891 ? ? 113.64 108.50 5.14 0.70 N 150 1 "O4'" A C 904 ? ? "C1'" A C 904 ? ? N1 A C 904 ? ? 113.04 108.50 4.54 0.70 N 151 1 "C3'" A A 908 ? ? "C2'" A A 908 ? ? "C1'" A A 908 ? ? 96.60 101.30 -4.70 0.70 N 152 1 "O5'" A C 910 ? ? "C5'" A C 910 ? ? "C4'" A C 910 ? ? 104.11 109.40 -5.29 0.80 N 153 1 "C3'" A A 913 ? ? "O3'" A A 913 ? ? P A A 914 ? ? 148.74 119.70 29.04 1.20 Y 154 1 "O3'" A A 913 ? ? P A A 914 ? ? OP2 A A 914 ? ? 91.38 105.20 -13.82 2.20 Y 155 1 "O3'" A A 913 ? ? P A A 914 ? ? OP1 A A 914 ? ? 128.54 110.50 18.04 1.10 Y 156 1 "C1'" A A 914 ? ? "O4'" A A 914 ? ? "C4'" A A 914 ? ? 102.71 109.70 -6.99 0.70 N 157 1 "C4'" A A 914 ? ? "C3'" A A 914 ? ? "C2'" A A 914 ? ? 95.66 102.60 -6.94 1.00 N 158 1 "O4'" A A 914 ? ? "C1'" A A 914 ? ? N9 A A 914 ? ? 115.39 108.50 6.89 0.70 N 159 1 "C3'" A A 915 ? ? "C2'" A A 915 ? ? "C1'" A A 915 ? ? 96.56 101.30 -4.74 0.70 N 160 1 "C4'" A G 917 ? ? "C3'" A G 917 ? ? "C2'" A G 917 ? ? 96.33 102.60 -6.27 1.00 N 161 1 "C3'" A G 917 ? ? "C2'" A G 917 ? ? "C1'" A G 917 ? ? 96.68 101.30 -4.62 0.70 N 162 1 "C3'" A G 927 ? ? "C2'" A G 927 ? ? "C1'" A G 927 ? ? 95.40 101.30 -5.90 0.70 N 163 1 "C1'" A G 939 ? ? "O4'" A G 939 ? ? "C4'" A G 939 ? ? 104.84 109.70 -4.86 0.70 N 164 1 "C3'" A G 944 ? ? "O3'" A G 944 ? ? P A G 945 ? ? 96.34 119.70 -23.36 1.20 Y 165 1 "O3'" A G 944 ? ? P A G 945 ? ? OP2 A G 945 ? ? 136.27 110.50 25.77 1.10 Y 166 1 "O3'" A G 944 ? ? P A G 945 ? ? OP1 A G 945 ? ? 84.62 105.20 -20.58 2.20 Y 167 1 "O3'" A U 960 ? ? P A U 961 ? ? OP1 A U 961 ? ? 90.67 105.20 -14.53 2.20 Y 168 1 "C3'" A A 965 ? ? "O3'" A A 965 ? ? P A G 966 ? ? 128.93 119.70 9.23 1.20 Y 169 1 "C3'" A A 975 ? ? "O3'" A A 975 ? ? P A G 976 ? ? 128.09 119.70 8.39 1.20 Y 170 1 "C1'" A G 976 ? ? "O4'" A G 976 ? ? "C4'" A G 976 ? ? 105.34 109.70 -4.36 0.70 N 171 1 "C3'" A U 992 ? ? "O3'" A U 992 ? ? P A G 993 ? ? 129.45 119.70 9.75 1.20 Y 172 1 "C3'" A G 993 ? ? "O3'" A G 993 ? ? P A A 994 ? ? 128.46 119.70 8.76 1.20 Y 173 1 "C1'" A A 1004 ? ? "O4'" A A 1004 ? ? "C4'" A A 1004 ? ? 104.93 109.70 -4.77 0.70 N 174 1 "C3'" A G 1024 ? ? "O3'" A G 1024 ? ? P A U 1025 ? ? 108.79 119.70 -10.91 1.20 Y 175 1 "O3'" A G 1024 ? ? P A U 1025 ? ? "O5'" A U 1025 ? ? 127.32 104.00 23.32 1.90 Y 176 1 "O3'" A G 1024 ? ? P A U 1025 ? ? OP2 A U 1025 ? ? 91.15 105.20 -14.05 2.20 Y 177 1 "O3'" A C 1037 ? ? P A C 1038 ? ? "O5'" A C 1038 ? ? 120.95 104.00 16.95 1.90 Y 178 1 "C3'" A U 1049 ? ? "O3'" A U 1049 ? ? P A G 1050 ? ? 128.77 119.70 9.07 1.20 Y 179 1 "C1'" A G 1064 ? ? "O4'" A G 1064 ? ? "C4'" A G 1064 ? ? 101.92 109.70 -7.78 0.70 N 180 1 "C3'" A U 1065 ? ? "O3'" A U 1065 ? ? P A C 1066 ? ? 130.74 119.70 11.04 1.20 Y 181 1 "C3'" A U 1073 ? ? "O3'" A U 1073 ? ? P A G 1074 ? ? 88.70 119.70 -31.00 1.20 Y 182 1 "O3'" A U 1073 ? ? P A G 1074 ? ? OP2 A G 1074 ? ? 137.56 110.50 27.06 1.10 Y 183 1 "O3'" A U 1073 ? ? P A G 1074 ? ? OP1 A G 1074 ? ? 78.12 105.20 -27.08 2.20 Y 184 1 "C3'" A G 1084 ? ? "O3'" A G 1084 ? ? P A U 1085 ? ? 127.59 119.70 7.89 1.20 Y 185 1 "C3'" A U 1085 ? ? "O3'" A U 1085 ? ? P A U 1086 ? ? 147.22 119.70 27.52 1.20 Y 186 1 "O3'" A U 1085 ? ? P A U 1086 ? ? "O5'" A U 1086 ? ? 122.77 104.00 18.77 1.90 Y 187 1 "O3'" A U 1085 ? ? P A U 1086 ? ? OP1 A U 1086 ? ? 85.13 105.20 -20.07 2.20 Y 188 1 "C1'" A G 1094 ? ? "O4'" A G 1094 ? ? "C4'" A G 1094 ? ? 105.21 109.70 -4.49 0.70 N 189 1 "C3'" A A 1101 ? ? "O3'" A A 1101 ? ? P A A 1102 ? ? 111.76 119.70 -7.94 1.20 Y 190 1 "O3'" A A 1101 ? ? P A A 1102 ? ? "O5'" A A 1102 ? ? 119.66 104.00 15.66 1.90 Y 191 1 "O3'" A A 1101 ? ? P A A 1102 ? ? OP1 A A 1102 ? ? 89.43 105.20 -15.77 2.20 Y 192 1 "C4'" A G 1108 ? ? "C3'" A G 1108 ? ? "C2'" A G 1108 ? ? 96.39 102.60 -6.21 1.00 N 193 1 "C3'" A G 1117 ? ? "O3'" A G 1117 ? ? P A C 1118 ? ? 131.60 119.70 11.90 1.20 Y 194 1 "O3'" A G 1117 ? ? P A C 1118 ? ? OP1 A C 1118 ? ? 120.35 110.50 9.85 1.10 Y 195 1 "C3'" A C 1145 ? ? "O3'" A C 1145 ? ? P A A 1146 ? ? 128.35 119.70 8.65 1.20 Y 196 1 "O3'" A G 1182 ? ? P A A 1183 ? ? OP2 A A 1183 ? ? 122.60 110.50 12.10 1.10 Y 197 1 "C3'" A C 1189 ? ? "O3'" A C 1189 ? ? P A G 1190 ? ? 107.15 119.70 -12.55 1.20 Y 198 1 "O3'" A C 1189 ? ? P A G 1190 ? ? "O5'" A G 1190 ? ? 88.74 104.00 -15.26 1.90 Y 199 1 "O3'" A C 1189 ? ? P A G 1190 ? ? OP2 A G 1190 ? ? 129.76 110.50 19.26 1.10 Y 200 1 "C3'" A G 1190 ? ? "O3'" A G 1190 ? ? P A A 1191 ? ? 128.54 119.70 8.84 1.20 Y 201 1 "C3'" A C 1192 ? ? "C2'" A C 1192 ? ? "C1'" A C 1192 ? ? 96.95 101.30 -4.35 0.70 N 202 1 "C3'" A G 1193 ? ? "C2'" A G 1193 ? ? "C1'" A G 1193 ? ? 96.89 101.30 -4.41 0.70 N 203 1 "C3'" A A 1201 ? ? "O3'" A A 1201 ? ? P A G 1202 ? ? 132.20 119.70 12.50 1.20 Y 204 1 "C1'" A G 1224 ? ? "O4'" A G 1224 ? ? "C4'" A G 1224 ? ? 104.40 109.70 -5.30 0.70 N 205 1 "C3'" A C 1226 ? ? "O3'" A C 1226 ? ? P A A 1227 ? ? 129.75 119.70 10.05 1.20 Y 206 1 "C3'" A G 1255 ? ? "O3'" A G 1255 ? ? P A A 1256 ? ? 91.31 119.70 -28.39 1.20 Y 207 1 "O3'" A G 1255 ? ? P A A 1256 ? ? "O5'" A A 1256 ? ? 91.90 104.00 -12.10 1.90 Y 208 1 "O3'" A G 1255 ? ? P A A 1256 ? ? OP2 A A 1256 ? ? 151.81 110.50 41.31 1.10 Y 209 1 "O3'" A G 1255 ? ? P A A 1256 ? ? OP1 A A 1256 ? ? 70.84 105.20 -34.36 2.20 Y 210 1 "C3'" A U 1257 ? ? "O3'" A U 1257 ? ? P A G 1258 ? ? 129.41 119.70 9.71 1.20 Y 211 1 "C3'" A U 1278 ? ? "O3'" A U 1278 ? ? P A A 1279 ? ? 138.67 119.70 18.97 1.20 Y 212 1 "O3'" A U 1278 ? ? P A A 1279 ? ? "O5'" A A 1279 ? ? 70.25 104.00 -33.75 1.90 Y 213 1 "O3'" A U 1278 ? ? P A A 1279 ? ? OP2 A A 1279 ? ? 145.68 110.50 35.18 1.10 Y 214 1 "O3'" A U 1278 ? ? P A A 1279 ? ? OP1 A A 1279 ? ? 91.81 105.20 -13.39 2.20 Y 215 1 "C3'" A U 1281 ? ? "O3'" A U 1281 ? ? P A C 1282 ? ? 129.13 119.70 9.43 1.20 Y 216 1 "C3'" A A 1285 ? ? "O3'" A A 1285 ? ? P A A 1286 ? ? 127.16 119.70 7.46 1.20 Y 217 1 "C3'" A C 1297 ? ? "O3'" A C 1297 ? ? P A C 1298 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y 218 1 "C3'" A G 1300 ? ? "O3'" A G 1300 ? ? P A U 1301 ? ? 127.20 119.70 7.50 1.20 Y 219 1 "C1'" A U 1301 ? ? "O4'" A U 1301 ? ? "C4'" A U 1301 ? ? 104.13 109.70 -5.57 0.70 N 220 1 "C3'" A G 1337 ? ? "O3'" A G 1337 ? ? P A G 1338 ? ? 145.94 119.70 26.24 1.20 Y 221 1 "O3'" A G 1337 ? ? P A G 1338 ? ? "O5'" A G 1338 ? ? 126.60 104.00 22.60 1.90 Y 222 1 "O3'" A G 1337 ? ? P A G 1338 ? ? OP2 A G 1338 ? ? 86.08 105.20 -19.12 2.20 Y 223 1 "C3'" A U 1345 ? ? "O3'" A U 1345 ? ? P A A 1346 ? ? 140.07 119.70 20.37 1.20 Y 224 1 "O3'" A U 1345 ? ? P A A 1346 ? ? "O5'" A A 1346 ? ? 87.86 104.00 -16.14 1.90 Y 225 1 "O3'" A U 1345 ? ? P A A 1346 ? ? OP2 A A 1346 ? ? 126.05 110.50 15.55 1.10 Y 226 1 "C3'" A A 1346 ? ? "O3'" A A 1346 ? ? P A G 1347 ? ? 129.29 119.70 9.59 1.20 Y 227 1 "C3'" A G 1347 ? ? "O3'" A G 1347 ? ? P A U 1348 ? ? 129.95 119.70 10.25 1.20 Y 228 1 "O3'" A A 1377 ? ? P A C 1378 ? ? OP2 A C 1378 ? ? 127.60 110.50 17.10 1.10 Y 229 1 "O3'" A A 1377 ? ? P A C 1378 ? ? OP1 A C 1378 ? ? 87.03 105.20 -18.17 2.20 Y 230 1 "C1'" A U 1380 ? ? "O4'" A U 1380 ? ? "C4'" A U 1380 ? ? 105.43 109.70 -4.27 0.70 N 231 1 "C3'" A U 1380 ? ? "O3'" A U 1380 ? ? P A U 1381 ? ? 129.48 119.70 9.78 1.20 Y 232 1 "C3'" A A 1396 ? ? "O3'" A A 1396 ? ? P A C 1397 ? ? 96.57 119.70 -23.13 1.20 Y 233 1 "O3'" A A 1396 ? ? P A C 1397 ? ? "O5'" A C 1397 ? ? 77.39 104.00 -26.61 1.90 Y 234 1 "O3'" A A 1396 ? ? P A C 1397 ? ? OP2 A C 1397 ? ? 125.16 110.50 14.66 1.10 Y 235 1 N1 A C 1397 ? ? C2 A C 1397 ? ? O2 A C 1397 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 236 1 "C3'" A A 1398 ? ? "C2'" A A 1398 ? ? "C1'" A A 1398 ? ? 96.37 101.30 -4.93 0.70 N 237 1 "C1'" A C 1399 ? ? "O4'" A C 1399 ? ? "C4'" A C 1399 ? ? 105.38 109.70 -4.32 0.70 N 238 1 "C3'" A C 1400 ? ? "C2'" A C 1400 ? ? "C1'" A C 1400 ? ? 106.63 101.50 5.13 0.80 N 239 1 "C3'" A A 1413 ? ? "C2'" A A 1413 ? ? "C1'" A A 1413 ? ? 96.59 101.30 -4.71 0.70 N 240 1 "C3'" A A 1451 ? ? "C2'" A A 1451 ? ? "C1'" A A 1451 ? ? 96.99 101.30 -4.31 0.70 N 241 1 C2 A C 1452 ? ? N1 A C 1452 ? ? "C1'" A C 1452 ? ? 125.82 118.80 7.02 1.10 N 242 1 "C1'" A G 1453 ? ? "O4'" A G 1453 ? ? "C4'" A G 1453 ? ? 104.83 109.70 -4.87 0.70 N 243 1 "O4'" A G 1453 ? ? "C1'" A G 1453 ? ? N9 A G 1453 ? ? 112.95 108.50 4.45 0.70 N 244 1 "O4'" A U 1481 ? ? "C1'" A U 1481 ? ? N1 A U 1481 ? ? 113.20 108.50 4.70 0.70 N 245 1 "C3'" A U 1498 ? ? "O3'" A U 1498 ? ? P A A 1499 ? ? 128.07 119.70 8.37 1.20 Y 246 1 "C1'" A A 1502 ? ? "O4'" A A 1502 ? ? "C4'" A A 1502 ? ? 102.94 109.70 -6.76 0.70 N 247 1 "O4'" A A 1502 ? ? "C1'" A A 1502 ? ? N9 A A 1502 ? ? 113.64 108.50 5.14 0.70 N 248 1 "C3'" A G 1504 ? ? "O3'" A G 1504 ? ? P A G 1505 ? ? 131.41 119.70 11.71 1.20 Y 249 1 "O3'" A G 1504 ? ? P A G 1505 ? ? "O5'" A G 1505 ? ? 85.26 104.00 -18.74 1.90 Y 250 1 "O3'" A G 1504 ? ? P A G 1505 ? ? OP2 A G 1505 ? ? 125.71 110.50 15.21 1.10 Y 251 1 "C3'" A G 1505 ? ? "O3'" A G 1505 ? ? P A U 1506 ? ? 130.82 119.70 11.12 1.20 Y 252 1 "C3'" A U 1510 ? ? "C2'" A U 1510 ? ? "C1'" A U 1510 ? ? 97.07 101.30 -4.23 0.70 N 253 1 "O4'" A U 1522 ? ? "C1'" A U 1522 ? ? N1 A U 1522 ? ? 113.76 108.50 5.26 0.70 N 254 1 "C3'" A U 1528 ? ? "O3'" A U 1528 ? ? P A G 1529 ? ? 127.90 119.70 8.20 1.20 Y 255 1 "C3'" A U 1532 ? ? "C2'" A U 1532 ? ? "C1'" A U 1532 ? ? 96.38 101.30 -4.92 0.70 N 256 1 "O4'" A U 1532 ? ? "C1'" A U 1532 ? ? N1 A U 1532 ? ? 113.65 108.50 5.15 0.70 N 257 1 "O3'" V G 45 ? ? P V G 46 ? ? "O5'" V G 46 ? ? 126.72 104.00 22.72 1.90 Y 258 1 "O3'" V G 45 ? ? P V G 46 ? ? OP1 V G 46 ? ? 85.83 105.20 -19.37 2.20 Y 259 1 "C3'" V G 65 ? ? "O3'" V G 65 ? ? P V A 66 ? ? 135.93 119.70 16.23 1.20 Y 260 1 "O3'" V G 65 ? ? P V A 66 ? ? OP1 V A 66 ? ? 124.38 110.50 13.88 1.10 Y 261 1 "C3'" W G 1 ? ? "O3'" W G 1 ? ? P W C 2 ? ? 133.07 119.70 13.37 1.20 Y 262 1 C4 W U 16 ? ? C5 W U 16 ? ? C6 W U 16 ? ? 113.73 119.70 -5.97 0.60 N 263 1 C5 W U 16 ? ? C6 W U 16 ? ? N1 W U 16 ? ? 112.24 122.70 -10.46 0.50 N 264 1 C4 W U 17 ? ? C5 W U 17 ? ? C6 W U 17 ? ? 112.51 119.70 -7.19 0.60 N 265 1 C5 W U 17 ? ? C6 W U 17 ? ? N1 W U 17 ? ? 111.11 122.70 -11.59 0.50 N 266 1 "C5'" W G 18 ? ? "C4'" W G 18 ? ? "O4'" W G 18 ? ? 98.99 109.10 -10.11 1.20 N 267 1 "C3'" W A 21 ? ? "O3'" W A 21 ? ? P W G 22 ? ? 141.85 119.70 22.15 1.20 Y 268 1 "O3'" W A 21 ? ? P W G 22 ? ? "O5'" W G 22 ? ? 92.39 104.00 -11.61 1.90 Y 269 1 "O3'" W A 21 ? ? P W G 22 ? ? OP1 W G 22 ? ? 130.69 110.50 20.19 1.10 Y 270 1 "C3'" W U 33 ? ? "O3'" W U 33 ? ? P W G 34 ? ? 152.45 119.70 32.75 1.20 Y 271 1 "O3'" W U 33 ? ? P W G 34 ? ? "O5'" W G 34 ? ? 83.90 104.00 -20.10 1.90 Y 272 1 "O3'" W U 33 ? ? P W G 34 ? ? OP1 W G 34 ? ? 133.17 110.50 22.67 1.10 Y 273 1 "O3'" W G 34 ? ? P W A 35 ? ? "O5'" W A 35 ? ? 122.27 104.00 18.27 1.90 Y 274 1 "O3'" W G 34 ? ? P W A 35 ? ? OP2 W A 35 ? ? 84.74 105.20 -20.46 2.20 Y 275 1 "C3'" W A 35 ? ? "O3'" W A 35 ? ? P W A 36 ? ? 152.29 119.70 32.59 1.20 Y 276 1 "O3'" W A 35 ? ? P W A 36 ? ? OP2 W A 36 ? ? 83.99 105.20 -21.21 2.20 Y 277 1 "O3'" W A 35 ? ? P W A 36 ? ? OP1 W A 36 ? ? 137.09 110.50 26.59 1.10 Y 278 1 "O3'" W A 36 ? ? P W YYG 37 ? ? "O5'" W YYG 37 ? ? 134.23 104.00 30.23 1.90 Y 279 1 "O3'" W A 36 ? ? P W YYG 37 ? ? 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D A 16 "O4'" 171 1 Y 1 X A 128 ? "C3'" ? D A 16 "C3'" 172 1 Y 1 X A 128 ? "O3'" ? D A 16 "O3'" 173 1 Y 1 X A 128 ? "C2'" ? D A 16 "C2'" 174 1 Y 1 X A 128 ? "O2'" ? D A 16 "O2'" 175 1 Y 1 X A 128 ? "C1'" ? D A 16 "C1'" 176 1 Y 1 X A 128 ? N9 ? D A 16 N9 177 1 Y 1 X A 128 ? C8 ? D A 16 C8 178 1 Y 1 X A 128 ? N7 ? D A 16 N7 179 1 Y 1 X A 128 ? C5 ? D A 16 C5 180 1 Y 1 X A 128 ? C6 ? D A 16 C6 181 1 Y 1 X A 128 ? N6 ? D A 16 N6 182 1 Y 1 X A 128 ? N1 ? D A 16 N1 183 1 Y 1 X A 128 ? C2 ? D A 16 C2 184 1 Y 1 X A 128 ? N3 ? D A 16 N3 185 1 Y 1 X A 128 ? C4 ? D A 16 C4 186 1 Y 1 X A 129 ? OP1 ? D A 17 OP1 187 1 Y 1 X A 129 ? OP2 ? D A 17 OP2 188 1 Y 1 X A 129 ? "O5'" ? D A 17 "O5'" 189 1 Y 1 X A 129 ? "C5'" ? D A 17 "C5'" 190 1 Y 1 X A 129 ? "C4'" ? D A 17 "C4'" 191 1 Y 1 X A 129 ? "O4'" ? D A 17 "O4'" 192 1 Y 1 X A 129 ? "C3'" ? D A 17 "C3'" 193 1 Y 1 X A 129 ? "O3'" ? D A 17 "O3'" 194 1 Y 1 X A 129 ? "C2'" ? D A 17 "C2'" 195 1 Y 1 X A 129 ? "O2'" ? D A 17 "O2'" 196 1 Y 1 X A 129 ? "C1'" ? D A 17 "C1'" 197 1 Y 1 X A 129 ? N9 ? D A 17 N9 198 1 Y 1 X A 129 ? C8 ? D A 17 C8 199 1 Y 1 X A 129 ? N7 ? D A 17 N7 200 1 Y 1 X A 129 ? C5 ? D A 17 C5 201 1 Y 1 X A 129 ? C6 ? D A 17 C6 202 1 Y 1 X A 129 ? N6 ? D A 17 N6 203 1 Y 1 X A 129 ? N1 ? D A 17 N1 204 1 Y 1 X A 129 ? C2 ? D A 17 C2 205 1 Y 1 X A 129 ? N3 ? D A 17 N3 206 1 Y 1 X A 129 ? C4 ? D A 17 C4 207 1 Y 1 X U 130 ? OP1 ? D U 18 OP1 208 1 Y 1 X U 130 ? OP2 ? D U 18 OP2 209 1 Y 1 X U 130 ? "O5'" ? D U 18 "O5'" 210 1 Y 1 X U 130 ? "C5'" ? D U 18 "C5'" 211 1 Y 1 X U 130 ? "C4'" ? D U 18 "C4'" 212 1 Y 1 X U 130 ? "O4'" ? D U 18 "O4'" 213 1 Y 1 X U 130 ? "C3'" ? D U 18 "C3'" 214 1 Y 1 X U 130 ? "O3'" ? D U 18 "O3'" 215 1 Y 1 X U 130 ? "C2'" ? D U 18 "C2'" 216 1 Y 1 X U 130 ? "O2'" ? D U 18 "O2'" 217 1 Y 1 X U 130 ? "C1'" ? D U 18 "C1'" 218 1 Y 1 X U 130 ? N1 ? D U 18 N1 219 1 Y 1 X U 130 ? C2 ? D U 18 C2 220 1 Y 1 X U 130 ? O2 ? D U 18 O2 221 1 Y 1 X U 130 ? N3 ? D U 18 N3 222 1 Y 1 X U 130 ? C4 ? D U 18 C4 223 1 Y 1 X U 130 ? O4 ? D U 18 O4 224 1 Y 1 X U 130 ? C5 ? D U 18 C5 225 1 Y 1 X U 130 ? C6 ? D U 18 C6 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A U 0 ? A U 1 2 1 Y 1 A U 1 ? A U 2 3 1 Y 1 A U 2 ? A U 3 4 1 Y 1 A G 3 ? A G 4 5 1 Y 1 A U 4 ? A U 5 6 1 Y 1 A C 1543 ? A C 1521 7 1 Y 1 A U 1544 ? A U 1522 8 1 Y 1 X A 113 ? D A 1 9 1 Y 1 B MET 1 ? E MET 1 10 1 Y 1 B PRO 2 ? E PRO 2 11 1 Y 1 B VAL 3 ? E VAL 3 12 1 Y 1 B GLU 4 ? E GLU 4 13 1 Y 1 B ILE 5 ? E ILE 5 14 1 Y 1 B THR 6 ? E THR 6 15 1 Y 1 B GLU 241 ? 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W LYS 5 149 1 Y 1 T PRO 6 ? W PRO 6 150 1 Y 1 T LYS 7 ? W LYS 7 151 1 Y 1 U MET 1 ? X MET 1 152 1 Y 1 U LYS 26 ? X LYS 26 153 1 Y 1 U LYS 27 ? X LYS 27 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 2B9M 'double helix' 2B9M 'a-form double helix' 2B9M 'parallel strands' 2B9M 'hairpin loop' 2B9M tetraloop 2B9M 'bulge loop' 2B9M 'mismatched base pair' 2B9M 'internal loop' 2B9M 'triple helix' 2B9M 'quadruple helix' 2B9M 'three-way junction' 2B9M 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 22 1_555 A U 14 1_555 0.474 -0.628 1.013 9.301 32.134 5.845 1 A_G21:U13_A A 21 ? 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