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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 2C2B _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 5.3 _exptl_crystal.density_percent_sol 76.4 _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.50 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details '10 MM CACL2, 15% (W/V) PEG 2000 MONOMETHYL ETHER, 1 MM PLP, 5MM SAM, 100 MM BISTRIS PH 6.5 BUFFER' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100.0 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2004-11-30 _diffrn_detector.details MIRRORS # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.934 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ESRF BEAMLINE ID14-1' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ESRF _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline ID14-1 _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.934 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 2C2B _reflns.observed_criterion_sigma_I ? _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 30.000 _reflns.d_resolution_high 2.600 _reflns.number_obs 93317 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 99.8 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.08000 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 11.7000 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 3.700 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 2.60 _reflns_shell.d_res_low 2.74 _reflns_shell.percent_possible_all 99.9 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.44000 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.800 _reflns_shell.pdbx_redundancy 3.70 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 2C2B _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag 'LIKELY RESIDUAL' _refine.ls_number_reflns_obs 93254 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 29.89 _refine.ls_d_res_high 2.60 _refine.ls_percent_reflns_obs 100.0 _refine.ls_R_factor_obs 0.208 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.206 _refine.ls_R_factor_R_free 0.248 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.000 _refine.ls_number_reflns_R_free 4904 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.945 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.922 _refine.B_iso_mean 60.90 _refine.aniso_B[1][1] 0.72000 _refine.aniso_B[2][2] -0.12000 _refine.aniso_B[3][3] -0.60000 _refine.aniso_B[1][2] 0.00000 _refine.aniso_B[1][3] -0.26000 _refine.aniso_B[2][3] 0.00000 _refine.solvent_model_details MASK _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.20 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.80 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.80 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. RESIDUES 1-35 AND 480-486 ARE DISORDERED IN MONOMERS A, C AND F RESIDUS 1-34, 344-362 AND 482-486 ARE DISORDERED IN MONOMERS B, D AND E. ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRY 1E5X' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.812 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.311 _refine.overall_SU_ML 0.272 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B 25.549 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 20207 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 438 _refine_hist.number_atoms_solvent 313 _refine_hist.number_atoms_total 20958 _refine_hist.d_res_high 2.60 _refine_hist.d_res_low 29.89 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function r_bond_refined_d 0.006 0.022 ? 21143 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_bond_other_d ? ? ? ? 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? ? ? ? ? 2 C 8 .44 .50 'medium positional' 3 8 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 F 8 .56 .50 'medium positional' 3 9 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 1612 .31 5.00 'loose positional' 1 10 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 C 1612 .30 5.00 'loose positional' 1 11 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 F 1612 .35 5.00 'loose positional' 1 12 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 B 1550 .26 5.00 'loose positional' 2 13 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 D 1550 .24 5.00 'loose positional' 2 14 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 E 1550 .24 5.00 'loose positional' 2 15 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 1724 .14 2.00 'medium thermal' 1 16 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 C 1724 .15 2.00 'medium thermal' 1 17 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 F 1724 .15 2.00 'medium thermal' 1 18 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 B 1648 .14 2.00 'medium thermal' 2 19 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 D 1648 .14 2.00 'medium thermal' 2 20 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 E 1648 .14 2.00 'medium thermal' 2 21 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 8 .06 2.00 'medium thermal' 3 22 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 C 8 .09 2.00 'medium thermal' 3 23 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 F 8 .13 2.00 'medium thermal' 3 24 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 A 1612 .81 10.00 'loose thermal' 1 25 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 C 1612 .90 10.00 'loose thermal' 1 26 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 F 1612 .85 10.00 'loose thermal' 1 27 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 1 B 1550 .86 10.00 'loose thermal' 2 28 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 2 D 1550 .85 10.00 'loose thermal' 2 29 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? 3 E 1550 .85 10.00 'loose thermal' 2 30 'X-RAY DIFFRACTION' ? ? ? ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 2.60 _refine_ls_shell.d_res_low 2.67 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 6882 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.3000 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.3470 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 356 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? -0.499380 0.866390 0.000170 -0.866390 -0.499380 -0.000630 -0.000470 -0.000460 1.000000 32.06766 55.19161 -50.87350 2 given ? 0.500750 0.865590 0.000230 0.865590 -0.500750 0.000350 0.000420 0.000020 -1.000000 32.08090 -55.66830 101.83951 3 given ? -0.499800 0.866140 0.000060 -0.866140 -0.499800 0.000680 0.000620 0.000290 1.000000 32.11317 55.10795 -50.94014 4 given ? 0.500500 0.865740 -0.000430 0.865740 -0.500500 -0.000370 -0.000540 -0.000190 -1.000000 32.15505 -55.63955 101.86627 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 C 1 3 F 1 1 B 2 2 D 2 3 E 2 1 A 3 2 C 3 3 F 3 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 1 A SER 40 . A ALA 470 . A SER 40 A ALA 470 5 ? 1 2 1 C SER 40 . C ALA 470 . C SER 40 C ALA 470 5 ? 1 3 1 F SER 40 . F ALA 470 . F SER 40 F ALA 470 5 ? 2 1 1 B SER 40 . B ALA 470 . B SER 40 B ALA 470 5 ? 2 2 1 D SER 40 . D ALA 470 . D SER 40 D ALA 470 5 ? 2 3 1 E SER 40 . E ALA 470 . E SER 40 E ALA 470 5 ? 3 1 1 I TRS . . I TRS . . A TRS 800 A TRS 800 4 ? 3 2 1 P TRS . . P TRS . . C TRS 800 C TRS 800 4 ? 3 3 1 Z TRS . . Z TRS . . F TRS 800 F TRS 800 4 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? # _struct.entry_id 2C2B _struct.title 'Crystallographic structure of Arabidopsis thaliana Threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and S-adenosylmethionine' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2C2B _struct_keywords.pdbx_keywords LYASE _struct_keywords.text 'THREONINE SYNTHESIS, ALLOSTERY, SYNTHASE, LYASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 4 ? K N N 2 ? L N N 2 ? M N N 4 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 3 ? Q N N 4 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 4 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 4 ? X N N 2 ? Y N N 2 ? Z N N 3 ? AA N N 4 ? BA N N 5 ? CA N N 5 ? DA N N 5 ? EA N N 5 ? FA N N 5 ? GA N N 5 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;THE BIOLOGICAL UNIT OF ARABIDOPSIS THALIANA THREONINESYNTHASE (HOMODIMER) IN COMPLEX WITH SAM IS FORMED BY TWOASYMETRIC MONOMERS. IN ONE MONOMER THE ACTIVE SITECORRESPONDS TO AN INACTIVE FORM WHEREAS IN THE OTHERMONOMER, THE ACTIVE SITE CORRESPONDS TO AN ACTIVE FORM WITHA STANDARD PLP ORIENTATION FOR A TYPE II FAMILY PLPENZYMES. ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP A 76 ? LYS A 81 ? ASP A 76 LYS A 81 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 2 ASP A 84 ? SER A 94 ? ASP A 84 SER A 94 1 ? 11 HELX_P HELX_P3 3 VAL A 107 ? VAL A 114 ? VAL A 107 VAL A 114 5 ? 8 HELX_P HELX_P4 4 ALA A 136 ? LEU A 144 ? ALA A 136 LEU A 144 1 ? 9 HELX_P HELX_P5 5 PHE A 162 ? MET A 180 ? PHE A 162 MET A 180 1 ? 19 HELX_P HELX_P6 6 GLY A 193 ? ALA A 206 ? GLY A 193 ALA A 206 1 ? 14 HELX_P HELX_P7 7 LEU A 224 ? ASN A 230 ? LEU A 224 ASN A 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P8 8 ASP A 240 ? LEU A 255 ? ASP A 240 LEU A 255 1 ? 16 HELX_P HELX_P9 9 ASN A 264 ? LYS A 272 ? ASN A 264 LYS A 272 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 10 LYS A 272 ? PHE A 282 ? LYS A 272 PHE A 282 1 ? 11 HELX_P HELX_P11 11 LEU A 297 ? LEU A 313 ? LEU A 297 LEU A 313 1 ? 17 HELX_P HELX_P12 12 ASN A 331 ? LYS A 338 ? ASN A 331 LYS A 338 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 13 ALA A 354 ? GLN A 358 ? ALA A 354 GLN A 358 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 SER A 364 ? CYS A 375 ? SER A 364 CYS A 375 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 15 THR A 383 ? SER A 396 ? THR A 383 SER A 396 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 16 CYS A 402 ? GLN A 418 ? CYS A 402 GLN A 418 1 ? 17 HELX_P HELX_P17 17 GLY A 435 ? PHE A 438 ? GLY A 435 PHE A 438 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 18 THR A 439 ? SER A 447 ? THR A 439 SER A 447 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 19 ASP A 467 ? LEU A 479 ? ASP A 467 LEU A 479 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 20 ASP B 76 ? LYS B 81 ? ASP B 76 LYS B 81 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 21 ASP B 84 ? VAL B 96 ? ASP B 84 VAL B 96 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 22 VAL B 107 ? VAL B 114 ? VAL B 107 VAL B 114 5 ? 8 HELX_P HELX_P23 23 ASP B 119 ? ILE B 123 ? ASP B 119 ILE B 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 ALA B 136 ? LEU B 144 ? ALA B 136 LEU B 144 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 25 PHE B 162 ? MET B 180 ? PHE B 162 MET B 180 1 ? 19 HELX_P HELX_P26 26 GLY B 193 ? GLY B 207 ? GLY B 193 GLY B 207 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 27 ASN B 217 ? ILE B 219 ? ASN B 217 ILE B 219 5 ? 3 HELX_P HELX_P28 28 LEU B 224 ? ASN B 230 ? LEU B 224 ASN B 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P29 29 ASP B 240 ? ALA B 253 ? ASP B 240 ALA B 253 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 30 SER B 265 ? LYS B 272 ? SER B 265 LYS B 272 1 ? 8 HELX_P HELX_P31 31 LYS B 272 ? PHE B 282 ? LYS B 272 PHE B 282 1 ? 11 HELX_P HELX_P32 32 LEU B 297 ? LEU B 313 ? LEU B 297 LEU B 313 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 33 PRO B 332 ? SER B 339 ? PRO B 332 SER B 339 1 ? 8 HELX_P HELX_P34 34 SER B 364 ? CYS B 375 ? SER B 364 CYS B 375 1 ? 12 HELX_P HELX_P35 35 THR B 383 ? SER B 396 ? THR B 383 SER B 396 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 36 CYS B 402 ? GLN B 418 ? CYS B 402 GLN B 418 1 ? 17 HELX_P HELX_P37 37 GLY B 435 ? LYS B 437 ? GLY B 435 LYS B 437 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 38 PHE B 438 ? SER B 447 ? PHE B 438 SER B 447 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 39 ASP B 467 ? GLY B 480 ? ASP B 467 GLY B 480 1 ? 14 HELX_P HELX_P40 40 ASP C 76 ? LYS C 81 ? ASP C 76 LYS C 81 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 41 ASP C 84 ? SER C 94 ? ASP C 84 SER C 94 1 ? 11 HELX_P HELX_P42 42 VAL C 107 ? VAL C 114 ? VAL C 107 VAL C 114 5 ? 8 HELX_P HELX_P43 43 ASP C 119 ? ILE C 123 ? ASP C 119 ILE C 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 ALA C 136 ? LEU C 144 ? ALA C 136 LEU C 144 1 ? 9 HELX_P HELX_P45 45 LYS C 163 ? MET C 180 ? LYS C 163 MET C 180 1 ? 18 HELX_P HELX_P46 46 GLY C 193 ? ALA C 206 ? GLY C 193 ALA C 206 1 ? 14 HELX_P HELX_P47 47 LEU C 224 ? ASN C 230 ? LEU C 224 ASN C 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P48 48 ASP C 240 ? LEU C 255 ? ASP C 240 LEU C 255 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 49 ASN C 264 ? LYS C 272 ? ASN C 264 LYS C 272 1 ? 9 HELX_P HELX_P50 50 LYS C 272 ? PHE C 282 ? LYS C 272 PHE C 282 1 ? 11 HELX_P HELX_P51 51 LEU C 297 ? LEU C 313 ? LEU C 297 LEU C 313 1 ? 17 HELX_P HELX_P52 52 ASN C 331 ? SER C 339 ? ASN C 331 SER C 339 1 ? 9 HELX_P HELX_P53 53 SER C 364 ? CYS C 375 ? SER C 364 CYS C 375 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 54 THR C 383 ? SER C 396 ? THR C 383 SER C 396 1 ? 14 HELX_P HELX_P55 55 CYS C 402 ? GLN C 418 ? CYS C 402 GLN C 418 1 ? 17 HELX_P HELX_P56 56 GLY C 435 ? LYS C 437 ? GLY C 435 LYS C 437 5 ? 3 HELX_P HELX_P57 57 PHE C 438 ? SER C 447 ? PHE C 438 SER C 447 1 ? 10 HELX_P HELX_P58 58 ASP C 467 ? LEU C 479 ? ASP C 467 LEU C 479 1 ? 13 HELX_P HELX_P59 59 ASP D 76 ? LYS D 81 ? ASP D 76 LYS D 81 1 ? 6 HELX_P HELX_P60 60 ASP D 84 ? VAL D 96 ? ASP D 84 VAL D 96 1 ? 13 HELX_P HELX_P61 61 VAL D 107 ? VAL D 114 ? VAL D 107 VAL D 114 5 ? 8 HELX_P HELX_P62 62 ASP D 119 ? ILE D 123 ? ASP D 119 ILE D 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 63 ALA D 136 ? LEU D 144 ? ALA D 136 LEU D 144 1 ? 9 HELX_P HELX_P64 64 PHE D 162 ? MET D 180 ? PHE D 162 MET D 180 1 ? 19 HELX_P HELX_P65 65 GLY D 193 ? ALA D 206 ? GLY D 193 ALA D 206 1 ? 14 HELX_P HELX_P66 66 LEU D 224 ? ASN D 230 ? LEU D 224 ASN D 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P67 67 ASP D 240 ? ALA D 253 ? ASP D 240 ALA D 253 1 ? 14 HELX_P HELX_P68 68 ARG D 267 ? LYS D 272 ? ARG D 267 LYS D 272 1 ? 6 HELX_P HELX_P69 69 LYS D 272 ? PHE D 282 ? LYS D 272 PHE D 282 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 70 LEU D 297 ? LEU D 313 ? LEU D 297 LEU D 313 1 ? 17 HELX_P HELX_P71 71 PRO D 332 ? SER D 339 ? PRO D 332 SER D 339 1 ? 8 HELX_P HELX_P72 72 SER D 364 ? CYS D 375 ? SER D 364 CYS D 375 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 73 THR D 383 ? SER D 396 ? THR D 383 SER D 396 1 ? 14 HELX_P HELX_P74 74 CYS D 402 ? GLN D 418 ? CYS D 402 GLN D 418 1 ? 17 HELX_P HELX_P75 75 GLY D 435 ? LYS D 437 ? GLY D 435 LYS D 437 5 ? 3 HELX_P HELX_P76 76 PHE D 438 ? SER D 447 ? PHE D 438 SER D 447 1 ? 10 HELX_P HELX_P77 77 ASP D 467 ? GLY D 480 ? ASP D 467 GLY D 480 1 ? 14 HELX_P HELX_P78 78 ASP E 76 ? LYS E 81 ? ASP E 76 LYS E 81 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 79 ASP E 84 ? VAL E 96 ? ASP E 84 VAL E 96 1 ? 13 HELX_P HELX_P80 80 VAL E 107 ? VAL E 114 ? VAL E 107 VAL E 114 5 ? 8 HELX_P HELX_P81 81 ASP E 119 ? ILE E 123 ? ASP E 119 ILE E 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P82 82 ALA E 136 ? LEU E 144 ? ALA E 136 LEU E 144 1 ? 9 HELX_P HELX_P83 83 PHE E 162 ? MET E 180 ? PHE E 162 MET E 180 1 ? 19 HELX_P HELX_P84 84 GLY E 193 ? ALA E 206 ? GLY E 193 ALA E 206 1 ? 14 HELX_P HELX_P85 85 ASN E 217 ? ILE E 219 ? ASN E 217 ILE E 219 5 ? 3 HELX_P HELX_P86 86 LEU E 224 ? ASN E 230 ? LEU E 224 ASN E 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P87 87 ASP E 240 ? ALA E 253 ? ASP E 240 ALA E 253 1 ? 14 HELX_P HELX_P88 88 SER E 265 ? LYS E 272 ? SER E 265 LYS E 272 1 ? 8 HELX_P HELX_P89 89 LYS E 272 ? PHE E 282 ? LYS E 272 PHE E 282 1 ? 11 HELX_P HELX_P90 90 LEU E 297 ? LEU E 313 ? LEU E 297 LEU E 313 1 ? 17 HELX_P HELX_P91 91 PRO E 332 ? SER E 339 ? PRO E 332 SER E 339 1 ? 8 HELX_P HELX_P92 92 SER E 364 ? CYS E 375 ? SER E 364 CYS E 375 1 ? 12 HELX_P HELX_P93 93 THR E 383 ? SER E 396 ? THR E 383 SER E 396 1 ? 14 HELX_P HELX_P94 94 CYS E 402 ? GLN E 418 ? CYS E 402 GLN E 418 1 ? 17 HELX_P HELX_P95 95 GLY E 435 ? LYS E 437 ? GLY E 435 LYS E 437 5 ? 3 HELX_P HELX_P96 96 PHE E 438 ? SER E 447 ? PHE E 438 SER E 447 1 ? 10 HELX_P HELX_P97 97 ASP E 467 ? THR E 483 ? ASP E 467 THR E 483 1 ? 17 HELX_P HELX_P98 98 ASP F 76 ? LYS F 81 ? ASP F 76 LYS F 81 1 ? 6 HELX_P HELX_P99 99 ASP F 84 ? SER F 94 ? ASP F 84 SER F 94 1 ? 11 HELX_P HELX_P100 100 VAL F 107 ? VAL F 114 ? VAL F 107 VAL F 114 5 ? 8 HELX_P HELX_P101 101 ASP F 119 ? ILE F 123 ? ASP F 119 ILE F 123 5 ? 5 HELX_P HELX_P102 102 ALA F 136 ? LEU F 144 ? ALA F 136 LEU F 144 1 ? 9 HELX_P HELX_P103 103 PHE F 162 ? MET F 180 ? PHE F 162 MET F 180 1 ? 19 HELX_P HELX_P104 104 GLY F 193 ? ALA F 206 ? GLY F 193 ALA F 206 1 ? 14 HELX_P HELX_P105 105 LEU F 224 ? ASN F 230 ? LEU F 224 ASN F 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P106 106 ASP F 240 ? LEU F 255 ? ASP F 240 LEU F 255 1 ? 16 HELX_P HELX_P107 107 ASN F 264 ? LYS F 272 ? ASN F 264 LYS F 272 1 ? 9 HELX_P HELX_P108 108 LYS F 272 ? PHE F 282 ? LYS F 272 PHE F 282 1 ? 11 HELX_P HELX_P109 109 LEU F 297 ? LEU F 313 ? LEU F 297 LEU F 313 1 ? 17 HELX_P HELX_P110 110 ASN F 331 ? SER F 339 ? ASN F 331 SER F 339 1 ? 9 HELX_P HELX_P111 111 ALA F 354 ? GLN F 358 ? ALA F 354 GLN F 358 5 ? 5 HELX_P HELX_P112 112 SER F 364 ? CYS F 375 ? SER F 364 CYS F 375 1 ? 12 HELX_P HELX_P113 113 THR F 383 ? SER F 396 ? THR F 383 SER F 396 1 ? 14 HELX_P HELX_P114 114 CYS F 402 ? GLN F 418 ? CYS F 402 GLN F 418 1 ? 17 HELX_P HELX_P115 115 GLY F 435 ? PHE F 438 ? GLY F 435 PHE F 438 5 ? 4 HELX_P HELX_P116 116 THR F 439 ? SER F 447 ? THR F 439 SER F 447 1 ? 9 HELX_P HELX_P117 117 ASP F 467 ? LEU F 479 ? ASP F 467 LEU F 479 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale one ? A LYS 163 NZ ? ? ? 1_555 J PLP . C4A ? ? A LYS 163 A PLP 1163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale2 covale one ? B LYS 163 NZ ? ? ? 1_555 M PLP . C4A ? ? B LYS 163 B PLP 1163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale3 covale one ? C LYS 163 NZ ? ? ? 1_555 Q PLP . C4A ? ? C LYS 163 C PLP 1163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale4 covale one ? D LYS 163 NZ ? ? ? 1_555 T PLP . C4A ? ? D LYS 163 D PLP 1163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale5 covale one ? E LYS 163 NZ ? ? ? 1_555 W PLP . C4A ? ? E LYS 163 E PLP 1163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale6 covale one ? F LYS 163 NZ ? ? ? 1_555 AA PLP . C4A ? ? F LYS 163 F PLP 1163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? # _struct_conn_type.id covale _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TRP 101 A . ? TRP 101 A PRO 102 A ? PRO 102 A 1 -3.19 2 TRP 101 B . ? TRP 101 B PRO 102 B ? PRO 102 B 1 -0.67 3 TRP 101 C . ? TRP 101 C PRO 102 C ? PRO 102 C 1 -1.46 4 TRP 101 D . ? TRP 101 D PRO 102 D ? PRO 102 D 1 -4.12 5 TRP 101 E . ? TRP 101 E PRO 102 E ? PRO 102 E 1 -1.73 6 TRP 101 F . ? TRP 101 F PRO 102 F ? PRO 102 F 1 -1.51 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 2 ? AB ? 6 ? AC ? 5 ? AD ? 5 ? BA ? 2 ? BB ? 6 ? CA ? 2 ? CB ? 6 ? CC ? 5 ? CD ? 5 ? DA ? 2 ? DB ? 6 ? EA ? 2 ? EB ? 6 ? EC ? 5 ? ED ? 5 ? FA ? 2 ? FB ? 6 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? parallel AB 3 4 ? parallel AB 4 5 ? parallel AB 5 6 ? parallel AC 1 2 ? parallel AC 2 3 ? parallel AC 3 4 ? parallel AC 4 5 ? parallel AD 1 2 ? parallel AD 2 3 ? parallel AD 3 4 ? parallel AD 4 5 ? parallel BA 1 2 ? anti-parallel BB 1 2 ? anti-parallel BB 2 3 ? parallel BB 3 4 ? parallel BB 4 5 ? parallel BB 5 6 ? parallel CA 1 2 ? anti-parallel CB 1 2 ? anti-parallel CB 2 3 ? parallel CB 3 4 ? parallel CB 4 5 ? parallel CB 5 6 ? parallel CC 1 2 ? parallel CC 2 3 ? parallel CC 3 4 ? parallel CC 4 5 ? parallel CD 1 2 ? parallel CD 2 3 ? parallel CD 3 4 ? parallel CD 4 5 ? parallel DA 1 2 ? anti-parallel DB 1 2 ? anti-parallel DB 2 3 ? parallel DB 3 4 ? parallel DB 4 5 ? parallel DB 5 6 ? parallel EA 1 2 ? anti-parallel EB 1 2 ? anti-parallel EB 2 3 ? parallel EB 3 4 ? parallel EB 4 5 ? parallel EB 5 6 ? parallel EC 1 2 ? parallel EC 2 3 ? parallel EC 3 4 ? parallel EC 4 5 ? parallel ED 1 2 ? parallel ED 2 3 ? parallel ED 3 4 ? parallel ED 4 5 ? parallel FA 1 2 ? anti-parallel FB 1 2 ? anti-parallel FB 2 3 ? parallel FB 3 4 ? parallel FB 4 5 ? parallel FB 5 6 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA 1 ALA A 41 ? 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O ILE F 378 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A PLP 1163 ? 14 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP A 1163' AC2 Software B PLP 1163 ? 8 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP B 1163' AC3 Software C PLP 1163 ? 14 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP C 1163' AC4 Software D PLP 1163 ? 10 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP D 1163' AC5 Software E PLP 1163 ? 10 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP E 1163' AC6 Software F PLP 1163 ? 14 'BINDING SITE FOR RESIDUE PLP F 1163' AC7 Software A SAM 500 ? 14 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM A 500' AC8 Software A SAM 501 ? 7 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM A 501' AC9 Software B SAM 500 ? 13 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM B 500' BC1 Software B SAM 501 ? 8 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM B 501' BC2 Software C SAM 500 ? 14 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM C 500' BC3 Software C SAM 501 ? 8 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM C 501' BC4 Software D SAM 500 ? 14 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM D 500' BC5 Software D SAM 501 ? 7 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM D 501' BC6 Software E SAM 500 ? 13 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM E 500' BC7 Software E SAM 501 ? 7 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM E 501' BC8 Software F SAM 500 ? 15 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM F 500' BC9 Software F SAM 501 ? 7 'BINDING SITE FOR RESIDUE SAM F 501' CC1 Software A TRS 800 ? 1 'BINDING SITE FOR RESIDUE TRS A 800' CC2 Software C TRS 800 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE TRS C 800' CC3 Software F TRS 800 ? 2 'BINDING SITE FOR RESIDUE TRS F 800' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 14 PHE A 162 ? 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