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'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 2.05 _refine_ls_shell.d_res_low 2.10 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 1850 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.285 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.312 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 98 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _database_PDB_matrix.entry_id 2GDI _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 2GDI _struct.title 'Crystal structure of thiamine pyrophosphate-specific riboswitch in complex with thiamine pyrophosphate' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2GDI _struct_keywords.pdbx_keywords RNA _struct_keywords.text 'riboswitch, thiamine pyrophosphate, RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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A GTP 1 "O3'" ? ? ? 1_555 A G 2 P ? ? X GTP 10 X G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.605 ? ? covale2 covale both ? A U 79 "O3'" ? ? ? 1_555 A CCC 80 P ? ? X U 88 X CCC 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.598 ? ? covale3 covale both ? B GTP 1 "O3'" ? ? ? 1_555 B G 2 P ? ? Y GTP 10 Y G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.596 ? ? covale4 covale both ? B U 79 "O3'" ? ? ? 1_555 B CCC 80 P ? ? Y U 88 Y CCC 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.600 ? ? metalc1 metalc ? ? A G 12 "O3'" ? ? ? 1_555 E K . K ? ? X G 21 X K 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? ? metalc2 metalc ? ? A G 12 "O2'" ? ? ? 1_555 E K . K ? ? X G 21 X K 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? ? metalc3 metalc ? ? A G 12 N3 ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X G 21 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.902 ? ? metalc4 metalc ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X G 21 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.634 ? ? metalc5 metalc ? ? A G 12 "O2'" ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X G 21 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.110 ? ? metalc6 metalc ? ? A C 13 "O4'" ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X C 22 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.591 ? ? metalc7 metalc ? ? A C 29 "O2'" ? ? ? 1_555 G K . K ? ? X C 38 X K 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? ? metalc8 metalc ? ? A U 30 "O4'" ? ? ? 1_555 G K . K ? ? X U 39 X K 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.021 ? ? metalc9 metalc ? ? A A 32 N7 ? ? ? 1_555 J MG . MG ? ? X A 41 X MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? ? metalc10 metalc ? ? A G 51 O6 ? ? ? 1_555 H MG . MG ? ? X G 60 X MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? ? metalc11 metalc ? ? A A 52 "O2'" ? ? ? 1_555 C NA . NA ? ? X A 61 X NA 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.952 ? ? metalc12 metalc ? ? A A 52 N3 ? ? ? 1_555 C NA . NA ? ? X A 61 X NA 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? ? metalc13 metalc ? ? A U 55 O4 ? ? ? 1_555 D NA . NA ? ? X U 64 X NA 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? ? metalc14 metalc ? ? A G 56 O6 ? ? ? 1_555 D NA . NA ? ? X G 65 X NA 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? ? metalc15 metalc ? ? A A 61 N6 ? ? ? 1_555 G K . K ? ? X A 70 X K 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.647 ? ? metalc16 metalc ? ? A U 62 "O2'" ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X U 71 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? ? metalc17 metalc ? ? A U 62 O2 ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X U 71 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.160 ? ? metalc18 metalc ? ? A U 62 O4 ? ? ? 1_555 G K . K ? ? X U 71 X K 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.901 ? ? metalc19 metalc ? ? A G 63 N7 ? ? ? 1_555 E K . K ? ? X G 72 X K 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? ? metalc20 metalc ? ? A G 63 O6 ? ? ? 1_555 E K . K ? ? X G 72 X K 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? ? metalc21 metalc ? ? A C 64 OP1 ? ? ? 1_555 F K . K ? ? X C 73 X K 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? ? metalc22 metalc ? ? A C 64 "O4'" ? ? ? 1_555 G K . K ? ? X C 73 X K 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.191 ? ? metalc23 metalc ? ? A G 69 O6 ? ? ? 1_555 H MG . MG ? ? X G 78 X MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? ? metalc24 metalc ? ? K TPP . O2B ? ? ? 1_555 H MG . MG ? ? X TPP 100 X MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? ? metalc25 metalc ? ? K TPP . O1B ? ? ? 1_555 I MG . MG ? ? X TPP 100 X MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? ? metalc26 metalc ? ? K TPP . O2A ? ? ? 1_555 I MG . MG ? ? X TPP 100 X MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? ? metalc27 metalc ? ? H MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 101 X HOH 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc28 metalc ? ? H MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 101 X HOH 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc29 metalc ? ? H MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 101 X HOH 490 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc30 metalc ? ? I MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 102 X HOH 491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.175 ? ? metalc31 metalc ? ? I MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 102 X HOH 492 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc32 metalc ? ? I MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 102 X HOH 493 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc33 metalc ? ? I MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 102 X HOH 494 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc34 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 103 X HOH 495 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc35 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 103 X HOH 496 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? ? metalc36 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 103 X HOH 497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc37 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 103 X HOH 498 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? ? metalc38 metalc ? ? J MG . MG ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X MG 103 X HOH 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc39 metalc ? ? C NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 121 X HOH 356 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.963 ? ? metalc40 metalc ? ? C NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 121 X HOH 357 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc41 metalc ? ? C NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 121 X HOH 358 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? ? metalc42 metalc ? ? C NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 121 X HOH 359 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? ? metalc43 metalc ? ? D NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 122 X HOH 380 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.515 ? ? metalc44 metalc ? ? D NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 122 X HOH 396 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? ? metalc45 metalc ? ? D NA . NA ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X NA 122 X HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? ? metalc46 metalc ? ? E K . K ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X K 123 X HOH 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? ? metalc47 metalc ? ? E K . K ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X K 123 X HOH 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.630 ? ? metalc48 metalc ? ? F K . K ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X K 124 X HOH 365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.093 ? ? metalc49 metalc ? ? G K . K ? ? ? 1_555 P HOH . O ? ? X K 125 X HOH 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? ? metalc50 metalc ? ? B A 32 N7 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? Y A 41 Y MG 113 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? ? metalc51 metalc ? ? B G 51 O6 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? Y G 60 Y MG 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc52 metalc ? ? B G 69 O6 ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? Y G 78 Y MG 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc53 metalc ? ? O TPP . O2B ? ? ? 1_555 L MG . MG ? ? Y TPP 100 Y MG 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? ? metalc54 metalc ? ? O TPP . O1A ? ? ? 1_555 M MG . MG ? ? Y TPP 100 Y MG 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? ? metalc55 metalc ? ? O TPP . O1B ? ? ? 1_555 M MG . MG ? ? Y TPP 100 Y MG 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc56 metalc ? ? L MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 111 Y HOH 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc57 metalc ? ? L MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 111 Y HOH 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc58 metalc ? ? L MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 111 Y HOH 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc59 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 112 Y HOH 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc60 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 112 Y HOH 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? ? metalc61 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 112 Y HOH 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc62 metalc ? ? M MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 112 Y HOH 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? ? metalc63 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 113 Y HOH 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? ? metalc64 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 113 Y HOH 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? ? metalc65 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 113 Y HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc66 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 113 Y HOH 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? ? metalc67 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 Q HOH . O ? ? Y MG 113 Y HOH 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A GTP 1 N1 ? ? ? 1_555 A CCC 80 N3 ? ? X GTP 10 X CCC 89 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A GTP 1 N2 ? ? ? 1_555 A CCC 80 O2 ? ? X GTP 10 X CCC 89 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A GTP 1 O6 ? ? ? 1_555 A CCC 80 N4 ? ? X GTP 10 X CCC 89 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A U 79 O2 ? ? X G 11 X U 88 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A U 79 N3 ? ? X G 11 X U 88 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A A 3 N1 ? ? ? 1_555 A U 78 N3 ? ? X A 12 X U 87 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A A 3 N6 ? ? ? 1_555 A U 78 O4 ? ? X A 12 X U 87 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A C 4 N3 ? ? ? 1_555 A G 77 N1 ? ? X C 13 X G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A C 4 N4 ? ? ? 1_555 A G 77 O6 ? ? X C 13 X G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A C 4 O2 ? ? ? 1_555 A G 77 N2 ? ? X C 13 X G 86 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 5 N3 ? ? ? 1_555 A A 76 N1 ? ? X U 14 X A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A U 5 O4 ? ? ? 1_555 A A 76 N6 ? ? X U 14 X A 85 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A C 6 N3 ? ? ? 1_555 A G 42 N1 ? ? X C 15 X G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A C 6 N4 ? ? ? 1_555 A G 42 O6 ? ? X C 15 X G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A C 6 O2 ? ? ? 1_555 A G 42 N2 ? ? X C 15 X G 51 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 7 N1 ? ? ? 1_555 A C 41 N3 ? ? X G 16 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A G 7 N2 ? ? ? 1_555 A C 41 O2 ? ? X G 16 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A G 7 O6 ? ? ? 1_555 A C 41 N4 ? ? X G 16 X C 50 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A G 7 N2 ? ? ? 1_555 A A 75 N3 ? ? X G 16 X A 84 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A G 8 N1 ? ? ? 1_555 A C 40 N3 ? ? X G 17 X C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A G 8 N2 ? ? ? 1_555 A C 40 O2 ? ? X G 17 X C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A G 8 O6 ? ? ? 1_555 A C 40 N4 ? ? X G 17 X C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A G 8 N2 ? ? ? 1_555 A A 47 N3 ? ? X G 17 X A 56 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A G 9 N1 ? ? ? 1_555 A C 39 N3 ? ? X G 18 X C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A G 9 N2 ? ? ? 1_555 A C 39 O2 ? ? X G 18 X C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A G 9 O6 ? ? ? 1_555 A C 39 N4 ? ? X G 18 X C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 10 N2 ? ? ? 1_555 A G 33 N3 ? ? X G 19 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_4_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 10 N3 ? ? ? 1_555 A G 33 N2 ? ? X G 19 X G 42 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_4_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 10 N1 ? ? ? 1_555 A A 38 N1 ? ? X G 19 X A 47 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A A 38 N6 ? ? X G 19 X A 47 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A U 11 N3 ? ? ? 1_555 A A 36 N1 ? ? X U 20 X A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A U 11 O4 ? ? ? 1_555 A A 36 N6 ? ? X U 20 X A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A G 12 N1 ? ? ? 1_555 A C 29 N3 ? ? X G 21 X C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 A C 29 O2 ? ? X G 21 X C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A G 12 O6 ? ? ? 1_555 A C 29 N4 ? ? X G 21 X C 38 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 A U 62 O2 ? ? X G 21 X U 71 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A C 13 N3 ? ? ? 1_555 A G 28 N1 ? ? X C 22 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A C 13 N4 ? ? ? 1_555 A G 28 O6 ? ? X C 22 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A C 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 28 N2 ? ? X C 22 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A C 14 N3 ? ? ? 1_555 A G 27 N1 ? ? X C 23 X G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A C 14 N4 ? ? ? 1_555 A G 27 O6 ? ? X C 23 X G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A C 14 O2 ? ? ? 1_555 A G 27 N2 ? ? X C 23 X G 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A C 15 N4 ? ? ? 1_555 A G 28 N3 ? ? X C 24 X G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A U 16 N3 ? ? ? 1_555 A A 26 N1 ? ? X U 25 X A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A U 16 O4 ? ? ? 1_555 A A 26 N6 ? ? X U 25 X A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A U 17 N3 ? ? ? 1_555 A A 25 N1 ? ? X U 26 X A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A U 17 O4 ? ? ? 1_555 A A 25 N6 ? ? X U 26 X A 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A C 18 N3 ? ? ? 1_555 A G 24 N1 ? ? X C 27 X G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A C 18 N4 ? ? ? 1_555 A G 24 O6 ? ? X C 27 X G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A C 18 O2 ? ? ? 1_555 A G 24 N2 ? ? X C 27 X G 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A U 19 N3 ? ? ? 1_555 A U 23 O4 ? ? X U 28 X U 32 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_12_PAIR ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? A U 19 O4 ? ? ? 1_555 A U 23 N3 ? ? X U 28 X U 32 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_12_PAIR ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? A G 20 N1 ? ? ? 1_555 B C 21 N3 ? ? X G 29 Y C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? A G 20 N2 ? ? ? 1_555 B C 21 O2 ? ? X G 29 Y C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? A G 20 O6 ? ? ? 1_555 B C 21 N4 ? ? X G 29 Y C 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? A C 21 N3 ? ? ? 1_555 B G 20 N1 ? ? X C 30 Y G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? A C 21 N4 ? ? ? 1_555 B G 20 O6 ? ? X C 30 Y G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? A C 21 O2 ? ? ? 1_555 B G 20 N2 ? ? X C 30 Y G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? A G 28 N2 ? ? ? 1_555 A A 60 N1 ? ? X G 37 X A 69 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? A U 30 N3 ? ? ? 1_555 A A 34 N7 ? ? 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N N 235 TPP C6 C7 sing N N 236 TPP C6 H61 sing N N 237 TPP C6 H62 sing N N 238 TPP C7 O7 sing N N 239 TPP C7 H71 sing N N 240 TPP C7 H72 sing N N 241 TPP O7 PA sing N N 242 TPP PA O1A doub N N 243 TPP PA O2A sing N N 244 TPP PA O3A sing N N 245 TPP O2A HOA2 sing N N 246 TPP O3A PB sing N N 247 TPP PB O1B doub N N 248 TPP PB O2B sing N N 249 TPP PB O3B sing N N 250 TPP O2B HOB2 sing N N 251 TPP O3B HOB3 sing N N 252 U OP3 P sing N N 253 U OP3 HOP3 sing N N 254 U P OP1 doub N N 255 U P OP2 sing N N 256 U P "O5'" sing N N 257 U OP2 HOP2 sing N N 258 U "O5'" "C5'" sing N N 259 U "C5'" "C4'" sing N N 260 U "C5'" "H5'" sing N N 261 U "C5'" "H5''" sing N N 262 U "C4'" "O4'" sing N N 263 U "C4'" "C3'" sing N N 264 U "C4'" "H4'" sing N N 265 U "O4'" "C1'" sing N N 266 U "C3'" "O3'" sing N N 267 U "C3'" "C2'" sing N N 268 U "C3'" "H3'" sing N N 269 U "O3'" "HO3'" sing N N 270 U "C2'" "O2'" sing N N 271 U "C2'" "C1'" sing N N 272 U "C2'" "H2'" sing N N 273 U "O2'" "HO2'" sing N N 274 U "C1'" N1 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