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D . n # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal MAR345 'data collection' . ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 MOLREP phasing . ? 3 SHELXL-97 refinement . ? 4 XDS 'data scaling' . ? 5 # _cell.entry_id 2GK9 _cell.length_a 95.390 _cell.length_b 95.390 _cell.length_c 189.110 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.length_a_esd ? _cell.length_b_esd ? _cell.length_c_esd ? _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma_esd ? # _symmetry.entry_id 2GK9 _symmetry.space_group_name_H-M 'P 43' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 78 _symmetry.space_group_name_Hall ? # _exptl.entry_id 2GK9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.35 _exptl_crystal.density_percent_sol 47.74 _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 273 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;20 % Peg3350 0.3 M di-ammoniumtartrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K ; _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'MAR CCD 165 mm' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2005-10-25 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Double crystal Monochromator' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.953 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'BESSY BEAMLINE 14.1' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site BESSY _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 14.1 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 0.953 # _reflns.entry_id 2GK9 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3 _reflns.observed_criterion_sigma_F 0 _reflns.d_resolution_low 20 _reflns.d_resolution_high 2.80 _reflns.number_obs 40823 _reflns.number_all 41535 _reflns.percent_possible_obs 98.3 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.0791 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 8.23 _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 2.55 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_chi_squared ? _reflns.pdbx_scaling_rejects ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _reflns_shell.d_res_high 2.8 _reflns_shell.d_res_low 2.9 _reflns_shell.percent_possible_all 99.7 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.663 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.13 _reflns_shell.pdbx_redundancy 3.18 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.number_measured_all ? _reflns_shell.number_measured_obs ? _reflns_shell.number_unique_obs ? _reflns_shell.pdbx_chi_squared ? _reflns_shell.pdbx_diffrn_id ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 2GK9 _refine.ls_number_reflns_obs 39963 _refine.ls_number_reflns_all 39963 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 20 _refine.ls_d_res_high 2.8 _refine.ls_percent_reflns_obs 99.1 _refine.ls_R_factor_obs 0.261 _refine.ls_R_factor_all 0.261 _refine.ls_R_factor_R_work 0.254 _refine.ls_R_factor_R_free 0.297 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free 1890 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method Rfree _refine.details 'No twin reflections in same set. 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'cloning artifact' 30 7 4 2GK9 MET D 2 ? UNP Q8TBX8 ? ? 'cloning artifact' 31 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 2020 ? 1 MORE -10 ? 1 'SSA (A^2)' 27330 ? 2 'ABSA (A^2)' 2080 ? 2 MORE -9 ? 2 'SSA (A^2)' 27090 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,D 2 1 B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP A 16 ? SER A 34 ? ASP A 45 SER A 63 1 ? 19 HELX_P HELX_P2 2 LEU A 43 ? LYS A 48 ? LEU A 72 LYS A 77 5 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 CYS A 75 ? ARG A 85 ? CYS A 104 ARG A 114 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 4 ASP A 89 ? ARG A 99 ? ASP A 118 ARG A 128 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 5 SER A 126 ? CYS A 147 ? SER A 155 CYS A 176 1 ? 22 HELX_P HELX_P6 6 LYS A 230 ? VAL A 245 ? LYS A 259 VAL A 274 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 7 HIS A 375 ? PHE A 386 ? HIS A 404 PHE A 415 1 ? 12 HELX_P HELX_P8 8 ASP B 16 ? VAL B 36 ? ASP B 45 VAL B 65 1 ? 21 HELX_P HELX_P9 9 LEU B 43 ? ALA B 49 ? LEU B 72 ALA B 78 5 ? 7 HELX_P HELX_P10 10 CYS B 75 ? PHE B 86 ? CYS B 104 PHE B 115 1 ? 12 HELX_P HELX_P11 11 ASP B 89 ? ARG B 99 ? ASP B 118 ARG B 128 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 12 SER B 126 ? HIS B 148 ? SER B 155 HIS B 177 1 ? 23 HELX_P HELX_P13 13 MET B 214 ? LYS B 219 ? MET B 243 LYS B 248 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 14 LYS B 230 ? LEU B 247 ? LYS B 259 LEU B 276 1 ? 18 HELX_P HELX_P15 15 HIS B 375 ? PHE B 386 ? HIS B 404 PHE B 415 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 16 PRO C 17 ? SER C 34 ? PRO C 46 SER C 63 1 ? 18 HELX_P HELX_P17 17 LEU C 43 ? LYS C 48 ? LEU C 72 LYS C 77 5 ? 6 HELX_P HELX_P18 18 CYS C 75 ? PHE C 86 ? CYS C 104 PHE C 115 1 ? 12 HELX_P HELX_P19 19 ASP C 89 ? SER C 96 ? ASP C 118 SER C 125 1 ? 8 HELX_P HELX_P20 20 GLU C 128 ? HIS C 148 ? GLU C 157 HIS C 177 1 ? 21 HELX_P HELX_P21 21 GLU C 229 ? LEU C 247 ? GLU C 258 LEU C 276 1 ? 19 HELX_P HELX_P22 22 HIS C 375 ? PHE C 386 ? HIS C 404 PHE C 415 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 23 ASP D 16 ? GLN D 35 ? ASP D 45 GLN D 64 1 ? 20 HELX_P HELX_P24 24 LEU D 43 ? ALA D 49 ? LEU D 72 ALA D 78 1 ? 7 HELX_P HELX_P25 25 CYS D 75 ? PHE D 86 ? CYS D 104 PHE D 115 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 26 ASP D 89 ? ARG D 99 ? ASP D 118 ARG D 128 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 27 SER D 126 ? HIS D 148 ? SER D 155 HIS D 177 1 ? 23 HELX_P HELX_P28 28 ARG D 212 ? PHE D 216 ? ARG D 241 PHE D 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 29 GLY D 226 ? LEU D 247 ? GLY D 255 LEU D 276 1 ? 22 HELX_P HELX_P30 30 HIS D 375 ? PHE D 386 ? HIS D 404 PHE D 415 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 12 ? B ? 2 ? C ? 4 ? D ? 3 ? E ? 2 ? F ? 2 ? G ? 3 ? H ? 2 ? I ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel A 5 6 ? anti-parallel A 6 7 ? anti-parallel A 7 8 ? anti-parallel A 8 9 ? anti-parallel A 9 10 ? anti-parallel A 10 11 ? anti-parallel A 11 12 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 LEU A 120 ? 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ASP B 218 LEU B 219 E 2 LEU B 254 ? LEU B 255 ? LEU B 283 LEU B 284 F 1 ILE B 258 ? HIS B 259 ? ILE B 287 HIS B 288 F 2 VAL B 338 ? TYR B 339 ? VAL B 367 TYR B 368 G 1 LEU C 120 ? VAL C 125 ? LEU C 149 VAL C 154 G 2 SER C 169 ? ARG C 175 ? SER C 198 ARG C 204 G 3 PHE C 156 ? VAL C 162 ? PHE C 185 VAL C 191 H 1 ARG C 186 ? TYR C 188 ? ARG C 215 TYR C 217 H 2 LEU C 254 ? ILE C 258 ? LEU C 283 ILE C 287 I 1 ARG D 186 ? LEU D 190 ? ARG D 215 LEU D 219 I 2 LEU D 254 ? HIS D 259 ? LEU D 283 HIS D 288 I 3 VAL D 338 ? PHE D 340 ? VAL D 367 PHE D 369 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N VAL A 121 ? N VAL A 150 O MET A 174 ? O MET A 203 A 2 3 O MET A 171 ? O MET A 200 N TYR A 160 ? N TYR A 189 A 3 4 O MET A 159 ? O MET A 188 N TYR A 74 ? N TYR A 103 A 4 5 O PHE A 71 ? O PHE A 100 N ILE A 53 ? N ILE A 82 A 5 6 N LYS A 52 ? N LYS A 81 O ASN D 56 ? O ASN D 85 A 6 7 N VAL D 55 ? N VAL D 84 O PHE D 69 ? O PHE D 98 A 7 8 N LYS D 70 ? N LYS D 99 O SER D 163 ? O SER D 192 A 8 9 N GLY D 158 ? N GLY D 187 O VAL D 173 ? O VAL D 202 A 9 10 O TYR D 170 ? O TYR D 199 N VAL D 125 ? N VAL D 154 A 10 11 O ILE D 122 ? O ILE D 151 N LEU D 113 ? N LEU D 142 A 11 12 O ILE D 114 ? O ILE D 143 N SER D 103 ? N SER D 132 B 1 2 N LEU A 190 ? N LEU A 219 O LEU A 254 ? O LEU A 283 C 1 2 O PHE B 71 ? O PHE B 100 N ILE B 53 ? N ILE B 82 C 2 3 N LYS B 54 ? N LYS B 83 O LYS C 54 ? O LYS C 83 C 3 4 N ILE C 53 ? N ILE C 82 O PHE C 71 ? O PHE C 100 D 1 2 N VAL B 121 ? N VAL B 150 O MET B 174 ? O MET B 203 D 2 3 O VAL B 173 ? O VAL B 202 N LEU B 157 ? N LEU B 186 E 1 2 N LEU B 190 ? N LEU B 219 O LEU B 254 ? 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