data_2GYA # _entry.id 2GYA # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 2GYA RCSB RCSB037697 WWPDB D_1000037697 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2014-12-10 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 4V4V _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 2GYA _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ;This entry with other split entries have been consolidated into a combined file for complete representation. 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2006 MOCEFL US 1097-2765 2168 ? 16713583 10.1016/j.molcel.2006.05.003 1 'Structure of the E. coli protein-conducting channel bound to a translating ribosome' Nature 438 318 324 2005 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? ? ? 2 'Locking and unlocking of ribosomal motions' 'Cell(Cambridge,Mass.)' 114 123 134 2003 CELLB5 US 0092-8674 0998 ? ? ? 3 'A model for co-translational translocation: ribosome-regulated nascent polypeptide translocation at the protein-conducting channel' 'FEBS Lett.' 580 3353 3360 2006 FEBLAL NE 0014-5793 0165 ? 16714018 10.1016/j.febslet.2006.05.019 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Mitra, K.' 1 primary 'Schaffitzel, C.' 2 primary 'Fabiola, F.' 3 primary 'Chapman, M.S.' 4 primary 'Ban, N.' 5 primary 'Frank, J.' 6 1 'Mitra, K.' 7 1 'Schaffitzel, C.' 8 1 'Shaikh, T.' 9 1 'Tama, F.' 10 1 'Jenni, S.' 11 1 'Brooks III, C.L.' 12 1 'Ban, N.' 13 1 'Frank, J.' 14 2 'Valle, M.' 15 2 'Zavialov, A.V.' 16 2 'Sengupta, J.' 17 2 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;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; H ? 13 'polypeptide(L)' no no ;IQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFDG NACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL ; ;IQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFDG NACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL ; I ? 14 'polypeptide(L)' no no ;NTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSDLA KVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIE ; ;NTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSDLA KVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIE ; J ? 15 'polypeptide(L)' no no ;QPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAVRM GKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTK ; ;QPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAVRM GKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTK ; K ? 16 'polypeptide(L)' no no ;HRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLFNE LGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELV ; ;HRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLFNE LGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELV ; L ? 17 'polypeptide(L)' no no ;KKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERA LEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGL ; ;KKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERA LEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGL ; M ? 18 'polypeptide(L)' no no ;SNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVV DSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; ;SNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVV DSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; N ? 19 'polypeptide(L)' no no ;RVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFING LKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAAL ; ;RVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFING LKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAAL ; O ? 20 'polypeptide(L)' no no ;AKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGPSMKR IMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; ;AKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGPSMKR IMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; Q ? 21 'polypeptide(L)' no no ;LLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDWKKAYVT LKEGQNLDFVGG ; ;LLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDWKKAYVT LKEGQNLDFVGG ; R ? 22 'polypeptide(L)' no no ;KIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKADRV GFRFEDGKKVRFFKSNSET ; ;KIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKADRV GFRFEDGKKVRFFKSNSET ; S ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; T ? 24 'polypeptide(L)' no no ;AHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFIS IEAE ; ;AHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFIS IEAE ; U ? 25 'polypeptide(L)' no no MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEK MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEK W ? 26 'polypeptide(L)' no no TIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE TIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE X ? 27 'polypeptide(L)' no no LSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIA LSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIA Z ? 28 'polypeptide(L)' no no AKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK AKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK 1 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 C n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 A n 1 5 C n 1 6 A n 1 7 C n 1 8 G n 1 9 G n 1 10 U n 1 11 G n 1 12 G n 1 13 A n 1 14 U n 1 15 G n 1 16 C n 1 17 C n 1 18 C n 1 19 U n 1 20 G n 1 21 G n 1 22 C n 1 23 A n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 C n 1 27 A n 1 28 A n 1 29 G n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 G n 1 33 A n 1 34 U n 1 35 G n 1 36 A n 1 37 A n 1 38 G n 1 39 G n 1 40 A n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 U n 1 44 G n 1 45 C n 1 46 U n 1 47 A n 1 48 A n 1 49 U n 1 50 C n 1 51 U n 1 52 G n 1 53 C n 1 54 G n 1 55 A n 1 56 U n 1 57 A n 1 58 A n 1 59 G n 1 60 C n 1 61 G n 1 62 U n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 G n 1 66 U n 1 67 A n 1 68 A n 1 69 G n 1 70 G n 1 71 U n 1 72 G n 1 73 A n 1 74 U n 1 75 A n 1 76 U n 1 77 G n 1 78 A n 1 79 A n 1 80 C n 1 81 C n 1 82 G n 1 83 U n 1 84 U n 1 85 U n 1 86 A n 1 87 A n 1 88 C n 1 89 C n 1 90 G n 1 91 G n 1 92 C n 1 93 G n 1 94 A n 1 95 U n 1 96 U n 1 97 U n 1 98 C n 1 99 C n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 A n 1 103 U n 1 104 G n 1 105 G n 1 106 G n 1 107 G n 1 108 A n 1 109 A n 1 110 C n 1 111 C n 1 112 C n 1 113 C n 1 114 G n 1 115 A n 1 116 U n 1 117 C n 1 118 A n 1 119 U n 1 120 U n 1 121 A n 1 122 U n 1 123 C n 1 124 C n 1 125 A n 1 126 A n 1 127 A n 1 128 U n 1 129 G n 1 130 A n 1 131 G n 1 132 G n 1 133 C n 1 134 G n 1 135 A n 1 136 A n 1 137 C n 1 138 C n 1 139 G n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 G n 1 143 G n 1 144 A n 1 145 A n 1 146 C n 1 147 U n 1 148 G n 1 149 A n 1 150 A n 1 151 A n 1 152 C n 1 153 A n 1 154 U n 1 155 C n 1 156 U n 1 157 A n 1 158 A n 1 159 G n 1 160 U n 1 161 A n 1 162 C n 1 163 C n 1 164 C n 1 165 C n 1 166 G n 1 167 A n 1 168 G n 1 169 G n 1 170 A n 1 171 A n 1 172 A n 1 173 A n 1 174 G n 1 175 A n 1 176 A n 1 177 A n 1 178 U n 1 179 C n 1 180 A n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 C n 1 184 G n 1 185 A n 1 186 G n 1 187 A n 1 188 U n 1 189 U n 1 190 C n 1 191 C n 1 192 C n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 A n 1 196 G n 1 197 U n 1 198 A n 1 199 G n 1 200 C n 1 201 G n 1 202 G n 1 203 C n 1 204 G n 1 205 A n 1 206 G n 1 207 C n 1 208 G n 1 209 A n 1 210 A n 1 211 C n 1 212 G n 1 213 G n 1 214 G n 1 215 G n 1 216 A n 1 217 G n 1 218 C n 1 219 A n 1 220 G n 1 221 C n 1 222 C n 1 223 C n 1 224 G n 1 225 A n 1 226 G n 1 227 C n 1 228 C n 1 229 U n 1 230 A n 1 231 A n 1 232 U n 1 233 C n 1 234 A n 1 235 G n 1 236 U n 1 237 G n 1 238 U n 1 239 G n 1 240 U n 1 241 G n 1 242 U n 1 243 G n 1 244 U n 1 245 U n 1 246 G n 1 247 U n 1 248 G n 1 249 G n 1 250 A n 1 251 A n 1 252 G n 1 253 C n 1 254 G n 1 255 U n 1 256 C n 1 257 U n 1 258 G n 1 259 G n 1 260 A n 1 261 A n 1 262 A n 1 263 G n 1 264 G n 1 265 C n 1 266 G n 1 267 C n 1 268 G n 1 269 C n 1 270 G n 1 271 A n 1 272 U n 1 273 A n 1 274 C n 1 275 A n 1 276 G n 1 277 G n 1 278 G n 1 279 U n 1 280 G n 1 281 A n 1 282 C n 1 283 A n 1 284 G n 1 285 C n 1 286 C n 1 287 C n 1 288 C n 1 289 G n 1 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B U 27 N3 ? ? ? 1_555 B A 45 N1 ? ? 9 U 32 9 A 50 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog1840 hydrog ? ? B G 28 N1 ? ? ? 1_555 B C 44 N3 ? ? 9 G 33 9 C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1841 hydrog ? ? B A 34 N3 ? ? ? 1_555 B A 41 N6 ? ? 9 A 39 9 A 46 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog1842 hydrog ? ? B U 35 O2 ? ? ? 1_555 B A 40 N6 ? ? 9 U 40 9 A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog1843 hydrog ? ? B G 39 N2 ? ? ? 1_555 B C 42 O2 ? ? 9 G 44 9 C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1844 hydrog ? ? B G 64 O6 ? ? ? 1_555 B G 101 N2 ? ? 9 G 69 9 G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? hydrog1845 hydrog ? ? B C 66 O2 ? ? ? 1_555 B G 100 N2 ? ? 9 C 71 9 G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? hydrog1846 hydrog ? ? B G 67 N1 ? ? ? 1_555 B A 99 N1 ? ? 9 G 72 9 A 104 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog1847 hydrog ? ? B U 69 O4 ? ? ? 1_555 B G 97 N2 ? ? 9 U 74 9 G 102 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog1848 hydrog ? ? 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B G 78 N1 ? ? ? 1_555 B C 88 O2 ? ? 9 G 83 9 C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1858 hydrog ? ? B G 79 N1 ? ? ? 1_555 B C 87 O2 ? ? 9 G 84 9 C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1859 hydrog ? ? B G 80 N1 ? ? ? 1_555 B C 86 O2 ? ? 9 G 85 9 C 91 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1860 hydrog ? ? B G 81 N1 ? ? ? 1_555 B C 85 N3 ? ? 9 G 86 9 C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1861 hydrog ? ? B G 81 N2 ? ? ? 1_555 B C 85 O2 ? ? 9 G 86 9 C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1862 hydrog ? ? B G 81 O6 ? ? ? 1_555 B C 85 N4 ? ? 9 G 86 9 C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 151 G . ? THR 151 B PRO 152 G ? PRO 152 B 1 0.27 2 VAL 26 I . ? VAL 27 D PRO 27 I ? PRO 28 D 1 -0.07 3 VAL 106 I . ? VAL 107 D PRO 107 I ? PRO 108 D 1 0.17 4 PHE 173 I . ? PHE 174 D PRO 174 I ? 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34 34 34 SER SER W . n Z 25 35 GLY 35 35 35 GLY GLY W . n Z 25 36 GLN 36 36 36 GLN GLN W . n Z 25 37 LEU 37 37 37 LEU LEU W . n Z 25 38 GLN 38 38 38 GLN GLN W . n Z 25 39 GLN 39 39 39 GLN GLN W . n Z 25 40 SER 40 40 40 SER SER W . n Z 25 41 HIS 41 41 41 HIS HIS W . n Z 25 42 LEU 42 42 42 LEU LEU W . n Z 25 43 LEU 43 43 43 LEU LEU W . n Z 25 44 LYS 44 44 44 LYS LYS W . n Z 25 45 GLN 45 45 45 GLN GLN W . n Z 25 46 VAL 46 46 46 VAL VAL W . n Z 25 47 ARG 47 47 47 ARG ARG W . n Z 25 48 ARG 48 48 48 ARG ARG W . n Z 25 49 ASP 49 49 49 ASP ASP W . n Z 25 50 VAL 50 50 50 VAL VAL W . n Z 25 51 ALA 51 51 51 ALA ALA W . n Z 25 52 ARG 52 52 52 ARG ARG W . n Z 25 53 VAL 53 53 53 VAL VAL W . n Z 25 54 LYS 54 54 54 LYS LYS W . n Z 25 55 THR 55 55 55 THR THR W . n Z 25 56 LEU 56 56 56 LEU LEU W . n Z 25 57 LEU 57 57 57 LEU LEU W . n Z 25 58 ASN 58 58 58 ASN ASN W . n Z 25 59 GLU 59 59 59 GLU GLU W . n Z 25 60 LYS 60 60 60 LYS LYS W . n AA 26 1 THR 1 3 3 THR THR X . n AA 26 2 ILE 2 4 4 ILE ILE X . n AA 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130 PRO PRO 1 . n CA 28 31 GLU 31 31 131 GLU GLU 1 . n CA 28 32 LYS 32 32 132 LYS LYS 1 . n CA 28 33 LEU 33 33 133 LEU LEU 1 . n CA 28 34 GLU 34 34 134 GLU GLU 1 . n CA 28 35 LEU 35 35 135 LEU LEU 1 . n CA 28 36 LYS 36 36 136 LYS LYS 1 . n CA 28 37 LYS 37 37 137 LYS LYS 1 . n CA 28 38 PHE 38 38 138 PHE PHE 1 . n CA 28 39 ASP 39 39 139 ASP ASP 1 . n CA 28 40 PRO 40 40 140 PRO PRO 1 . n CA 28 41 VAL 41 41 141 VAL VAL 1 . n CA 28 42 VAL 42 42 142 VAL VAL 1 . n CA 28 43 ARG 43 43 143 ARG ARG 1 . n CA 28 44 GLN 44 44 144 GLN GLN 1 . n CA 28 45 HIS 45 45 145 HIS HIS 1 . n CA 28 46 VAL 46 46 146 VAL VAL 1 . n CA 28 47 ILE 47 47 147 ILE ILE 1 . n CA 28 48 TYR 48 48 148 TYR TYR 1 . n CA 28 49 LYS 49 49 149 LYS LYS 1 . n CA 28 50 GLU 50 50 150 GLU GLU 1 . n CA 28 51 ALA 51 51 151 ALA ALA 1 . n CA 28 52 LYS 52 52 152 LYS LYS 1 . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 29-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 29 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2006-09-26 2 'Structure model' 1 1 2008-05-01 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2014-12-10 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 4 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 400 ;COMPOUND THIS FILE, 2GYA, CONTAINS THE 50S SUBUNIT OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX. THE ENTIRE CRYO-EM STRUCTURE CONTAINS ONE 70S RIBOSOME AND ARE DEPOSITED UNDER 2GY9 (30S SUBUNIT) AND 2GYA (50S SUBUNIT). ; 999 ;SEQUENCE THIS PDB FILE WAS OBTAINED UPON RIGID BODY REFINEMENT OF A STARTING PDB FILE INTO A CRYO-EM MAP. THE E. COLI RIBOSOMES ARE OBTAINED NATURALLY, BUT FOR THE MODELING OF THE PROTEINS INTO THE EM MAP AUTHORS SOMETIMES DID NOT MODEL IN THE ENTIRE PROTEIN. Some residues are not within link distances for C-N bond. ; # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 2GYA _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'CNS implementation of RSRef' _em_3d_fitting.target_criteria 'Minimization of number of poor van der Waals contacts and maximation of correlation coefficient' _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.details ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 2GYA _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method '3D projection matching; conjugate gradients with regularization' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 2.82 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 2.82 _em_3d_reconstruction.resolution 15 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration TMV _em_3d_reconstruction.details ;WITH THE USE OF APPROPRIATE STEREOCHEMICAL CONSTRAINTS, AN ATOMIC MODEL FITTED INTO AN EM MAP YIELDS AN ACCURACY OF 5-FOLD BETTER THAN THE NOMINAL RESOLUTION OF THE EM MAP. THE RESOLUTION OF THE ATOMIC MODEL FITTED INTO EMD-1056 (NOMINAL RESOLUTION 15.0 ANGSTROMS) IS THUS ESTIMATED TO BE BETWEEN 2-3 ANGSTROMS. REAL-SPACE REFINEMENT USING RIGID BODIES INTO EM MAP EMD-1056 (FILTERED TO A NOMINAL RESOLUTION OF 15 ANGSTROMS). RIGID BODY DEFINITION: AN AUTONOMOUS SECONDARY STRUCTURE UNIT (E.G. HELIX SEGMENT, HAIRPIN) OF THE RIBOSOMAL RNA; AN AUTONOMOUS RIBOSOMAL PROTEIN DOMAIN. THE ATOMIC MODEL USED WAS GENERATED FROM E. COLI MODELS OF X-RAY CRYSTALLOGRAPHY STRUCTURES OF RIBOSOMES FROM OTHER ORGANISMS. IN THE ABSENCE OF E. COLI MODELS, STRUCTURES WERE DERIVED DIRECTLY FROM THE X-RAY CRYSTALLOGRAPHY STRUCTURES OF RIBOSOMES FROM OTHER ORGANISMS. ; _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles ? _em_3d_reconstruction.symmetry_type ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id ? _em_buffer.name ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 ? '30S ribosomal protein L1' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 2 ? '30S ribosomal protein L7/L12' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 3 ? '30S ribosomal protein L2' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 4 ? '30S ribosomal protein L3' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 5 ? 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? -168.59 -145.15 86 1 LEU A 104 ? ? -53.20 103.42 87 1 PRO A 106 ? ? -66.50 -141.09 88 1 ILE A 115 ? ? -67.36 81.10 89 1 GLN A 116 ? ? -48.51 170.14 90 1 PRO A 125 ? ? -51.34 96.17 91 1 MET A 131 ? ? 26.00 -83.13 92 1 ARG A 132 ? ? -45.38 0.58 93 1 PRO A 135 ? ? -54.68 179.76 94 1 VAL A 140 ? ? -132.80 -152.76 95 1 HIS A 141 ? ? 139.22 136.21 96 1 ASN A 142 ? ? 65.60 101.43 97 1 GLU A 144 ? ? -15.98 155.13 98 1 LYS A 149 ? ? 138.61 -37.03 99 1 GLN A 152 ? ? 178.01 -72.26 100 1 ALA A 154 ? ? 131.34 102.76 101 1 ARG A 155 ? ? 177.33 27.45 102 1 SER A 156 ? ? -96.21 -157.44 103 1 ALA A 157 ? ? -40.46 25.40 104 1 THR A 159 ? ? -9.11 172.55 105 1 VAL A 161 ? ? -108.70 41.68 106 1 GLN A 162 ? ? -46.93 158.61 107 1 VAL A 164 ? ? -148.39 -32.26 108 1 ASP A 167 ? ? -173.97 148.79 109 1 TYR A 170 ? ? -124.80 -157.95 110 1 VAL A 171 ? ? 177.16 124.29 111 1 THR A 172 ? ? -40.54 -100.11 112 1 LEU A 173 ? ? 83.04 116.10 113 1 LEU A 175 ? ? 74.27 -138.10 114 1 MET A 180 ? ? -53.54 96.97 115 1 GLU A 184 ? ? -64.49 -176.46 116 1 ASP A 186 ? ? -170.14 -3.72 117 1 CYS A 187 ? ? -74.52 -152.73 118 1 VAL A 194 ? ? -124.19 -126.70 119 1 ASN A 196 ? ? 14.65 135.73 120 1 VAL A 203 ? ? -38.03 163.75 121 1 ARG A 216 ? ? -169.58 58.43 122 1 PRO A 217 ? ? -85.77 -152.84 123 1 THR A 222 ? ? -78.56 26.89 124 1 LYS A 241 ? ? -174.91 -58.49 125 1 HIS A 242 ? ? 92.26 -72.58 126 1 THR A 251 ? ? 77.46 -35.95 127 1 LYS A 255 ? ? 61.36 -112.05 128 1 ASP A 263 ? ? -69.09 -74.40 129 1 THR B 12 ? ? -126.44 -134.90 130 1 ARG B 13 ? ? 174.91 154.00 131 1 TYR B 45 ? ? -158.83 50.98 132 1 VAL B 50 ? ? -63.73 -70.96 133 1 PHE B 82 ? ? 113.83 -74.62 134 1 LEU B 84 ? ? -68.31 -177.63 135 1 ALA B 85 ? ? 171.09 159.73 136 1 GLU B 86 ? ? -107.94 -92.86 137 1 THR B 91 ? ? -62.39 -80.23 138 1 VAL B 92 ? ? -152.53 -13.99 139 1 ARG B 124 ? ? -78.72 -165.79 140 1 TRP B 125 ? ? -28.71 73.18 141 1 ASN B 126 ? ? 30.98 11.03 142 1 ARG B 128 ? ? -62.70 -149.44 143 1 GLN B 130 ? ? -64.37 89.50 144 1 ALA B 132 ? ? 72.15 -155.99 145 1 SER B 137 ? ? -79.33 27.52 146 1 LEU B 138 ? ? 42.02 13.19 147 1 HIS B 140 ? ? -73.39 -79.42 148 1 ASN B 149 ? ? 36.72 91.19 149 1 LYS B 159 ? ? -33.04 85.67 150 1 MET B 161 ? ? -136.32 -143.84 151 1 ALA B 182 ? ? 155.74 -172.04 152 1 ASN B 185 ? ? -58.75 97.99 153 1 ALA B 206 ? ? -38.46 117.20 154 1 ALA C 11 ? ? -48.25 153.98 155 1 VAL C 14 ? ? -145.73 -121.72 156 1 SER C 15 ? ? -86.39 -157.85 157 1 THR C 18 ? ? 176.50 170.17 158 1 ARG C 21 ? ? -174.70 112.66 159 1 ASP C 22 ? ? -36.94 90.56 160 1 VAL C 28 ? ? -159.08 59.42 161 1 HIS C 29 ? ? -153.43 -48.10 162 1 GLN C 30 ? ? -93.55 -65.27 163 1 VAL C 31 ? ? -4.41 -62.59 164 1 GLN C 41 ? ? 64.67 157.81 165 1 ARG C 44 ? ? -56.22 -92.94 166 1 ALA C 45 ? ? 164.34 -93.82 167 1 LYS C 47 ? ? -56.73 86.81 168 1 THR C 48 ? ? 172.56 144.47 169 1 LYS C 57 ? ? -52.84 -81.37 170 1 PRO C 59 ? ? -39.12 78.95 171 1 TRP C 60 ? ? 170.82 159.02 172 1 ALA C 68 ? ? -176.27 128.63 173 1 ARG C 69 ? ? 67.30 -58.74 174 1 SER C 70 ? ? -179.04 2.38 175 1 LYS C 74 ? ? 64.91 -59.82 176 1 ARG C 79 ? ? -54.79 171.76 177 1 SER C 80 ? ? 58.44 -2.27 178 1 PHE C 85 ? ? -113.32 -142.98 179 1 ALA C 87 ? ? 105.89 66.37 180 1 ARG C 88 ? ? 172.45 110.54 181 1 GLN C 90 ? ? -102.54 -143.64 182 1 ASP C 91 ? ? -83.02 -144.50 183 1 ARG C 117 ? ? -142.29 -145.81 184 1 LEU C 118 ? ? -78.69 -158.27 185 1 ALA C 128 ? ? -42.48 107.46 186 1 ILE C 149 ? ? -80.56 -81.10 187 1 THR C 150 ? ? 168.62 -157.03 188 1 LEU C 153 ? ? -172.09 -148.67 189 1 ASP C 154 ? ? -129.25 -115.35 190 1 GLU C 155 ? ? -7.79 -86.63 191 1 LEU C 164 ? ? -35.38 159.70 192 1 LYS C 166 ? ? 34.16 41.55 193 1 ALA C 172 ? ? -46.19 -13.23 194 1 ILE C 181 ? ? -157.30 82.08 195 1 PHE C 183 ? ? 90.32 78.83 196 1 ASP C 184 ? ? 26.97 39.41 197 1 VAL C 186 ? ? -173.52 -161.59 198 1 VAL C 187 ? ? -170.49 140.37 199 1 HIS D 4 ? ? -161.69 -18.47 200 1 LYS D 8 ? ? 94.18 64.78 201 1 ASP D 9 ? ? 153.05 -30.16 202 1 VAL D 12 ? ? -151.21 -20.70 203 1 MET D 16 ? ? 171.70 18.69 204 1 ASN D 20 ? ? -160.41 -69.32 205 1 TYR D 21 ? ? 60.07 73.20 206 1 ASN D 22 ? ? -154.19 -147.20 207 1 MET D 25 ? ? -103.65 -159.48 208 1 GLN D 26 ? ? 67.24 -22.03 209 1 VAL D 30 ? ? -114.92 -106.80 210 1 GLU D 31 ? ? 60.23 134.59 211 1 VAL D 39 ? ? -22.56 115.02 212 1 ALA D 42 ? ? 74.77 -79.76 213 1 ILE D 43 ? ? -8.70 -75.03 214 1 ASP D 45 ? ? -96.89 -150.90 215 1 LYS D 46 ? ? -58.24 91.11 216 1 LYS D 47 ? ? 165.12 -160.14 217 1 LEU D 48 ? ? 62.67 -23.33 218 1 ASP D 55 ? ? -150.83 -28.34 219 1 GLN D 62 ? ? 68.15 171.99 220 1 LYS D 71 ? ? -50.84 91.80 221 1 SER D 72 ? ? -161.37 100.69 222 1 LYS D 77 ? ? -68.85 89.12 223 1 ARG D 91 ? ? -144.84 -158.15 224 1 GLU D 93 ? ? -168.09 1.95 225 1 MET D 95 ? ? -66.44 72.76 226 1 TRP D 96 ? ? -156.23 -40.95 227 1 PHE D 98 ? ? -86.17 37.81 228 1 PHE D 99 ? ? -143.85 15.03 229 1 GLU D 100 ? ? -124.20 -63.98 230 1 THR D 104 ? ? -165.65 -61.10 231 1 ALA D 106 ? ? 67.47 -21.33 232 1 ARG D 109 ? ? 167.53 48.03 233 1 ILE D 110 ? ? -102.07 -89.77 234 1 ARG D 111 ? ? -177.45 -18.01 235 1 ASP D 112 ? ? -171.18 53.28 236 1 ARG D 114 ? ? -82.07 -95.66 237 1 LYS D 119 ? ? -60.08 95.64 238 1 SER D 120 ? ? -59.40 -78.40 239 1 ASP D 122 ? ? -132.71 -53.38 240 1 ARG D 124 ? ? -149.33 -139.72 241 1 ASN D 126 ? ? -47.06 100.18 242 1 TYR D 127 ? ? -53.69 -101.07 243 1 SER D 128 ? ? 156.17 -163.57 244 1 MET D 129 ? ? -176.50 -166.35 245 1 LYS D 144 ? ? 174.35 -12.39 246 1 ARG D 147 ? ? 63.93 103.31 247 1 THR D 158 ? ? -113.13 66.18 248 1 GLU D 164 ? ? 59.29 17.83 249 1 PHE D 172 ? ? -167.01 -47.14 250 1 PHE D 176 ? ? -179.50 84.04 251 1 ASP E 38 ? ? -160.11 -167.19 252 1 ALA E 39 ? ? -79.96 49.09 253 1 ASP E 46 ? ? -35.61 -29.81 254 1 PRO E 53 ? ? -69.34 -172.02 255 1 ASN E 100 ? ? -103.43 -69.21 256 1 ALA E 118 ? ? 49.23 -151.37 257 1 THR E 126 ? ? -64.31 76.21 258 1 GLN E 127 ? ? -162.87 -141.74 259 1 PRO E 155 ? ? -58.23 171.55 260 1 LYS E 159 ? ? -79.77 -168.98 261 1 ALA E 164 ? ? -36.87 113.29 262 1 ASP E 165 ? ? -179.86 139.34 263 1 ASP F 7 ? ? -78.51 -93.98 264 1 VAL F 9 ? ? -155.94 -63.05 265 1 ALA F 10 ? ? -151.98 74.32 266 1 ASN F 11 ? ? 76.66 -57.02 267 1 SER F 14 ? ? -78.24 40.78 268 1 LEU F 15 ? ? -110.71 -71.91 269 1 VAL F 21 ? ? -108.07 -164.64 270 1 PHE F 29 ? ? -120.05 -80.91 271 1 ASN F 73 ? ? -67.96 2.67 272 1 GLU F 76 ? ? 76.50 172.39 273 1 THR F 77 ? ? 15.79 147.34 274 1 SER F 136 ? ? -58.01 -10.00 275 1 VAL G 8 ? ? 171.12 138.08 276 1 ALA G 14 ? ? -52.63 97.24 277 1 ALA G 17 ? ? -150.86 -83.32 278 1 PRO G 19 ? ? -77.24 -153.28 279 1 ILE G 34 ? ? -99.35 30.96 280 1 GLU G 36 ? ? -88.78 -158.43 281 1 PHE G 37 ? ? 70.42 -14.56 282 1 PHE G 41 ? ? -140.48 -49.71 283 1 ASN G 42 ? ? -91.99 41.30 284 1 ALA G 43 ? ? -152.92 14.80 285 1 LYS G 44 ? ? -138.81 -30.15 286 1 THR G 45 ? ? -97.65 53.34 287 1 SER G 47 ? ? 136.59 4.50 288 1 ILE G 48 ? ? -109.16 -148.63 289 1 PRO G 53 ? ? -69.70 69.60 290 1 THR G 59 ? ? -78.08 -138.76 291 1 VAL G 60 ? ? -141.62 -87.74 292 1 ALA G 62 ? ? -157.94 -10.94 293 1 ASP G 63 ? ? -127.60 -78.60 294 1 ARG G 64 ? ? -160.41 -37.11 295 1 SER G 65 ? ? -54.60 -155.75 296 1 PHE G 66 ? ? -152.08 -154.74 297 1 LYS G 71 ? ? -77.68 -152.22 298 1 ALA G 75 ? ? 129.76 108.07 299 1 ALA G 76 ? ? 106.89 -51.87 300 1 LEU G 78 ? ? 65.50 -12.43 301 1 LYS G 81 ? ? -94.98 40.60 302 1 ALA G 83 ? ? -154.79 51.31 303 1 ASN G 93 ? ? 128.86 -17.44 304 1 VAL G 97 ? ? -143.24 -42.29 305 1 GLN G 104 ? ? -78.56 27.56 306 1 GLN G 110 ? ? 71.12 -43.68 307 1 THR G 111 ? ? -79.95 46.28 308 1 LYS G 112 ? ? 176.31 3.57 309 1 ASP G 115 ? ? 160.00 -48.69 310 1 ASP G 120 ? ? 65.53 140.76 311 1 SER G 127 ? ? 74.94 -46.15 312 1 ALA G 132 ? ? -33.20 -83.71 313 1 SER G 134 ? ? -144.06 26.74 314 1 MET G 135 ? ? -154.68 70.23 315 1 LEU G 137 ? ? 8.19 129.33 316 1 THR H 3 ? ? -150.56 83.21 317 1 PRO H 8 ? ? -118.69 -90.85 318 1 GLU H 9 ? ? -150.35 12.44 319 1 ARG H 13 ? ? -33.61 126.06 320 1 ASP H 14 ? ? -63.75 -153.19 321 1 TRP H 15 ? ? 160.57 146.06 322 1 ASP H 19 ? ? -112.26 74.05 323 1 LYS H 23 ? ? 127.98 160.08 324 1 LEU H 28 ? ? -148.99 -12.15 325 1 GLU H 31 ? ? 60.85 171.68 326 1 LEU H 32 ? ? 62.99 -63.50 327 1 LEU H 36 ? ? -78.88 -112.30 328 1 ARG H 37 ? ? -61.36 93.15 329 1 HIS H 40 ? ? 115.97 43.13 330 1 ALA H 42 ? ? -76.93 45.54 331 1 THR H 45 ? ? -161.33 -41.71 332 1 HIS H 47 ? ? -160.88 -25.43 333 1 THR H 50 ? ? -150.19 -38.93 334 1 LEU H 57 ? ? -64.47 -101.25 335 1 VAL H 62 ? ? -49.34 97.02 336 1 ASN H 67 ? ? -148.44 -50.57 337 1 ARG H 69 ? ? -127.63 -104.66 338 1 THR H 70 ? ? -74.40 32.84 339 1 HIS H 77 ? ? 162.30 173.66 340 1 GLU H 91 ? ? -72.43 22.21 341 1 ARG H 96 ? ? -68.70 -122.27 342 1 GLU H 98 ? ? -142.28 -46.29 343 1 VAL H 100 ? ? -156.26 -79.09 344 1 ILE H 101 ? ? -79.79 34.58 345 1 GLU H 102 ? ? -141.37 -10.32 346 1 VAL H 105 ? ? 37.78 31.81 347 1 LYS H 106 ? ? -145.15 -24.62 348 1 LYS H 111 ? ? -161.81 53.37 349 1 PRO H 113 ? ? 31.00 114.66 350 1 LEU H 114 ? ? -52.56 95.39 351 1 PHE H 119 ? ? 176.52 -52.96 352 1 LYS H 121 ? ? -59.61 -71.88 353 1 TYR H 125 ? ? -171.26 146.71 354 1 ASN H 128 ? ? -178.73 -129.36 355 1 GLN H 135 ? ? 65.73 106.97 356 1 GLN H 138 ? ? -27.81 -165.74 357 1 LEU H 140 ? ? -125.85 -151.03 358 1 ASP H 141 ? ? 165.64 92.37 359 1 ILE I 22 ? ? -128.90 -57.85 360 1 ARG I 31 ? ? 65.31 107.32 361 1 TYR I 32 ? ? -179.22 149.44 362 1 ALA I 33 ? ? -174.50 109.72 363 1 LYS I 44 ? ? -105.33 -69.42 364 1 ALA I 46 ? ? 178.69 -164.54 365 1 PRO I 48 ? ? -63.38 6.48 366 1 VAL I 52 ? ? -30.83 92.24 367 1 ASP I 80 ? ? -66.81 -77.82 368 1 ASN I 90 ? ? -59.74 89.64 369 1 SER I 91 ? ? -0.51 104.33 370 1 ARG I 108 ? ? -105.82 -89.23 371 1 SER I 109 ? ? -40.13 -70.96 372 1 LYS I 111 ? ? -102.01 -80.60 373 1 THR J 5 ? ? -81.53 43.25 374 1 SER J 7 ? ? -55.70 107.64 375 1 GLU J 10 ? ? 161.92 120.97 376 1 SER J 12 ? ? -124.19 -108.02 377 1 LYS J 14 ? ? -64.59 51.96 378 1 LYS J 17 ? ? 167.56 122.58 379 1 LEU J 19 ? ? -29.83 -39.98 380 1 LEU J 27 ? ? -58.71 -175.03 381 1 THR J 30 ? ? -140.71 -92.45 382 1 LYS J 36 ? ? -171.62 -172.37 383 1 GLN J 38 ? ? 49.71 73.56 384 1 LYS J 39 ? ? 166.13 -160.67 385 1 ARG J 41 ? ? -52.56 175.57 386 1 SER J 42 ? ? 85.28 -136.45 387 1 VAL J 46 ? ? -33.09 -35.39 388 1 GLU J 51 ? ? -146.23 -27.83 389 1 GLN J 54 ? ? -168.66 -162.03 390 1 ARG J 60 ? ? -43.74 -75.42 391 1 LEU J 61 ? ? -154.93 67.15 392 1 PRO J 62 ? ? -68.11 -159.00 393 1 PHE J 64 ? ? -48.86 166.95 394 1 ALA J 75 ? ? 70.51 59.13 395 1 ILE J 77 ? ? -43.36 109.13 396 1 ASP J 81 ? ? 67.04 164.93 397 1 ALA J 83 ? ? -146.53 -0.87 398 1 VAL J 85 ? ? -77.38 37.95 399 1 VAL J 89 ? ? -73.82 -161.81 400 1 VAL J 90 ? ? 34.04 85.30 401 1 ASN J 93 ? ? -59.79 90.42 402 1 THR J 94 ? ? 166.77 -34.68 403 1 LEU J 95 ? ? -119.77 70.38 404 1 ILE J 100 ? ? -82.50 37.46 405 1 GLN J 104 ? ? -63.09 3.41 406 1 ILE J 105 ? ? -110.52 -140.55 407 1 PHE J 107 ? ? 78.37 173.70 408 1 ALA J 108 ? ? -169.75 -139.30 409 1 LYS J 109 ? ? 172.38 153.38 410 1 LEU J 112 ? ? -58.53 79.41 411 1 VAL J 116 ? ? -39.17 131.10 412 1 THR J 118 ? ? -124.28 -69.93 413 1 VAL J 120 ? ? -32.35 154.86 414 1 ARG J 123 ? ? -68.38 -95.77 415 1 LEU J 125 ? ? 95.58 5.93 416 1 VAL J 127 ? ? -173.14 148.03 417 1 ALA J 134 ? ? 60.91 -175.39 418 1 ILE J 135 ? ? 30.36 35.36 419 1 GLU J 136 ? ? -162.48 -44.26 420 1 THR K 7 ? ? -142.01 -99.69 421 1 LYS K 8 ? ? -102.03 -168.16 422 1 HIS K 13 ? ? -104.76 -122.62 423 1 LEU K 20 ? ? -55.37 102.87 424 1 GLN K 22 ? ? 59.26 165.68 425 1 ASP K 25 ? ? -97.45 54.06 426 1 PHE K 31 ? ? -102.55 -137.22 427 1 LEU K 33 ? ? -151.48 89.03 428 1 VAL K 57 ? ? -84.28 47.62 429 1 GLN K 60 ? ? -151.93 -140.35 430 1 LEU K 78 ? ? -177.47 -135.43 431 1 ALA K 79 ? ? -82.76 -96.33 432 1 VAL K 80 ? ? -172.92 -68.87 433 1 ASN K 88 ? ? -108.43 -140.69 434 1 TYR K 91 ? ? -99.45 -150.40 435 1 ASP K 106 ? ? -63.29 89.83 436 1 PRO K 109 ? ? -30.71 82.20 437 1 GLU K 110 ? ? -158.00 17.76 438 1 GLU K 111 ? ? -34.22 101.95 439 1 ILE K 126 ? ? 153.50 129.58 440 1 LYS L 5 ? ? -57.56 -172.77 441 1 ARG L 8 ? ? -72.02 -166.72 442 1 ARG L 12 ? ? -103.76 -112.93 443 1 ASN L 13 ? ? -108.31 -140.46 444 1 MET L 20 ? ? 68.94 -37.09 445 1 ASN L 23 ? ? 78.18 134.97 446 1 ALA L 25 ? ? -136.92 -35.37 447 1 LEU L 28 ? ? -95.90 51.75 448 1 VAL L 29 ? ? -170.84 -25.51 449 1 GLU L 32 ? ? -68.15 28.03 450 1 THR L 36 ? ? -105.52 -112.23 451 1 THR L 37 ? ? -141.54 -126.04 452 1 LEU L 38 ? ? -101.21 -70.97 453 1 LYS L 40 ? ? -40.69 -126.51 454 1 GLU L 49 ? ? 72.05 78.13 455 1 LEU L 51 ? ? 110.88 -5.15 456 1 THR L 53 ? ? 70.18 118.63 457 1 LEU L 54 ? ? 92.52 -8.57 458 1 LYS L 56 ? ? -66.38 -89.23 459 1 ASN L 62 ? ? -136.43 -65.43 460 1 ALA L 68 ? ? -155.91 -39.73 461 1 ASP L 72 ? ? -178.88 133.70 462 1 ILE L 75 ? ? -93.91 36.39 463 1 ASN L 81 ? ? 53.63 17.85 464 1 GLU L 82 ? ? 172.51 142.61 465 1 ARG L 86 ? ? -170.70 -13.32 466 1 ALA L 88 ? ? -36.39 -83.17 467 1 SER L 89 ? ? -94.31 54.61 468 1 THR L 95 ? ? -150.65 87.26 469 1 ILE L 97 ? ? -171.85 147.66 470 1 LYS L 99 ? ? -45.13 167.08 471 1 ALA L 104 ? ? -65.90 -168.36 472 1 ASN L 107 ? ? -57.36 95.24 473 1 ALA L 111 ? ? -82.35 -138.25 474 1 TYR L 112 ? ? -164.56 66.56 475 1 ILE L 113 ? ? 7.79 -67.61 476 1 GLU L 114 ? ? 54.47 167.04 477 1 THR M 12 ? ? 39.38 28.18 478 1 ALA M 23 ? ? -120.14 -154.40 479 1 PRO M 32 ? ? -55.30 1.48 480 1 VAL M 39 ? ? -119.44 78.31 481 1 PRO M 42 ? ? -42.32 170.16 482 1 ASN M 43 ? ? 66.32 68.95 483 1 SER M 45 ? ? -108.84 72.69 484 1 ALA M 59 ? ? -72.51 -72.52 485 1 GLU M 60 ? ? 174.42 60.61 486 1 HIS M 100 ? ? 59.14 5.02 487 1 ILE N 3 ? ? -70.86 38.26 488 1 ILE N 4 ? ? -138.22 -33.51 489 1 GLU N 8 ? ? -148.53 -12.47 490 1 GLU N 10 ? ? -80.91 -82.04 491 1 LYS N 13 ? ? -39.34 135.50 492 1 GLN N 14 ? ? -56.20 73.44 493 1 VAL N 16 ? ? -17.23 87.82 494 1 PRO N 17 ? ? -54.51 104.91 495 1 SER N 18 ? ? -29.73 127.44 496 1 PHE N 19 ? ? -29.48 -61.27 497 1 PRO N 21 ? ? -34.79 148.16 498 1 ASP N 23 ? ? 45.49 -148.68 499 1 VAL N 25 ? ? -25.64 127.37 500 1 VAL N 29 ? ? -74.87 -164.59 501 1 TRP N 30 ? ? -136.90 -156.93 502 1 VAL N 31 ? ? 169.23 170.80 503 1 VAL N 32 ? ? -174.58 9.69 504 1 SER N 35 ? ? 70.36 -33.19 505 1 LYS N 36 ? ? -131.59 -157.84 506 1 ARG N 38 ? ? -54.84 88.06 507 1 LEU N 39 ? ? -159.30 13.76 508 1 PHE N 42 ? ? -65.94 -169.07 509 1 ILE N 47 ? ? -129.32 -149.82 510 1 ALA N 48 ? ? -173.40 -163.07 511 1 ILE N 49 ? ? -73.08 -111.04 512 1 ASN N 51 ? ? -44.60 163.02 513 1 LEU N 54 ? ? -112.24 -157.27 514 1 HIS N 55 ? ? -70.65 -88.43 515 1 SER N 56 ? ? -45.72 -78.95 516 1 VAL N 60 ? ? -54.57 -91.47 517 1 ARG N 61 ? ? 160.97 -167.80 518 1 GLU N 67 ? ? -35.35 136.34 519 1 GLU N 70 ? ? -173.95 -113.66 520 1 ARG N 71 ? ? -172.81 -150.16 521 1 VAL N 72 ? ? 116.05 -154.04 522 1 PHE N 73 ? ? 49.73 160.63 523 1 GLN N 74 ? ? 175.69 136.71 524 1 ASP N 81 ? ? -106.96 66.44 525 1 VAL N 85 ? ? -110.17 -163.68 526 1 ARG N 87 ? ? -101.02 -159.55 527 1 ARG N 88 ? ? -179.82 -136.12 528 1 VAL N 91 ? ? 37.06 -173.17 529 1 ARG N 92 ? ? 171.18 -153.07 530 1 ALA N 94 ? ? 159.25 -76.94 531 1 LYS N 95 ? ? 179.51 85.68 532 1 TYR N 97 ? ? 134.22 -40.42 533 1 ARG N 100 ? ? -62.57 -146.35 534 1 GLU N 101 ? ? 56.81 -158.64 535 1 ARG N 102 ? ? 63.55 -22.88 536 1 LYS N 105 ? ? -169.73 80.93 537 1 ALA N 107 ? ? -129.83 -160.33 538 1 ARG N 108 ? ? -67.55 -81.37 539 1 VAL O 7 ? ? -72.21 36.96 540 1 ALA O 9 ? ? 66.57 120.86 541 1 ARG O 10 ? ? 81.75 -8.87 542 1 LYS O 14 ? ? -85.13 -159.86 543 1 LYS O 15 ? ? 58.43 12.88 544 1 LEU O 17 ? ? 68.13 -11.65 545 1 GLN O 19 ? ? 138.63 -21.08 546 1 TYR O 23 ? ? -98.08 -154.91 547 1 ALA O 26 ? ? -105.89 -130.65 548 1 ARG O 27 ? ? 34.64 31.63 549 1 SER O 28 ? ? -158.11 -32.49 550 1 VAL O 33 ? ? -140.03 -40.86 551 1 PHE O 35 ? ? 67.81 118.25 552 1 GLN O 36 ? ? 95.02 -12.82 553 1 GLN O 43 ? ? -96.60 -149.01 554 1 TYR O 44 ? ? 61.06 -37.12 555 1 TYR O 46 ? ? -32.20 -35.12 556 1 ARG O 47 ? ? -172.16 48.52 557 1 GLN O 55 ? ? -119.08 -72.25 558 1 ILE O 61 ? ? -173.53 95.31 559 1 ALA O 62 ? ? 103.94 66.54 560 1 ARG O 63 ? ? 165.23 -35.16 561 1 ALA O 68 ? ? -79.04 -155.19 562 1 GLN O 70 ? ? 178.77 -27.48 563 1 TYR O 75 ? ? 14.62 -64.96 564 1 ASN O 80 ? ? -155.56 76.30 565 1 LYS O 84 ? ? -105.21 -77.28 566 1 SER O 86 ? ? 98.20 178.84 567 1 GLU O 88 ? ? 60.10 95.03 568 1 LYS O 92 ? ? -140.09 -67.24 569 1 ASP O 96 ? ? 169.96 -10.13 570 1 VAL O 99 ? ? -156.32 -51.20 571 1 ASP O 101 ? ? -169.37 114.24 572 1 LYS O 102 ? ? -69.07 28.28 573 1 ALA O 104 ? ? 67.14 -28.78 574 1 ALA O 107 ? ? -79.40 39.45 575 1 LEU O 108 ? ? -170.50 12.57 576 1 LYS O 113 ? ? 61.66 -2.58 577 1 ARG Q 8 ? ? -142.15 -126.81 578 1 HIS Q 9 ? ? -47.93 97.31 579 1 ARG Q 11 ? ? -62.72 3.70 580 1 SER Q 12 ? ? -58.40 -179.98 581 1 ALA Q 14 ? ? 68.26 -42.36 582 1 ARG Q 18 ? ? 63.15 76.22 583 1 LEU Q 19 ? ? -178.67 -47.49 584 1 LEU Q 23 ? ? 77.59 -25.23 585 1 LYS Q 27 ? ? -65.98 -178.45 586 1 LYS Q 28 ? ? 55.07 110.88 587 1 LEU Q 36 ? ? 83.56 -1.16 588 1 ASN Q 40 ? ? 59.63 19.54 589 1 ALA Q 44 ? ? -157.09 -50.95 590 1 LEU Q 46 ? ? 70.20 -57.91 591 1 LYS Q 49 ? ? -69.80 4.01 592 1 GLU Q 52 ? ? -140.10 -36.70 593 1 ASN Q 57 ? ? 66.39 -5.43 594 1 GLU Q 59 ? ? -84.21 -73.64 595 1 ASN Q 61 ? ? 67.43 119.64 596 1 ASP Q 62 ? ? 70.95 43.50 597 1 ILE Q 85 ? ? -107.80 71.89 598 1 PRO Q 87 ? ? -67.79 99.56 599 1 ALA Q 89 ? ? 65.92 148.57 600 1 ARG Q 92 ? ? 178.66 168.92 601 1 SER Q 101 ? ? -170.39 138.95 602 1 VAL Q 107 ? ? -114.94 77.73 603 1 LYS R 9 ? ? -134.87 -35.20 604 1 LEU R 11 ? ? 178.09 164.57 605 1 ARG R 12 ? ? -137.94 -106.09 606 1 HIS R 15 ? ? 174.45 -158.77 607 1 SER R 17 ? ? -67.32 -145.68 608 1 LYS R 19 ? ? 123.10 -62.70 609 1 MET R 24 ? ? 71.18 -11.04 610 1 LYS R 26 ? ? -138.30 -30.82 611 1 ASN R 28 ? ? -66.40 91.36 612 1 LEU R 32 ? ? -179.67 134.27 613 1 THR R 39 ? ? -80.24 -129.53 614 1 LYS R 44 ? ? 176.98 31.84 615 1 ALA R 45 ? ? 167.18 126.91 616 1 ALA R 46 ? ? 91.89 14.35 617 1 GLN R 48 ? ? 71.32 -14.55 618 1 GLU R 56 ? ? -107.80 -92.60 619 1 LYS R 64 ? ? 178.18 137.25 620 1 LYS R 66 ? ? -174.97 -166.57 621 1 LYS R 68 ? ? 77.44 -144.32 622 1 ARG R 69 ? ? 83.44 -19.62 623 1 HIS R 70 ? ? -138.36 -140.05 624 1 ARG R 73 ? ? -124.11 -153.20 625 1 ARG R 76 ? ? 9.41 87.46 626 1 ASP R 79 ? ? -71.75 -168.29 627 1 LEU R 87 ? ? -69.24 -110.27 628 1 GLU R 89 ? ? -60.01 86.79 629 1 LEU R 93 ? ? 45.62 -11.43 630 1 ASP R 94 ? ? 83.04 19.06 631 1 PHE R 95 ? ? -170.14 -82.93 632 1 LEU S 13 ? ? -144.14 -17.53 633 1 ASN S 26 ? ? 169.68 150.90 634 1 LYS S 42 ? 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