data_2GYC # _entry.id 2GYC # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 2GYC RCSB RCSB037699 WWPDB D_1000037699 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2014-12-10 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 4V4W _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 2GYC _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ;This entry with other split entries have been consolidated into a combined file for complete representation. 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2006 MOCEFL US 1097-2765 2168 ? 16713583 10.1016/j.molcel.2006.05.003 1 'Structure of the E. coli protein-conducting channel bound to a translating ribosome' Nature 438 318 324 2005 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? ? ? 2 'Locking and unlocking of ribosomal motions' 'Cell(Cambridge,Mass.)' 114 123 134 2003 CELLB5 US 0092-8674 0998 ? ? ? 3 'A model for co-translational translocation: ribosome-regulated nascent polypeptide translocation at the protein-conducting channel' 'FEBS Lett.' 580 3353 3360 2006 FEBLAL NE 0014-5793 0165 ? 16714018 10.1016/j.febslet.2006.05.019 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Mitra, K.' 1 primary 'Schaffitzel, C.' 2 primary 'Fabiola, F.' 3 primary 'Chapman, M.S.' 4 primary 'Ban, N.' 5 primary 'Frank, J.' 6 1 'Mitra, K.' 7 1 'Schaffitzel, C.' 8 1 'Shaikh, T.' 9 1 'Tama, F.' 10 1 'Jenni, S.' 11 1 'Brooks III, C.L.' 12 1 'Ban, N.' 13 1 'Frank, J.' 14 2 'Valle, M.' 15 2 'Zavialov, A.V.' 16 2 'Sengupta, J.' 17 2 'Rawat, U.' 18 2 'Ehrenberg, M.' 19 2 'Frank, J.' 20 3 'Mitra, K.' 21 3 'Frank, J.' 22 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '23S ribosomal RNA' 888503.500 1 ? ? ? ? 2 polymer nat '5S ribosomal RNA' 34916.805 1 ? ? ? ? 3 polymer nat '50S ribosomal protein L1' 23591.266 1 ? ? ? ? 4 polymer nat '50S ribosomal protein L7/L12' 12090.882 2 ? ? ? ? 5 polymer nat '50S ribosomal protein L2' 24691.252 1 ? ? ? ? 6 polymer nat '50S ribosomal protein L3' 22277.535 1 ? ? ? ? 7 polymer nat '50S ribosomal protein L4' 21806.133 1 ? ? ? ? 8 polymer nat '50S ribosomal protein L5' 20131.338 1 ? ? ? ? 9 polymer nat '50S ribosomal protein L6' 17799.383 1 ? ? ? ? 10 polymer nat '50S ribosomal protein L9' 15789.020 1 ? ? ? ? 11 polymer nat '50S ribosomal protein L11' 14577.000 1 ? ? ? ? 12 polymer nat '50S ribosomal protein 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polyribonucleotide no no ;GGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGG GUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGAACUGCC ; ;GGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGG GUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGAACUGCC ; 9 ? 3 'polypeptide(L)' no no ;KRMRVIREKVDATKQYDINEAIALLKELATAKFVESVDVAVNLGIDARKSDQNVRGATVLPHGTGRSVRVAVFTQGANAE AAKAAGAELVGMEDLADQIKKGEMNFDVVIASPDAMRVVGQLGQVLGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKAGQVRYRN DKNGIIHTTIGKVDFDADKLKENLEALLVALKKAKPTQAKGVYIKKVSISTTMGAGVAVDQA ; ;KRMRVIREKVDATKQYDINEAIALLKELATAKFVESVDVAVNLGIDARKSDQNVRGATVLPHGTGRSVRVAVFTQGANAE AAKAAGAELVGMEDLADQIKKGEMNFDVVIASPDAMRVVGQLGQVLGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKAGQVRYRN DKNGIIHTTIGKVDFDADKLKENLEALLVALKKAKPTQAKGVYIKKVSISTTMGAGVAVDQA ; 2 ? 4 'polypeptide(L)' no no ;ITKDQIIEAVAAMSVMDVVELISAMEEKFGVSAAAAVAVAAGPVEAAEEKTEFDVILKAAGANKVAVIKAVRGATGLGLK EAKDLVESAPAALKEGVSKDDAEALKKALEEAGAEVEVK ; ;ITKDQIIEAVAAMSVMDVVELISAMEEKFGVSAAAAVAVAAGPVEAAEEKTEFDVILKAAGANKVAVIKAVRGATGLGLK 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KLQLVGVGYRAAVKGNVINLSLGFSHPVDHQLPAGITAECPTQTEIVLKGADKQVIGQVAADLRAYRRPEPYKGKGVRYA DEVVRTK ; ;KAPVVVPAGVDVKINGQVITIKGKNGELTRTLNDAVEVKHADNTLTFGPRDGYADGWAQAGTARALLNSMVIGVTEGFTK KLQLVGVGYRAAVKGNVINLSLGFSHPVDHQLPAGITAECPTQTEIVLKGADKQVIGQVAADLRAYRRPEPYKGKGVRYA DEVVRTK ; E ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTI ASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE ; ;MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTI ASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE ; F ? 11 'polypeptide(L)' no no ;KKVQAYVKLQVAAGMANPSPPVGPALGQQGVNIMEFCKAFNAKTDSIEKGLPIPVVITVYADRSFTFVTKTPPAAVLLKK AAGIKSGSGKPNKDKVGKISRAQLQEIAQTKAADMTGADIEAMTRSIEGTARSMGLVVE ; ;KKVQAYVKLQVAAGMANPSPPVGPALGQQGVNIMEFCKAFNAKTDSIEKGLPIPVVITVYADRSFTFVTKTPPAAVLLKK AAGIKSGSGKPNKDKVGKISRAQLQEIAQTKAADMTGADIEAMTRSIEGTARSMGLVVE ; G ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; ;MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGH IGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI ; H ? 13 'polypeptide(L)' no no ;IQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFDG NACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL ; ;IQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFDG NACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL ; I ? 14 'polypeptide(L)' no no ;NTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSDLA KVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIE ; ;NTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSDLA KVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIE ; J ? 15 'polypeptide(L)' no no ;QPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAVRM GKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTK ; ;QPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAVRM GKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTK ; K ? 16 'polypeptide(L)' no no ;HRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLFNE LGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELV ; ;HRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLFNE LGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELV ; L ? 17 'polypeptide(L)' no no ;KKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERA LEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGL ; ;KKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERA LEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGL ; M ? 18 'polypeptide(L)' no no ;SNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVV DSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; ;SNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVV DSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN ; N ? 19 'polypeptide(L)' no no ;RVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFING LKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAAL ; ;RVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFING LKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAAL ; O ? 20 'polypeptide(L)' no no ;AKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGPSMKR IMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; ;AKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGPSMKR IMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR ; Q ? 21 'polypeptide(L)' no no ;LLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDWKKAYVT LKEGQNLDFVGG ; ;LLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDWKKAYVT LKEGQNLDFVGG ; R ? 22 'polypeptide(L)' no no ;KIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKADRV GFRFEDGKKVRFFKSNSET ; ;KIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKADRV GFRFEDGKKVRFFKSNSET ; S ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; ;MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRH PYKPKLQHIDFVRA ; T ? 24 'polypeptide(L)' no no ;AHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFIS IEAE ; ;AHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFIS IEAE ; U ? 25 'polypeptide(L)' no no MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEK MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEK W ? 26 'polypeptide(L)' no no TIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE TIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE X ? 27 'polypeptide(L)' no no LSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIA LSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIA Z ? 28 'polypeptide(L)' no no AKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK AKGIREKIKLVSSAGTGHFYTTTKNKRTKPEKLELKKFDPVVRQHVIYKEAK 1 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 C n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 A n 1 5 C n 1 6 A n 1 7 C n 1 8 G n 1 9 G n 1 10 U n 1 11 G n 1 12 G n 1 13 A n 1 14 U n 1 15 G n 1 16 C n 1 17 C n 1 18 C n 1 19 U n 1 20 G n 1 21 G n 1 22 C n 1 23 A n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 C n 1 27 A n 1 28 A n 1 29 G n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 G n 1 33 A n 1 34 U n 1 35 G n 1 36 A n 1 37 A n 1 38 G n 1 39 G n 1 40 A n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 U n 1 44 G n 1 45 C n 1 46 U n 1 47 A n 1 48 A n 1 49 U n 1 50 C n 1 51 U n 1 52 G n 1 53 C n 1 54 G n 1 55 A n 1 56 U n 1 57 A n 1 58 A n 1 59 G n 1 60 C n 1 61 G n 1 62 U n 1 63 C n 1 64 G n 1 65 G n 1 66 U n 1 67 A n 1 68 A n 1 69 G n 1 70 G n 1 71 U n 1 72 G n 1 73 A n 1 74 U n 1 75 A n 1 76 U n 1 77 G n 1 78 A n 1 79 A n 1 80 C n 1 81 C n 1 82 G n 1 83 U n 1 84 U n 1 85 U n 1 86 A n 1 87 A n 1 88 C n 1 89 C n 1 90 G n 1 91 G n 1 92 C n 1 93 G n 1 94 A n 1 95 U n 1 96 U n 1 97 U n 1 98 C n 1 99 C n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 A n 1 103 U n 1 104 G n 1 105 G n 1 106 G n 1 107 G n 1 108 A n 1 109 A n 1 110 C n 1 111 C n 1 112 C n 1 113 C n 1 114 G n 1 115 A n 1 116 U n 1 117 C n 1 118 A n 1 119 U n 1 120 U n 1 121 A n 1 122 U n 1 123 C n 1 124 C n 1 125 A n 1 126 A n 1 127 A n 1 128 U n 1 129 G n 1 130 A n 1 131 G n 1 132 G n 1 133 C n 1 134 G n 1 135 A n 1 136 A n 1 137 C n 1 138 C n 1 139 G n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 G n 1 143 G n 1 144 A n 1 145 A n 1 146 C n 1 147 U n 1 148 G n 1 149 A n 1 150 A n 1 151 A n 1 152 C n 1 153 A n 1 154 U n 1 155 C n 1 156 U n 1 157 A n 1 158 A n 1 159 G n 1 160 U n 1 161 A n 1 162 C n 1 163 C n 1 164 C n 1 165 C n 1 166 G n 1 167 A n 1 168 G n 1 169 G n 1 170 A n 1 171 A n 1 172 A n 1 173 A n 1 174 G n 1 175 A n 1 176 A n 1 177 A n 1 178 U n 1 179 C n 1 180 A n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 C n 1 184 G n 1 185 A n 1 186 G n 1 187 A n 1 188 U n 1 189 U n 1 190 C n 1 191 C n 1 192 C n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 A n 1 196 G n 1 197 U n 1 198 A n 1 199 G n 1 200 C n 1 201 G n 1 202 G n 1 203 C n 1 204 G n 1 205 A n 1 206 G n 1 207 C n 1 208 G n 1 209 A n 1 210 A n 1 211 C n 1 212 G n 1 213 G n 1 214 G n 1 215 G n 1 216 A n 1 217 G n 1 218 C n 1 219 A n 1 220 G n 1 221 C n 1 222 C n 1 223 C n 1 224 G n 1 225 A n 1 226 G n 1 227 C n 1 228 C n 1 229 U n 1 230 A n 1 231 A n 1 232 U n 1 233 C n 1 234 A n 1 235 G n 1 236 U n 1 237 G n 1 238 U n 1 239 G n 1 240 U n 1 241 G n 1 242 U n 1 243 G n 1 244 U n 1 245 U n 1 246 G n 1 247 U n 1 248 G n 1 249 G n 1 250 A n 1 251 A n 1 252 G n 1 253 C n 1 254 G n 1 255 U n 1 256 C n 1 257 U n 1 258 G n 1 259 G n 1 260 A n 1 261 A n 1 262 A n 1 263 G n 1 264 G n 1 265 C n 1 266 G n 1 267 C n 1 268 G n 1 269 C n 1 270 G n 1 271 A n 1 272 U n 1 273 A n 1 274 C n 1 275 A n 1 276 G n 1 277 G n 1 278 G n 1 279 U n 1 280 G n 1 281 A n 1 282 C n 1 283 A n 1 284 G n 1 285 C n 1 286 C n 1 287 C n 1 288 C n 1 289 G n 1 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B C 25 O2 ? ? ? 1_555 B A 52 N6 ? ? 9 C 30 9 A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? hydrog1522 hydrog ? ? B C 26 O2 ? ? ? 1_555 B A 48 N6 ? ? 9 C 31 9 A 53 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-A MISPAIR' ? ? hydrog1523 hydrog ? ? B U 27 N3 ? ? ? 1_555 B A 45 N1 ? ? 9 U 32 9 A 50 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog1524 hydrog ? ? B G 28 N2 ? ? ? 1_555 B C 44 O2 ? ? 9 G 33 9 C 49 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1525 hydrog ? ? B A 34 N3 ? ? ? 1_555 B A 41 N6 ? ? 9 A 39 9 A 46 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog1526 hydrog ? ? B U 35 O2 ? ? ? 1_555 B A 40 N6 ? ? 9 U 40 9 A 45 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog1527 hydrog ? ? B G 39 N2 ? ? ? 1_555 B C 42 O2 ? ? 9 G 44 9 C 47 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1528 hydrog ? ? B U 50 O2 ? ? ? 1_555 B A 52 N6 ? ? 9 U 55 9 A 57 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog1529 hydrog ? ? B G 62 N7 ? ? ? 1_555 B A 102 N6 ? ? 9 G 67 9 A 108 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog1530 hydrog ? ? B G 64 O6 ? ? ? 1_555 B G 101 N2 ? ? 9 G 69 9 G 106 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? hydrog1531 hydrog ? ? B C 66 O2 ? ? ? 1_555 B G 100 N2 ? ? 9 C 71 9 G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? hydrog1532 hydrog ? ? B G 67 N1 ? ? ? 1_555 B A 99 N1 ? ? 9 G 72 9 A 104 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog1533 hydrog ? ? B U 69 O4 ? ? ? 1_555 B G 97 N2 ? ? 9 U 74 9 G 102 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog1534 hydrog ? ? B G 70 N1 ? ? ? 1_555 B A 96 N1 ? ? 9 G 75 9 A 101 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog1535 hydrog ? ? B G 71 N3 ? ? ? 1_555 B G 95 N2 ? ? 9 G 76 9 G 100 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-G MISPAIR' ? ? hydrog1536 hydrog ? ? B G 71 N2 ? ? ? 1_555 B A 96 N1 ? ? 9 G 76 9 A 101 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog1537 hydrog ? ? B A 73 N6 ? ? ? 1_555 B G 93 N3 ? ? 9 A 78 9 G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? hydrog1538 hydrog ? ? B G 74 N1 ? ? ? 1_555 B C 92 O2 ? ? 9 G 79 9 C 97 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1539 hydrog ? ? B U 75 O2 ? ? ? 1_555 B G 91 N1 ? ? 9 U 80 9 G 96 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? hydrog1540 hydrog ? ? B G 76 O6 ? ? ? 1_555 B A 89 N6 ? ? 9 G 81 9 A 94 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-A MISPAIR' ? ? hydrog1541 hydrog ? ? B G 76 N1 ? ? ? 1_555 B U 90 O2 ? ? 9 G 81 9 U 95 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog1542 hydrog ? ? B G 76 O6 ? ? ? 1_555 B U 90 N3 ? ? 9 G 81 9 U 95 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog1543 hydrog ? ? B G 78 N1 ? ? ? 1_555 B C 88 O2 ? ? 9 G 83 9 C 93 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1544 hydrog ? ? B G 79 N1 ? ? ? 1_555 B C 87 O2 ? ? 9 G 84 9 C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1545 hydrog ? ? B G 80 N1 ? ? ? 1_555 B C 86 O2 ? ? 9 G 85 9 C 91 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-C PAIR' ? ? hydrog1546 hydrog ? ? B G 81 N1 ? ? ? 1_555 B C 85 N3 ? ? 9 G 86 9 C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1547 hydrog ? ? B G 81 N2 ? ? ? 1_555 B C 85 O2 ? ? 9 G 86 9 C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1548 hydrog ? ? B G 81 O6 ? ? ? 1_555 B C 85 N4 ? ? 9 G 86 9 C 90 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 151 G . ? THR 151 B PRO 152 G ? PRO 152 B 1 -0.18 2 VAL 26 I . ? VAL 27 D PRO 27 I ? PRO 28 D 1 -0.04 3 VAL 106 I . ? 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PHE PHE 1 . n CA 28 20 TYR 20 20 20 TYR TYR 1 . n CA 28 21 THR 21 21 21 THR THR 1 . n CA 28 22 THR 22 22 22 THR THR 1 . n CA 28 23 THR 23 23 23 THR THR 1 . n CA 28 24 LYS 24 24 24 LYS LYS 1 . n CA 28 25 ASN 25 25 25 ASN ASN 1 . n CA 28 26 LYS 26 26 26 LYS LYS 1 . n CA 28 27 ARG 27 27 27 ARG ARG 1 . n CA 28 28 THR 28 28 28 THR THR 1 . n CA 28 29 LYS 29 29 29 LYS LYS 1 . n CA 28 30 PRO 30 30 30 PRO PRO 1 . n CA 28 31 GLU 31 31 31 GLU GLU 1 . n CA 28 32 LYS 32 32 32 LYS LYS 1 . n CA 28 33 LEU 33 33 33 LEU LEU 1 . n CA 28 34 GLU 34 34 34 GLU GLU 1 . n CA 28 35 LEU 35 35 35 LEU LEU 1 . n CA 28 36 LYS 36 36 36 LYS LYS 1 . n CA 28 37 LYS 37 37 37 LYS LYS 1 . n CA 28 38 PHE 38 38 38 PHE PHE 1 . n CA 28 39 ASP 39 39 39 ASP ASP 1 . n CA 28 40 PRO 40 40 40 PRO PRO 1 . n CA 28 41 VAL 41 41 41 VAL VAL 1 . n CA 28 42 VAL 42 42 42 VAL VAL 1 . n CA 28 43 ARG 43 43 43 ARG ARG 1 . n CA 28 44 GLN 44 44 44 GLN GLN 1 . n CA 28 45 HIS 45 45 45 HIS HIS 1 . n CA 28 46 VAL 46 46 46 VAL VAL 1 . n CA 28 47 ILE 47 47 47 ILE ILE 1 . n CA 28 48 TYR 48 48 48 TYR TYR 1 . n CA 28 49 LYS 49 49 49 LYS LYS 1 . n CA 28 50 GLU 50 50 50 GLU GLU 1 . n CA 28 51 ALA 51 51 51 ALA ALA 1 . n CA 28 52 LYS 52 52 52 LYS LYS 1 . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 29-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 29 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 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'Initial release' ? 2 4 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 400 ;COMPOUND THIS FILE, 2GYC, CONTAINS THE 50S SUBUNIT OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX. THE ENTIRE CRYO-EM STRUCTURE CONTAINS ONE 70S RIBOSOME AND ARE DEPOSITED UNDER 2GYB (30S SUBUNIT) AND 2GYC (50S SUBUNIT). ; 999 ;SEQUENCE THIS PDB FILE WAS OBTAINED UPON RIGID BODY REFINEMENT OF A STARTING PDB FILE INTO A CRYO-EM MAP. THE E. COLI RIBOSOMES ARE OBTAINED NATURALLY, BUT FOR THE MODELING OF THE PROTEINS INTO THE EM MAP AUTHORS SOMETIMES DID NOT MODEL IN THE ENTIRE PROTEIN. SOME RESIDUES ARE NOT WITHIN LINK DISTANCES FOR C-N BOND. ; # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 2GYC _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.ref_protocol 'CNS implementation of RSRef' _em_3d_fitting.target_criteria 'Minimization of number of poor van der Waals contacts and maximation of correlation coefficient' _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.method ? _em_3d_fitting.details ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 2GYC _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.method '3D projection matching; conjugate gradients with regularization' _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 3.59 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 3.59 _em_3d_reconstruction.resolution 15 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration TMV _em_3d_reconstruction.details ;WITH THE USE OF APPROPRIATE STEREOCHEMICAL CONSTRAINTS, AN ATOMIC MODEL FITTED INTO AN EM MAP YIELDS AN ACCURACY OF 5-FOLD BETTER THAN THE NOMINAL RESOLUTION OF THE EM MAP. THE RESOLUTION OF THE ATOMIC MODEL FITTED INTO EMD-1143 (11.0 ANGSTROMS AT FSC 3SIGMA, 15.0 ANGSTROMS AT FSC 0.5) IS THUS ESTIMATED TO BE BETWEEN 2-3 ANGSTROMS. REAL-SPACE REFINEMENT USING RIGID BODIES INTO EM MAP EMD-1143. RIGID BODY DEFINITION: AN AUTONOMOUS SECONDARY STRUCTURE UNIT (E.G. HELIX SEGMENT, HAIRPIN) OF THE RIBOSOMAL RNA; AN AUTONOMOUS RIBOSOMAL PROTEIN DOMAIN. THE ATOMIC MODEL USED WAS GENERATED FROM E. COLI MODELS OF X-RAY CRYSTALLOGRAPHY STRUCTURES OF RIBOSOMES FROM OTHER ORGANISMS. IN THE ABSENCE OF E. COLI MODELS, STRUCTURES WERE DERIVED DIRECTLY FROM THE X-RAY CRYSTALLOGRAPHY STRUCTURES OF RIBOSOMES FROM OTHER ORGANISMS. RESOLUTION for FSC 3SIGMA (ANGSTROMS) is 11.000, RESOLUTION for FSC 0.5 (ANGSTROMS) is 15.000. ; _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles ? _em_3d_reconstruction.symmetry_type ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id ? _em_buffer.name ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.details ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 ? '30S ribosomal protein L1' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 2 ? '30S ribosomal protein L7/L12' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 3 ? '30S ribosomal protein L2' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 4 ? '30S ribosomal protein L3' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 5 ? '30S ribosomal protein L4' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 6 ? '30S ribosomal protein L5' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 7 ? '30S ribosomal protein L6' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 8 ? '30S ribosomal protein L9' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 9 ? '30S ribosomal protein L11' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 10 ? '30S ribosomal protein L13' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 11 ? '30S ribosomal protein L14' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 12 ? '30S ribosomal protein L15' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 13 ? '30S ribosomal protein L16' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 14 ? '30S ribosomal protein L17' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 15 ? '30S ribosomal protein L18' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 16 ? '30S ribosomal protein L19' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 17 ? '30S ribosomal protein L20' 'structural constituent of ribosome' ? ? ? 18 ? 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? -153.72 -141.29 207 1 GLU D 93 ? ? 179.83 2.01 208 1 MET D 95 ? ? -66.37 73.45 209 1 TRP D 96 ? ? -159.52 -33.27 210 1 THR D 104 ? ? -162.89 -58.92 211 1 ALA D 106 ? ? 65.81 -15.41 212 1 ARG D 109 ? ? -174.60 53.05 213 1 ILE D 110 ? ? -105.91 -92.94 214 1 ARG D 111 ? ? -168.64 -29.46 215 1 ASP D 112 ? ? -157.84 53.80 216 1 ARG D 114 ? ? -81.63 -99.78 217 1 LYS D 119 ? ? -64.46 98.15 218 1 SER D 120 ? ? -56.59 -86.17 219 1 ASP D 122 ? ? -132.64 -61.40 220 1 ARG D 124 ? ? -147.51 -156.94 221 1 TYR D 127 ? ? -69.77 -135.84 222 1 SER D 128 ? ? -162.97 -161.89 223 1 MET D 129 ? ? -174.71 -176.22 224 1 LYS D 144 ? ? 172.41 -8.80 225 1 ARG D 147 ? ? 61.53 95.50 226 1 ASP D 152 ? ? -69.16 -169.89 227 1 THR D 158 ? ? -113.51 64.54 228 1 GLU D 164 ? ? 66.63 -11.42 229 1 ARG D 166 ? ? 63.80 -11.90 230 1 PHE D 172 ? ? -169.67 -28.79 231 1 PHE D 176 ? ? 176.63 81.98 232 1 ALA E 39 ? ? -81.00 45.89 233 1 ASN E 47 ? ? -145.02 -0.25 234 1 PRO E 53 ? ? -61.46 -167.12 235 1 ASN E 100 ? ? -105.14 -72.09 236 1 LEU E 106 ? ? 59.20 5.04 237 1 ALA E 118 ? ? 49.35 -146.22 238 1 THR E 126 ? ? -69.12 76.18 239 1 GLN E 127 ? ? -160.03 -136.29 240 1 PRO E 153 ? ? -47.92 109.87 241 1 PRO E 155 ? ? -56.90 170.87 242 1 LYS E 159 ? ? -76.85 -163.14 243 1 ALA E 164 ? ? -46.42 105.18 244 1 ASP E 165 ? ? -173.40 131.53 245 1 ASP F 7 ? ? -85.12 -97.68 246 1 VAL F 9 ? ? -152.94 -52.11 247 1 ALA F 10 ? ? -159.23 63.81 248 1 ASN F 11 ? ? 77.02 -47.46 249 1 SER F 14 ? ? -80.22 42.21 250 1 LEU F 15 ? ? -110.40 -77.15 251 1 VAL F 21 ? ? -108.27 -166.22 252 1 PHE F 29 ? ? -122.34 -77.66 253 1 GLU F 76 ? ? 67.11 153.92 254 1 THR F 77 ? ? 50.96 153.79 255 1 VAL F 78 ? ? -151.92 70.84 256 1 VAL G 8 ? ? 175.57 140.63 257 1 LYS G 9 ? ? -171.74 143.30 258 1 ALA G 14 ? ? -58.35 96.20 259 1 ALA G 17 ? ? -163.35 -78.29 260 1 PRO G 19 ? ? -71.12 -155.58 261 1 VAL G 23 ? ? -66.40 80.98 262 1 MET G 35 ? ? -46.55 -74.95 263 1 GLU G 36 ? ? -82.46 -144.93 264 1 PHE G 37 ? ? 66.36 -30.98 265 1 THR G 45 ? ? -104.71 57.56 266 1 SER G 47 ? ? 176.74 -4.83 267 1 ILE G 48 ? ? -108.19 -153.35 268 1 PRO G 53 ? ? -64.28 77.62 269 1 THR G 59 ? ? -77.27 -133.46 270 1 VAL G 60 ? ? -140.05 -84.34 271 1 ALA G 62 ? ? -147.87 -11.12 272 1 ASP G 63 ? ? -135.85 -75.31 273 1 ARG G 64 ? ? -155.97 -38.90 274 1 SER G 65 ? ? -58.15 -162.42 275 1 PHE G 66 ? ? -148.20 -150.41 276 1 LYS G 71 ? ? -95.61 -154.44 277 1 ALA G 75 ? ? 109.55 140.59 278 1 ALA G 76 ? ? 72.50 -48.76 279 1 LEU G 78 ? ? 69.30 -24.71 280 1 ALA G 83 ? ? -158.89 58.07 281 1 ASN G 93 ? ? 114.75 -33.99 282 1 VAL G 97 ? ? -142.24 -29.26 283 1 GLN G 110 ? ? 69.53 -32.32 284 1 THR G 111 ? ? -87.03 31.79 285 1 LYS G 112 ? ? -165.48 6.69 286 1 ASP G 115 ? ? -141.89 -14.04 287 1 ASP G 120 ? ? 64.25 152.45 288 1 SER G 127 ? ? -161.47 -46.74 289 1 SER G 134 ? ? -156.20 18.64 290 1 MET G 135 ? ? -162.46 64.42 291 1 LEU G 137 ? ? 41.40 145.82 292 1 THR H 5 ? ? -115.67 -144.78 293 1 ALA H 6 ? ? -60.84 -175.98 294 1 PRO H 8 ? ? -76.86 -129.75 295 1 LYS H 12 ? ? 69.09 -1.47 296 1 ASP H 14 ? ? -72.50 -86.71 297 1 TRP H 15 ? ? 154.71 132.19 298 1 VAL H 17 ? ? 164.32 -157.41 299 1 VAL H 18 ? ? -149.53 -127.79 300 1 THR H 21 ? ? -63.44 91.99 301 1 LYS H 23 ? ? 156.28 164.28 302 1 GLU H 31 ? ? 63.66 164.52 303 1 LEU H 32 ? ? 67.10 -30.17 304 1 LEU H 36 ? ? -67.27 -109.28 305 1 LYS H 39 ? ? -54.25 -86.40 306 1 HIS H 40 ? ? -161.15 67.94 307 1 THR H 45 ? ? -64.86 -76.71 308 1 HIS H 47 ? ? 122.47 -46.78 309 1 ASP H 49 ? ? -58.03 177.25 310 1 THR H 50 ? ? -153.08 -84.81 311 1 ILE H 54 ? ? -120.78 -167.03 312 1 VAL H 62 ? ? -56.89 99.31 313 1 ASN H 67 ? ? -148.05 -51.83 314 1 ARG H 69 ? ? -127.25 -97.46 315 1 THR H 70 ? ? -78.61 29.70 316 1 HIS H 77 ? ? 167.92 162.83 317 1 GLU H 91 ? ? -65.78 3.69 318 1 ARG H 96 ? ? -67.05 -118.17 319 1 GLU H 98 ? ? -143.40 -44.21 320 1 ARG H 99 ? ? -118.54 59.64 321 1 VAL H 100 ? ? -133.08 -76.37 322 1 ILE H 101 ? ? -66.93 0.78 323 1 VAL H 105 ? ? 38.01 34.47 324 1 LYS H 106 ? ? -139.40 -37.39 325 1 LYS H 111 ? ? -159.00 49.30 326 1 PRO H 113 ? ? 27.76 126.67 327 1 LEU H 114 ? ? -59.02 36.28 328 1 MET H 118 ? ? -80.86 45.91 329 1 PHE H 119 ? ? -133.15 -41.13 330 1 LYS H 121 ? ? -48.02 -72.32 331 1 ASN H 128 ? ? -176.75 -126.93 332 1 GLN H 135 ? ? 59.98 174.47 333 1 GLN H 136 ? ? -171.68 31.99 334 1 PRO H 137 ? ? -61.21 -108.47 335 1 GLN H 138 ? ? -122.03 -159.86 336 1 GLN I 3 ? ? -128.61 -168.85 337 1 ASN I 13 ? ? -118.15 71.56 338 1 ARG I 17 ? ? -108.34 -63.03 339 1 ILE I 22 ? ? -97.46 -75.95 340 1 ARG I 30 ? ? -62.05 77.36 341 1 ARG I 31 ? ? 64.75 119.45 342 1 TYR I 32 ? ? -178.42 148.12 343 1 ALA I 33 ? ? -172.50 93.17 344 1 ILE I 43 ? ? -43.83 151.69 345 1 LYS I 44 ? ? -107.62 -63.20 346 1 ALA I 46 ? ? -173.66 -159.09 347 1 PRO I 48 ? ? -61.64 0.24 348 1 VAL I 52 ? ? -35.23 97.58 349 1 LYS I 53 ? ? -102.94 -62.44 350 1 ASP I 80 ? ? -69.84 -90.06 351 1 ASN I 90 ? ? -55.40 98.81 352 1 SER I 91 ? ? -10.43 97.80 353 1 GLU I 92 ? ? 50.37 79.75 354 1 GLU I 106 ? ? -59.20 -9.07 355 1 ARG I 108 ? ? -117.31 -107.91 356 1 SER I 109 ? ? -28.41 -78.05 357 1 LYS I 111 ? ? -99.45 -99.97 358 1 GLU J 10 ? ? 171.12 -171.53 359 1 SER J 12 ? ? -168.15 -95.15 360 1 LYS J 13 ? ? -97.07 -80.17 361 1 LYS J 14 ? ? -63.47 54.34 362 1 ARG J 18 ? ? -118.66 -127.92 363 1 LEU J 19 ? ? -107.82 -98.19 364 1 ARG J 21 ? ? -40.01 152.15 365 1 SER J 25 ? ? -123.00 -153.62 366 1 THR J 30 ? ? -130.45 -46.64 367 1 LYS J 36 ? ? -179.33 143.53 368 1 GLN J 38 ? ? 46.94 92.12 369 1 LYS J 39 ? ? 154.18 -176.01 370 1 ARG J 41 ? ? 53.82 -161.82 371 1 SER J 42 ? ? 53.47 -154.31 372 1 VAL J 46 ? ? -4.43 -75.05 373 1 PHE J 50 ? ? -50.14 174.88 374 1 GLU J 51 ? ? -142.18 -20.34 375 1 GLN J 54 ? ? -165.11 -129.93 376 1 LEU J 57 ? ? -143.96 -22.69 377 1 ARG J 60 ? ? -44.03 -84.66 378 1 LEU J 61 ? ? -150.29 60.33 379 1 PRO J 62 ? ? -72.59 -149.31 380 1 PHE J 64 ? ? -58.46 -175.41 381 1 ALA J 75 ? ? 67.38 66.14 382 1 ASP J 81 ? ? 59.93 179.48 383 1 LEU J 82 ? ? 59.55 -2.73 384 1 VAL J 89 ? ? -78.52 -161.11 385 1 VAL J 90 ? ? 34.40 90.29 386 1 ASN J 93 ? ? -59.92 82.93 387 1 THR J 94 ? ? 175.60 -30.18 388 1 ILE J 100 ? ? -77.93 28.06 389 1 ILE J 105 ? ? -85.93 -144.84 390 1 PHE J 107 ? ? 72.16 167.75 391 1 ALA J 108 ? ? -170.34 -142.35 392 1 LYS J 109 ? ? 179.00 160.39 393 1 LEU J 112 ? ? -46.10 88.38 394 1 VAL J 120 ? ? -36.33 154.18 395 1 ARG J 123 ? ? -74.45 -91.15 396 1 LEU J 125 ? ? 91.52 6.91 397 1 VAL J 127 ? ? -178.15 139.69 398 1 ALA J 134 ? ? 57.24 -174.54 399 1 ILE J 135 ? ? 29.79 37.84 400 1 GLU J 136 ? ? -159.82 -46.39 401 1 LYS K 5 ? ? -38.80 140.12 402 1 THR K 7 ? ? -151.75 -120.54 403 1 LYS K 8 ? ? -135.00 -114.16 404 1 ARG K 10 ? ? -131.95 -99.00 405 1 HIS K 13 ? ? -108.17 -147.54 406 1 ARG K 18 ? ? -105.21 -167.73 407 1 LEU K 20 ? ? -48.79 99.67 408 1 GLN K 22 ? ? 62.23 162.86 409 1 ASP K 25 ? ? -115.96 56.50 410 1 SER K 30 ? ? -145.92 49.32 411 1 PHE K 31 ? ? -101.58 -150.76 412 1 VAL K 57 ? ? -85.26 41.85 413 1 GLN K 60 ? ? -153.42 -141.51 414 1 LEU K 78 ? ? 118.72 -154.20 415 1 ALA K 79 ? ? -59.25 -118.64 416 1 VAL K 80 ? ? 160.08 126.68 417 1 ARG K 81 ? ? 156.44 12.04 418 1 MET K 82 ? ? -177.74 91.21 419 1 LYS K 84 ? ? -32.68 -79.56 420 1 ASN K 88 ? ? -104.32 -137.93 421 1 TYR K 91 ? ? -87.62 -155.86 422 1 LEU K 102 ? ? -93.04 -77.39 423 1 ASP K 106 ? ? -64.11 93.77 424 1 PRO K 109 ? ? -28.46 81.85 425 1 GLU K 110 ? ? -155.35 12.98 426 1 GLU K 111 ? ? -25.08 106.89 427 1 ILE K 126 ? ? 176.88 131.66 428 1 LYS L 5 ? ? -49.30 169.53 429 1 ARG L 8 ? ? -71.36 -166.60 430 1 ARG L 12 ? ? -114.30 -101.87 431 1 ASN L 13 ? ? -119.28 -136.74 432 1 MET L 20 ? ? 68.93 -49.46 433 1 ASN L 23 ? ? 70.16 150.32 434 1 LEU L 28 ? ? -95.39 31.51 435 1 VAL L 29 ? ? -149.06 -17.99 436 1 GLU L 32 ? ? -67.85 29.50 437 1 THR L 36 ? ? -110.05 -114.15 438 1 THR L 37 ? ? -138.30 -135.68 439 1 LYS L 40 ? ? 0.58 -123.00 440 1 GLU L 49 ? ? 70.81 78.68 441 1 LEU L 51 ? ? 126.58 -45.86 442 1 THR L 53 ? ? 69.77 145.44 443 1 ALA L 55 ? ? -160.03 5.07 444 1 LYS L 56 ? ? -67.12 -70.63 445 1 SER L 59 ? ? -175.75 -171.17 446 1 ALA L 61 ? ? -83.93 40.51 447 1 ASN L 62 ? ? -152.12 -53.54 448 1 ALA L 68 ? ? -148.90 -33.34 449 1 ASP L 72 ? ? -172.96 140.41 450 1 ILE L 75 ? ? -97.12 33.19 451 1 ASN L 81 ? ? 64.14 -7.58 452 1 PRO L 85 ? ? -62.24 95.26 453 1 ARG L 86 ? ? -160.01 -9.91 454 1 ALA L 88 ? ? -37.94 -94.76 455 1 TYR L 94 ? ? -40.70 -73.31 456 1 ILE L 97 ? ? -174.67 147.66 457 1 LYS L 99 ? ? -47.88 151.41 458 1 ALA L 104 ? ? -66.71 -174.53 459 1 ASN L 107 ? ? -53.86 106.45 460 1 ALA L 108 ? ? -164.50 110.65 461 1 ALA L 111 ? ? -79.27 -134.18 462 1 TYR L 112 ? ? -162.77 68.18 463 1 ILE L 113 ? ? 4.59 -68.49 464 1 GLU L 114 ? ? 54.98 160.06 465 1 THR M 12 ? ? 38.32 32.00 466 1 ALA M 23 ? ? -108.80 -153.02 467 1 PRO M 32 ? ? -59.73 6.31 468 1 ARG M 33 ? ? -131.38 -37.80 469 1 PRO M 42 ? ? -43.51 167.55 470 1 ASN M 43 ? ? 66.16 74.69 471 1 SER M 45 ? ? -109.19 68.72 472 1 ALA M 59 ? ? -71.63 -74.76 473 1 GLU M 60 ? ? 179.74 60.24 474 1 LYS M 63 ? ? -58.70 174.57 475 1 VAL M 90 ? ? -171.15 142.68 476 1 PHE M 97 ? ? 178.59 167.39 477 1 HIS M 100 ? ? 59.23 8.28 478 1 ILE N 3 ? ? -72.31 24.40 479 1 LEU N 7 ? ? -114.37 53.26 480 1 GLU N 8 ? ? -149.03 -7.90 481 1 GLU N 10 ? ? -82.99 -84.00 482 1 GLN N 14 ? ? -63.15 74.18 483 1 VAL N 16 ? ? -7.74 84.31 484 1 PRO N 17 ? ? -56.03 101.42 485 1 SER N 18 ? ? -32.01 128.89 486 1 PHE N 19 ? ? -27.57 -66.09 487 1 PRO N 21 ? ? -22.16 134.60 488 1 ASP N 23 ? ? 43.29 -137.22 489 1 VAL N 25 ? ? -39.13 132.08 490 1 VAL N 29 ? ? -64.03 -162.80 491 1 VAL N 31 ? ? 174.77 159.00 492 1 VAL N 32 ? ? -164.14 -0.12 493 1 SER N 35 ? ? 71.71 -37.37 494 1 LYS N 36 ? ? -132.92 -153.82 495 1 ARG N 38 ? ? -59.37 84.89 496 1 LEU N 39 ? ? -159.45 14.94 497 1 ALA N 41 ? ? -89.99 -152.97 498 1 VAL N 45 ? ? -170.72 132.74 499 1 ILE N 47 ? ? -122.57 -154.43 500 1 ALA N 48 ? ? -170.50 -135.49 501 1 ILE N 49 ? ? -97.00 -123.14 502 1 ASN N 51 ? ? -47.33 164.11 503 1 LEU N 54 ? ? -115.01 -148.73 504 1 HIS N 55 ? ? -82.23 -79.48 505 1 SER N 56 ? ? -52.74 -86.58 506 1 VAL N 60 ? ? -57.06 -96.95 507 1 ARG N 61 ? ? 174.01 -166.20 508 1 GLU N 70 ? ? -175.40 -114.26 509 1 ARG N 71 ? ? 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