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'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DT6 'D-saccharide, beta linking' . 2,4-bisacetamido-2,4-dideoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C10 H18 N2 O6' 262.260 GLA 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-galactopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MEA 'L-peptide linking' n N-METHYLPHENYLALANINE ? 'C10 H13 N O2' 179.216 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 OPE non-polymer . 'PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER' 'COLAMINE PHOSPHORIC ACID' 'C2 H8 N O4 P' 141.063 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2HIL _pdbx_nmr_refine.method ? _pdbx_nmr_refine.details ;The GC pilus filament structure was built by computationally fitting a single GC pilin subunit (2HI2.pdb) into a cryoEM density map of the pilus filament (EMDB code xxx) using the program CoAn (Volkmann and Hanein, J. Struct. Biol., 125, 176-184, 1999), and then applying the symmetry operators defined by the cryoEM reconstruction (10.5 Angstrom rise and a 100.8 degree azimuthal rotation, Craig et al., Mol. Cell xxx, yyy, 2006) to the subunit. ; _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_software.name CoAn _pdbx_nmr_software.version ? _pdbx_nmr_software.classification refinement _pdbx_nmr_software.authors ? _pdbx_nmr_software.ordinal 1 # _exptl.entry_id 2HIL _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.description ? _exptl_crystal.F_000 ? _exptl_crystal.preparation ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _refine.entry_id 2HIL _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high 12.5 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ;The GC pilus filament structure was built by computationally fitting a single GC pilin subunit (2HI2.pdb) into a cryoEM density map of the pilus filament (EMDB code xxx) using the program CoAn (Volkmann and Hanein, J. Struct. Biol., 125, 176-184, 1999), and then applying the symmetry operators defined by the cryoEM reconstruction (10.5 Angstrom rise and a 100.8 degree azimuthal rotation, Craig et al., Mol. Cell xxx, yyy, 2006) to the subunit. ; _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 21726 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 648 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 22374 _refine_hist.d_res_high 12.5 _refine_hist.d_res_low . # _struct.entry_id 2HIL _struct.title 'Structure of the Neisseria gonorrhoeae Type IV pilus filament from x-ray crystallography and electron cryomicroscopy' _struct.pdbx_descriptor 'Fimbrial protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2HIL _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL ADHESION' _struct_keywords.text 'TYPE IV PILI, virulence factors, DNA binding protein, natural transformation, antigenic variation, CELL ADHESION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 1 ? N N N 1 ? O N N 1 ? P N N 1 ? Q N N 1 ? R N N 1 ? S N N 2 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? Y N N 2 ? Z N N 2 ? AA N N 2 ? BA N N 2 ? CA N N 2 ? DA N N 2 ? EA N N 2 ? FA N N 2 ? GA N N 2 ? HA N N 2 ? IA N N 2 ? JA N N 2 ? KA N N 3 ? LA N N 3 ? MA N N 3 ? NA N N 3 ? OA N N 3 ? PA N N 3 ? QA N N 3 ? RA N N 3 ? SA N N 3 ? TA N N 3 ? UA N N 3 ? VA N N 3 ? WA N N 3 ? XA N N 3 ? YA N N 3 ? ZA N N 3 ? AB N N 3 ? BB N N 3 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ILE A 4 ? GLU A 41 ? ILE A 4 GLU A 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P2 2 GLN A 43 ? GLY A 55 ? GLN A 43 GLY A 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 3 ASN A 60 ? GLY A 65 ? ASN A 60 GLY A 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 4 SER A 69 ? LYS A 74 ? SER A 69 LYS A 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P5 5 ASP A 143 ? LEU A 147 ? ASP A 143 LEU A 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 6 PRO A 148 ? ARG A 152 ? PRO A 148 ARG A 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 7 ILE B 4 ? GLU B 41 ? ILE B 4 GLU B 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P8 8 GLN B 43 ? GLY B 55 ? GLN B 43 GLY B 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 9 ASN B 60 ? GLY B 65 ? ASN B 60 GLY B 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 10 SER B 69 ? LYS B 74 ? SER B 69 LYS B 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 ASP B 143 ? LEU B 147 ? ASP B 143 LEU B 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 12 PRO B 148 ? ARG B 152 ? PRO B 148 ARG B 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P13 13 ILE C 4 ? GLU C 41 ? ILE C 4 GLU C 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P14 14 GLN C 43 ? GLY C 55 ? GLN C 43 GLY C 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 15 ASN C 60 ? GLY C 65 ? ASN C 60 GLY C 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P16 16 SER C 69 ? LYS C 74 ? SER C 69 LYS C 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 ASP C 143 ? LEU C 147 ? ASP C 143 LEU C 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 18 PRO C 148 ? ARG C 152 ? PRO C 148 ARG C 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 ILE D 4 ? GLU D 41 ? ILE D 4 GLU D 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P20 20 GLN D 43 ? GLY D 55 ? GLN D 43 GLY D 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 21 ASN D 60 ? GLY D 65 ? ASN D 60 GLY D 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 22 SER D 69 ? LYS D 74 ? SER D 69 LYS D 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P23 23 ASP D 143 ? LEU D 147 ? ASP D 143 LEU D 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 PRO D 148 ? ARG D 152 ? PRO D 148 ARG D 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 25 ILE E 4 ? GLU E 41 ? ILE E 4 GLU E 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P26 26 GLN E 43 ? GLY E 55 ? GLN E 43 GLY E 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P27 27 ASN E 60 ? GLY E 65 ? ASN E 60 GLY E 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 28 SER E 69 ? LYS E 74 ? SER E 69 LYS E 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 ASP E 143 ? LEU E 147 ? ASP E 143 LEU E 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 PRO E 148 ? ARG E 152 ? PRO E 148 ARG E 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 ILE F 4 ? GLU F 41 ? ILE F 4 GLU F 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P32 32 GLN F 43 ? GLY F 55 ? GLN F 43 GLY F 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 33 ASN F 60 ? GLY F 65 ? ASN F 60 GLY F 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 34 SER F 69 ? LYS F 74 ? SER F 69 LYS F 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P35 35 ASP F 143 ? LEU F 147 ? ASP F 143 LEU F 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 36 PRO F 148 ? ARG F 152 ? PRO F 148 ARG F 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 37 ILE G 4 ? GLU G 41 ? ILE G 4 GLU G 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P38 38 GLN G 43 ? GLY G 55 ? GLN G 43 GLY G 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 39 ASN G 60 ? GLY G 65 ? ASN G 60 GLY G 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 SER G 69 ? LYS G 74 ? SER G 69 LYS G 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P41 41 ASP G 143 ? LEU G 147 ? ASP G 143 LEU G 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P42 42 PRO G 148 ? ARG G 152 ? PRO G 148 ARG G 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 43 ILE H 4 ? GLU H 41 ? ILE H 4 GLU H 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P44 44 GLN H 43 ? GLY H 55 ? GLN H 43 GLY H 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P45 45 ASN H 60 ? GLY H 65 ? ASN H 60 GLY H 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P46 46 SER H 69 ? LYS H 74 ? SER H 69 LYS H 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P47 47 ASP H 143 ? LEU H 147 ? ASP H 143 LEU H 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 PRO H 148 ? ARG H 152 ? PRO H 148 ARG H 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 ILE I 4 ? GLU I 41 ? ILE I 4 GLU I 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P50 50 GLN I 43 ? GLY I 55 ? GLN I 43 GLY I 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P51 51 ASN I 60 ? GLY I 65 ? ASN I 60 GLY I 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 52 SER I 69 ? LYS I 74 ? SER I 69 LYS I 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P53 53 ASP I 143 ? LEU I 147 ? ASP I 143 LEU I 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 54 PRO I 148 ? ARG I 152 ? PRO I 148 ARG I 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P55 55 ILE J 4 ? GLU J 41 ? ILE J 4 GLU J 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P56 56 GLN J 43 ? GLY J 55 ? GLN J 43 GLY J 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P57 57 ASN J 60 ? GLY J 65 ? ASN J 60 GLY J 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 58 SER J 69 ? LYS J 74 ? SER J 69 LYS J 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P59 59 ASP J 143 ? LEU J 147 ? ASP J 143 LEU J 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 60 PRO J 148 ? ARG J 152 ? PRO J 148 ARG J 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 61 ILE K 4 ? GLU K 41 ? ILE K 4 GLU K 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P62 62 GLN K 43 ? GLY K 55 ? GLN K 43 GLY K 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P63 63 ASN K 60 ? GLY K 65 ? ASN K 60 GLY K 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P64 64 SER K 69 ? LYS K 74 ? SER K 69 LYS K 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P65 65 ASP K 143 ? LEU K 147 ? ASP K 143 LEU K 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P66 66 PRO K 148 ? ARG K 152 ? PRO K 148 ARG K 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 67 ILE L 4 ? GLU L 41 ? ILE L 4 GLU L 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P68 68 GLN L 43 ? GLY L 55 ? GLN L 43 GLY L 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P69 69 ASN L 60 ? GLY L 65 ? ASN L 60 GLY L 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 70 SER L 69 ? LYS L 74 ? SER L 69 LYS L 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P71 71 ASP L 143 ? LEU L 147 ? ASP L 143 LEU L 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P72 72 PRO L 148 ? ARG L 152 ? PRO L 148 ARG L 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P73 73 ILE M 4 ? GLU M 41 ? ILE M 4 GLU M 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P74 74 GLN M 43 ? GLY M 55 ? GLN M 43 GLY M 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P75 75 ASN M 60 ? GLY M 65 ? ASN M 60 GLY M 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P76 76 SER M 69 ? LYS M 74 ? SER M 69 LYS M 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P77 77 ASP M 143 ? LEU M 147 ? ASP M 143 LEU M 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P78 78 PRO M 148 ? ARG M 152 ? PRO M 148 ARG M 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P79 79 ILE N 4 ? GLU N 41 ? ILE N 4 GLU N 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P80 80 GLN N 43 ? GLY N 55 ? GLN N 43 GLY N 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P81 81 ASN N 60 ? GLY N 65 ? ASN N 60 GLY N 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P82 82 SER N 69 ? LYS N 74 ? SER N 69 LYS N 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P83 83 ASP N 143 ? LEU N 147 ? ASP N 143 LEU N 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P84 84 PRO N 148 ? ARG N 152 ? PRO N 148 ARG N 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P85 85 ILE O 4 ? GLU O 41 ? ILE O 4 GLU O 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P86 86 GLN O 43 ? GLY O 55 ? GLN O 43 GLY O 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P87 87 ASN O 60 ? GLY O 65 ? ASN O 60 GLY O 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P88 88 SER O 69 ? LYS O 74 ? SER O 69 LYS O 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P89 89 ASP O 143 ? LEU O 147 ? ASP O 143 LEU O 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P90 90 PRO O 148 ? ARG O 152 ? PRO O 148 ARG O 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P91 91 ILE P 4 ? GLU P 41 ? ILE P 4 GLU P 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P92 92 GLN P 43 ? GLY P 55 ? GLN P 43 GLY P 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P93 93 ASN P 60 ? GLY P 65 ? ASN P 60 GLY P 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P94 94 SER P 69 ? LYS P 74 ? SER P 69 LYS P 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P95 95 ASP P 143 ? LEU P 147 ? ASP P 143 LEU P 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P96 96 PRO P 148 ? ARG P 152 ? PRO P 148 ARG P 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P97 97 ILE Q 4 ? GLU Q 41 ? ILE Q 4 GLU Q 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P98 98 GLN Q 43 ? GLY Q 55 ? GLN Q 43 GLY Q 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P99 99 ASN Q 60 ? GLY Q 65 ? ASN Q 60 GLY Q 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P100 100 SER Q 69 ? LYS Q 74 ? SER Q 69 LYS Q 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P101 101 ASP Q 143 ? LEU Q 147 ? ASP Q 143 LEU Q 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P102 102 PRO Q 148 ? ARG Q 152 ? PRO Q 148 ARG Q 152 5 ? 5 HELX_P HELX_P103 103 ILE R 4 ? GLU R 41 ? ILE R 4 GLU R 41 1 ? 38 HELX_P HELX_P104 104 GLN R 43 ? GLY R 55 ? GLN R 43 GLY R 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P105 105 ASN R 60 ? GLY R 65 ? ASN R 60 GLY R 65 1 ? 6 HELX_P HELX_P106 106 SER R 69 ? LYS R 74 ? SER R 69 LYS R 74 5 ? 6 HELX_P HELX_P107 107 ASP R 143 ? LEU R 147 ? ASP R 143 LEU R 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P108 108 PRO R 148 ? ARG R 152 ? PRO R 148 ARG R 152 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 121 SG ? ? ? 1_555 A CYS 151 SG ? ? A CYS 121 A CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 121 SG ? ? ? 1_555 B CYS 151 SG ? ? B CYS 121 B CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 121 SG ? ? ? 1_555 C CYS 151 SG ? ? C CYS 121 C CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 121 SG ? ? ? 1_555 D CYS 151 SG ? ? D CYS 121 D CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 121 SG ? ? ? 1_555 E CYS 151 SG ? ? E CYS 121 E CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf6 disulf ? ? F CYS 121 SG ? ? ? 1_555 F CYS 151 SG ? ? F CYS 121 F CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf7 disulf ? ? G CYS 121 SG ? ? ? 1_555 G CYS 151 SG ? ? G CYS 121 G CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf8 disulf ? ? H CYS 121 SG ? ? ? 1_555 H CYS 151 SG ? ? H CYS 121 H CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf9 disulf ? ? I CYS 121 SG ? ? ? 1_555 I CYS 151 SG ? ? I CYS 121 I CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf10 disulf ? ? J CYS 121 SG ? ? ? 1_555 J CYS 151 SG ? ? J CYS 121 J CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf11 disulf ? ? K CYS 121 SG ? ? ? 1_555 K CYS 151 SG ? ? K CYS 121 K CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? L CYS 121 SG ? ? ? 1_555 L CYS 151 SG ? ? L CYS 121 L CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf13 disulf ? ? M CYS 121 SG ? ? ? 1_555 M CYS 151 SG ? ? M CYS 121 M CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf14 disulf ? ? N CYS 121 SG ? ? ? 1_555 N CYS 151 SG ? ? N CYS 121 N CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf15 disulf ? ? O CYS 121 SG ? ? ? 1_555 O CYS 151 SG ? ? O CYS 121 O CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf16 disulf ? ? P CYS 121 SG ? ? ? 1_555 P CYS 151 SG ? ? P CYS 121 P CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? Q CYS 121 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 151 SG ? ? Q CYS 121 Q CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? R CYS 121 SG ? ? ? 1_555 R CYS 151 SG ? ? R CYS 121 R CYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale both ? A MEA 1 C ? ? ? 1_555 A THR 2 N ? ? A MEA 1 A THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale2 covale one ? A SER 63 OG ? ? ? 1_555 S DT6 . C1 ? ? A SER 63 S DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale3 covale none ? A SER 68 CB ? ? ? 1_555 KA OPE . O3 ? ? A SER 68 A OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale4 covale both ? B MEA 1 C ? ? ? 1_555 B THR 2 N ? ? B MEA 1 B THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale5 covale one ? B SER 63 OG ? ? ? 1_555 T DT6 . C1 ? ? B SER 63 T DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale6 covale none ? B SER 68 CB ? ? ? 1_555 LA OPE . O3 ? ? B SER 68 B OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale7 covale both ? C MEA 1 C ? ? ? 1_555 C THR 2 N ? ? C MEA 1 C THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale8 covale one ? C SER 63 OG ? ? ? 1_555 U DT6 . C1 ? ? C SER 63 U DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale9 covale none ? C SER 68 CB ? ? ? 1_555 MA OPE . O3 ? ? C SER 68 C OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale10 covale both ? D MEA 1 C ? ? ? 1_555 D THR 2 N ? ? D MEA 1 D THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale11 covale one ? D SER 63 OG ? ? ? 1_555 V DT6 . C1 ? ? D SER 63 V DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale12 covale none ? D SER 68 CB ? ? ? 1_555 NA OPE . O3 ? ? D SER 68 D OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale13 covale both ? E MEA 1 C ? ? ? 1_555 E THR 2 N ? ? E MEA 1 E THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale14 covale one ? E SER 63 OG ? ? ? 1_555 W DT6 . C1 ? ? E SER 63 W DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale15 covale none ? E SER 68 CB ? ? ? 1_555 OA OPE . O3 ? ? E SER 68 E OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale16 covale both ? F MEA 1 C ? ? ? 1_555 F THR 2 N ? ? F MEA 1 F THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale17 covale one ? F SER 63 OG ? ? ? 1_555 X DT6 . C1 ? ? F SER 63 X DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale18 covale none ? F SER 68 CB ? ? ? 1_555 PA OPE . O3 ? ? F SER 68 F OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale19 covale both ? G MEA 1 C ? ? ? 1_555 G THR 2 N ? ? G MEA 1 G THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale20 covale one ? G SER 63 OG ? ? ? 1_555 Y DT6 . C1 ? ? G SER 63 Y DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale21 covale none ? G SER 68 CB ? ? ? 1_555 QA OPE . O3 ? ? G SER 68 G OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale22 covale both ? H MEA 1 C ? ? ? 1_555 H THR 2 N ? ? H MEA 1 H THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale23 covale one ? H SER 63 OG ? ? ? 1_555 Z DT6 . C1 ? ? H SER 63 Z DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale24 covale none ? H SER 68 CB ? ? ? 1_555 RA OPE . O3 ? ? H SER 68 H OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale25 covale both ? I MEA 1 C ? ? ? 1_555 I THR 2 N ? ? I MEA 1 I THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale26 covale one ? I SER 63 OG ? ? ? 1_555 AA DT6 . C1 ? ? I SER 63 a DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale27 covale none ? I SER 68 CB ? ? ? 1_555 SA OPE . O3 ? ? I SER 68 I OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale28 covale both ? J MEA 1 C ? ? ? 1_555 J THR 2 N ? ? J MEA 1 J THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale29 covale one ? J SER 63 OG ? ? ? 1_555 BA DT6 . C1 ? ? J SER 63 b DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale30 covale none ? J SER 68 CB ? ? ? 1_555 TA OPE . O3 ? ? J SER 68 J OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale31 covale both ? K MEA 1 C ? ? ? 1_555 K THR 2 N ? ? K MEA 1 K THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale32 covale one ? K SER 63 OG ? ? ? 1_555 CA DT6 . C1 ? ? K SER 63 c DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale33 covale none ? K SER 68 CB ? ? ? 1_555 UA OPE . O3 ? ? K SER 68 K OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale34 covale both ? L MEA 1 C ? ? ? 1_555 L THR 2 N ? ? L MEA 1 L THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale35 covale one ? L SER 63 OG ? ? ? 1_555 DA DT6 . C1 ? ? L SER 63 d DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale36 covale none ? L SER 68 CB ? ? ? 1_555 VA OPE . O3 ? ? L SER 68 L OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale37 covale both ? M MEA 1 C ? ? ? 1_555 M THR 2 N ? ? M MEA 1 M THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale38 covale one ? M SER 63 OG ? ? ? 1_555 EA DT6 . C1 ? ? M SER 63 e DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale39 covale none ? M SER 68 CB ? ? ? 1_555 WA OPE . O3 ? ? M SER 68 M OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale40 covale both ? N MEA 1 C ? ? ? 1_555 N THR 2 N ? ? N MEA 1 N THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale41 covale one ? N SER 63 OG ? ? ? 1_555 FA DT6 . C1 ? ? N SER 63 f DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale42 covale none ? N SER 68 CB ? ? ? 1_555 XA OPE . O3 ? ? N SER 68 N OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale43 covale both ? O MEA 1 C ? ? ? 1_555 O THR 2 N ? ? O MEA 1 O THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale44 covale one ? O SER 63 OG ? ? ? 1_555 GA DT6 . C1 ? ? O SER 63 g DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale45 covale none ? O SER 68 CB ? ? ? 1_555 YA OPE . O3 ? ? O SER 68 O OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale46 covale both ? P MEA 1 C ? ? ? 1_555 P THR 2 N ? ? P MEA 1 P THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale47 covale one ? P SER 63 OG ? ? ? 1_555 HA DT6 . C1 ? ? P SER 63 h DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale48 covale none ? P SER 68 CB ? ? ? 1_555 ZA OPE . O3 ? ? P SER 68 P OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale49 covale both ? Q MEA 1 C ? ? ? 1_555 Q THR 2 N ? ? Q MEA 1 Q THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale50 covale one ? Q SER 63 OG ? ? ? 1_555 IA DT6 . C1 ? ? Q SER 63 i DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? ? covale51 covale none ? Q SER 68 CB ? ? ? 1_555 AB OPE . O3 ? ? Q SER 68 Q OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale52 covale both ? R MEA 1 C ? ? ? 1_555 R THR 2 N ? ? R MEA 1 R THR 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale53 covale one ? R SER 63 OG ? ? ? 1_555 JA DT6 . C1 ? ? R SER 63 j DT6 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? ? covale54 covale none ? R SER 68 CB ? ? ? 1_555 BB OPE . O3 ? ? R SER 68 R OPE 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale55 covale both ? S DT6 . O3 ? ? ? 1_555 S GLA . C1 ? ? S DT6 1 S GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale56 covale both ? T DT6 . O3 ? ? ? 1_555 T GLA . C1 ? ? T DT6 1 T GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale57 covale both ? U DT6 . O3 ? ? ? 1_555 U GLA . C1 ? ? U DT6 1 U GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale58 covale both ? V DT6 . O3 ? ? ? 1_555 V GLA . C1 ? ? V DT6 1 V GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale59 covale both ? W DT6 . O3 ? ? ? 1_555 W GLA . C1 ? ? W DT6 1 W GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale60 covale both ? X DT6 . O3 ? ? ? 1_555 X GLA . C1 ? ? X DT6 1 X GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale61 covale both ? Y DT6 . O3 ? ? ? 1_555 Y GLA . C1 ? ? Y DT6 1 Y GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale62 covale both ? Z DT6 . O3 ? ? ? 1_555 Z GLA . C1 ? ? Z DT6 1 Z GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? ? covale63 covale both ? AA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 AA GLA . C1 ? ? a DT6 1 a GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale64 covale both ? BA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 BA GLA . C1 ? ? b DT6 1 b GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale65 covale both ? CA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 CA GLA . C1 ? ? c DT6 1 c GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale66 covale both ? DA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 DA GLA . C1 ? ? d DT6 1 d GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale67 covale both ? EA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 EA GLA . C1 ? ? e DT6 1 e GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale68 covale both ? FA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 FA GLA . C1 ? ? f DT6 1 f GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale69 covale both ? GA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 GA GLA . C1 ? ? g DT6 1 g GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale70 covale both ? HA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 HA GLA . C1 ? ? h DT6 1 h GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale71 covale both ? IA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 IA GLA . C1 ? ? i DT6 1 i GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? covale72 covale both ? JA DT6 . O3 ? ? ? 1_555 JA GLA . C1 ? ? j DT6 1 j GLA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 4 ? B ? 2 ? C ? 4 ? D ? 2 ? E ? 4 ? F ? 2 ? G ? 4 ? H ? 2 ? I ? 4 ? J ? 2 ? K ? 4 ? L ? 2 ? M ? 4 ? N ? 2 ? O ? 4 ? P ? 2 ? Q ? 4 ? R ? 2 ? S ? 4 ? T ? 2 ? U ? 4 ? V ? 2 ? W ? 4 ? X ? 2 ? Y ? 4 ? Z ? 2 ? AA ? 4 ? AB ? 2 ? AC ? 4 ? AD ? 2 ? AE ? 4 ? AF ? 2 ? AG ? 4 ? AH ? 2 ? AI ? 4 ? 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LA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE B . MA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE C . NA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE D . OA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE E . PA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE F . QA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE G . RA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE H . SA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE I . TA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE J . UA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE K . VA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE L . WA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE M . XA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE N . YA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE O . ZA 3 OPE 1 824 824 OPE OPE P . AB 3 OPE 1 824 824 OPE OPE Q . BB 3 OPE 1 824 824 OPE OPE R . # loop_ _pdbx_struct_mod_residue.id _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.details 1 A SER 63 A SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 2 B SER 63 B SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 3 C SER 63 C SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 4 D SER 63 D SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 5 E SER 63 E SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 6 F SER 63 F SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 7 G SER 63 G SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 8 H SER 63 H SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 9 I SER 63 I SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 10 J SER 63 J SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 11 K SER 63 K SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 12 L SER 63 L SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 13 M SER 63 M SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 14 N SER 63 N SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 15 O SER 63 O SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 16 P SER 63 P SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 17 Q SER 63 Q SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 18 R SER 63 R SER 63 ? SER 'GLYCOSYLATION SITE' 19 A MEA 1 A MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 20 B MEA 1 B MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 21 C MEA 1 C MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 22 D MEA 1 D MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 23 E MEA 1 E MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 24 F MEA 1 F MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 25 G MEA 1 G MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 26 H MEA 1 H MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 27 I MEA 1 I MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 28 J MEA 1 J MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 29 K MEA 1 K MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 30 L MEA 1 L MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 31 M MEA 1 M MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 32 N MEA 1 N MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 33 O MEA 1 O MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 34 P MEA 1 P MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 35 Q MEA 1 Q MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE 36 R MEA 1 R MEA 1 ? PHE N-METHYLPHENYLALANINE # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2006-09-12 2 'Structure model' 1 1 2008-05-01 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2018-07-18 5 'Structure model' 2 0 2020-07-29 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 5 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Author supporting evidence' 4 4 'Structure model' 'Data collection' 5 5 'Structure model' 'Atomic model' 6 5 'Structure model' 'Data collection' 7 5 'Structure model' 'Derived calculations' 8 5 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' em_single_particle_entity 2 4 'Structure model' em_software 3 5 'Structure model' atom_site 4 5 'Structure model' chem_comp 5 5 'Structure model' entity 6 5 'Structure model' pdbx_branch_scheme 7 5 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 8 5 'Structure model' pdbx_entity_branch 9 5 'Structure model' pdbx_entity_branch_descriptor 10 5 'Structure model' pdbx_entity_branch_link 11 5 'Structure model' pdbx_entity_branch_list 12 5 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 13 5 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 14 5 'Structure model' pdbx_struct_assembly_gen 15 5 'Structure model' struct_asym 16 5 'Structure model' struct_conn 17 5 'Structure model' struct_site 18 5 'Structure model' struct_site_gen # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_em_software.image_processing_id' 2 5 'Structure model' '_atom_site.B_iso_or_equiv' 3 5 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 4 5 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 5 5 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 6 5 'Structure model' '_atom_site.auth_asym_id' 7 5 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 8 5 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 9 5 'Structure model' '_atom_site.auth_seq_id' 10 5 'Structure model' '_atom_site.label_asym_id' 11 5 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 12 5 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 13 5 'Structure model' '_atom_site.label_entity_id' 14 5 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 15 5 'Structure model' '_chem_comp.name' 16 5 'Structure model' '_chem_comp.type' 17 5 'Structure model' '_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list' 18 5 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_dist_value' 19 5 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 20 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id' 21 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 22 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 23 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 24 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 25 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 26 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 27 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id' 28 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 29 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 30 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 31 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 32 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 33 5 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_seq_id' # _pdbx_entry_details.entry_id 2HIL _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;ACCORDING TO AUTHORS THE RESIDUES HAVE BEEN CONFIRMED BY SEQUENCING THE PILE GENE THAT ENCODES THE GC PILIN SUBUNIT ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.entry_id 2HIL _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.target_criteria 'real-space density correlation coefficient' _em_3d_fitting.details 'METHOD--CoAn REFINEMENT PROTOCOL--rigid body' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 2HI2 _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 2HIL _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.symmetry_type HELICAL _em_3d_reconstruction.num_particles 25000 _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.method IHRSR _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size 2.23676682 _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size 2.23676682 _em_3d_reconstruction.resolution 12.5 _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.resolution_method ? _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.algorithm ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name '50 mM CHES' _em_buffer.pH 9.5 _em_buffer.details '50 mM CHES' # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.name 'N. gonorrhoeae Type IV pili' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.details ;native pili were sheared from N. gonorrhoeae cells and purified by successive rounds of precipitation in neutral pH buffer, which causes the filaments to aggregate, followed by resuspension in high pH buffer ; _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 2HIL _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.number_digital_images 12 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.entry_id 2HIL _em_imaging.id 1 _em_imaging.microscope_model 'FEI/PHILIPS CM200FEG' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.date 2004-06-23 _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.temperature 95 _em_imaging.nominal_defocus_min 1100 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.tilt_angle_min 0 _em_imaging.tilt_angle_max 0 _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_magnification 50000 _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.accelerating_voltage 120 _em_imaging.details ? _em_imaging.specimen_holder_type . _em_imaging.specimen_holder_model . _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details 'Quantifoil holey carbon grids, glow discharged with amyl amine' _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type ? _em_sample_support.method ? # _em_vitrification.entry_id 2HIL _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK I' _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;5 ul of sample were applied to grids for 1 minute, blotted for 2.5 seconds then plunge-frozen in liquid ethane using an FEI Vitrobot ; _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 2HIL _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state FILAMENT _em_experiment.entity_assembly_id 1 _em_experiment.reconstruction_method HELICAL # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OE1 A GLU 35 ? ? CD2 M LEU 6 ? ? 0.52 2 1 CD2 D LEU 6 ? ? OE1 H GLU 35 ? ? 0.52 3 1 OE1 N GLU 35 ? ? CD2 R LEU 6 ? ? 0.52 4 1 CD2 B LEU 6 ? ? OE1 F GLU 35 ? ? 0.52 5 1 CD2 C LEU 6 ? ? OE1 G GLU 35 ? ? 0.52 6 1 CD2 A LEU 6 ? ? OE1 E GLU 35 ? ? 0.52 7 1 OE1 B GLU 35 ? ? CD2 L LEU 6 ? ? 0.52 8 1 CD2 E LEU 6 ? ? OE1 I GLU 35 ? ? 0.52 9 1 OE1 M GLU 35 ? ? CD2 Q LEU 6 ? ? 0.52 10 1 OE1 J GLU 35 ? ? CD2 N LEU 6 ? ? 0.52 11 1 OE1 C GLU 35 ? ? CD2 K LEU 6 ? ? 0.52 12 1 OE1 D GLU 35 ? ? CD2 J LEU 6 ? ? 0.52 13 1 OE1 L GLU 35 ? ? CD2 P LEU 6 ? ? 0.52 14 1 OE1 K GLU 35 ? ? CD2 O LEU 6 ? ? 0.52 15 1 CG D GLN 25 ? ? C H GLY 115 ? ? 0.62 16 1 CG B GLN 25 ? ? C F GLY 115 ? ? 0.62 17 1 CG A GLN 25 ? ? C E GLY 115 ? ? 0.62 18 1 CG C GLN 25 ? ? C G GLY 115 ? ? 0.62 19 1 CG E GLN 25 ? ? C I GLY 115 ? ? 0.62 20 1 C M GLY 115 ? ? CG Q GLN 25 ? ? 0.62 21 1 C J GLY 115 ? ? CG N GLN 25 ? ? 0.62 22 1 C N GLY 115 ? ? CG R GLN 25 ? ? 0.62 23 1 C D GLY 115 ? ? CG J GLN 25 ? ? 0.62 24 1 C L GLY 115 ? ? 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CG M ASN 99 ? ? 1.43 164 1 NH2 N ARG 112 ? ? CG R ASN 99 ? ? 1.43 165 1 NH2 D ARG 112 ? ? CG J ASN 99 ? ? 1.43 166 1 NH2 B ARG 112 ? ? CG L ASN 99 ? ? 1.43 167 1 NH2 L ARG 112 ? ? CG P ASN 99 ? ? 1.43 168 1 NH2 M ARG 112 ? ? CG Q ASN 99 ? ? 1.43 169 1 CG A ASN 99 ? ? NH2 E ARG 112 ? ? 1.43 170 1 NH2 C ARG 112 ? ? CG K ASN 99 ? ? 1.43 171 1 CG E ASN 99 ? ? NH2 I ARG 112 ? ? 1.43 172 1 CG B ASN 99 ? ? NH2 F ARG 112 ? ? 1.43 173 1 CG C ASN 99 ? ? NH2 G ARG 112 ? ? 1.43 174 1 CG D ASN 99 ? ? NH2 H ARG 112 ? ? 1.43 175 1 CB D GLN 25 ? ? C H GLY 115 ? ? 1.45 176 1 CB B GLN 25 ? ? C F GLY 115 ? ? 1.45 177 1 CB E GLN 25 ? ? C I GLY 115 ? ? 1.45 178 1 CB C GLN 25 ? ? C G GLY 115 ? ? 1.46 179 1 CB A GLN 25 ? ? C E GLY 115 ? ? 1.46 180 1 C D GLY 115 ? ? CB J GLN 25 ? ? 1.46 181 1 C C GLY 115 ? ? CB K GLN 25 ? ? 1.46 182 1 C J GLY 115 ? ? CB N GLN 25 ? ? 1.46 183 1 C A GLY 115 ? ? CB M GLN 25 ? ? 1.46 184 1 C B GLY 115 ? ? CB L GLN 25 ? ? 1.46 185 1 C K GLY 115 ? ? 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