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'Embo J.' 26 1953 ? 2007 EMJODG UK 0261-4189 0897 ? 17347647 10.1038/SJ.EMBOJ.7601634 1 ;Improving Diffraction from 3A to 2A for a Complex between a Small Gtpase and its Effector by Analysis of Crystal Contacts and Use of Reverse Screening. ; 'Cryst. Growth Des.' 7 2140 ? 2007 ? 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ASN R 1041 LEU R 1063 1 ? 23 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? A THR 16 OG1 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A THR 31 A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.100 ? ? metalc2 metalc ? ? A THR 33 OG1 ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A THR 48 A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? ? metalc3 metalc ? ? M GTP . O2B ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A GTP 1181 A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? ? metalc4 metalc ? ? M GTP . O3G ? ? ? 1_555 N MG . MG ? ? A GTP 1181 A MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.070 ? ? metalc5 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? A MG 1182 A HOH 3074 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? ? metalc6 metalc ? ? N MG . MG ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? A MG 1182 A HOH 3188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? ? metalc7 metalc ? ? B THR 16 OG1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B THR 31 B MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? metalc8 metalc ? ? B THR 33 OG1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B THR 48 B MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? ? metalc9 metalc ? ? P GTP . O3G ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B GTP 1181 B MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? metalc10 metalc ? ? P GTP . O2B ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? B GTP 1181 B MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? ? metalc11 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? B MG 1182 B HOH 3033 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.180 ? ? metalc12 metalc ? ? Q MG . MG ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? B MG 1182 B HOH 3064 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? ? metalc13 metalc ? ? C THR 16 OG1 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C THR 31 C MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? ? metalc14 metalc ? ? C THR 33 OG1 ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C THR 48 C MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? ? metalc15 metalc ? ? S GTP . O3G ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C GTP 1181 C MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? ? metalc16 metalc ? ? S GTP . O2B ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? C GTP 1181 C MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? metalc17 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C MG 1182 C HOH 3036 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? ? metalc18 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? C MG 1182 C HOH 3060 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? ? metalc19 metalc ? ? D THR 16 OG1 ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D THR 31 D MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? ? metalc20 metalc ? ? D THR 33 OG1 ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D THR 48 D MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.152 ? ? metalc21 metalc ? ? V GTP . O2B ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D GTP 1181 D MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? metalc22 metalc ? ? V GTP . O3G ? ? ? 1_555 W MG . MG ? ? D GTP 1181 D MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? metalc23 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? D MG 1182 D HOH 3035 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.158 ? ? metalc24 metalc ? ? W MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? D MG 1182 D HOH 3063 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? ? metalc25 metalc ? ? E THR 16 OG1 ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? E THR 31 E MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc26 metalc ? ? E THR 33 OG1 ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? E THR 48 E MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.225 ? ? metalc27 metalc ? ? X GTP . O3G ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? E GTP 1181 E MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? ? metalc28 metalc ? ? X GTP . O2B ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? E GTP 1181 E MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? metalc29 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? E MG 1182 E HOH 3038 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? ? metalc30 metalc ? ? Y MG . MG ? ? ? 1_555 OA HOH . O ? ? E MG 1182 E HOH 3076 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? ? metalc31 metalc ? ? F THR 16 OG1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F THR 31 F MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? ? metalc32 metalc ? ? F THR 33 OG1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F THR 48 F MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? ? metalc33 metalc ? ? AA GTP . O3G ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F GTP 1181 F MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.080 ? ? metalc34 metalc ? ? AA GTP . O2B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? F GTP 1181 F MG 1182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? ? metalc35 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? F MG 1182 F HOH 3059 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? ? metalc36 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 PA HOH . O ? ? F MG 1182 F HOH 3157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 6 ? BA ? 6 ? CA ? 6 ? DA ? 6 ? EA ? 6 ? FA ? 6 ? MA ? 7 ? NA ? 7 ? OA ? 7 ? PA ? 7 ? QA ? 7 ? 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GLY D 87 ASP D 93 DA 5 VAL D 105 ? ASN D 111 ? VAL D 120 ASN D 126 DA 6 TRP D 138 ? ALA D 142 ? TRP D 153 ALA D 157 EA 1 PHE E 36 ? TYR E 43 ? PHE E 51 TYR E 58 EA 2 ILE E 46 ? VAL E 53 ? ILE E 61 VAL E 68 EA 3 SER E 2 ? VAL E 8 ? SER E 17 VAL E 23 EA 4 GLY E 72 ? ASP E 78 ? GLY E 87 ASP E 93 EA 5 VAL E 105 ? ASN E 111 ? VAL E 120 ASN E 126 EA 6 TRP E 138 ? ALA E 142 ? TRP E 153 ALA E 157 FA 1 PHE F 36 ? TYR F 43 ? PHE F 51 TYR F 58 FA 2 ILE F 46 ? VAL F 53 ? ILE F 61 VAL F 68 FA 3 SER F 2 ? VAL F 8 ? SER F 17 VAL F 23 FA 4 GLY F 72 ? ASP F 78 ? GLY F 87 ASP F 93 FA 5 VAL F 105 ? ASN F 111 ? VAL F 120 ASN F 126 FA 6 TRP F 138 ? ALA F 142 ? TRP F 153 ALA F 157 MA 1 ILE G 60 ? SER G 61 ? ILE M 988 SER M 989 MA 2 SER G 40 ? TYR G 44 ? SER M 968 TYR M 972 MA 3 LYS G 30 ? ARG G 37 ? LYS M 958 ARG M 965 MA 4 LYS G 5 ? VAL G 15 ? LYS M 933 VAL M 943 MA 5 GLU G 88 ? GLN G 92 ? GLU M 1016 GLN M 1020 MA 6 VAL G 79 ? THR G 83 ? VAL M 1007 THR M 1011 MA 7 LEU G 66 ? ILE G 69 ? LEU M 994 ILE M 997 NA 1 ILE H 60 ? SER H 61 ? ILE N 988 SER N 989 NA 2 SER H 40 ? TYR H 44 ? SER N 968 TYR N 972 NA 3 LYS H 30 ? ARG H 37 ? LYS N 958 ARG N 965 NA 4 LYS H 5 ? VAL H 15 ? LYS N 933 VAL N 943 NA 5 GLU H 88 ? GLN H 92 ? GLU N 1016 GLN N 1020 NA 6 VAL H 79 ? THR H 83 ? VAL N 1007 THR N 1011 NA 7 LEU H 66 ? ILE H 69 ? LEU N 994 ILE N 997 OA 1 ILE I 60 ? SER I 61 ? ILE O 988 SER O 989 OA 2 SER I 40 ? TYR I 44 ? SER O 968 TYR O 972 OA 3 LYS I 30 ? ARG I 37 ? LYS O 958 ARG O 965 OA 4 LYS I 5 ? VAL I 15 ? LYS O 933 VAL O 943 OA 5 GLU I 88 ? GLN I 92 ? GLU O 1016 GLN O 1020 OA 6 VAL I 79 ? THR I 83 ? VAL O 1007 THR O 1011 OA 7 LEU I 66 ? ILE I 69 ? LEU O 994 ILE O 997 PA 1 ILE J 60 ? SER J 61 ? ILE P 988 SER P 989 PA 2 SER J 40 ? TYR J 44 ? SER P 968 TYR P 972 PA 3 LYS J 30 ? ARG J 37 ? LYS P 958 ARG P 965 PA 4 LYS J 5 ? VAL J 15 ? LYS P 933 VAL P 943 PA 5 GLU J 88 ? GLN J 92 ? GLU P 1016 GLN P 1020 PA 6 VAL J 79 ? THR J 83 ? VAL P 1007 THR P 1011 PA 7 LEU J 66 ? ILE J 69 ? LEU P 994 ILE P 997 QA 1 ILE K 60 ? SER K 61 ? ILE Q 988 SER Q 989 QA 2 SER K 40 ? TYR K 44 ? SER Q 968 TYR Q 972 QA 3 LYS K 30 ? ARG K 37 ? LYS Q 958 ARG Q 965 QA 4 LYS K 5 ? VAL K 15 ? LYS Q 933 VAL Q 943 QA 5 GLU K 88 ? GLN K 92 ? GLU Q 1016 GLN Q 1020 QA 6 VAL K 79 ? THR K 83 ? VAL Q 1007 THR Q 1011 QA 7 LEU K 66 ? ILE K 69 ? LEU Q 994 ILE Q 997 RA 1 ILE L 60 ? SER L 61 ? ILE R 988 SER R 989 RA 2 SER L 40 ? TYR L 44 ? SER R 968 TYR R 972 RA 3 LYS L 30 ? ARG L 37 ? LYS R 958 ARG R 965 RA 4 LYS L 5 ? VAL L 15 ? LYS R 933 VAL R 943 RA 5 GLU L 88 ? GLN L 92 ? GLU R 1016 GLN R 1020 RA 6 VAL L 79 ? THR L 83 ? VAL R 1007 THR R 1011 RA 7 LEU L 66 ? ILE L 69 ? LEU R 994 ILE R 997 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA 1 2 N TYR A 43 ? 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N LEU D 88 O VAL D 105 ? O VAL D 120 DA 5 6 N VAL D 108 ? N VAL D 123 O TYR D 139 ? O TYR D 154 EA 1 2 N TYR E 43 ? N TYR E 58 O ILE E 46 ? O ILE E 61 EA 2 3 N THR E 49 ? N THR E 64 O MET E 3 ? O MET E 18 EA 3 4 N LEU E 6 ? N LEU E 21 O GLY E 72 ? O GLY E 87 EA 4 5 N LEU E 73 ? N LEU E 88 O VAL E 105 ? O VAL E 120 EA 5 6 N VAL E 108 ? N VAL E 123 O TYR E 139 ? O TYR E 154 FA 1 2 N TYR F 43 ? N TYR F 58 O ILE F 46 ? O ILE F 61 FA 2 3 N THR F 49 ? N THR F 64 O MET F 3 ? O MET F 18 FA 3 4 N LEU F 6 ? N LEU F 21 O GLY F 72 ? O GLY F 87 FA 4 5 N LEU F 73 ? N LEU F 88 O VAL F 105 ? O VAL F 120 FA 5 6 N VAL F 108 ? N VAL F 123 O TYR F 139 ? O TYR F 154 MA 1 2 N ILE G 60 ? N ILE M 988 O LEU G 41 ? O LEU M 969 MA 2 3 N TYR G 44 ? N TYR M 972 O TYR G 33 ? O TYR M 961 MA 3 4 N LEU G 36 ? N LEU M 964 O LYS G 5 ? O LYS M 933 MA 4 5 N LEU G 14 ? N LEU M 942 O GLU G 88 ? O GLU M 1016 MA 5 6 N PHE G 91 ? N PHE M 1019 O PHE G 80 ? O PHE M 1008 MA 6 7 N THR G 83 ? N THR M 1011 O LEU G 66 ? 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O LEU R 994 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software ? ? ? ? 27 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP A1181' AC2 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG A1182' AC3 Software ? ? ? ? 27 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP B1181' AC4 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG B1182' AC5 Software ? ? ? ? 27 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP C1181' AC6 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG C1182' AC7 Software ? ? ? ? 25 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP D1181' AC8 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG D1182' AC9 Software ? ? ? ? 29 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP E1181' BC1 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG E1182' BC2 Software ? ? ? ? 26 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP F1181' BC3 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE MG F1182' BC4 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 M2064' BC5 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 N2064' BC6 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 O2062' BC7 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 P2064' BC8 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 Q2064' BC9 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 R2064' CC1 Software ? ? ? ? 6 'BINDING SITE FOR RESIDUE DIO A1183' CC2 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE DIO B1183' CC3 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE DIO F1183' CC4 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE EDO C1183' CC5 Software ? ? ? ? 5 'BINDING SITE FOR RESIDUE EDO O2063' CC6 Software ? ? ? ? 4 'BINDING SITE FOR RESIDUE EDO E1183' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 27 ASP A 11 ? 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VA 8 HOH 54 3054 3054 HOH HOH R . VA 8 HOH 55 3055 3055 HOH HOH R . VA 8 HOH 56 3056 3056 HOH HOH R . VA 8 HOH 57 3057 3057 HOH HOH R . VA 8 HOH 58 3058 3058 HOH HOH R . VA 8 HOH 59 3059 3059 HOH HOH R . VA 8 HOH 60 3060 3060 HOH HOH R . VA 8 HOH 61 3061 3061 HOH HOH R . VA 8 HOH 62 3062 3062 HOH HOH R . VA 8 HOH 63 3063 3063 HOH HOH R . VA 8 HOH 64 3064 3064 HOH HOH R . VA 8 HOH 65 3065 3065 HOH HOH R . VA 8 HOH 66 3066 3066 HOH HOH R . VA 8 HOH 67 3067 3067 HOH HOH R . VA 8 HOH 68 3068 3068 HOH HOH R . VA 8 HOH 69 3069 3069 HOH HOH R . VA 8 HOH 70 3070 3070 HOH HOH R . VA 8 HOH 71 3071 3071 HOH HOH R . VA 8 HOH 72 3072 3072 HOH HOH R . VA 8 HOH 73 3073 3073 HOH HOH R . VA 8 HOH 74 3074 3074 HOH HOH R . VA 8 HOH 75 3075 3075 HOH HOH R . VA 8 HOH 76 3076 3076 HOH HOH R . 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