data_2KJ0 # _entry.id 2KJ0 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 2KJ0 RCSB RCSB101179 WWPDB D_1000101179 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2009-11-24 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 2KQG _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 2KJ0 _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ? # _pdbx_database_status.deposit_site BMRB _pdbx_database_status.entry_id 2KJ0 _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2009-05-13 _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.status_code_mr OBS _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Hsu, S.' 1 'Varnai, P.' 2 'Bugaut, A.' 3 'Reska, T.' 4 'Neidle, S.' 5 'Balasubramanian, S.' 6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.journal_id_ASTM _citation.country _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_id_CSD _citation.book_publisher _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'A G-rich sequence within the c-kit oncogene promoter forms a parallel G-quadruplex having asymmetric G-tetrad dynamics' J.Am.Chem.Soc. 131 13399 13409 2009 JACSAT US 0002-7863 0004 ? 19705869 10.1021/ja904007p 1 'A conserved quadruplex motif located in a transcription activation site of the human c-kit oncogene.' Biochemistry 45 7854 7860 2006 BICHAW US 0006-2960 0033 ? 16784237 0.1021/bi060151 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Hsu, S.T.' 1 primary 'Varnai, P.' 2 primary 'Bugaut, A.' 3 primary 'Reszka, A.P.' 4 primary 'Neidle, S.' 5 primary 'Balasubramanian, S.' 6 1 'Fernando, H.' 7 1 'Anthony, R.P.' 8 1 'Huppert, J.' 9 1 'Ladame, S.' 10 1 'Rankin, S.' 11 1 'Venkitaraman, A.R.' 12 1 'Neidle, S.' 13 1 'Balasubramanian, S.' 14 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-D(*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*AP*CP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3'" 6635.259 1 ? ? ? ? 2 non-polymer syn 'POTASSIUM ION' 39.098 2 ? ? ? ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;(DC)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG) (DT) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can CGGGCGGGCACGAGGGAGGGT _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 DG n 1 4 DG n 1 5 DC n 1 6 DG n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DC n 1 10 DA n 1 11 DC n 1 12 DG n 1 13 DA n 1 14 DG n 1 15 DG n 1 16 DG n 1 17 DA n 1 18 DG n 1 19 DG n 1 20 DG n 1 21 DT n # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 2KJ0 _struct_ref.pdbx_db_accession 2KJ0 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_align_begin 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code CGGGCGGGCACGAGGGAGGGT _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 2KJ0 _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 21 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 2KJ0 _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 21 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 21 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 K non-polymer . 'POTASSIUM ION' ? 'K 1' 39.098 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 2 1 '2D 1H-1H TOCSY' 1 3 1 '2D DQF-COSY' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 10 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ambient _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 # _pdbx_nmr_sample_details.contents ;200 uM DNA (5'-D(*(DC5)P*DGP*DGP*DGP*DCP*DGP*DGP*DGP*DCP*DAP*DCP*DGP*DAP*DGP*DGP*DGP*DAP*DGP*DGP*DGP*(DT3))-3')-1, 10 mM potassium phosphate-2, 93% H2O/7% D2O ; _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '93% H2O/7% D2O' # _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 700 _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.model Avance _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type 'Bruker Avance' # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2KJ0 _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing, molecular dynamics' _pdbx_nmr_refine.details 'Explicit water refinement including potassium ions within the G-tetrads.' _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the least restraint violations' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 100 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2KJ0 _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2KJ0 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.ordinal Goddard 'chemical shift assignment' SPARKY ? 1 'Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, Pfeifer and Bax' processing NMRPipe ? 2 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollm' 'structure solution' AMBER ? 3 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollm' refinement AMBER ? 4 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.crystals_number ? _exptl.details 'The structures have been refined in explicit water model with a sequence that contains double mutations G21T/G10A' _exptl.entry_id 2KJ0 _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 2KJ0 _struct.title ;DNA promoter sequence of the c-kit oncogene forms a parallel G-quadruplex (c-kit2) with a long loop that confers asymmetric internal dynamics in the G-tetrads ; _struct.pdbx_descriptor "5'-D(*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*AP*CP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3'" _struct.pdbx_model_details 'lowest energy, model 1' _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2KJ0 _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'c-kit2, oncogene, promoter, G-quadruplex, DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc1 metalc ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 2 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc2 metalc ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 3 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.773 ? metalc3 metalc ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 4 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? metalc4 metalc ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 6 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc5 metalc ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 7 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc6 metalc ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 7 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.870 ? metalc7 metalc ? ? A DG 8 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 8 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? metalc8 metalc ? ? A DG 14 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 14 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc9 metalc ? ? A DG 15 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 15 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc10 metalc ? ? A DG 15 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 15 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? metalc11 metalc ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 16 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? metalc12 metalc ? ? A DG 18 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 18 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc13 metalc ? ? A DG 19 O6 ? ? ? 1_555 B K . K ? ? A DG 19 A K 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? metalc14 metalc ? ? A DG 19 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 19 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.925 ? metalc15 metalc ? ? A DG 20 O6 ? ? ? 1_555 C K . K ? ? A DG 20 A K 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? hydrog1 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 A DG 6 O6 ? ? A DG 2 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 A DG 6 N7 ? ? A DG 2 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 2 N7 ? ? ? 1_555 A DG 18 N2 ? ? A DG 2 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 A DG 18 N1 ? ? A DG 2 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 3 N1 ? ? ? 1_555 A DG 7 O6 ? ? A DG 3 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 3 N2 ? ? ? 1_555 A DG 7 N7 ? ? A DG 3 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 3 N7 ? ? ? 1_555 A DG 19 N2 ? ? A DG 3 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 A DG 19 N1 ? ? A DG 3 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 A DG 8 O6 ? ? A DG 4 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 A DG 8 N7 ? ? A DG 4 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 4 N7 ? ? ? 1_555 A DG 20 N2 ? ? A DG 4 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 A DG 20 N1 ? ? A DG 4 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 A DG 14 O6 ? ? A DG 6 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 A DG 14 N7 ? ? A DG 6 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 A DG 15 O6 ? ? A DG 7 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 A DG 15 N7 ? ? A DG 7 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 A DG 16 O6 ? ? A DG 8 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DG 16 N7 ? ? A DG 8 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 14 N1 ? ? ? 1_555 A DG 18 O6 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 14 N2 ? ? ? 1_555 A DG 18 N7 ? ? A DG 14 A DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 15 N1 ? ? ? 1_555 A DG 19 O6 ? ? A DG 15 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 15 N2 ? ? ? 1_555 A DG 19 N7 ? ? A DG 15 A DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 16 N1 ? ? ? 1_555 A DG 20 O6 ? ? A DG 16 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 16 N2 ? ? ? 1_555 A DG 20 N7 ? ? A DG 16 A DG 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 16 N1 ? ? ? 1_555 A DT 21 O4 ? ? A DG 16 A DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DT MISPAIR' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software ? ? ? ? 9 'BINDING SITE FOR RESIDUE K A 22' AC2 Software ? ? ? ? 9 'BINDING SITE FOR RESIDUE K A 23' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 9 DG A 2 ? DG A 2 . ? 1_555 ? 2 AC1 9 DG A 3 ? DG A 3 . ? 1_555 ? 3 AC1 9 DG A 6 ? DG A 6 . ? 1_555 ? 4 AC1 9 DG A 7 ? DG A 7 . ? 1_555 ? 5 AC1 9 DG A 14 ? DG A 14 . ? 1_555 ? 6 AC1 9 DG A 15 ? DG A 15 . ? 1_555 ? 7 AC1 9 DG A 18 ? DG A 18 . ? 1_555 ? 8 AC1 9 DG A 19 ? DG A 19 . ? 1_555 ? 9 AC1 9 K C . ? K A 23 . ? 1_555 ? 10 AC2 9 DG A 3 ? DG A 3 . ? 1_555 ? 11 AC2 9 DG A 4 ? DG A 4 . ? 1_555 ? 12 AC2 9 DG A 7 ? DG A 7 . ? 1_555 ? 13 AC2 9 DG A 8 ? DG A 8 . ? 1_555 ? 14 AC2 9 DG A 15 ? DG A 15 . ? 1_555 ? 15 AC2 9 DG A 16 ? DG A 16 . ? 1_555 ? 16 AC2 9 DG A 19 ? DG A 19 . ? 1_555 ? 17 AC2 9 DG A 20 ? DG A 20 . ? 1_555 ? 18 AC2 9 K B . ? K A 22 . ? 1_555 ? # _atom_sites.entry_id 2KJ0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H K N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG DG A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DC 5 5 5 DC DC A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DC 9 9 9 DC DC A . n A 1 10 DA 10 10 10 DA DA A . n A 1 11 DC 11 11 11 DC DC A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DA 13 13 13 DA DA A . n A 1 14 DG 14 14 14 DG DG A . n A 1 15 DG 15 15 15 DG DG A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DA 17 17 17 DA DA A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG DG A . n A 1 19 DG 19 19 19 DG DG A . n A 1 20 DG 20 20 20 DG DG A . n A 1 21 DT 21 21 21 DT DT A . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 K 1 22 22 K K A . C 2 K 1 23 23 K K A . # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 71.9 ? 2 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 123.1 ? 3 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 71.6 ? 4 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 115.3 ? 5 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 75.8 ? 6 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 95.9 ? 7 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 160.1 ? 8 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 127.5 ? 9 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 67.3 ? 10 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 77.4 ? 11 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 73.3 ? 12 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 119.3 ? 13 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 163.6 ? 14 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 76.4 ? 15 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 96.6 ? 16 O6 ? A DG 2 ? A DG 2 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 93.0 ? 17 O6 ? A DG 6 ? A DG 6 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 153.9 ? 18 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 101.5 ? 19 O6 ? A DG 14 ? A DG 14 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 130.2 ? 20 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 67.5 ? 21 O6 ? A DG 18 ? A DG 18 ? 1_555 K ? B K . ? A K 22 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 73.9 ? 22 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 79.2 ? 23 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 65.8 ? 24 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 96.7 ? 25 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 124.9 ? 26 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 71.8 ? 27 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 72.3 ? 28 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 101.4 ? 29 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 158.5 ? 30 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 64.9 ? 31 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 91.1 ? 32 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 157.5 ? 33 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 116.3 ? 34 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 124.2 ? 35 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 77.0 ? 36 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 70.4 ? 37 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 66.0 ? 38 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 132.7 ? 39 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 96.9 ? 40 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 155.1 ? 41 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 64.0 ? 42 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 91.9 ? 43 O6 ? A DG 3 ? A DG 3 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 91.7 ? 44 O6 ? A DG 4 ? A DG 4 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 72.8 ? 45 O6 ? A DG 7 ? A DG 7 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 156.9 ? 46 O6 ? A DG 8 ? A DG 8 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 121.2 ? 47 O6 ? A DG 15 ? A DG 15 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 128.4 ? 48 O6 ? A DG 16 ? A DG 16 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 78.7 ? 49 O6 ? A DG 19 ? A DG 19 ? 1_555 K ? C K . ? A K 23 ? 1_555 O6 ? A DG 20 ? A DG 20 ? 1_555 77.2 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2009-10-13 2 'Structure model' 1 1 2009-11-24 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 2 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id ;DNA (5'-D(*(DC5)P*DGP*DGP*DGP*DCP*DGP*DGP*DGP*DCP*DAP*DCP*DGP*DAP*DGP*DGP*DGP*DAP*DGP*DGP*DGP*(DT3))-3')-1 ; 200 ? uM ? 1 'potassium phosphate-2' 10 ? mM ? 1 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 2 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 115.98 121.90 -5.92 0.70 N 3 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.35 108.30 4.05 0.30 N 4 1 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.10 108.30 6.80 0.30 N 5 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.44 108.30 5.14 0.30 N 6 1 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 7 1 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 122.76 118.90 3.86 0.60 N 8 1 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.02 121.90 -4.88 0.70 N 9 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.88 108.30 5.58 0.30 N 10 1 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 11 1 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.59 121.90 -4.31 0.70 N 12 1 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 113.40 108.30 5.10 0.30 N 13 1 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 14 1 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.41 118.60 -5.19 0.60 N 15 1 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.18 121.90 -4.72 0.70 N 16 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.02 108.30 2.72 0.30 N 17 1 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 112.59 108.30 4.29 0.30 N 18 1 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.57 117.70 3.87 0.50 N 19 1 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 114.50 118.60 -4.10 0.60 N 20 1 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 21 1 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 22 1 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.27 108.30 4.97 0.30 N 23 1 "O4'" A DA 17 ? ? "C1'" A DA 17 ? ? "C2'" A DA 17 ? ? 100.09 105.90 -5.81 0.80 N 24 1 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 25 1 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 26 1 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 112.40 118.60 -6.20 0.60 N 27 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 28 1 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 29 1 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 112.28 108.30 3.98 0.30 N 30 1 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.99 122.90 -3.91 0.60 N 31 2 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.19 121.90 -4.71 0.70 N 32 2 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.47 108.30 4.17 0.30 N 33 2 C8 A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? C4 A DG 2 ? ? 103.99 106.40 -2.41 0.40 N 34 2 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.54 119.90 -4.36 0.70 N 35 2 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 114.09 108.30 5.79 0.30 N 36 2 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.34 108.30 5.04 0.30 N 37 2 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 38 2 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.48 121.90 -4.42 0.70 N 39 2 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.20 108.30 4.90 0.30 N 40 2 "O4'" A DC 9 ? ? "C4'" A DC 9 ? ? "C3'" A DC 9 ? ? 99.98 104.50 -4.52 0.40 N 41 2 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 115.51 108.30 7.21 0.30 N 42 2 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.67 118.90 4.77 0.60 N 43 2 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.37 121.90 -5.53 0.70 N 44 2 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 45 2 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.28 117.00 -3.72 0.50 N 46 2 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 120.90 117.70 3.20 0.50 N 47 2 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.48 118.60 -6.12 0.60 N 48 2 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.46 121.90 -4.44 0.70 N 49 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 50 2 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 51 2 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.55 117.00 -3.45 0.50 N 52 2 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 53 2 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 54 2 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 55 2 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.63 108.30 4.33 0.30 N 56 2 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 111.78 108.30 3.48 0.30 N 57 2 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 58 2 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 59 2 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 111.72 118.60 -6.88 0.60 N 60 2 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 61 2 C5 A DG 19 ? ? C6 A DG 19 ? ? N1 A DG 19 ? ? 114.59 111.50 3.09 0.50 N 62 2 N1 A DG 19 ? ? C6 A DG 19 ? ? O6 A DG 19 ? ? 115.55 119.90 -4.35 0.60 N 63 2 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 64 2 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 112.80 108.30 4.50 0.30 N 65 2 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.18 122.90 -4.72 0.60 N 66 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.49 121.90 -4.41 0.70 N 67 3 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 68 3 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 115.25 119.90 -4.65 0.70 N 69 3 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 113.25 108.30 4.95 0.30 N 70 3 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 71 3 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.53 108.30 4.23 0.30 N 72 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 73 3 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.01 118.90 4.11 0.60 N 74 3 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.10 121.90 -5.80 0.70 N 75 3 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 76 3 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 77 3 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 78 3 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.58 118.60 -5.02 0.60 N 79 3 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N 80 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 81 3 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.64 108.30 5.34 0.30 N 82 3 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 83 3 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 84 3 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.03 118.60 -5.57 0.60 N 85 3 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 86 3 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.49 108.30 5.19 0.30 N 87 3 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.24 108.30 4.94 0.30 N 88 3 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 89 3 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 90 3 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.14 118.60 -5.46 0.60 N 91 3 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 92 3 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 93 3 N3 A DT 21 ? ? C2 A DT 21 ? ? O2 A DT 21 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 94 3 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.92 122.90 -3.98 0.60 N 95 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? "C2'" A DC 1 ? ? 100.99 105.90 -4.91 0.80 N 96 4 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.97 108.30 4.67 0.30 N 97 4 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 117.40 108.30 9.10 0.30 N 98 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 99 4 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 100 4 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.19 121.90 -4.71 0.70 N 101 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.88 108.30 4.58 0.30 N 102 4 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.30 119.90 -4.60 0.70 N 103 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 104 4 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 112.21 108.30 3.91 0.30 N 105 4 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.07 118.90 4.17 0.60 N 106 4 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.13 121.90 -5.77 0.70 N 107 4 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 108 4 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 109 4 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 110 4 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 114.18 118.60 -4.42 0.60 N 111 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 112 4 N3 A DG 12 ? ? C2 A DG 12 ? ? N2 A DG 12 ? ? 115.23 119.90 -4.67 0.70 N 113 4 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.83 108.30 2.53 0.30 N 114 4 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.36 117.00 -3.64 0.50 N 115 4 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 116 4 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.06 118.60 -5.54 0.60 N 117 4 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 118 4 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 111.42 108.30 3.12 0.30 N 119 4 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 112.56 108.30 4.26 0.30 N 120 4 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 121 4 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 122.02 117.70 4.32 0.50 N 122 4 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.43 118.60 -5.17 0.60 N 123 4 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 124 4 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 113.10 108.30 4.80 0.30 N 125 4 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 126 4 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.95 122.90 -3.95 0.60 N 127 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.64 108.30 4.34 0.30 N 128 5 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 114.58 108.30 6.28 0.30 N 129 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.65 108.30 5.35 0.30 N 130 5 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 131 5 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.59 121.90 -4.31 0.70 N 132 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 133 5 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.83 108.30 3.53 0.30 N 134 5 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.14 121.90 -4.76 0.70 N 135 5 "C3'" A DC 9 ? ? "O3'" A DC 9 ? ? P A DA 10 ? ? 127.47 119.70 7.77 1.20 Y 136 5 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.03 108.30 2.73 0.30 N 137 5 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.21 117.00 -3.79 0.50 N 138 5 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.93 117.70 4.23 0.50 N 139 5 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.14 118.60 -6.46 0.60 N 140 5 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 112.19 108.30 3.89 0.30 N 141 5 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.52 121.90 -4.38 0.70 N 142 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 116.48 108.30 8.18 0.30 N 143 5 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 114.08 108.30 5.78 0.30 N 144 5 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.54 117.70 3.84 0.50 N 145 5 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.95 118.60 -4.65 0.60 N 146 5 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 115.29 108.30 6.99 0.30 N 147 5 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? "C2'" A DG 15 ? ? 99.39 105.90 -6.51 0.80 N 148 5 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.73 108.30 4.43 0.30 N 149 5 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.77 108.30 5.47 0.30 N 150 5 "C4'" A DA 17 ? ? "C3'" A DA 17 ? ? "C2'" A DA 17 ? ? 97.84 102.20 -4.36 0.70 N 151 5 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.55 117.70 3.85 0.50 N 152 5 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 114.04 118.60 -4.56 0.60 N 153 5 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 154 5 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 155 5 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 156 5 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 157 5 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.30 122.90 -3.60 0.60 N 158 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.49 121.90 -4.41 0.70 N 159 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.88 108.30 4.58 0.30 N 160 6 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.22 108.30 6.92 0.30 N 161 6 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 162 6 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 113.26 108.30 4.96 0.30 N 163 6 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 164 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.82 108.30 3.52 0.30 N 165 6 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 166 6 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.45 121.90 -5.45 0.70 N 167 6 "C3'" A DC 9 ? ? "O3'" A DC 9 ? ? P A DA 10 ? ? 127.42 119.70 7.72 1.20 Y 168 6 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 169 6 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.45 117.00 -3.55 0.50 N 170 6 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 171 6 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.98 118.60 -5.62 0.60 N 172 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 173 6 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.42 108.30 5.12 0.30 N 174 6 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.40 117.00 -3.60 0.50 N 175 6 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 176 6 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.28 118.60 -6.32 0.60 N 177 6 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 178 6 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.37 108.30 4.07 0.30 N 179 6 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.57 108.30 6.27 0.30 N 180 6 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.21 117.00 -3.79 0.50 N 181 6 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.68 117.70 3.98 0.50 N 182 6 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 111.34 118.60 -7.26 0.60 N 183 6 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 184 6 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 185 6 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 186 6 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 187 6 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.00 122.90 -3.90 0.60 N 188 7 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.58 118.90 3.68 0.60 N 189 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 190 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.10 108.30 4.80 0.30 N 191 7 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 115.74 108.30 7.44 0.30 N 192 7 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.28 108.30 3.98 0.30 N 193 7 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 194 7 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.36 121.90 -4.54 0.70 N 195 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 113.31 108.30 5.01 0.30 N 196 7 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.34 108.30 2.04 0.30 N 197 7 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.74 121.90 -5.16 0.70 N 198 7 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 199 7 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 200 7 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.21 118.60 -5.39 0.60 N 201 7 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 111.95 108.30 3.65 0.30 N 202 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C4'" A DG 12 ? ? "C3'" A DG 12 ? ? 102.07 104.50 -2.43 0.40 N 203 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.43 108.30 3.13 0.30 N 204 7 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 113.31 108.30 5.01 0.30 N 205 7 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 206 7 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 207 7 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 111.74 118.60 -6.86 0.60 N 208 7 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 209 7 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 114.03 108.30 5.73 0.30 N 210 7 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.11 108.30 4.81 0.30 N 211 7 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.56 117.00 -3.44 0.50 N 212 7 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.62 117.70 3.92 0.50 N 213 7 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 112.93 118.60 -5.67 0.60 N 214 7 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 215 7 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.70 108.30 4.40 0.30 N 216 7 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 217 7 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 218 7 N3 A DT 21 ? ? C2 A DT 21 ? ? O2 A DT 21 ? ? 118.67 122.30 -3.63 0.60 N 219 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.66 121.90 -4.24 0.70 N 220 8 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.49 108.30 4.19 0.30 N 221 8 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 114.69 108.30 6.39 0.30 N 222 8 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 223 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 224 8 "C3'" A DG 8 ? ? "O3'" A DG 8 ? ? P A DC 9 ? ? 126.95 119.70 7.25 1.20 Y 225 8 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 226 8 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.83 121.90 -5.07 0.70 N 227 8 N3 A DC 9 ? ? C4 A DC 9 ? ? N4 A DC 9 ? ? 113.75 118.00 -4.25 0.70 N 228 8 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 110.64 108.30 2.34 0.30 N 229 8 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.49 117.00 -3.51 0.50 N 230 8 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 120.93 117.70 3.23 0.50 N 231 8 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 111.96 118.60 -6.64 0.60 N 232 8 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.32 121.90 -4.58 0.70 N 233 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 234 8 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.91 108.30 3.61 0.30 N 235 8 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 120.93 117.70 3.23 0.50 N 236 8 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 114.13 118.60 -4.47 0.60 N 237 8 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 114.21 108.30 5.91 0.30 N 238 8 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.53 108.30 6.23 0.30 N 239 8 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 240 8 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 241 8 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 114.06 118.60 -4.54 0.60 N 242 8 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.98 108.30 4.68 0.30 N 243 8 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 118.72 122.90 -4.18 0.60 N 244 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.41 121.90 -4.49 0.70 N 245 9 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.54 108.30 5.24 0.30 N 246 9 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 117.37 108.30 9.07 0.30 N 247 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 113.55 108.30 5.25 0.30 N 248 9 N3 A DG 4 ? ? C2 A DG 4 ? ? N2 A DG 4 ? ? 114.73 119.90 -5.17 0.70 N 249 9 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N 250 9 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 122.94 118.90 4.04 0.60 N 251 9 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.10 121.90 -4.80 0.70 N 252 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.90 108.30 4.60 0.30 N 253 9 "O4'" A DC 9 ? ? "C4'" A DC 9 ? ? "C3'" A DC 9 ? ? 100.08 104.50 -4.42 0.40 N 254 9 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 255 9 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 123.09 118.90 4.19 0.60 N 256 9 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.21 121.90 -5.69 0.70 N 257 9 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 258 9 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 120.97 117.70 3.27 0.50 N 259 9 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 114.25 118.60 -4.35 0.60 N 260 9 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 114.29 108.30 5.99 0.30 N 261 9 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.03 121.90 -4.87 0.70 N 262 9 N3 A DC 11 ? ? C4 A DC 11 ? ? N4 A DC 11 ? ? 113.35 118.00 -4.65 0.70 N 263 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.62 108.30 3.32 0.30 N 264 9 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 265 9 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 266 9 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.49 118.60 -5.11 0.60 N 267 9 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 268 9 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 112.96 108.30 4.66 0.30 N 269 9 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.56 108.30 5.26 0.30 N 270 9 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 271 9 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 272 9 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.50 118.60 -5.10 0.60 N 273 9 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 112.59 108.30 4.29 0.30 N 274 9 "O4'" A DG 19 ? ? "C1'" A DG 19 ? ? N9 A DG 19 ? ? 112.19 108.30 3.89 0.30 N 275 9 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 111.54 108.30 3.24 0.30 N 276 9 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 277 9 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 278 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.24 121.90 -4.66 0.70 N 279 10 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 280 10 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 116.27 108.30 7.97 0.30 N 281 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.71 108.30 4.41 0.30 N 282 10 C5 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? N1 A DG 7 ? ? 114.71 111.50 3.21 0.50 N 283 10 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 103.65 108.00 -4.35 0.70 N 284 10 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 112.81 108.30 4.51 0.30 N 285 10 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 122.67 118.90 3.77 0.60 N 286 10 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.32 121.90 -5.58 0.70 N 287 10 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 112.58 108.30 4.28 0.30 N 288 10 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 289 10 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 290 10 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.07 118.60 -5.53 0.60 N 291 10 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 292 10 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.22 121.90 -4.68 0.70 N 293 10 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 112.66 108.30 4.36 0.30 N 294 10 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 295 10 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 296 10 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.46 118.60 -6.14 0.60 N 297 10 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.02 108.30 3.72 0.30 N 298 10 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.00 108.30 4.70 0.30 N 299 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 113.80 108.30 5.50 0.30 N 300 10 "C4'" A DA 17 ? ? "C3'" A DA 17 ? ? "C2'" A DA 17 ? ? 97.82 102.20 -4.38 0.70 N 301 10 C4 A DA 17 ? ? C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? 113.25 117.00 -3.75 0.50 N 302 10 C5 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N1 A DA 17 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 303 10 N1 A DA 17 ? ? C6 A DA 17 ? ? N6 A DA 17 ? ? 113.04 118.60 -5.56 0.60 N 304 10 N3 A DG 19 ? ? C2 A DG 19 ? ? N2 A DG 19 ? ? 115.48 119.90 -4.42 0.70 N 305 10 "O4'" A DG 20 ? ? "C1'" A DG 20 ? ? N9 A DG 20 ? ? 112.03 108.30 3.73 0.30 N 306 10 N3 A DG 20 ? ? C2 A DG 20 ? ? N2 A DG 20 ? ? 115.53 119.90 -4.37 0.70 N 307 10 "O4'" A DT 21 ? ? "C1'" A DT 21 ? ? N1 A DT 21 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 308 10 C6 A DT 21 ? ? C5 A DT 21 ? ? C7 A DT 21 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DC A 1 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 2 1 DG A 2 ? ? 0.147 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 3 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 4 1 DG A 4 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 5 1 DC A 9 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 6 1 DA A 13 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 7 1 DG A 14 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 2 ? ? 0.242 'SIDE CHAIN' 9 2 DG A 4 ? ? 0.148 'SIDE CHAIN' 10 2 DG A 8 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 11 2 DC A 9 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 12 2 DA A 13 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 13 3 DG A 2 ? ? 0.183 'SIDE CHAIN' 14 3 DG A 4 ? ? 0.174 'SIDE CHAIN' 15 3 DC A 5 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 16 3 DG A 6 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 17 3 DG A 8 ? ? 0.121 'SIDE CHAIN' 18 3 DC A 9 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 19 3 DG A 20 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 20 4 DC A 1 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 21 4 DG A 2 ? ? 0.200 'SIDE CHAIN' 22 4 DG A 4 ? ? 0.105 'SIDE CHAIN' 23 4 DG A 6 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 24 4 DG A 8 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 25 4 DC A 9 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 26 4 DC A 11 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 27 4 DG A 12 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 28 5 DG A 2 ? ? 0.170 'SIDE CHAIN' 29 5 DG A 3 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 30 6 DG A 2 ? ? 0.165 'SIDE CHAIN' 31 6 DG A 4 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 32 6 DC A 5 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 33 7 DC A 1 ? ? 0.124 'SIDE CHAIN' 34 7 DG A 2 ? ? 0.196 'SIDE CHAIN' 35 7 DG A 3 ? ? 0.097 'SIDE CHAIN' 36 7 DG A 4 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 37 7 DG A 7 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 38 7 DG A 8 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 39 7 DG A 12 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 40 8 DG A 2 ? ? 0.137 'SIDE CHAIN' 41 8 DG A 4 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 42 8 DG A 6 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 43 8 DC A 11 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 44 8 DA A 17 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 45 9 DG A 2 ? ? 0.174 'SIDE CHAIN' 46 9 DG A 3 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 47 9 DG A 4 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 48 9 DG A 6 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 49 9 DG A 8 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 50 9 DC A 9 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 51 9 DG A 18 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 52 10 DC A 1 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 53 10 DG A 2 ? ? 0.214 'SIDE CHAIN' 54 10 DG A 3 ? ? 0.101 'SIDE CHAIN' 55 10 DG A 4 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 56 10 DG A 12 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 57 10 DA A 13 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 58 10 DG A 14 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 59 10 DG A 15 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' # _ndb_struct_conf_na.entry_id 2KJ0 _ndb_struct_conf_na.feature 'quadruple helix' # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2 _pdbx_entity_nonpoly.name 'POTASSIUM ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id K #