data_2L8Q # _entry.id 2L8Q # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.279 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 2L8Q RCSB RCSB102097 BMRB 17423 WWPDB D_1000102097 # loop_ _pdbx_database_related.content_type _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details unspecified 2L8P PDB 'Cidofovir DNA duplex' unspecified 17422 BMRB 'Cidofovir DNA duplex' unspecified 17423 BMRB 'Control DNA duplex' # _pdbx_database_status.deposit_site BMRB _pdbx_database_status.entry_id 2L8Q _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2011-01-22 _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Julien, O.' 1 'Beadle, J.R.' 2 'Magee, W.C.' 3 'Chatterjee, S.' 4 'Hostetler, K.Y.' 5 'Evans, D.H.' 6 'Sykes, B.D.' 7 # _citation.id primary _citation.title 'Solution structure of a DNA duplex containing the potent anti-poxvirus agent cidofovir.' _citation.journal_abbrev J.Am.Chem.Soc. _citation.journal_volume 133 _citation.page_first 2264 _citation.page_last 2274 _citation.year 2011 _citation.journal_id_ASTM JACSAT _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0002-7863 _citation.journal_id_CSD 0004 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 21280608 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1021/ja109823e # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Julien, O.' 1 primary 'Beadle, J.R.' 2 primary 'Magee, W.C.' 3 primary 'Chatterjee, S.' 4 primary 'Hostetler, K.Y.' 5 primary 'Evans, D.H.' 6 primary 'Sykes, B.D.' 7 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*TP*GP*CP*TP*AP*CP*GP*C)-3') ; 3623.368 1 ? ? ? ? 2 polymer syn ;DNA (5'-D(*GP*CP*GP*TP*AP*GP*CP*AP*TP*GP*CP*G)-3') ; 3703.416 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no '(DC)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)' CGCATGCTACGC A ? 2 polydeoxyribonucleotide no no '(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DG)' GCGTAGCATGCG B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 DC n 1 4 DA n 1 5 DT n 1 6 DG n 1 7 DC n 1 8 DT n 1 9 DA n 1 10 DC n 1 11 DG n 1 12 DC n 2 1 DG n 2 2 DC n 2 3 DG n 2 4 DT n 2 5 DA n 2 6 DG n 2 7 DC n 2 8 DA n 2 9 DT n 2 10 DG n 2 11 DC n 2 12 DG n # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 PDB 2L8Q 2L8Q 1 ? ? ? 2 PDB 2L8Q 2L8Q 2 ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2L8Q A 1 ? 12 ? 2L8Q 1 ? 12 ? 1 12 2 2 2L8Q B 1 ? 12 ? 2L8Q 13 ? 24 ? 13 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 2 1 '2D 1H-1H TOCSY' 1 3 1 '2D DQF-COSY' 1 4 1 '2D DQF-COSY' 1 5 1 '2D 1H-13C HSQC' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 70 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0-7.2 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ambient _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # _pdbx_nmr_sample_details.contents '2 mM control DNA duplex, 95% H2O/5% D2O' _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '95% H2O/5% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.type 600 Varian INOVA 1 'Varian INOVA' 500 Varian INOVA 2 'Varian INOVA' # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2L8Q _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ;The upper bounds obtained from MARDIGRAS were multiplied by a factor 1.25 before being exported to Amber 10 for a 25 ps simulated annealing protocol. The simulated annealing protocol using the pairwise generalized Born model was as follows: the temperature of the system was kept constant at 600 K during the first 5 ps, cooled down slowly to 100 K between 5-18 ps, and cooled down to 0 K for the last 7 ps. The protocol was repeated 50 times to obtain an NMR ensemble with the 10 lowest RMSD structures. The structure with the lowest RMSD of the ensemble was put back into MARDIGRAS for a second and third cycle of NOE calibration and structure calculations. ; _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'lowest RMSD to average structure' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 50 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2L8Q _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2L8Q _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'closest to the average' # loop_ _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.ordinal Varian collection VNMRJ 2.1B 1 'Delaglio, Grzesiek, Vuister, Zhu, Pfeifer and Bax' processing NMRPipe 4.9 2 'Johnson, One Moon Scientific' 'chemical shift assignment' NMRView 8.0.b30 3 'T.L. James' 'noe calibration' MARDIGRAS ? 4 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollm' 'structure solution' AMBER 10 5 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollm' refinement AMBER 10 6 'T.L. 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B N N 2 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 12 N1 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 12 O6 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 12 N2 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 B DC 11 N3 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 B DC 11 O2 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B DC 11 N4 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 3 N3 ? ? ? 1_555 B DG 10 N1 ? ? A DC 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 B DG 10 O6 ? ? A DC 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DC 3 O2 ? ? ? 1_555 B DG 10 N2 ? ? A DC 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DA 4 N1 ? ? ? 1_555 B DT 9 N3 ? ? A DA 4 B DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DA 4 N6 ? ? ? 1_555 B DT 9 O4 ? ? A DA 4 B DT 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DT 5 N3 ? ? ? 1_555 B DA 8 N1 ? ? A DT 5 B DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DT 5 O4 ? ? ? 1_555 B DA 8 N6 ? ? A DT 5 B DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 B DC 7 N3 ? ? A DG 6 B DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 B DC 7 O2 ? ? A DG 6 B DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B DC 7 N4 ? ? A DG 6 B DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DC 7 N3 ? ? ? 1_555 B DG 6 N1 ? ? A DC 7 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DC 7 N4 ? ? ? 1_555 B DG 6 O6 ? ? A DC 7 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DC 7 O2 ? ? ? 1_555 B DG 6 N2 ? ? A DC 7 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 5 N1 ? ? A DT 8 B DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DT 8 O4 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? A DT 8 B DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DA 9 N1 ? ? ? 1_555 B DT 4 N3 ? ? A DA 9 B DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DA 9 N6 ? ? ? 1_555 B DT 4 O4 ? ? A DA 9 B DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DC 10 N3 ? ? ? 1_555 B DG 3 N1 ? ? A DC 10 B DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DC 10 N4 ? ? ? 1_555 B DG 3 O6 ? ? A DC 10 B DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DC 10 O2 ? ? ? 1_555 B DG 3 N2 ? ? A DC 10 B DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 B DC 2 N3 ? ? A DG 11 B DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 B DC 2 O2 ? ? A DG 11 B DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DG 11 O6 ? ? ? 1_555 B DC 2 N4 ? ? A DG 11 B DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DC 12 N3 ? ? ? 1_555 B DG 1 N1 ? ? A DC 12 B DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DC 12 N4 ? ? ? 1_555 B DG 1 O6 ? ? A DC 12 B DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DC 12 O2 ? ? ? 1_555 B DG 1 N2 ? ? A DC 12 B DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _atom_sites.entry_id 2L8Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DC 3 3 3 DC DC A . n A 1 4 DA 4 4 4 DA DA A . n A 1 5 DT 5 5 5 DT DT A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DC 7 7 7 DC DC A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT DT A . n A 1 9 DA 9 9 9 DA DA A . n A 1 10 DC 10 10 10 DC DC A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG DG A . n A 1 12 DC 12 12 12 DC DC A . n B 2 1 DG 1 13 13 DG DG B . n B 2 2 DC 2 14 14 DC DC B . n B 2 3 DG 3 15 15 DG DG B . n B 2 4 DT 4 16 16 DT DT B . n B 2 5 DA 5 17 17 DA DA B . n B 2 6 DG 6 18 18 DG DG B . n B 2 7 DC 7 19 19 DC DC B . n B 2 8 DA 8 20 20 DA DA B . n B 2 9 DT 9 21 21 DT DT B . n B 2 10 DG 10 22 22 DG DG B . n B 2 11 DC 11 23 23 DC DC B . n B 2 12 DG 12 24 24 DG DG B . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2011-02-23 2 'Structure model' 1 1 2011-07-13 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? 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N1 B DA 17 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 127 4 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.44 118.60 -5.16 0.60 N 128 4 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 129 4 "O4'" B DC 19 ? ? "C1'" B DC 19 ? ? N1 B DC 19 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 130 4 N3 B DC 19 ? ? C2 B DC 19 ? ? O2 B DC 19 ? ? 116.84 121.90 -5.06 0.70 N 131 4 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 132 4 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 133 4 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 134 4 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 135 4 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 136 4 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 137 4 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.86 108.30 3.56 0.30 N 138 5 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 112.23 108.30 3.93 0.30 N 139 5 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.57 118.90 3.67 0.60 N 140 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.34 121.90 -5.56 0.70 N 141 5 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 142 5 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 143 5 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 144 5 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.57 117.70 3.87 0.50 N 145 5 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 114.02 118.60 -4.58 0.60 N 146 5 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 147 5 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 148 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 149 5 "O4'" A DC 7 ? ? "C1'" A DC 7 ? ? N1 A DC 7 ? ? 112.82 108.30 4.52 0.30 N 150 5 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.99 121.90 -4.91 0.70 N 151 5 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 152 5 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 153 5 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 154 5 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.65 118.60 -4.95 0.60 N 155 5 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.80 121.90 -5.10 0.70 N 156 5 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 157 5 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 158 5 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 116.89 121.90 -5.01 0.70 N 159 5 "O4'" B DG 15 ? ? "C1'" B DG 15 ? ? N9 B DG 15 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 160 5 "C3'" B DT 16 ? ? "O3'" B DT 16 ? ? P B DA 17 ? ? 127.20 119.70 7.50 1.20 Y 161 5 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 162 5 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 163 5 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 164 5 N3 B DC 19 ? ? C2 B DC 19 ? ? O2 B DC 19 ? ? 116.77 121.90 -5.13 0.70 N 165 5 "O4'" B DA 20 ? ? "C1'" B DA 20 ? ? N9 B DA 20 ? ? 110.74 108.30 2.44 0.30 N 166 5 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.39 117.00 -3.61 0.50 N 167 5 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 168 5 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.39 118.60 -5.21 0.60 N 169 5 "O4'" B DT 21 ? ? "C1'" B DT 21 ? ? N1 B DT 21 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 170 5 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 171 5 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 122.56 118.90 3.66 0.60 N 172 5 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.68 121.90 -5.22 0.70 N 173 5 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.94 108.30 3.64 0.30 N 174 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 175 6 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.06 108.30 2.76 0.30 N 176 6 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.80 121.90 -5.10 0.70 N 177 6 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 178 6 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 179 6 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 180 6 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 181 6 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.62 118.90 3.72 0.60 N 182 6 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 183 6 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 184 6 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 185 6 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.34 118.60 -5.26 0.60 N 186 6 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.89 121.90 -5.01 0.70 N 187 6 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 188 6 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 189 6 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 190 6 "O4'" B DG 15 ? ? "C1'" B DG 15 ? ? N9 B DG 15 ? ? 110.53 108.30 2.23 0.30 N 191 6 "O4'" B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 192 6 C6 B DT 16 ? ? C5 B DT 16 ? ? C7 B DT 16 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 193 6 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 194 6 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.56 117.00 -3.44 0.50 N 195 6 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 196 6 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 197 6 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 198 6 "O4'" B DC 19 ? ? "C1'" B DC 19 ? ? N1 B DC 19 ? ? 111.84 108.30 3.54 0.30 N 199 6 N3 B DC 19 ? ? C2 B DC 19 ? ? O2 B DC 19 ? ? 117.11 121.90 -4.79 0.70 N 200 6 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 201 6 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 202 6 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.39 118.60 -5.21 0.60 N 203 6 "O4'" B DT 21 ? ? "C1'" B DT 21 ? ? N1 B DT 21 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 204 6 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 112.53 108.30 4.23 0.30 N 205 6 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 206 7 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.57 118.90 3.67 0.60 N 207 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 208 7 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 209 7 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.75 121.90 -5.15 0.70 N 210 7 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 211 7 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 212 7 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.57 118.60 -5.03 0.60 N 213 7 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 111.81 108.30 3.51 0.30 N 214 7 C6 A DT 5 ? ? 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O2 B DC 14 ? ? 116.91 121.90 -4.99 0.70 N 227 7 "O4'" B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 110.10 108.30 1.80 0.30 N 228 7 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 229 7 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 230 7 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 231 7 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 232 7 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 112.45 108.30 4.15 0.30 N 233 7 N1 B DC 19 ? ? C2 B DC 19 ? ? O2 B DC 19 ? ? 122.50 118.90 3.60 0.60 N 234 7 N3 B DC 19 ? ? C2 B DC 19 ? ? O2 B DC 19 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 235 7 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 236 7 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.10 117.70 3.40 0.50 N 237 7 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.77 118.60 -4.83 0.60 N 238 7 C6 B DT 21 ? ? C5 B DT 21 ? ? C7 B DT 21 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 239 7 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 240 7 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.72 121.90 -5.18 0.70 N 241 7 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 242 8 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 243 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.72 121.90 -5.18 0.70 N 244 8 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 245 8 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 246 8 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 247 8 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N 248 8 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 249 8 "O4'" A DC 7 ? ? "C1'" A DC 7 ? ? N1 A DC 7 ? ? 113.70 108.30 5.40 0.30 N 250 8 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.55 118.90 3.65 0.60 N 251 8 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 252 8 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 253 8 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 254 8 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 255 8 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 256 8 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 111.26 108.30 2.96 0.30 N 257 8 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.95 121.90 -4.95 0.70 N 258 8 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.25 108.30 2.95 0.30 N 259 8 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 260 8 "O4'" B DG 13 ? ? "C1'" B DG 13 ? ? N9 B DG 13 ? ? 112.91 108.30 4.61 0.30 N 261 8 "O4'" B DC 14 ? ? "C1'" B DC 14 ? ? N1 B DC 14 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 262 8 N3 B DC 14 ? ? C2 B DC 14 ? ? O2 B DC 14 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 263 8 "O4'" B DT 16 ? ? "C1'" B DT 16 ? ? N1 B DT 16 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 264 8 C6 B DT 16 ? ? C5 B DT 16 ? ? C7 B DT 16 ? ? 119.30 122.90 -3.60 0.60 N 265 8 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 266 8 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 267 8 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.65 118.60 -4.95 0.60 N 268 8 "O4'" B DC 19 ? ? "C1'" B DC 19 ? ? N1 B DC 19 ? ? 111.04 108.30 2.74 0.30 N 269 8 N3 B DC 19 ? ? C2 B DC 19 ? ? O2 B DC 19 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 270 8 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 271 8 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 272 8 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.79 118.60 -4.81 0.60 N 273 8 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 112.51 108.30 4.21 0.30 N 274 8 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 117.07 121.90 -4.83 0.70 N 275 8 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.35 108.30 3.05 0.30 N 276 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 277 9 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 278 9 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.78 121.90 -5.12 0.70 N 279 9 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 280 9 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 281 9 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 114.08 118.60 -4.52 0.60 N 282 9 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 283 9 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.29 122.90 -3.61 0.60 N 284 9 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 285 9 "O4'" A DC 7 ? ? "C1'" A DC 7 ? ? N1 A DC 7 ? ? 110.70 108.30 2.40 0.30 N 286 9 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.62 118.90 3.72 0.60 N 287 9 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 288 9 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? 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O2 B DC 23 ? ? 116.83 121.90 -5.07 0.70 N 313 9 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 314 10 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.60 118.90 3.70 0.60 N 315 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.44 121.90 -5.46 0.70 N 316 10 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 317 10 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 318 10 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.35 117.00 -3.65 0.50 N 319 10 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 320 10 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.40 118.60 -5.20 0.60 N 321 10 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 112.31 108.30 4.01 0.30 N 322 10 "O4'" A DC 7 ? ? "C1'" A DC 7 ? ? N1 A DC 7 ? ? 112.18 108.30 3.88 0.30 N 323 10 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.58 118.90 3.68 0.60 N 324 10 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 116.82 121.90 -5.08 0.70 N 325 10 C4 A DA 9 ? ? 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O2 B DC 23 ? ? 116.77 121.90 -5.13 0.70 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DT B 21 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 2 6 DA B 20 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 3 8 DG A 2 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 4 8 DA A 9 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 5 10 DT A 8 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' # _ndb_struct_conf_na.entry_id 2L8Q _ndb_struct_conf_na.feature 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 0.258 -0.075 0.163 3.535 -11.603 -0.739 1 A_DC1:DG24_B A 1 ? 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B 18 ? 1 A DC 7 1_555 B DG 6 1_555 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 0.392 -0.710 3.003 4.750 -1.903 33.569 -0.932 0.039 3.062 -3.271 -8.165 33.946 7 AA_DC7DT8:DA17DG18_BB A 7 ? B 18 ? A 8 ? B 17 ? 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 A DA 9 1_555 B DT 4 1_555 -0.323 -1.020 3.334 -2.393 8.728 34.442 -2.924 0.184 3.009 14.434 3.958 35.577 8 AA_DT8DA9:DT16DA17_BB A 8 ? B 17 ? A 9 ? B 16 ? 1 A DA 9 1_555 B DT 4 1_555 A DC 10 1_555 B DG 3 1_555 -0.063 -0.703 3.351 -3.185 2.798 34.547 -1.609 -0.388 3.278 4.690 5.338 34.798 9 AA_DA9DC10:DG15DT16_BB A 9 ? B 16 ? A 10 ? B 15 ? 1 A DC 10 1_555 B DG 3 1_555 A DG 11 1_555 B DC 2 1_555 -0.078 -0.622 3.016 2.097 8.769 31.093 -2.508 0.473 2.732 15.943 -3.812 32.342 10 AA_DC10DG11:DC14DG15_BB A 10 ? B 15 ? A 11 ? B 14 ? 1 A DG 11 1_555 B DC 2 1_555 A DC 12 1_555 B DG 1 1_555 0.532 -0.711 3.500 -0.725 2.320 34.552 -1.572 -1.011 3.435 3.900 1.219 34.634 11 AA_DG11DC12:DG13DC14_BB A 11 ? B 14 ? A 12 ? B 13 ? #