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A . n A 1 138 MET 138 138 ? ? ? A . n A 1 139 SER 139 139 ? ? ? A . n A 1 140 ALA 140 140 ? ? ? A . n A 1 141 ALA 141 141 ? ? ? A . n A 1 142 LYS 142 142 ? ? ? A . n A 1 143 VAL 143 143 ? ? ? A . n A 1 144 ALA 144 144 ? ? ? A . n A 1 145 PHE 145 145 ? ? ? A . n A 1 146 MET 146 146 ? ? ? A . n A 1 147 SER 147 147 ? ? ? A . n A 1 148 ILE 148 148 ? ? ? A . n A 1 149 LYS 149 149 ? ? ? A . n A 1 150 ASN 150 150 ? ? ? A . n A 1 151 GLY 151 151 ? ? ? A . n A 1 152 ASN 152 152 ? ? ? A . n A 1 153 SER 153 153 ? ? ? A . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.entry_id 2N3G _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 2N3G _struct.title 'Solution structure of DRB4 dsRBD1 (viz. DRB4(1-72))' _struct.pdbx_model_details 'lowest energy, model1' _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2N3G _struct_keywords.pdbx_keywords 'RNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.text 'RNAi, RNA BINDING PROTEIN' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name UNP _struct_ref.db_code DRB4_ARATH _struct_ref.pdbx_db_accession Q8H1D4 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ;MDHVYKGQLQAYALQHNLELPVYANEREGPPHAPRFRCNVTFCGQTFQSSEFFPTLKSAEHAAAKIAVASLTPQSPEGID VAYKNLLQEIAQKESSLLPFYATATSGPSHAPTFTSTVEFAGKVFSGEEAKTKKLAEMSAAKVAFMSIKNGNS ; _struct_ref.pdbx_align_begin 1 _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 2N3G _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 72 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession Q8H1D4 _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 72 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 72 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 VAL A 4 ? 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THR A 55 THR A 72 1 ? 18 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # _struct_sheet.id A _struct_sheet.type ? _struct_sheet.number_strands 3 _struct_sheet.details ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 VAL A 22 ? ARG A 27 ? VAL A 22 ARG A 27 A 2 ARG A 35 ? PHE A 42 ? ARG A 35 PHE A 42 A 3 GLN A 45 ? PHE A 47 ? GLN A 45 PHE A 47 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N ARG A 27 ? N ARG A 27 O THR A 41 ? O THR A 41 A 2 3 N PHE A 42 ? N PHE A 42 O GLN A 45 ? O GLN A 45 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 2 HG A SER 49 ? ? H A GLU 51 ? ? 1.30 2 13 HG A SER 49 ? ? H A GLU 51 ? ? 1.27 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASN A 17 ? ? 62.91 66.00 2 1 PRO A 30 ? ? -43.48 166.42 3 2 HIS A 3 ? ? -159.34 43.59 4 2 PRO A 30 ? ? -43.83 165.94 5 3 PRO A 30 ? ? -43.88 165.01 6 4 HIS A 3 ? ? -167.26 59.12 7 4 ASN A 17 ? ? 60.72 67.12 8 4 PRO A 30 ? ? -42.49 162.87 9 5 PRO A 30 ? ? -44.10 166.37 10 6 GLU A 19 ? ? -41.72 152.64 11 6 PRO A 30 ? ? -44.71 160.27 12 7 HIS A 3 ? ? -145.35 30.89 13 7 PRO A 30 ? ? -43.79 162.93 14 8 ASP A 2 ? ? 42.20 -111.10 15 8 PRO A 30 ? ? -42.92 166.64 16 9 LEU A 20 ? ? -45.81 151.42 17 10 ASP A 2 ? ? 41.76 -94.30 18 12 HIS A 3 ? ? -151.53 35.52 19 12 ASN A 17 ? ? 60.49 65.83 20 12 PRO A 30 ? ? -45.85 159.92 21 13 HIS A 3 ? ? -139.12 -95.84 22 13 ASN A 17 ? ? 62.36 67.13 23 13 PRO A 30 ? ? -44.10 165.50 24 14 GLU A 19 ? ? -41.30 151.54 25 14 PRO A 30 ? ? -45.19 160.92 26 15 HIS A 3 ? ? 39.08 42.37 27 15 ASN A 17 ? ? 62.98 66.62 28 15 PRO A 30 ? ? -43.88 164.94 29 16 GLU A 28 ? ? -162.78 105.95 30 16 PRO A 30 ? ? -45.06 155.70 31 17 HIS A 3 ? ? -69.12 73.85 32 17 ASN A 17 ? ? 64.54 67.37 33 17 PRO A 30 ? ? -43.44 167.14 34 18 HIS A 3 ? ? 45.11 85.24 35 18 LEU A 20 ? ? -48.51 150.02 36 18 GLU A 28 ? ? -165.01 108.45 37 19 PRO A 30 ? ? -43.67 167.68 38 20 ASN A 17 ? ? 61.30 65.32 39 20 GLU A 28 ? ? -164.63 109.81 # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR ; # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the lowest energy' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 100 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 20 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2N3G _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2N3G _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '500 uM [U-100% 15N] DRB4(1-72), 90% H2O/10% D2O' 1 '90% H2O/10% D2O' '500 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] DRB4(1-72), 90% H2O/10% D2O' 2 '90% H2O/10% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id 'DRB4(1-72)-1' 500 ? 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6 Goddard 'structure solution' Sparky ? 7 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 'data analysis' Sparky ? 8 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 'structure solution' Sparky ? 9 Goddard 'data analysis' Sparky ? 10 Goddard 'structure solution' Sparky ? 11 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 'data analysis' Sparky ? 12 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 'structure solution' Sparky ? 13 'Laskowski and MacArthur' 'structure validation' ProcheckNMR 3.5.4 14 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' refinement 'X-PLOR NIH' ? 15 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A PRO 73 ? 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