data_2N96
#
_entry.id 2N96
#
_audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic
_audit_conform.dict_version 5.392
_audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic
#
loop_
_database_2.database_code
_database_2.database_id
_database_2.pdbx_database_accession
_database_2.pdbx_DOI
RCSB104579 RCSB ? ?
2N96 PDB pdb_00002n96 10.2210/pdb2n96/pdb
25882 BMRB ? 10.13018/BMR25882
D_1000104579 WWPDB ? ?
#
loop_
_pdbx_audit_revision_history.ordinal
_pdbx_audit_revision_history.data_content_type
_pdbx_audit_revision_history.major_revision
_pdbx_audit_revision_history.minor_revision
_pdbx_audit_revision_history.revision_date
1 'Structure model' 1 0 2016-06-01
2 'Structure model' 1 1 2016-06-08
3 'Structure model' 1 2 2016-06-29
4 'Structure model' 1 3 2021-11-03
5 'Structure model' 1 4 2024-05-15
#
_pdbx_audit_revision_details.ordinal 1
_pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1
_pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model'
_pdbx_audit_revision_details.provider repository
_pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release'
_pdbx_audit_revision_details.description ?
_pdbx_audit_revision_details.details ?
#
loop_
_pdbx_audit_revision_group.ordinal
_pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal
_pdbx_audit_revision_group.data_content_type
_pdbx_audit_revision_group.group
1 2 'Structure model' 'Database references'
2 3 'Structure model' 'Database references'
3 4 'Structure model' 'Data collection'
4 4 'Structure model' 'Database references'
5 4 'Structure model' 'Derived calculations'
6 4 'Structure model' 'Experimental preparation'
7 4 'Structure model' 'Refinement description'
8 4 'Structure model' 'Source and taxonomy'
9 4 'Structure model' 'Structure summary'
10 5 'Structure model' 'Data collection'
11 5 'Structure model' 'Database references'
#
loop_
_pdbx_audit_revision_category.ordinal
_pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal
_pdbx_audit_revision_category.data_content_type
_pdbx_audit_revision_category.category
1 4 'Structure model' chem_comp
2 4 'Structure model' database_2
3 4 'Structure model' entity
4 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly
5 4 'Structure model' pdbx_entity_src_syn
6 4 'Structure model' pdbx_nmr_exptl_sample
7 4 'Structure model' pdbx_nmr_refine
8 4 'Structure model' pdbx_nmr_sample_details
9 4 'Structure model' pdbx_nmr_software
10 4 'Structure model' pdbx_nmr_spectrometer
11 4 'Structure model' struct_site
12 5 'Structure model' chem_comp_atom
13 5 'Structure model' chem_comp_bond
14 5 'Structure model' database_2
#
loop_
_pdbx_audit_revision_item.ordinal
_pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal
_pdbx_audit_revision_item.data_content_type
_pdbx_audit_revision_item.item
1 4 'Structure model' '_chem_comp.name'
2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI'
3 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession'
4 4 'Structure model' '_entity.pdbx_description'
5 4 'Structure model' '_pdbx_entity_nonpoly.name'
6 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_exptl_sample.component'
7 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling'
8 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_refine.software_ordinal'
9 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_sample_details.label'
10 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_sample_details.type'
11 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.classification'
12 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name'
13 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_spectrometer.model'
14 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_spectrometer.type'
15 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id'
16 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id'
17 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id'
18 5 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI'
#
_pdbx_database_status.deposit_site BMRB
_pdbx_database_status.entry_id 2N96
_pdbx_database_status.process_site RCSB
_pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2015-11-07
_pdbx_database_status.SG_entry ?
_pdbx_database_status.status_code REL
_pdbx_database_status.status_code_mr REL
_pdbx_database_status.status_code_sf ?
_pdbx_database_status.status_code_cs REL
_pdbx_database_status.methods_development_category ?
_pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y
_pdbx_database_status.status_code_nmr_data ?
#
_pdbx_database_related.db_id 25882
_pdbx_database_related.db_name BMRB
_pdbx_database_related.content_type unspecified
_pdbx_database_related.details .
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Woo, C.M.' 1
'Li, Z.' 2
'Paulson, E.' 3
'Herzon, S.B.' 4
#
_citation.id primary
_citation.title 'Structural basis for DNA cleavage by the potent antiproliferative agent (-)-lomaiviticin A.'
_citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA
_citation.journal_volume 113
_citation.page_first 2851
_citation.page_last 2856
_citation.year 2016
_citation.journal_id_ASTM PNASA6
_citation.country US
_citation.journal_id_ISSN 0027-8424
_citation.journal_id_CSD 0040
_citation.book_publisher ?
_citation.pdbx_database_id_PubMed 26929332
_citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.1519846113
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
_citation_author.identifier_ORCID
primary 'Woo, C.M.' 1 ?
primary 'Li, Z.' 2 ?
primary 'Paulson, E.K.' 3 ?
primary 'Herzon, S.B.' 4 ?
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.pdbx_ec
_entity.pdbx_mutation
_entity.pdbx_fragment
_entity.details
1 polymer syn
;DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3')
;
2426.617 2 ? ? ? ?
2 non-polymer syn
;(1R,1'R,2S,2'S,3R,3'R,5aR,10aR,11a'S)-2'-[(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)oxy]-2,2'-diethyl-11,11 '-dihydrazinyl-6,6',9,9'-tetrahydroxy-4,4',5,5',10,10'-hexaoxo-1,1'-bis{[2,4,6-trideoxy-4-(dimethylamino)-beta-L-arabino -hexopyranosyl]oxy}[2,2',3,3',4,4',5,5',5a,8,10,10',10a,11a'-tetradecahydro-1H,1'H-[3,3'-bibenzo[b]fluorene]]-2-yl 2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside
;
1375.468 1 ? ? ? ?
#
_entity_poly.entity_id 1
_entity_poly.type polydeoxyribonucleotide
_entity_poly.nstd_linkage no
_entity_poly.nstd_monomer no
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DA)(DG)(DC)'
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can GCTATAGC
_entity_poly.pdbx_strand_id X,Y
_entity_poly.pdbx_target_identifier ?
#
_pdbx_entity_nonpoly.entity_id 2
_pdbx_entity_nonpoly.name
;(1R,1'R,2S,2'S,3R,3'R,5aR,10aR,11a'S)-2'-[(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)oxy]-2,2'-diethyl-11,11 '-dihydrazinyl-6,6',9,9'-tetrahydroxy-4,4',5,5',10,10'-hexaoxo-1,1'-bis{[2,4,6-trideoxy-4-(dimethylamino)-beta-L-arabino -hexopyranosyl]oxy}[2,2',3,3',4,4',5,5',5a,8,10,10',10a,11a'-tetradecahydro-1H,1'H-[3,3'-bibenzo[b]fluorene]]-2-yl 2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside
;
_pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4JF
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 DG n
1 2 DC n
1 3 DT n
1 4 DA n
1 5 DT n
1 6 DA n
1 7 DG n
1 8 DC n
#
_pdbx_entity_src_syn.entity_id 1
_pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1
_pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample
_pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ?
_pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ?
_pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct'
_pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ?
_pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630
_pdbx_entity_src_syn.details ?
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.mon_nstd_flag
_chem_comp.name
_chem_comp.pdbx_synonyms
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
4JF non-polymer .
;(1R,1'R,2S,2'S,3R,3'R,5aR,10aR,11a'S)-2'-[(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)oxy]-2,2'-diethyl-11,11 '-dihydrazinyl-6,6',9,9'-tetrahydroxy-4,4',5,5',10,10'-hexaoxo-1,1'-bis{[2,4,6-trideoxy-4-(dimethylamino)-beta-L-arabino -hexopyranosyl]oxy}[2,2',3,3',4,4',5,5',5a,8,10,10',10a,11a'-tetradecahydro-1H,1'H-[3,3'-bibenzo[b]fluorene]]-2-yl 2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside
;
'Lomaiviticin A' 'C68 H90 N6 O24' 1375.468
DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222
DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197
DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221
DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208
#
loop_
_pdbx_poly_seq_scheme.asym_id
_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
_pdbx_poly_seq_scheme.seq_id
_pdbx_poly_seq_scheme.mon_id
_pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num
_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id
_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
_pdbx_poly_seq_scheme.hetero
A 1 1 DG 1 1 1 DG DG X . n
A 1 2 DC 2 2 2 DC DC X . n
A 1 3 DT 3 3 3 DT DT X . n
A 1 4 DA 4 4 4 DA DA X . n
A 1 5 DT 5 5 5 DT DT X . n
A 1 6 DA 6 6 6 DA DA X . n
A 1 7 DG 7 7 7 DG DG X . n
A 1 8 DC 8 8 8 DC DC X . n
B 1 1 DG 1 9 9 DG DG Y . n
B 1 2 DC 2 10 10 DC DC Y . n
B 1 3 DT 3 11 11 DT DT Y . n
B 1 4 DA 4 12 12 DA DA Y . n
B 1 5 DT 5 13 13 DT DT Y . n
B 1 6 DA 6 14 14 DA DA Y . n
B 1 7 DG 7 15 15 DG DG Y . n
B 1 8 DC 8 16 16 DC DC Y . n
#
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id C
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 2
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id 4JF
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 101
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 17
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id 4JF
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id LOM
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id Y
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code .
#
_exptl.absorpt_coefficient_mu ?
_exptl.absorpt_correction_T_max ?
_exptl.absorpt_correction_T_min ?
_exptl.absorpt_correction_type ?
_exptl.absorpt_process_details ?
_exptl.crystals_number ?
_exptl.details ?
_exptl.entry_id 2N96
_exptl.method 'SOLUTION NMR'
_exptl.method_details ?
#
_struct.entry_id 2N96
_struct.title
;An unexpected mode of small molecule DNA binding provides the structural basis for DNA cleavage by the potent antiproliferative agent (-)-lomaiviticin A
;
_struct.pdbx_model_details 'minimized average structure, model1'
_struct.pdbx_CASP_flag ?
_struct.pdbx_model_type_details 'minimized average'
#
_struct_keywords.entry_id 2N96
_struct_keywords.pdbx_keywords DNA
_struct_keywords.text 'diazofluorene, intercalator, DNA'
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A N N 1 ?
B N N 1 ?
C N N 2 ?
#
_struct_ref.id 1
_struct_ref.db_name PDB
_struct_ref.db_code 2N96
_struct_ref.pdbx_db_accession 2N96
_struct_ref.entity_id 1
_struct_ref.pdbx_align_begin ?
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ?
_struct_ref.pdbx_db_isoform ?
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code
_struct_ref_seq.pdbx_strand_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code
_struct_ref_seq.pdbx_db_accession
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code
_struct_ref_seq.db_align_end
_struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code
_struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg
_struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end
1 1 2N96 X 1 ? 8 ? 2N96 1 ? 8 ? 1 8
2 1 2N96 Y 1 ? 8 ? 2N96 9 ? 16 ? 9 16
#
_pdbx_struct_assembly.id 1
_pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly
_pdbx_struct_assembly.method_details ?
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2
#
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C
#
_pdbx_struct_oper_list.id 1
_pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation'
_pdbx_struct_oper_list.name 1_555
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000
_pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000
#
loop_
_struct_conn.id
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.details
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
_struct_conn.pdbx_role
hydrog1 hydrog ? ? A DG 1 N1 ? ? ? 1_555 B DC 8 N3 ? ? X DG 1 Y DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog2 hydrog ? ? A DG 1 N2 ? ? ? 1_555 B DC 8 O2 ? ? X DG 1 Y DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog3 hydrog ? ? A DG 1 O6 ? ? ? 1_555 B DC 8 N4 ? ? X DG 1 Y DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog4 hydrog ? ? A DC 2 N3 ? ? ? 1_555 B DG 7 N1 ? ? X DC 2 Y DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ?
hydrog5 hydrog ? ? A DT 3 O4 ? ? ? 1_555 B DA 6 N6 ? ? X DT 3 Y DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ?
hydrog6 hydrog ? ? A DA 6 N1 ? ? ? 1_555 B DT 3 N3 ? ? X DA 6 Y DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog7 hydrog ? ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 B DT 3 O4 ? ? X DA 6 Y DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog8 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 B DC 2 N3 ? ? X DG 7 Y DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog9 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 B DC 2 O2 ? ? X DG 7 Y DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog10 hydrog ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 B DC 2 N4 ? ? X DG 7 Y DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog11 hydrog ? ? A DC 8 N3 ? ? ? 1_555 B DG 1 N1 ? ? X DC 8 Y DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog12 hydrog ? ? A DC 8 N4 ? ? ? 1_555 B DG 1 O6 ? ? X DC 8 Y DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
hydrog13 hydrog ? ? A DC 8 O2 ? ? ? 1_555 B DG 1 N2 ? ? X DC 8 Y DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ?
#
_struct_conn_type.id hydrog
_struct_conn_type.criteria ?
_struct_conn_type.reference ?
#
_struct_site.id AC1
_struct_site.pdbx_evidence_code Software
_struct_site.pdbx_auth_asym_id Y
_struct_site.pdbx_auth_comp_id 4JF
_struct_site.pdbx_auth_seq_id 101
_struct_site.pdbx_auth_ins_code ?
_struct_site.pdbx_num_residues 7
_struct_site.details 'BINDING SITE FOR RESIDUE 4JF Y 101'
#
loop_
_struct_site_gen.id
_struct_site_gen.site_id
_struct_site_gen.pdbx_num_res
_struct_site_gen.label_comp_id
_struct_site_gen.label_asym_id
_struct_site_gen.label_seq_id
_struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code
_struct_site_gen.auth_comp_id
_struct_site_gen.auth_asym_id
_struct_site_gen.auth_seq_id
_struct_site_gen.label_atom_id
_struct_site_gen.label_alt_id
_struct_site_gen.symmetry
_struct_site_gen.details
1 AC1 7 DC A 2 ? DC X 2 . ? 1_555 ?
2 AC1 7 DT A 3 ? DT X 3 . ? 1_555 ?
3 AC1 7 DA A 4 ? DA X 4 . ? 1_555 ?
4 AC1 7 DA A 6 ? DA X 6 . ? 1_555 ?
5 AC1 7 DA B 4 ? DA Y 12 . ? 1_555 ?
6 AC1 7 DT B 5 ? DT Y 13 . ? 1_555 ?
7 AC1 7 DA B 6 ? DA Y 14 . ? 1_555 ?
#
loop_
_pdbx_validate_rmsd_bond.id
_pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1
_pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1
_pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2
_pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2
_pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2
_pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2
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121 4 "C5'" Y DC 16 ? ? "C4'" Y DC 16 ? ? 1.615 1.512 0.103 0.007 N
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136 5 "O4'" X DC 8 ? ? "C4'" X DC 8 ? ? 1.383 1.446 -0.063 0.010 N
137 5 N1 X DC 8 ? ? C2 X DC 8 ? ? 1.306 1.397 -0.091 0.010 N
138 5 C4 Y DC 10 ? ? N4 Y DC 10 ? ? 1.249 1.335 -0.086 0.009 N
139 5 P Y DT 11 ? ? "O5'" Y DT 11 ? ? 1.521 1.593 -0.072 0.010 N
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141 5 "O4'" Y DT 11 ? ? "C1'" Y DT 11 ? ? 1.344 1.418 -0.074 0.012 N
142 5 "O3'" Y DT 11 ? ? "C3'" Y DT 11 ? ? 1.359 1.419 -0.060 0.006 N
143 5 N3 Y DT 11 ? ? C4 Y DT 11 ? ? 1.435 1.382 0.053 0.008 N
144 5 N3 Y DA 12 ? ? C4 Y DA 12 ? ? 1.397 1.344 0.053 0.006 N
145 5 "C5'" Y DT 13 ? ? "C4'" Y DT 13 ? ? 1.577 1.512 0.065 0.007 N
146 5 "C3'" Y DA 14 ? ? "C2'" Y DA 14 ? ? 1.456 1.516 -0.060 0.008 N
147 5 N7 Y DA 14 ? ? C8 Y DA 14 ? ? 1.268 1.311 -0.043 0.007 N
148 5 N9 Y DA 14 ? ? C4 Y DA 14 ? ? 1.417 1.374 0.043 0.006 N
149 5 "C5'" Y DG 15 ? ? "C4'" Y DG 15 ? ? 1.585 1.512 0.073 0.007 N
150 5 C4 Y DG 15 ? ? C5 Y DG 15 ? ? 1.423 1.379 0.044 0.007 N
151 5 C6 Y DG 15 ? ? N1 Y DG 15 ? ? 1.338 1.391 -0.053 0.007 N
152 5 "C5'" Y DC 16 ? ? "C4'" Y DC 16 ? ? 1.571 1.512 0.059 0.007 N
153 5 "O3'" Y DC 16 ? ? "C3'" Y DC 16 ? ? 1.364 1.419 -0.055 0.006 N
154 5 C4 Y DC 16 ? ? N4 Y DC 16 ? ? 1.230 1.335 -0.105 0.009 N
155 6 C6 X DG 1 ? ? N1 X DG 1 ? ? 1.326 1.391 -0.065 0.007 N
156 6 P X DC 2 ? ? "O5'" X DC 2 ? ? 1.669 1.593 0.076 0.010 N
157 6 C2 X DC 2 ? ? O2 X DC 2 ? ? 1.184 1.240 -0.056 0.009 N
158 6 N1 X DC 2 ? ? C6 X DC 2 ? ? 1.412 1.367 0.045 0.006 N
159 6 "C5'" X DA 4 ? ? "C4'" X DA 4 ? ? 1.568 1.512 0.056 0.007 N
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169 6 "O4'" X DG 7 ? ? "C4'" X DG 7 ? ? 1.380 1.446 -0.066 0.010 N
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176 6 N1 Y DC 10 ? ? C6 Y DC 10 ? ? 1.406 1.367 0.039 0.006 N
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12 1 "O4'" X DA 4 ? ? "C1'" X DA 4 ? ? "C2'" X DA 4 ? ? 100.93 105.90 -4.97 0.80 N
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72 2 N1 X DT 3 ? ? "C1'" X DT 3 ? ? "C2'" X DT 3 ? ? 123.28 114.30 8.98 1.40 N
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80 2 "C5'" X DT 5 ? ? "C4'" X DT 5 ? ? "C3'" X DT 5 ? ? 124.99 115.70 9.29 1.20 N
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84 2 C6 X DA 6 ? ? N1 X DA 6 ? ? C2 X DA 6 ? ? 114.60 118.60 -4.00 0.60 N
85 2 C4 X DA 6 ? ? C5 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? 111.31 117.00 -5.69 0.50 N
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89 2 "C3'" X DA 6 ? ? "O3'" X DA 6 ? ? P X DG 7 ? ? 127.26 119.70 7.56 1.20 Y
90 2 C6 X DG 7 ? ? N1 X DG 7 ? ? C2 X DG 7 ? ? 121.38 125.10 -3.72 0.60 N
91 2 N3 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? C5 X DG 7 ? ? 123.27 128.60 -5.33 0.50 N
92 2 "O3'" X DG 7 ? ? P X DC 8 ? ? "O5'" X DC 8 ? ? 91.17 104.00 -12.83 1.90 Y
93 2 "O4'" X DC 8 ? ? "C1'" X DC 8 ? ? N1 X DC 8 ? ? 112.34 108.30 4.04 0.30 N
94 2 N1 X DC 8 ? ? C2 X DC 8 ? ? N3 X DC 8 ? ? 126.77 119.20 7.57 0.70 N
95 2 C2 X DC 8 ? ? N3 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? 113.51 119.90 -6.39 0.50 N
96 2 C5 X DC 8 ? ? C6 X DC 8 ? ? N1 X DC 8 ? ? 117.40 121.00 -3.60 0.50 N
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99 2 C5 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? N4 X DC 8 ? ? 125.26 120.20 5.06 0.70 N
100 2 "O4'" Y DG 9 ? ? "C4'" Y DG 9 ? ? "C3'" Y DG 9 ? ? 100.20 104.50 -4.30 0.40 N
101 2 "C3'" Y DG 9 ? ? "C2'" Y DG 9 ? ? "C1'" Y DG 9 ? ? 96.88 102.40 -5.52 0.80 N
102 2 N1 Y DG 9 ? ? C6 Y DG 9 ? ? O6 Y DG 9 ? ? 115.99 119.90 -3.91 0.60 N
103 2 C5 Y DG 9 ? ? C6 Y DG 9 ? ? O6 Y DG 9 ? ? 132.73 128.60 4.13 0.60 N
104 2 "O4'" Y DC 10 ? ? "C4'" Y DC 10 ? ? "C3'" Y DC 10 ? ? 102.07 104.50 -2.43 0.40 N
105 2 "C1'" Y DC 10 ? ? "O4'" Y DC 10 ? ? "C4'" Y DC 10 ? ? 116.35 110.30 6.05 0.70 N
106 2 "O4'" Y DC 10 ? ? "C1'" Y DC 10 ? ? N1 Y DC 10 ? ? 119.44 108.30 11.14 0.30 N
107 2 C2 Y DC 10 ? ? N3 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? 116.36 119.90 -3.54 0.50 N
108 2 N3 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? C5 Y DC 10 ? ? 125.91 121.90 4.01 0.40 N
109 2 C5 Y DC 10 ? ? C6 Y DC 10 ? ? N1 Y DC 10 ? ? 117.40 121.00 -3.60 0.50 N
110 2 "C4'" Y DT 11 ? ? "C3'" Y DT 11 ? ? "C2'" Y DT 11 ? ? 109.32 103.10 6.22 0.90 N
111 2 "C3'" Y DT 11 ? ? "C2'" Y DT 11 ? ? "C1'" Y DT 11 ? ? 97.19 102.40 -5.21 0.80 N
112 2 "O4'" Y DT 11 ? ? "C1'" Y DT 11 ? ? N1 Y DT 11 ? ? 116.01 108.30 7.71 0.30 N
113 2 N3 Y DT 11 ? ? C4 Y DT 11 ? ? C5 Y DT 11 ? ? 118.89 115.20 3.69 0.60 N
114 2 N3 Y DT 11 ? ? C4 Y DT 11 ? ? O4 Y DT 11 ? ? 115.29 119.90 -4.61 0.60 N
115 2 "O4'" Y DA 12 ? ? "C4'" Y DA 12 ? ? "C3'" Y DA 12 ? ? 100.85 104.50 -3.65 0.40 N
116 2 "C5'" Y DA 12 ? ? "C4'" Y DA 12 ? ? "O4'" Y DA 12 ? ? 118.40 109.80 8.60 1.10 N
117 2 "C4'" Y DA 12 ? ? "C3'" Y DA 12 ? ? "C2'" Y DA 12 ? ? 96.49 102.20 -5.71 0.70 N
118 2 "O4'" Y DA 12 ? ? "C1'" Y DA 12 ? ? N9 Y DA 12 ? ? 112.16 108.30 3.86 0.30 N
119 2 C2 Y DA 12 ? ? N3 Y DA 12 ? ? C4 Y DA 12 ? ? 113.64 110.60 3.04 0.50 N
120 2 C4 Y DA 12 ? ? C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? 113.23 117.00 -3.77 0.50 N
121 2 C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N1 Y DA 12 ? ? 122.75 117.70 5.05 0.50 N
122 2 C6 Y DA 12 ? ? C5 Y DA 12 ? ? N7 Y DA 12 ? ? 138.12 132.30 5.82 0.70 N
123 2 N1 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N6 Y DA 12 ? ? 112.57 118.60 -6.03 0.60 N
124 2 "O5'" Y DT 13 ? ? P Y DT 13 ? ? OP1 Y DT 13 ? ? 100.14 105.70 -5.56 0.90 N
125 2 "O5'" Y DT 13 ? ? "C5'" Y DT 13 ? ? "C4'" Y DT 13 ? ? 103.83 109.40 -5.57 0.80 N
126 2 "O4'" Y DT 13 ? ? "C4'" Y DT 13 ? ? "C3'" Y DT 13 ? ? 109.95 106.00 3.95 0.60 N
127 2 "O4'" Y DT 13 ? ? "C1'" Y DT 13 ? ? N1 Y DT 13 ? ? 116.79 108.30 8.49 0.30 N
128 2 N3 Y DT 13 ? ? C4 Y DT 13 ? ? O4 Y DT 13 ? ? 112.59 119.90 -7.31 0.60 N
129 2 C5 Y DT 13 ? ? C4 Y DT 13 ? ? O4 Y DT 13 ? ? 132.42 124.90 7.52 0.70 N
130 2 C4 Y DT 13 ? ? C5 Y DT 13 ? ? C7 Y DT 13 ? ? 113.93 119.00 -5.07 0.60 N
131 2 "C3'" Y DA 14 ? ? "C2'" Y DA 14 ? ? "C1'" Y DA 14 ? ? 96.37 102.40 -6.03 0.80 N
132 2 "O4'" Y DA 14 ? ? "C1'" Y DA 14 ? ? N9 Y DA 14 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N
133 2 C6 Y DA 14 ? ? N1 Y DA 14 ? ? C2 Y DA 14 ? ? 113.41 118.60 -5.19 0.60 N
134 2 C5 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? N1 Y DA 14 ? ? 122.72 117.70 5.02 0.50 N
135 2 N1 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? N6 Y DA 14 ? ? 111.81 118.60 -6.79 0.60 N
136 2 "O4'" Y DG 15 ? ? "C4'" Y DG 15 ? ? "C3'" Y DG 15 ? ? 110.53 106.00 4.53 0.60 N
137 2 "C4'" Y DG 15 ? ? "C3'" Y DG 15 ? ? "C2'" Y DG 15 ? ? 96.61 102.20 -5.59 0.70 N
138 2 "O4'" Y DG 15 ? ? "C1'" Y DG 15 ? ? "C2'" Y DG 15 ? ? 97.12 105.90 -8.78 0.80 N
139 2 "O4'" Y DG 15 ? ? "C1'" Y DG 15 ? ? N9 Y DG 15 ? ? 115.85 108.30 7.55 0.30 N
140 2 C4 Y DG 15 ? ? C5 Y DG 15 ? ? C6 Y DG 15 ? ? 114.32 118.80 -4.48 0.60 N
141 2 C5 Y DG 15 ? ? C6 Y DG 15 ? ? N1 Y DG 15 ? ? 116.75 111.50 5.25 0.50 N
142 2 C4 Y DG 15 ? ? C5 Y DG 15 ? ? N7 Y DG 15 ? ? 113.21 110.80 2.41 0.40 N
143 2 N1 Y DG 15 ? ? C6 Y DG 15 ? ? O6 Y DG 15 ? ? 112.45 119.90 -7.45 0.60 N
144 2 N1 Y DC 16 ? ? C2 Y DC 16 ? ? O2 Y DC 16 ? ? 124.59 118.90 5.69 0.60 N
145 2 N3 Y DC 16 ? ? C2 Y DC 16 ? ? O2 Y DC 16 ? ? 114.87 121.90 -7.03 0.70 N
146 3 "O4'" X DG 1 ? ? "C1'" X DG 1 ? ? N9 X DG 1 ? ? 118.80 108.30 10.50 0.30 N
147 3 N7 X DG 1 ? ? C8 X DG 1 ? ? N9 X DG 1 ? ? 116.16 113.10 3.06 0.50 N
148 3 C8 X DG 1 ? ? N9 X DG 1 ? ? C4 X DG 1 ? ? 103.52 106.40 -2.88 0.40 N
149 3 N1 X DG 1 ? ? C6 X DG 1 ? ? O6 X DG 1 ? ? 116.09 119.90 -3.81 0.60 N
150 3 "O4'" X DC 2 ? ? "C4'" X DC 2 ? ? "C3'" X DC 2 ? ? 110.63 106.00 4.63 0.60 N
151 3 "C5'" X DC 2 ? ? "C4'" X DC 2 ? ? "O4'" X DC 2 ? ? 117.41 109.80 7.61 1.10 N
152 3 C2 X DC 2 ? ? N3 X DC 2 ? ? C4 X DC 2 ? ? 116.34 119.90 -3.56 0.50 N
153 3 N3 X DC 2 ? ? C2 X DC 2 ? ? O2 X DC 2 ? ? 115.96 121.90 -5.94 0.70 N
154 3 "O4'" X DT 3 ? ? "C1'" X DT 3 ? ? N1 X DT 3 ? ? 111.46 108.30 3.16 0.30 N
155 3 N1 X DT 3 ? ? C2 X DT 3 ? ? O2 X DT 3 ? ? 130.44 123.10 7.34 0.80 N
156 3 N3 X DT 3 ? ? C2 X DT 3 ? ? O2 X DT 3 ? ? 116.30 122.30 -6.00 0.60 N
157 3 C6 X DT 3 ? ? C5 X DT 3 ? ? C7 X DT 3 ? ? 117.99 122.90 -4.91 0.60 N
158 3 "C3'" X DA 4 ? ? "C2'" X DA 4 ? ? "C1'" X DA 4 ? ? 97.36 102.40 -5.04 0.80 N
159 3 "O4'" X DA 4 ? ? "C1'" X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? 112.52 108.30 4.22 0.30 N
160 3 N1 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? N6 X DA 4 ? ? 114.90 118.60 -3.70 0.60 N
161 3 N1 X DT 5 ? ? C2 X DT 5 ? ? N3 X DT 5 ? ? 118.58 114.60 3.98 0.60 N
162 3 C6 X DA 6 ? ? N1 X DA 6 ? ? C2 X DA 6 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N
163 3 C4 X DA 6 ? ? C5 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? 112.83 117.00 -4.17 0.50 N
164 3 C5 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? N1 X DA 6 ? ? 125.29 117.70 7.59 0.50 N
165 3 C5 X DA 6 ? ? N7 X DA 6 ? ? C8 X DA 6 ? ? 100.49 103.90 -3.41 0.50 N
166 3 N1 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? N6 X DA 6 ? ? 109.21 118.60 -9.39 0.60 N
167 3 "O4'" X DG 7 ? ? "C4'" X DG 7 ? ? "C3'" X DG 7 ? ? 110.87 106.00 4.87 0.60 N
168 3 C4 X DG 7 ? ? C5 X DG 7 ? ? C6 X DG 7 ? ? 115.20 118.80 -3.60 0.60 N
169 3 C5 X DG 7 ? ? C6 X DG 7 ? ? N1 X DG 7 ? ? 115.06 111.50 3.56 0.50 N
170 3 C8 X DG 7 ? ? N9 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N
171 3 C6 X DG 7 ? ? C5 X DG 7 ? ? N7 X DG 7 ? ? 134.13 130.40 3.73 0.60 N
172 3 N3 X DG 7 ? ? C2 X DG 7 ? ? N2 X DG 7 ? ? 115.23 119.90 -4.67 0.70 N
173 3 N1 X DG 7 ? ? C6 X DG 7 ? ? O6 X DG 7 ? ? 113.71 119.90 -6.19 0.60 N
174 3 "C4'" X DC 8 ? ? "C3'" X DC 8 ? ? "C2'" X DC 8 ? ? 97.66 102.20 -4.54 0.70 N
175 3 "O4'" X DC 8 ? ? "C1'" X DC 8 ? ? N1 X DC 8 ? ? 114.01 108.30 5.71 0.30 N
176 3 C6 X DC 8 ? ? N1 X DC 8 ? ? C2 X DC 8 ? ? 116.51 120.30 -3.79 0.40 N
177 3 N3 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? C5 X DC 8 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.40 N
178 3 C5 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? N4 X DC 8 ? ? 115.44 120.20 -4.76 0.70 N
179 3 "C5'" Y DG 9 ? ? "C4'" Y DG 9 ? ? "C3'" Y DG 9 ? ? 124.68 115.70 8.98 1.20 N
180 3 "O4'" Y DG 9 ? ? "C1'" Y DG 9 ? ? "C2'" Y DG 9 ? ? 95.13 105.90 -10.77 0.80 N
181 3 C4 Y DG 9 ? ? C5 Y DG 9 ? ? N7 Y DG 9 ? ? 106.70 110.80 -4.10 0.40 N
182 3 C8 Y DG 9 ? ? N9 Y DG 9 ? ? C4 Y DG 9 ? ? 103.11 106.40 -3.29 0.40 N
183 3 "O4'" Y DC 10 ? ? "C1'" Y DC 10 ? ? "C2'" Y DC 10 ? ? 99.67 105.90 -6.23 0.80 N
184 3 "O4'" Y DC 10 ? ? "C1'" Y DC 10 ? ? N1 Y DC 10 ? ? 115.68 108.30 7.38 0.30 N
185 3 N3 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? N4 Y DC 10 ? ? 112.66 118.00 -5.34 0.70 N
186 3 C5 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? N4 Y DC 10 ? ? 126.47 120.20 6.27 0.70 N
187 3 "O4'" Y DT 11 ? ? "C4'" Y DT 11 ? ? "C3'" Y DT 11 ? ? 110.33 106.00 4.33 0.60 N
188 3 C5 Y DT 11 ? ? C6 Y DT 11 ? ? N1 Y DT 11 ? ? 119.39 123.70 -4.31 0.60 N
189 3 C6 Y DT 11 ? ? C5 Y DT 11 ? ? C7 Y DT 11 ? ? 117.77 122.90 -5.13 0.60 N
190 3 "C3'" Y DT 11 ? ? "O3'" Y DT 11 ? ? P Y DA 12 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y
191 3 "O4'" Y DA 12 ? ? "C4'" Y DA 12 ? ? "C3'" Y DA 12 ? ? 111.30 106.00 5.30 0.60 N
192 3 "C1'" Y DA 12 ? ? "O4'" Y DA 12 ? ? "C4'" Y DA 12 ? ? 103.47 110.10 -6.63 1.00 N
193 3 "O4'" Y DA 12 ? ? "C1'" Y DA 12 ? ? N9 Y DA 12 ? ? 116.31 108.30 8.01 0.30 N
194 3 C4 Y DA 12 ? ? C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? 112.67 117.00 -4.33 0.50 N
195 3 C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N1 Y DA 12 ? ? 123.15 117.70 5.45 0.50 N
196 3 C6 Y DA 12 ? ? C5 Y DA 12 ? ? N7 Y DA 12 ? ? 138.16 132.30 5.86 0.70 N
197 3 N1 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N6 Y DA 12 ? ? 110.06 118.60 -8.54 0.60 N
198 3 "O4'" Y DT 13 ? ? "C1'" Y DT 13 ? ? N1 Y DT 13 ? ? 117.50 108.30 9.20 0.30 N
199 3 N1 Y DT 13 ? ? C2 Y DT 13 ? ? N3 Y DT 13 ? ? 118.23 114.60 3.63 0.60 N
200 3 C2 Y DT 13 ? ? N3 Y DT 13 ? ? C4 Y DT 13 ? ? 122.05 127.20 -5.15 0.60 N
201 3 C4 Y DT 13 ? ? C5 Y DT 13 ? ? C6 Y DT 13 ? ? 123.01 118.00 5.01 0.60 N
202 3 C5 Y DT 13 ? ? C6 Y DT 13 ? ? N1 Y DT 13 ? ? 119.11 123.70 -4.59 0.60 N
203 3 N3 Y DT 13 ? ? C4 Y DT 13 ? ? O4 Y DT 13 ? ? 115.96 119.90 -3.94 0.60 N
204 3 C5 Y DT 13 ? ? C4 Y DT 13 ? ? O4 Y DT 13 ? ? 129.67 124.90 4.77 0.70 N
205 3 "C3'" Y DT 13 ? ? "O3'" Y DT 13 ? ? P Y DA 14 ? ? 127.49 119.70 7.79 1.20 Y
206 3 "O4'" Y DA 14 ? ? "C1'" Y DA 14 ? ? N9 Y DA 14 ? ? 112.12 108.30 3.82 0.30 N
207 3 C6 Y DA 14 ? ? N1 Y DA 14 ? ? C2 Y DA 14 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N
208 3 N3 Y DA 14 ? ? C4 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? 131.86 126.80 5.06 0.70 N
209 3 C4 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? 108.52 117.00 -8.48 0.50 N
210 3 C5 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? N1 Y DA 14 ? ? 125.25 117.70 7.55 0.50 N
211 3 N3 Y DA 14 ? ? C4 Y DA 14 ? ? N9 Y DA 14 ? ? 122.31 127.40 -5.09 0.80 N
212 3 C6 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? N7 Y DA 14 ? ? 138.57 132.30 6.27 0.70 N
213 3 N1 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? N6 Y DA 14 ? ? 110.20 118.60 -8.40 0.60 N
214 3 "O4'" Y DG 15 ? ? "C4'" Y DG 15 ? ? "C3'" Y DG 15 ? ? 110.06 106.00 4.06 0.60 N
215 3 "O4'" Y DG 15 ? ? "C1'" Y DG 15 ? ? N9 Y DG 15 ? ? 114.37 108.30 6.07 0.30 N
216 3 C6 Y DG 15 ? ? N1 Y DG 15 ? ? C2 Y DG 15 ? ? 120.20 125.10 -4.90 0.60 N
217 3 N1 Y DG 15 ? ? C2 Y DG 15 ? ? N3 Y DG 15 ? ? 129.96 123.90 6.06 0.60 N
218 3 C5 Y DG 15 ? ? C6 Y DG 15 ? ? N1 Y DG 15 ? ? 115.34 111.50 3.84 0.50 N
219 3 C4 Y DG 15 ? ? C5 Y DG 15 ? ? N7 Y DG 15 ? ? 107.73 110.80 -3.07 0.40 N
220 3 C6 Y DG 15 ? ? C5 Y DG 15 ? ? N7 Y DG 15 ? ? 136.13 130.40 5.73 0.60 N
221 3 C2 Y DC 16 ? ? N3 Y DC 16 ? ? C4 Y DC 16 ? ? 112.78 119.90 -7.12 0.50 N
222 3 N3 Y DC 16 ? ? C4 Y DC 16 ? ? C5 Y DC 16 ? ? 128.61 121.90 6.71 0.40 N
223 3 C5 Y DC 16 ? ? C6 Y DC 16 ? ? N1 Y DC 16 ? ? 115.42 121.00 -5.58 0.50 N
224 3 N1 Y DC 16 ? ? C2 Y DC 16 ? ? O2 Y DC 16 ? ? 123.93 118.90 5.03 0.60 N
225 3 N3 Y DC 16 ? ? C2 Y DC 16 ? ? O2 Y DC 16 ? ? 113.40 121.90 -8.50 0.70 N
226 3 N3 Y DC 16 ? ? C4 Y DC 16 ? ? N4 Y DC 16 ? ? 113.34 118.00 -4.66 0.70 N
227 4 "C1'" X DG 1 ? ? "O4'" X DG 1 ? ? "C4'" X DG 1 ? ? 103.48 110.10 -6.62 1.00 N
228 4 "O4'" X DG 1 ? ? "C1'" X DG 1 ? ? "C2'" X DG 1 ? ? 100.12 105.90 -5.78 0.80 N
229 4 "O4'" X DG 1 ? ? "C1'" X DG 1 ? ? N9 X DG 1 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N
230 4 "O4'" X DC 2 ? ? "C1'" X DC 2 ? ? N1 X DC 2 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N
231 4 C6 X DC 2 ? ? N1 X DC 2 ? ? C2 X DC 2 ? ? 117.77 120.30 -2.53 0.40 N
232 4 C6 X DT 3 ? ? N1 X DT 3 ? ? C2 X DT 3 ? ? 117.27 121.30 -4.03 0.50 N
233 4 N1 X DT 3 ? ? C2 X DT 3 ? ? N3 X DT 3 ? ? 120.06 114.60 5.46 0.60 N
234 4 C2 X DT 3 ? ? N3 X DT 3 ? ? C4 X DT 3 ? ? 121.57 127.20 -5.63 0.60 N
235 4 N3 X DT 3 ? ? C2 X DT 3 ? ? O2 X DT 3 ? ? 116.04 122.30 -6.26 0.60 N
236 4 "O4'" X DA 4 ? ? "C4'" X DA 4 ? ? "C3'" X DA 4 ? ? 110.48 106.00 4.48 0.60 N
237 4 "C1'" X DA 4 ? ? "O4'" X DA 4 ? ? "C4'" X DA 4 ? ? 104.00 110.10 -6.10 1.00 N
238 4 "C4'" X DA 4 ? ? "C3'" X DA 4 ? ? "C2'" X DA 4 ? ? 96.51 102.20 -5.69 0.70 N
239 4 "O4'" X DA 4 ? ? "C1'" X DA 4 ? ? "C2'" X DA 4 ? ? 99.43 105.90 -6.47 0.80 N
240 4 "O4'" X DA 4 ? ? "C1'" X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N
241 4 C4 X DA 4 ? ? C5 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? 113.34 117.00 -3.66 0.50 N
242 4 C5 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? N1 X DA 4 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N
243 4 C5 X DA 4 ? ? N7 X DA 4 ? ? C8 X DA 4 ? ? 99.82 103.90 -4.08 0.50 N
244 4 N7 X DA 4 ? ? C8 X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? 118.69 113.80 4.89 0.50 N
245 4 C8 X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? C4 X DA 4 ? ? 102.69 105.80 -3.11 0.40 N
246 4 N1 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? N6 X DA 4 ? ? 114.05 118.60 -4.55 0.60 N
247 4 "O4'" X DT 5 ? ? "C1'" X DT 5 ? ? N1 X DT 5 ? ? 103.58 108.00 -4.42 0.70 N
248 4 C4 X DT 5 ? ? C5 X DT 5 ? ? C6 X DT 5 ? ? 123.32 118.00 5.32 0.60 N
249 4 C5 X DT 5 ? ? C6 X DT 5 ? ? N1 X DT 5 ? ? 119.72 123.70 -3.98 0.60 N
250 4 C4 X DT 5 ? ? C5 X DT 5 ? ? C7 X DT 5 ? ? 125.32 119.00 6.32 0.60 N
251 4 C6 X DT 5 ? ? C5 X DT 5 ? ? C7 X DT 5 ? ? 110.65 122.90 -12.25 0.60 N
252 4 "C3'" X DA 6 ? ? "C2'" X DA 6 ? ? "C1'" X DA 6 ? ? 96.83 102.40 -5.57 0.80 N
253 4 "O4'" X DA 6 ? ? "C1'" X DA 6 ? ? "C2'" X DA 6 ? ? 111.91 106.80 5.11 0.50 N
254 4 C4 X DA 6 ? ? C5 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? 111.87 117.00 -5.13 0.50 N
255 4 C5 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? N1 X DA 6 ? ? 122.48 117.70 4.78 0.50 N
256 4 C4 X DA 6 ? ? C5 X DA 6 ? ? N7 X DA 6 ? ? 114.30 110.70 3.60 0.50 N
257 4 C8 X DA 6 ? ? N9 X DA 6 ? ? C4 X DA 6 ? ? 109.35 105.80 3.55 0.40 N
258 4 N9 X DA 6 ? ? C4 X DA 6 ? ? C5 X DA 6 ? ? 101.37 105.80 -4.43 0.40 N
259 4 N1 X DA 6 ? ? C6 X DA 6 ? ? N6 X DA 6 ? ? 111.36 118.60 -7.24 0.60 N
260 4 "C3'" X DG 7 ? ? "C2'" X DG 7 ? ? "C1'" X DG 7 ? ? 97.02 102.40 -5.38 0.80 N
261 4 "O4'" X DG 7 ? ? "C1'" X DG 7 ? ? "C2'" X DG 7 ? ? 110.20 106.80 3.40 0.50 N
262 4 "O4'" X DG 7 ? ? "C1'" X DG 7 ? ? N9 X DG 7 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N
263 4 C2 X DG 7 ? ? N3 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? 119.10 111.90 7.20 0.50 N
264 4 N3 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? C5 X DG 7 ? ? 122.29 128.60 -6.31 0.50 N
265 4 C5 X DG 7 ? ? C6 X DG 7 ? ? N1 X DG 7 ? ? 115.91 111.50 4.41 0.50 N
266 4 C8 X DG 7 ? ? N9 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? 103.15 106.40 -3.25 0.40 N
267 4 N9 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? C5 X DG 7 ? ? 108.27 105.40 2.87 0.40 N
268 4 N1 X DG 7 ? ? C6 X DG 7 ? ? O6 X DG 7 ? ? 114.94 119.90 -4.96 0.60 N
269 4 C2 X DC 8 ? ? N3 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? 114.68 119.90 -5.22 0.50 N
270 4 N3 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? C5 X DC 8 ? ? 128.12 121.90 6.22 0.40 N
271 4 C5 X DC 8 ? ? C6 X DC 8 ? ? N1 X DC 8 ? ? 117.50 121.00 -3.50 0.50 N
272 4 N3 X DC 8 ? ? C2 X DC 8 ? ? O2 X DC 8 ? ? 116.06 121.90 -5.84 0.70 N
273 4 N3 X DC 8 ? ? C4 X DC 8 ? ? N4 X DC 8 ? ? 112.71 118.00 -5.29 0.70 N
274 4 "O4'" Y DG 9 ? ? "C1'" Y DG 9 ? ? N9 Y DG 9 ? ? 116.09 108.30 7.79 0.30 N
275 4 C4 Y DG 9 ? ? C5 Y DG 9 ? ? N7 Y DG 9 ? ? 114.77 110.80 3.97 0.40 N
276 4 C5 Y DG 9 ? ? N7 Y DG 9 ? ? C8 Y DG 9 ? ? 99.51 104.30 -4.79 0.50 N
277 4 N9 Y DG 9 ? ? C4 Y DG 9 ? ? C5 Y DG 9 ? ? 101.80 105.40 -3.60 0.40 N
278 4 N3 Y DG 9 ? ? C4 Y DG 9 ? ? N9 Y DG 9 ? ? 131.61 126.00 5.61 0.60 N
279 4 N3 Y DG 9 ? ? C2 Y DG 9 ? ? N2 Y DG 9 ? ? 114.18 119.90 -5.72 0.70 N
280 4 "O4'" Y DC 10 ? ? "C4'" Y DC 10 ? ? "C3'" Y DC 10 ? ? 111.05 106.00 5.05 0.60 N
281 4 "O4'" Y DC 10 ? ? "C1'" Y DC 10 ? ? N1 Y DC 10 ? ? 115.58 108.30 7.28 0.30 N
282 4 "O4'" Y DT 11 ? ? "C1'" Y DT 11 ? ? N1 Y DT 11 ? ? 113.56 108.30 5.26 0.30 N
283 4 C5 Y DT 11 ? ? C6 Y DT 11 ? ? N1 Y DT 11 ? ? 119.53 123.70 -4.17 0.60 N
284 4 N3 Y DT 11 ? ? C2 Y DT 11 ? ? O2 Y DT 11 ? ? 118.58 122.30 -3.72 0.60 N
285 4 C4 Y DT 11 ? ? C5 Y DT 11 ? ? C7 Y DT 11 ? ? 125.15 119.00 6.15 0.60 N
286 4 C6 Y DT 11 ? ? C5 Y DT 11 ? ? C7 Y DT 11 ? ? 115.52 122.90 -7.38 0.60 N
287 4 "C1'" Y DA 12 ? ? "O4'" Y DA 12 ? ? "C4'" Y DA 12 ? ? 101.93 110.10 -8.17 1.00 N
288 4 "O4'" Y DA 12 ? ? "C1'" Y DA 12 ? ? N9 Y DA 12 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N
289 4 C4 Y DA 12 ? ? C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? 111.79 117.00 -5.21 0.50 N
290 4 C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N1 Y DA 12 ? ? 124.88 117.70 7.18 0.50 N
291 4 C5 Y DA 12 ? ? N7 Y DA 12 ? ? C8 Y DA 12 ? ? 98.55 103.90 -5.35 0.50 N
292 4 N7 Y DA 12 ? ? C8 Y DA 12 ? ? N9 Y DA 12 ? ? 117.70 113.80 3.90 0.50 N
293 4 C8 Y DA 12 ? ? N9 Y DA 12 ? ? C4 Y DA 12 ? ? 103.03 105.80 -2.77 0.40 N
294 4 N9 Y DA 12 ? ? C4 Y DA 12 ? ? C5 Y DA 12 ? ? 108.56 105.80 2.76 0.40 N
295 4 N1 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N6 Y DA 12 ? ? 108.83 118.60 -9.77 0.60 N
296 4 "O4'" Y DT 13 ? ? "C1'" Y DT 13 ? ? "C2'" Y DT 13 ? ? 100.10 105.90 -5.80 0.80 N
297 4 "O4'" Y DT 13 ? ? "C1'" Y DT 13 ? ? N1 Y DT 13 ? ? 116.18 108.30 7.88 0.30 N
298 4 C6 Y DT 13 ? ? N1 Y DT 13 ? ? C2 Y DT 13 ? ? 117.79 121.30 -3.51 0.50 N
299 4 N1 Y DT 13 ? ? C2 Y DT 13 ? ? N3 Y DT 13 ? ? 119.40 114.60 4.80 0.60 N
300 4 C2 Y DT 13 ? ? N3 Y DT 13 ? ? C4 Y DT 13 ? ? 121.36 127.20 -5.84 0.60 N
301 4 "O4'" Y DA 14 ? ? "C1'" Y DA 14 ? ? N9 Y DA 14 ? ? 114.54 108.30 6.24 0.30 N
302 4 C2 Y DA 14 ? ? N3 Y DA 14 ? ? C4 Y DA 14 ? ? 114.70 110.60 4.10 0.50 N
303 4 N3 Y DA 14 ? ? C4 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? 122.39 126.80 -4.41 0.70 N
304 4 C5 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? N1 Y DA 14 ? ? 121.73 117.70 4.03 0.50 N
305 4 C4 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? N7 Y DA 14 ? ? 107.34 110.70 -3.36 0.50 N
306 4 N3 Y DG 15 ? ? C4 Y DG 15 ? ? C5 Y DG 15 ? ? 124.47 128.60 -4.13 0.50 N
307 4 C5 Y DG 15 ? ? N7 Y DG 15 ? ? C8 Y DG 15 ? ? 100.13 104.30 -4.17 0.50 N
308 4 N7 Y DG 15 ? ? C8 Y DG 15 ? ? N9 Y DG 15 ? ? 116.45 113.10 3.35 0.50 N
309 4 C8 Y DG 15 ? ? N9 Y DG 15 ? ? C4 Y DG 15 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N
310 4 "C3'" Y DG 15 ? ? "O3'" Y DG 15 ? ? P Y DC 16 ? ? 130.21 119.70 10.51 1.20 Y
311 4 "O4'" Y DC 16 ? ? "C1'" Y DC 16 ? ? N1 Y DC 16 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N
312 4 N3 Y DC 16 ? ? C4 Y DC 16 ? ? C5 Y DC 16 ? ? 124.49 121.90 2.59 0.40 N
313 4 C5 Y DC 16 ? ? C6 Y DC 16 ? ? N1 Y DC 16 ? ? 117.35 121.00 -3.65 0.50 N
314 4 N1 Y DC 16 ? ? C2 Y DC 16 ? ? O2 Y DC 16 ? ? 123.94 118.90 5.04 0.60 N
315 4 N3 Y DC 16 ? ? C2 Y DC 16 ? ? O2 Y DC 16 ? ? 116.84 121.90 -5.06 0.70 N
316 4 N3 Y DC 16 ? ? C4 Y DC 16 ? ? N4 Y DC 16 ? ? 113.23 118.00 -4.77 0.70 N
317 5 "O4'" X DG 1 ? ? "C1'" X DG 1 ? ? N9 X DG 1 ? ? 114.08 108.30 5.78 0.30 N
318 5 C2 X DG 1 ? ? N3 X DG 1 ? ? C4 X DG 1 ? ? 115.44 111.90 3.54 0.50 N
319 5 N3 X DG 1 ? ? C4 X DG 1 ? ? C5 X DG 1 ? ? 123.82 128.60 -4.78 0.50 N
320 5 C8 X DG 1 ? ? N9 X DG 1 ? ? C4 X DG 1 ? ? 103.36 106.40 -3.04 0.40 N
321 5 N9 X DG 1 ? ? C4 X DG 1 ? ? C5 X DG 1 ? ? 107.82 105.40 2.42 0.40 N
322 5 N1 X DG 1 ? ? C6 X DG 1 ? ? O6 X DG 1 ? ? 115.89 119.90 -4.01 0.60 N
323 5 "C5'" X DC 2 ? ? "C4'" X DC 2 ? ? "O4'" X DC 2 ? ? 119.14 109.80 9.34 1.10 N
324 5 "O4'" X DC 2 ? ? "C1'" X DC 2 ? ? N1 X DC 2 ? ? 117.75 108.30 9.45 0.30 N
325 5 N1 X DC 2 ? ? C2 X DC 2 ? ? O2 X DC 2 ? ? 125.87 118.90 6.97 0.60 N
326 5 N3 X DC 2 ? ? C2 X DC 2 ? ? O2 X DC 2 ? ? 114.24 121.90 -7.66 0.70 N
327 5 "O4'" X DT 3 ? ? "C1'" X DT 3 ? ? N1 X DT 3 ? ? 117.79 108.30 9.49 0.30 N
328 5 C6 X DT 3 ? ? N1 X DT 3 ? ? C2 X DT 3 ? ? 116.59 121.30 -4.71 0.50 N
329 5 "O4'" X DA 4 ? ? "C1'" X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? 118.90 108.30 10.60 0.30 N
330 5 C4 X DA 4 ? ? C5 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? 113.60 117.00 -3.40 0.50 N
331 5 C5 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? N1 X DA 4 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N
332 5 C4 X DA 4 ? ? C5 X DA 4 ? ? N7 X DA 4 ? ? 114.20 110.70 3.50 0.50 N
333 5 C5 X DA 4 ? ? N7 X DA 4 ? ? C8 X DA 4 ? ? 100.49 103.90 -3.41 0.50 N
334 5 C8 X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? C4 X DA 4 ? ? 108.94 105.80 3.14 0.40 N
335 5 N9 X DA 4 ? ? C4 X DA 4 ? ? C5 X DA 4 ? ? 102.27 105.80 -3.53 0.40 N
336 5 N3 X DA 4 ? ? C4 X DA 4 ? ? N9 X DA 4 ? ? 132.55 127.40 5.15 0.80 N
337 5 N1 X DA 4 ? ? C6 X DA 4 ? ? N6 X DA 4 ? ? 113.30 118.60 -5.30 0.60 N
338 5 "C3'" X DT 5 ? ? "C2'" X DT 5 ? ? "C1'" X DT 5 ? ? 111.41 102.50 8.91 1.20 N
339 5 "O4'" X DT 5 ? ? "C1'" X DT 5 ? ? N1 X DT 5 ? ? 112.94 108.30 4.64 0.30 N
340 5 "O4'" X DA 6 ? ? "C4'" X DA 6 ? ? "C3'" X DA 6 ? ? 113.74 106.00 7.74 0.60 N
341 5 "C4'" X DA 6 ? ? "C3'" X DA 6 ? ? "C2'" X DA 6 ? ? 95.52 102.20 -6.68 0.70 N
342 5 N1 X DA 6 ? ? C2 X DA 6 ? ? N3 X DA 6 ? ? 125.05 129.30 -4.25 0.50 N
343 5 N7 X DG 7 ? ? C8 X DG 7 ? ? N9 X DG 7 ? ? 117.48 113.10 4.38 0.50 N
344 5 C8 X DG 7 ? ? N9 X DG 7 ? ? C4 X DG 7 ? ? 102.50 106.40 -3.90 0.40 N
345 5 N1 X DG 7 ? ? C2 X DG 7 ? ? N2 X DG 7 ? ? 121.90 116.20 5.70 0.90 N
346 5 N3 X DG 7 ? ? C2 X DG 7 ? ? N2 X DG 7 ? ? 113.89 119.90 -6.01 0.70 N
347 5 "C3'" X DC 8 ? ? "C2'" X DC 8 ? ? "C1'" X DC 8 ? ? 97.11 102.40 -5.29 0.80 N
348 5 "O4'" X DC 8 ? ? "C1'" X DC 8 ? ? N1 X DC 8 ? ? 113.79 108.30 5.49 0.30 N
349 5 N1 X DC 8 ? ? C2 X DC 8 ? ? O2 X DC 8 ? ? 122.89 118.90 3.99 0.60 N
350 5 N3 X DC 8 ? ? C2 X DC 8 ? ? O2 X DC 8 ? ? 115.66 121.90 -6.24 0.70 N
351 5 "O4'" Y DG 9 ? ? "C1'" Y DG 9 ? ? N9 Y DG 9 ? ? 113.78 108.30 5.48 0.30 N
352 5 C2 Y DG 9 ? ? N3 Y DG 9 ? ? C4 Y DG 9 ? ? 114.92 111.90 3.02 0.50 N
353 5 N3 Y DG 9 ? ? C4 Y DG 9 ? ? C5 Y DG 9 ? ? 124.01 128.60 -4.59 0.50 N
354 5 C4 Y DG 9 ? ? C5 Y DG 9 ? ? N7 Y DG 9 ? ? 105.03 110.80 -5.77 0.40 N
355 5 C5 Y DG 9 ? ? N7 Y DG 9 ? ? C8 Y DG 9 ? ? 109.56 104.30 5.26 0.50 N
356 5 C6 Y DG 9 ? ? C5 Y DG 9 ? ? N7 Y DG 9 ? ? 134.19 130.40 3.79 0.60 N
357 5 "O5'" Y DC 10 ? ? "C5'" Y DC 10 ? ? "C4'" Y DC 10 ? ? 100.87 109.40 -8.53 0.80 N
358 5 "O4'" Y DC 10 ? ? "C1'" Y DC 10 ? ? "C2'" Y DC 10 ? ? 109.85 106.80 3.05 0.50 N
359 5 C2 Y DC 10 ? ? N3 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? 115.71 119.90 -4.19 0.50 N
360 5 N3 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? C5 Y DC 10 ? ? 125.97 121.90 4.07 0.40 N
361 5 N1 Y DC 10 ? ? C2 Y DC 10 ? ? O2 Y DC 10 ? ? 126.12 118.90 7.22 0.60 N
362 5 N3 Y DC 10 ? ? C2 Y DC 10 ? ? O2 Y DC 10 ? ? 114.51 121.90 -7.39 0.70 N
363 5 N3 Y DC 10 ? ? C4 Y DC 10 ? ? N4 Y DC 10 ? ? 110.56 118.00 -7.44 0.70 N
364 5 "O4'" Y DT 11 ? ? "C1'" Y DT 11 ? ? N1 Y DT 11 ? ? 117.34 108.30 9.04 0.30 N
365 5 C6 Y DT 11 ? ? N1 Y DT 11 ? ? C2 Y DT 11 ? ? 117.08 121.30 -4.22 0.50 N
366 5 N1 Y DT 11 ? ? C2 Y DT 11 ? ? N3 Y DT 11 ? ? 118.21 114.60 3.61 0.60 N
367 5 N3 Y DT 11 ? ? C2 Y DT 11 ? ? O2 Y DT 11 ? ? 118.59 122.30 -3.71 0.60 N
368 5 "O4'" Y DA 12 ? ? "C1'" Y DA 12 ? ? N9 Y DA 12 ? ? 112.07 108.30 3.77 0.30 N
369 5 N1 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N6 Y DA 12 ? ? 114.83 118.60 -3.77 0.60 N
370 5 C5 Y DA 12 ? ? C6 Y DA 12 ? ? N6 Y DA 12 ? ? 129.14 123.70 5.44 0.80 N
371 5 "O4'" Y DT 13 ? ? "C1'" Y DT 13 ? ? "C2'" Y DT 13 ? ? 100.74 105.90 -5.16 0.80 N
372 5 "O4'" Y DT 13 ? ? "C1'" Y DT 13 ? ? N1 Y DT 13 ? ? 113.76 108.30 5.46 0.30 N
373 5 N3 Y DT 13 ? ? C2 Y DT 13 ? ? O2 Y DT 13 ? ? 117.01 122.30 -5.29 0.60 N
374 5 C4 Y DT 13 ? ? C5 Y DT 13 ? ? C7 Y DT 13 ? ? 122.90 119.00 3.90 0.60 N
375 5 C6 Y DT 13 ? ? C5 Y DT 13 ? ? C7 Y DT 13 ? ? 115.56 122.90 -7.34 0.60 N
376 5 "O4'" Y DA 14 ? ? "C1'" Y DA 14 ? ? N9 Y DA 14 ? ? 111.60 108.30 3.30 0.30 N
377 5 C4 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? C6 Y DA 14 ? ? 112.31 117.00 -4.69 0.50 N
378 5 N9 Y DA 14 ? ? C4 Y DA 14 ? ? C5 Y DA 14 ? ? 101.73 105.80 -4.07 0.40 N
379 5 "C3'" Y DG 15 ? ? "C2'" Y DG 15 ? ? "C1'" Y DG 15 ? ? 95.83 102.40 -6.57 0.80 N
380 5 "O4'" Y DG 15 ? ? "C1'" Y DG 15 ? ? N9 Y DG 15 ? ? 103.47 108.00 -4.53 0.70 N
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395 6 "O4'" X DC 2 ? ? "C4'" X DC 2 ? ? "C3'" X DC 2 ? ? 111.72 106.00 5.72 0.60 N
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459 6 N3 Y DC 16 ? ? C4 Y DC 16 ? ? N4 Y DC 16 ? ? 112.76 118.00 -5.24 0.70 N
#
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_pdbx_validate_chiral.label_alt_id
_pdbx_validate_chiral.auth_asym_id
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_pdbx_validate_chiral.auth_seq_id
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_pdbx_validate_chiral.omega
1 1 C20 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
2 1 C57 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
3 1 C66 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
4 2 C20 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
5 2 C57 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
6 2 C66 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
7 3 C20 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
8 3 C57 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
9 3 C66 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
10 4 C20 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
11 4 C57 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
12 4 C66 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
13 5 C20 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
14 5 C57 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
15 5 C66 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
16 6 C20 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
17 6 C57 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
18 6 C66 ? Y 4JF 101 ? PLANAR .
#
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_pdbx_validate_planes.PDB_model_num
_pdbx_validate_planes.auth_comp_id
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_pdbx_validate_planes.PDB_ins_code
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1 1 DC X 2 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN'
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3 1 DA X 4 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN'
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6 1 DC X 8 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN'
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12 1 DC Y 16 ? ? 0.101 'SIDE CHAIN'
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#
_pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ?
_pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ?
_pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ?
_pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ?
_pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the least restraint violations'
_pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 1000
_pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 6
_pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ?
_pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2N96
_pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ?
_pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ?
_pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ?
_pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ?
_pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ?
#
_pdbx_nmr_representative.conformer_id 1
_pdbx_nmr_representative.entry_id 2N96
_pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'minimized average structure'
#
loop_
_pdbx_nmr_sample_details.contents
_pdbx_nmr_sample_details.solution_id
_pdbx_nmr_sample_details.solvent_system
_pdbx_nmr_sample_details.label
_pdbx_nmr_sample_details.type
_pdbx_nmr_sample_details.details
;1.1 uM DNA (5'-D(*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3)*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3))-3'), 1.1 uM lomaiviticin A, 100% D2O
;
1 '100% D2O' sample_1 solution ?
;1.1 uM DNA (5'-D(*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3)*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3))-3'), 1.1 uM lomaiviticin A, 90% H2O/10% D2O
;
2 '90% H2O/10% D2O' sample_2 solution ?
#
loop_
_pdbx_nmr_exptl_sample.component
_pdbx_nmr_exptl_sample.concentration
_pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range
_pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units
_pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling
_pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id
;DNA (5'-D(*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3)*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3))-3')
;
1.1 ? uM 'natural abundance' 1
'lomaiviticin A' 1.1 ? uM 'natural abundance' 1
;DNA (5'-D(*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3)*(DG5)P*CP*TP*AP*TP*AP*GP*(DC3))-3')
;
1.1 ? uM 'natural abundance' 2
'lomaiviticin A' 1.1 ? uM 'natural abundance' 2
#
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 24
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.5
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ambient
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units ?
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 297
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label ?
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units ?
_pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units ?
#
loop_
_pdbx_nmr_exptl.conditions_id
_pdbx_nmr_exptl.experiment_id
_pdbx_nmr_exptl.solution_id
_pdbx_nmr_exptl.type
1 1 1 '2D DQF-COSY'
1 2 1 '2D 1H-13C HSQC'
1 3 1 '2D 1H-1H NOESY'
1 4 1 '2D 1H-1H NOESY'
1 5 2 '2D 1H-1H NOESY'
1 6 2 '2D DQF-COSY'
#
_pdbx_nmr_refine.entry_id 2N96
_pdbx_nmr_refine.method 'molecular dynamics'
_pdbx_nmr_refine.details ?
_pdbx_nmr_refine.software_ordinal 2
#
loop_
_pdbx_nmr_software.authors
_pdbx_nmr_software.classification
_pdbx_nmr_software.name
_pdbx_nmr_software.version
_pdbx_nmr_software.ordinal
'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollman' 'structure calculation' Amber 14 1
'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, and Kollman' refinement Amber 14 2
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
4JF C1 C Y N 1
4JF C2 C Y N 2
4JF C3 C Y N 3
4JF C4 C Y N 4
4JF C5 C Y N 5
4JF C6 C Y N 6
4JF C9 C N N 7
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4JF C12 C N N 10
4JF O13 O N N 11
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4JF C19 C N N 15
4JF C20 C N S 16
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4JF H8H H N N 188
DA OP3 O N N 189
DA P P N N 190
DA OP1 O N N 191
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DA "O3'" O N N 198
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DA "C1'" C N R 200
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DA C8 C Y N 202
DA N7 N Y N 203
DA C5 C Y N 204
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DA N6 N N N 206
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DA C4 C Y N 210
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DA H62 H N N 223
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DG OP3 O N N 259
DG P P N N 260
DG OP1 O N N 261
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DG "O5'" O N N 263
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DG "O3'" O N N 268
DG "C2'" C N N 269
DG "C1'" C N R 270
DG N9 N Y N 271
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DG "H2''" H N N 290
DG "H1'" H N N 291
DG H8 H N N 292
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DT OP3 O N N 296
DT P P N N 297
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DT "O5'" O N N 300
DT "C5'" C N N 301
DT "C4'" C N R 302
DT "O4'" O N N 303
DT "C3'" C N S 304
DT "O3'" O N N 305
DT "C2'" C N N 306
DT "C1'" C N R 307
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DT N3 N N N 311
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DT HOP3 H N N 317
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DT "H5''" H N N 320
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DT H71 H N N 328
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DT H73 H N N 330
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#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
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_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
4JF O73 C68 sing N N 1
4JF C3C N8B sing N N 2
4JF C68 C63 sing N N 3
4JF C68 C67 doub N N 4
4JF O61 C59 doub N N 5
4JF C63 C64 sing N N 6
4JF N76 N75 sing N N 7
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4JF C59 C67 sing N N 9
4JF C59 C57 sing N N 10
4JF N8B C7A sing N N 11
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4JF C7C C8A sing N N 13
4JF C67 C66 sing N N 14
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4JF C5 C4 sing Y N 21
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4JF C65 O71 sing N N 30
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4JF C4A O55 sing N N 41
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4JF C9F O0H sing N N 80
4JF C9F C3G sing N N 81
4JF C29 O25 sing N N 82
4JF C2G C3G sing N N 83
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4JF O25 C78 sing N N 85
4JF C1H O0H sing N N 86
4JF C3G O8G sing N N 87
4JF O2D C3D sing N N 88
4JF C79 C78 sing N N 89
4JF C79 C80 sing N N 90
4JF C78 O88 sing N N 91
4JF C3D O4E sing N N 92
4JF C3D C4D sing N N 93
4JF C9D C5E sing N N 94
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4JF O9E C0E sing N N 101
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4JF C89 H92 sing N N 148
4JF C89 H91 sing N N 149
4JF C89 H90 sing N N 150
4JF O94 H95 sing N N 151
4JF C96 H97 sing N N 152
4JF C96 H98 sing N N 153
4JF C96 H99 sing N N 154
4JF C0A H2A sing N N 155
4JF C0A H1A sing N N 156
4JF C0A H3A sing N N 157
4JF C4A H1B sing N N 158
4JF C5A H0B sing N N 159
4JF C5A H9A sing N N 160
4JF C6A H4B sing N N 161
4JF C7A H2B sing N N 162
4JF C8A H3B sing N N 163
4JF O6B H7B sing N N 164
4JF C9B H0C sing N N 165
4JF C9B H2C sing N N 166
4JF C9B H1C sing N N 167
4JF C3C H5C sing N N 168
4JF C3C H6C sing N N 169
4JF C3C H4C sing N N 170
4JF C7C H9C sing N N 171
4JF C7C H0D sing N N 172
4JF C7C H8C sing N N 173
4JF C3D H5D sing N N 174
4JF C4D H7D sing N N 175
4JF C4D H8D sing N N 176
4JF C6D H1E sing N N 177
4JF C9D H2E sing N N 178
4JF C0E H3E sing N N 179
4JF C5E H7E sing N N 180
4JF C5E H8E sing N N 181
4JF C5E H6E sing N N 182
4JF O9E H0F sing N N 183
4JF C2F H4F sing N N 184
4JF C2F H3F sing N N 185
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4JF C7F H1G sing N N 188
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4JF O8G H9G sing N N 193
4JF C1H H3H sing N N 194
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4JF C5H H6H sing N N 197
4JF C5H H7H sing N N 198
4JF C5H H8H sing N N 199
DA OP3 P sing N N 200
DA OP3 HOP3 sing N N 201
DA P OP1 doub N N 202
DA P OP2 sing N N 203
DA P "O5'" sing N N 204
DA OP2 HOP2 sing N N 205
DA "O5'" "C5'" sing N N 206
DA "C5'" "C4'" sing N N 207
DA "C5'" "H5'" sing N N 208
DA "C5'" "H5''" sing N N 209
DA "C4'" "O4'" sing N N 210
DA "C4'" "C3'" sing N N 211
DA "C4'" "H4'" sing N N 212
DA "O4'" "C1'" sing N N 213
DA "C3'" "O3'" sing N N 214
DA "C3'" "C2'" sing N N 215
DA "C3'" "H3'" sing N N 216
DA "O3'" "HO3'" sing N N 217
DA "C2'" "C1'" sing N N 218
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DA "C2'" "H2''" sing N N 220
DA "C1'" N9 sing N N 221
DA "C1'" "H1'" sing N N 222
DA N9 C8 sing Y N 223
DA N9 C4 sing Y N 224
DA C8 N7 doub Y N 225
DA C8 H8 sing N N 226
DA N7 C5 sing Y N 227
DA C5 C6 sing Y N 228
DA C5 C4 doub Y N 229
DA C6 N6 sing N N 230
DA C6 N1 doub Y N 231
DA N6 H61 sing N N 232
DA N6 H62 sing N N 233
DA N1 C2 sing Y N 234
DA C2 N3 doub Y N 235
DA C2 H2 sing N N 236
DA N3 C4 sing Y N 237
DC OP3 P sing N N 238
DC OP3 HOP3 sing N N 239
DC P OP1 doub N N 240
DC P OP2 sing N N 241
DC P "O5'" sing N N 242
DC OP2 HOP2 sing N N 243
DC "O5'" "C5'" sing N N 244
DC "C5'" "C4'" sing N N 245
DC "C5'" "H5'" sing N N 246
DC "C5'" "H5''" sing N N 247
DC "C4'" "O4'" sing N N 248
DC "C4'" "C3'" sing N N 249
DC "C4'" "H4'" sing N N 250
DC "O4'" "C1'" sing N N 251
DC "C3'" "O3'" sing N N 252
DC "C3'" "C2'" sing N N 253
DC "C3'" "H3'" sing N N 254
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DC "C2'" "H2'" sing N N 257
DC "C2'" "H2''" sing N N 258
DC "C1'" N1 sing N N 259
DC "C1'" "H1'" sing N N 260
DC N1 C2 sing N N 261
DC N1 C6 sing N N 262
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DC C4 N4 sing N N 266
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DC N4 H41 sing N N 268
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DC C5 C6 doub N N 270
DC C5 H5 sing N N 271
DC C6 H6 sing N N 272
DG OP3 P sing N N 273
DG OP3 HOP3 sing N N 274
DG P OP1 doub N N 275
DG P OP2 sing N N 276
DG P "O5'" sing N N 277
DG OP2 HOP2 sing N N 278
DG "O5'" "C5'" sing N N 279
DG "C5'" "C4'" sing N N 280
DG "C5'" "H5'" sing N N 281
DG "C5'" "H5''" sing N N 282
DG "C4'" "O4'" sing N N 283
DG "C4'" "C3'" sing N N 284
DG "C4'" "H4'" sing N N 285
DG "O4'" "C1'" sing N N 286
DG "C3'" "O3'" sing N N 287
DG "C3'" "C2'" sing N N 288
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DG "C2'" "C1'" sing N N 291
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DG "C2'" "H2''" sing N N 293
DG "C1'" N9 sing N N 294
DG "C1'" "H1'" sing N N 295
DG N9 C8 sing Y N 296
DG N9 C4 sing Y N 297
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DG C8 H8 sing N N 299
DG N7 C5 sing Y N 300
DG C5 C6 sing N N 301
DG C5 C4 doub Y N 302
DG C6 O6 doub N N 303
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DG N1 H1 sing N N 306
DG C2 N2 sing N N 307
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DG N2 H21 sing N N 309
DG N2 H22 sing N N 310
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DT OP3 P sing N N 312
DT OP3 HOP3 sing N N 313
DT P OP1 doub N N 314
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DT P "O5'" sing N N 316
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DT "O5'" "C5'" sing N N 318
DT "C5'" "C4'" sing N N 319
DT "C5'" "H5'" sing N N 320
DT "C5'" "H5''" sing N N 321
DT "C4'" "O4'" sing N N 322
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DT "C3'" "H3'" sing N N 328
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DT "C2'" "C1'" sing N N 330
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DT "C2'" "H2''" sing N N 332
DT "C1'" N1 sing N N 333
DT "C1'" "H1'" sing N N 334
DT N1 C2 sing N N 335
DT N1 C6 sing N N 336
DT C2 O2 doub N N 337
DT C2 N3 sing N N 338
DT N3 C4 sing N N 339
DT N3 H3 sing N N 340
DT C4 O4 doub N N 341
DT C4 C5 sing N N 342
DT C5 C7 sing N N 343
DT C5 C6 doub N N 344
DT C7 H71 sing N N 345
DT C7 H72 sing N N 346
DT C7 H73 sing N N 347
DT C6 H6 sing N N 348
#
loop_
_ndb_struct_conf_na.entry_id
_ndb_struct_conf_na.feature
2N96 'double helix'
2N96 'b-form double helix'
2N96 'internal loop'
#
loop_
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_ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12
1 A DG 1 1_555 B DC 8 1_555 -0.462 -0.097 -0.348 18.529 7.926 -6.254 1 X_DG1:DC16_Y X 1 ? Y 16 ? 19 1
1 A DC 2 1_555 B DG 7 1_555 -0.620 0.285 0.963 19.424 -20.587 -11.205 2 X_DC2:DG15_Y X 2 ? Y 15 ? ? ?
1 A DT 3 1_555 B DA 6 1_555 -3.848 2.909 -0.941 8.466 -52.923 -100.417 3 X_DT3:DA14_Y X 3 ? Y 14 ? ? ?
1 A DA 6 1_555 B DT 3 1_555 -0.217 -0.446 1.100 -11.909 -3.494 3.409 4 X_DA6:DT11_Y X 6 ? Y 11 ? 20 1
1 A DG 7 1_555 B DC 2 1_555 -0.103 -0.032 0.539 3.439 -15.672 -3.776 5 X_DG7:DC10_Y X 7 ? Y 10 ? 19 1
1 A DC 8 1_555 B DG 1 1_555 -0.288 -0.144 -0.159 4.479 -13.692 -6.217 6 X_DC8:DG9_Y X 8 ? Y 9 ? 19 1
#
loop_
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1 A DG 1 1_555 B DC 8 1_555 A DC 2 1_555 B DG 7 1_555 -1.158 1.001 3.486 -5.487 -11.934 30.719 3.815 1.066 3.054 -21.345 9.813
33.347 1 XX_DG1DC2:DG15DC16_YY X 1 ? Y 16 ? X 2 ? Y 15 ?
1 A DC 2 1_555 B DG 7 1_555 A DT 3 1_555 B DA 6 1_555 -5.077 0.318 3.598 -12.999 -2.343 36.016 0.885 5.515 5.040 -3.643 20.206
38.287 2 XX_DC2DT3:DA14DG15_YY X 2 ? Y 15 ? X 3 ? Y 14 ?
1 A DA 6 1_555 B DT 3 1_555 A DG 7 1_555 B DC 2 1_555 -0.285 -0.696 3.169 4.311 -0.870 36.158 -0.997 1.034 3.131 -1.396 -6.915
36.416 3 XX_DA6DG7:DC10DT11_YY X 6 ? Y 11 ? X 7 ? Y 10 ?
1 A DG 7 1_555 B DC 2 1_555 A DC 8 1_555 B DG 1 1_555 0.428 -0.279 3.326 6.190 2.135 21.346 -1.546 1.283 3.274 5.597
-16.226 22.316 4 XX_DG7DC8:DG9DC10_YY X 7 ? Y 10 ? X 8 ? Y 9 ?
#
_pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 800
_pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Agilent
_pdbx_nmr_spectrometer.model 'Direct Drive'
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_pdbx_nmr_spectrometer.type ?
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_atom_sites.entry_id 2N96
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P
#
loop_