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C N N 115 JOS C14 C N N 116 JOS C15 C N R 117 JOS C16 C N N 118 JOS C1 C N N 119 JOS C2 C N N 120 JOS C3 C N R 121 JOS C17 C N N 122 JOS C18 C N N 123 JOS C4 C N R 124 JOS C19 C N N 125 JOS C5 C N S 126 JOS C6 C N R 127 JOS C20 C N N 128 JOS C21 C N N 129 JOS C7 C N N 130 JOS C8 C N R 131 JOS C22 C N N 132 JOS O3 O N N 133 JOS O2 O N N 134 JOS O1 O N N 135 JOS O6 O N N 136 JOS O7 O N N 137 JOS O5 O N N 138 JOS O4 O N N 139 JOS C1A C N R 140 JOS C2A C N R 141 JOS C3A C N R 142 JOS C4A C N S 143 JOS C5A C N R 144 JOS C6A C N N 145 JOS C7A C N N 146 JOS O1A O N N 147 JOS O2A O N N 148 JOS N3A N N N 149 JOS O5A O N N 150 JOS C1B C N R 151 JOS C2B C N N 152 JOS C3B C N R 153 JOS C4B C N S 154 JOS C5B C N S 155 JOS C6B C N N 156 JOS C7B C N N 157 JOS O1B O N N 158 JOS O3B O N N 159 JOS O4B O N N 160 JOS O5B O N N 161 JOS C1C C N N 162 JOS C2C C N N 163 JOS C3C C N N 164 JOS C4C C N N 165 JOS C5C C N N 166 JOS O1C O N N 167 JOS C8A C N N 168 JOS H9 H N N 169 JOS H101 H N N 170 JOS H102 H N N 171 JOS H11 H N N 172 JOS H12 H N N 173 JOS H13 H N N 174 JOS H14 H N N 175 JOS H15 H N N 176 JOS H161 H N N 177 JOS H162 H N N 178 JOS H163 H N N 179 JOS H21A H N N 180 JOS H22 H N N 181 JOS H3 H N N 182 JOS H181 H N N 183 JOS H182 H N N 184 JOS H183 H N N 185 JOS H4 H N N 186 JOS H191 H N N 187 JOS H192 H N N 188 JOS H193 H N N 189 JOS H5 H N N 190 JOS H6 H N N 191 JOS H201 H N N 192 JOS H202 H N N 193 JOS H21 H N N 194 JOS H71 H N N 195 JOS H72 H N N 196 JOS H8 H N N 197 JOS H221 H N N 198 JOS H222 H N N 199 JOS H223 H N N 200 JOS HO3 H N N 201 JOS H1A H N N 202 JOS H2A H N N 203 JOS H3A H N N 204 JOS H4A H N N 205 JOS H5A H N N 206 JOS H6A1 H N N 207 JOS H6A2 H N N 208 JOS H6A3 H N N 209 JOS H7A1 H N N 210 JOS H7A2 H N N 211 JOS H7A3 H N N 212 JOS HO2A H N N 213 JOS H1B H N N 214 JOS H2B1 H N N 215 JOS H2B2 H N N 216 JOS H4B H N N 217 JOS H5B H N N 218 JOS H6B1 H N N 219 JOS H6B2 H N N 220 JOS H6B3 H N N 221 JOS H7B1 H N N 222 JOS H7B2 H N N 223 JOS H7B3 H N N 224 JOS HO3B H N N 225 JOS H2C1 H N N 226 JOS H2C2 H N N 227 JOS H3C H N N 228 JOS H4C1 H N N 229 JOS H4C2 H N N 230 JOS H4C3 H N N 231 JOS H5C1 H N N 232 JOS H5C2 H N N 233 JOS H5C3 H N N 234 JOS H8A1 H N N 235 JOS H8A2 H N N 236 JOS H8A3 H N N 237 U OP3 O N N 238 U P P N N 239 U OP1 O N N 240 U OP2 O N N 241 U "O5'" O N N 242 U "C5'" C N N 243 U "C4'" C N R 244 U "O4'" O N N 245 U "C3'" C N S 246 U "O3'" O N N 247 U "C2'" C N R 248 U "O2'" O N N 249 U "C1'" C N R 250 U N1 N N N 251 U C2 C N N 252 U O2 O N N 253 U N3 N N N 254 U C4 C N N 255 U O4 O N N 256 U C5 C N N 257 U C6 C N N 258 U HOP3 H N N 259 U HOP2 H N N 260 U "H5'" H N N 261 U "H5''" H N N 262 U "H4'" H N N 263 U "H3'" H N N 264 U "HO3'" H N N 265 U "H2'" H N N 266 U "HO2'" H N N 267 U "H1'" H N N 268 U H3 H N N 269 U H5 H N N 270 U H6 H N N 271 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A OP3 P sing N N 1 A OP3 HOP3 sing N N 2 A P OP1 doub N N 3 A P OP2 sing N N 4 A P "O5'" sing N N 5 A OP2 HOP2 sing N N 6 A "O5'" "C5'" sing N N 7 A "C5'" "C4'" sing N N 8 A "C5'" "H5'" sing N N 9 A "C5'" "H5''" sing N N 10 A "C4'" "O4'" sing N N 11 A "C4'" "C3'" sing N N 12 A "C4'" "H4'" sing N N 13 A "O4'" "C1'" sing N N 14 A "C3'" "O3'" sing N N 15 A "C3'" "C2'" sing N N 16 A "C3'" "H3'" sing N N 17 A "O3'" "HO3'" sing N N 18 A "C2'" "O2'" sing N N 19 A "C2'" "C1'" sing N N 20 A "C2'" "H2'" sing N N 21 A "O2'" "HO2'" sing N N 22 A "C1'" N9 sing N N 23 A "C1'" "H1'" sing N N 24 A N9 C8 sing Y N 25 A N9 C4 sing Y N 26 A C8 N7 doub Y N 27 A C8 H8 sing N N 28 A N7 C5 sing Y N 29 A C5 C6 sing Y N 30 A C5 C4 doub Y N 31 A C6 N6 sing N N 32 A C6 N1 doub Y N 33 A N6 H61 sing N N 34 A N6 H62 sing N N 35 A N1 C2 sing Y N 36 A C2 N3 doub Y N 37 A C2 H2 sing N N 38 A N3 C4 sing Y N 39 C OP3 P sing N N 40 C OP3 HOP3 sing N N 41 C P OP1 doub N N 42 C P OP2 sing N N 43 C P "O5'" sing N N 44 C OP2 HOP2 sing N N 45 C "O5'" "C5'" sing N N 46 C "C5'" "C4'" sing N N 47 C "C5'" "H5'" sing N N 48 C "C5'" "H5''" sing N N 49 C "C4'" "O4'" sing N N 50 C "C4'" "C3'" sing N N 51 C "C4'" "H4'" sing N N 52 C "O4'" "C1'" sing N N 53 C "C3'" "O3'" sing N N 54 C "C3'" "C2'" sing N N 55 C "C3'" "H3'" sing N N 56 C "O3'" "HO3'" sing N N 57 C "C2'" "O2'" sing N N 58 C "C2'" "C1'" sing N N 59 C "C2'" "H2'" sing N N 60 C "O2'" "HO2'" sing N N 61 C "C1'" N1 sing N N 62 C "C1'" "H1'" sing N N 63 C N1 C2 sing N N 64 C N1 C6 sing N N 65 C C2 O2 doub N N 66 C C2 N3 sing N N 67 C N3 C4 doub N N 68 C C4 N4 sing N N 69 C C4 C5 sing N N 70 C N4 H41 sing N N 71 C N4 H42 sing N N 72 C C5 C6 doub N N 73 C C5 H5 sing N N 74 C C6 H6 sing N N 75 G OP3 P sing N N 76 G OP3 HOP3 sing N N 77 G P OP1 doub N N 78 G P OP2 sing N N 79 G P "O5'" sing N N 80 G OP2 HOP2 sing N N 81 G "O5'" "C5'" sing N N 82 G "C5'" "C4'" sing N N 83 G "C5'" "H5'" sing N N 84 G "C5'" "H5''" sing N N 85 G "C4'" "O4'" sing N N 86 G "C4'" "C3'" sing N N 87 G "C4'" "H4'" sing N N 88 G "O4'" "C1'" sing N N 89 G "C3'" "O3'" sing N N 90 G "C3'" "C2'" sing N N 91 G "C3'" "H3'" sing N N 92 G "O3'" "HO3'" sing N N 93 G "C2'" "O2'" sing N N 94 G "C2'" "C1'" sing N N 95 G "C2'" "H2'" sing N N 96 G "O2'" "HO2'" sing N N 97 G "C1'" N9 sing N N 98 G "C1'" "H1'" sing N N 99 G N9 C8 sing Y N 100 G N9 C4 sing Y N 101 G C8 N7 doub Y N 102 G C8 H8 sing N N 103 G N7 C5 sing Y N 104 G C5 C6 sing N N 105 G C5 C4 doub Y N 106 G C6 O6 doub N N 107 G C6 N1 sing N N 108 G N1 C2 sing N N 109 G N1 H1 sing N N 110 G C2 N2 sing N N 111 G C2 N3 doub N N 112 G N2 H21 sing N N 113 G N2 H22 sing N N 114 G N3 C4 sing N N 115 JOS C9 C8 sing N N 116 JOS C9 O3 sing N N 117 JOS C9 C10 sing N N 118 JOS C9 H9 sing N N 119 JOS C10 C11 sing N N 120 JOS C10 H101 sing N N 121 JOS C10 H102 sing N N 122 JOS C11 C12 doub N E 123 JOS C11 H11 sing N N 124 JOS C12 C13 sing N N 125 JOS C12 H12 sing N N 126 JOS C13 C14 doub N Z 127 JOS C13 H13 sing N N 128 JOS C14 C15 sing N N 129 JOS C14 H14 sing N N 130 JOS C15 O2 sing N N 131 JOS C15 C16 sing N N 132 JOS C15 H15 sing N N 133 JOS C16 H161 sing N N 134 JOS C16 H162 sing N N 135 JOS C16 H163 sing N N 136 JOS C1 O1 doub N N 137 JOS C1 C2 sing N N 138 JOS C1 O2 sing N N 139 JOS C2 C3 sing N N 140 JOS C2 H21A sing N N 141 JOS C2 H22 sing N N 142 JOS C3 C4 sing N N 143 JOS C3 O6 sing N N 144 JOS C3 H3 sing N N 145 JOS C17 C18 sing N N 146 JOS C17 O6 sing N N 147 JOS C17 O7 doub N N 148 JOS C18 H181 sing N N 149 JOS C18 H182 sing N N 150 JOS C18 H183 sing N N 151 JOS C4 C5 sing N N 152 JOS C4 O5 sing N N 153 JOS C4 H4 sing N N 154 JOS C19 O5 sing N N 155 JOS C19 H191 sing N N 156 JOS C19 H192 sing N N 157 JOS C19 H193 sing N N 158 JOS C5 C6 sing N N 159 JOS C5 O1A sing N N 160 JOS C5 H5 sing N N 161 JOS C6 C20 sing N N 162 JOS C6 C7 sing N N 163 JOS C6 H6 sing N N 164 JOS C20 C21 sing N N 165 JOS C20 H201 sing N N 166 JOS C20 H202 sing N N 167 JOS C21 O4 doub N N 168 JOS C21 H21 sing N N 169 JOS C7 C8 sing N N 170 JOS C7 H71 sing N N 171 JOS C7 H72 sing N N 172 JOS C8 C22 sing N N 173 JOS C8 H8 sing N N 174 JOS C22 H221 sing N N 175 JOS C22 H222 sing N N 176 JOS C22 H223 sing N N 177 JOS O3 HO3 sing N N 178 JOS C1A O5A sing N N 179 JOS C1A C2A sing N N 180 JOS C1A O1A sing N N 181 JOS C1A H1A sing N N 182 JOS C2A C3A sing N N 183 JOS C2A O2A sing N N 184 JOS C2A H2A sing N N 185 JOS C3A N3A sing N N 186 JOS C3A C4A sing N N 187 JOS C3A H3A sing N N 188 JOS C4A O1B sing N N 189 JOS C4A C5A sing N N 190 JOS C4A H4A sing N N 191 JOS C5A C6A sing N N 192 JOS C5A O5A sing N N 193 JOS C5A H5A sing N N 194 JOS C6A H6A1 sing N N 195 JOS C6A H6A2 sing N N 196 JOS C6A H6A3 sing N N 197 JOS C7A N3A sing N N 198 JOS C7A H7A1 sing N N 199 JOS C7A H7A2 sing N N 200 JOS C7A H7A3 sing N N 201 JOS O2A HO2A sing N N 202 JOS N3A C8A sing N N 203 JOS C1B O5B sing N N 204 JOS C1B C2B sing N N 205 JOS C1B O1B sing N N 206 JOS C1B H1B sing N N 207 JOS C2B C3B sing N N 208 JOS C2B H2B1 sing N N 209 JOS C2B H2B2 sing N N 210 JOS C3B C4B sing N N 211 JOS C3B C7B sing N N 212 JOS C3B O3B sing N N 213 JOS C4B O4B sing N N 214 JOS C4B C5B sing N N 215 JOS C4B H4B sing N N 216 JOS C5B C6B sing N N 217 JOS C5B O5B sing N N 218 JOS C5B H5B sing N N 219 JOS C6B H6B1 sing N N 220 JOS C6B H6B2 sing N N 221 JOS C6B H6B3 sing N N 222 JOS C7B H7B1 sing N N 223 JOS C7B H7B2 sing N N 224 JOS C7B H7B3 sing N N 225 JOS O3B HO3B sing N N 226 JOS O4B C1C sing N N 227 JOS C1C O1C doub N N 228 JOS C1C C2C sing N N 229 JOS C2C C3C sing N N 230 JOS C2C H2C1 sing N N 231 JOS C2C H2C2 sing N N 232 JOS C3C C4C sing N N 233 JOS C3C C5C sing N N 234 JOS C3C H3C sing N N 235 JOS C4C H4C1 sing N N 236 JOS C4C H4C2 sing N N 237 JOS C4C H4C3 sing N N 238 JOS C5C H5C1 sing N N 239 JOS C5C H5C2 sing N N 240 JOS C5C H5C3 sing N N 241 JOS C8A H8A1 sing N N 242 JOS C8A H8A2 sing N N 243 JOS C8A H8A3 sing N N 244 U OP3 P sing N N 245 U OP3 HOP3 sing N N 246 U P OP1 doub N N 247 U P OP2 sing N N 248 U P "O5'" sing N N 249 U OP2 HOP2 sing N N 250 U "O5'" "C5'" sing N N 251 U "C5'" "C4'" sing N N 252 U "C5'" "H5'" sing N N 253 U "C5'" "H5''" sing N N 254 U "C4'" "O4'" sing N N 255 U "C4'" "C3'" sing N N 256 U "C4'" "H4'" sing N N 257 U "O4'" "C1'" sing N N 258 U "C3'" "O3'" sing N N 259 U "C3'" "C2'" sing N N 260 U "C3'" "H3'" sing N N 261 U "O3'" "HO3'" sing N N 262 U "C2'" "O2'" sing N N 263 U "C2'" "C1'" sing N N 264 U "C2'" "H2'" sing N N 265 U "O2'" "HO2'" sing N N 266 U "C1'" N1 sing N N 267 U "C1'" "H1'" sing N N 268 U N1 C2 sing N N 269 U N1 C6 sing N N 270 U C2 O2 doub N N 271 U C2 N3 sing N N 272 U N3 C4 sing N N 273 U N3 H3 sing N N 274 U C4 O4 doub N N 275 U C4 C5 sing N N 276 U C5 C6 doub N N 277 U C5 H5 sing N N 278 U C6 H6 sing N N 279 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 2O44 'double helix' 2O44 'a-form double helix' 2O44 'parallel strands' 2O44 'hairpin loop' 2O44 tetraloop 2O44 'bulge loop' 2O44 'mismatched base pair' 2O44 'internal loop' 2O44 'triple helix' 2O44 'quadruple helix' 2O44 'three-way junction' 2O44 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 2876 1_555 1.127 0.244 0.494 0.245 -9.634 14.296 1 A_G1:C2876_A A 1 ? 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