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_refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.796 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.787 _refine.B_iso_mean 78.174 _refine.aniso_B[1][1] -14.93 _refine.aniso_B[2][2] -14.93 _refine.aniso_B[3][3] 29.85 _refine.aniso_B[1][2] 0.00 _refine.aniso_B[1][3] 0.00 _refine.aniso_B[2][3] 0.00 _refine.solvent_model_details MASK _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.20 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.80 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.80 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. Sept6 (Chain B) and Sept7 (Chain C) will have poly-alanine stretches due low resolution. ; _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct MIRAS _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.700 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.540 _refine.overall_SU_ML 0.616 _refine.overall_SU_B 82.738 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 4407 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 88 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 4495 _refine_hist.d_res_high 4.00 _refine_hist.d_res_low 49.15 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function r_bond_refined_d 0.057 0.022 ? 4612 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_bond_other_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_angle_refined_deg 4.719 1.954 ? 6311 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_angle_other_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_1_deg 18.875 5.000 ? 681 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_2_deg 51.524 25.258 ? 97 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_3_deg 30.803 15.000 ? 461 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_dihedral_angle_4_deg 5.216 15.000 ? 6 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_chiral_restr 0.247 0.200 ? 808 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_gen_planes_refined 0.014 0.020 ? 3366 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_gen_planes_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbd_refined 0.475 0.200 ? 3293 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbd_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbtor_refined 0.375 0.200 ? 2772 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_nbtor_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_xyhbond_nbd_refined 0.403 0.200 ? 320 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_xyhbond_nbd_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_metal_ion_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_metal_ion_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_vdw_refined 0.339 0.200 ? 15 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_vdw_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_hbond_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_hbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcbond_it 1.747 1.500 ? 3815 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcbond_other ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_mcangle_it 2.844 2.000 ? 5299 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scbond_it 3.276 3.000 ? 1223 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_scangle_it 5.123 4.500 ? 1012 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_rigid_bond_restr ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_free ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? r_sphericity_bonded ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 4.000 _refine_ls_shell.d_res_low 4.103 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 2948 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.467 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 98.95 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.454 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 156 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # _struct.entry_id 2QAG _struct.title 'Crystal structure of human septin trimer 2/6/7' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2QAG _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE, STRUCTURAL PROTEIN' _struct_keywords.text ;Cell cycle, Cell division, GTP-binding, Nucleotide-binding, Phosphorylation, Acetylation, Alternative splicing, Coiled coil, STRUCTURAL PROTEIN ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP SEPT2_HUMAN Q15019 1 ;MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQ IEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGL KPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVV GSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQ ILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV ; 1 ? 2 UNP SEPT6_HUMAN Q14141 2 ;MAATDIARQVGEGCRTVPLAGHVGFDSLPDQLVNKSVSQGFCFNILCVGETGLGKSTLMDTLFNTKFEGEPATHTQPGVQ LQSNTYDLQESNVRLKLTIVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHVCLYFIAPTGH SLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKADAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGS TEELKIGNKMMRARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSL QETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLDDEVNAFKQRK TAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKNNPWLCTE ; 1 ? 3 UNP SEPT7_HUMAN Q16181 3 ;MVAQQKNLEGYVGFANLPNQVYRKSVKRGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYSPEYPGPSHRIKKTVQVEQSKVL IKEGGVQLLLTIVDTPGFGDAVDNSNCWQPVIDYIDSKFEDYLNAESRVNRRQMPDNRVQCCLYFIAPSGHGLKPLDIEF MKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNG KRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQM EEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILE QQNSSRTLEKNKKKGKIF ; 20 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2QAG A 1 ? 361 ? Q15019 1 ? 361 ? 1 361 2 2 2QAG B 1 ? 427 ? Q14141 1 ? 427 ? 1 427 3 3 2QAG C 1 ? 418 ? Q16181 20 ? 437 ? 1 418 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 5_655 -x+1,y,-z -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 252.5150000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;The biological assembly is a hexamer, but hexamer is divided by crystallographic symmetry, trimer occupies the asymmetric unit. Trimer model was generated from Sept2 (2QA5, submitted recently). ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN A 22 ? ARG A 29 ? ASN A 22 ARG A 29 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 2 ARG A 29 ? GLY A 35 ? ARG A 29 GLY A 35 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 3 GLY A 49 ? LEU A 59 ? GLY A 49 LEU A 59 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 4 ILE A 118 ? SER A 134 ? ILE A 118 SER A 134 1 ? 17 HELX_P HELX_P5 5 LYS A 161 ? ILE A 171 ? LYS A 161 ILE A 171 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 6 THR A 188 ? ILE A 203 ? THR A 188 ILE A 203 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 7 PHE A 224 ? SER A 234 ? PHE A 224 SER A 234 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 8 ASP A 272 ? HIS A 283 ? ASP A 272 HIS A 283 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 9 MET A 284 ? LEU A 287 ? MET A 284 LEU A 287 5 ? 4 HELX_P HELX_P10 10 GLN A 288 ? ASP A 293 ? GLN A 288 ASP A 293 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 11 HIS A 295 ? SER A 301 ? HIS A 295 SER A 301 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 12 PRO B 29 ? SER B 36 ? PRO B 29 SER B 36 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 13 LYS B 55 ? ASN B 64 ? LYS B 55 ASN B 64 1 ? 10 HELX_P HELX_P14 14 ASN B 110 ? TYR B 115 ? ASN B 110 TYR B 115 1 ? 6 HELX_P HELX_P15 15 TYR B 115 ? GLU B 133 ? TYR B 115 GLU B 133 1 ? 19 HELX_P HELX_P16 16 LYS B 163 ? LEU B 173 ? LYS B 163 LEU B 173 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 17 LYS B 185 ? ILE B 189 ? LYS B 185 ILE B 189 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 18 SER B 190 ? VAL B 206 ? SER B 190 VAL B 206 1 ? 17 HELX_P HELX_P19 19 GLU B 224 ? ASN B 230 ? GLU B 224 ASN B 230 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 20 PHE B 271 ? VAL B 281 ? PHE B 271 VAL B 281 1 ? 11 HELX_P HELX_P21 21 GLU B 284 ? HIS B 294 ? GLU B 284 HIS B 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 TYR B 295 ? GLY B 307 ? TYR B 295 GLY B 307 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 23 GLY C 43 ? PHE C 52 ? GLY C 43 PHE C 52 1 ? 10 HELX_P HELX_P24 24 TRP C 108 ? LEU C 123 ? TRP C 108 LEU C 123 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 25 LYS C 154 ? HIS C 165 ? LYS C 154 HIS C 165 1 ? 12 HELX_P HELX_P26 26 THR C 181 ? LYS C 200 ? THR C 181 LYS C 200 1 ? 20 HELX_P HELX_P27 27 THR C 264 ? ARG C 272 ? THR C 264 ARG C 272 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 28 HIS C 274 ? HIS C 286 ? HIS C 274 HIS C 286 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 29 HIS C 286 ? LEU C 295 ? HIS C 286 LEU C 295 1 ? 10 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 235 A . ? ILE 235 A PRO 236 A ? PRO 236 A 1 8.75 2 ARG 254 A . ? ARG 254 A GLY 255 A ? GLY 255 A 1 -4.93 3 PRO 64 C . ? PRO 64 C SER 65 C ? SER 65 C 1 1.12 4 PRO 135 C . ? PRO 135 C ASP 136 C ? ASP 136 C 1 20.31 5 GLY 258 C . ? GLY 258 C GLU 259 C ? GLU 259 C 1 -5.30 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 6 ? C ? 2 ? D ? 5 ? E ? 6 ? F ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? parallel A 2 3 ? anti-parallel B 1 2 ? parallel B 2 3 ? parallel B 3 4 ? parallel B 4 5 ? parallel B 5 6 ? parallel C 1 2 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? parallel D 3 4 ? parallel D 4 5 ? parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? parallel E 3 4 ? parallel E 4 5 ? parallel E 5 6 ? parallel F 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 GLU A 37 ? 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LEU C 227 VAL C 229 F 1 ARG C 246 ? GLN C 247 ? ARG C 246 GLN C 247 F 2 VAL C 252 ? ALA C 253 ? VAL C 252 ALA C 253 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id A 1 2 N PHE A 38 ? N PHE A 38 O LYS A 94 ? O LYS A 94 A 2 3 O LEU A 97 ? O LEU A 97 N GLU A 82 ? N GLU A 82 B 1 2 N PHE A 38 ? N PHE A 38 O LYS A 94 ? O LYS A 94 B 2 3 O VAL A 100 ? O VAL A 100 N VAL A 42 ? N VAL A 42 B 3 4 N MET A 41 ? N MET A 41 O CYS A 148 ? O CYS A 148 B 4 5 N TYR A 151 ? N TYR A 151 O VAL A 180 ? O VAL A 180 B 5 6 N ILE A 181 ? N ILE A 181 O VAL A 239 ? O VAL A 239 C 1 2 N ARG A 256 ? N ARG A 256 O VAL A 263 ? O VAL A 263 D 1 2 N TYR B 86 ? N TYR B 86 O LEU B 97 ? O LEU B 97 D 2 3 O THR B 98 ? O THR B 98 N PHE B 43 ? N PHE B 43 D 3 4 N LEU B 46 ? N LEU B 46 O VAL B 150 ? O VAL B 150 D 4 5 N ILE B 155 ? N ILE B 155 O ILE B 182 ? O ILE B 182 E 1 2 N GLN C 76 ? N GLN C 76 O LEU C 90 ? O LEU C 90 E 2 3 O THR C 91 ? O THR C 91 N PHE C 32 ? N PHE C 32 E 3 4 N MET C 35 ? N MET C 35 O LEU C 143 ? O LEU C 143 E 4 5 N TYR C 144 ? N TYR C 144 O LEU C 173 ? O LEU C 173 E 5 6 N ILE C 174 ? N ILE C 174 O VAL C 229 ? O VAL C 229 F 1 2 N ARG C 246 ? N ARG C 246 O ALA C 253 ? O ALA C 253 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A GDP 362 ? 13 'BINDING SITE FOR RESIDUE GDP A 362' AC2 Software B GTP 428 ? 12 'BINDING SITE FOR RESIDUE GTP B 428' AC3 Software C GDP 419 ? 13 'BINDING SITE FOR RESIDUE GDP C 419' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 13 SER A 46 ? SER A 46 . ? 1_555 ? 2 AC1 13 GLY A 47 ? GLY A 47 . ? 1_555 ? 3 AC1 13 LEU A 48 ? LEU A 48 . ? 1_555 ? 4 AC1 13 GLY A 49 ? GLY A 49 . ? 1_555 ? 5 AC1 13 LYS A 50 ? LYS A 50 . ? 1_555 ? 6 AC1 13 SER A 51 ? SER A 51 . ? 1_555 ? 7 AC1 13 THR A 52 ? THR A 52 . ? 1_555 ? 8 AC1 13 LYS A 183 ? LYS A 183 . ? 1_555 ? 9 AC1 13 ASP A 185 ? ASP A 185 . ? 1_555 ? 10 AC1 13 VAL A 240 ? VAL A 240 . ? 1_555 ? 11 AC1 13 TYR A 258 ? TYR A 258 . ? 1_555 ? 12 AC1 13 ALA B 188 ? ALA B 188 . ? 1_555 ? 13 AC1 13 GLU B 193 ? GLU B 193 . ? 1_555 ? 14 AC2 12 THR A 186 ? THR A 186 . ? 1_555 ? 15 AC2 12 GLU A 191 ? GLU A 191 . ? 1_555 ? 16 AC2 12 ARG A 194 ? ARG A 194 . ? 1_555 ? 17 AC2 12 THR B 51 ? THR B 51 . ? 1_555 ? 18 AC2 12 GLY B 52 ? GLY B 52 . ? 1_555 ? 19 AC2 12 GLY B 54 ? GLY B 54 . ? 1_555 ? 20 AC2 12 LYS B 55 ? LYS B 55 . ? 1_555 ? 21 AC2 12 SER B 56 ? SER B 56 . ? 1_555 ? 22 AC2 12 THR B 57 ? THR B 57 . ? 1_555 ? 23 AC2 12 LYS B 185 ? LYS B 185 . ? 1_555 ? 24 AC2 12 ALA B 186 ? ALA B 186 . ? 1_555 ? 25 AC2 12 ASP B 187 ? ASP B 187 . ? 1_555 ? 26 AC3 13 SER C 40 ? SER C 40 . ? 1_555 ? 27 AC3 13 GLY C 41 ? GLY C 41 . ? 1_555 ? 28 AC3 13 LEU C 42 ? LEU C 42 . ? 1_555 ? 29 AC3 13 GLY C 43 ? GLY C 43 . ? 1_555 ? 30 AC3 13 LYS C 44 ? LYS C 44 . ? 1_555 ? 31 AC3 13 SER C 45 ? SER C 45 . ? 1_555 ? 32 AC3 13 THR C 46 ? THR C 46 . ? 1_555 ? 33 AC3 13 GLU C 60 ? GLU C 60 . ? 1_555 ? 34 AC3 13 LYS C 176 ? LYS C 176 . ? 1_555 ? 35 AC3 13 ASP C 178 ? ASP C 178 . ? 1_555 ? 36 AC3 13 THR C 179 ? THR C 179 . ? 5_555 ? 37 AC3 13 GLY C 231 ? GLY C 231 . ? 1_555 ? 38 AC3 13 TYR C 248 ? TYR C 248 . ? 1_555 ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CB A VAL 86 ? ? CA A VAL 86 ? ? C A VAL 86 ? ? 96.26 111.40 -15.14 1.90 N 2 1 C A LYS 161 ? ? N A PRO 162 ? ? CA A PRO 162 ? ? 128.61 119.30 9.31 1.50 Y 3 1 CB A ASP 164 ? ? CG A ASP 164 ? ? OD1 A ASP 164 ? ? 112.56 118.30 -5.74 0.90 N 4 1 C A ASN 267 ? ? N A PRO 268 ? ? CD A PRO 268 ? ? 110.59 128.40 -17.81 2.10 Y 5 1 C B ILE 180 ? ? N B PRO 181 ? ? CD B PRO 181 ? ? 110.19 128.40 -18.21 2.10 Y 6 1 C C SER 58 ? ? N C PRO 59 ? ? CD C PRO 59 ? ? 115.45 128.40 -12.95 2.10 Y 7 1 C C MET 134 ? ? N C PRO 135 ? ? CD C PRO 135 ? ? 114.41 128.40 -13.99 2.10 Y 8 1 C C ALA 147 ? ? N C PRO 148 ? ? CD C PRO 148 ? ? 112.09 128.40 -16.31 2.10 Y 9 1 C C PHE 206 ? ? N C PRO 207 ? ? CD C PRO 207 ? ? 115.31 128.40 -13.09 2.10 Y # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 LEU A 59 ? ? 39.89 41.55 2 1 THR A 60 ? ? -179.67 -177.06 3 1 HIS A 158 ? ? 89.31 -121.71 4 1 ALA A 184 ? ? -102.64 42.44 5 1 GLU A 205 ? ? -61.98 9.98 6 1 ASN A 243 ? ? -117.82 53.43 7 1 THR A 282 ? ? -74.36 -73.16 8 1 LEU B 19 ? ? -67.76 91.47 9 1 ALA B 20 ? ? -151.62 50.09 10 1 VAL B 37 ? ? -91.00 35.05 11 1 PHE B 41 ? ? 169.33 107.31 12 1 GLU B 50 ? ? -49.96 150.33 13 1 THR B 51 ? ? -67.64 74.07 14 1 ASN B 64 ? ? 33.15 61.65 15 1 GLN B 76 ? ? 176.79 161.15 16 1 PHE B 105 ? ? -173.87 -170.22 17 1 TYR B 143 ? ? -125.16 -169.47 18 1 HIS B 144 ? ? 36.49 50.41 19 1 LEU B 173 ? ? -82.28 31.30 20 1 SER B 175 ? ? -64.71 -71.54 21 1 ASP B 187 ? ? -88.67 35.59 22 1 ASN B 282 ? ? -93.60 45.68 23 1 ASN C 16 ? ? -162.16 105.90 24 1 LYS C 24 ? ? -56.70 -1.84 25 1 GLU C 31 ? ? -171.06 143.38 26 1 PHE C 32 ? ? -175.80 130.12 27 1 LEU C 42 ? ? -150.99 67.77 28 1 SER C 58 ? ? 75.04 50.56 29 1 LEU C 89 ? ? -65.43 89.75 30 1 ARG C 132 ? ? -105.37 76.24 31 1 GLN C 133 ? ? 71.02 51.25 32 1 HIS C 151 ? ? -137.60 -38.36 33 1 VAL C 168 ? ? -126.06 -169.88 34 1 ALA C 177 ? ? -90.35 31.42 35 1 ILE C 203 ? ? -117.86 -159.49 36 1 PRO C 226 ? ? -110.19 -150.62 37 1 TYR C 248 ? ? -123.67 -169.68 38 1 HIS C 260 ? ? 40.37 -129.87 39 1 ASP C 262 ? ? -77.73 32.15 # loop_ _pdbx_validate_peptide_omega.id _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_model_num _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_1 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_peptide_omega.label_alt_id_2 _pdbx_validate_peptide_omega.omega 1 1 ASN A 22 ? ? 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