data_2WDM # _entry.id 2WDM # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.280 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 2WDM PDBE EBI-39175 WWPDB D_1290039175 # _pdbx_database_PDB_obs_spr.id OBSLTE _pdbx_database_PDB_obs_spr.date 2014-12-10 _pdbx_database_PDB_obs_spr.pdb_id 4V5D _pdbx_database_PDB_obs_spr.replace_pdb_id 2WDM _pdbx_database_PDB_obs_spr.details ;THIS ENTRY WITH OTHER SPLIT ENTRIES HAVE BEEN CONSOLIDATED INTO A COMBINED FILE FOR COMPLETE REPRESENTATION. NO COORDINATES HAVE BEEN CHANGED. ; # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type _pdbx_database_related.details PDB 2WDK split ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A- AND P-SITE TRNAS, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. ; PDB 2WDL split ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A- AND P-SITE TRNAS, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FOR MOLECULE I. ; PDB 2WDM split . PDB 2WDN split ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A- AND P-SITE TRNAS, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FOR MOLECULE II. ; PDB 1HR0 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF INITIATION FACTOR IF1 BOUND TO THE 30SRIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 2V48 unspecified ;STRUCTURE OF THE RIBOSOME RECYCLING FACTOR BOUND TO THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME WITH MRNA, ASL-PHE AND TRNA-FMET (PART 3 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE ASL, E-SITE TRNA AND RRF FOR MOLECULE 2. ; PDB 1IBK unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH THE ANTIBIOTIC PAROMOMYCIN' PDB 1XMQ unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF T6A37-ASLLYSUUU AAA- MRNA BOUND TO THEDECODING CENTER' PDB 2B64 unspecified ;30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX.THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TRNAS, MRNA ANDRELEASE FACTOR RF1 FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLERIBOSOMAL COMPLEX". THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURE CONTAINSONE 70S RIBOSOME, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF1 ANDIS DESCRIBED IN REMARK 400. ; PDB 1IBL unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATETRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE ANDWITH THE ANTIBIOTIC PAROMOMYCIN ; PDB 2UUC unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE- ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUA-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 2B9M unspecified ;30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTOR RF2FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX.THIS FILE CONTAINS THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS, MRNAAND RELEASE FACTOR RF2 FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THEWHOLE RIBOSOMAL COMPLEX". THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURECONTAINS ONE 70S RIBOSOME, TRNAS, MRNA AND RELEASE FACTORRF2 AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. ; PDB 1PN8 unspecified ;COORDINATES OF S12, L11 PROTEINS AND E- SITE TRNA FROM 70SCRYSTAL STRUCTURE SEPARATELY FITTED INTO THE CRYO-EM MAPOF E.COLI 70S.EF-G.GDPNP COMPLEX. THE ATOMIC COORDINATESORIGINALLY FROM THE E-SITE TRNA WERE FITTED IN THEPOSITION OF THE HYBRID P /E-SITE TRNA. ; PDB 1XNR unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF AN INOSINE-CYTOSINE WOBBLE BASE PAIRIN THE CONTEXT OF THE DECODING CENTER' PDB 1DV4 unspecified 'PARTIAL STRUCTURE OF 16S RIBONUCLEIC ACID OF THE SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS' PDB 1HNZ unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH HYGROMYCIN B' PDB 1RSS unspecified 'RIBOSOMAL PROTEIN S7 FROM THERMUS THERMOPHILUS' PDB 2J02 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 3 OF 4) THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, A-, P- AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE II. ; PDB 1J5E unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 1JGQ unspecified ;THE PATH OF MESSENGER RNA THROUGH THE RIBOSOME. THIS FILE,1JGQ, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, ANDMRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 2J00 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME COMPLEXED WITH MRNA, TRNA AND PAROMOMYCIN (PART 1 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, A-, P- AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. ; PDB 1HNX unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH PACTAMYCIN' PDB 2B9O unspecified ;30S RIBOSOMAL SUBUNIT, TRNAS AND MRNA FROM A CRYSTALSTRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMAL COMPLEX WITH A STOP CODONIN THE A-SITE. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TRNASAND MRNA FROM A CRYSTAL STRUCTURE OF THE WHOLE RIBOSOMALCOMPLEX WITH A STOP CODON IN THE A-SITE AND IS DESCRIBEDIN REMARK 400 . ; PDB 1I94 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURES OF THE SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT WITHTETRACYCLINE, EDEINE AND IF3' PDB 1I96 unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUSTHERMOPHILUS IN COMPLEX WITH THE TRANSLATION INITIATIONFACTOR IF3 (C- TERMINAL DOMAIN) ; PDB 2UU9 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE- ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUG-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 1PN7 unspecified 'COORDINATES OF S12, L11 PROTEINS AND P- TRNA, FROM THE 70S X-RAY STRUCTURE ALIGNED TO THE 70S CRYO-EM MAP OF E. COLIRIBOSOME' PDB 2UUB unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE- ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUU-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 1VOV unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF FIVE 70S RIBOSOMES FROM ESCHERICHIACOLI IN COMPLEX WITH PROTEIN Y. THIS FILE CONTAINS THE 30SSUBUNIT OF ONE 70S RIBOSOME. THE ENTIRE CRYSTAL STRUCTURECONTAINS FIVE 70S RIBOSOMES AND IS DESCRIBED IN REMARK 400. ; PDB 1EG0 unspecified 'FITTING OF COMPONENTS WITH KNOWN STRUCTURE INTO AN 11.5 A CRYO-EM MAP OF THE E .COLI 70S RIBOSOME' PDB 1IBM unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATETRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE ; PDB 1EMI unspecified 'STRUCTURE OF 16S RRNA IN THE REGION AROUND RIBOSOMALPROTEIN S8.' PDB 2UXB unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA GGGU IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. ; PDB 2VQE unspecified ;MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING ; PDB 1G1X unspecified 'STRUCTURE OF RIBOSOMAL PROTEINS S15, S6, S18 , AND 16SRIBOSOMAL RNA' PDB 1PNX unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF THE WILD TYPE RIBOSOME FROM E. COLI,30S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME . THIS FILE, 1PNX, CONTAINSONLY MOLECULES OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50SSUBUNIT IS IN THE PDB FILE 1PNY. ; PDB 2V46 unspecified ;STRUCTURE OF THE RIBOSOME RECYCLING FACTOR BOUND TO THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME WITH MRNA, ASL-PHE AND TRNA-FMET (PART 1 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE ASL, E-SITE TRNA AND RRF FOR MOLECULE 1. ; PDB 2UUA unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH A VALINE- ASL WITH CMO5U IN POSITION 34 BOUND TO AN MRNA WITH A GUC-CODON IN THE A-SITE AND PAROMOMYCIN. ; PDB 1I95 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUSTHERMOPHILUS IN COMPLEX WITH EDEINE' PDB 1XNQ unspecified 'STRUCTURE OF AN INOSINE-ADENINE WOBBLE BASE PAIR COMPLEX INTHE CONTEXT OF THE DECODING CENTER' PDB 1QD7 unspecified 'PARTIAL MODEL FOR 30S RIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 1GIX unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOSOME AT 5.5 A RESOLUTION. THISFILE, 1GIX, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA,AND MRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 2VQF unspecified ;MODIFIED URIDINES WITH C5-METHYLENE SUBSTITUENTS AT THE FIRST POSITION OF THE TRNA ANTICODON STABILIZE U-G WOBBLE PAIRING DURING DECODING ; PDB 1JGO unspecified ;THE PATH OF MESSENGER RNA THROUGH THE RIBOSOME. THIS FILE,1JGO, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, ANDMRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 1JGP unspecified ;THE PATH OF MESSENGER RNA THROUGH THE RIBOSOME. THIS FILE,1JGP, CONTAINS THE 30S RIBOSOME SUBUNIT, THREE TRNA, ANDMRNA MOLECULES. 50S RIBOSOME SUBUNIT IS IN THE FILE 1GIY ; PDB 1N32 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITBOUND TO CODON AND NEAR- COGNATE TRANSFER RNA ANTICODONSTEM-LOOP MISMATCHED AT THE FIRST CODON POSITION AT THE ASITE WITH PAROMOMYCIN ; PDB 2F4V unspecified '30S RIBOSOME + DESIGNER ANTIBIOTIC' PDB 2JL5 unspecified ;INSIGHTS INTO TRANSLATIONAL TERMINATION FROM THE STRUCTURE OF RF2 BOUND TO THE RIBOSOME (PART 1 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT. ; PDB 1N34 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN THE PRESENCE OF CODON AND CRYSTALLOGRAPHICALLYDISORDERED NEAR-COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOPMISMATCHED AT THE FIRST CODON POSITION ; PDB 1N33 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITBOUND TO CODON AND NEAR- COGNATE TRANSFER RNA ANTICODONSTEM-LOOP MISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION AT THE ASITE WITH PAROMOMYCIN ; PDB 1TWT unspecified ;MODEL STRUCTURE OF THE T. THERMOPHILUS 70S RIBOSOME, 30SSUBUNIT OF 70S ROBOSOME. THIS FILE, 1TWT, CONTAINS ONLYMOLECULES OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 50S SUBUNIT ISIN THE PDB FILE 1TWV. ; PDB 2JL7 unspecified ;INSIGHTS INTO TRANSLATIONAL TERMINATION FROM THE STRUCTURE OF RF2 BOUND TO THE RIBOSOME (PART 3 OF 4). THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT. ; PDB 1PNS unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF A STREPTOMYCIN DEPENDENT RIBOSOME FROME. COLI, 30S SUBUNIT OF 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNS,CONTAINS THE 30S SUBUNIT, TWO TRNAS, AND ONE MRNAMOLECULE. THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT IS IN FILE 1PNU . ; PDB 1QZC unspecified ;COORDINATES OF S12, SH44, LH69 AND SRL SEPARATELY FITTEDINTO THE CRYO-EM MAP OF EF-TU TERNARY COMPLEX(GDP.KIRROMYCIN) BOUND 70S RIBOSOME ; PDB 2UXD unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA CGGG IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. ; PDB 1FKA unspecified 'STRUCTURE OF FUNCTIONALLY ACTIVATED SMALL RIBOSOMAL SUBUNITAT 3.3 A RESOLUTION' PDB 1YL4 unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF 70S RIBOSOME WITH THRS OPERATOR ANDTRNAS. 30S SUBUNIT. THE COORDINATES FOR THE 50S SUBUNITARE IN THE PDB ENTRY 1YL3 ; PDB 1FJG unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH THE ANTIBIOTICS STREPTOMYCIN, SPECTINOMYCIN,AND PAROMOMYCIN ; PDB 1N36 unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN THE PRESENCE OF CRYSTALLOGRAPHICALLY DISORDERED CODONAND NEAR- COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM- LOOPMISMATCHED AT THE SECOND CODON POSITION ; PDB 2UXC unspecified ;CRYSTAL STRUCTURE OF AN EXTENDED TRNA ANTICODON STEM LOOP IN COMPLEX WITH ITS COGNATE MRNA UCGU IN THE CONTEXT OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S SUBUNIT. ; PDB 1XMO unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF MNM5U34T6A37-TRNALYSUUU COMPLEXED WITHAAG-MRNA IN THE DECODING CENTER' PDB 1HNW unspecified 'STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNITIN COMPLEX WITH TETRACYCLINE' PDB 1I97 unspecified 'CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUSTHERMOPHILUS IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE' PDB 1L1U unspecified 'TERNARY COMPLEX DOCKED IN THE DECODING SITE OF THE 30SRIBOSOMAL SUBUNIT' PDB 2WDG unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A-SITE TRNA, DEACYLATED P-SITE TRNA, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE I. ; PDB 2WDH unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A-SITE TRNA, DEACYLATED P-SITE TRNA, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 30S SUBUNIT A-,P-, AND E-SITE TRNAS AND PAROMOMYCIN FOR MOLECULE II. ; PDB 2WDI unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A-SITE TRNA, DEACYLATED P-SITE TRNA, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FOR MOLECULE I. ; PDB 2WDJ unspecified ;STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 70S RIBOSOME IN COMPLEX WITH MRNA, PAROMOMYCIN, ACYLATED A-SITE TRNA, DEACYLATED P-SITE TRNA, AND E-SITE TRNA. THIS FILE CONTAINS THE 50S SUBUNIT FOR MOLECULE II. ; # _pdbx_database_status.status_code OBS _pdbx_database_status.entry_id 2WDM _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2009-03-24 _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Voorhees, R.M.' 1 'Weixlbaumer, A.' 2 'Loakes, D.' 3 'Kelley, A.C.' 4 'Ramakrishnan, V.' 5 # _citation.id primary _citation.title 'Insights Into Substrate Stabilization from Snapshots of the Peptidyl Transferase Center of the Intact 70S Ribosome' _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_volume 16 _citation.page_first 528 _citation.page_last ? _citation.year 2009 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 1545-9993 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 19363482 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/NSMB.1577 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Voorhees, R.M.' 1 primary 'Weixlbaumer, A.' 2 primary 'Loakes, D.' 3 primary 'Kelley, A.C.' 4 primary 'Ramakrishnan, V.' 5 # _cell.entry_id 2WDM _cell.length_a 210.864 _cell.length_b 450.456 _cell.length_c 628.880 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2WDM _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '16S RRNA' 493958.281 1 ? ? ? 'CHAIN A (16S RNA) HAS E.COLI NUMBERING, BASED ON A STRUCTURAL ALIGNMENT WITH THE CORRESPONDING E.COLI STRUCTURE IN 2AVY' 2 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S2' 29317.703 1 ? ? ? ? 3 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S3' 26751.076 1 ? ? ? ? 4 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S4' 24373.447 1 ? ? ? ? 5 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S5' 17583.416 1 ? ? ? ? 6 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S6' 11988.753 1 ? ? ? ? 7 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S7' 18050.973 1 ? ? ? ? 8 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S8' 15868.570 1 ? ? ? ? 9 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S9' 14429.661 1 ? ? ? ? 10 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S10' 11954.968 1 ? ? ? ? 11 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S11' 13737.868 1 ? ? ? ? 12 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S12' 14920.754 1 ? ? 'RESIDUES 2-132' ? 13 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S13' 14338.861 1 ? ? ? ? 14 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S14' 7158.725 1 ? ? ? ? 15 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S15' 10578.407 1 ? ? ? ? 16 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S16' 10409.983 1 ? ? ? ? 17 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S17' 12325.655 1 ? ? ? ? 18 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S18' 10258.299 1 ? ? ? ? 19 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S19' 10605.464 1 ? ? ? ? 20 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN S20' 11736.143 1 ? ? ? ? 21 polymer nat '30S RIBOSOMAL PROTEIN THX' 3350.030 1 ? ? ? ? 22 polymer nat 'P AND A-SITE PHE-TRNA PHE' 24615.730 2 ? ? ? 'UNMODIFIED BASES' 23 polymer nat 'E-SITE TRNA PHE' 24485.539 1 ? ? ? 'UNMODIFIED BASES' 24 polymer syn MRNA 3436.098 1 ? ? ? ? 25 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 673 ? ? ? ? 26 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 3 ? ? ? ? 27 non-polymer syn PAROMOMYCIN 615.628 1 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 6 _entity_name_com.name TS9 # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polyribonucleotide no no ;UUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGU UUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUC GGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAU CAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUG AGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCU UGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUA AUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGG GCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGAC GGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCC ACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAA CGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAG GCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUU ACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUG GCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUC GGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCC UGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCC AGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUA CGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGG CGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU CU ; ;UUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGU UUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUC GGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAU CAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUG AGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCU UGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUA AUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGG GCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGAC GGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCC ACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAA CGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAG GCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUU ACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUG GCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUC GGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCC UGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCC AGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUA CGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGG CGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU CU ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDI VRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPD AIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ EAEATETPEGESEVEA ; ;MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDI VRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPD AIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQ EAEATETPEGESEVEA ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; ;MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRG GERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGA EQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; ;MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFE EASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQ NLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; ;MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEI EVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQA QG ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; ;MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELR IRDNVRRVMVVKSQEPFLANA ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV GGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; ;MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRV GGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; ;MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVI HHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLG IARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; ;MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLG IARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR ; I ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MPKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRK TIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR ; ;MPKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRK TIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSV DVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; ;MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSV DVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MVALPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEH SVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK ; ;MVALPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEH SVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKR LMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; ;MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKR LMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRA LIEKLGIRG ; ;MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRA LIEKLGIRG ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEAREGA ; ;MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVF RQEAREGA ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESG RMDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; ;MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESG RMDLVEKYLIRRQNYESLSKRGGKA ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLP FTEKLVRK ; ;MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSAKEQRILAKTIKRARILGLLP FTEKLVRK ; R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTY RGHGKEAKATKKK ; ;MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTY RGHGKEAKATKKK ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARR KSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; ;MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARR KSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK MGKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK U ? 22 polyribonucleotide no yes ;GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACC(8AN) (PHA) ; GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCAF V,Y ? 23 polyribonucleotide no no GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAGGGGAUUGAAAAUCCCCGUGUCCUUGGUUCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA W ? 24 polyribonucleotide no no AAAAUUCUUCA AAAAUUCUUCA X ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 U n 1 3 U n 1 4 G n 1 5 U n 1 6 U n 1 7 G n 1 8 G n 1 9 A n 1 10 G n 1 11 A n 1 12 G n 1 13 U n 1 14 U n 1 15 U n 1 16 G n 1 17 A n 1 18 U n 1 19 C n 1 20 C n 1 21 U n 1 22 G n 1 23 G n 1 24 C n 1 25 U n 1 26 C n 1 27 A n 1 28 G n 1 29 G n 1 30 G n 1 31 U n 1 32 G n 1 33 A n 1 34 A n 1 35 C n 1 36 G n 1 37 C n 1 38 U n 1 39 G n 1 40 G n 1 41 C n 1 42 G n 1 43 G n 1 44 C n 1 45 G n 1 46 U n 1 47 G n 1 48 C n 1 49 C n 1 50 U n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 A n 1 55 C n 1 56 A n 1 57 U n 1 58 G n 1 59 C n 1 60 A n 1 61 A n 1 62 G n 1 63 U n 1 64 C n 1 65 G n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 G n 1 71 G n 1 72 C n 1 73 C n 1 74 G n 1 75 C n 1 76 G n 1 77 G n 1 78 G n 1 79 G n 1 80 U n 1 81 U n 1 82 U n 1 83 U n 1 84 A n 1 85 C n 1 86 U n 1 87 C n 1 88 C n 1 89 G n 1 90 U n 1 91 G n 1 92 G n 1 93 U n 1 94 C n 1 95 A n 1 96 G n 1 97 C n 1 98 G n 1 99 G n 1 100 C n 1 101 G n 1 102 G n 1 103 A n 1 104 C n 1 105 G n 1 106 G n 1 107 G n 1 108 U n 1 109 G n 1 110 A n 1 111 G n 1 112 U n 1 113 A n 1 114 A n 1 115 C n 1 116 G n 1 117 C n 1 118 G n 1 119 U n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 G n 1 123 U n 1 124 G n 1 125 A n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 U n 1 129 A n 1 130 C n 1 131 C n 1 132 C n 1 133 G n 1 134 G n 1 135 A n 1 136 A n 1 137 G n 1 138 A n 1 139 G n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 G n 1 143 G n 1 144 A n 1 145 C n 1 146 A n 1 147 A n 1 148 C n 1 149 C n 1 150 C n 1 151 G n 1 152 G n 1 153 G n 1 154 G n 1 155 A n 1 156 A n 1 157 A n 1 158 C n 1 159 U n 1 160 C n 1 161 G n 1 162 G n 1 163 G n 1 164 C n 1 165 U n 1 166 A n 1 167 A n 1 168 U n 1 169 C n 1 170 C n 1 171 C n 1 172 C n 1 173 C n 1 174 A n 1 175 U n 1 176 G n 1 177 U n 1 178 G n 1 179 G n 1 180 A n 1 181 C n 1 182 C n 1 183 C n 1 184 G n 1 185 C n 1 186 C n 1 187 C n 1 188 C n 1 189 U n 1 190 U n 1 191 G n 1 192 G n 1 193 G n 1 194 G n 1 195 U n 1 196 G n 1 197 U n 1 198 G n 1 199 U n 1 200 C n 1 201 C n 1 202 A n 1 203 A n 1 204 A n 1 205 G n 1 206 G n 1 207 G n 1 208 C n 1 209 U n 1 210 U n 1 211 U n 1 212 G n 1 213 C n 1 214 C n 1 215 C n 1 216 G n 1 217 C n 1 218 U n 1 219 U n 1 220 C n 1 221 C n 1 222 G n 1 223 G n 1 224 A n 1 225 U n 1 226 G n 1 227 G n 1 228 G n 1 229 C n 1 230 C n 1 231 C n 1 232 G n 1 233 C n 1 234 G n 1 235 U n 1 236 C n 1 237 C n 1 238 C n 1 239 A n 1 240 U n 1 241 C n 1 242 A n 1 243 G n 1 244 C n 1 245 U n 1 246 A n 1 247 G n 1 248 U n 1 249 U n 1 250 G n 1 251 G n 1 252 U n 1 253 G n 1 254 G n 1 255 G n 1 256 G n 1 257 U n 1 258 A n 1 259 A n 1 260 U n 1 261 G n 1 262 G n 1 263 C n 1 264 C n 1 265 C n 1 266 A n 1 267 C n 1 268 C n 1 269 A n 1 270 A n 1 271 G n 1 272 G n 1 273 C n 1 274 G n 1 275 A n 1 276 C n 1 277 G n 1 278 A n 1 279 C n 1 280 G n 1 281 G n 1 282 G n 1 283 U n 1 284 A n 1 285 G n 1 286 C n 1 287 C n 1 288 G n 1 289 G n 1 290 U n 1 291 C n 1 292 U n 1 293 G n 1 294 A n 1 295 G n 1 296 A n 1 297 G n 1 298 G n 1 299 A n 1 300 U n 1 301 G n 1 302 G n 1 303 C n 1 304 C n 1 305 G n 1 306 G n 1 307 C n 1 308 C n 1 309 A n 1 310 C n 1 311 A n 1 312 G n 1 313 G n 1 314 G n 1 315 G n 1 316 C n 1 317 A n 1 318 C n 1 319 U n 1 320 G n 1 321 A n 1 322 G n 1 323 A n 1 324 C n 1 325 A n 1 326 C n 1 327 G n 1 328 G n 1 329 G n 1 330 C n 1 331 C n 1 332 C n 1 333 C n 1 334 A n 1 335 C n 1 336 U n 1 337 C n 1 338 C n 1 339 U n 1 340 A n 1 341 C n 1 342 G n 1 343 G n 1 344 G n 1 345 A n 1 346 G n 1 347 G n 1 348 C n 1 349 A n 1 350 G n 1 351 C n 1 352 A n 1 353 G n 1 354 U n 1 355 U n 1 356 A n 1 357 G n 1 358 G n 1 359 A n 1 360 A n 1 361 U n 1 362 C n 1 363 U n 1 364 U n 1 365 C n 1 366 C n 1 367 G n 1 368 C n 1 369 A n 1 370 A n 1 371 U n 1 372 G n 1 373 G n 1 374 G n 1 375 C n 1 376 G n 1 377 C n 1 378 A n 1 379 A n 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Q5SIH3 ? 23 PDB 2WDM 22 ? ? 2WDM ? 24 PDB 2WDM 23 ? ? 2WDM ? 25 PDB 2WDM 24 ? ? 2WDM ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2WDM A 1 ? 1522 ? 2WDM 0 ? 1544 ? 0 1544 2 2 2WDM B 1 ? 256 ? P80371 1 ? 256 ? 1 256 3 3 2WDM C 1 ? 239 ? P80372 1 ? 239 ? 1 239 4 4 2WDM D 1 ? 209 ? P80373 1 ? 209 ? 1 209 5 5 2WDM E 1 ? 162 ? Q5SHQ5 1 ? 162 ? 1 162 6 6 2WDM F 1 ? 101 ? Q5SLP8 1 ? 101 ? 1 101 7 7 2WDM G 1 ? 156 ? P17291 1 ? 156 ? 1 156 8 8 2WDM H 1 ? 138 ? Q5SHQ2 1 ? 138 ? 1 138 9 9 2WDM I 1 ? 128 ? P62669 1 ? 128 ? 1 128 10 10 2WDM J 1 ? 105 ? Q5SHN7 1 ? 105 ? 1 105 11 11 2WDM K 1 ? 129 ? P80376 1 ? 129 ? 1 129 12 12 2WDM L 1 ? 4 ? 2WDM 1 ? 4 ? 1 4 13 13 2WDM L 5 ? 135 ? Q5SHN3 2 ? 132 ? 5 135 14 14 2WDM M 1 ? 126 ? P80377 1 ? 126 ? 1 126 15 15 2WDM N 1 ? 61 ? Q5SHQ1 1 ? 61 ? 1 61 16 16 2WDM O 1 ? 89 ? Q5SJ76 1 ? 89 ? 1 89 17 17 2WDM P 1 ? 88 ? Q5SJH3 1 ? 88 ? 1 88 18 18 2WDM Q 1 ? 105 ? Q5SHP7 1 ? 105 ? 1 105 19 19 2WDM R 1 ? 88 ? Q5SLQ0 1 ? 88 ? 1 88 20 20 2WDM S 1 ? 93 ? Q5SHP2 1 ? 93 ? 1 93 21 21 2WDM T 1 ? 106 ? P80380 1 ? 106 ? 1 106 22 22 2WDM U 1 ? 27 ? Q5SIH3 1 ? 27 ? 1 27 23 23 2WDM V 1 ? 77 ? 2WDM 1 ? 77 ? 1 77 24 24 2WDM W 1 ? 76 ? 2WDM 1 ? 76 ? 1 76 25 25 2WDM X 1 ? 11 ? 2WDM 12 ? 22 ? 12 22 26 23 2WDM Y 1 ? 77 ? 2WDM 1 ? 77 ? 1 77 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 8AN 'RNA linking' n ;3'-amino-3'-deoxyadenosine 5'-(dihydrogen phosphate) ; ? 'C10 H15 N6 O6 P' 346.236 A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PAR non-polymer . PAROMOMYCIN 'PAROMOMYCIN I, AMMINOSIDIN, CATENULIN, CRESTOMYCIN, MONOMYCIN A, NEOMYCIN E' 'C23 H45 N5 O14' 615.628 PHA 'L-peptide linking' n PHENYLALANINAL ? 'C9 H11 N O' 149.190 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.entry_id 2WDM _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description NONE # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.1 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'pH 7.1' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 77 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector PIXEL _diffrn_detector.type 'DECTRIS PILATUS 6M' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2008-07-20 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.000 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SLS BEAMLINE X06SA' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X06SA _diffrn_source.pdbx_wavelength 1.000 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 2WDM _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.0 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 50.00 _reflns.d_resolution_high 3.40 _reflns.number_obs 789136 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 97.1 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.20 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 7.42 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 52.00 _reflns.pdbx_redundancy 5.6 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 3.40 _reflns_shell.d_res_low 3.50 _reflns_shell.percent_possible_all 75.0 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.97 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.04 _reflns_shell.pdbx_redundancy 2.48 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 2WDM _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 738740 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.000 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 50.00 _refine.ls_d_res_high 3.50 _refine.ls_percent_reflns_obs 99.1 _refine.ls_R_factor_obs 0.208 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.208 _refine.ls_R_factor_R_free 0.256 _refine.ls_R_factor_R_free_error 0.001 _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 4.600 _refine.ls_number_reflns_R_free 33747 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean 105.90 _refine.aniso_B[1][1] 1.64000 _refine.aniso_B[2][2] -6.29000 _refine.aniso_B[3][3] 4.64000 _refine.aniso_B[1][2] 0.00000 _refine.aniso_B[1][3] 0.00000 _refine.aniso_B[2][3] 0.00000 _refine.solvent_model_details 'FLAT MODEL' _refine.solvent_model_param_ksol 0.30 _refine.solvent_model_param_bsol 47.77 _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;THIS IS THE FIRST OF A FOUR-PART DEPOSITION FOR A COMPLEX OF THE 70S RIBOSOME AND RELEASE FACTOR RF2 (RELATED TO 2WDK, 2WDL AND 2WDN). REGIONS OF THE 23S RNA AND SEVERAL 50S SUBUNIT PROTEINS WERE CORRECTED IN THIS STRUCTURE BY RE-EVALUATING DATA FROM 2J01 AND 2JL6 (THE SARCIN-RICIN LOOP, A-SITE FINGER, L1 ARM, AND PROTEINS L28 AND L36) AND BY COMPARISON WITH 3D5B (L2, L9, L13, L15, L21, L23, L31, L35). ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRY 2J00' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_analyze.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_analyze.entry_id 2WDM _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_obs 0.43 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_obs 0.74 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_obs 5.00 _refine_analyze.Luzzati_coordinate_error_free 0.50 _refine_analyze.Luzzati_sigma_a_free 0.81 _refine_analyze.Luzzati_d_res_low_free ? _refine_analyze.number_disordered_residues ? _refine_analyze.occupancy_sum_hydrogen ? _refine_analyze.occupancy_sum_non_hydrogen ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 19157 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 37435 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 718 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 57310 _refine_hist.d_res_high 3.50 _refine_hist.d_res_low 50.00 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function c_bond_d 0.007 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg 1.50 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d 28.90 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d 1.50 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? c_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_restr_ncs.dom_id 1 _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details RESTRAINTS _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position ? _refine_ls_restr_ncs.weight_position ? _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso ? _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso ? _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal 1 _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type . _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id . _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 1 _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 6 _refine_ls_shell.d_res_high 3.50 _refine_ls_shell.d_res_low 3.72 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 113302 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.3200 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 96.60 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.3500 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error 0.005 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free 4.90 _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 5890 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? # loop_ _pdbx_xplor_file.pdbx_refine_id _pdbx_xplor_file.serial_no _pdbx_xplor_file.param_file _pdbx_xplor_file.topol_file 'X-RAY DIFFRACTION' 1 WATER_REP.PARAM WATER.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 2 ION.PARAM ION.TOP 'X-RAY DIFFRACTION' 3 PAR_LIGAND.PAR ? 'X-RAY DIFFRACTION' 4 DNA-RNA-MULTI-ENDO_NHA.PARAM ? 'X-RAY DIFFRACTION' 5 PROTEIN_REP_NHA.PARAM ? # _struct_ncs_dom.id 1 _struct_ncs_dom.details ? _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 2WDM _struct.title ;Structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome in complex with mRNA, paromomycin, acylated A- and P-site tRNAs, and E-site tRNA. This file contains the 30S subunit A-,P-, and E-site tRNAs and paromomycin for molecule II. ; _struct.pdbx_descriptor ;30S RIBOSOMAL PROTEIN S2, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20, 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX/RNA Complex, PAROMOMYCIN ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2WDM _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text ;METAL-BINDING, RIBOSOMAL PROTEIN, RIBONUCLEOPROTEIN, TRANSLATION, COILED COIL, TRNA-BINDING, RRNA-BINDING, TRNA, ZINC, MRNA, RIBOSOME, RNA-BINDING, ZINC-FINGER ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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LYS I 97 ? TYR I 92 LYS I 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P51 51 LYS J 14 ? GLN J 21 ? LYS J 14 GLN J 21 1 ? 8 HELX_P HELX_P52 52 ASN J 78 ? LEU J 85 ? ASN J 78 LEU J 85 1 ? 8 HELX_P HELX_P53 53 LYS K 51 ? GLY K 56 ? LYS K 51 GLY K 56 5 ? 6 HELX_P HELX_P54 54 THR K 57 ? TYR K 75 ? THR K 57 TYR K 75 1 ? 19 HELX_P HELX_P55 55 GLY K 90 ? ALA K 100 ? GLY K 90 ALA K 100 1 ? 11 HELX_P HELX_P56 56 THR L 6 ? LYS L 13 ? THR L 6 LYS L 13 1 ? 8 HELX_P HELX_P57 57 ARG M 14 ? LEU M 19 ? ARG M 14 LEU M 19 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 58 THR M 20 ? ILE M 22 ? THR M 20 ILE M 22 5 ? 3 HELX_P HELX_P59 59 GLY M 26 ? LEU M 34 ? GLY M 26 LEU M 34 1 ? 9 HELX_P HELX_P60 60 THR M 49 ? TRP M 64 ? THR M 49 TRP M 64 1 ? 16 HELX_P HELX_P61 61 ALA M 75 ? LEU M 81 ? ALA M 75 LEU M 81 1 ? 7 HELX_P HELX_P62 62 ARG N 3 ? ALA N 10 ? ARG N 3 ALA N 10 1 ? 8 HELX_P HELX_P63 63 PHE N 16 ? ALA N 20 ? PHE N 16 ALA N 20 5 ? 5 HELX_P HELX_P64 64 CYS N 40 ? GLY N 51 ? CYS N 40 GLY N 51 1 ? 12 HELX_P HELX_P65 65 THR O 4 ? GLN O 13 ? THR O 4 GLN O 13 1 ? 10 HELX_P HELX_P66 66 SER O 24 ? HIS O 46 ? SER O 24 HIS O 46 1 ? 23 HELX_P HELX_P67 67 HIS O 50 ? ASP O 74 ? HIS O 50 ASP O 74 1 ? 25 HELX_P HELX_P68 68 GLU O 76 ? GLY O 86 ? GLU O 76 GLY O 86 1 ? 11 HELX_P HELX_P69 69 ASP P 52 ? VAL P 62 ? ASP P 52 VAL P 62 1 ? 11 HELX_P HELX_P70 70 ARG P 71 ? GLN P 76 ? ARG P 71 GLN P 76 1 ? 6 HELX_P HELX_P71 71 ARG Q 81 ? SER Q 99 ? ARG Q 81 SER Q 99 1 ? 19 HELX_P HELX_P72 72 ASN R 36 ? LYS R 41 ? ASN R 36 LYS R 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P73 73 ARG R 42 ? LEU R 44 ? ARG R 42 LEU R 44 5 ? 3 HELX_P HELX_P74 74 PRO R 52 ? GLY R 57 ? PRO R 52 GLY R 57 1 ? 6 HELX_P HELX_P75 75 SER R 59 ? LEU R 76 ? SER R 59 LEU R 76 1 ? 18 HELX_P HELX_P76 76 ASP S 12 ? GLU S 21 ? ASP S 12 GLU S 21 1 ? 10 HELX_P HELX_P77 77 LYS S 70 ? ALA S 75 ? LYS S 70 ALA S 75 5 ? 6 HELX_P HELX_P78 78 LEU T 13 ? GLU T 46 ? LEU T 13 GLU T 46 1 ? 34 HELX_P HELX_P79 79 ALA T 49 ? GLY T 69 ? ALA T 49 GLY T 69 1 ? 21 HELX_P HELX_P80 80 ASN T 75 ? GLU T 93 ? ASN T 75 GLU T 93 1 ? 19 HELX_P HELX_P81 81 THR U 8 ? GLY U 16 ? THR U 8 GLY U 16 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? D CYS 12 SG ? ? ? 1_555 D CYS 31 SG ? ? D CYS 12 D CYS 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? disulf2 disulf ? ? D CYS 12 SG ? ? ? 1_555 D CYS 26 SG ? ? D CYS 12 D CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.912 ? covale1 covale ? ? V C 75 "O3'" ? ? ? 1_555 V 8AN 76 P ? ? V C 75 V 8AN 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.604 ? covale2 covale ? ? V 8AN 76 "N3'" ? ? ? 1_555 V PHA 77 C ? ? V 8AN 76 V PHA 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale3 covale ? ? Y C 75 "O3'" ? ? ? 1_555 Y 8AN 76 P ? ? Y C 75 Y 8AN 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.612 ? covale4 covale ? ? Y 8AN 76 "N3'" ? ? ? 1_555 Y PHA 77 C ? ? Y 8AN 76 Y PHA 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? metalc1 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1412 "O2'" ? ? Z MG 2 A C 1429 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? metalc2 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1413 "O4'" ? ? Z MG 2 A C 1430 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? metalc3 metalc ? ? CA MG . MG ? ? ? 1_555 A U 777 O4 ? ? Z MG 4 A U 793 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc4 metalc ? ? GA MG . MG ? ? ? 1_555 L PRO 48 O ? ? Z MG 11 L PRO 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc5 metalc ? ? HA MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1385 OP2 ? ? Z MG 12 A C 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? metalc6 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 558 OP2 ? ? Z MG 16 A A 574 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? metalc7 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 556 OP2 ? ? Z MG 16 A A 572 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? metalc8 metalc ? ? LA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 557 OP2 ? ? Z MG 16 A A 573 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc9 metalc ? ? OA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 311 OP1 ? ? Z MG 19 A A 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc10 metalc ? ? PA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1478 OP1 ? ? Z MG 20 A A 1500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc11 metalc ? ? PA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1485 "O3'" ? ? Z MG 20 A A 1507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? metalc12 metalc ? ? PA MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1486 OP1 ? ? Z MG 20 A G 1508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.906 ? metalc13 metalc ? ? RA MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1037 "O5'" ? ? Z MG 22 A C 1054 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.557 ? metalc14 metalc ? ? RA MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1180 OP2 ? ? Z MG 22 A G 1198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc15 metalc ? ? RA MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1179 OP1 ? ? Z MG 22 A G 1197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? metalc16 metalc ? ? XA MG . MG ? ? ? 1_555 A G 358 O6 ? ? Z MG 28 A G 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc17 metalc ? ? XA MG . MG ? ? ? 1_555 A G 358 N7 ? ? Z MG 28 A G 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? metalc18 metalc ? ? YA MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1186 N7 ? ? Z MG 29 A A 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.818 ? metalc19 metalc ? ? YA MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1187 O4 ? ? Z MG 29 A U 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.876 ? metalc20 metalc ? ? ZA MG . MG ? ? ? 1_555 A G 254 O6 ? ? Z MG 30 A G 258 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? metalc21 metalc ? ? FB MG . MG ? ? ? 1_555 A A 752 OP2 ? ? Z MG 36 A A 768 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.864 ? metalc22 metalc ? ? GB MG . MG ? ? ? 1_555 A A 556 "O5'" ? ? Z MG 37 A A 572 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? metalc23 metalc ? ? GB MG . MG ? ? ? 1_555 A A 556 OP1 ? ? Z MG 37 A A 572 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.954 ? metalc24 metalc ? ? IB MG . MG ? ? ? 1_555 A C 49 OP2 ? ? Z MG 39 A C 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc25 metalc ? ? IB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 109 OP1 ? ? Z MG 39 A G 115 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc26 metalc ? ? JB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 847 N7 ? ? Z MG 40 A G 869 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc27 metalc ? ? JB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 836 N7 ? ? Z MG 40 A G 858 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc28 metalc ? ? LB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1353 O6 ? ? Z MG 42 A G 1370 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc29 metalc ? ? NB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1206 OP1 ? ? Z MG 44 A G 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.968 ? metalc30 metalc ? ? OB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1418 O6 ? ? Z MG 45 A G 1435 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc31 metalc ? ? PB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 542 OP1 ? ? Z MG 46 A G 558 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? metalc32 metalc ? ? PB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 295 O6 ? ? Z MG 46 A G 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.950 ? metalc33 metalc ? ? QB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 320 N7 ? ? Z MG 47 A G 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? metalc34 metalc ? ? RB MG . MG ? ? ? 1_555 A A 517 OP2 ? ? Z MG 48 A A 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? metalc35 metalc ? ? RB MG . MG ? ? ? 1_555 A U 500 O4 ? ? Z MG 48 A U 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc36 metalc ? ? UB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1091 O6 ? ? Z MG 51 A G 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc37 metalc ? ? UB MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1078 OP2 ? ? Z MG 51 A U 1095 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc38 metalc ? ? WB MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1504 O6 ? ? Z MG 53 A G 1526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc39 metalc ? ? YB MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1476 "O3'" ? ? Z MG 55 A U 1498 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc40 metalc ? ? YB MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1477 OP2 ? ? Z MG 55 A A 1499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? metalc41 metalc ? ? YB MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1478 OP2 ? ? Z MG 55 A A 1500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.363 ? metalc42 metalc ? ? AC MG . MG ? ? ? 1_555 A A 202 OP2 ? ? Z MG 57 A A 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.744 ? metalc43 metalc ? ? CC MG . MG ? ? ? 1_555 A A 110 OP2 ? ? Z MG 59 A A 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc44 metalc ? ? CC MG . MG ? ? ? 1_555 A G 285 OP2 ? ? Z MG 59 A G 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? metalc45 metalc ? ? CC MG . MG ? ? ? 1_555 A G 285 "O5'" ? ? Z MG 59 A G 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.710 ? metalc46 metalc ? ? CC MG . MG ? ? ? 1_555 A G 111 OP1 ? ? Z MG 59 A G 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc47 metalc ? ? CC MG . MG ? ? ? 1_555 A U 112 O4 ? ? Z MG 59 A U 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.760 ? metalc48 metalc ? ? DC MG . MG ? ? ? 1_555 A C 348 OP1 ? ? Z MG 60 A C 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc49 metalc ? ? EC MG . MG ? ? ? 1_555 A C 104 OP2 ? ? Z MG 61 A C 110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? metalc50 metalc ? ? IC MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1400 O6 ? ? Z MG 65 A G 1417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc51 metalc ? ? OF MG . MG ? ? ? 1_555 A C 503 O2 ? ? Z MG 149 A C 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? metalc52 metalc ? ? OF MG . MG ? ? ? 1_555 A C 503 "O2'" ? ? Z MG 149 A C 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc53 metalc ? ? OF MG . MG ? ? ? 1_555 A A 504 "O4'" ? ? Z MG 149 A A 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? metalc54 metalc ? ? PF MG . MG ? ? ? 1_555 A G 708 OP1 ? ? Z MG 150 A G 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc55 metalc ? ? PF MG . MG ? ? ? 1_555 A G 709 OP2 ? ? Z MG 150 A G 725 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? metalc56 metalc ? ? RF MG . MG ? ? ? 1_555 D LYS 151 NZ ? ? Z MG 152 D LYS 151 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc57 metalc ? ? TF MG . MG ? ? ? 1_555 A U 383 OP1 ? ? Z MG 154 A U 387 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.910 ? metalc58 metalc ? ? VF MG . MG ? ? ? 1_555 A G 651 OP1 ? ? Z MG 156 A G 667 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.772 ? metalc59 metalc ? ? VF MG . MG ? ? ? 1_555 A C 716 "O2'" ? ? Z MG 156 A C 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? metalc60 metalc ? ? VF MG . MG ? ? ? 1_555 A C 716 "O3'" ? ? Z MG 156 A C 732 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc61 metalc ? ? WF MG . MG ? ? ? 1_555 A A 294 "O3'" ? ? Z MG 157 A A 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc62 metalc ? ? WF MG . MG ? ? ? 1_555 A G 295 OP2 ? ? Z MG 157 A G 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc63 metalc ? ? YF MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1444 OP2 ? ? Z MG 159 A C 1466 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.817 ? metalc64 metalc ? ? AG MG . MG ? ? ? 1_555 A G 954 O6 ? ? Z MG 161 A G 976 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc65 metalc ? ? EG MG . MG ? ? ? 1_555 A A 750 OP2 ? ? Z MG 166 A A 766 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc66 metalc ? ? IG MG . MG ? ? ? 1_555 A C 580 OP2 ? ? Z MG 170 A C 596 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? metalc67 metalc ? ? IG MG . MG ? ? ? 1_555 A G 581 OP2 ? ? Z MG 170 A G 597 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? metalc68 metalc ? ? IG MG . MG ? ? ? 1_555 A U 582 O4 ? ? Z MG 170 A U 598 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc69 metalc ? ? KG MG . MG ? ? ? 1_555 A G 863 O6 ? ? Z MG 173 A G 885 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? metalc70 metalc ? ? PG MG . MG ? ? ? 1_555 A G 551 OP1 ? ? Z MG 178 A G 567 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.771 ? metalc71 metalc ? ? PG MG . MG ? ? ? 1_555 A U 549 OP2 ? ? Z MG 178 A U 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc72 metalc ? ? PG MG . MG ? ? ? 1_555 A C 548 OP2 ? ? Z MG 178 A C 564 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc73 metalc ? ? QG MG . MG ? ? ? 1_555 A G 666 O6 ? ? Z MG 179 A G 682 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? metalc74 metalc ? ? SG MG . MG ? ? ? 1_555 A A 174 OP2 ? ? Z MG 181 A A 179 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc75 metalc ? ? UG MG . MG ? ? ? 1_555 A A 516 "O2'" ? ? Z MG 183 A A 532 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? metalc76 metalc ? ? WG MG . MG ? ? ? 1_555 A A 54 OP2 ? ? Z MG 185 A A 53 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.200 ? metalc77 metalc ? ? YG MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1246 OP2 ? ? Z MG 187 A C 1264 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc78 metalc ? ? BH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 8 OP2 ? ? Z MG 190 A G 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc79 metalc ? ? DH MG . MG ? ? ? 1_555 A U 177 OP2 ? ? Z MG 192 A U 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc80 metalc ? ? DH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 176 "O2'" ? ? Z MG 192 A G 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.548 ? metalc81 metalc ? ? EH MG . MG ? ? ? 1_555 A U 383 O4 ? ? Z MG 193 A U 387 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc82 metalc ? ? EH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 372 O6 ? ? Z MG 193 A G 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc83 metalc ? ? GH MG . MG ? ? ? 1_555 A C 488 OP1 ? ? Z MG 195 A C 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.853 ? metalc84 metalc ? ? GH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 489 OP2 ? ? Z MG 195 A G 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc85 metalc ? ? IH MG . MG ? ? ? 1_555 A A 778 OP1 ? ? Z MG 198 A A 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? metalc86 metalc ? ? IH MG . MG ? ? ? 1_555 A A 766 OP1 ? ? Z MG 198 A A 782 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.852 ? metalc87 metalc ? ? IH MG . MG ? ? ? 1_555 A A 778 OP2 ? ? Z MG 198 A A 794 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc88 metalc ? ? LH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 923 OP2 ? ? Z MG 201 A G 945 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc89 metalc ? ? LH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 922 OP1 ? ? Z MG 201 A G 944 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? metalc90 metalc ? ? MH MG . MG ? ? ? 1_555 A C 957 OP1 ? ? Z MG 202 A C 979 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc91 metalc ? ? MH MG . MG ? ? ? 1_555 A C 958 OP2 ? ? Z MG 202 A C 980 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc92 metalc ? ? MH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1204 O6 ? ? Z MG 202 A G 1222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc93 metalc ? ? NH MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1484 O2 ? ? Z MG 203 A U 1506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? metalc94 metalc ? ? OH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 327 OP2 ? ? Z MG 204 A G 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.865 ? metalc95 metalc ? ? OH MG . MG ? ? ? 1_555 A A 103 OP1 ? ? Z MG 204 A A 109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc96 metalc ? ? PH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1065 N7 ? ? Z MG 205 A G 1082 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.798 ? metalc97 metalc ? ? QH MG . MG ? ? ? 1_555 L PRO 48 O ? ? Z MG 206 L PRO 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc98 metalc ? ? QH MG . MG ? ? ? 1_555 A C 502 N3 ? ? Z MG 206 A C 518 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? metalc99 metalc ? ? QH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 513 O6 ? ? Z MG 206 A G 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc100 metalc ? ? SH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1501 O6 ? ? Z MG 208 A G 1523 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc101 metalc ? ? SH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1489 O6 ? ? Z MG 208 A G 1511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc102 metalc ? ? TH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 247 "O2'" ? ? Z MG 209 A G 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc103 metalc ? ? TH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 262 "O2'" ? ? Z MG 209 A G 266 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.929 ? metalc104 metalc ? ? WH MG . MG ? ? ? 1_555 E GLU 68 OE2 ? ? Z MG 212 E GLU 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.872 ? metalc105 metalc ? ? WH MG . MG ? ? ? 1_555 E ASP 147 OD1 ? ? Z MG 212 E ASP 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? metalc106 metalc ? ? XH MG . MG ? ? ? 1_555 A U 848 O2 ? ? Z MG 213 A U 870 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? metalc107 metalc ? ? YH MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1304 OP1 ? ? Z MG 214 A C 1322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? metalc108 metalc ? ? YH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1206 "O2'" ? ? Z MG 214 A G 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.369 ? metalc109 metalc ? ? YH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1206 "O3'" ? ? Z MG 214 A G 1224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc110 metalc ? ? ZH MG . MG ? ? ? 1_555 A G 590 O6 ? ? Z MG 215 A G 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? metalc111 metalc ? ? BI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 322 O6 ? ? Z MG 217 A G 326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? metalc112 metalc ? ? BI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 101 OP2 ? ? Z MG 217 A G 107 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.911 ? metalc113 metalc ? ? CI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 500 OP2 ? ? Z MG 218 A U 516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc114 metalc ? ? CI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 501 N7 ? ? Z MG 218 A G 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc115 metalc ? ? DI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 865 O6 ? ? Z MG 219 A G 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc116 metalc ? ? DI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 865 N7 ? ? Z MG 219 A G 887 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc117 metalc ? ? DI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 864 O6 ? ? Z MG 219 A G 886 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.888 ? metalc118 metalc ? ? EI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 115 O2 ? ? Z MG 220 A C 121 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.859 ? metalc119 metalc ? ? EI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 119 O4 ? ? Z MG 220 A U 125 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc120 metalc ? ? EI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 118 O6 ? ? Z MG 220 A G 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc121 metalc ? ? FI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 63 O4 ? ? Z MG 221 A U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc122 metalc ? ? FI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 62 O6 ? ? Z MG 221 A G 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? metalc123 metalc ? ? FI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 63 N3 ? ? Z MG 221 A U 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? metalc124 metalc ? ? FI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 99 O6 ? ? Z MG 221 A G 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc125 metalc ? ? GI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 922 OP1 ? ? Z MG 223 A G 944 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc126 metalc ? ? GI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 921 "O3'" ? ? Z MG 223 A U 943 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.868 ? metalc127 metalc ? ? HI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1066 O4 ? ? Z MG 224 A U 1083 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? metalc128 metalc ? ? HI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1057 O6 ? ? Z MG 224 A G 1074 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc129 metalc ? ? HI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1056 O4 ? ? Z MG 224 A U 1073 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc130 metalc ? ? II MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1286 OP2 ? ? Z MG 225 A G 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.210 ? metalc131 metalc ? ? II MG . MG ? ? ? 1_555 U ASP 5 OD2 ? ? Z MG 225 U ASP 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.080 ? metalc132 metalc ? ? II MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1285 OP1 ? ? Z MG 225 A C 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? metalc133 metalc ? ? JI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 801 "O2'" ? ? Z MG 226 A C 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.840 ? metalc134 metalc ? ? JI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 801 "O3'" ? ? Z MG 226 A C 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.890 ? metalc135 metalc ? ? JI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1506 OP1 ? ? Z MG 226 A U 1528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? metalc136 metalc ? ? KI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1345 O2 ? ? Z MG 227 A C 1363 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.822 ? metalc137 metalc ? ? KI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1345 "O2'" ? ? Z MG 227 A C 1363 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? metalc138 metalc ? ? LI MG . MG ? ? ? 1_555 A A 616 OP2 ? ? Z MG 228 A A 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? metalc139 metalc ? ? LI MG . MG ? ? ? 1_555 A A 616 OP1 ? ? Z MG 228 A A 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? metalc140 metalc ? ? NI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1400 O6 ? ? Z MG 230 A G 1417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.843 ? metalc141 metalc ? ? PI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 541 OP1 ? ? Z MG 232 A G 557 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc142 metalc ? ? QI MG . MG ? ? ? 1_555 A A 311 OP1 ? ? Z MG 233 A A 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.832 ? metalc143 metalc ? ? QI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 310 "O3'" ? ? Z MG 233 A C 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc144 metalc ? ? RI MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1042 N4 ? ? Z MG 234 A C 1059 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.470 ? metalc145 metalc ? ? SI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 320 O6 ? ? Z MG 235 A G 324 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.280 ? metalc146 metalc ? ? UI MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1402 O6 ? ? Z MG 237 A G 1419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? metalc147 metalc ? ? UI MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1459 O4 ? ? Z MG 237 A U 1481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc148 metalc ? ? KK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1369 OP2 ? ? Z MG 280 A G 1386 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc149 metalc ? ? MK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 904 "O4'" ? ? Z MG 282 A G 926 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? metalc150 metalc ? ? OK MG . MG ? ? ? 1_555 A C 287 OP1 ? ? Z MG 284 A C 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.891 ? metalc151 metalc ? ? OK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 301 O6 ? ? Z MG 284 A G 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc152 metalc ? ? PK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 560 OP1 ? ? Z MG 285 A G 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc153 metalc ? ? PK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 559 "O3'" ? ? Z MG 285 A G 575 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc154 metalc ? ? RK MG . MG ? ? ? 1_555 A C 19 OP2 ? ? Z MG 287 A C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? metalc155 metalc ? ? RK MG . MG ? ? ? 1_555 A U 18 "O3'" ? ? Z MG 287 A U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? metalc156 metalc ? ? RK MG . MG ? ? ? 1_555 A U 18 "O5'" ? ? Z MG 287 A U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc157 metalc ? ? RK MG . MG ? ? ? 1_555 A U 18 OP1 ? ? Z MG 287 A U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.849 ? metalc158 metalc ? ? SK MG . MG ? ? ? 1_555 A U 18 OP2 ? ? Z MG 288 A U 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc159 metalc ? ? SK MG . MG ? ? ? 1_555 A U 15 O4 ? ? Z MG 288 A U 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? metalc160 metalc ? ? TK MG . MG ? ? ? 1_555 A C 520 OP2 ? ? Z MG 289 A C 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.876 ? metalc161 metalc ? ? VK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 29 O6 ? ? Z MG 291 A G 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? metalc162 metalc ? ? XK MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1093 OP2 ? ? Z MG 293 A A 1110 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc163 metalc ? ? XK MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1171 O2 ? ? Z MG 293 A C 1189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc164 metalc ? ? YK MG . MG ? ? ? 1_555 A G 228 O6 ? ? Z MG 295 A G 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? metalc165 metalc ? ? YK MG . MG ? ? ? 1_555 A U 123 O4 ? ? Z MG 295 A U 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc166 metalc ? ? ZK MG . MG ? ? ? 1_555 A C 117 OP2 ? ? Z MG 296 A C 123 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.668 ? metalc167 metalc ? ? AL MG . MG ? ? ? 1_555 A U 235 O4 ? ? Z MG 297 A U 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? metalc168 metalc ? ? DL MG . MG ? ? ? 1_555 A C 170 OP2 ? ? Z MG 300 A C 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? metalc169 metalc ? ? DL MG . MG ? ? ? 1_555 A C 169 OP1 ? ? Z MG 300 A C 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? metalc170 metalc ? ? GL MG . MG ? ? ? 1_555 A C 948 OP2 ? ? Z MG 304 A C 970 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc171 metalc ? ? HL MG . MG ? ? ? 1_555 A C 754 OP1 ? ? Z MG 305 A C 770 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.866 ? metalc172 metalc ? ? IL MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1037 O2 ? ? Z MG 306 A C 1054 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? metalc173 metalc ? ? IL MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1036 OP1 ? ? Z MG 306 A G 1053 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? metalc174 metalc ? ? KL MG . MG ? ? ? 1_555 A U 300 OP2 ? ? Z MG 308 A U 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.794 ? metalc175 metalc ? ? KL MG . MG ? ? ? 1_555 A A 299 "O5'" ? ? Z MG 308 A A 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc176 metalc ? ? KL MG . MG ? ? ? 1_555 A A 299 "O3'" ? ? Z MG 308 A A 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc177 metalc ? ? ML MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1393 N7 ? ? Z MG 311 A G 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc178 metalc ? ? UL MG . MG ? ? ? 1_555 A G 343 OP2 ? ? Z MG 319 A G 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc179 metalc ? ? UL MG . MG ? ? ? 1_555 A G 343 "O5'" ? ? Z MG 319 A G 347 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.771 ? metalc180 metalc ? ? TP MG . MG ? ? ? 1_555 A A 878 "O3'" ? ? Z MG 425 A A 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc181 metalc ? ? TP MG . MG ? ? ? 1_555 A A 879 OP1 ? ? Z MG 425 A A 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? metalc182 metalc ? ? JR MG . MG ? ? ? 1_555 V 8AN 76 O2P ? ? Z MG 469 V 8AN 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc183 metalc ? ? JR MG . MG ? ? ? 1_555 V C 75 OP1 ? ? Z MG 469 V C 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc184 metalc ? ? CS MG . MG ? ? ? 1_555 A C 215 "O2'" ? ? Z MG 488 A C 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.280 ? metalc185 metalc ? ? CS MG . MG ? ? ? 1_555 A C 215 "O4'" ? ? Z MG 488 A C 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc186 metalc ? ? DS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 47 O6 ? ? Z MG 489 A G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? metalc187 metalc ? ? FS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 32 O6 ? ? Z MG 491 A G 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? metalc188 metalc ? ? HS MG . MG ? ? ? 1_555 A C 348 O2 ? ? Z MG 493 A C 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? metalc189 metalc ? ? IS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 358 O6 ? ? Z MG 494 A G 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? metalc190 metalc ? ? KS MG . MG ? ? ? 1_555 V A 9 "O2'" ? ? Z MG 496 V A 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc191 metalc ? ? MS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 466 O6 ? ? Z MG 500 A G 481 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.699 ? metalc192 metalc ? ? MS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 445 OP2 ? ? Z MG 500 A G 450 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.882 ? metalc193 metalc ? ? OS MG . MG ? ? ? 1_555 A A 493 OP2 ? ? Z MG 502 A A 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc194 metalc ? ? OS MG . MG ? ? ? 1_555 A A 493 "O3'" ? ? Z MG 502 A A 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? metalc195 metalc ? ? RS MG . MG ? ? ? 1_555 A C 583 OP1 ? ? Z MG 506 A C 599 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc196 metalc ? ? TS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 762 OP1 ? ? Z MG 509 A G 778 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc197 metalc ? ? US MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1504 "O3'" ? ? Z MG 510 A G 1526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc198 metalc ? ? VS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 742 OP1 ? ? Z MG 511 A G 758 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.010 ? metalc199 metalc ? ? VS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 560 O6 ? ? Z MG 511 A G 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc200 metalc ? ? WS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 923 N7 ? ? Z MG 512 A G 945 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc201 metalc ? ? XS MG . MG ? ? ? 1_555 A A 953 OP2 ? ? Z MG 513 A A 975 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? metalc202 metalc ? ? YS MG . MG ? ? ? 1_555 A G 971 OP2 ? ? Z MG 514 A G 993 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc203 metalc ? ? AT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1495 OP1 ? ? Z MG 517 A G 1517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc204 metalc ? ? AT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1494 "O3'" ? ? Z MG 517 A G 1516 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc205 metalc ? ? AT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1495 "O5'" ? ? Z MG 517 A G 1517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc206 metalc ? ? BT MG . MG ? ? ? 1_555 A A 798 "O3'" ? ? Z MG 518 A A 814 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc207 metalc ? ? CT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1464 O6 ? ? Z MG 519 A G 1486 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? metalc208 metalc ? ? CT MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1463 O4 ? ? Z MG 519 A U 1485 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? metalc209 metalc ? ? DT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1348 "O4'" ? ? Z MG 520 A G 1365 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? metalc210 metalc ? ? DT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 949 N3 ? ? Z MG 520 A G 971 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc211 metalc ? ? ET MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1289 O4 ? ? Z MG 521 A U 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc212 metalc ? ? FT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1256 N7 ? ? Z MG 522 A G 1274 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.866 ? metalc213 metalc ? ? GT MG . MG ? ? ? 1_555 A A 961 OP2 ? ? Z MG 527 A A 983 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc214 metalc ? ? GT MG . MG ? ? ? 1_555 A U 960 "O3'" ? ? Z MG 527 A U 982 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.400 ? metalc215 metalc ? ? HT MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1304 N4 ? ? Z MG 528 A C 1322 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc216 metalc ? ? JT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1499 OP1 ? ? Z MG 530 A G 1521 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? metalc217 metalc ? ? JT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1486 OP1 ? ? Z MG 530 A G 1508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.340 ? metalc218 metalc ? ? JT MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1478 OP1 ? ? Z MG 530 A A 1500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc219 metalc ? ? MT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 422 OP2 ? ? Z MG 533 A G 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc220 metalc ? ? NT MG . MG ? ? ? 1_555 A G 412 O6 ? ? Z MG 534 A G 416 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.838 ? metalc221 metalc ? ? HZ MG . MG ? ? ? 1_555 W C 4 OP1 ? ? Z MG 713 W C 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc222 metalc ? ? JZ MG . MG ? ? ? 1_555 W A 9 OP2 ? ? Z MG 716 W A 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? metalc223 metalc ? ? JZ MG . MG ? ? ? 1_555 W C 13 N4 ? ? Z MG 716 W C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc224 metalc ? ? KZ MG . MG ? ? ? 1_555 W C 13 "O5'" ? ? Z MG 717 W C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.908 ? metalc225 metalc ? ? LZ MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1322 OP1 ? ? Z MG 725 A A 1340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc226 metalc ? ? LZ MG . MG ? ? ? 1_555 A A 1322 "O5'" ? ? Z MG 725 A A 1340 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.110 ? metalc227 metalc ? ? MZ MG . MG ? ? ? 1_555 W U 47 "O2'" ? ? Z MG 726 W U 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc228 metalc ? ? MZ MG . MG ? ? ? 1_555 W U 47 "O3'" ? ? Z MG 726 W U 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? metalc229 metalc ? ? NZ MG . MG ? ? ? 1_555 W C 74 N3 ? ? Z MG 730 W C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.410 ? metalc230 metalc ? ? NZ MG . MG ? ? ? 1_555 W C 74 O2 ? ? Z MG 730 W C 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? metalc231 metalc ? ? PZ MG . MG ? ? ? 1_555 W G 46 OP1 ? ? Z MG 733 W G 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc232 metalc ? ? QZ MG . MG ? ? ? 1_555 X C 7 OP2 ? ? Z MG 734 X C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc233 metalc ? ? RZ MG . MG ? ? ? 1_555 X C 7 "O2'" ? ? Z MG 735 X C 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.880 ? metalc234 metalc ? ? RZ MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1384 OP1 ? ? Z MG 735 A G 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc235 metalc ? ? RZ MG . MG ? ? ? 1_555 A C 1383 "O3'" ? ? Z MG 735 A C 1400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc236 metalc ? ? SZ MG . MG ? ? ? 1_555 X U 8 "O5'" ? ? Z MG 736 X U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc237 metalc ? ? SZ MG . MG ? ? ? 1_555 X U 8 N1 ? ? Z MG 736 X U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? metalc238 metalc ? ? TZ MG . MG ? ? ? 1_555 X U 8 OP1 ? ? Z MG 737 X U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? metalc239 metalc ? ? TZ MG . MG ? ? ? 1_555 X U 9 OP2 ? ? Z MG 737 X U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc240 metalc ? ? UZ MG . MG ? ? ? 1_555 A U 1476 O4 ? ? Z MG 739 A U 1498 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc241 metalc ? ? UZ MG . MG ? ? ? 1_555 A G 1475 N7 ? ? Z MG 739 A G 1497 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? metalc242 metalc ? ? VZ MG . MG ? ? ? 1_555 A G 775 O6 ? ? Z MG 741 A G 791 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc243 metalc ? ? VZ MG . MG ? ? ? 1_555 A A 774 N7 ? ? Z MG 741 A A 790 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc244 metalc ? ? VZ MG . MG ? ? ? 1_555 A U 773 "O2'" ? ? Z MG 741 A U 789 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc245 metalc ? ? WZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 D CYS 9 SG ? ? Z ZN 742 D CYS 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? metalc246 metalc ? ? WZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 D CYS 12 SG ? ? Z ZN 742 D CYS 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc247 metalc ? ? WZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 D CYS 26 SG ? ? Z ZN 742 D CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.287 ? metalc248 metalc ? ? XZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 N CYS 27 SG ? ? Z ZN 743 N CYS 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc249 metalc ? ? XZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 N CYS 40 SG ? ? Z ZN 743 N CYS 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.291 ? metalc250 metalc ? ? XZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 N CYS 43 SG ? ? Z ZN 743 N CYS 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc251 metalc ? ? XZ ZN . ZN ? ? ? 1_555 N CYS 24 SG ? ? Z ZN 743 N CYS 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? hydrog1 hydrog ? ? A G 8 N2 ? ? ? 1_555 A U 544 O4 ? ? A G 7 A U 560 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 10 N1 ? ? ? 1_555 A C 26 N3 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 10 N2 ? ? ? 1_555 A C 26 O2 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 10 O6 ? ? ? 1_555 A C 26 N4 ? ? A G 9 A C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A A 11 N1 ? ? ? 1_555 A U 25 N3 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A A 11 N6 ? ? ? 1_555 A U 25 O4 ? ? A A 10 A U 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A G 12 N1 ? ? ? 1_555 A C 24 N3 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A G 12 N2 ? ? ? 1_555 A C 24 O2 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A G 12 O6 ? ? ? 1_555 A C 24 N4 ? ? A G 11 A C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A U 13 N3 ? ? ? 1_555 A G 23 O6 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A U 13 O2 ? ? ? 1_555 A G 23 N1 ? ? A U 12 A G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A U 21 N3 ? ? A U 13 A U 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-U MISPAIR' ? ? hydrog13 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 A A 893 N7 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog14 hydrog ? ? A U 14 O4 ? ? ? 1_555 A A 893 N6 ? ? A U 13 A A 915 1_555 ? ? ? ? ? ? HOOGSTEEN ? ? hydrog15 hydrog ? ? A G 16 N1 ? ? ? 1_555 A U 898 O2 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 16 O6 ? ? ? 1_555 A U 898 N3 ? ? A G 15 A U 920 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog17 hydrog ? ? A A 17 N6 ? ? ? 1_555 A A 897 N1 ? ? A A 16 A A 919 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog18 hydrog ? ? A U 18 N3 ? ? ? 1_555 A A 896 N1 ? ? A U 17 A A 918 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A U 18 O4 ? ? ? 1_555 A A 896 N6 ? ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? hydrog220 hydrog ? ? A A 147 N6 ? ? ? 1_555 A C 164 N3 ? ? A A 152 A C 169 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? hydrog221 hydrog ? ? A A 147 N7 ? ? ? 1_555 A C 164 N4 ? ? A A 152 A C 169 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_25_PAIR ? ? hydrog222 hydrog ? ? A C 148 N3 ? ? ? 1_555 A G 163 N1 ? ? A C 153 A G 168 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog223 hydrog ? ? A C 148 N4 ? ? ? 1_555 A G 163 O6 ? ? A C 153 A G 168 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog224 hydrog ? ? A C 148 O2 ? ? ? 1_555 A G 163 N2 ? ? A C 153 A G 168 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog225 hydrog ? ? A C 148 N3 ? ? ? 1_555 A C 164 N4 ? ? A C 153 A C 169 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-C MISPAIR' ? ? hydrog226 hydrog ? ? A C 149 O2 ? ? ? 1_555 A G 162 N2 ? ? A C 154 A G 167 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? hydrog227 hydrog ? ? A C 149 N3 ? ? ? 1_555 A G 163 N1 ? ? A C 154 A G 168 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog228 hydrog ? ? A C 149 N4 ? ? ? 1_555 A G 163 O6 ? ? A C 154 A G 168 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog229 hydrog ? ? A C 149 O2 ? ? ? 1_555 A G 163 N2 ? ? A C 154 A G 168 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog230 hydrog ? ? A C 150 O2 ? ? ? 1_555 A G 161 N2 ? ? A C 155 A G 166 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-G PAIR' ? ? hydrog231 hydrog ? ? A C 150 N3 ? ? ? 1_555 A G 162 N1 ? ? A C 155 A G 167 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog232 hydrog ? ? A C 150 N4 ? ? ? 1_555 A G 162 O6 ? ? A C 155 A G 167 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog233 hydrog ? ? A C 150 O2 ? ? ? 1_555 A G 162 N2 ? ? A C 155 A G 167 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog234 hydrog ? ? A G 151 N1 ? ? ? 1_555 A C 160 N3 ? ? A G 156 A C 165 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog235 hydrog ? ? A G 151 N2 ? ? ? 1_555 A C 160 O2 ? ? A G 156 A C 165 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog236 hydrog ? ? A G 151 O6 ? ? ? 1_555 A C 160 N4 ? ? A G 156 A C 165 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog237 hydrog ? ? A G 152 N1 ? ? ? 1_555 A U 159 O2 ? ? A G 157 A U 164 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 112 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id M _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 112 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id M _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 113 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 M _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 113 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 M _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 0.24 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details BA ? 2 ? BB ? 5 ? 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FE 25 MG 1 114 114 MG MG Z . GE 25 MG 1 115 115 MG MG Z . HE 25 MG 1 116 116 MG MG Z . IE 25 MG 1 117 117 MG MG Z . JE 25 MG 1 118 118 MG MG Z . KE 25 MG 1 119 119 MG MG Z . LE 25 MG 1 120 120 MG MG Z . ME 25 MG 1 121 121 MG MG Z . NE 25 MG 1 122 122 MG MG Z . OE 25 MG 1 123 123 MG MG Z . PE 25 MG 1 124 124 MG MG Z . QE 25 MG 1 125 125 MG MG Z . RE 25 MG 1 126 126 MG MG Z . SE 25 MG 1 127 127 MG MG Z . TE 25 MG 1 128 128 MG MG Z . UE 25 MG 1 129 129 MG MG Z . VE 25 MG 1 130 130 MG MG Z . WE 25 MG 1 131 131 MG MG Z . XE 25 MG 1 132 132 MG MG Z . YE 25 MG 1 133 133 MG MG Z . ZE 25 MG 1 134 134 MG MG Z . AF 25 MG 1 135 135 MG MG Z . BF 25 MG 1 136 136 MG MG Z . CF 25 MG 1 137 137 MG MG Z . DF 25 MG 1 138 138 MG MG Z . EF 25 MG 1 139 139 MG MG Z . FF 25 MG 1 140 140 MG MG Z . GF 25 MG 1 141 141 MG MG Z . HF 25 MG 1 142 142 MG MG Z . IF 25 MG 1 143 143 MG MG Z . JF 25 MG 1 144 144 MG MG Z . KF 25 MG 1 145 145 MG MG Z . LF 25 MG 1 146 146 MG MG Z . MF 25 MG 1 147 147 MG MG Z . 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VG 25 MG 1 184 184 MG MG Z . WG 25 MG 1 185 185 MG MG Z . XG 25 MG 1 186 186 MG MG Z . YG 25 MG 1 187 187 MG MG Z . ZG 25 MG 1 188 188 MG MG Z . AH 25 MG 1 189 189 MG MG Z . BH 25 MG 1 190 190 MG MG Z . CH 25 MG 1 191 191 MG MG Z . DH 25 MG 1 192 192 MG MG Z . EH 25 MG 1 193 193 MG MG Z . FH 25 MG 1 194 194 MG MG Z . GH 25 MG 1 195 195 MG MG Z . HH 25 MG 1 197 197 MG MG Z . IH 25 MG 1 198 198 MG MG Z . JH 25 MG 1 199 199 MG MG Z . KH 25 MG 1 200 200 MG MG Z . LH 25 MG 1 201 201 MG MG Z . MH 25 MG 1 202 202 MG MG Z . NH 25 MG 1 203 203 MG MG Z . OH 25 MG 1 204 204 MG MG Z . PH 25 MG 1 205 205 MG MG Z . QH 25 MG 1 206 206 MG MG Z . RH 25 MG 1 207 207 MG MG Z . SH 25 MG 1 208 208 MG MG Z . TH 25 MG 1 209 209 MG MG Z . UH 25 MG 1 210 210 MG MG Z . VH 25 MG 1 211 211 MG MG Z . WH 25 MG 1 212 212 MG MG Z . XH 25 MG 1 213 213 MG MG Z . YH 25 MG 1 214 214 MG MG Z . ZH 25 MG 1 215 215 MG MG Z . AI 25 MG 1 216 216 MG MG Z . BI 25 MG 1 217 217 MG MG Z . CI 25 MG 1 218 218 MG MG Z . DI 25 MG 1 219 219 MG MG Z . EI 25 MG 1 220 220 MG MG Z . FI 25 MG 1 221 221 MG MG Z . GI 25 MG 1 223 223 MG MG Z . HI 25 MG 1 224 224 MG MG Z . II 25 MG 1 225 225 MG MG Z . JI 25 MG 1 226 226 MG MG Z . KI 25 MG 1 227 227 MG MG Z . LI 25 MG 1 228 228 MG MG Z . MI 25 MG 1 229 229 MG MG Z . NI 25 MG 1 230 230 MG MG Z . OI 25 MG 1 231 231 MG MG Z . PI 25 MG 1 232 232 MG MG Z . QI 25 MG 1 233 233 MG MG Z . RI 25 MG 1 234 234 MG MG Z . SI 25 MG 1 235 235 MG MG Z . TI 25 MG 1 236 236 MG MG Z . UI 25 MG 1 237 237 MG MG Z . VI 25 MG 1 238 238 MG MG Z . WI 25 MG 1 239 239 MG MG Z . XI 25 MG 1 240 240 MG MG Z . YI 25 MG 1 241 241 MG MG Z . ZI 25 MG 1 242 242 MG MG Z . AJ 25 MG 1 243 243 MG MG Z . BJ 25 MG 1 244 244 MG MG Z . CJ 25 MG 1 245 245 MG MG Z . DJ 25 MG 1 246 246 MG MG Z . EJ 25 MG 1 247 247 MG MG Z . FJ 25 MG 1 248 248 MG MG Z . GJ 25 MG 1 249 249 MG MG Z . HJ 25 MG 1 250 250 MG MG Z . IJ 25 MG 1 251 251 MG MG Z . JJ 25 MG 1 252 252 MG MG Z . KJ 25 MG 1 253 253 MG MG Z . LJ 25 MG 1 254 254 MG MG Z . MJ 25 MG 1 255 255 MG MG Z . NJ 25 MG 1 256 256 MG MG Z . OJ 25 MG 1 257 257 MG MG Z . PJ 25 MG 1 258 258 MG MG Z . QJ 25 MG 1 259 259 MG MG Z . RJ 25 MG 1 260 260 MG MG Z . SJ 25 MG 1 261 261 MG MG Z . TJ 25 MG 1 262 262 MG MG Z . UJ 25 MG 1 263 263 MG MG Z . VJ 25 MG 1 264 264 MG MG Z . WJ 25 MG 1 265 265 MG MG Z . XJ 25 MG 1 266 266 MG MG Z . YJ 25 MG 1 267 267 MG MG Z . ZJ 25 MG 1 268 268 MG MG Z . AK 25 MG 1 269 269 MG MG Z . BK 25 MG 1 270 270 MG MG Z . CK 25 MG 1 271 271 MG MG Z . DK 25 MG 1 272 272 MG MG Z . EK 25 MG 1 274 274 MG MG Z . FK 25 MG 1 275 275 MG MG Z . GK 25 MG 1 276 276 MG MG Z . HK 25 MG 1 277 277 MG MG Z . IK 25 MG 1 278 278 MG MG Z . JK 25 MG 1 279 279 MG MG Z . KK 25 MG 1 280 280 MG MG Z . LK 25 MG 1 281 281 MG MG Z . MK 25 MG 1 282 282 MG MG Z . NK 25 MG 1 283 283 MG MG Z . OK 25 MG 1 284 284 MG MG Z . PK 25 MG 1 285 285 MG MG Z . QK 25 MG 1 286 286 MG MG Z . RK 25 MG 1 287 287 MG MG Z . SK 25 MG 1 288 288 MG MG Z . TK 25 MG 1 289 289 MG MG Z . UK 25 MG 1 290 290 MG MG Z . VK 25 MG 1 291 291 MG MG Z . WK 25 MG 1 292 292 MG MG Z . XK 25 MG 1 293 293 MG MG Z . YK 25 MG 1 295 295 MG MG Z . ZK 25 MG 1 296 296 MG MG Z . AL 25 MG 1 297 297 MG MG Z . BL 25 MG 1 298 298 MG MG Z . CL 25 MG 1 299 299 MG MG Z . DL 25 MG 1 300 300 MG MG Z . EL 25 MG 1 301 301 MG MG Z . FL 25 MG 1 302 302 MG MG Z . GL 25 MG 1 304 304 MG MG Z . HL 25 MG 1 305 305 MG MG Z . IL 25 MG 1 306 306 MG MG Z . JL 25 MG 1 307 307 MG MG Z . KL 25 MG 1 308 308 MG MG Z . LL 25 MG 1 310 310 MG MG Z . ML 25 MG 1 311 311 MG MG Z . NL 25 MG 1 312 312 MG MG Z . OL 25 MG 1 313 313 MG MG Z . PL 25 MG 1 314 314 MG MG Z . QL 25 MG 1 315 315 MG MG Z . RL 25 MG 1 316 316 MG MG Z . SL 25 MG 1 317 317 MG MG Z . TL 25 MG 1 318 318 MG MG Z . UL 25 MG 1 319 319 MG MG Z . VL 25 MG 1 320 320 MG MG Z . WL 25 MG 1 321 321 MG MG Z . XL 25 MG 1 322 322 MG MG Z . YL 25 MG 1 323 323 MG MG Z . ZL 25 MG 1 324 324 MG MG Z . AM 25 MG 1 325 325 MG MG Z . BM 25 MG 1 326 326 MG MG Z . CM 25 MG 1 327 327 MG MG Z . DM 25 MG 1 328 328 MG MG Z . EM 25 MG 1 329 329 MG MG Z . FM 25 MG 1 330 330 MG MG Z . GM 25 MG 1 331 331 MG MG Z . HM 25 MG 1 332 332 MG MG Z . IM 25 MG 1 333 333 MG MG Z . JM 25 MG 1 334 334 MG MG Z . KM 25 MG 1 335 335 MG MG Z . LM 25 MG 1 336 336 MG MG Z . MM 25 MG 1 337 337 MG MG Z . NM 25 MG 1 338 338 MG MG Z . OM 25 MG 1 339 339 MG MG Z . PM 25 MG 1 340 340 MG MG Z . QM 25 MG 1 341 341 MG MG Z . RM 25 MG 1 342 342 MG MG Z . SM 25 MG 1 343 343 MG MG Z . TM 25 MG 1 344 344 MG MG Z . UM 25 MG 1 345 345 MG MG Z . VM 25 MG 1 346 346 MG MG Z . WM 25 MG 1 347 347 MG MG Z . XM 25 MG 1 348 348 MG MG Z . YM 25 MG 1 349 349 MG MG Z . ZM 25 MG 1 350 350 MG MG Z . AN 25 MG 1 351 351 MG MG Z . BN 25 MG 1 352 352 MG MG Z . CN 25 MG 1 353 353 MG MG Z . DN 25 MG 1 354 354 MG MG Z . EN 25 MG 1 355 355 MG MG Z . FN 25 MG 1 356 356 MG MG Z . GN 25 MG 1 357 357 MG MG Z . HN 25 MG 1 358 358 MG MG Z . IN 25 MG 1 359 359 MG MG Z . 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PHE PHENYLALANINAL # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 25-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 25 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 "O2'" ? 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U ASP 5 ? 1_555 106.9 ? 85 OP2 ? A G 1286 ? A G 1304 ? 1_555 MG ? II MG . ? Z MG 225 ? 1_555 OP1 ? A C 1285 ? A C 1303 ? 1_555 76.5 ? 86 OD2 ? U ASP 5 ? U ASP 5 ? 1_555 MG ? II MG . ? Z MG 225 ? 1_555 OP1 ? A C 1285 ? A C 1303 ? 1_555 164.5 ? 87 "O2'" ? A C 801 ? A C 817 ? 1_555 MG ? JI MG . ? Z MG 226 ? 1_555 "O3'" ? A C 801 ? A C 817 ? 1_555 63.7 ? 88 "O2'" ? A C 801 ? A C 817 ? 1_555 MG ? JI MG . ? Z MG 226 ? 1_555 OP1 ? A U 1506 ? A U 1528 ? 1_555 149.2 ? 89 "O3'" ? A C 801 ? A C 817 ? 1_555 MG ? JI MG . ? Z MG 226 ? 1_555 OP1 ? A U 1506 ? A U 1528 ? 1_555 144.2 ? 90 O2 ? A C 1345 ? A C 1363 ? 1_555 MG ? KI MG . ? Z MG 227 ? 1_555 "O2'" ? A C 1345 ? A C 1363 ? 1_555 93.0 ? 91 OP2 ? A A 616 ? A A 632 ? 1_555 MG ? LI MG . ? Z MG 228 ? 1_555 OP1 ? A A 616 ? A A 632 ? 1_555 53.0 ? 92 OP1 ? A A 311 ? A A 315 ? 1_555 MG ? QI MG . ? Z MG 233 ? 1_555 "O3'" ? A C 310 ? A C 314 ? 1_555 51.6 ? 93 O6 ? A G 1402 ? A G 1419 ? 1_555 MG ? UI MG . ? Z MG 237 ? 1_555 O4 ? A U 1459 ? 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V 8AN 76 ? 1_555 MG ? JR MG . ? Z MG 469 ? 1_555 OP1 ? V C 75 ? V C 75 ? 1_555 92.6 ? 113 "O2'" ? A C 215 ? A C 219 ? 1_555 MG ? CS MG . ? Z MG 488 ? 1_555 "O4'" ? A C 215 ? A C 219 ? 1_555 87.9 ? 114 O6 ? A G 466 ? A G 481 ? 1_555 MG ? MS MG . ? Z MG 500 ? 1_555 OP2 ? A G 445 ? A G 450 ? 1_555 92.4 ? 115 OP2 ? A A 493 ? A A 509 ? 1_555 MG ? OS MG . ? Z MG 502 ? 1_555 "O3'" ? A A 493 ? A A 509 ? 1_555 60.8 ? 116 OP1 ? A G 742 ? A G 758 ? 1_555 MG ? VS MG . ? Z MG 511 ? 1_555 O6 ? A G 560 ? A G 576 ? 1_555 124.1 ? 117 OP1 ? A G 1495 ? A G 1517 ? 1_555 MG ? AT MG . ? Z MG 517 ? 1_555 "O3'" ? A G 1494 ? A G 1516 ? 1_555 58.9 ? 118 OP1 ? A G 1495 ? A G 1517 ? 1_555 MG ? AT MG . ? Z MG 517 ? 1_555 "O5'" ? A G 1495 ? A G 1517 ? 1_555 68.8 ? 119 "O3'" ? A G 1494 ? A G 1516 ? 1_555 MG ? AT MG . ? Z MG 517 ? 1_555 "O5'" ? A G 1495 ? A G 1517 ? 1_555 60.3 ? 120 O6 ? A G 1464 ? A G 1486 ? 1_555 MG ? CT MG . ? Z MG 519 ? 1_555 O4 ? A U 1463 ? A U 1485 ? 1_555 94.8 ? 121 "O4'" ? A G 1348 ? 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D CYS 12 ? D CYS 12 ? 1_555 85.8 ? 140 SG ? D CYS 9 ? D CYS 9 ? 1_555 ZN ? WZ ZN . ? Z ZN 742 ? 1_555 SG ? D CYS 26 ? D CYS 26 ? 1_555 154.3 ? 141 SG ? D CYS 12 ? D CYS 12 ? 1_555 ZN ? WZ ZN . ? Z ZN 742 ? 1_555 SG ? D CYS 26 ? D CYS 26 ? 1_555 74.3 ? 142 SG ? N CYS 27 ? N CYS 27 ? 1_555 ZN ? XZ ZN . ? Z ZN 743 ? 1_555 SG ? N CYS 40 ? N CYS 40 ? 1_555 113.6 ? 143 SG ? N CYS 27 ? N CYS 27 ? 1_555 ZN ? XZ ZN . ? Z ZN 743 ? 1_555 SG ? N CYS 43 ? N CYS 43 ? 1_555 83.4 ? 144 SG ? N CYS 40 ? N CYS 40 ? 1_555 ZN ? XZ ZN . ? Z ZN 743 ? 1_555 SG ? N CYS 43 ? N CYS 43 ? 1_555 115.5 ? 145 SG ? N CYS 27 ? N CYS 27 ? 1_555 ZN ? XZ ZN . ? Z ZN 743 ? 1_555 SG ? N CYS 24 ? N CYS 24 ? 1_555 86.1 ? 146 SG ? N CYS 40 ? N CYS 40 ? 1_555 ZN ? XZ ZN . ? Z ZN 743 ? 1_555 SG ? N CYS 24 ? N CYS 24 ? 1_555 127.0 ? 147 SG ? N CYS 43 ? N CYS 43 ? 1_555 ZN ? XZ ZN . ? Z ZN 743 ? 1_555 SG ? N CYS 24 ? N CYS 24 ? 1_555 115.3 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2009-04-14 2 'Structure model' 1 1 2014-12-10 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 2 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal CNS refinement 1.2 ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 XDS 'data scaling' . ? 3 CNS phasing . ? 4 # _pdbx_database_remark.id 700 _pdbx_database_remark.text ; SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "QA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 5-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 6-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED. ; # _pdbx_entry_details.entry_id 2WDM _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ;PAROMOMYCIN (PAR): THIS IS AN ANTIBIOTIC WHICH HAS BEEN USED IN PREVIOUS STRUCTURES FROM OUR LAB I.E. 2J00. MAGNESIUM (MG): THESE ARE MAGNESIUM ATOMS PHENYLALANINE REVERSE (PHA): THIS IS A STANDARD PHENYLALANINE RESIDUE THAT HAS BEEN LINKED VIA AN AMIDE LINKAGE TO RESIDUE Y 76 OF THE A-SITE TRNA. 3'-AMINO-3-DEOXY ADENOSINE (8AN): THIS IS A STANDARD ADENOSINE RESIDUE IN WHICH THE 3'O HAS BEEN REPLACED BY A 3'N AND LINKED VIA AN AMIDE LINKAGE TO A PHENYLALANINE RESIDUE Y 77. ZINC (ZN): THESE ARE ZINC IONS ; _pdbx_entry_details.sequence_details ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "C2'" A G 115 ? ? 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U LYS 27 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 2WDM 'double helix' 2WDM 'a-form double helix' 2WDM 'parallel strands' 2WDM 'hairpin loop' 2WDM tetraloop 2WDM 'bulge loop' 2WDM 'mismatched base pair' 2WDM 'internal loop' 2WDM 'triple helix' 2WDM 'quadruple helix' 2WDM 'three-way junction' 2WDM 'four-way junction' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 8 1_555 A U 544 1_555 4.399 2.493 0.814 18.042 0.000 -76.629 1 A_G7:U560_A A 7 ? 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