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'X-RAY DIFFRACTION' ? t_ideal_dist_contact ? ? 4.00 9962 'X-RAY DIFFRACTION' SEMIHARMONIC # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.d_res_high 2.64 _refine_ls_shell.d_res_low 2.71 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 3146 _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.2162 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.2774 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free 4.55 _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 150 _refine_ls_shell.number_reflns_all 3296 _refine_ls_shell.R_factor_all 0.2190 # _struct_ncs_oper.id 1 _struct_ncs_oper.code given _struct_ncs_oper.details ? _struct_ncs_oper.matrix[1][1] -0.991000 _struct_ncs_oper.matrix[1][2] 0.132200 _struct_ncs_oper.matrix[1][3] 0.021700 _struct_ncs_oper.matrix[2][1] 0.130600 _struct_ncs_oper.matrix[2][2] 0.989500 _struct_ncs_oper.matrix[2][3] -0.062200 _struct_ncs_oper.matrix[3][1] -0.029700 _struct_ncs_oper.matrix[3][2] -0.058800 _struct_ncs_oper.matrix[3][3] -0.997800 _struct_ncs_oper.vector[1] 63.85240 _struct_ncs_oper.vector[2] 0.72900 _struct_ncs_oper.vector[3] 183.96240 # _database_PDB_matrix.entry_id 2WWW _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 2WWW _struct.title 'Crystal Structure of Methylmalonic Acidemia Type A Protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2WWW _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSPORT PROTEIN' _struct_keywords.text 'TRANSPORT PROTEIN, NUCLEOTIDE-BINDING' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 3 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 4 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 PDB 2WWW 1 ? ? 2WWW ? 2 UNP MMAA_HUMAN 1 ? ? Q8IVH4 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2WWW A 1 ? 2 ? 2WWW 70 ? 71 ? 70 71 2 2 2WWW A 3 ? 349 ? Q8IVH4 72 ? 418 ? 72 418 3 1 2WWW B 1 ? 2 ? 2WWW 70 ? 71 ? 70 71 4 2 2WWW B 3 ? 349 ? Q8IVH4 72 ? 418 ? 72 418 5 1 2WWW C 1 ? 2 ? 2WWW 70 ? 71 ? 70 71 6 2 2WWW C 3 ? 349 ? Q8IVH4 72 ? 418 ? 72 418 7 1 2WWW D 1 ? 2 ? 2WWW 70 ? 71 ? 70 71 8 2 2WWW D 3 ? 349 ? Q8IVH4 72 ? 418 ? 72 418 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 5760 ? 1 MORE -46.6 ? 1 'SSA (A^2)' 28430 ? 2 'ABSA (A^2)' 5580 ? 2 MORE -46.6 ? 2 'SSA (A^2)' 28200 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 C,D,H,I,J,K,N,O 2 1 A,B,E,F,G,L,M # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 SER A 10 ? GLN A 26 ? SER A 79 GLN A 95 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 2 GLN A 28 ? SER A 41 ? GLN A 97 SER A 110 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 3 HIS A 43 ? SER A 67 ? HIS A 112 SER A 136 1 ? 25 HELX_P HELX_P4 4 GLY A 86 ? ARG A 101 ? GLY A 155 ARG A 170 1 ? 16 HELX_P HELX_P5 5 THR A 154 ? ALA A 165 ? THR A 223 ALA A 234 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 6 SER A 180 ? ASP A 186 ? SER A 249 ASP A 255 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 7 ASP A 223 ? ASP A 225 ? ASP A 292 ASP A 294 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 8 LEU A 226 ? LYS A 242 ? LEU A 295 LYS A 311 1 ? 17 HELX_P HELX_P9 9 GLY A 265 ? GLY A 284 ? GLY A 334 GLY A 353 1 ? 20 HELX_P HELX_P10 10 GLY A 284 ? HIS A 313 ? GLY A 353 HIS A 382 1 ? 30 HELX_P HELX_P11 11 HIS A 313 ? ILE A 329 ? HIS A 382 ILE A 398 1 ? 17 HELX_P HELX_P12 12 SER A 333 ? SER A 347 ? SER A 402 SER A 416 1 ? 15 HELX_P HELX_P13 13 SER B 10 ? GLN B 26 ? SER B 79 GLN B 95 1 ? 17 HELX_P HELX_P14 14 GLN B 28 ? SER B 41 ? GLN B 97 SER B 110 1 ? 14 HELX_P HELX_P15 15 HIS B 43 ? SER B 67 ? HIS B 112 SER B 136 1 ? 25 HELX_P HELX_P16 16 GLY B 86 ? ARG B 101 ? GLY B 155 ARG B 170 1 ? 16 HELX_P HELX_P17 17 THR B 154 ? ALA B 165 ? THR B 223 ALA B 234 1 ? 12 HELX_P HELX_P18 18 GLN B 179 ? ASP B 186 ? GLN B 248 ASP B 255 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 19 ILE B 227 ? LYS B 242 ? ILE B 296 LYS B 311 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 20 GLY B 265 ? GLY B 284 ? GLY B 334 GLY B 353 1 ? 20 HELX_P HELX_P21 21 GLY B 284 ? HIS B 313 ? GLY B 353 HIS B 382 1 ? 30 HELX_P HELX_P22 22 HIS B 313 ? ILE B 329 ? HIS B 382 ILE B 398 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 23 SER B 333 ? SER B 347 ? SER B 402 SER B 416 1 ? 15 HELX_P HELX_P24 24 ARG C 15 ? GLN C 26 ? ARG C 84 GLN C 95 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 25 GLN C 28 ? SER C 41 ? GLN C 97 SER C 110 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 26 HIS C 43 ? SER C 67 ? HIS C 112 SER C 136 1 ? 25 HELX_P HELX_P27 27 GLY C 86 ? ARG C 101 ? GLY C 155 ARG C 170 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 28 VAL C 151 ? ARG C 153 ? VAL C 220 ARG C 222 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 29 THR C 154 ? GLY C 166 ? 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GLY D 278 MET D 282 5 ? 5 HELX_P HELX_P44 44 ASP D 223 ? ASP D 225 ? ASP D 292 ASP D 294 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 45 LEU D 226 ? LYS D 242 ? LEU D 295 LYS D 311 1 ? 17 HELX_P HELX_P46 46 GLY D 265 ? SER D 283 ? GLY D 334 SER D 352 1 ? 19 HELX_P HELX_P47 47 GLY D 284 ? HIS D 313 ? GLY D 353 HIS D 382 1 ? 30 HELX_P HELX_P48 48 HIS D 313 ? ILE D 329 ? HIS D 382 ILE D 398 1 ? 17 HELX_P HELX_P49 49 SER D 333 ? SER D 347 ? SER D 402 SER D 416 1 ? 15 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 HIS 5 D . ? HIS 74 D THR 6 D ? THR 75 D 1 8.82 2 ARG 208 D . ? ARG 277 D GLY 209 D ? GLY 278 D 1 11.38 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 7 ? BA ? 7 ? CA ? 7 ? 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ARG A 140 ? ALA A 206 ARG A 209 AA 2 LEU A 105 ? ALA A 109 ? LEU A 174 ALA A 178 AA 3 ILE A 169 ? GLU A 173 ? ILE A 238 GLU A 242 AA 4 PHE A 75 ? SER A 80 ? PHE A 144 SER A 149 AA 5 MET A 190 ? LEU A 195 ? MET A 259 LEU A 264 AA 6 LEU A 216 ? VAL A 219 ? LEU A 285 VAL A 288 AA 7 LYS A 254 ? ARG A 257 ? LYS A 323 ARG A 326 BA 1 ALA B 137 ? ARG B 140 ? ALA B 206 ARG B 209 BA 2 LEU B 105 ? ALA B 109 ? LEU B 174 ALA B 178 BA 3 ILE B 169 ? GLU B 173 ? ILE B 238 GLU B 242 BA 4 PHE B 75 ? SER B 80 ? PHE B 144 SER B 149 BA 5 MET B 190 ? LEU B 195 ? MET B 259 LEU B 264 BA 6 LEU B 216 ? VAL B 219 ? LEU B 285 VAL B 288 BA 7 LYS B 254 ? ARG B 257 ? LYS B 323 ARG B 326 CA 1 ALA C 137 ? ARG C 140 ? ALA C 206 ARG C 209 CA 2 LEU C 105 ? ALA C 109 ? LEU C 174 ALA C 178 CA 3 ILE C 169 ? GLU C 173 ? ILE C 238 GLU C 242 CA 4 PHE C 75 ? SER C 80 ? PHE C 144 SER C 149 CA 5 MET C 190 ? LEU C 195 ? MET C 259 LEU C 264 CA 6 LEU C 216 ? VAL C 219 ? LEU C 285 VAL C 288 CA 7 LYS C 254 ? ARG C 257 ? 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