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P PEU 1 ODE # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal PHENIX refinement '(PHENIX.REFINE)' ? 1 XDS 'data reduction' . ? 2 XSCALE 'data scaling' . ? 3 PHASER phasing . ? 4 # _cell.entry_id 2WY3 _cell.length_a 58.120 _cell.length_b 104.170 _cell.length_c 146.800 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 2WY3 _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 # _exptl.entry_id 2WY3 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.5 _exptl_crystal.density_percent_sol 50.84 _exptl_crystal.description NONE # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details '0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5, 25 % PEG 8000' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector PIXEL _diffrn_detector.type 'DECTRIS PILATUS 6M' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2008-08-30 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator DCCM _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.0013 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SLS BEAMLINE X06SA' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X06SA _diffrn_source.pdbx_wavelength 1.0013 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 2WY3 _reflns.observed_criterion_sigma_I 3.44 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 50.00 _reflns.d_resolution_high 1.80 _reflns.number_obs 82272 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 98.7 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.07 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 16.90 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 24.06 _reflns.pdbx_redundancy 8.9 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 1.80 _reflns_shell.d_res_low 1.85 _reflns_shell.percent_possible_all 97.5 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.49 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 3.44 _reflns_shell.pdbx_redundancy 6.9 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 2WY3 _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 82271 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.99 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 49.087 _refine.ls_d_res_high 1.800 _refine.ls_percent_reflns_obs 98.68 _refine.ls_R_factor_obs 0.1788 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.1770 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2133 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0 _refine.ls_number_reflns_R_free 4114 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean 33.92 _refine.aniso_B[1][1] 4.6447 _refine.aniso_B[2][2] -0.5617 _refine.aniso_B[3][3] -4.0830 _refine.aniso_B[1][2] -0.0000 _refine.aniso_B[1][3] -0.0000 _refine.aniso_B[2][3] 0.0000 _refine.solvent_model_details 'FLAT BULK SOLVENT MODEL' _refine.solvent_model_param_ksol 0.375 _refine.solvent_model_param_bsol 56.518 _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.11 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.90 _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ;CHAIN A RESIDUES 149-151 AND 176- -181 ARE DISORDERED. CHAIN B 164-184 ARE DISORDERED. CHAIN C RESIDUES 148-149 AND 176-181 ARE DISORDERED. CHAIN D RESIDUES 160-184 ARE DISORDERED. MET0 IN CHAIN A IS NOT PART OF THE MATURE EUCARYOTIC MICB SEQUENCE BUT AN E.COLI ARTEFACT. MET140 IN CHAIN A AND CHAIN C WAS MODELLED AS AN ALANINE IN BOTH CASES ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRY 1JE6' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ML _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML 0.24 _refine.pdbx_overall_phase_error 19.02 _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 4914 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 229 _refine_hist.number_atoms_solvent 639 _refine_hist.number_atoms_total 5782 _refine_hist.d_res_high 1.800 _refine_hist.d_res_low 49.087 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function f_bond_d 0.006 ? ? 5481 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_angle_d 1.057 ? ? 7451 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_dihedral_angle_d 14.769 ? ? 2086 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_chiral_restr 0.077 ? ? 846 'X-RAY DIFFRACTION' ? f_plane_restr 0.004 ? ? 942 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _refine_ls_shell.pdbx_refine_id _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used _refine_ls_shell.d_res_high _refine_ls_shell.d_res_low _refine_ls_shell.number_reflns_R_work _refine_ls_shell.R_factor_R_work _refine_ls_shell.percent_reflns_obs _refine_ls_shell.R_factor_R_free _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_R_free _refine_ls_shell.number_reflns_all _refine_ls_shell.R_factor_all 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.8000 1.8212 2625 0.2116 98.00 0.2195 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.8212 1.8434 2613 0.1983 97.00 0.2357 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.8434 1.8667 2657 0.1948 98.00 0.2260 . . 139 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.8667 1.8913 2615 0.1961 97.00 0.2275 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.8913 1.9172 2610 0.1844 98.00 0.2307 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.9172 1.9446 2681 0.1843 98.00 0.2592 . . 141 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.9446 1.9736 2628 0.1788 98.00 0.2068 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 1.9736 2.0045 2658 0.1727 98.00 0.2516 . . 140 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.0045 2.0373 2635 0.1673 99.00 0.1906 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.0373 2.0724 2684 0.1599 99.00 0.2124 . . 142 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.0724 2.1101 2630 0.1659 98.00 0.2082 . . 138 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1101 2.1507 2690 0.1597 99.00 0.1805 . . 142 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1507 2.1946 2673 0.1538 99.00 0.2003 . . 140 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.1946 2.2423 2664 0.1616 99.00 0.1731 . . 141 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.2423 2.2945 2687 0.1601 99.00 0.2209 . . 141 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.2945 2.3519 2690 0.1682 99.00 0.2216 . . 142 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.3519 2.4155 2702 0.1695 99.00 0.2313 . . 142 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4155 2.4865 2679 0.1692 99.00 0.2266 . . 141 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.4865 2.5668 2693 0.1665 99.00 0.1864 . . 142 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.5668 2.6585 2715 0.1766 99.00 0.2182 . . 142 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.6585 2.7650 2715 0.1745 99.00 0.2021 . . 143 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.7650 2.8908 2718 0.1732 99.00 0.2300 . . 143 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 2.8908 3.0432 2732 0.1807 100.00 0.2421 . . 144 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.0432 3.2338 2738 0.1700 99.00 0.1920 . . 144 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.2338 3.4834 2733 0.1554 99.00 0.1996 . . 144 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.4834 3.8339 2759 0.1451 99.00 0.1821 . . 145 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 3.8339 4.3883 2776 0.1449 100.00 0.1644 . . 147 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 4.3883 5.5276 2799 0.1522 100.00 0.2027 . . 147 . . 'X-RAY DIFFRACTION' . 5.5276 49.1051 2958 0.2309 99.00 0.2350 . . 156 . . # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? -0.507600 -0.028430 0.861100 0.028940 -0.999500 -0.015930 0.861100 0.016840 0.508200 -50.64000 75.60000 28.66000 2 given ? -0.507200 -0.030880 0.861200 0.024850 -0.999500 -0.021200 0.861400 0.010650 0.507700 -50.73000 76.22000 28.81000 # _database_PDB_matrix.entry_id 2WY3 _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 2WY3 _struct.title 'Structure of the HCMV UL16-MICB complex elucidates select binding of a viral immunoevasin to diverse NKG2D ligands' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2WY3 _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM/VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.text ;IMMUNE SYSTEM-VIRAL PROTEIN COMPLEX, IMMUNE RESPONSE, INNATE IMMUNITY, STRUCTURAL MIMICRY, IMMUNOGLOBULIN DOMAIN, MEMBRANE, CYTOLYSIS, ULBP, NKG2D, NK CELL, CELL MEMBRANE, TRANSMEMBRANE, VIRAL IMMUNE EVASION, NATURAL KILLER CELL, CONVERGENT EVOLUTION ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 5 ? J N N 5 ? K N N 5 ? L N N 5 ? M N N 5 ? N N N 3 ? O N N 4 ? P N N 3 ? Q N N 5 ? R N N 5 ? S N N 5 ? T N N 5 ? U N N 5 ? V N N 5 ? W N N 6 ? X N N 6 ? Y N N 6 ? Z N N 6 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 PDB 2WY3 1 ? ? 2WY3 ? 2 UNP MICB_HUMAN 1 ? ? Q29980 ? 3 UNP UL16P_HCMVA 2 ? ? P16757 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2WY3 A 1 ? 1 ? 2WY3 0 ? 0 ? 0 0 2 2 2WY3 A 2 ? 319 ? Q29980 24 ? 341 ? 1 318 3 3 2WY3 B 1 ? 158 ? P16757 27 ? 184 ? 27 184 4 1 2WY3 C 1 ? 1 ? 2WY3 0 ? 0 ? 0 0 5 2 2WY3 C 2 ? 319 ? Q29980 24 ? 341 ? 1 318 6 3 2WY3 D 1 ? 158 ? P16757 27 ? 184 ? 27 184 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 2WY3 GLU A 58 ? UNP Q29980 LYS 80 conflict 57 1 1 2WY3 ASN A 114 ? UNP Q29980 ASP 136 conflict 113 2 4 2WY3 GLU C 58 ? UNP Q29980 LYS 80 conflict 57 3 4 2WY3 ASN C 114 ? UNP Q29980 ASP 136 conflict 113 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 4070 ? 1 MORE 1.7 ? 1 'SSA (A^2)' 16660 ? 2 'ABSA (A^2)' 4080 ? 2 MORE 5.4 ? 2 'SSA (A^2)' 16360 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,W,X 2 1 C,D,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,Y,Z # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 48 ? VAL A 54 ? GLY A 47 VAL A 53 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 2 ALA A 57 ? HIS A 80 ? ALA A 56 HIS A 79 1 ? 24 HELX_P HELX_P3 3 SER A 133 ? GLU A 149 ? SER A 132 GLU A 148 1 ? 17 HELX_P HELX_P4 4 LYS A 153 ? GLY A 176 ? LYS A 152 GLY A 175 1 ? 24 HELX_P HELX_P5 5 ASN B 15 ? ILE B 22 ? ASN B 41 ILE B 48 5 ? 8 HELX_P HELX_P6 6 GLY C 48 ? VAL C 54 ? GLY C 47 VAL C 53 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 7 ALA C 57 ? HIS C 80 ? ALA C 56 HIS C 79 1 ? 24 HELX_P HELX_P8 8 SER C 133 ? TRP C 147 ? SER C 132 TRP C 146 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 9 LYS C 153 ? GLY C 176 ? LYS C 152 GLY C 175 1 ? 24 HELX_P HELX_P10 10 ASN D 15 ? ILE D 22 ? ASN D 41 ILE D 48 5 ? 8 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 97 SG ? ? ? 1_555 A CYS 165 SG ? ? A CYS 96 A CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 12 SG A ? ? 1_555 B CYS 117 SG A ? B CYS 38 B CYS 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 12 SG B ? ? 1_555 B CYS 117 SG B ? B CYS 38 B CYS 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 38 SG A ? ? 1_555 B CYS 114 SG ? ? B CYS 64 B CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 38 SG B ? ? 1_555 B CYS 114 SG ? ? B CYS 64 B CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf6 disulf ? ? C CYS 97 SG ? ? ? 1_555 C CYS 165 SG ? ? C CYS 96 C CYS 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 12 SG A ? ? 1_555 D CYS 117 SG A ? D CYS 38 D CYS 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf8 disulf ? ? D CYS 12 SG B ? ? 1_555 D CYS 117 SG B ? D CYS 38 D CYS 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf9 disulf ? ? D CYS 38 SG A ? ? 1_555 D CYS 114 SG A ? D CYS 64 D CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? ? disulf10 disulf ? ? D CYS 38 SG B ? ? 1_555 D CYS 114 SG B ? D CYS 64 D CYS 140 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? covale1 covale one ? B ASN 15 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 41 B NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 42 ND2 A ? ? 1_555 I NAG . C1 A ? B ASN 68 B NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 42 ND2 B ? ? 1_555 I NAG . C1 B ? B ASN 68 B NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 84 B NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? B ASN 69 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? B ASN 95 B NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 75 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? B ASN 101 B NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 106 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 132 B NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? D ASN 15 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? D ASN 41 D NAG 1201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? D ASN 42 ND2 B ? ? 1_555 R NAG . C1 B ? D ASN 68 D NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? D ASN 42 ND2 A ? ? 1_555 R NAG . C1 A ? D ASN 68 D NAG 1202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? D ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? D ASN 84 D NAG 1203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? D ASN 69 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? D ASN 95 D NAG 1204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? D ASN 75 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? D ASN 101 D NAG 1205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? D ASN 106 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? D ASN 132 D NAG 1206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG H . ? ASN B 15 ? NAG B 1201 ? 1_555 ASN B 41 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG I . A ASN B 42 A NAG B 1202 ? 1_555 ASN B 68 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 NAG I . B ASN B 42 B NAG B 1202 ? 1_555 ASN B 68 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 4 NAG J . ? ASN B 58 ? NAG B 1203 ? 1_555 ASN B 84 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 5 NAG K . ? ASN B 69 ? NAG B 1204 ? 1_555 ASN B 95 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 6 NAG L . ? ASN B 75 ? NAG B 1205 ? 1_555 ASN B 101 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 7 NAG M . ? ASN B 106 ? NAG B 1206 ? 1_555 ASN B 132 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 8 NAG Q . ? ASN D 15 ? NAG D 1201 ? 1_555 ASN D 41 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 9 NAG R . A ASN D 42 A NAG D 1202 ? 1_555 ASN D 68 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 10 NAG R . B ASN D 42 B NAG D 1202 ? 1_555 ASN D 68 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 11 NAG S . ? ASN D 58 ? NAG D 1203 ? 1_555 ASN D 84 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 12 NAG T . ? ASN D 69 ? NAG D 1204 ? 1_555 ASN D 95 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 13 NAG U . ? ASN D 75 ? NAG D 1205 ? 1_555 ASN D 101 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 14 NAG V . ? ASN D 106 ? NAG D 1206 ? 1_555 ASN D 132 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 15 CYS A 97 ? CYS A 165 ? CYS A 96 ? 1_555 CYS A 164 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS B 12 A CYS B 117 A CYS B 38 ? 1_555 CYS B 143 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS B 12 B CYS B 117 B CYS B 38 ? 1_555 CYS B 143 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS B 38 A CYS B 114 ? CYS B 64 ? 1_555 CYS B 140 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 19 CYS B 38 B CYS B 114 ? CYS B 64 ? 1_555 CYS B 140 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 20 CYS C 97 ? CYS C 165 ? CYS C 96 ? 1_555 CYS C 164 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 21 CYS D 12 A CYS D 117 A CYS D 38 ? 1_555 CYS D 143 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 22 CYS D 12 B CYS D 117 B CYS D 38 ? 1_555 CYS D 143 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 23 CYS D 38 A CYS D 114 A CYS D 64 ? 1_555 CYS D 140 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 24 CYS D 38 B CYS D 114 B CYS D 64 ? 1_555 CYS D 140 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA ? 2 ? AB ? 5 ? AC ? 8 ? BA ? 2 ? BB ? 6 ? BC ? 3 ? CA ? 2 ? CB ? 5 ? CC ? 8 ? DA ? 2 ? DB ? 6 ? DC ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA 1 2 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AB 2 3 ? anti-parallel AB 3 4 ? anti-parallel AB 4 5 ? anti-parallel AC 1 2 ? anti-parallel AC 2 3 ? anti-parallel AC 3 4 ? anti-parallel AC 4 5 ? anti-parallel AC 5 6 ? anti-parallel AC 6 7 ? anti-parallel AC 7 8 ? anti-parallel BA 1 2 ? anti-parallel BB 1 2 ? parallel BB 2 3 ? anti-parallel BB 3 4 ? anti-parallel BB 4 5 ? anti-parallel BB 5 6 ? anti-parallel BC 1 2 ? anti-parallel BC 2 3 ? anti-parallel CA 1 2 ? anti-parallel CB 1 2 ? anti-parallel CB 2 3 ? anti-parallel CB 3 4 ? anti-parallel CB 4 5 ? anti-parallel CC 1 2 ? anti-parallel CC 2 3 ? anti-parallel CC 3 4 ? anti-parallel CC 4 5 ? anti-parallel CC 5 6 ? anti-parallel CC 6 7 ? anti-parallel CC 7 8 ? anti-parallel DA 1 2 ? anti-parallel DB 1 2 ? parallel DB 2 3 ? anti-parallel DB 3 4 ? anti-parallel DB 4 5 ? anti-parallel DB 5 6 ? anti-parallel DC 1 2 ? anti-parallel DC 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA 1 SER A 18 ? VAL A 19 ? SER A 17 VAL A 18 AA 2 HIS A 4 ? GLN A 15 ? HIS A 3 GLN A 14 AB 1 ARG A 43 ? PRO A 46 ? ARG A 42 PRO A 45 AB 2 GLN A 32 ? ASP A 38 ? GLN A 31 ASP A 37 AB 3 LEU A 24 ? LEU A 29 ? LEU A 23 LEU A 28 AB 4 HIS A 4 ? GLN A 15 ? HIS A 3 GLN A 14 AB 5 SER A 18 ? VAL A 19 ? SER A 17 VAL A 18 AC 1 ARG A 43 ? PRO A 46 ? ARG A 42 PRO A 45 AC 2 GLN A 32 ? ASP A 38 ? GLN A 31 ASP A 37 AC 3 LEU A 24 ? LEU A 29 ? LEU A 23 LEU A 28 AC 4 HIS A 4 ? GLN A 15 ? HIS A 3 GLN A 14 AC 5 LEU A 88 ? ILE A 99 ? LEU A 87 ILE A 98 AC 6 THR A 105 ? TYR A 113 ? THR A 104 TYR A 112 AC 7 GLU A 116 ? ASN A 122 ? GLU A 115 ASN A 121 AC 8 SER A 128 ? THR A 129 ? SER A 127 THR A 128 BA 1 ASP B 2 ? SER B 5 ? ASP B 28 SER B 31 BA 2 SER B 10 ? ARG B 13 ? SER B 36 ARG B 39 BB 1 THR B 27 ? HIS B 31 ? THR B 53 HIS B 57 BB 2 THR B 121 ? ARG B 131 ? THR B 147 ARG B 157 BB 3 GLY B 110 ? GLU B 118 ? GLY B 136 GLU B 144 BB 4 ILE B 49 ? TRP B 55 ? ILE B 75 TRP B 81 BB 5 VAL B 62 ? GLN B 68 ? VAL B 88 GLN B 94 BB 6 THR B 71 ? ARG B 74 ? THR B 97 ARG B 100 BC 1 CYS B 34 ? GLU B 41 ? CYS B 60 GLU B 67 BC 2 VAL B 95 ? ARG B 102 ? VAL B 121 ARG B 128 BC 3 ASN B 82 ? LYS B 89 ? ASN B 108 LYS B 115 CA 1 SER C 18 ? VAL C 19 ? SER C 17 VAL C 18 CA 2 HIS C 4 ? GLN C 15 ? HIS C 3 GLN C 14 CB 1 ARG C 43 ? PRO C 46 ? ARG C 42 PRO C 45 CB 2 GLN C 32 ? ASP C 38 ? GLN C 31 ASP C 37 CB 3 LEU C 24 ? LEU C 29 ? LEU C 23 LEU C 28 CB 4 HIS C 4 ? GLN C 15 ? HIS C 3 GLN C 14 CB 5 SER C 18 ? VAL C 19 ? SER C 17 VAL C 18 CC 1 ARG C 43 ? PRO C 46 ? ARG C 42 PRO C 45 CC 2 GLN C 32 ? ASP C 38 ? GLN C 31 ASP C 37 CC 3 LEU C 24 ? LEU C 29 ? LEU C 23 LEU C 28 CC 4 HIS C 4 ? GLN C 15 ? HIS C 3 GLN C 14 CC 5 HIS C 89 ? ILE C 99 ? HIS C 88 ILE C 98 CC 6 THR C 105 ? TYR C 113 ? THR C 104 TYR C 112 CC 7 GLU C 116 ? ASN C 122 ? GLU C 115 ASN C 121 CC 8 SER C 128 ? THR C 129 ? SER C 127 THR C 128 DA 1 ASP D 2 ? SER D 5 ? ASP D 28 SER D 31 DA 2 SER D 10 ? ARG D 13 ? SER D 36 ARG D 39 DB 1 THR D 27 ? HIS D 31 ? THR D 53 HIS D 57 DB 2 THR D 121 ? ARG D 131 ? THR D 147 ARG D 157 DB 3 GLY D 110 ? GLU D 118 ? GLY D 136 GLU D 144 DB 4 ILE D 49 ? TRP D 55 ? ILE D 75 TRP D 81 DB 5 VAL D 62 ? GLN D 68 ? VAL D 88 GLN D 94 DB 6 THR D 71 ? ARG D 74 ? THR D 97 ARG D 100 DC 1 ILE D 35 ? GLU D 41 ? ILE D 61 GLU D 67 DC 2 VAL D 95 ? ARG D 102 ? VAL D 121 ARG D 128 DC 3 ASN D 82 ? LYS D 89 ? ASN D 108 LYS D 115 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA 1 2 N SER A 18 ? N SER A 17 O GLN A 15 ? O GLN A 14 AB 1 2 N LYS A 45 ? N LYS A 44 O ARG A 36 ? O ARG A 35 AB 2 3 N TYR A 37 ? N TYR A 36 O ALA A 25 ? O ALA A 24 AB 3 4 N HIS A 28 ? N HIS A 27 O ARG A 7 ? O ARG A 6 AB 4 5 N GLN A 15 ? N GLN A 14 O SER A 18 ? O SER A 17 AC 1 2 N LYS A 45 ? N LYS A 44 O ARG A 36 ? O ARG A 35 AC 2 3 N TYR A 37 ? N TYR A 36 O ALA A 25 ? O ALA A 24 AC 3 4 N HIS A 28 ? N HIS A 27 O ARG A 7 ? O ARG A 6 AC 4 5 N SER A 14 ? N SER A 13 O HIS A 89 ? O HIS A 88 AC 5 6 N GLU A 98 ? N GLU A 97 O ARG A 106 ? O ARG A 105 AC 6 7 N TYR A 113 ? N TYR A 112 O GLU A 116 ? O GLU A 115 AC 7 8 N SER A 120 ? N SER A 119 O THR A 129 ? O THR A 128 BA 1 2 N SER B 5 ? N SER B 31 O SER B 10 ? O SER B 36 BB 1 2 N TRP B 28 ? N TRP B 54 O ARG B 127 ? O ARG B 153 BB 2 3 N VAL B 130 ? N VAL B 156 O GLY B 110 ? O GLY B 136 BB 3 4 N LEU B 115 ? N LEU B 141 O GLY B 50 ? O GLY B 76 BB 4 5 N PHE B 53 ? N PHE B 79 O ASP B 63 ? O ASP B 89 BB 5 6 N GLN B 68 ? N GLN B 94 O THR B 71 ? O THR B 97 BC 1 2 N TYR B 40 ? N TYR B 66 O THR B 96 ? O THR B 122 BC 2 3 O SER B 101 ? O SER B 127 N ILE B 83 ? N ILE B 109 CA 1 2 N SER C 18 ? N SER C 17 O GLN C 15 ? O GLN C 14 CB 1 2 N LYS C 45 ? N LYS C 44 O ARG C 36 ? O ARG C 35 CB 2 3 N TYR C 37 ? N TYR C 36 O ALA C 25 ? O ALA C 24 CB 3 4 N HIS C 28 ? N HIS C 27 O ARG C 7 ? O ARG C 6 CB 4 5 N GLN C 15 ? N GLN C 14 O SER C 18 ? O SER C 17 CC 1 2 N LYS C 45 ? N LYS C 44 O ARG C 36 ? O ARG C 35 CC 2 3 N TYR C 37 ? N TYR C 36 O ALA C 25 ? O ALA C 24 CC 3 4 N HIS C 28 ? N HIS C 27 O ARG C 7 ? O ARG C 6 CC 4 5 N SER C 14 ? N SER C 13 O HIS C 89 ? O HIS C 88 CC 5 6 N GLU C 98 ? N GLU C 97 O ARG C 106 ? O ARG C 105 CC 6 7 N TYR C 113 ? N TYR C 112 O GLU C 116 ? O GLU C 115 CC 7 8 N SER C 120 ? N SER C 119 O THR C 129 ? O THR C 128 DA 1 2 N SER D 5 ? N SER D 31 O SER D 10 ? O SER D 36 DB 1 2 N TRP D 28 ? N TRP D 54 O ARG D 127 ? O ARG D 153 DB 2 3 N VAL D 130 ? N VAL D 156 O GLY D 110 ? O GLY D 136 DB 3 4 N LEU D 115 ? N LEU D 141 O GLY D 50 ? O GLY D 76 DB 4 5 N PHE D 53 ? N PHE D 79 O ASP D 63 ? O ASP D 89 DB 5 6 N GLN D 68 ? N GLN D 94 O THR D 71 ? O THR D 97 DC 1 2 N TYR D 40 ? N TYR D 66 O THR D 96 ? O THR D 122 DC 2 3 O SER D 101 ? O SER D 127 N ILE D 83 ? N ILE D 109 # _pdbx_entry_details.entry_id 2WY3 _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;THE UNIPROT ACCESSION NUMBER Q29980 DOES NOT PROVIDE THE CORRECT AMINO ACID SEQUENCE OF THE MICB ALLELE 002. THIS CAN BE FOUND UNDER AAB71642 IN PUBMED PROTEIN SEARCH. ONLY THE ALPHA1 AND ALPHA2 DOMAINS (RESIDUES 1-181) OF THE ECTODOMAIN (1-276) WAS EXPRESSED. THIS IS A FRAGMENT OF THE FULL LENGTH PROTEIN (RESIDUES 1-318). SEQUENCE OF UNCHARACTERIZED PROTEIN UL16 CAN ALSO BE FOUND UNDER NP_039950 IN THE PUBMED PROTEIN SEARCH. ONLY THE ECTODOMAIN (RESIDUES 1-184) WAS EXPRESSED. THIS IS A FRAGMENT OF THE FULL LENGTH PROTEIN ( 1-230). DUE TO CLEAVAGE OF THE SIGNAL PEPTIDE (RESIDUES 1- 26) THE MATURE UL16 PROTEIN USED FOR CRYSTALLIZATION CONSISTS OF RESIDUES 27-184. ; _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? _pdbx_entry_details.has_protein_modification Y # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CA D CYS 38 ? A CB D CYS 38 ? A SG D CYS 38 ? A 121.03 114.20 6.83 1.10 N 2 1 CA D CYS 143 ? B CB D CYS 143 ? B SG D CYS 143 ? B 121.67 114.20 7.47 1.10 N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 GLU A 16 ? ? 83.91 -0.11 2 1 GLN B 111 ? ? -152.13 73.38 3 1 GLU C 16 ? ? 83.52 4.75 4 1 HIS C 79 ? ? -98.38 58.41 5 1 SER C 102 ? ? 79.85 -3.70 6 1 GLN C 125 ? B 74.77 -3.31 7 1 ASN D 84 ? ? -163.08 105.71 8 1 GLN D 111 ? ? -151.38 73.23 # loop_ _pdbx_validate_chiral.id _pdbx_validate_chiral.PDB_model_num _pdbx_validate_chiral.auth_atom_id _pdbx_validate_chiral.label_alt_id _pdbx_validate_chiral.auth_asym_id _pdbx_validate_chiral.auth_comp_id _pdbx_validate_chiral.auth_seq_id _pdbx_validate_chiral.PDB_ins_code _pdbx_validate_chiral.details _pdbx_validate_chiral.omega 1 1 C1 A B NAG 1202 ? 'WRONG HAND' . 2 1 C1 B D NAG 1202 ? 'WRONG HAND' . # loop_ _pdbx_struct_mod_residue.id _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.details 1 B ASN 15 B ASN 41 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 2 B ASN 42 B ASN 68 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 3 B ASN 58 B ASN 84 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 4 B ASN 69 B ASN 95 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 5 B ASN 75 B ASN 101 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 6 B ASN 106 B ASN 132 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 7 D ASN 15 D ASN 41 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 8 D ASN 42 D ASN 68 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 9 D ASN 58 D ASN 84 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 10 D ASN 69 D ASN 95 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 11 D ASN 75 D ASN 101 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' 12 D ASN 106 D ASN 132 ? ASN 'GLYCOSYLATION SITE' # loop_ _pdbx_refine_tls.pdbx_refine_id _pdbx_refine_tls.id _pdbx_refine_tls.details _pdbx_refine_tls.method _pdbx_refine_tls.origin_x _pdbx_refine_tls.origin_y _pdbx_refine_tls.origin_z _pdbx_refine_tls.T[1][1] _pdbx_refine_tls.T[2][2] _pdbx_refine_tls.T[3][3] _pdbx_refine_tls.T[1][2] _pdbx_refine_tls.T[1][3] _pdbx_refine_tls.T[2][3] _pdbx_refine_tls.L[1][1] _pdbx_refine_tls.L[2][2] _pdbx_refine_tls.L[3][3] _pdbx_refine_tls.L[1][2] _pdbx_refine_tls.L[1][3] _pdbx_refine_tls.L[2][3] _pdbx_refine_tls.S[1][1] _pdbx_refine_tls.S[1][2] _pdbx_refine_tls.S[1][3] _pdbx_refine_tls.S[2][1] _pdbx_refine_tls.S[2][2] _pdbx_refine_tls.S[2][3] _pdbx_refine_tls.S[3][1] _pdbx_refine_tls.S[3][2] _pdbx_refine_tls.S[3][3] 'X-RAY DIFFRACTION' 1 ? refined 17.4489 48.7049 89.1082 0.2910 0.1848 0.1416 0.0002 -0.0236 -0.0401 2.6889 0.3071 2.0066 0.5430 1.1172 0.8275 -0.0071 0.3072 -0.3937 -0.1792 0.2416 -0.1812 0.2872 0.2566 -0.2466 'X-RAY DIFFRACTION' 2 ? refined 18.6056 49.1065 96.4055 0.2270 0.1062 0.1276 0.0376 -0.0194 -0.0088 1.7158 1.0711 3.2354 0.6443 0.3632 0.8814 0.1127 -0.0365 -0.0434 -0.0369 0.0196 0.0138 0.2959 0.1234 -0.1331 'X-RAY DIFFRACTION' 3 ? 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