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J ALA 156 ? 4 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? # _struct.entry_id 2DB4 _struct.title 'Crystal structure of rotor ring with DCCD of the V- ATPase from Enterococcus hirae' _struct.pdbx_descriptor 'V-Type Sodium ATPase Subunit K (E.C.3.6.3.14)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 2DB4 _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE _struct_keywords.text ;NtpK, V-ATPase, Na(+)-ATPase, DCCD, Proteolipid, Enterococcus hirae, Structural Genomics, NPPSFA, National Project on Protein Structural and Functional Analyses, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI, HYDROLASE ; # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 2 ? L N N 3 ? M N N 4 ? N N N 4 ? O N N 5 ? P N N 5 ? Q N N 3 ? 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RB N N 6 ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 MET A 1 ? GLN A 8 ? MET A 1 GLN A 8 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 2 GLY A 11 ? THR A 46 ? GLY A 11 THR A 46 1 ? 36 HELX_P HELX_P3 3 GLN A 48 ? GLU A 50 ? GLN A 48 GLU A 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 4 LYS A 51 ? LEU A 61 ? LYS A 51 LEU A 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P5 5 GLY A 63 ? ILE A 78 ? GLY A 63 ILE A 78 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 6 SER A 85 ? LYS A 124 ? SER A 85 LYS A 124 1 ? 40 HELX_P HELX_P7 7 HIS A 127 ? MET A 137 ? HIS A 127 MET A 137 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 9 MET B 1 ? GLN B 8 ? MET B 1 GLN B 8 1 ? 8 HELX_P HELX_P9 10 GLY B 11 ? THR B 46 ? GLY B 11 THR B 46 1 ? 36 HELX_P HELX_P10 11 GLN B 48 ? GLU B 50 ? GLN B 48 GLU B 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 12 LYS B 51 ? LEU B 61 ? LYS B 51 LEU B 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P12 13 GLY B 63 ? ILE B 78 ? GLY B 63 ILE B 78 1 ? 16 HELX_P HELX_P13 14 SER B 85 ? LYS B 124 ? SER B 85 LYS B 124 1 ? 40 HELX_P HELX_P14 15 HIS B 127 ? MET B 137 ? HIS B 127 MET B 137 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 17 MET C 1 ? GLN C 8 ? MET C 1 GLN C 8 1 ? 8 HELX_P HELX_P16 18 GLY C 11 ? THR C 46 ? GLY C 11 THR C 46 1 ? 36 HELX_P HELX_P17 19 GLN C 48 ? GLU C 50 ? GLN C 48 GLU C 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 20 LYS C 51 ? LEU C 61 ? LYS C 51 LEU C 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 21 GLY C 63 ? ILE C 78 ? GLY C 63 ILE C 78 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 22 SER C 85 ? LYS C 124 ? SER C 85 LYS C 124 1 ? 40 HELX_P HELX_P21 23 HIS C 127 ? MET C 137 ? 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GLY H 11 THR H 46 1 ? 36 HELX_P HELX_P52 59 GLN H 48 ? GLU H 50 ? GLN H 48 GLU H 50 5 ? 3 HELX_P HELX_P53 60 LYS H 51 ? LEU H 61 ? LYS H 51 LEU H 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P54 61 GLY H 63 ? ILE H 78 ? GLY H 63 ILE H 78 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 62 SER H 85 ? LYS H 124 ? SER H 85 LYS H 124 1 ? 40 HELX_P HELX_P56 63 HIS H 127 ? MET H 137 ? HIS H 127 MET H 137 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 65 MET I 1 ? GLN I 8 ? MET I 1 GLN I 8 1 ? 8 HELX_P HELX_P58 66 GLY I 11 ? THR I 46 ? GLY I 11 THR I 46 1 ? 36 HELX_P HELX_P59 67 SER I 47 ? GLU I 50 ? SER I 47 GLU I 50 5 ? 4 HELX_P HELX_P60 68 LYS I 51 ? LEU I 61 ? LYS I 51 LEU I 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P61 69 GLY I 63 ? ILE I 78 ? GLY I 63 ILE I 78 1 ? 16 HELX_P HELX_P62 70 SER I 85 ? LYS I 124 ? SER I 85 LYS I 124 1 ? 40 HELX_P HELX_P63 71 HIS I 127 ? MET I 137 ? HIS I 127 MET I 137 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 73 MET J 1 ? GLN J 8 ? MET J 1 GLN J 8 1 ? 8 HELX_P HELX_P65 74 GLY J 11 ? THR J 46 ? GLY J 11 THR J 46 1 ? 36 HELX_P HELX_P66 75 GLN J 48 ? GLU J 50 ? 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HIS J 127 MET J 137 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc1 metalc ? ? 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E NA 202 E LEU 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc11 metalc ? ? JA NA . NA ? ? ? 1_555 F LEU 61 O ? ? F NA 202 F LEU 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc12 metalc ? ? JA NA . NA ? ? ? 1_555 F THR 64 OG1 ? ? F NA 202 F THR 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc13 metalc ? ? PA NA . NA ? ? ? 1_555 G LEU 61 O ? ? G NA 202 G LEU 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? metalc14 metalc ? ? PA NA . NA ? ? ? 1_555 G THR 64 OG1 ? ? G NA 202 G THR 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.460 ? metalc15 metalc ? ? TA NA . NA ? ? ? 1_555 H LEU 61 O ? ? H NA 202 H LEU 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc16 metalc ? ? TA NA . NA ? ? ? 1_555 H THR 64 OG1 ? ? H NA 202 H THR 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc17 metalc ? ? XA NA . NA ? ? ? 1_555 I THR 64 OG1 ? ? I NA 202 I THR 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc18 metalc ? ? XA NA . NA ? ? ? 1_555 I LEU 61 O ? ? I NA 202 I LEU 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc19 metalc ? ? CB NA . NA ? ? ? 1_555 J LEU 61 O ? ? 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E GLN 65 E NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? metalc29 metalc ? ? E GLN 110 OE1 ? ? ? 1_555 FA NA . NA ? ? E GLN 110 E NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.939 ? metalc30 metalc ? ? F GLN 65 OE1 ? ? ? 1_555 JA NA . NA ? ? F GLN 65 F NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? metalc31 metalc ? ? F GLN 110 OE1 ? ? ? 1_555 JA NA . NA ? ? F GLN 110 F NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.892 ? metalc32 metalc ? ? G GLN 65 OE1 ? ? ? 1_555 PA NA . NA ? ? G GLN 65 G NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc33 metalc ? ? G GLN 110 OE1 ? ? ? 1_555 PA NA . NA ? ? G GLN 110 G NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? metalc34 metalc ? ? H GLN 65 OE1 ? ? ? 1_555 TA NA . NA ? ? H GLN 65 H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.708 ? metalc35 metalc ? ? H GLN 110 OE1 ? ? ? 1_555 TA NA . NA ? ? H GLN 110 H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? metalc36 metalc ? ? I GLN 65 OE1 ? ? ? 1_555 XA NA . NA ? ? I GLN 65 I NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc37 metalc ? ? J THR 64 OG1 ? ? ? 1_555 CB NA . NA ? ? 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G GLU 139 G NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.000 ? metalc47 metalc ? ? H GLU 139 OE1 ? ? ? 1_555 TA NA . NA ? ? H GLU 139 H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.001 ? metalc48 metalc ? ? C GLU 139 OE1 ? ? ? 1_555 U NA . NA ? ? C GLU 139 C NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.003 ? metalc49 metalc ? ? B GLU 139 OE1 ? ? ? 1_555 Q NA . NA ? ? B GLU 139 B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.015 ? metalc50 metalc ? ? J GLU 139 OE1 ? ? ? 1_555 CB NA . NA ? ? J GLU 139 J NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.037 ? covale1 covale ? ? D GLU 139 CD ? ? ? 1_555 DA DCW . N1 ? ? D GLU 139 D DCW 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale2 covale ? ? J GLU 139 CD ? ? ? 1_555 HB DCW . N1 ? ? J GLU 139 J DCW 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale3 covale ? ? A GLU 139 CD ? ? ? 1_555 K DCW . N1 ? ? A GLU 139 A DCW 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale4 covale ? ? C GLU 139 CD ? ? ? 1_555 W DCW . N1 ? ? C GLU 139 C DCW 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale5 covale ? ? G GLU 139 CD ? ? ? 1_555 SA DCW . N1 ? ? 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