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'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY' 1 2 1 '2D 1H-1H COSY' 2 3 2 '2D 1H-1H NOESY' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 0.100 7.0 ambient ? 288 K 2 0.100 7.0 ambient ? 283 K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system ;0.51 mM 5'-D(*CP*GP*GP*AP*CP*(6HB)P*AP*GP*AP*AP*G)-3', 0.51 mM 5'-D(*CP*TP*TP*CP*TP*TP*GP*TP*CP*CP*G)-3', 100 mM sodium chloride, 50 uM EDTA, 10 mM sodium phosphate pH 7.0, 100% D2O ; 1 '100% D2O' ;0.51 mM 5'-D(*CP*GP*GP*AP*CP*(6HB)P*AP*GP*AP*AP*G)-3', 0.51 mM 5'-D(*CP*TP*TP*CP*TP*TP*GP*TP*CP*CP*G)-3', 100 mM sodium chloride, 50 uM EDTA, 10 mM sodium phosphate pH 7.0, 90% H2O/10% D2O ; 2 '90% H2O/10% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.type 800 Bruker Avance 1 'Bruker Avance' 600 Bruker Avance 2 'Bruker Avance' # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2MNX _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'back calculated data agree with experimental NOESY spectrum' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 9 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 9 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2MNX _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2MNX _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'closest to the average' # loop_ _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.ordinal 'Bruker Biospin' collection TOPSPIN ? 1 'Bruker Biospin' processing TOPSPIN ? 2 Goddard 'chemical shift assignment' SPARKY ? 3 Goddard 'peak picking' SPARKY ? 4 Goddard 'data analysis' SPARKY ? 5 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' refinement AMBER ? 6 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' 'structure solution' AMBER ? 7 'James, T. L.' 'data analysis' CORMA ? 8 'Brandan A. Borgias, T. L. 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"C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 103 4 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 104 4 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 105 4 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.56 117.00 -3.44 0.50 N 106 4 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 107 4 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 113.75 118.60 -4.85 0.60 N 108 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 109 4 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 110 4 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 111 4 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.71 118.60 -4.89 0.60 N 112 4 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 113 4 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 114 4 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.55 118.60 -5.05 0.60 N 115 4 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 116 4 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 117 4 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 118 4 C6 B DT 14 ? ? C5 B DT 14 ? ? C7 B DT 14 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 119 4 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 120 4 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.77 121.90 -5.13 0.70 N 121 4 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 122 4 N3 B DT 17 ? ? C2 B DT 17 ? ? O2 B DT 17 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 123 4 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 124 4 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 125 4 N3 B DC 20 ? ? C2 B DC 20 ? ? O2 B DC 20 ? ? 116.96 121.90 -4.94 0.70 N 126 4 N3 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 116.70 121.90 -5.20 0.70 N 127 4 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 128 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 129 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 130 5 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 111.35 108.30 3.05 0.30 N 131 5 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 132 5 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 133 5 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.87 118.60 -4.73 0.60 N 134 5 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 111.32 108.30 3.02 0.30 N 135 5 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 122.54 118.90 3.64 0.60 N 136 5 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 137 5 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 138 5 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 139 5 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 140 5 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 113.75 118.60 -4.85 0.60 N 141 5 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 142 5 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 143 5 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 144 5 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.31 117.70 3.61 0.50 N 145 5 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.97 118.60 -4.63 0.60 N 146 5 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.56 117.00 -3.44 0.50 N 147 5 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 148 5 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.59 118.60 -5.01 0.60 N 149 5 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 112.63 108.30 4.33 0.30 N 150 5 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 151 5 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 152 5 C6 B DT 14 ? ? C5 B DT 14 ? ? C7 B DT 14 ? ? 119.26 122.90 -3.64 0.60 N 153 5 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 154 5 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.89 121.90 -5.01 0.70 N 155 5 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 110.71 108.30 2.41 0.30 N 156 5 N3 B DT 17 ? ? C2 B DT 17 ? ? O2 B DT 17 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 157 5 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 158 5 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 159 5 N3 B DC 20 ? ? C2 B DC 20 ? ? O2 B DC 20 ? ? 116.77 121.90 -5.13 0.70 N 160 5 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 161 5 N3 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 162 5 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 112.12 108.30 3.82 0.30 N 163 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.61 121.90 -5.29 0.70 N 164 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.87 108.30 2.57 0.30 N 165 6 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 166 6 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 167 6 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 168 6 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.80 118.60 -4.80 0.60 N 169 6 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 170 6 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.68 121.90 -5.22 0.70 N 171 6 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 172 6 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 173 6 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 174 6 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 113.84 118.60 -4.76 0.60 N 175 6 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 176 6 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 177 6 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 178 6 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.82 118.60 -4.78 0.60 N 179 6 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 180 6 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 181 6 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.67 118.60 -4.93 0.60 N 182 6 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 112.30 108.30 4.00 0.30 N 183 6 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 184 6 N3 B DC 12 ? ? C2 B DC 12 ? ? O2 B DC 12 ? ? 116.92 121.90 -4.98 0.70 N 185 6 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 111.02 108.30 2.72 0.30 N 186 6 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 187 6 C6 B DT 16 ? ? C5 B DT 16 ? ? C7 B DT 16 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 188 6 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 189 6 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? 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N1 A DC 5 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 202 7 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.74 121.90 -5.16 0.70 N 203 7 "O4'" A DA 7 ? ? "C1'" A DA 7 ? ? N9 A DA 7 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 204 7 C4 A DA 7 ? ? C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 205 7 C5 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N1 A DA 7 ? ? 121.58 117.70 3.88 0.50 N 206 7 N1 A DA 7 ? ? C6 A DA 7 ? ? N6 A DA 7 ? ? 114.08 118.60 -4.52 0.60 N 207 7 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 208 7 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 209 7 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 210 7 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.79 118.60 -4.81 0.60 N 211 7 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.63 117.00 -3.37 0.50 N 212 7 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.32 117.70 3.62 0.50 N 213 7 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.80 118.60 -4.80 0.60 N 214 7 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? 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