data_2MO7 # _entry.id 2MO7 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.391 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 2MO7 pdb_00002mo7 10.2210/pdb2mo7/pdb RCSB RCSB103851 ? ? BMRB 19925 ? 10.13018/BMR19925 WWPDB D_1000103851 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2014-09-10 2 'Structure model' 1 1 2024-05-01 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' chem_comp_atom 2 2 'Structure model' chem_comp_bond 3 2 'Structure model' database_2 4 2 'Structure model' pdbx_nmr_software 5 2 'Structure model' pdbx_nmr_spectrometer # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 2 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 2 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' 4 2 'Structure model' '_pdbx_nmr_spectrometer.model' # loop_ _database_PDB_caveat.id _database_PDB_caveat.text 1 ;Significant bond length deviation observed between C5' and O5' of DC A 1 in model 1 ; 2 'Significant bond angle deviations observed in DC A 1 and DA B 17 in model 1' # _pdbx_database_status.deposit_site BMRB _pdbx_database_status.entry_id 2MO7 _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2014-04-18 _pdbx_database_status.SG_entry ? _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # _pdbx_database_related.db_id 19925 _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.content_type unspecified _pdbx_database_related.details . # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Donahue, P.S.' 1 'Szulik, M.W.' 2 'Stone, M.P.' 3 # _citation.id primary _citation.title 'Characterization of 5-hydroxycytosine in DNA' _citation.journal_abbrev 'To be Published' _citation.journal_volume ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.year ? _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country ? _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Szulik, M.' 1 ? primary 'Donahue, P.' 2 ? primary 'Stone, M.' 3 ? # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description "DNA_(5'-D(*CP*GP*CP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3')" _entity.formula_weight 3647.393 _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DC)(DG)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)' _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can CGCAAATTCGCG _entity_poly.pdbx_strand_id A,B _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 DC n 1 4 DA n 1 5 DA n 1 6 DA n 1 7 DT n 1 8 DT n 1 9 DC n 1 10 DG n 1 11 DC n 1 12 DG n # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC DC A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DC 3 3 3 DC DC A . n A 1 4 DA 4 4 4 DA DA A . n A 1 5 DA 5 5 5 DA DA A . n A 1 6 DA 6 6 6 DA DA A . n A 1 7 DT 7 7 7 DT DT A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT DT A . n A 1 9 DC 9 9 9 DC DC A . n A 1 10 DG 10 10 10 DG DG A . n A 1 11 DC 11 11 11 DC DC A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n B 1 1 DC 1 13 13 DC DC B . n B 1 2 DG 2 14 14 DG DG B . n B 1 3 DC 3 15 15 DC DC B . n B 1 4 DA 4 16 16 DA DA B . n B 1 5 DA 5 17 17 DA DA B . n B 1 6 DA 6 18 18 DA DA B . n B 1 7 DT 7 19 19 DT DT B . n B 1 8 DT 8 20 20 DT DT B . n B 1 9 DC 9 21 21 DC DC B . n B 1 10 DG 10 22 22 DG DG B . n B 1 11 DC 11 23 23 DC DC B . n B 1 12 DG 12 24 24 DG DG B . n # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.entry_id 2MO7 _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 2MO7 _struct.title 'Solution NMR structure of DNA dodecamer with A:C mismatch' _struct.pdbx_model_details 'minimized average structure, model1' _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details 'minimized average' # _struct_keywords.entry_id 2MO7 _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'DNA, dodecamer, mismatch' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 2MO7 _struct_ref.pdbx_db_accession 2MO7 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_align_begin ? _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_db_isoform ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 2MO7 A 1 ? 12 ? 2MO7 1 ? 12 ? 1 12 2 1 2MO7 B 1 ? 12 ? 2MO7 13 ? 24 ? 13 24 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 1320 ? 1 MORE -7 ? 1 'SSA (A^2)' 4740 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 12 N1 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 12 O6 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 12 N2 ? ? A DC 1 B DG 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 B DC 11 N3 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 B DC 11 O2 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B DC 11 N4 ? ? A DG 2 B DC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 3 N3 ? ? ? 1_555 B DG 10 N1 ? ? A DC 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DC 3 N4 ? ? ? 1_555 B DG 10 O6 ? ? A DC 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DC 3 O2 ? ? ? 1_555 B DG 10 N2 ? ? A DC 3 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DA 4 N6 ? ? ? 1_555 B DC 9 N3 ? ? A DA 4 B DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DC MISPAIR' ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DA 5 N1 ? ? ? 1_555 B DT 8 N3 ? ? A DA 5 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DA 5 N6 ? ? ? 1_555 B DT 8 O4 ? ? A DA 5 B DT 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DA 6 N1 ? ? ? 1_555 B DT 7 N3 ? ? A DA 6 B DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 B DT 7 O4 ? ? A DA 6 B DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DT 7 N3 ? ? ? 1_555 B DA 6 N1 ? ? A DT 7 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DT 7 O4 ? ? ? 1_555 B DA 6 N6 ? ? A DT 7 B DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 5 N1 ? ? A DT 8 B DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DT 8 O4 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? A DT 8 B DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DC 9 N3 ? ? ? 1_555 B DA 4 N6 ? ? A DC 9 B DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 B DC 3 N3 ? ? A DG 10 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 B DC 3 O2 ? ? A DG 10 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 10 O6 ? ? ? 1_555 B DC 3 N4 ? ? A DG 10 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DC 11 N3 ? ? ? 1_555 B DG 2 N1 ? ? A DC 11 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DC 11 N4 ? ? ? 1_555 B DG 2 O6 ? ? A DC 11 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DC 11 O2 ? ? ? 1_555 B DG 2 N2 ? ? A DC 11 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 12 N1 ? ? ? 1_555 B DC 1 N3 ? ? A DG 12 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 12 N2 ? ? ? 1_555 B DC 1 O2 ? ? A DG 12 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 12 O6 ? ? ? 1_555 B DC 1 N4 ? ? A DG 12 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 "O5'" A DC 1 ? ? "C5'" A DC 1 ? ? 0.840 1.418 -0.578 0.025 N 2 1 "O5'" B DC 13 ? ? "C5'" B DC 13 ? ? 1.260 1.418 -0.158 0.025 N 3 1 "O3'" B DC 15 ? ? P B DA 16 ? ? 1.533 1.607 -0.074 0.012 Y 4 1 "O5'" B DA 16 ? ? "C5'" B DA 16 ? ? 1.239 1.418 -0.179 0.025 N 5 1 "O3'" B DA 17 ? ? "C3'" B DA 17 ? ? 1.340 1.419 -0.079 0.006 N 6 1 "O3'" B DA 17 ? ? P B DA 18 ? ? 1.420 1.607 -0.187 0.012 Y 7 1 P B DA 18 ? ? OP1 B DA 18 ? ? 1.329 1.485 -0.156 0.017 N 8 1 P B DA 18 ? ? OP2 B DA 18 ? ? 1.315 1.485 -0.170 0.017 N 9 1 "O3'" B DG 22 ? ? P B DC 23 ? ? 1.516 1.607 -0.091 0.012 Y 10 2 C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 1.533 1.496 0.037 0.006 N 11 5 "C5'" B DG 14 ? ? "C4'" B DG 14 ? ? 1.556 1.512 0.044 0.007 N 12 6 C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 1.534 1.496 0.038 0.006 N 13 6 "C5'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? 1.559 1.512 0.047 0.007 N 14 7 "C5'" A DC 3 ? ? "C4'" A DC 3 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 15 7 "C5'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? 1.562 1.512 0.050 0.007 N 16 9 "C5'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 17 11 C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 1.539 1.496 0.043 0.006 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O5'" A DC 1 ? ? "C5'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? 146.27 111.00 35.27 2.50 N 2 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 3 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 4 1 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 5 1 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 122.69 118.90 3.79 0.60 N 6 1 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 7 1 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 8 1 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 120.93 117.70 3.23 0.50 N 9 1 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.20 118.60 -5.40 0.60 N 10 1 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.94 117.00 -3.06 0.50 N 11 1 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 12 1 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.86 118.60 -4.74 0.60 N 13 1 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 14 1 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 15 1 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.33 118.60 -4.27 0.60 N 16 1 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 17 1 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.58 122.30 -3.72 0.60 N 18 1 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 19 1 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.02 121.90 -4.88 0.70 N 20 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.97 108.30 4.67 0.30 N 21 1 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.00 121.90 -4.90 0.70 N 22 1 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 23 1 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 24 1 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 123.30 118.90 4.40 0.60 N 25 1 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.78 121.90 -5.12 0.70 N 26 1 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.37 117.00 -3.63 0.50 N 27 1 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 28 1 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.47 118.60 -6.13 0.60 N 29 1 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 30 1 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 31 1 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.35 118.60 -5.25 0.60 N 32 1 "C3'" B DA 17 ? ? "O3'" B DA 17 ? ? P B DA 18 ? ? 149.35 119.70 29.65 1.20 Y 33 1 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.92 117.00 -3.08 0.50 N 34 1 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 35 1 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 114.22 118.60 -4.38 0.60 N 36 1 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 37 1 "C3'" B DG 22 ? ? "O3'" B DG 22 ? ? P B DC 23 ? ? 132.02 119.70 12.32 1.20 Y 38 1 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 122.54 118.90 3.64 0.60 N 39 1 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.55 121.90 -5.35 0.70 N 40 1 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 41 2 N1 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? O6 A DG 2 ? ? 115.94 119.90 -3.96 0.60 N 42 2 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 113.05 108.30 4.75 0.30 N 43 2 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.99 121.90 -4.91 0.70 N 44 2 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 45 2 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.07 117.70 3.37 0.50 N 46 2 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 47 2 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 48 2 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.64 117.70 3.94 0.50 N 49 2 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 50 2 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? N9 A DA 6 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 51 2 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.65 117.00 -3.35 0.50 N 52 2 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 122.00 117.70 4.30 0.50 N 53 2 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.63 118.60 -4.97 0.60 N 54 2 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 55 2 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 118.87 122.90 -4.03 0.60 N 56 2 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.75 108.30 3.45 0.30 N 57 2 "O4'" A DC 11 ? ? "C1'" A DC 11 ? ? N1 A DC 11 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 58 2 N3 A DC 11 ? ? C4 A DC 11 ? ? C5 A DC 11 ? ? 124.43 121.90 2.53 0.40 N 59 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.65 108.30 4.35 0.30 N 60 2 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.70 118.90 3.80 0.60 N 61 2 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.60 121.90 -4.30 0.70 N 62 2 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 123.05 118.90 4.15 0.60 N 63 2 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 115.95 121.90 -5.95 0.70 N 64 2 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 65 2 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.21 117.00 -3.79 0.50 N 66 2 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 67 2 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.12 118.60 -6.48 0.60 N 68 2 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.06 117.00 -3.94 0.50 N 69 2 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.20 117.70 3.50 0.50 N 70 2 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 112.67 118.60 -5.93 0.60 N 71 2 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.27 117.70 3.57 0.50 N 72 2 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 114.65 118.60 -3.95 0.60 N 73 2 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 111.03 108.30 2.73 0.30 N 74 2 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 118.93 122.90 -3.97 0.60 N 75 2 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.77 121.90 -5.13 0.70 N 76 2 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 77 3 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 78 3 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.92 118.90 5.02 0.60 N 79 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 114.87 121.90 -7.03 0.70 N 80 3 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.70 N 81 3 N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? N4 A DC 3 ? ? 113.43 118.00 -4.57 0.70 N 82 3 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 83 3 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 84 3 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.90 118.60 -4.70 0.60 N 85 3 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.22 117.00 -3.78 0.50 N 86 3 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 87 3 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.15 118.60 -4.45 0.60 N 88 3 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.97 117.00 -4.03 0.50 N 89 3 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 122.17 117.70 4.47 0.50 N 90 3 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.94 118.60 -5.66 0.60 N 91 3 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 92 3 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 93 3 N3 A DC 11 ? ? C4 A DC 11 ? ? C5 A DC 11 ? ? 124.97 121.90 3.07 0.40 N 94 3 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.70 N 95 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 113.23 108.30 4.93 0.30 N 96 3 N1 A DG 12 ? ? C6 A DG 12 ? ? O6 A DG 12 ? ? 115.78 119.90 -4.12 0.60 N 97 3 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 98 3 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.45 121.90 -4.45 0.70 N 99 3 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 100 3 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 101 3 N3 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? C5 B DC 15 ? ? 124.33 121.90 2.43 0.40 N 102 3 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 123.21 118.90 4.31 0.60 N 103 3 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.47 121.90 -4.43 0.70 N 104 3 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 105 3 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.22 117.00 -3.78 0.50 N 106 3 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.77 117.70 4.07 0.50 N 107 3 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.85 118.60 -5.75 0.60 N 108 3 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.11 117.00 -3.89 0.50 N 109 3 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.86 117.70 4.16 0.50 N 110 3 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.02 118.60 -5.58 0.60 N 111 3 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 112 3 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 120.95 117.70 3.25 0.50 N 113 3 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 114.82 118.60 -3.78 0.60 N 114 3 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 115 3 N3 B DT 20 ? ? C2 B DT 20 ? ? O2 B DT 20 ? ? 118.48 122.30 -3.82 0.60 N 116 3 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 118.50 122.90 -4.40 0.60 N 117 3 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 118 3 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 119 3 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 120 3 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 123.56 118.90 4.66 0.60 N 121 3 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.05 121.90 -5.85 0.70 N 122 3 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.76 108.30 3.46 0.30 N 123 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 124 4 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.95 118.90 5.05 0.60 N 125 4 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 115.59 121.90 -6.31 0.70 N 126 4 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.64 108.30 3.34 0.30 N 127 4 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.98 121.90 -4.92 0.70 N 128 4 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.55 117.00 -3.45 0.50 N 129 4 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 120.94 117.70 3.24 0.50 N 130 4 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.51 118.60 -5.09 0.60 N 131 4 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 120.70 117.70 3.00 0.50 N 132 4 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.30 118.60 -5.30 0.60 N 133 4 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.36 117.00 -3.64 0.50 N 134 4 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.62 117.70 3.92 0.50 N 135 4 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.84 118.60 -4.76 0.60 N 136 4 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.70 122.30 -3.60 0.60 N 137 4 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.64 108.30 3.34 0.30 N 138 4 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.43 121.90 -4.47 0.70 N 139 4 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 140 4 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.57 121.90 -4.33 0.70 N 141 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 113.60 108.30 5.30 0.30 N 142 4 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.70 118.90 3.80 0.60 N 143 4 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 115.94 121.90 -5.96 0.70 N 144 4 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 145 4 N3 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? C5 B DC 15 ? ? 124.78 121.90 2.88 0.40 N 146 4 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.00 121.90 -4.90 0.70 N 147 4 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 148 4 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 149 4 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 150 4 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.57 118.60 -6.03 0.60 N 151 4 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 111.41 108.30 3.11 0.30 N 152 4 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.93 117.00 -3.07 0.50 N 153 4 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.54 117.70 3.84 0.50 N 154 4 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 112.97 118.60 -5.63 0.60 N 155 4 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.53 117.00 -3.47 0.50 N 156 4 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.80 117.70 4.10 0.50 N 157 4 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.98 118.60 -4.62 0.60 N 158 4 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 159 4 "O4'" B DT 20 ? ? "C1'" B DT 20 ? ? N1 B DT 20 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 160 4 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 161 4 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 162 4 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 163 4 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 117.62 121.90 -4.28 0.70 N 164 4 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 113.78 108.30 5.48 0.30 N 165 4 N1 B DG 24 ? ? C6 B DG 24 ? ? O6 B DG 24 ? ? 115.77 119.90 -4.13 0.60 N 166 5 N3 A DC 1 ? ? C4 A DC 1 ? ? C5 A DC 1 ? ? 124.77 121.90 2.87 0.40 N 167 5 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.08 118.90 4.18 0.60 N 168 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.29 121.90 -5.61 0.70 N 169 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N 170 5 N1 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? O6 A DG 2 ? ? 116.15 119.90 -3.75 0.60 N 171 5 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.62 118.90 4.72 0.60 N 172 5 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.82 121.90 -5.08 0.70 N 173 5 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.21 118.60 -6.39 0.60 N 174 5 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.22 118.60 -4.38 0.60 N 175 5 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? N9 A DA 6 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 176 5 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 177 5 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.92 118.60 -3.68 0.60 N 178 5 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 118.39 122.90 -4.51 0.60 N 179 5 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.48 122.30 -3.82 0.60 N 180 5 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 118.91 122.90 -3.99 0.60 N 181 5 N1 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 122.61 118.90 3.71 0.60 N 182 5 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.52 121.90 -5.38 0.70 N 183 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 113.31 108.30 5.01 0.30 N 184 5 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 185 5 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.56 118.90 3.66 0.60 N 186 5 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.36 121.90 -5.54 0.70 N 187 5 N1 B DG 14 ? ? C6 B DG 14 ? ? O6 B DG 14 ? ? 116.20 119.90 -3.70 0.60 N 188 5 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 123.13 118.90 4.23 0.60 N 189 5 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 190 5 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.82 117.70 4.12 0.50 N 191 5 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.40 118.60 -6.20 0.60 N 192 5 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.57 117.00 -3.43 0.50 N 193 5 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 194 5 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 114.01 118.60 -4.59 0.60 N 195 5 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 120.92 117.70 3.22 0.50 N 196 5 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 114.41 118.60 -4.19 0.60 N 197 5 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.98 108.30 2.68 0.30 N 198 5 N3 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? O2 B DT 19 ? ? 118.47 122.30 -3.83 0.60 N 199 5 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 200 5 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 119.12 122.90 -3.78 0.60 N 201 5 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 202 5 C5 B DG 22 ? ? C6 B DG 22 ? ? N1 B DG 22 ? ? 114.67 111.50 3.17 0.50 N 203 5 N1 B DG 22 ? ? C6 B DG 22 ? ? O6 B DG 22 ? ? 116.26 119.90 -3.64 0.60 N 204 5 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 205 5 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 123.12 118.90 4.22 0.60 N 206 5 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.46 121.90 -5.44 0.70 N 207 5 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 208 6 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 209 6 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 210 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.26 121.90 -4.64 0.70 N 211 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 212 6 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.41 108.30 2.11 0.30 N 213 6 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 214 6 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 215 6 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.12 118.60 -5.48 0.60 N 216 6 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 217 6 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 218 6 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.21 118.60 -4.39 0.60 N 219 6 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.25 117.00 -3.75 0.50 N 220 6 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 122.05 117.70 4.35 0.50 N 221 6 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.76 118.60 -4.84 0.60 N 222 6 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 223 6 N3 A DT 7 ? ? C2 A DT 7 ? ? O2 A DT 7 ? ? 118.33 122.30 -3.97 0.60 N 224 6 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.04 122.30 -4.26 0.60 N 225 6 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.15 122.90 -3.75 0.60 N 226 6 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 227 6 N1 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 122.87 118.90 3.97 0.60 N 228 6 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.17 121.90 -4.73 0.70 N 229 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 230 6 N1 A DG 12 ? ? C6 A DG 12 ? ? O6 A DG 12 ? ? 115.93 119.90 -3.97 0.60 N 231 6 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.63 121.90 -4.27 0.70 N 232 6 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 233 6 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 234 6 N3 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? C5 B DC 15 ? ? 124.67 121.90 2.77 0.40 N 235 6 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 124.05 118.90 5.15 0.60 N 236 6 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 114.62 121.90 -7.28 0.70 N 237 6 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.39 117.00 -3.61 0.50 N 238 6 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 113.57 118.60 -5.03 0.60 N 239 6 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 240 6 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.38 117.00 -3.62 0.50 N 241 6 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 242 6 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.77 118.60 -4.83 0.60 N 243 6 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 244 6 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.74 117.70 4.04 0.50 N 245 6 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.23 118.60 -5.37 0.60 N 246 6 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 247 6 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 248 6 "O4'" B DT 20 ? ? "C1'" B DT 20 ? ? N1 B DT 20 ? ? 110.53 108.30 2.23 0.30 N 249 6 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 117.28 121.90 -4.62 0.70 N 250 6 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.64 108.30 3.34 0.30 N 251 6 N1 B DG 24 ? ? C6 B DG 24 ? ? O6 B DG 24 ? ? 115.78 119.90 -4.12 0.60 N 252 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.00 121.90 -4.90 0.70 N 253 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 254 7 N1 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? O6 A DG 2 ? ? 116.12 119.90 -3.78 0.60 N 255 7 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 256 7 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.00 118.90 4.10 0.60 N 257 7 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 258 7 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.94 118.60 -4.66 0.60 N 259 7 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.58 108.30 2.28 0.30 N 260 7 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.07 117.70 3.37 0.50 N 261 7 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.46 118.60 -5.14 0.60 N 262 7 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.97 117.00 -3.03 0.50 N 263 7 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 120.72 117.70 3.02 0.50 N 264 7 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 265 7 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.09 122.90 -3.81 0.60 N 266 7 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.11 122.30 -4.19 0.60 N 267 7 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.37 121.90 -5.53 0.70 N 268 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 269 7 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.98 121.90 -4.92 0.70 N 270 7 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 123.48 118.90 4.58 0.60 N 271 7 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.57 121.90 -5.33 0.70 N 272 7 "O4'" B DA 16 ? ? "C1'" B DA 16 ? ? N9 B DA 16 ? ? 110.50 108.30 2.20 0.30 N 273 7 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 274 7 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 113.03 118.60 -5.57 0.60 N 275 7 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 112.82 117.00 -4.18 0.50 N 276 7 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 277 7 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.53 118.60 -5.07 0.60 N 278 7 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 279 7 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 122.86 117.70 5.16 0.50 N 280 7 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 112.43 118.60 -6.17 0.60 N 281 7 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.13 108.30 1.83 0.30 N 282 7 N3 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? O2 B DT 19 ? ? 117.90 122.30 -4.40 0.60 N 283 7 N3 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 117.57 121.90 -4.33 0.70 N 284 7 "O4'" B DC 23 ? ? "C4'" B DC 23 ? ? "C3'" B DC 23 ? ? 109.94 106.00 3.94 0.60 N 285 7 "O4'" B DC 23 ? ? "C1'" B DC 23 ? ? N1 B DC 23 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 286 7 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 122.74 118.90 3.84 0.60 N 287 7 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.55 121.90 -5.35 0.70 N 288 7 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 289 8 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 290 8 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 122.80 118.90 3.90 0.60 N 291 8 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.74 121.90 -5.16 0.70 N 292 8 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 293 8 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.59 118.60 -5.01 0.60 N 294 8 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.07 117.00 -3.93 0.50 N 295 8 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 122.53 117.70 4.83 0.50 N 296 8 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.42 118.60 -5.18 0.60 N 297 8 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.34 117.70 3.64 0.50 N 298 8 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.65 118.60 -3.95 0.60 N 299 8 C6 A DT 7 ? ? C5 A DT 7 ? ? C7 A DT 7 ? ? 119.24 122.90 -3.66 0.60 N 300 8 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 117.04 122.30 -5.26 0.60 N 301 8 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 302 8 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.52 121.90 -4.38 0.70 N 303 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 114.49 108.30 6.19 0.30 N 304 8 C5 A DG 12 ? ? C6 A DG 12 ? ? N1 A DG 12 ? ? 114.70 111.50 3.20 0.50 N 305 8 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 306 8 N1 B DG 14 ? ? C6 B DG 14 ? ? O6 B DG 14 ? ? 116.21 119.90 -3.69 0.60 N 307 8 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 111.12 108.30 2.82 0.30 N 308 8 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.31 121.90 -4.59 0.70 N 309 8 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.84 117.00 -3.16 0.50 N 310 8 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.23 117.70 3.53 0.50 N 311 8 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.18 118.60 -6.42 0.60 N 312 8 "O4'" B DA 17 ? ? "C1'" B DA 17 ? ? N9 B DA 17 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 313 8 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.91 117.00 -3.09 0.50 N 314 8 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 112.58 118.60 -6.02 0.60 N 315 8 "O4'" B DA 18 ? ? "C1'" B DA 18 ? ? N9 B DA 18 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 316 8 N1 B DA 18 ? ? C2 B DA 18 ? ? N3 B DA 18 ? ? 126.24 129.30 -3.06 0.50 N 317 8 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 112.89 117.00 -4.11 0.50 N 318 8 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.92 117.70 4.22 0.50 N 319 8 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 114.39 118.60 -4.21 0.60 N 320 8 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.84 108.30 2.54 0.30 N 321 8 N3 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 116.97 121.90 -4.93 0.70 N 322 8 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 122.67 118.90 3.77 0.60 N 323 8 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.62 121.90 -5.28 0.70 N 324 8 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.24 108.30 3.94 0.30 N 325 9 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.08 118.90 4.18 0.60 N 326 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.11 121.90 -5.79 0.70 N 327 9 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 328 9 C5 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? N1 A DG 2 ? ? 114.57 111.50 3.07 0.50 N 329 9 N1 A DG 2 ? ? C6 A DG 2 ? ? O6 A DG 2 ? ? 115.72 119.90 -4.18 0.60 N 330 9 N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 124.38 121.90 2.48 0.40 N 331 9 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 122.54 118.90 3.64 0.60 N 332 9 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.94 121.90 -4.96 0.70 N 333 9 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.41 117.00 -3.59 0.50 N 334 9 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 120.73 117.70 3.03 0.50 N 335 9 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.89 118.60 -5.71 0.60 N 336 9 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 120.77 117.70 3.07 0.50 N 337 9 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.55 118.60 -4.05 0.60 N 338 9 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? N9 A DA 6 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 339 9 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 340 9 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 341 9 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 118.87 122.90 -4.03 0.60 N 342 9 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 343 9 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 344 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 114.23 108.30 5.93 0.30 N 345 9 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.40 121.90 -5.50 0.70 N 346 9 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 347 9 N3 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? C5 B DC 15 ? ? 124.51 121.90 2.61 0.40 N 348 9 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 123.46 118.90 4.56 0.60 N 349 9 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 350 9 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.31 117.00 -3.69 0.50 N 351 9 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.08 117.70 3.38 0.50 N 352 9 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 112.45 118.60 -6.15 0.60 N 353 9 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.89 117.00 -3.11 0.50 N 354 9 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 114.52 118.60 -4.08 0.60 N 355 9 "O4'" B DA 18 ? ? "C1'" B DA 18 ? ? N9 B DA 18 ? ? 111.79 108.30 3.49 0.30 N 356 9 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 120.91 117.70 3.21 0.50 N 357 9 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 114.39 118.60 -4.21 0.60 N 358 9 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 113.32 108.30 5.02 0.30 N 359 9 N3 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? O2 B DT 19 ? ? 118.20 122.30 -4.10 0.60 N 360 9 N3 B DT 20 ? ? C2 B DT 20 ? ? O2 B DT 20 ? ? 117.46 122.30 -4.84 0.60 N 361 9 N3 B DC 21 ? ? C4 B DC 21 ? ? C5 B DC 21 ? ? 124.71 121.90 2.81 0.40 N 362 9 "O4'" B DC 23 ? ? "C4'" B DC 23 ? ? "C3'" B DC 23 ? ? 110.31 106.00 4.31 0.60 N 363 9 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.88 121.90 -5.02 0.70 N 364 9 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 112.48 108.30 4.18 0.30 N 365 10 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.51 121.90 -4.39 0.70 N 366 10 "O4'" A DC 3 ? ? "C1'" A DC 3 ? ? N1 A DC 3 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 367 10 N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 124.41 121.90 2.51 0.40 N 368 10 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 123.38 118.90 4.48 0.60 N 369 10 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 116.71 121.90 -5.19 0.70 N 370 10 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.28 117.00 -3.72 0.50 N 371 10 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 372 10 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.94 118.60 -5.66 0.60 N 373 10 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 112.87 117.00 -4.13 0.50 N 374 10 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.90 117.70 4.20 0.50 N 375 10 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 114.74 118.60 -3.86 0.60 N 376 10 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 377 10 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 122.27 117.70 4.57 0.50 N 378 10 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.95 118.60 -4.65 0.60 N 379 10 "O4'" A DT 7 ? ? "C1'" A DT 7 ? ? N1 A DT 7 ? ? 111.02 108.30 2.72 0.30 N 380 10 C4 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C6 A DT 8 ? ? 121.66 118.00 3.66 0.60 N 381 10 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.50 122.30 -3.80 0.60 N 382 10 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 117.75 122.90 -5.15 0.60 N 383 10 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 384 10 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 117.59 121.90 -4.31 0.70 N 385 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.12 108.30 3.82 0.30 N 386 10 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.76 118.90 3.86 0.60 N 387 10 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.75 121.90 -5.15 0.70 N 388 10 C5 B DG 14 ? ? C6 B DG 14 ? ? N1 B DG 14 ? ? 115.07 111.50 3.57 0.50 N 389 10 N1 B DG 14 ? ? C6 B DG 14 ? ? O6 B DG 14 ? ? 115.54 119.90 -4.36 0.60 N 390 10 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 391 10 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 124.01 118.90 5.11 0.60 N 392 10 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.22 121.90 -4.68 0.70 N 393 10 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 112.30 117.00 -4.70 0.50 N 394 10 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.83 117.70 4.13 0.50 N 395 10 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 111.17 118.60 -7.43 0.60 N 396 10 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.11 117.00 -3.89 0.50 N 397 10 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 121.02 117.70 3.32 0.50 N 398 10 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 113.88 118.60 -4.72 0.60 N 399 10 C4 B DA 18 ? ? C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? 113.99 117.00 -3.01 0.50 N 400 10 C5 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N1 B DA 18 ? ? 121.80 117.70 4.10 0.50 N 401 10 N1 B DA 18 ? ? C6 B DA 18 ? ? N6 B DA 18 ? ? 113.77 118.60 -4.83 0.60 N 402 10 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 403 10 N3 B DT 19 ? ? C2 B DT 19 ? ? O2 B DT 19 ? ? 118.29 122.30 -4.01 0.60 N 404 10 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 119.16 122.90 -3.74 0.60 N 405 10 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 118.77 122.90 -4.13 0.60 N 406 10 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 407 10 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 408 10 N1 B DG 22 ? ? C6 B DG 22 ? ? O6 B DG 22 ? ? 115.91 119.90 -3.99 0.60 N 409 10 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 116.00 121.90 -5.90 0.70 N 410 10 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 111.55 108.30 3.25 0.30 N 411 11 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 412 11 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 413 11 N3 A DC 3 ? ? C4 A DC 3 ? ? C5 A DC 3 ? ? 124.33 121.90 2.43 0.40 N 414 11 N1 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 122.59 118.90 3.69 0.60 N 415 11 N3 A DC 3 ? ? C2 A DC 3 ? ? O2 A DC 3 ? ? 115.94 121.90 -5.96 0.70 N 416 11 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 417 11 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.29 117.70 3.59 0.50 N 418 11 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.52 118.60 -5.08 0.60 N 419 11 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 120.77 117.70 3.07 0.50 N 420 11 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.55 118.60 -6.05 0.60 N 421 11 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 422 11 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 120.85 117.70 3.15 0.50 N 423 11 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.34 118.60 -4.26 0.60 N 424 11 N1 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? N3 A DT 8 ? ? 118.32 114.60 3.72 0.60 N 425 11 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 117.27 122.30 -5.03 0.60 N 426 11 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 119.06 122.90 -3.84 0.60 N 427 11 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 428 11 N1 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 123.58 118.90 4.68 0.60 N 429 11 N3 A DC 11 ? ? C2 A DC 11 ? ? O2 A DC 11 ? ? 115.86 121.90 -6.04 0.70 N 430 11 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 431 11 N1 A DG 12 ? ? C6 A DG 12 ? ? O6 A DG 12 ? ? 115.96 119.90 -3.94 0.60 N 432 11 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.69 118.90 3.79 0.60 N 433 11 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 434 11 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 111.96 108.30 3.66 0.30 N 435 11 N1 B DG 14 ? ? C6 B DG 14 ? ? O6 B DG 14 ? ? 115.56 119.90 -4.34 0.60 N 436 11 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 110.96 108.30 2.66 0.30 N 437 11 N1 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 122.64 118.90 3.74 0.60 N 438 11 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.40 121.90 -4.50 0.70 N 439 11 N3 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? N4 B DC 15 ? ? 113.64 118.00 -4.36 0.70 N 440 11 C4 B DA 16 ? ? C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? 113.26 117.00 -3.74 0.50 N 441 11 C5 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N1 B DA 16 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 442 11 N1 B DA 16 ? ? C6 B DA 16 ? ? N6 B DA 16 ? ? 111.94 118.60 -6.66 0.60 N 443 11 C4 B DA 17 ? ? C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? 113.45 117.00 -3.55 0.50 N 444 11 C5 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N1 B DA 17 ? ? 122.31 117.70 4.61 0.50 N 445 11 N1 B DA 17 ? ? C6 B DA 17 ? ? N6 B DA 17 ? ? 112.38 118.60 -6.22 0.60 N 446 11 "O4'" B DT 19 ? ? "C1'" B DT 19 ? ? N1 B DT 19 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 447 11 C6 B DT 19 ? ? C5 B DT 19 ? ? C7 B DT 19 ? ? 118.83 122.90 -4.07 0.60 N 448 11 C4 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C6 B DT 20 ? ? 121.94 118.00 3.94 0.60 N 449 11 N3 B DT 20 ? ? C2 B DT 20 ? ? O2 B DT 20 ? ? 118.70 122.30 -3.60 0.60 N 450 11 C6 B DT 20 ? ? C5 B DT 20 ? ? C7 B DT 20 ? ? 118.69 122.90 -4.21 0.60 N 451 11 N1 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 122.75 118.90 3.85 0.60 N 452 11 N3 B DC 23 ? ? C2 B DC 23 ? ? O2 B DC 23 ? ? 115.73 121.90 -6.17 0.70 N 453 11 "O4'" B DG 24 ? ? "C1'" B DG 24 ? ? N9 B DG 24 ? ? 113.58 108.30 5.28 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DG A 2 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 2 1 DG A 10 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 3 2 DG A 2 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 4 2 DG A 10 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 5 2 DG B 14 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 6 3 DG A 2 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 7 3 DG A 10 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 8 3 DA B 16 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 9 3 DG B 22 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 10 4 DG A 2 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 11 4 DG A 12 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 12 5 DG A 10 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 13 5 DG B 14 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 14 5 DC B 23 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 15 7 DG A 2 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 16 7 DG A 12 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 17 7 DG B 22 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 18 8 DT A 7 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 19 8 DG B 14 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 20 9 DG A 2 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 21 9 DG A 10 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 22 9 DG B 14 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 23 10 DG A 2 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 24 10 DG A 10 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 25 10 DG A 12 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 26 10 DG B 14 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 27 11 DG A 2 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 28 11 DC A 11 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 29 11 DG B 22 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' # _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'back calculated data agree with experimental NOESY spectrum' _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 30 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 11 _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 2MO7 _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.entry_id 2MO7 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'minimized average structure' # _pdbx_nmr_sample_details.contents ;100 mM DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3'), 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 100 % D2O, 11 mM sodium azide, 0.5 mM EDTA, 100% D2O ; _pdbx_nmr_sample_details.solution_id 1 _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system '100% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id ;DNA (5'-D(*CP*GP*CP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3')-1 ; 100 ? mM ? 1 'sodium phosphate-2' 10 ? mM ? 1 'sodium chloride-3' 100 ? mM ? 1 D2O-4 100 ? % ? 1 'sodium azide-5' 11 ? mM ? 1 EDTA-6 0.5 ? mM ? 1 # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 0.1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 6.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ambient _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 288 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # _pdbx_nmr_exptl.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl.experiment_id 1 _pdbx_nmr_exptl.solution_id 1 _pdbx_nmr_exptl.type '2D 1H-1H NOESY' # _pdbx_nmr_refine.entry_id 2MO7 _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # loop_ _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.ordinal 'Case, Darden, Cheatham, III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' refinement Amber ? 1 Goddard 'chemical shift assignment' Sparky ? 2 'Bruker Biospin' processing TopSpin ? 3 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DA OP3 O N N 1 DA P P N N 2 DA OP1 O N N 3 DA OP2 O N N 4 DA "O5'" O N N 5 DA "C5'" C N N 6 DA "C4'" C N R 7 DA "O4'" O N N 8 DA "C3'" C N S 9 DA "O3'" O N N 10 DA "C2'" C N N 11 DA "C1'" C N R 12 DA N9 N Y N 13 DA C8 C Y N 14 DA N7 N Y N 15 DA C5 C Y N 16 DA C6 C Y N 17 DA N6 N N N 18 DA N1 N Y N 19 DA C2 C Y N 20 DA N3 N Y N 21 DA C4 C Y N 22 DA HOP3 H N N 23 DA HOP2 H N N 24 DA "H5'" H N N 25 DA "H5''" H N N 26 DA "H4'" H N N 27 DA "H3'" H N N 28 DA "HO3'" H N N 29 DA "H2'" H N N 30 DA "H2''" H N N 31 DA "H1'" H N N 32 DA H8 H N N 33 DA H61 H N N 34 DA H62 H N N 35 DA H2 H N N 36 DC OP3 O N N 37 DC P P N N 38 DC OP1 O N N 39 DC OP2 O N N 40 DC "O5'" O N N 41 DC "C5'" C N N 42 DC "C4'" C N R 43 DC "O4'" O N N 44 DC "C3'" C N S 45 DC "O3'" O N N 46 DC "C2'" C N N 47 DC "C1'" C N R 48 DC N1 N N N 49 DC C2 C N N 50 DC O2 O N N 51 DC N3 N N N 52 DC C4 C N N 53 DC N4 N N N 54 DC C5 C N N 55 DC C6 C N N 56 DC HOP3 H N N 57 DC HOP2 H N N 58 DC "H5'" H N N 59 DC "H5''" H N N 60 DC "H4'" H N N 61 DC "H3'" H N N 62 DC "HO3'" H N N 63 DC "H2'" H N N 64 DC "H2''" H N N 65 DC "H1'" H N N 66 DC H41 H N N 67 DC H42 H N N 68 DC H5 H N N 69 DC H6 H N N 70 DG OP3 O N N 71 DG P P N N 72 DG OP1 O N N 73 DG OP2 O N N 74 DG "O5'" O N N 75 DG "C5'" C N N 76 DG "C4'" C N R 77 DG "O4'" O N N 78 DG "C3'" C N S 79 DG "O3'" O N N 80 DG "C2'" C N N 81 DG "C1'" C N R 82 DG N9 N Y N 83 DG C8 C Y N 84 DG N7 N Y N 85 DG C5 C Y N 86 DG C6 C N N 87 DG O6 O N N 88 DG N1 N N N 89 DG C2 C N N 90 DG N2 N N N 91 DG N3 N N N 92 DG C4 C Y N 93 DG HOP3 H N N 94 DG HOP2 H N N 95 DG "H5'" H N N 96 DG "H5''" H N N 97 DG "H4'" H N N 98 DG "H3'" H N N 99 DG "HO3'" H N N 100 DG "H2'" H N N 101 DG "H2''" H N N 102 DG "H1'" H N N 103 DG H8 H N N 104 DG H1 H N N 105 DG H21 H N N 106 DG H22 H N N 107 DT OP3 O N N 108 DT P P N N 109 DT OP1 O N N 110 DT OP2 O N N 111 DT "O5'" O N N 112 DT "C5'" C N N 113 DT "C4'" C N R 114 DT "O4'" O N N 115 DT "C3'" C N S 116 DT "O3'" O N N 117 DT "C2'" C N N 118 DT "C1'" C N R 119 DT N1 N N N 120 DT C2 C N N 121 DT O2 O N N 122 DT N3 N N N 123 DT C4 C N N 124 DT O4 O N N 125 DT C5 C N N 126 DT C7 C N N 127 DT C6 C N N 128 DT HOP3 H N N 129 DT HOP2 H N N 130 DT "H5'" H N N 131 DT "H5''" H N N 132 DT "H4'" H N N 133 DT "H3'" H N N 134 DT "HO3'" H N N 135 DT "H2'" H N N 136 DT "H2''" H N N 137 DT "H1'" H N N 138 DT H3 H N N 139 DT H71 H N N 140 DT H72 H N N 141 DT H73 H N N 142 DT H6 H N N 143 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DA OP3 P sing N N 1 DA OP3 HOP3 sing N N 2 DA P OP1 doub N N 3 DA P OP2 sing N N 4 DA P "O5'" sing N N 5 DA OP2 HOP2 sing N N 6 DA "O5'" "C5'" sing N N 7 DA "C5'" "C4'" sing N N 8 DA "C5'" "H5'" sing N N 9 DA "C5'" "H5''" sing N N 10 DA "C4'" "O4'" sing N N 11 DA "C4'" "C3'" sing N N 12 DA "C4'" "H4'" sing N N 13 DA "O4'" "C1'" sing N N 14 DA "C3'" "O3'" sing N N 15 DA "C3'" "C2'" sing N N 16 DA "C3'" "H3'" sing N N 17 DA "O3'" "HO3'" sing N N 18 DA "C2'" "C1'" sing N N 19 DA "C2'" "H2'" sing N N 20 DA "C2'" "H2''" sing N N 21 DA "C1'" N9 sing N N 22 DA "C1'" "H1'" sing N N 23 DA N9 C8 sing Y N 24 DA N9 C4 sing Y N 25 DA C8 N7 doub Y N 26 DA C8 H8 sing N N 27 DA N7 C5 sing Y N 28 DA C5 C6 sing Y N 29 DA C5 C4 doub Y N 30 DA C6 N6 sing N N 31 DA C6 N1 doub Y N 32 DA N6 H61 sing N N 33 DA N6 H62 sing N N 34 DA N1 C2 sing Y N 35 DA C2 N3 doub Y N 36 DA C2 H2 sing N N 37 DA N3 C4 sing Y N 38 DC OP3 P sing N N 39 DC OP3 HOP3 sing N N 40 DC P OP1 doub N N 41 DC P OP2 sing N N 42 DC P "O5'" sing N N 43 DC OP2 HOP2 sing N N 44 DC "O5'" "C5'" sing N N 45 DC "C5'" "C4'" sing N N 46 DC "C5'" "H5'" sing N N 47 DC "C5'" "H5''" sing N N 48 DC "C4'" "O4'" sing N N 49 DC "C4'" "C3'" sing N N 50 DC "C4'" "H4'" sing N N 51 DC "O4'" "C1'" sing N N 52 DC "C3'" "O3'" sing N N 53 DC "C3'" "C2'" sing N N 54 DC "C3'" "H3'" sing N N 55 DC "O3'" "HO3'" sing N N 56 DC "C2'" "C1'" sing N N 57 DC "C2'" "H2'" sing N N 58 DC "C2'" "H2''" sing N N 59 DC "C1'" N1 sing N N 60 DC "C1'" "H1'" sing N N 61 DC N1 C2 sing N N 62 DC N1 C6 sing N N 63 DC C2 O2 doub N N 64 DC C2 N3 sing N N 65 DC N3 C4 doub N N 66 DC C4 N4 sing N N 67 DC C4 C5 sing N N 68 DC N4 H41 sing N N 69 DC N4 H42 sing N N 70 DC C5 C6 doub N N 71 DC C5 H5 sing N N 72 DC C6 H6 sing N N 73 DG OP3 P sing N N 74 DG OP3 HOP3 sing N N 75 DG P OP1 doub N N 76 DG P OP2 sing N N 77 DG P "O5'" sing N N 78 DG OP2 HOP2 sing N N 79 DG "O5'" "C5'" sing N N 80 DG "C5'" "C4'" sing N N 81 DG "C5'" "H5'" sing N N 82 DG "C5'" "H5''" sing N N 83 DG "C4'" "O4'" sing N N 84 DG "C4'" "C3'" sing N N 85 DG "C4'" "H4'" sing N N 86 DG "O4'" "C1'" sing N N 87 DG "C3'" "O3'" sing N N 88 DG "C3'" "C2'" sing N N 89 DG "C3'" "H3'" sing N N 90 DG "O3'" "HO3'" sing N N 91 DG "C2'" "C1'" sing N N 92 DG "C2'" "H2'" sing N N 93 DG "C2'" "H2''" sing N N 94 DG "C1'" N9 sing N N 95 DG "C1'" "H1'" sing N N 96 DG N9 C8 sing Y N 97 DG N9 C4 sing Y N 98 DG C8 N7 doub Y N 99 DG C8 H8 sing N N 100 DG N7 C5 sing Y N 101 DG C5 C6 sing N N 102 DG C5 C4 doub Y N 103 DG C6 O6 doub N N 104 DG C6 N1 sing N N 105 DG N1 C2 sing N N 106 DG N1 H1 sing N N 107 DG C2 N2 sing N N 108 DG C2 N3 doub N N 109 DG N2 H21 sing N N 110 DG N2 H22 sing N N 111 DG N3 C4 sing N N 112 DT OP3 P sing N N 113 DT OP3 HOP3 sing N N 114 DT P OP1 doub N N 115 DT P OP2 sing N N 116 DT P "O5'" sing N N 117 DT OP2 HOP2 sing N N 118 DT "O5'" "C5'" sing N N 119 DT "C5'" "C4'" sing N N 120 DT "C5'" "H5'" sing N N 121 DT "C5'" "H5''" sing N N 122 DT "C4'" "O4'" sing N N 123 DT "C4'" "C3'" sing N N 124 DT "C4'" "H4'" sing N N 125 DT "O4'" "C1'" sing N N 126 DT "C3'" "O3'" sing N N 127 DT "C3'" "C2'" sing N N 128 DT "C3'" "H3'" sing N N 129 DT "O3'" "HO3'" sing N N 130 DT "C2'" "C1'" sing N N 131 DT "C2'" "H2'" sing N N 132 DT "C2'" "H2''" sing N N 133 DT "C1'" N1 sing N N 134 DT "C1'" "H1'" sing N N 135 DT N1 C2 sing N N 136 DT N1 C6 sing N N 137 DT C2 O2 doub N N 138 DT C2 N3 sing N N 139 DT N3 C4 sing N N 140 DT N3 H3 sing N N 141 DT C4 O4 doub N N 142 DT C4 C5 sing N N 143 DT C5 C7 sing N N 144 DT C5 C6 doub N N 145 DT C7 H71 sing N N 146 DT C7 H72 sing N N 147 DT C7 H73 sing N N 148 DT C6 H6 sing N N 149 # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 2MO7 'b-form double helix' 2MO7 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 0.258 -0.074 0.090 -0.128 -10.185 -0.215 1 A_DC1:DG24_B A 1 ? B 24 ? 19 1 1 A DG 2 1_555 B DC 11 1_555 -0.402 -0.112 0.134 -1.291 -4.706 -0.315 2 A_DG2:DC23_B A 2 ? B 23 ? 19 1 1 A DC 3 1_555 B DG 10 1_555 0.580 -0.156 0.067 3.649 0.770 -0.548 3 A_DC3:DG22_B A 3 ? B 22 ? 19 1 1 A DA 4 1_555 B DC 9 1_555 -2.266 -0.162 -0.054 13.826 -21.548 2.278 4 A_DA4:DC21_B A 4 ? B 21 ? ? ? 1 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 0.216 -0.009 -0.042 6.490 -20.313 -2.132 5 A_DA5:DT20_B A 5 ? B 20 ? 20 1 1 A DA 6 1_555 B DT 7 1_555 0.083 -0.025 0.237 2.964 -17.519 -2.533 6 A_DA6:DT19_B A 6 ? B 19 ? 20 1 1 A DT 7 1_555 B DA 6 1_555 -0.141 -0.033 0.234 -3.941 -17.882 -2.709 7 A_DT7:DA18_B A 7 ? B 18 ? 20 1 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 -0.223 0.011 -0.008 -6.646 -19.069 -1.445 8 A_DT8:DA17_B A 8 ? B 17 ? 20 1 1 A DC 9 1_555 B DA 4 1_555 2.279 -0.149 -0.099 -11.290 -20.381 2.881 9 A_DC9:DA16_B A 9 ? B 16 ? ? ? 1 A DG 10 1_555 B DC 3 1_555 -0.570 -0.154 0.068 -1.010 0.647 -0.838 10 A_DG10:DC15_B A 10 ? B 15 ? 19 1 1 A DC 11 1_555 B DG 2 1_555 0.423 -0.116 0.155 1.589 -5.229 -0.559 11 A_DC11:DG14_B A 11 ? B 14 ? 19 1 1 A DG 12 1_555 B DC 1 1_555 -0.233 -0.075 0.127 5.544 -8.038 -0.955 12 A_DG12:DC13_B A 12 ? B 13 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DC 1 1_555 B DG 12 1_555 A DG 2 1_555 B DC 11 1_555 -0.433 -0.783 3.198 -1.642 9.228 27.064 -3.560 0.525 2.805 19.009 3.383 28.612 1 AA_DC1DG2:DC23DG24_BB A 1 ? B 24 ? A 2 ? B 23 ? 1 A DG 2 1_555 B DC 11 1_555 A DC 3 1_555 B DG 10 1_555 -0.102 -0.228 3.218 0.618 3.265 37.456 -0.771 0.237 3.185 5.072 -0.960 37.598 2 AA_DG2DC3:DG22DC23_BB A 2 ? B 23 ? A 3 ? B 22 ? 1 A DC 3 1_555 B DG 10 1_555 A DA 4 1_555 B DC 9 1_555 -0.875 -0.227 3.004 -3.396 5.658 25.746 -1.879 1.075 2.976 12.440 7.465 26.564 3 AA_DC3DA4:DC21DG22_BB A 3 ? B 22 ? A 4 ? B 21 ? 1 A DA 4 1_555 B DC 9 1_555 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 -0.230 -0.145 3.517 -1.871 2.731 43.343 -0.480 0.116 3.508 3.691 2.529 43.464 4 AA_DA4DA5:DT20DC21_BB A 4 ? B 21 ? A 5 ? B 20 ? 1 A DA 5 1_555 B DT 8 1_555 A DA 6 1_555 B DT 7 1_555 0.186 -0.499 3.255 -3.191 2.497 37.025 -1.109 -0.709 3.190 3.917 5.006 37.238 5 AA_DA5DA6:DT19DT20_BB A 5 ? B 20 ? A 6 ? B 19 ? 1 A DA 6 1_555 B DT 7 1_555 A DT 7 1_555 B DA 6 1_555 -0.104 -1.094 3.424 -0.171 -1.856 33.864 -1.561 0.150 3.478 -3.184 0.293 33.914 6 AA_DA6DT7:DA18DT19_BB A 6 ? B 19 ? A 7 ? B 18 ? 1 A DT 7 1_555 B DA 6 1_555 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 -0.100 -0.519 3.266 2.615 1.384 36.666 -1.010 0.513 3.231 2.196 -4.149 36.781 7 AA_DT7DT8:DA17DA18_BB A 7 ? B 18 ? A 8 ? B 17 ? 1 A DT 8 1_555 B DA 5 1_555 A DC 9 1_555 B DA 4 1_555 0.135 -0.187 3.468 2.005 1.744 42.067 -0.450 0.031 3.461 2.426 -2.790 42.147 8 AA_DT8DC9:DA16DA17_BB A 8 ? B 17 ? A 9 ? B 16 ? 1 A DC 9 1_555 B DA 4 1_555 A DG 10 1_555 B DC 3 1_555 0.740 -0.440 2.977 2.524 7.656 25.349 -2.775 -1.012 2.786 16.909 -5.574 26.580 9 AA_DC9DG10:DC15DA16_BB A 9 ? B 16 ? A 10 ? B 15 ? 1 A DG 10 1_555 B DC 3 1_555 A DC 11 1_555 B DG 2 1_555 0.094 -0.256 3.279 -0.987 3.732 37.998 -0.860 -0.268 3.237 5.713 1.511 38.187 10 AA_DG10DC11:DG14DC15_BB A 10 ? B 15 ? A 11 ? B 14 ? 1 A DC 11 1_555 B DG 2 1_555 A DG 12 1_555 B DC 1 1_555 0.426 -0.626 3.105 1.495 8.733 25.133 -3.472 -0.564 2.756 19.319 -3.307 26.626 11 AA_DC11DG12:DC13DG14_BB A 11 ? B 14 ? A 12 ? B 13 ? # _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 900 _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.model AVANCE _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type 'Bruker Avance' # _atom_sites.entry_id 2MO7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_