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'C5 H11 N O2 S' 149.211 MSE 'L-peptide linking' n SELENOMETHIONINE ? 'C5 H11 N O2 Se' 196.106 PEG non-polymer . 'DI(HYDROXYETHYL)ETHER' ? 'C4 H10 O3' 106.120 PGE non-polymer . 'TRIETHYLENE GLYCOL' ? 'C6 H14 O4' 150.173 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. 2. ATOM RECORD CONTAINS RESIDUAL B FACTORS ONLY. 3. A MET-INHIBITION PROTOCOL WAS USED FOR SELENOMETHIONINE INCORPORATION DURING PROTEIN EXPRESSION. THE OCCUPANCY OF THE SE ATOMS IN THE MSE RESIDUES WAS REDUCED TO 0.75 TO ACCOUNT FOR THE REDUCED SCATTERING POWER DUE TO PARTIAL S-MET INCORPORATION. 4. POLYETHYLENE GLYCOL MOLECULES FROM THE CRYSTALLIZATION BUFFER WERE MODELED INTO THE STRUCTURE. ; _refine.ls_R_factor_all 0.213 _refine.ls_R_factor_R_work 0.211 _refine.ls_R_factor_R_free 0.262 _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.100 _refine.ls_number_reflns_R_free 7726 _refine.B_iso_mean 32.806 _refine.aniso_B[1][1] 0.940 _refine.aniso_B[2][2] -0.850 _refine.aniso_B[3][3] 0.990 _refine.aniso_B[1][2] -2.420 _refine.aniso_B[1][3] -2.970 _refine.aniso_B[2][3] 4.050 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc 0.949 _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free 0.917 _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.245 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.208 _refine.overall_SU_ML 0.210 _refine.overall_SU_B 8.887 _refine.solvent_model_details 'BABINET MODEL WITH MASK' _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii 1.200 _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii 0.800 _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii 0.800 _refine.pdbx_method_to_determine_struct MAD _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES' _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_R_factor_obs 0.213 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 17690 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 245 _refine_hist.number_atoms_solvent 1338 _refine_hist.number_atoms_total 19273 _refine_hist.d_res_high 2.150 _refine_hist.d_res_low 48.912 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function r_bond_refined_d 18345 0.018 0.022 ? 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_refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.369 _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.396 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 570 _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs 11382 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details 1 1 A 1 2 B 1 3 C 1 4 D 1 5 E 1 6 F 1 7 G 1 8 H 1 9 I 1 10 J 1 11 K 1 12 L # loop_ _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 A 6 A 193 5 . . 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ALA VAL L 5 L 192 1 ? # _struct_ncs_ens.id 1 _struct_ncs_ens.details ? # _struct.entry_id 2PRR _struct.title ;Crystal structure of alkylhydroperoxidase AhpD core: uncharacterized peroxidase-related protein (YP_296737.1) from Ralstonia eutropha JMP134 at 2.15 A resolution ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.text ;YP_296737.1, Carboxymuconolactone decarboxylase family, Alkylhydroperoxidase AhpD core: uncharacterized peroxidase-related, Structural Genomics, Joint Center for Structural Genomics, JCSG, Protein Structure Initiative, PSI-2, OXIDOREDUCTASE ; _struct_keywords.pdbx_keywords OXIDOREDUCTASE _struct_keywords.entry_id 2PRR # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? 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THR H 154 GLY H 179 1 ? 26 HELX_P HELX_P103 103 ASN H 184 ? LEU H 189 ? ASN H 183 LEU H 188 5 ? 6 HELX_P HELX_P104 104 GLU I 16 ? LEU I 20 ? GLU I 15 LEU I 19 5 ? 5 HELX_P HELX_P105 105 PRO I 21 ? GLY I 36 ? PRO I 20 GLY I 35 1 ? 16 HELX_P HELX_P106 106 PRO I 39 ? ALA I 46 ? PRO I 38 ALA I 45 1 ? 8 HELX_P HELX_P107 107 ARG I 48 ? LEU I 64 ? ARG I 47 LEU I 63 1 ? 17 HELX_P HELX_P108 108 THR I 70 ? ASN I 85 ? THR I 69 ASN I 84 1 ? 16 HELX_P HELX_P109 109 CYS I 87 ? LYS I 103 ? CYS I 86 LYS I 102 1 ? 17 HELX_P HELX_P110 110 LEU I 106 ? TYR I 115 ? LEU I 105 TYR I 114 1 ? 10 HELX_P HELX_P111 111 LEU I 116 ? ALA I 118 ? LEU I 115 ALA I 117 5 ? 3 HELX_P HELX_P112 112 PRO I 121 ? SER I 138 ? PRO I 120 SER I 137 1 ? 18 HELX_P HELX_P113 113 HIS I 139 ? VAL I 141 ? HIS I 138 VAL I 140 5 ? 3 HELX_P HELX_P114 114 ASN I 142 ? HIS I 152 ? ASN I 141 HIS I 151 1 ? 11 HELX_P HELX_P115 115 THR I 155 ? GLY I 180 ? THR I 154 GLY I 179 1 ? 26 HELX_P HELX_P116 116 ASN I 184 ? MSE I 190 ? 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PRO L 20 GLY L 35 1 ? 16 HELX_P HELX_P145 145 PRO L 39 ? ALA L 46 ? PRO L 38 ALA L 45 1 ? 8 HELX_P HELX_P146 146 ARG L 48 ? LEU L 64 ? ARG L 47 LEU L 63 1 ? 17 HELX_P HELX_P147 147 THR L 70 ? ASN L 85 ? THR L 69 ASN L 84 1 ? 16 HELX_P HELX_P148 148 CYS L 87 ? LYS L 103 ? CYS L 86 LYS L 102 1 ? 17 HELX_P HELX_P149 149 LEU L 106 ? TYR L 115 ? LEU L 105 TYR L 114 1 ? 10 HELX_P HELX_P150 150 LEU L 116 ? ALA L 118 ? LEU L 115 ALA L 117 5 ? 3 HELX_P HELX_P151 151 PRO L 121 ? ALA L 137 ? PRO L 120 ALA L 136 1 ? 17 HELX_P HELX_P152 152 SER L 138 ? VAL L 141 ? SER L 137 VAL L 140 5 ? 4 HELX_P HELX_P153 153 ASN L 142 ? GLU L 151 ? ASN L 141 GLU L 150 1 ? 10 HELX_P HELX_P154 154 THR L 155 ? GLY L 180 ? THR L 154 GLY L 179 1 ? 26 HELX_P HELX_P155 155 ASN L 184 ? MSE L 190 ? ASN L 183 MSE L 189 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? A LEU 62 C ? ? ? 1_555 A MSE 63 N ? ? A LEU 61 A MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? ? covale2 covale both ? A MSE 63 C ? ? ? 1_555 A LEU 64 N ? ? A MSE 62 A LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale3 covale both ? A GLU 75 C ? ? ? 1_555 A MSE 76 N ? ? A GLU 74 A MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? ? covale4 covale both ? A MSE 76 C ? ? ? 1_555 A ILE 77 N ? ? A MSE 75 A ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale5 covale both ? A ALA 126 C ? ? ? 1_555 A MSE 127 N ? ? A ALA 125 A MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale6 covale both ? A MSE 127 C ? ? ? 1_555 A LEU 128 N ? ? A MSE 126 A LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale7 covale both ? A ARG 174 C ? ? ? 1_555 A MSE 175 N ? ? A ARG 173 A MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale8 covale both ? A MSE 175 C ? ? ? 1_555 A ALA 176 N ? ? A MSE 174 A ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? ? covale9 covale both ? A GLY 180 C ? ? ? 1_555 A MSE 181 N ? ? A GLY 179 A MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale10 covale both ? A MSE 181 C ? ? ? 1_555 A ARG 182 N ? ? A MSE 180 A ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale11 covale both ? A LEU 189 C ? ? ? 1_555 A MSE 190 N ? ? A LEU 188 A MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale12 covale both ? A MSE 190 C ? ? ? 1_555 A GLY 191 N ? ? A MSE 189 A GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale13 covale both ? B LEU 62 C ? ? ? 1_555 B MSE 63 N ? ? B LEU 61 B MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.308 ? ? covale14 covale both ? B MSE 63 C ? ? ? 1_555 B LEU 64 N ? ? B MSE 62 B LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale15 covale both ? B GLU 75 C ? ? ? 1_555 B MSE 76 N ? ? B GLU 74 B MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale16 covale both ? B MSE 76 C ? ? ? 1_555 B ILE 77 N ? ? B MSE 75 B ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale17 covale both ? B ALA 126 C ? ? ? 1_555 B MSE 127 N ? ? B ALA 125 B MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale18 covale both ? B MSE 127 C ? ? ? 1_555 B LEU 128 N ? ? B MSE 126 B LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale19 covale both ? B ARG 174 C ? ? ? 1_555 B MSE 175 N ? ? B ARG 173 B MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? ? covale20 covale both ? B MSE 175 C ? ? ? 1_555 B ALA 176 N ? ? B MSE 174 B ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.313 ? ? covale21 covale both ? B GLY 180 C ? ? ? 1_555 B MSE 181 N ? ? B GLY 179 B MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale22 covale both ? B MSE 181 C ? ? ? 1_555 B ARG 182 N ? ? B MSE 180 B ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? ? covale23 covale both ? B LEU 189 C ? ? ? 1_555 B MSE 190 N ? ? B LEU 188 B MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale24 covale both ? B MSE 190 C ? ? ? 1_555 B GLY 191 N ? ? B MSE 189 B GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale25 covale both ? C LEU 62 C ? ? ? 1_555 C MSE 63 N ? ? C LEU 61 C MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale26 covale both ? C MSE 63 C ? ? ? 1_555 C LEU 64 N ? ? C MSE 62 C LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale27 covale both ? C GLU 75 C ? ? ? 1_555 C MSE 76 N ? ? C GLU 74 C MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale28 covale both ? C MSE 76 C ? ? ? 1_555 C ILE 77 N ? ? C MSE 75 C ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale29 covale both ? C ALA 126 C ? ? ? 1_555 C MSE 127 N ? ? C ALA 125 C MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? ? covale30 covale both ? C MSE 127 C ? ? ? 1_555 C LEU 128 N ? ? C MSE 126 C LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? covale31 covale both ? C ARG 174 C ? ? ? 1_555 C MSE 175 N ? ? C ARG 173 C MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale32 covale both ? C MSE 175 C ? ? ? 1_555 C ALA 176 N ? ? C MSE 174 C ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale33 covale both ? C GLY 180 C ? ? ? 1_555 C MSE 181 N ? ? C GLY 179 C MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale34 covale both ? C MSE 181 C ? ? ? 1_555 C ARG 182 N ? ? C MSE 180 C ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale35 covale both ? C LEU 189 C ? ? ? 1_555 C MSE 190 N ? ? C LEU 188 C MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale36 covale both ? C MSE 190 C ? ? ? 1_555 C GLY 191 N ? ? C MSE 189 C GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? ? covale37 covale both ? D LEU 62 C ? ? ? 1_555 D MSE 63 N ? ? D LEU 61 D MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale38 covale both ? D MSE 63 C ? ? ? 1_555 D LEU 64 N ? ? D MSE 62 D LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale39 covale both ? D GLU 75 C ? ? ? 1_555 D MSE 76 N ? ? D GLU 74 D MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale40 covale both ? D MSE 76 C ? ? ? 1_555 D ILE 77 N ? ? D MSE 75 D ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale41 covale both ? D ALA 126 C ? ? ? 1_555 D MSE 127 N ? ? D ALA 125 D MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale42 covale both ? D MSE 127 C ? ? ? 1_555 D LEU 128 N ? ? D MSE 126 D LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? ? covale43 covale both ? D ARG 174 C ? ? ? 1_555 D MSE 175 N ? ? D ARG 173 D MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale44 covale both ? D MSE 175 C ? ? ? 1_555 D ALA 176 N ? ? D MSE 174 D ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? covale45 covale both ? D GLY 180 C ? ? ? 1_555 D MSE 181 N ? ? D GLY 179 D MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale46 covale both ? D MSE 181 C ? ? ? 1_555 D ARG 182 N ? ? D MSE 180 D ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale47 covale both ? D LEU 189 C ? ? ? 1_555 D MSE 190 N ? ? D LEU 188 D MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale48 covale both ? D MSE 190 C ? ? ? 1_555 D GLY 191 N ? ? D MSE 189 D GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? covale49 covale both ? E LEU 62 C ? ? ? 1_555 E MSE 63 N ? ? E LEU 61 E MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? ? covale50 covale both ? E MSE 63 C ? ? ? 1_555 E LEU 64 N ? ? E MSE 62 E LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale51 covale both ? E GLU 75 C ? ? ? 1_555 E MSE 76 N ? ? E GLU 74 E MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale52 covale both ? E MSE 76 C ? ? ? 1_555 E ILE 77 N ? ? E MSE 75 E ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale53 covale both ? E ALA 126 C ? ? ? 1_555 E MSE 127 N ? ? E ALA 125 E MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale54 covale both ? E MSE 127 C ? ? ? 1_555 E LEU 128 N ? ? E MSE 126 E LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? ? covale55 covale both ? E ARG 174 C ? ? ? 1_555 E MSE 175 N ? ? E ARG 173 E MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale56 covale both ? E MSE 175 C ? ? ? 1_555 E ALA 176 N ? ? E MSE 174 E ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale57 covale both ? E GLY 180 C ? ? ? 1_555 E MSE 181 N ? ? E GLY 179 E MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? ? covale58 covale both ? E MSE 181 C ? ? ? 1_555 E ARG 182 N ? ? E MSE 180 E ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale59 covale both ? E LEU 189 C ? ? ? 1_555 E MSE 190 N ? ? E LEU 188 E MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale60 covale both ? E MSE 190 C ? ? ? 1_555 E GLY 191 N ? ? E MSE 189 E GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale61 covale both ? F LEU 62 C ? ? ? 1_555 F MSE 63 N ? ? F LEU 61 F MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.320 ? ? covale62 covale both ? F MSE 63 C ? ? ? 1_555 F LEU 64 N ? ? F MSE 62 F LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? covale63 covale both ? F GLU 75 C ? ? ? 1_555 F MSE 76 N ? ? F GLU 74 F MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale64 covale both ? F MSE 76 C ? ? ? 1_555 F ILE 77 N ? ? F MSE 75 F ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale65 covale both ? F ALA 126 C ? ? ? 1_555 F MSE 127 N ? ? F ALA 125 F MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale66 covale both ? F MSE 127 C ? ? ? 1_555 F LEU 128 N ? ? F MSE 126 F LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale67 covale both ? F ARG 174 C ? ? ? 1_555 F MSE 175 N ? ? F ARG 173 F MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? ? covale68 covale both ? F MSE 175 C ? ? ? 1_555 F ALA 176 N ? ? F MSE 174 F ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale69 covale both ? F GLY 180 C ? ? ? 1_555 F MSE 181 N ? ? F GLY 179 F MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale70 covale both ? F MSE 181 C ? ? ? 1_555 F ARG 182 N ? ? F MSE 180 F ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale71 covale both ? F LEU 189 C ? ? ? 1_555 F MSE 190 N ? ? F LEU 188 F MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale72 covale both ? F MSE 190 C ? ? ? 1_555 F GLY 191 N ? ? F MSE 189 F GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? ? covale73 covale both ? G LEU 62 C ? ? ? 1_555 G MSE 63 N ? ? G LEU 61 G MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? ? covale74 covale both ? G MSE 63 C ? ? ? 1_555 G LEU 64 N ? ? G MSE 62 G LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale75 covale both ? G GLU 75 C ? ? ? 1_555 G MSE 76 N ? ? G GLU 74 G MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.313 ? ? covale76 covale both ? G MSE 76 C ? ? ? 1_555 G ILE 77 N ? ? G MSE 75 G ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? ? covale77 covale both ? G ALA 126 C ? ? ? 1_555 G MSE 127 N ? ? G ALA 125 G MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? ? covale78 covale both ? G MSE 127 C ? ? ? 1_555 G LEU 128 N ? ? G MSE 126 G LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale79 covale both ? G ARG 174 C ? ? ? 1_555 G MSE 175 N ? ? G ARG 173 G MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? ? covale80 covale both ? G MSE 175 C ? ? ? 1_555 G ALA 176 N ? ? G MSE 174 G ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale81 covale both ? G GLY 180 C ? ? ? 1_555 G MSE 181 N ? ? G GLY 179 G MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? ? covale82 covale both ? G MSE 181 C ? ? ? 1_555 G ARG 182 N ? ? G MSE 180 G ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale83 covale both ? G LEU 189 C ? ? ? 1_555 G MSE 190 N ? ? G LEU 188 G MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.314 ? ? covale84 covale both ? G MSE 190 C ? ? ? 1_555 G GLY 191 N ? ? G MSE 189 G GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale85 covale both ? H LEU 62 C ? ? ? 1_555 H MSE 63 N ? ? H LEU 61 H MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale86 covale both ? H MSE 63 C ? ? ? 1_555 H LEU 64 N ? ? H MSE 62 H LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale87 covale both ? H GLU 75 C ? ? ? 1_555 H MSE 76 N ? ? H GLU 74 H MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale88 covale both ? H MSE 76 C ? ? ? 1_555 H ILE 77 N ? ? H MSE 75 H ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale89 covale both ? H ALA 126 C ? ? ? 1_555 H MSE 127 N ? ? H ALA 125 H MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale90 covale both ? H MSE 127 C ? ? ? 1_555 H LEU 128 N ? ? H MSE 126 H LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale91 covale both ? H ARG 174 C ? ? ? 1_555 H MSE 175 N ? ? H ARG 173 H MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale92 covale both ? H MSE 175 C ? ? ? 1_555 H ALA 176 N ? ? H MSE 174 H ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale93 covale both ? H GLY 180 C ? ? ? 1_555 H MSE 181 N ? ? H GLY 179 H MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? ? covale94 covale both ? H MSE 181 C ? ? ? 1_555 H ARG 182 N ? ? H MSE 180 H ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale95 covale both ? H LEU 189 C ? ? ? 1_555 H MSE 190 N ? ? H LEU 188 H MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale96 covale both ? H MSE 190 C ? ? ? 1_555 H GLY 191 N ? ? H MSE 189 H GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale97 covale both ? I LEU 62 C ? ? ? 1_555 I MSE 63 N ? ? I LEU 61 I MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? ? covale98 covale both ? I MSE 63 C ? ? ? 1_555 I LEU 64 N ? ? I MSE 62 I LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale99 covale both ? I GLU 75 C ? ? ? 1_555 I MSE 76 N ? ? I GLU 74 I MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale100 covale both ? I MSE 76 C ? ? ? 1_555 I ILE 77 N ? ? I MSE 75 I ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale101 covale both ? I ALA 126 C ? ? ? 1_555 I MSE 127 N ? ? I ALA 125 I MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale102 covale both ? I MSE 127 C ? ? ? 1_555 I LEU 128 N ? ? I MSE 126 I LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale103 covale both ? I ARG 174 C ? ? ? 1_555 I MSE 175 N ? ? I ARG 173 I MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale104 covale both ? I MSE 175 C ? ? ? 1_555 I ALA 176 N ? ? I MSE 174 I ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale105 covale both ? I GLY 180 C ? ? ? 1_555 I MSE 181 N ? ? I GLY 179 I MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale106 covale both ? I MSE 181 C ? ? ? 1_555 I ARG 182 N ? ? I MSE 180 I ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale107 covale both ? I LEU 189 C ? ? ? 1_555 I MSE 190 N ? ? I LEU 188 I MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? ? covale108 covale both ? I MSE 190 C ? ? ? 1_555 I GLY 191 N ? ? I MSE 189 I GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? ? covale109 covale both ? J LEU 62 C ? ? ? 1_555 J MSE 63 N ? ? J LEU 61 J MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale110 covale both ? J MSE 63 C ? ? ? 1_555 J LEU 64 N ? ? J MSE 62 J LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale111 covale both ? J GLU 75 C ? ? ? 1_555 J MSE 76 N ? ? J GLU 74 J MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale112 covale both ? J MSE 76 C ? ? ? 1_555 J ILE 77 N ? ? J MSE 75 J ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale113 covale both ? J ALA 126 C ? ? ? 1_555 J MSE 127 N ? ? J ALA 125 J MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale114 covale both ? J MSE 127 C ? ? ? 1_555 J LEU 128 N ? ? J MSE 126 J LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale115 covale both ? J ARG 174 C ? ? ? 1_555 J MSE 175 N ? ? J ARG 173 J MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.342 ? ? covale116 covale both ? J MSE 175 C ? ? ? 1_555 J ALA 176 N ? ? J MSE 174 J ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale117 covale both ? J GLY 180 C ? ? ? 1_555 J MSE 181 N ? ? J GLY 179 J MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale118 covale both ? J MSE 181 C ? ? ? 1_555 J ARG 182 N ? ? J MSE 180 J ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale119 covale both ? J LEU 189 C ? ? ? 1_555 J MSE 190 N ? ? J LEU 188 J MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale120 covale both ? J MSE 190 C ? ? ? 1_555 J GLY 191 N ? ? J MSE 189 J GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.319 ? ? covale121 covale both ? K LEU 62 C ? ? ? 1_555 K MSE 63 N ? ? K LEU 61 K MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale122 covale both ? K MSE 63 C ? ? ? 1_555 K LEU 64 N ? ? K MSE 62 K LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale123 covale both ? K GLU 75 C ? ? ? 1_555 K MSE 76 N ? ? K GLU 74 K MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale124 covale both ? K MSE 76 C ? ? ? 1_555 K ILE 77 N ? ? K MSE 75 K ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale125 covale both ? K ALA 126 C ? ? ? 1_555 K MSE 127 N ? ? K ALA 125 K MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale126 covale both ? K MSE 127 C ? ? ? 1_555 K LEU 128 N ? ? K MSE 126 K LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale127 covale both ? K ARG 174 C ? ? ? 1_555 K MSE 175 N ? ? K ARG 173 K MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale128 covale both ? K MSE 175 C ? ? ? 1_555 K ALA 176 N ? ? K MSE 174 K ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale129 covale both ? K GLY 180 C ? ? ? 1_555 K MSE 181 N ? ? K GLY 179 K MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? ? covale130 covale both ? K MSE 181 C ? ? ? 1_555 K ARG 182 N ? ? K MSE 180 K ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale131 covale both ? K LEU 189 C ? ? ? 1_555 K MSE 190 N ? ? K LEU 188 K MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? ? covale132 covale both ? K MSE 190 C ? ? ? 1_555 K GLY 191 N ? ? K MSE 189 K GLY 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? ? covale133 covale both ? L LEU 62 C ? ? ? 1_555 L MSE 63 N ? ? L LEU 61 L MSE 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale134 covale both ? L MSE 63 C ? ? ? 1_555 L LEU 64 N ? ? L MSE 62 L LEU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale135 covale both ? L GLU 75 C ? ? ? 1_555 L MSE 76 N ? ? L GLU 74 L MSE 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale136 covale both ? L MSE 76 C ? ? ? 1_555 L ILE 77 N ? ? L MSE 75 L ILE 76 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale137 covale both ? L ALA 126 C ? ? ? 1_555 L MSE 127 N ? ? L ALA 125 L MSE 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale138 covale both ? L MSE 127 C ? ? ? 1_555 L LEU 128 N ? ? L MSE 126 L LEU 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.340 ? ? covale139 covale both ? L ARG 174 C ? ? ? 1_555 L MSE 175 N ? ? L ARG 173 L MSE 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale140 covale both ? L MSE 175 C ? ? ? 1_555 L ALA 176 N ? ? L MSE 174 L ALA 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale141 covale both ? L GLY 180 C ? ? ? 1_555 L MSE 181 N ? ? L GLY 179 L MSE 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale142 covale both ? L MSE 181 C ? ? ? 1_555 L ARG 182 N ? ? L MSE 180 L ARG 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale143 covale both ? L LEU 189 C ? ? ? 1_555 L MSE 190 N ? ? L LEU 188 L MSE 189 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale144 covale both ? L MSE 190 C ? ? ? 1_555 L GLY 191 N ? ? 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MET SELENOMETHIONINE 29 E MSE 181 E MSE 180 ? MET SELENOMETHIONINE 30 E MSE 190 E MSE 189 ? MET SELENOMETHIONINE 31 F MSE 63 F MSE 62 ? MET SELENOMETHIONINE 32 F MSE 76 F MSE 75 ? MET SELENOMETHIONINE 33 F MSE 127 F MSE 126 ? MET SELENOMETHIONINE 34 F MSE 175 F MSE 174 ? MET SELENOMETHIONINE 35 F MSE 181 F MSE 180 ? MET SELENOMETHIONINE 36 F MSE 190 F MSE 189 ? MET SELENOMETHIONINE 37 G MSE 63 G MSE 62 ? MET SELENOMETHIONINE 38 G MSE 76 G MSE 75 ? MET SELENOMETHIONINE 39 G MSE 127 G MSE 126 ? MET SELENOMETHIONINE 40 G MSE 175 G MSE 174 ? MET SELENOMETHIONINE 41 G MSE 181 G MSE 180 ? MET SELENOMETHIONINE 42 G MSE 190 G MSE 189 ? MET SELENOMETHIONINE 43 H MSE 63 H MSE 62 ? MET SELENOMETHIONINE 44 H MSE 76 H MSE 75 ? MET SELENOMETHIONINE 45 H MSE 127 H MSE 126 ? MET SELENOMETHIONINE 46 H MSE 175 H MSE 174 ? MET SELENOMETHIONINE 47 H MSE 181 H MSE 180 ? MET SELENOMETHIONINE 48 H MSE 190 H MSE 189 ? MET SELENOMETHIONINE 49 I MSE 63 I MSE 62 ? MET SELENOMETHIONINE 50 I MSE 76 I MSE 75 ? 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Richardson lab' molprobity@kinemage.biochem.duke.edu 'model building' http://kinemage.biochem.duke.edu/molprobity/ ? ? 1 SHELX . ? package 'George Sheldrick' gsheldr@shelx.uni-ac.gwdg.de phasing http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/ Fortran_77 ? 2 REFMAC 5.2.0005 ? program 'Murshudov, G.N.' ccp4@dl.ac.uk refinement http://www.ccp4.ac.uk/main.html Fortran_77 ? 3 XSCALE . ? package 'Wolfgang Kabsch' ? 'data scaling' http://www.mpimf-heidelberg.mpg.de/~kabsch/xds/xscale_program.html ? ? 4 PDB_EXTRACT 2.000 'April. 3, 2006' package PDB sw-help@rcsb.rutgers.edu 'data extraction' http://pdb.rutgers.edu/software/ C++ ? 5 MAR345 CCD ? ? ? ? 'data collection' ? ? ? 6 XDS . ? ? ? ? 'data reduction' ? ? ? 7 SHELXD . ? ? ? ? phasing ? ? ? 8 autoSHARP . ? ? ? ? phasing ? ? ? 9 # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 300 ; BIOMOLECULE: 1,2 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 12 CHAIN(S). SEE REMARK 350 FOR INFORMATION ON GENERATING THE BIOLOGICAL MOLECULE(S). ; 999 ; SEQUENCE THE CONSTRUCT WAS EXPRESSED WITH A PURIFICATION TAG MGSDKIHHHHHHENLYFQG. THE TAG WAS REMOVED WITH TEV PROTEASE LEAVING ONLY A GLYCINE (0) FOLLOWED BY THE TARGET SEQUENCE. ; # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 O _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 D _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 VAL _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 77 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 OG _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 D _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 SER _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 81 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 2.16 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 SE A MSE 126 ? ? 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