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EMDB EMD-57739 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date _pdbx_audit_revision_history.part_number 1 'Structure model' 1 0 2026-06-17 ? 2 'EM metadata' 1 0 2026-06-17 ? 3 Image 1 0 2026-06-17 ? 4 'Primary map' 1 0 2026-06-17 ? # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 2 'EM metadata' repository 'Initial release' ? ? 3 3 Image repository 'Initial release' ? ? 4 4 'Primary map' repository 'Initial release' ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 30GB _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2026-04-23 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB . EMD-57738 'consensus EM volume' EMDB 'TnsC focused' EMD-57737 'focused EM volume' EMDB 'Cryo-EM structure of the PseCascade-TniQ-TnsC complex bound to PseTnsB-hook motifs' EMD-57739 'associated EM volume' # _pdbx_contact_author.id 4 _pdbx_contact_author.email jinek@bioc.uzh.ch _pdbx_contact_author.name_first Martin _pdbx_contact_author.name_last Jinek _pdbx_contact_author.name_mi ? _pdbx_contact_author.role 'principal investigator/group leader' _pdbx_contact_author.identifier_ORCID 0000-0002-7601-210X # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Finocchio, G.' 1 0000-0001-6905-9308 'Oberli, S.' 2 0000-0002-3568-7637 'Schmitz, M.' 3 0000-0003-3216-7350 'Jinek, M.' 4 0000-0002-7601-210X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Biorxiv _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2692-8205 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structural basis of RNA-guided DNA integration by type I CRISPR-associated transposases.' _citation.year 2026 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.64898/2026.05.18.725949 _citation.pdbx_database_id_PubMed 42239233 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Finocchio, G.' 1 0000-0001-6905-9308 primary 'Oberli, S.' 2 0000-0002-3568-7637 primary 'Lampe, G.' 3 0000-0002-2873-2372 primary 'Schmitz, M.' 4 0000-0003-3216-7350 primary 'Sternberg, S.H.' 5 0000-0001-8240-9114 primary 'Jinek, M.' 6 0000-0002-7601-210X # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'CRISPR RNA' 30196.002 1 ? ? ? 'CRISPR RNA (crRNA) from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983.' 2 polymer syn 'Target DNA strand' 37162.676 1 ? ? ? 'Target DNA strand complementary to the crRNA spacer sequence.' 3 polymer syn 'Non-target DNA strand' 36726.367 1 ? ? ? ;Non-target DNA strand containing a +1 to +18 region identical to the target DNA strand, rather than complementary, to facilitate crRNA annealing to the protospacer. ; 4 polymer man Cas7.1 39845.145 6 ? ? ? 'CRISPR-associated protein Cas7 from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983.' 5 polymer man Cas8 79290.211 1 ? ? ? 'CRISPR-associated protein Cas8 from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983.' 6 polymer man Cas6 26631.074 1 ? ? ? ;CRISPR-associated protein Cas6 from the type I-F PseCAST (Tn7016) Cascade complex of Pseudoalteromonas sp. S983, bearing a C-terminal Twin-Strep tag. ; 7 polymer man TniQ.1 49832.406 2 ? ? ? ;CRISPR-associated protein TniQ from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983, bearing an N-terminal His10 tag followed by a TEV protease cleavage site. ; 8 polymer man 'AAA+ ATPase domain-containing protein' 38609.902 7 ? ? ? 'AAA+ ATPase TnsC from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983.' 9 polymer man 'Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,TnsA endonuclease N-terminal domain-containing protein,TnsB transposase' 142301.844 7 ? ? ? ;C-terminal hook motif of TnsB, part of the TnsA-TnsB fusion protein. The fusion protein is composed of TnsA (res 1-209, NCBI Reference Sequence WP_249364174.1) and TnsB (res 239-613, NCBI Reference Sequence TMP85090.1) from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983, connected by a synthetic NLS linker (res 210-238) and bearing an N-terminal His6-MBP tag followed by a TEV protease cleavage site. The hook comprises residues 605-613 of TnsB (843-851 of the TnsA-TnsB fusion).,C-terminal hook motif of TnsB, part of the TnsA-TnsB fusion protein. The fusion protein is composed of TnsA (res 1-209, NCBI Reference Sequence WP_249364174.1) and TnsB (res 239-613, NCBI Reference Sequence TMP85090.1) from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983, connected by a synthetic NLS linker (res 210-238) and bearing an N-terminal His6-MBP tag followed by a TEV protease cleavage site. The hook comprises residues 605-613 of TnsB (843-851 of the TnsA-TnsB fusion).,C-terminal hook motif of TnsB, part of the TnsA-TnsB fusion protein. The fusion protein is composed of TnsA (res 1-209, NCBI Reference Sequence WP_249364174.1) and TnsB (res 239-613, NCBI Reference Sequence TMP85090.1) from the type I-F PseCAST (Tn7016) system of Pseudoalteromonas sp. S983, connected by a synthetic NLS linker (res 210-238) and bearing an N-terminal His6-MBP tag followed by a TEV protease cleavage site. The hook comprises residues 605-613 of TnsB (843-851 of the TnsA-TnsB fusion). ; 10 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 507.181 7 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 7 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 9 _entity_name_com.name 'MMBP,Maltodextrin-binding protein,Maltose-binding protein,MBP' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polyribonucleotide no no ;GUGACCUGCCGUAUAGGCAGCUGAAAAUACAGUGGGGCCACUAGGGACAGGAUUGGUGACGUGACCUGCCGUAUAGGCAG CUGAAAAUGUAGC ; ;GUGACCUGCCGUAUAGGCAGCUGAAAAUACAGUGGGGCCACUAGGGACAGGAUUGGUGACGUGACCUGCCGUAUAGGCAG CUGAAAAUGUAGC ; 1 ? 2 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT) (DT)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC) (DT)(DA)(DG)(DG)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DA)(DG) (DG)(DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC) (DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DC) (DC)(DA)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DT)(DG)(DG)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG) ; ;GCCTAACAGGAGGTGCGCGTTAGGCCCAATATCAGGAGACTAGGAAGGAGGAGGCCTAAGGATGCGCCTTTTCTGTCACC AATCCTGTCCCTAGTGGCCCCACTGTGGCGTGGACGCATG ; 2 ? 3 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DA)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DC)(DC)(DA)(DC)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC) (DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT) (DG)(DG)(DT)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DG)(DC)(DA)(DT)(DC) (DC)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DC)(DT)(DA) (DG)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA) (DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DC) ; ;CATGCGTCCACGCCTGTCACCCCGGTGATCCCACAGGATTGGTGACAGAAAAGGCGCATCCTTAGGCCTCCTCCTTCCTA GTCTCCTGATATTGGGCCTAACGCGCACCTCCTGTTAGGC ; 3 ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MELCNILKYDRSLYPGKAVFFYKTADSDFVPLEADINKIRGPKSGFTEAFTPQFSPKNISPQDLTHNNILTLEECYVPPN VEHIFCRFSLRVQANSLVPSGCSDPEVFSLLKELAETFKECGGYKELAVRYCRNILIGTWLWRNQNTGNTQIEIKTSKGS CYLIDNTRKLAWESKWASDDLKVLEELSNEIESALTDPNVFWSADITAKIEASFCQEIYPSQILNDKVKQGEASKQFVKA KCADGRYAVSFNSVKIGAALQSIDDWWDEDASKRLRVHEFGADKEIGVARRPPDSEQNFYSIFKNTEWYLSALKNCITNK NEKIDPAIYYLFSVLIKGGMFQKKAEAKKA ; ;MELCNILKYDRSLYPGKAVFFYKTADSDFVPLEADINKIRGPKSGFTEAFTPQFSPKNISPQDLTHNNILTLEECYVPPN VEHIFCRFSLRVQANSLVPSGCSDPEVFSLLKELAETFKECGGYKELAVRYCRNILIGTWLWRNQNTGNTQIEIKTSKGS CYLIDNTRKLAWESKWASDDLKVLEELSNEIESALTDPNVFWSADITAKIEASFCQEIYPSQILNDKVKQGEASKQFVKA KCADGRYAVSFNSVKIGAALQSIDDWWDEDASKRLRVHEFGADKEIGVARRPPDSEQNFYSIFKNTEWYLSALKNCITNK NEKIDPAIYYLFSVLIKGGMFQKKAEAKKA ; A,B,C,D,E,F ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MHLKELLEITDTTERDRSLRRAFSPYTAMIDITGSEAVALIILLNLTYRKNQVDDLLDKKLAKQALKSEDHINKCIKEIA WFHTHNLKYPDIRVSKQNLAVEPPTLHSYVLSSANYPKAYGWSHNSAKVNFAKLFVSYFKWQNQVSWLAQVLATNSDNWK SAFTSLGLSVKAFKSLCVTVKNSLPEEAIPDSVDRYSRQIRMPYHDGYLAVTPVISHVVQSKIQQAAIDKRARFSNVEFT RPAAVSMLAASLGGVINVLNYPPYIRSKYHGLSNSRAFKLNNGQTVFNVEALLKPELIKALEGIIFSNNALALKQRRQQK VKNIKELRNTLLEWFSPVFEWRLDAIENGYDLEQLESASERLEYKILSLPDNELPSLTIPLFRLLNEMLGGVSMTQRYAF HPKLMSPLKAALQWLLVNLTDQKHVLIEEDDEHYRYLHLSGIRVFDAQALSNPYCSGIPSLTAVWGMIHSYQRKLNEALG TNVRFTSFSWFIRNYSAVAGKKLPELSLQGAQQSRLKRPGIIDGKYCDLVFDLIIHIDGYEDDLQAVDSKPDILKAHFPS NFAGGVMHQPELNSNINWCCLYSNENQLFEKLRRLPLSGCWVMPTEHKIQDLDELLLLLNSDSKLSPSMMGYMLLTEPMA RVGSLERLHCYAEPAIGVVKYEAATSVRLKGIGNYFNSAFWMLDAQEKFMLMKKV ; ;MHLKELLEITDTTERDRSLRRAFSPYTAMIDITGSEAVALIILLNLTYRKNQVDDLLDKKLAKQALKSEDHINKCIKEIA WFHTHNLKYPDIRVSKQNLAVEPPTLHSYVLSSANYPKAYGWSHNSAKVNFAKLFVSYFKWQNQVSWLAQVLATNSDNWK SAFTSLGLSVKAFKSLCVTVKNSLPEEAIPDSVDRYSRQIRMPYHDGYLAVTPVISHVVQSKIQQAAIDKRARFSNVEFT RPAAVSMLAASLGGVINVLNYPPYIRSKYHGLSNSRAFKLNNGQTVFNVEALLKPELIKALEGIIFSNNALALKQRRQQK 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;MGHHHHHHHHHHGGSENLYFQSGMAFLFSPKARAFSDESLESYLLRVVSENFFDSYEGLSLAIREELHELDFEAHGAFPV DLKRLNVYHAKHNSHFRMRALGLLETLLDLPRYELQKLALLKSDIKFNSSVALYNNGVDIPLRFIRHHAEEAVDSIPVCS QCLAEEAYIKQSWHIKWVNACTKHQCALLHNCPECYAPINYIENESITHCSCGFELSCASTSPVNTLSIEHLNKLLDKGE RNDSNPLFNNMTLTERFAALLWYQERYSQTDNFCLNDAVNYFSKWPAVFNTELDELSKNAEMKLIDLFNKTEFKFIFGDA ILACPSTQKQSESHFIYRALLDYLVTLVESNPKTKKPNAADLLVSVLEAATLLGTSVEQVYRLYQNGILQTAFRHKMNQR INPYKGAFFLRHVIEYKTSFGNDKARMYLSAW ; ;MGHHHHHHHHHHGGSENLYFQSGMAFLFSPKARAFSDESLESYLLRVVSENFFDSYEGLSLAIREELHELDFEAHGAFPV DLKRLNVYHAKHNSHFRMRALGLLETLLDLPRYELQKLALLKSDIKFNSSVALYNNGVDIPLRFIRHHAEEAVDSIPVCS QCLAEEAYIKQSWHIKWVNACTKHQCALLHNCPECYAPINYIENESITHCSCGFELSCASTSPVNTLSIEHLNKLLDKGE RNDSNPLFNNMTLTERFAALLWYQERYSQTDNFCLNDAVNYFSKWPAVFNTELDELSKNAEMKLIDLFNKTEFKFIFGDA ILACPSTQKQSESHFIYRALLDYLVTLVESNPKTKKPNAADLLVSVLEAATLLGTSVEQVYRLYQNGILQTAFRHKMNQR INPYKGAFFLRHVIEYKTSFGNDKARMYLSAW ; I,J ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNALTEIQIEKLRNFSDCIVMHPQIKTIFNDFDELRLNRKFQSDQQCMLLIGDTGVGKSHTINHYKKRVLATQNYSRNTM 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_entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 93 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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C DG 37 "O3'" 38 1 Y 1 3 DG 23 ? "C2'" ? C DG 37 "C2'" 39 1 Y 1 3 DG 23 ? "C1'" ? C DG 37 "C1'" 40 1 Y 1 3 DG 23 ? N9 ? C DG 37 N9 41 1 Y 1 3 DG 23 ? C8 ? C DG 37 C8 42 1 Y 1 3 DG 23 ? N7 ? C DG 37 N7 43 1 Y 1 3 DG 23 ? C5 ? C DG 37 C5 44 1 Y 1 3 DG 23 ? C6 ? C DG 37 C6 45 1 Y 1 3 DG 23 ? O6 ? C DG 37 O6 46 1 Y 1 3 DG 23 ? N1 ? C DG 37 N1 47 1 Y 1 3 DG 23 ? C2 ? C DG 37 C2 48 1 Y 1 3 DG 23 ? N2 ? C DG 37 N2 49 1 Y 1 3 DG 23 ? N3 ? C DG 37 N3 50 1 Y 1 3 DG 23 ? C4 ? C DG 37 C4 51 1 Y 1 3 DG 34 ? P ? C DG 48 P 52 1 Y 1 3 DG 34 ? OP1 ? C DG 48 OP1 53 1 Y 1 3 DG 34 ? OP2 ? C DG 48 OP2 54 1 Y 1 O VAL 332 ? CG2 ? 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# _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 30GB _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 30GB _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high 2.9 _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? 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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'REAL-SPACE (WEIGHTED MAP SUM AT ATOM CENTERS)' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.532 ? 73713 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.186 ? 8846 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.039 ? 8147 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 8783 ? f_plane_restr ? ? ? # _struct.entry_id 30GB _struct.title 'Cryo-EM structure of the PseCascade-TniQ-TnsC complex bound to PseTnsB-hook motifs' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 30GB _struct_keywords.text 'Transposase, DNA-binding, RNA-binding, CRISPR-Cas, CRISPR-associated transposon, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 4 ? I N N 4 ? J N N 5 ? K N N 6 ? L N N 7 ? M N N 7 ? N N N 8 ? O N N 8 ? P N N 8 ? Q N N 8 ? R N N 8 ? S N N 8 ? T N N 8 ? U N N 9 ? V N N 9 ? W N N 9 ? X N N 9 ? Y N N 9 ? Z N N 9 ? AA N N 9 ? BA N N 10 ? CA N N 11 ? DA N N 11 ? EA N N 10 ? FA N N 10 ? GA N N 11 ? HA N N 11 ? IA N N 10 ? JA N N 11 ? KA N N 10 ? LA N N 10 ? MA N N 11 ? NA N N 10 ? 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A U 42 O4 ? ? ? 1_555 B DA 93 N6 ? ? 1 U 14 2 DA -14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A A 43 N1 ? ? ? 1_555 B DT 92 N3 ? ? 1 A 15 2 DT -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A A 43 N6 ? ? ? 1_555 B DT 92 O4 ? ? 1 A 15 2 DT -15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A G 44 N1 ? ? ? 1_555 B DC 91 N3 ? ? 1 G 16 2 DC -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A G 44 N2 ? ? ? 1_555 B DC 91 O2 ? ? 1 G 16 2 DC -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A G 44 O6 ? ? ? 1_555 B DC 91 N4 ? ? 1 G 16 2 DC -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A G 45 N1 ? ? ? 1_555 B DC 90 N3 ? ? 1 G 17 2 DC -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A G 45 N2 ? ? ? 1_555 B DC 90 O2 ? ? 1 G 17 2 DC -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A G 45 O6 ? ? ? 1_555 B DC 90 N4 ? ? 1 G 17 2 DC -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? 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sing N N 96 ASP CA C sing N N 97 ASP CA CB sing N N 98 ASP CA HA sing N N 99 ASP C O doub N N 100 ASP C OXT sing N N 101 ASP CB CG sing N N 102 ASP CB HB2 sing N N 103 ASP CB HB3 sing N N 104 ASP CG OD1 doub N N 105 ASP CG OD2 sing N N 106 ASP OD2 HD2 sing N N 107 ASP OXT HXT sing N N 108 ATP PG O1G doub N N 109 ATP PG O2G sing N N 110 ATP PG O3G sing N N 111 ATP PG O3B sing N N 112 ATP O2G HOG2 sing N N 113 ATP O3G HOG3 sing N N 114 ATP PB O1B doub N N 115 ATP PB O2B sing N N 116 ATP PB O3B sing N N 117 ATP PB O3A sing N N 118 ATP O2B HOB2 sing N N 119 ATP PA O1A doub N N 120 ATP PA O2A sing N N 121 ATP PA O3A sing N N 122 ATP PA "O5'" sing N N 123 ATP O2A HOA2 sing N N 124 ATP "O5'" "C5'" sing N N 125 ATP "C5'" "C4'" sing N N 126 ATP "C5'" "H5'1" sing N N 127 ATP "C5'" "H5'2" sing N N 128 ATP "C4'" "O4'" sing N N 129 ATP "C4'" "C3'" sing N N 130 ATP "C4'" "H4'" sing N N 131 ATP "O4'" "C1'" sing N N 132 ATP "C3'" "O3'" sing N N 133 ATP "C3'" "C2'" sing N N 134 ATP "C3'" "H3'" sing N N 135 ATP "O3'" "HO3'" sing N N 136 ATP "C2'" "O2'" sing N N 137 ATP "C2'" "C1'" sing N N 138 ATP "C2'" "H2'" sing N N 139 ATP "O2'" "HO2'" sing N N 140 ATP "C1'" N9 sing N N 141 ATP "C1'" "H1'" sing N N 142 ATP N9 C8 sing Y N 143 ATP N9 C4 sing Y N 144 ATP C8 N7 doub Y N 145 ATP C8 H8 sing N N 146 ATP N7 C5 sing Y N 147 ATP C5 C6 sing Y N 148 ATP C5 C4 doub Y N 149 ATP C6 N6 sing N N 150 ATP C6 N1 doub Y N 151 ATP N6 HN61 sing N N 152 ATP N6 HN62 sing N N 153 ATP N1 C2 sing Y N 154 ATP C2 N3 doub Y N 155 ATP C2 H2 sing N N 156 ATP N3 C4 sing Y N 157 C OP3 P sing N N 158 C OP3 HOP3 sing N N 159 C P OP1 doub N N 160 C P OP2 sing N N 161 C P "O5'" sing N N 162 C OP2 HOP2 sing N N 163 C "O5'" "C5'" sing N N 164 C "C5'" "C4'" sing N N 165 C "C5'" "H5'" sing N N 166 C "C5'" "H5''" sing N N 167 C "C4'" "O4'" sing N N 168 C "C4'" "C3'" sing N N 169 C "C4'" "H4'" sing N N 170 C "O4'" "C1'" sing N N 171 C "C3'" "O3'" sing N N 172 C "C3'" "C2'" sing N N 173 C "C3'" "H3'" sing N N 174 C "O3'" "HO3'" sing N N 175 C "C2'" "O2'" sing N N 176 C "C2'" "C1'" sing N N 177 C "C2'" "H2'" sing N N 178 C "O2'" "HO2'" sing N N 179 C "C1'" N1 sing N N 180 C "C1'" "H1'" sing N N 181 C N1 C2 sing N N 182 C N1 C6 sing N N 183 C C2 O2 doub N N 184 C C2 N3 sing N N 185 C N3 C4 doub N N 186 C C4 N4 sing N N 187 C C4 C5 sing N N 188 C N4 H41 sing N N 189 C N4 H42 sing N N 190 C C5 C6 doub N N 191 C C5 H5 sing N N 192 C C6 H6 sing N N 193 CYS N CA sing N N 194 CYS N H sing N N 195 CYS N H2 sing N N 196 CYS CA C sing N N 197 CYS CA CB sing N N 198 CYS CA HA sing N N 199 CYS C O doub N N 200 CYS C OXT sing N N 201 CYS CB SG sing N N 202 CYS CB HB2 sing N N 203 CYS CB HB3 sing N N 204 CYS SG HG sing N N 205 CYS OXT HXT sing N N 206 DA OP3 P sing N N 207 DA OP3 HOP3 sing N N 208 DA P OP1 doub N N 209 DA P OP2 sing N N 210 DA P "O5'" sing N N 211 DA OP2 HOP2 sing N N 212 DA "O5'" "C5'" sing N N 213 DA "C5'" "C4'" sing N N 214 DA "C5'" "H5'" sing N N 215 DA "C5'" "H5''" sing N N 216 DA "C4'" "O4'" sing N N 217 DA "C4'" "C3'" sing N N 218 DA "C4'" "H4'" sing N N 219 DA "O4'" "C1'" sing N N 220 DA "C3'" "O3'" sing N N 221 DA "C3'" "C2'" sing N N 222 DA "C3'" "H3'" sing N N 223 DA "O3'" "HO3'" sing N N 224 DA "C2'" "C1'" sing N N 225 DA "C2'" "H2'" sing N N 226 DA "C2'" "H2''" sing N N 227 DA "C1'" N9 sing N N 228 DA "C1'" "H1'" sing N N 229 DA N9 C8 sing Y N 230 DA N9 C4 sing Y N 231 DA C8 N7 doub Y N 232 DA C8 H8 sing N N 233 DA N7 C5 sing Y N 234 DA C5 C6 sing Y N 235 DA C5 C4 doub Y N 236 DA C6 N6 sing N N 237 DA C6 N1 doub Y N 238 DA N6 H61 sing N N 239 DA N6 H62 sing N N 240 DA N1 C2 sing Y N 241 DA C2 N3 doub Y N 242 DA C2 H2 sing N N 243 DA N3 C4 sing Y N 244 DC OP3 P sing N N 245 DC OP3 HOP3 sing N N 246 DC P OP1 doub N N 247 DC P OP2 sing N N 248 DC P "O5'" sing N N 249 DC OP2 HOP2 sing N N 250 DC "O5'" "C5'" sing N N 251 DC "C5'" "C4'" sing N N 252 DC "C5'" "H5'" sing N N 253 DC "C5'" "H5''" sing N N 254 DC "C4'" "O4'" sing N N 255 DC "C4'" "C3'" sing N N 256 DC "C4'" "H4'" sing N N 257 DC "O4'" "C1'" sing N N 258 DC "C3'" "O3'" sing N N 259 DC "C3'" "C2'" sing N N 260 DC "C3'" "H3'" sing N N 261 DC "O3'" "HO3'" sing N N 262 DC "C2'" "C1'" sing N N 263 DC "C2'" "H2'" sing N N 264 DC "C2'" "H2''" sing N N 265 DC "C1'" N1 sing N N 266 DC "C1'" "H1'" sing N N 267 DC N1 C2 sing N N 268 DC N1 C6 sing N N 269 DC C2 O2 doub N N 270 DC C2 N3 sing N N 271 DC N3 C4 doub N N 272 DC C4 N4 sing N N 273 DC C4 C5 sing N N 274 DC N4 H41 sing N N 275 DC N4 H42 sing N N 276 DC C5 C6 doub N N 277 DC C5 H5 sing N N 278 DC C6 H6 sing N N 279 DG OP3 P sing N N 280 DG OP3 HOP3 sing N N 281 DG P OP1 doub N N 282 DG P OP2 sing N N 283 DG P "O5'" sing N N 284 DG OP2 HOP2 sing N N 285 DG "O5'" "C5'" sing N N 286 DG "C5'" "C4'" sing N N 287 DG "C5'" "H5'" sing N N 288 DG "C5'" "H5''" sing N N 289 DG "C4'" "O4'" sing N N 290 DG "C4'" "C3'" sing N N 291 DG "C4'" "H4'" sing N N 292 DG "O4'" "C1'" sing N N 293 DG "C3'" "O3'" sing N N 294 DG "C3'" "C2'" sing N N 295 DG "C3'" "H3'" sing N N 296 DG "O3'" "HO3'" sing N N 297 DG "C2'" "C1'" sing N N 298 DG "C2'" "H2'" sing N N 299 DG "C2'" "H2''" sing N N 300 DG "C1'" N9 sing N N 301 DG "C1'" "H1'" sing N N 302 DG N9 C8 sing Y N 303 DG N9 C4 sing Y N 304 DG C8 N7 doub Y N 305 DG C8 H8 sing N N 306 DG N7 C5 sing Y N 307 DG C5 C6 sing N N 308 DG C5 C4 doub Y N 309 DG C6 O6 doub N N 310 DG C6 N1 sing N N 311 DG N1 C2 sing N N 312 DG N1 H1 sing N N 313 DG C2 N2 sing N N 314 DG C2 N3 doub N N 315 DG N2 H21 sing N N 316 DG N2 H22 sing N N 317 DG N3 C4 sing N N 318 DT OP3 P sing N N 319 DT OP3 HOP3 sing N N 320 DT P OP1 doub N N 321 DT P OP2 sing N N 322 DT P "O5'" sing N N 323 DT OP2 HOP2 sing N N 324 DT "O5'" "C5'" sing N N 325 DT "C5'" "C4'" sing N N 326 DT "C5'" "H5'" sing N N 327 DT "C5'" "H5''" sing N N 328 DT "C4'" "O4'" sing N N 329 DT "C4'" "C3'" sing N N 330 DT "C4'" "H4'" sing N N 331 DT "O4'" "C1'" sing N N 332 DT "C3'" "O3'" sing N N 333 DT "C3'" "C2'" sing N N 334 DT "C3'" "H3'" sing N N 335 DT "O3'" "HO3'" sing N N 336 DT "C2'" "C1'" sing N N 337 DT "C2'" "H2'" sing N N 338 DT "C2'" "H2''" sing N N 339 DT "C1'" N1 sing N N 340 DT "C1'" "H1'" sing N N 341 DT N1 C2 sing N N 342 DT N1 C6 sing N N 343 DT C2 O2 doub N N 344 DT C2 N3 sing N N 345 DT N3 C4 sing N N 346 DT N3 H3 sing N N 347 DT C4 O4 doub N N 348 DT C4 C5 sing N N 349 DT C5 C7 sing N N 350 DT C5 C6 doub N N 351 DT C7 H71 sing N N 352 DT C7 H72 sing N N 353 DT C7 H73 sing N N 354 DT C6 H6 sing N N 355 G OP3 P sing N N 356 G OP3 HOP3 sing N N 357 G P OP1 doub N N 358 G P OP2 sing N N 359 G P "O5'" sing N N 360 G OP2 HOP2 sing N N 361 G "O5'" "C5'" sing N N 362 G "C5'" "C4'" sing N N 363 G "C5'" "H5'" sing N N 364 G "C5'" "H5''" sing N N 365 G "C4'" "O4'" sing N N 366 G "C4'" "C3'" sing N N 367 G "C4'" "H4'" sing N N 368 G "O4'" "C1'" sing N N 369 G "C3'" "O3'" sing N N 370 G "C3'" "C2'" sing N N 371 G "C3'" "H3'" sing N N 372 G "O3'" "HO3'" sing N N 373 G "C2'" "O2'" sing N N 374 G "C2'" "C1'" sing N N 375 G "C2'" "H2'" sing N N 376 G "O2'" "HO2'" sing N N 377 G "C1'" N9 sing N N 378 G "C1'" "H1'" sing N N 379 G N9 C8 sing Y N 380 G N9 C4 sing Y N 381 G C8 N7 doub Y N 382 G C8 H8 sing N N 383 G N7 C5 sing Y N 384 G C5 C6 sing N N 385 G C5 C4 doub Y N 386 G C6 O6 doub N N 387 G C6 N1 sing N N 388 G N1 C2 sing N N 389 G N1 H1 sing N N 390 G C2 N2 sing N N 391 G C2 N3 doub N N 392 G N2 H21 sing N N 393 G N2 H22 sing N N 394 G N3 C4 sing N N 395 GLN N CA sing N N 396 GLN N H sing N N 397 GLN N H2 sing N N 398 GLN CA C sing N N 399 GLN CA CB sing N N 400 GLN CA HA sing N N 401 GLN C O doub N N 402 GLN C OXT sing N N 403 GLN CB CG sing N N 404 GLN CB HB2 sing N N 405 GLN CB HB3 sing N N 406 GLN CG CD sing N N 407 GLN CG HG2 sing N N 408 GLN CG HG3 sing N N 409 GLN CD OE1 doub N N 410 GLN CD NE2 sing N N 411 GLN NE2 HE21 sing N N 412 GLN NE2 HE22 sing N N 413 GLN OXT HXT sing N N 414 GLU N CA sing N N 415 GLU N H sing N N 416 GLU N H2 sing N N 417 GLU CA C sing N N 418 GLU CA CB sing N N 419 GLU CA HA sing N N 420 GLU C O doub N N 421 GLU C OXT sing N N 422 GLU CB CG sing N N 423 GLU CB HB2 sing N N 424 GLU CB HB3 sing N N 425 GLU CG CD sing N N 426 GLU CG HG2 sing N N 427 GLU CG HG3 sing N N 428 GLU CD OE1 doub N N 429 GLU CD OE2 sing N N 430 GLU OE2 HE2 sing N N 431 GLU OXT HXT sing N N 432 GLY N CA sing N N 433 GLY N H sing N N 434 GLY N H2 sing N N 435 GLY CA C sing N N 436 GLY CA HA2 sing N N 437 GLY CA HA3 sing N N 438 GLY C O doub N N 439 GLY C OXT sing N N 440 GLY OXT HXT sing N N 441 HIS N CA sing N N 442 HIS N H sing N N 443 HIS N H2 sing N N 444 HIS CA C sing N N 445 HIS CA CB sing N N 446 HIS CA HA sing N N 447 HIS C O doub N N 448 HIS C OXT sing N N 449 HIS CB CG sing N N 450 HIS CB HB2 sing N N 451 HIS CB HB3 sing N N 452 HIS CG ND1 sing Y N 453 HIS CG CD2 doub Y N 454 HIS ND1 CE1 doub Y N 455 HIS ND1 HD1 sing N N 456 HIS CD2 NE2 sing Y N 457 HIS CD2 HD2 sing N N 458 HIS CE1 NE2 sing Y N 459 HIS CE1 HE1 sing N N 460 HIS NE2 HE2 sing N N 461 HIS OXT HXT sing N N 462 ILE N CA sing N N 463 ILE N H sing N N 464 ILE N H2 sing N N 465 ILE CA C sing N N 466 ILE CA CB sing N N 467 ILE CA HA sing N N 468 ILE C O doub N N 469 ILE C OXT sing N N 470 ILE CB CG1 sing N N 471 ILE CB CG2 sing N N 472 ILE CB HB sing N N 473 ILE CG1 CD1 sing N N 474 ILE CG1 HG12 sing N N 475 ILE CG1 HG13 sing N N 476 ILE CG2 HG21 sing N N 477 ILE CG2 HG22 sing N N 478 ILE CG2 HG23 sing N N 479 ILE CD1 HD11 sing N N 480 ILE CD1 HD12 sing N N 481 ILE CD1 HD13 sing N N 482 ILE OXT HXT sing N N 483 LEU N CA sing N N 484 LEU N H sing N N 485 LEU N H2 sing N N 486 LEU CA C sing N N 487 LEU CA CB sing N N 488 LEU CA HA sing N N 489 LEU C O doub N N 490 LEU C OXT sing N N 491 LEU CB CG sing N N 492 LEU CB HB2 sing N N 493 LEU CB HB3 sing N N 494 LEU CG CD1 sing N N 495 LEU CG CD2 sing N N 496 LEU CG HG sing N N 497 LEU CD1 HD11 sing N N 498 LEU CD1 HD12 sing N N 499 LEU CD1 HD13 sing N N 500 LEU CD2 HD21 sing N N 501 LEU CD2 HD22 sing N N 502 LEU CD2 HD23 sing N N 503 LEU OXT HXT sing N N 504 LYS N CA sing N N 505 LYS N H sing N N 506 LYS N H2 sing N N 507 LYS CA C sing N N 508 LYS CA CB sing N N 509 LYS CA HA sing N N 510 LYS C O doub N N 511 LYS C OXT sing N N 512 LYS CB CG sing N N 513 LYS CB HB2 sing N N 514 LYS CB HB3 sing N N 515 LYS CG CD sing N N 516 LYS CG HG2 sing N N 517 LYS CG HG3 sing N N 518 LYS CD CE sing N N 519 LYS CD HD2 sing N N 520 LYS CD HD3 sing N N 521 LYS CE NZ sing N N 522 LYS CE HE2 sing N N 523 LYS CE HE3 sing N N 524 LYS NZ HZ1 sing N N 525 LYS NZ HZ2 sing N N 526 LYS NZ HZ3 sing N N 527 LYS OXT HXT sing N N 528 MET N CA sing N N 529 MET N H sing N N 530 MET N H2 sing N N 531 MET CA C sing N N 532 MET CA CB sing N N 533 MET CA HA sing N N 534 MET C O doub N N 535 MET C OXT sing N N 536 MET CB CG sing N N 537 MET CB HB2 sing N N 538 MET CB HB3 sing N N 539 MET CG SD sing N N 540 MET CG HG2 sing N N 541 MET CG HG3 sing N N 542 MET SD CE sing N N 543 MET CE HE1 sing N N 544 MET CE HE2 sing N N 545 MET CE HE3 sing N N 546 MET OXT HXT sing N N 547 PHE N CA sing N N 548 PHE N H sing N N 549 PHE N H2 sing N N 550 PHE CA C sing N N 551 PHE CA CB sing N N 552 PHE CA HA sing N N 553 PHE C O doub N N 554 PHE C OXT sing N N 555 PHE CB CG sing N N 556 PHE CB HB2 sing N N 557 PHE CB HB3 sing N N 558 PHE CG CD1 doub Y N 559 PHE CG CD2 sing Y N 560 PHE CD1 CE1 sing Y N 561 PHE CD1 HD1 sing N N 562 PHE CD2 CE2 doub Y N 563 PHE CD2 HD2 sing N N 564 PHE CE1 CZ doub Y N 565 PHE CE1 HE1 sing N N 566 PHE CE2 CZ sing Y N 567 PHE CE2 HE2 sing N N 568 PHE CZ HZ sing N N 569 PHE OXT HXT sing N N 570 PRO N CA sing N N 571 PRO N CD sing N N 572 PRO N H sing N N 573 PRO CA C sing N N 574 PRO CA CB sing N N 575 PRO CA HA sing N N 576 PRO C O doub N N 577 PRO C OXT sing N N 578 PRO CB CG sing N N 579 PRO CB HB2 sing N N 580 PRO CB HB3 sing N N 581 PRO CG CD sing N N 582 PRO CG HG2 sing N N 583 PRO CG HG3 sing N N 584 PRO CD HD2 sing N N 585 PRO CD HD3 sing N N 586 PRO OXT HXT sing N N 587 SER N CA sing N N 588 SER N H sing N N 589 SER N H2 sing N N 590 SER CA C sing N N 591 SER CA CB sing N N 592 SER CA HA sing N N 593 SER C O doub N N 594 SER C OXT sing N N 595 SER CB OG sing N N 596 SER CB HB2 sing N N 597 SER CB HB3 sing N N 598 SER OG HG sing N N 599 SER OXT HXT sing N N 600 THR N CA sing N N 601 THR N H sing N N 602 THR N H2 sing N N 603 THR CA C sing N N 604 THR CA CB sing N N 605 THR CA HA sing N N 606 THR C O doub N N 607 THR C OXT sing N N 608 THR CB OG1 sing N N 609 THR CB CG2 sing N N 610 THR CB HB sing N N 611 THR OG1 HG1 sing N N 612 THR CG2 HG21 sing N N 613 THR CG2 HG22 sing N N 614 THR CG2 HG23 sing N N 615 THR OXT HXT sing N N 616 TRP N CA sing N N 617 TRP N H sing N N 618 TRP N H2 sing N N 619 TRP CA C sing N N 620 TRP CA CB sing N N 621 TRP CA HA sing N N 622 TRP C O doub N N 623 TRP C OXT sing N N 624 TRP CB CG sing N N 625 TRP CB HB2 sing N N 626 TRP CB HB3 sing N N 627 TRP CG CD1 doub Y N 628 TRP CG CD2 sing Y N 629 TRP CD1 NE1 sing Y N 630 TRP CD1 HD1 sing N N 631 TRP CD2 CE2 doub Y N 632 TRP CD2 CE3 sing Y N 633 TRP NE1 CE2 sing Y N 634 TRP NE1 HE1 sing N N 635 TRP CE2 CZ2 sing Y N 636 TRP CE3 CZ3 doub Y N 637 TRP CE3 HE3 sing N N 638 TRP CZ2 CH2 doub Y N 639 TRP CZ2 HZ2 sing N N 640 TRP CZ3 CH2 sing Y N 641 TRP CZ3 HZ3 sing N N 642 TRP CH2 HH2 sing N N 643 TRP OXT HXT sing N N 644 TYR N CA sing N N 645 TYR N H sing N N 646 TYR N H2 sing N N 647 TYR CA C sing N N 648 TYR CA CB sing N N 649 TYR CA HA sing N N 650 TYR C O doub N N 651 TYR C OXT sing N N 652 TYR CB CG sing N N 653 TYR CB HB2 sing N N 654 TYR CB HB3 sing N N 655 TYR CG CD1 doub Y N 656 TYR CG CD2 sing Y N 657 TYR CD1 CE1 sing Y N 658 TYR CD1 HD1 sing N N 659 TYR CD2 CE2 doub Y N 660 TYR CD2 HD2 sing N N 661 TYR CE1 CZ doub Y N 662 TYR CE1 HE1 sing N N 663 TYR CE2 CZ sing Y N 664 TYR CE2 HE2 sing N N 665 TYR CZ OH sing N N 666 TYR OH HH sing N N 667 TYR OXT HXT sing N N 668 U OP3 P sing N N 669 U OP3 HOP3 sing N N 670 U P OP1 doub N N 671 U P OP2 sing N N 672 U P "O5'" sing N N 673 U OP2 HOP2 sing N N 674 U "O5'" "C5'" sing N N 675 U "C5'" "C4'" sing N N 676 U "C5'" "H5'" sing N N 677 U "C5'" "H5''" sing N N 678 U "C4'" "O4'" sing N N 679 U "C4'" "C3'" sing N N 680 U "C4'" "H4'" sing N N 681 U "O4'" "C1'" sing N N 682 U "C3'" "O3'" sing N N 683 U "C3'" "C2'" sing N N 684 U "C3'" "H3'" sing N N 685 U "O3'" "HO3'" sing N N 686 U "C2'" "O2'" sing N N 687 U "C2'" "C1'" sing N N 688 U "C2'" "H2'" sing N N 689 U "O2'" "HO2'" sing N N 690 U "C1'" N1 sing N N 691 U "C1'" "H1'" sing N N 692 U N1 C2 sing N N 693 U N1 C6 sing N N 694 U C2 O2 doub N N 695 U C2 N3 sing N N 696 U N3 C4 sing N N 697 U N3 H3 sing N N 698 U C4 O4 doub N N 699 U C4 C5 sing N N 700 U C5 C6 doub N N 701 U C5 H5 sing N N 702 U C6 H6 sing N N 703 VAL N CA sing N N 704 VAL N H sing N N 705 VAL N H2 sing N N 706 VAL CA C sing N N 707 VAL CA CB sing N N 708 VAL CA HA sing N N 709 VAL C O doub N N 710 VAL C OXT sing N N 711 VAL CB CG1 sing N N 712 VAL CB CG2 sing N N 713 VAL CB HB sing N N 714 VAL CG1 HG11 sing N N 715 VAL CG1 HG12 sing N N 716 VAL CG1 HG13 sing N N 717 VAL CG2 HG21 sing N N 718 VAL CG2 HG22 sing N N 719 VAL CG2 HG23 sing N N 720 VAL OXT HXT sing N N 721 # _em_admin.current_status REL _em_admin.deposition_date 2026-04-23 _em_admin.deposition_site PDBE _em_admin.entry_id 30GB _em_admin.last_update 2026-06-17 _em_admin.map_release_date 2026-06-17 _em_admin.title 'Cryo-EM structure of the PseCascade-TniQ-TnsC complex bound to PseTnsB-hook motifs' # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.id _em_buffer_component.name 1 20 mM C8H17KN2O4S 1 'HEPES potassium salt' 1 10 mM MgCl2 2 'magnesium chloride' 1 300 mM KCl 3 'potassium chloride' 1 1 mM C4H10O2S2 4 dithiothreitol 1 0.025 % C58H114O26 5 'polysorbate 20 (Tween 20)' 1 1 mM C10H14N5Na2O13P3 6 ;adenosin-5'-triphosphate disodium salt ; 1 10 mM C12H22O11 7 maltose # _em_ctf_correction.details ? _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.74 # _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 579572 _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Pseudoalteromonas sp. S983' _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? _em_entity_assembly_naturalsource.details ? # _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.details ? _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 # _em_image_recording.average_exposure_time 1.25 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 60.95 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 (6k x 4k)' _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 11374 # _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 329059 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.category _em_software.details _em_software.id _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id _em_software.name _em_software.version _em_software.reference_DOI 'PARTICLE SELECTION' 'Blob Picker was used for particle selection' 1 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? 'IMAGE ACQUISITION' ? 2 ? ? 1 EPU 3.9 ? MASKING ? 3 ? ? ? ? ? ? 'CTF CORRECTION' 'Patch CTF Estimation was used for CTF correction' 4 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? 'LAYERLINE INDEXING' ? 5 ? ? ? ? ? ? 'DIFFRACTION INDEXING' ? 6 ? ? ? ? ? ? 'MODEL FITTING' ? 7 ? 1 ? Coot 0.9.4 ? OTHER ? 8 ? ? ? ? ? ? 'MODEL REFINEMENT' ? 9 ? 1 ? PHENIX 2.0_5936 ? 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' 'Ab-Initio Reconstruction was used for initial angular assignment' 10 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? 'FINAL EULER ASSIGNMENT' 'Non-Uniform Refinement was used fo final angular assignment' 11 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? CLASSIFICATION 'Ab-Initio Reconstruction was used for final classification' 12 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? cryoSPARC 4.7 ? # _em_specimen.concentration 2.6 _em_specimen.details ;The sample was prepared by co-precipitation, using His-MBP-tagged TnsAB bound to a double-stranded right-end substrate as bait to capture Cascade-TniQ and TnsC. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 30GB 'double helix' 30GB 'a-form double helix' 30GB 'b-form double helix' 30GB 'hairpin loop' 30GB 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 29 1_555 B DT 106 1_555 0.120 -0.200 -0.635 -11.276 7.864 -1.146 1 1_A1:DT-1_2 1 1 ? 2 -1 ? 20 1 1 A C 30 1_555 B DG 105 1_555 0.185 -0.278 -0.844 0.878 10.620 -2.772 2 1_C2:DG-2_2 1 2 ? 2 -2 ? 19 1 1 A A 31 1_555 B DT 104 1_555 0.061 -0.084 -0.128 12.459 5.708 0.359 3 1_A3:DT-3_2 1 3 ? 2 -3 ? 20 1 1 A G 32 1_555 B DC 103 1_555 -0.227 -0.207 -0.198 4.058 16.184 0.457 4 1_G4:DC-4_2 1 4 ? 2 -4 ? 19 1 1 A U 33 1_555 B DA 102 1_555 -0.163 -0.068 -0.183 18.321 23.985 -3.838 5 1_U5:DA-5_2 1 5 ? 2 -5 ? 20 1 1 A G 35 1_555 B DC 100 1_555 -0.121 -0.183 -0.727 -13.710 9.674 -1.675 6 1_G7:DC-7_2 1 7 ? 2 -7 ? 19 1 1 A G 36 1_555 B DC 99 1_555 0.365 -3.046 1.763 -17.177 -11.773 103.976 7 1_G8:DC-8_2 1 8 ? 2 -8 ? ? ? 1 A G 37 1_555 B DC 98 1_555 -0.204 -0.252 -0.601 11.873 15.472 -5.979 8 1_G9:DC-9_2 1 9 ? 2 -9 ? 19 1 1 A C 41 1_555 B DG 94 1_555 0.244 -0.170 -0.319 -8.083 10.907 -0.316 9 1_C13:DG-13_2 1 13 ? 2 -13 ? 19 1 1 A U 42 1_555 B DA 93 1_555 -0.005 -0.198 -0.526 1.079 13.010 4.657 10 1_U14:DA-14_2 1 14 ? 2 -14 ? 20 1 1 A A 43 1_555 B DT 92 1_555 0.100 -0.074 0.017 12.992 8.634 0.648 11 1_A15:DT-15_2 1 15 ? 2 -15 ? 20 1 1 A G 44 1_555 B DC 91 1_555 -0.165 -0.207 -0.516 -1.046 11.201 -0.798 12 1_G16:DC-16_2 1 16 ? 2 -16 ? 19 1 1 A G 45 1_555 B DC 90 1_555 -0.240 -0.259 -0.557 15.331 16.682 -3.924 13 1_G17:DC-17_2 1 17 ? 2 -17 ? 19 1 1 A A 47 1_555 B DT 88 1_555 0.156 -0.182 -0.696 -8.482 10.689 0.427 14 1_A19:DT-19_2 1 19 ? 2 -19 ? 20 1 1 A C 48 1_555 B DG 87 1_555 0.298 -0.094 -0.438 5.091 4.317 4.146 15 1_C20:DG-20_2 1 20 ? 2 -20 ? 19 1 1 A A 49 1_555 B DT 86 1_555 0.049 -0.116 -0.196 17.268 3.747 1.873 16 1_A21:DT-21_2 1 21 ? 2 -21 ? 20 1 1 A G 50 1_555 B DC 85 1_555 -0.077 -0.279 -0.965 -6.843 9.678 -3.296 17 1_G22:DC-22_2 1 22 ? 2 -22 ? 19 1 1 A G 51 1_555 B DC 84 1_555 -0.186 -0.304 -0.808 8.674 15.412 -4.873 18 1_G23:DC-23_2 1 23 ? 2 -23 ? 19 1 1 A U 53 1_555 B DA 82 1_555 -0.009 -0.177 -0.519 -5.270 13.288 2.012 19 1_U25:DA-25_2 1 25 ? 2 -25 ? 20 1 1 A U 54 1_555 B DA 81 1_555 -0.260 -0.160 -0.510 6.043 19.159 -5.247 20 1_U26:DA-26_2 1 26 ? 2 -26 ? 20 1 1 A G 55 1_555 B DC 80 1_555 -0.204 -0.166 0.461 17.859 11.021 -3.488 21 1_G27:DC-27_2 1 27 ? 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